3FMLA

P38 kinase crystal structure in complex with ro6224
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
349
structure length
342
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title P38 kinase crystal structure in complex with RO6224
rcsb
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 108
structure length 342
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fmlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fmlA01
2GTMA 3Q9XA 5K0KA 3HKOA 4X2KA 4RBLA 1TQPA 4HCTA 4JG6A 4HVSA 5M07A 5AUTA 5HBHA 2CNVA 3HYHA 3QX2A 4L44A 2C3KA 5B0XA 3UGCA 3QRTA 4HGEA 3L8VA 4XRLA 4CTCA 4DFNA 2W1CA 4XG8A 2X4FA 3QQHA 3QA8A 1ZYJA 4YHTA 3QC9A 3KXXA 4IC7A 4JNWA 2JFMA 1XH6A 4ZK5A 4ANSA 2F9GA 4FT0A 3TV4A 2YZAA 4RJ3A 4BDDA 4EH5A 3A2CA 5I9YA 5FM3A 4PP9A 4YSMA 3S1HA 2PU8A 1ZWSA 5CVFA 3OBJA 3QRJA 4YLLA 2PZRA 2C6LA 3R9NA 3R7OA 4K33A 3R7IA 5TR6A 4USEA 3DQWA 3QBNA 4LOQA 2XRUA 3P7AA 1U46A 4BKZA 4ALWA 4LRMA 5I9ZA 1IAJA 1CTPE 5HCYA 4AZTA 5LJJA 4BDFA 4YZ9A 3EQPA 4I6HA 4C62A 3HAMA 4A9RA 4QPMA 2PWLA 3ZYAA 4B8MA 4P2KA 4BCIA 4O0VA 1KSWA 2WTCA 4Z7GA 1URWA 1YOLA 3ORNA 3BYSA 5KMMA 3QF9A 5LARA 2OICA 2PSQA 2EU9A 5DE2A 3U4WA 4I5CA 4DFYA 3DFAA 2Z7LA 1P4FA 3AC4A 5F9EA 4J96A 3G9NA 4FSUA 4BGQA 4RJ4A 2VWYA 3JVSA 4FI1A 4L3JA 5K0XA 2B1PA 2CDZA 4IB5A 3VUIA 2YDIA 3JUHA 2WD1A 3UG2A 3TDWA 4UMUA 5CEQA 3AOXA 3QFVA 4O81A 1H1PA 4NCTC 4O82A 3QLFA 3CTQA 3VAPA 4XG7A 3FZSA 3PG3A 2YCRA 3QZFA 5HIDA 4N4SA 4MWIA 3ZU7A 3H10A 3MSSA 1K2PA 2BR1A 1SMHA 2ITOA 3VUKA 4IQ6A 1DAWA 1NXKA 1PMVA 3O71A 4XG2A 5GZ9A 3HUCA 3WF9A 1KOAA 4UMPA 2XUUA 3NPCA 4A9UA 2OZAA 4L3PA 4ZSJA 3QKMA 1XH8A 4FG9A 4YU2A 1REJA 4YLJA 4MQ2A 1CDKA 1J3HA 3O8TA 4JDJA 2B52A 3Q60A 4IX5A 3E8NA 3SG8A 3ROCA 1YDRE 3P5KA 1YWVA 4FNZA 3GT8A 4FV8A 3SRVA 2I6LA 4I4EA 1LEZA 4IZ5A 2PTKA 4J71A 2WELA 1XH9A 3FHIA 4GKIA 2UW5A 3DBCA 4X3FA 2BRNA 2E9UA 3HNGA 2Y4IC 5J9YA 2WIHA 4FZ7A 3ZONA 2BRBA 3E62A 4QMQA 1TQIA 5H2UA 1JPAA 2W5HA 3ZLYA 1OKZA 3C0GA 1R3CA 1PYEA 4IB3A 4ZSGA 4EOOA 4L53A 1XR1A 4MXOA 2PPQA 3KQ7A 3OEZA 4MXAA 5DR2A 2NO3A 2PE2A 4KABA 4O0RA 3KU2A 3UDBA 4ANMA 4PDYA 5E4HA 1AQ1A 1Q3WA 2X9FA 4ITHA 3G33A 3QCQA 4L3LA 5E1EA 2QO9A 3COIA 4J95A 4Y85A 2C6TA 4DGLC 5IMEA 5K4JA 4QQJA 2C6IA 1PKGA 4BDBA 5CAVA 2OF2A 3PA3A 1F0QA 3RKBA 2O0UA 5LCKA 2R3IA 2VX1A 3I5NA 2ZOQA 4FTKA 2WMSA 5B2KA 4A06A 5CAUA 3C5UA 2BPMA 2G2IA 4LG4A 3E63A 3BHYA 4F9WA 4JDHA 5J87A 3S95A 3ETAA 4HCUA 5AV2A 3PSCA 3VUMA 4U80A 2GNLA 3EQRA 2DS1A 4ACDA 5LVLA 4ZJJA 3DY7A 1ZYCA 5FTOA 4F9BA 4LUDA 4CFWA 4YLKA 5CI7A 4DCEA 5HTBA 1U54A 2IVSA 4HCVA 3NS9A 3G90X 3FLQA 2WMQA 3QTXA 3RPVA 2C5OA 2CCIA 4IJPA 4D4VA 3HMMA 3WYYA 2WQBA 4OTDA 2QD9A 3FMHA 3KL8A 3THBA 5A54A 3CQUA 2ITQA 3EL7A 4PDSA 2ETMA 2YCSA 3EQGA 1YWRA 3D9VA 2R3PA 2R3QA 5HVYA 3PXZA 1OKVA 4GW8A 3MY5A 2V0DA 1U4DA 3WYXA 4B99A 5CSVA 3C1XA 4NFMA 4CRLA 4RVMA 1SZMA 4FIJA 2BALA 3TZMA 3R63A 5C27A 4FA2A 3ZUTA 1QPJA 3VBTA 1ZYSA 3CP9A 2QR8A 4R3PA 4MD9E 5FWKK 4B7TA 1FMKA 2P4IA 3H0YA 3LCOA 4TXCA 4AGCA 1QCFA 1XHAA 1M2QA 2G2FA 3GC8A 1YI6A 2IZRA 4Z9LA 3R6XA 3EN7A 3FC2A 3NNVA 3G6GA 5L2IA 3TDVA 2XIXA 3FLNC 4JL9A 1PXMA 4W4VA 3UC3A 1MRVA 1MQBA 3DK3A 2VTMA 3GC7A 2JIUA 1JKKA 4WG3A 2PVNA 4FV5A 4J8NA 4PNIA 5GJFA 2J0MB 1WBVA 3LIJA 2WNTA 3OVVA 3PIYA 3RNYA 2QG5A 3PLAE 3A7GA 2X7OA 4FT5A 3PJ1A 4KBKA 4PDPA 4S34A 1WVYA 5EYCA 3LQ5A 4EK6A 3Q2MA 4DE4A 4WNMA 4D2WA 4FSWA 4E73A 4I22A 2QONA 4O27B 2VWVA 2Z7QA 2B0QA 3JXWA 3T9IA 3HLLA 4KSPA 3HX4A 4A9TA 4HPUE 1OIUA 5AP0A 4E4XA 3GU4A 4YO4A 1H1RA 1G5SA 4Z55A 1WMKA 2PE0A 3ORKA 3U6HA 5F94A 3JY9A 4GU9A 1ZOGA 3UZPA 3ATSA 4ZS0A 1MP8A 4J99A 1UU3A 2VO7A 5AUXA 5C03A 3VO3A 4BCNA 4CKJA 3NLBA 4O2ZA 3SX9A 5EI6A 3DKCA 3F5GA 5CF4A 4AA4A 4IX4A 4Y95A 5AP6A 3MDYA 4I6QA 2C6MA 4EONA 4GFMA 4GFOA 3E3PA 2YITA 4S32A 1BI8A 2HZNA 1RE8A 2PVHA 3H4JA 4MYGA 1KE7A 4W9XA 5J5SA 5J1VA 4G3CA 2QKWB 4AE9A 2UW8A 3BGZA 4EHVA 3FEGA 4WHZA 1ZYLA 3FMLA 5FTQA 4HGTA 3ZFYA 3IS5A 3KA0A 3HDNA 3EB0A 4FT3A 4GYGA 4I23A 3ACKA 1GZOA 2W17A 4WD5A 4E6CA 4W4XA 4L42A 4U97A 5FM2A 4OLIA 1VZOA 2GSFA 1LPUA 4EH3A 5BMMA 1WCCA 3MFUA 2ZYBA 1ZZLA 4EHZA 1YHWA 1YVJA 5LMKA 4BCPA 3Q4CA 1WZYA 4RG0A 3D7TA 5J7HA 3QWKA 5T6KA 5IA4A 2I0EA 4UN0C 2X2LA 4NW6A 5D11A 4EWQA 5FBOA 5IF1A 2W9ZB 4L01A 5HE3A 4DEHA 2ITXA 2QOOA 1OI9A 3I60A 2CKEA 4OT5A 3LOKA 2XJ2A 4JS8A 2J2IB 2JITA 3BWJA 4TWOA 4Y5HA 2WHBA 4DEIA 3QQGA 4ZLZA 5IISA 4Z7HA 1UWJA 5IH5A 5HO7A 5E7RA 2VNYA 3CJGA 3EZVA 4RSSA 4O96A 1ZYDA 4GMYA 5AIRA 3OEFX 3GQLA 2Z2WA 3MJ1A 4M68A 3AGLA 5M4FA 2YACA 2R2PA 3IONA 3BLQA 2P3GX 3EQCA 1V1KA 3M42A 4TRLA 5HIBA 1WBTA 4ALUA 5IQDA 3UODA 2YIYA 1S9JA 4EH7A 3R02A 2VGOA 5HKMA 5JSMA 4PRJA 3KMWA 4BHNA 2EVAA 5AP4A 3WZEA 3IO7A 3KXMA 3LFEA 3NUYA 4HW7A 1P4OA 1ZMUA 3AXWA 2UUEA 4BYIA 3OG7A 3SG9A 5IQGA 3FXZA 4G3DA 4ZS4A 1OL7A 5AUYA 5E8YA 3D83A 3G6HA 4I3ZA 1OB3A 3B2TA 1FGIA 2XCHA 1U5QA 3PVGA 4BYJA 5BVOA 5J9ZA 1K9AA 4QNYA 4D5HA 2F7ZE 4ACMA 5HEZA 1QPCA 2W1EA 3DBEA 3ODYX 1Y91A 4RIWB 3C4FA 2UVYA 4XOYA 3R8UA 1OIYA 4BCHA 3FLYA 4A7CA 3QUDA 4O6LA 5DOSA 3R7YA 5HO8A 4ANOA 3F5XA 3KRJA 3TXOA 2BZKB 4RVTA 5CYIA 3QXPA 3L9LA 4YHFA 4XEYA 4OW8A 2JIIA 3NGAA 2R3HA 3IGGA 2VX3A 3TTIA 5M57A 4FKWA 3L8XA 2OZOA 2QKRA 3I6WA 5DT4A 3I5ZA 1DM2A 2J50A 4IM0A 2FB8A 3TIYA 4C4JA 3GU7A 2UW0A 3LPBA 3NSZA 4MAOA 4G3EA 4IM2A 3FY2A 2OJGA 4RT7A 2JDTA 3LFBA 3LFSA 4Y8DA 3U9CA 1BI7A 3EHAA 3D2KA 3KRWA 4F7SA 2CSNA 3FMDA 1JNKA 4HGLA 4TL0A 2V55A 2WEIA 3MY0A 1XJDA 3OTVA 4KKHA 3RCJA 2XYUA 3UOHA 3EZRA 5KMOA 4F9YA 4AXAA 1A48A 1H00A 4W4WA 2GS2A 3OT8A 4BKJA 3RBWA 4X7QA 2YM7A 5JRSA 1V0PA 3PXFA 1ZMVA 1R39A 4RVLA 5BVDA 2JDOA 5JEBA 5EQPA 3CR0A 3H9OA 5E8ZA 2QI8A 4UBAA 1IEPA 4XV2A 3FUPA 5EHOA 3OBGA 2QU5A 2I0YA 3E88A 3FMJA 4KD1A 4M7IA 5A46A 4KKGA 2F49A 3QAME 3ZZEA 4EH2A 3AGMA 2XA4A 2CPKE 4I24A 2VO3A 2ZV9A 1VYWA 4PPAA 4OAVB 5KCVA 5DLSA 4F70A 5EYDA 2F57A 4FSRA 4FICA 3V5QA 3AC3A 3EN6A 4IVBA 5FXSA 2OXXA 3MFRA 3LCSA 2HY81 3POOA 2IW6A 5FGKA 3PXRA 3AC1A 4X2FA 4FIFA 5A6NA 3WOWA 3OXTA 5TOZA 4MHAA 3TZ8A 3MPMA 5EI8A 4NM7A 5IUGA 5JGDA 2UW6A 4WBOA 3M11A 4MWHA 2B9JA 4XG6A 4C33A 4DEGA 5HNIX 5LVPA 2X7FA 3NNXA 4M8TA 5TO8A 5FEDA 3TKHA 4BDEA 2O2UA 3LJ1A 5TF9A 1ZXEA 1Q5KA 4QOXA 3QTUA 4CG8A 2HK5A 3EN4A 3KXNA 5A6OA 5EM5A 1UA2A 3S0OA 2OIQA 1ZRZA 3ALOA 4G2FA 4YZDA 4HNFA 4AZSA 2W96B 2OGVA 3KMMA 4GRBA 1NVRA 2BHEA 3F3TA 3R1NA 3S3IA 2EXCX 5CLPA 4E7WA 3GUBA 3OOGA 2XNOA 4KIKB 5CNOA 4A07A 1JSTA 4C02A 4EHGA 5AAFA 4PUZA 4BL1A 3KF4A 1Q99A 4L9IA 3MFSA 4MBJA 3FC1X 4R6VA 4QPSA 3AT3A 5ETCA 2GFSA 3MVJA 2PUIA 1MRUA 5K9IA 1YXXA 2RG6A 1BKXA 2GNHA 3NX8A 5DPVA 3KN5A 2NRYA 2FSOX 4MTAA 4RMZA 3SQQA 1OUKA 2BRGA 4D58A 2YN8A 4E4MA 2OFUA 3OWJA 3TKUA 5IA3A 4DGNA 4I6FA 4IW0A 3ZM9A 1OIQA 4GJ2A 4NWMA 3HP5A 4FBXA 2CKQA 3DKGA 2YHVA 4CQEA 3KGAA 5IA5A 4ANNA 4JVGA 4YJQA 1W0XC 3BKBA 4JIAA 4U42A 4XP2A 2CKPA 4NIFB 5HIEA 4IACA 5DT3A 3W2SA 4FNYA 3HA6A 4F99A 3E7OA 3KFAA 1O9UA 3I0QA 3V8SA 3VC4A 1V0BA 1DAYA 3OWLA 2O3PA 3QHRA 3TM0A 5AV4A 2JKOA 5KMNA 2W05A 3OP5A 5LMKC 2R7IA 5HOAA 3BE9A 4PTCA 4BDIA 4JLCA 2VTPA 4OBOA 4CMOA 4CG9A 3JY0A 3VQUA 2V5QA 1Q97A 4EZ5A 4D1ZA 3UE4A 3ZC5A 1ZAOA 5CF8A 3EFJA 3NCGA 4FK3A 1Z5MA 4I93A 4RIYB 2BTRA 5DIAA 3ZXZA 2QOIA 2GCDA 2OJIA 4IWQA 5AWMA 3AD4A 3V5JA 1Q4LA 5IZFA 4RIXA 2OIBA 3L1SA 2R3NA 1H27A 1PXLA 4D0WA 2QOHA 2W1ZA 5J7BA 2OO8X 2WPAA 3W55A 3I7BA 4BCKA 3W10A 4U40A 1XH5A 4BICA 4BIEA 2YIQA 3R1YA 4L43A 4YMJA 4RA4A 1OPKA 3Q3BA 2WMXA 4F64A 2RSVA 4UX9A 3LFAA 3ZLWA 5IQBA 5CTPA 3PY3A 5L8LA 3MIYA 2VZ6A 4IE9A 3IW4A 3NR9A 5AR2A 4QMVA 4CNHA 3WZJA 4O86A 4DITA 3MESA 1BL6A 4JRVA 3REPA 4LGGA 4O7ZA 4L7SA 3VVHA 5L2SA 3PXQA 4ZTRA 2JC6A 2NRUA 2XM9A 3F7ZA 3NYNA 5HO6A 3OC1A 4DH5A 2JDRA 2J90A 5GZAA 2YJRA 4J53A 4N6YA 3UQFA 3TT0A 3LCTA 5H8EA 2XIYA 1Q3DA 2B9HA 4ZJIA 2WQMA 3BRBA 2QQ7A 4R7IA 3RMFA 2FSTX 2C30A 2Y4PA 3PWYA 4I4FA 4GFGA 4G6LA 2BROA 5JRQA 3RHKA 5HI2A 4GYIA 4QP3A 4ZLOA 3SLSA 5B2MA 4EWHA 2PVKA 3FI3A 5EW3A 4M97A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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