3FMDA

Crystal structure of human haspin with an isoquinoline ligand
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KGPVPFSHCLPTEKLQRCEKIGEGVFGEVFQTIADHTPVAIKIIAIEGPDLVNGSHQKTFEEILPEIIISKELSLLSGEVCNRTEGFIGLNSVHCVQGSYPPLLLKAWDHYNSTKGSANDRPDFFKDDQLFIVLEFEFGGIDLEQMRTKLSSLATAKSILHQLTASLAVAEASLRFEHRDLHWGNVLLKKTSLKKLHYTLNGKSSTIPSCGLQVSIIDYTLSRLERDGIVVFCDVSMDEDLFTGDGDYQFDIYRLMKKENNNRWGEYHPYSNVLWLHYLTDKMLKQMTFKTKCNTPAMKQIKRKIQEFHRTMLNFSSATDLLCQHSLFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Human Haspin with an Isoquinoline ligand
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase haspin
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fmdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fmdA01
4HCTA 2X9FA 3EKNA 4I4FA 4BWKA 4YTIA 4S32A 3HMPA 1YI6A 5LXMA 2ITOA 1TQPA 3CJFA 3NYVA 3GEQA 5B7VA 2R7IA 2CCHA 2OJJA 2VTLA 1CMKE 3P7BA 2P0CA 4RC4A 4NWMA 3QX4A 3BX5A 2XK8A 4FG8A 2B7AA 3O2MA 3VF8A 2O8YA 3NYNA 3OWLA 2QR8A 5IQGA 2IO6A 3LOKA 1Q62A 4LOQA 5E7RA 3QCQA 2ETKA 2J0LA 5JGBA 1GZOA 1R78A 4ZP5A 3CKWA 4DG3E 1WBVA 4XV1A 4ACCA 1WBOA 3BCEA 4RWKA 2ZB1A 2ITTA 3FQHA 3NNVA 4FKRA 1LEZA 4NIFB 3W8QA 5AP4A 4JX7A 4K33A 4QTAA 1H0WA 3UQCA 2X4ZA 3LFNA 4M13A 3R63A 2EVAA 4C0TA 2R3FA 3QXOA 5H8GA 4YU2A 5J5SA 1ZRZA 3Q32A 4EK5A 3ZLYA 3N4TA 3MH2A 2OBJA 4AW1A 4C4GA 1MP8A 5AP2A 3LCOA 2BRBA 4FTQA 3V8TA 2B1PA 3IOPA 3E64A 4IAAA 5AR3A 3FZOA 4E26A 3COHA 2J5EA 4O7YA 2WNTA 4ZSAA 2DYLA 3PSCA 3MS9A 3COMA 3PY0A 3U54A 2CDZA 2BIKB 2BUJA 1H07A 2YCFA 4I94A 2AC3A 3THBA 2VO0A 4JDJA 3FHIA 1XKKA 5TOZA 1OKWA 5CEOA 5KUPA 1FGKA 2YDKA 4JG6A 5CEKA 3CQWA 4BCJA 2J90A 4M68A 4B8MA 5JMSA 2O5KA 2WELA 4IIRA 4ZJJA 3F2RA 3UE4A 3AMBA 2YLFA 4FT5A 5KCVA 4Z7GA 3DAJA 3R7IA 3DFCB 4GVJA 4O0WA 4CGAA 1J1CA 1DI8A 5CLPA 4EOMA 4J52A 3VBYA 5CNOA 4H1JA 2HENA 2H8HA 3KGAA 4D28A 5IUHA 4BTJA 4DGNA 2OH4A 5KE0A 1PXLA 4X2NA 3VC4A 2VX1A 2BCJA 5DEWA 5EKOA 4LG4A 3R22A 2JIIA 4ZTRA 3VS5A 4EK8A 5BPYA 2XP2A 4DGLC 2PVYA 2QD9A 4RGJA 4DEGA 3G9NA 3NUNA 3PP1A 5HCXA 2B0QA 3R6XA 2BZHB 4X21A 5C03A 4F9YA 5GIPE 1PYXA 5HTCA 4FKLA 5CQUA 4D58A 4FG7A 3HECA 1XH8A 2RSVA 3BE2A 4JS8A 4GT3A 4U43A 4F7NA 5AUUA 5IZFA 2XK7A 5AWMA 3R9NA 4WSYA 4X7QA 3ULIA 5EQEA 2GNGA 3EWHA 3DKFA 5AUYA 3WF9A 5DNRA 1CDKA 2PU8A 4UZDA 4ZJVA 4ZJIA 4BZDA 1YHVA 2X2KA 3NUXA 3QHRA 2QG7A 3MI9A 2GS2A 4ZZMA 4W4XA 5B0XA 1ZY5A 2ERZE 4GYIA 2WZJA 5EDQA 1ZYJA 5FWKK 2GHMA 4M0YA 2Q0BA 5GHVA 2XRWA 4IQ6A 4NM7A 4RJ6A 4YJVA 4DLIA 5E8XA 4MBJA 2F7XE 3E8CA 2FB8A 2XJ1A 3SRVA 1DS5A 4QOXA 4C4EA 4N70A 3W32A 2BVAA 2HAKA 4YHJA 3CKXA 4PP7A 3AD5A 4YZ9A 4BKJA 3A8WA 2G15A 5HCZA 4CKJA 4O81A 3NLBA 3KRWA 1BL6A 3RM6A 2QO2A 2X2MA 4MD8E 4J53A 3PZEA 3R30A 2R3JA 4Z16A 3PY1A 4IB1A 5HG7A 1IG1A 2FVDA 2Y4IC 4DBXA 3H10A 3ZO1A 1ZYSA 3O96A 1FPUA 4MXZA 4S2ZA 3UYTA 4AQCA 4BTKA 5IQHA 4BDKA 5CU0A 5ANGA 2VWIA 3DDQA 4D2PA 3RZBA 3V6RA 2JKMA 2QHNA 3V51A 4C57A 5HZNA 3MJ1A 5K4IA 2YIQA 1IAJA 1MRVA 2FSLX 3DQXA 4M12A 2XNEA 4GIIA 4IDVA 4L67A 4U80A 2I6LA 3FKLA 3RPSA 3ZC5A 3TACA 4YMJA 2CPKE 2WTCA 5HHWA 4A06A 5LVOA 4HCUA 4Q5EA 3WZJA 2C3LA 2C5XA 3S1HA 1PHKA 4GUBA 2PVKA 3PXQA 5BVOA 1J7IA 2VTSA 3PG3A 4B9DA 2BPMA 4BY9E 4ZIMA 2HW6A 3WF5A 4PPBA 2WFYA 4JIAA 5AV4A 3NNWA 1OBGA 4YR8A 1U54B 3HV4A 2P4IA 4ALUA 1P14A 4YJOA 5LWMA 5CF6A 1FVRA 1ZOEA 3PA5A 4WNPA 1NXKA 1KE5A 4UN0C 4DTBA 3Q3BA 4U5JA 3VN9A 5LMKC 5HEZA 2ONLC 4DEDA 5FM3A 4O21A 3NS9A 2REIA 2QU6A 2W1GA 4GRBA 4AW0A 4N4SA 2XBAA 5DE2A 4UX9A 5I9ZA 3E3BX 4I6HA 4TYGA 5E92A 4C59A 3F6XA 3BV3A 2HW7A 2X8EA 3QRJA 4UYAA 4X3FC 4XHKB 3LFEA 3TCPA 4BIEA 4FT3A 4FE2A 3SGCA 4BGQA 2ITQA 3EQRA 4APPA 4FSRA 4EHVA 1WVXA 1QPEA 3LCTA 5HO6A 4CRLA 4FODA 2B9FA 2QOCA 4I5HA 4BB4A 4DH1A 4KIPA 4H39A 1ZYCA 4WA9A 3VAPA 3IW4A 1YHSA 2X39A 3PPZA 4FTIA 5CVFA 3CTJA 3DAEA 4Q2AA 4TN6A 3Q96A 3VUIA 4K77A 4MXOA 3WOWA 1XBCA 2PMOX 4MXXA 5AR5A 3RPOA 2YISA 2W0JA 3I81A 4G2FA 3GU8A 5LJJA 1R1WA 4BDCA 2GTNA 2YCSA 4QYYA 5A3XA 3UYSA 3D5VA 4MWIA 2R0UA 2YAAA 4QYHA 4EUUA 1U4DA 4WD5A 1P4FA 2QURA 2YDIA 2BTRA 2CCIA 3GNIB 3GOPA 2A4LA 3RAIA 3VO3A 2GSFA 1ZOHA 4QMNA 4YTCA 4EZ7A 2B9HA 3E93A 4L00A 4BCFA 4CD0A 5HI2A 4X6QC 4DCEA 4O0VA 2KULA 3R7GA 4IMYA 2Y6MA 4DYMA 1BI8A 5ACBC 1PMVA 2I1MA 4G9CA 4PRJA 3VS7A 2BHHA 4OTWA 4CFWA 2GQSA 4M97A 4B4LA 4BDAA 2CJMA 3F5XA 4RX7A 4YO4A 1Q24A 3EKKA 2WU7A 1H26A 5D7VA 4QMWA 4NZWB 3FXZA 5HE2A 3UG1A 4RIXA 1R3CA 4TL0A 1WMKA 5HVKA 1Z9XA 2F7EE 2QCSA 1O6YA 4ZY5A 4QP3A 4F9WA 1TQMA 4BGHA 3QGWA 1OI9A 5BNJA 4EK4A 5J9ZA 4FIEA 2HWPA 3UMWA 1P4OA 1WVWA 5TT7A 1V0OA 3BKBA 5EYCA 4O7LA 3TZMA 3CR0A 3UTOA 4M3QA 3GU7A 2GQRA 3VRYA 4RVLA 3LCDA 4DEAA 3LQ5A 3F2NA 3D2KA 2BTSA 4IC7A 2BZKB 1YOMA 4KBCA 3ORTA 4XRJA 3P08A 3K3IA 5E8WA 2XZSA 3OD6X 1GJOA 2IZTA 4P7EA 4QT1A 2UV2A 3EOCA 3CSVA 2ZB0A 4DFXE 3WYXA 1GY3A 4OT5A 4BTFA 4DFUA 3HGKA 5IQAA 2XB7A 3JVSA 3VVHA 3ZSHA 4J97A 3JY9A 3O8PA 4C36A 5IQCA 3Q9ZA 3NPCA 1Z5MA 2CKOA 1Q8ZA 4XNEA 3AGLA 3Q5IA 2OXYA 4AT3A 4O96A 3FY2A 3UVPA 3FLSA 4YC3A 4E5WA 3HMOA 3D7TA 4Q5HA 5HBJA 3U6JA 4YZDA 2GTMA 1M14A 2XCHA 4Y5QA 5CI7A 4BYIA 3QCYA 5BVEA 4JVGA 5M4UA 4NJDA 1H1RA 4YO6A 3R2YA 1H1QA 2QNJA 3EQPA 1VR2A 4FOBA 3V5JA 4AT4A 4BZOA 4ORKA 2O63A 4TPTA 3W8LA 1CKPA 1OUYA 2G1TA 3PXKA 4FEQA 4GMYA 4U44A 3A7IA 3ZFYA 4A9SA 3NNUA 5D11A 5AP0A 4FTRA 4R5YA 4DFLA 2R4BA 4FNYA 4HVDA 3RAHA 3DJ5A 4Y46A 4CLIA 3GCQA 5JZJA 4FTMA 4J71A 4IVCA 3EIDA 3LMIA 3Q4ZA 4CT2A 3VBXA 3NUYA 5CVGA 3DNDA 4GH2A 3C5IA 4FA2A 3ZHPC 4J99A 3NNXA 4BDDA 5CEQA 4F9BA 3MH1A 4XMOA 3KCKA 3SW4A 1JOWB 4FV7A 2WMUA 4IB5A 4MNFA 3PTGA 3AMYA 4X2GA 3WE4A 4CV9A 3QC9A 3VJNA 2PVLA 4G3EA 4O91A 3TNPC 4AA4A 3CS9A 1JSUA 2IJMA 3OTUA 4D4RA 4EH5A 4L6QA 4AOJA 4FKOA 4HZRA 2Z7QA 4FSYA 4YHTA 2LAVA 4ZSLA 3RINA 3QYZA 3JR1A 4AGDA 4MF0A 3R02A 1A9UA 3WIKA 3V3VA 4O7TA 1IA8A 4KS8A 3TG1A 3UIBA 3DJ7A 2J0KA 4QTCA 1H1PA 3FMHA 3ZEPA 4L46A 3OC1A 3OXIA 5DT0A 5J7HA 4C7TA 1NW1A 2X2LA 2YM4A 4L01A 2XIKA 2PVJA 3VQUA 5CXZA 5EQPA 5C26A 1LEWA 2W1ZA 3PLAE 2H96A 4G9RA 1J1BA 4D55A 4QMSA 3F61A 3UGCA 4ZS4A 4MAOA 5LVLA 4UMRA 3O7LB 3LM0A 3GU6A 5ETIA 2R3HA 2RG6A 2RFDA 2B55A 3PSDA 5GZAA 3W1FA 3VUHA 3ENHA 4PY1A 2HWOA 4MXAA 4RG0A 1ERKA 3EYGA 4JQ8A 4WBOA 1H01A 5EM7A 3V8WA 4AUAA 4C34A 3PE2A 4XG6A 5AIRA 4GJ2A 2EU9A 5HE1A 4I6FA 4V01A 5BX0A 5DT3A 1YW2A 1DI9A 2B54A 3EJ1A 2XVDA 3AT2A 4NFMA 1H25A 4LOPA 4E4LA 3FE3A 4IWDA 4PUZA 4ENXA 2ZAZA 3I60A 3ZBXA 3C50A 1PJKA 3EB0A 3D83A 1FQ1B 3D4QA 1REJA 2JFMA 4JQEA 5KO1A 4FTJA 5L2IA 3A62A 2PTKA 3W2CA 3ZCLA 4RJ7A 3KMMA 3N4UA 2QONA 5HU3A 5ICPA 1J7UA 2GDOA 3DXNA 3V5PA 3NIEA 4ANQA 3RCJA 5I9XA 3KRJA 4AS0A 5K5NA 2YIRA 3UZRA 3MB6A 1BX6A 3M2WA 1LPUA 4F64A 3NDMA 4QTEA 4USDA 4EOJA 3I5NA 2C6DA 3PXFA 4U6RA 2OJFE 2QC6A 5L6WL 1HOWA 3GI3A 3QQJA 4IVBA 5IA1A 2OICA 2XIZA 4JXFA 4EC9A 4ZY6A 4RVTA 4RIOA 3KN5A 4ANSA 3RP9A 4UALA 3LIJA 4HJOA 3U55A 3LXKA 3NSZA 3KVWA 2WGJA 4HPUE 4BKYA 3L8SA 4EORA 4PTGA 3ZZEA 1V0BA 3QD3A 4EH4A 3FZ1A 3UIXA 3IECA 4O27B 1OL5A 5HD4A 2JFLA 1ZXEA 4BDEA 2R3NA 3BELA 2O0UA 4NM0A 5JFXA 2I0YA 4QMQA 3ETAA 5JGAA 5HD7A 3EN4A 1SVHA 4XG4A 3LFBA 4L44A 3BHTA 2JEDA 4YNOA 4EOOA 2QO9A 4F9AA 4C2WA 2RF9A 4MQ2A 2V22A 4X0MA 2ZV8A 2RIOA 4FKJA 3O7LD 1P2AA 3PPJA 3MDYA 2BFXA 3RM7A 4W8DA 1IA9A 1ZY4A 3BEAA 4RX5A 5T3QA 4WIHA 3RNIA 4FG9A 3FUPA 2JDTA 4FVPA 4MNEB 2BMCA 4FV9A 3HUCA 3HA8A 5CSPA 2UW5A 4ASXA 2YERA 5IUGA 1WCCA 2YWPA 4M66A 3F9NA 2WKMA 4C3PA 2FUMA 2YDJA 3Q52A 3KXNA 2B52A 5EOBA 2J0MB 4I21A 5B2KA 4XP0A 4E6DA 1TVOA 2JIUA 3H0YA 4V05A 3FXWA 3EL7A 2JAVA 2WEIA 3OMVA 3P86A 4LUDA 3ZH8A 3TZ7A 4AW2A 4U8ZA 3KRXA 2Z7SA 4CKRA 4CG9A 1SNXA 4MQ1A 2EUFB 3SA0A 1AQ1A 3TT0A 3CGFA 3LMGA 4FSZA 3AQVA 5FDXA 5L2QA 5K0KA 4KIKA 5HE3A 3DFAA 4IM0A 4JBPA 4L43A 4O38A 1UU9A 4EI4A 4X6RA 3EQBA 3MA3A 4MBIA 1ND4A 1OBDA 2R3MA 3QGYA 2ITPA 1BI7A 1IASA 2BRMA 3OCTA 4FOCA 4WG3A 2EB3A 3KC3A 3OXZA 3MTLA 3EQDA 2PUNA 1SVGA 5H8EA 2XKEA 4BCKA 3MA6A 5DR9A 4I5CA 4CSVA 1OKVA 4F0GA 4J98A 2UW0A 3R1SA 5AP5A 2G2HA 4F70A 4IBMA 4ZTHA 4CFUA 3EYHA 3MH0A 3F66A 4QMYA 4RVMA 5HLPA 2XK3A 3OWPA 3SX9A 2XRUA 2ZJWA 3QUEA 2EWAA 4JBOA 4KSPA 4RJ4A 5KZIA 3GCVA 4YLKA 2J4ZA 2QO7A 2JD5A 2X8IA 4AF3A 3MFRA 3G0FA 4DC2A 3F5UA 4RX9A 4UYNA 3QD0A 3QQLA 3PVBA 2UZOA 3AC2A 3GOKA 2RL5A 3L9MA 4IAFA 3NMUF 1URCA 4FKUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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