3FXZA

Crystal structure of pak1 kinase domain with ruthenium complex lambda-fl172
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
293
structure length
292
Chain Sequence
SDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIRQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Targeting Large Kinase Active Site with Rigid, Bulky Octahedral Ruthenium Complexes
pubmed rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 292
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fxzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fxzA01
2GQRA 1QPEA 3GENA 3RPVA 4C2VA 1F0QA 3E8DA 3GCSA 4G6LA 3BEGA 4K0YA 2X39A 1MP8A 5J7HA 2FA2A 2KULA 3C0GA 3LFNA 4L67A 1TQMA 3RINA 2YM7A 2J0LA 4ITIA 4RWIA 5AP3A 2IZTA 4PPBA 1GZNA 4L43A 4ZJVA 3FZSA 2WMRA 3EQGA 1YWVA 5DR2A 4F7JA 2OF2A 3CQWA 4IBMA 1OL7A 2WOUA 3ENHA 3KF7A 1H1QA 3E7OA 3FHRA 5AR5A 2W5AA 5HLPA 5A54A 1YI6A 4FKOA 1QL6A 2Y8OA 1Q3WA 1J7LA 4M67A 3CY2A 3OF0A 3LCOA 4CMUA 4C4GA 2W9FB 4CRSA 5G6VA 3PG1A 2UW4A 2VWUA 3E93A 4BWKA 2XIRA 2XCHA 3ZU7A 3LXNA 3UC4A 3R63A 5ANKA 3LFCA 4JG7A 3COMA 3G6HA 3TXOA 4IB3A 2QU5A 4HCVA 2YDIA 4I0TA 3FY0A 3NUNA 3QTSA 4IAAA 3UZTA 4IIRA 2ONLC 2CN5A 3QQFA 5TE0A 4AZTA 3QA8A 4KIQA 5JT2A 3V5TA 3CS9A 4O1PA 4EH4A 3VS3A 3FKNA 4I1ZA 2PHKA 3WIGA 5AR2A 5T6KA 3EWHA 4FVRA 4QMMA 1V0PA 2EB3A 5E8VA 4FV7A 4O0YA 2IW9A 4O7YA 3PVUA 3EKNA 1XH5A 2GFCA 2WOTA 3DLZA 3DBEA 3VNTA 5C26A 3CQEA 2WMWA 5M4UA 3OTUA 4QYFA 4NTTA 5M07A 1CKPA 4W9XA 4MNFA 3R8ZA 4ZAUA 5IMXA 2QOIA 4QO9A 3JVSA 2IW8A 2J2IB 2YM5A 5L2WA 5HNBA 3OCTA 5DNRA 3OC1A 4MKCA 1IAHA 3EN7A 3NVMB 4L3PA 4H58A 2E9UA 5EH0A 3RVGA 3LCKA 2ITYA 4YC8A 4RIYB 3ORZA 4BDHA 2CKPA 4LV5A 4MHAA 2WQNA 1OKZA 4KWPA 4ANLA 4CZUA 1OKYA 3KKVA 4WRGA 3GQIA 4QP4A 2JAMA 4IVAA 3R8LA 2YZAA 2OKRA 3HYHA 4IAIA 4MWIA 3R9HA 5EQYA 1UU7A 3ANQA 5CZHA 4ZLYA 5BYYA 3F2RA 2A1AB 5EDQA 4B0GA 4W8EA 4L6QA 1DI8A 3EYGA 3V8WA 2ESMA 2R3LA 2QVSE 4U9AA 5LMBA 3R9RA 3C5UA 3LQ8A 1M2PA 5EHYA 2UZLA 3IW7A 3KXHA 4XYFA 3OROA 1B6CB 3GC0A 3KXMA 4MNEB 4HYUA 4DG3E 3VW6A 2XKEA 4F1OA 2XK8A 5CQUA 3UTOA 4D55A 3CQUA 5CEKA 4GL9A 4RIYA 4CFVA 5IQIA 5FP5A 5FEDA 3AC3A 3RNYA 3EFLA 3UPXA 5IEYA 1P2AA 4QQ5A 4FV0A 1OI9A 3PPJA 4HPUE 4OTIA 4UWBA 4FT3A 4IHPA 4DFLA 2QG5A 4F0IA 1XKKA 5HO7A 2B9IA 3UO6A 2VTMA 1Y57A 3QU0A 4XP2A 3PTGA 3RJCA 4E4MA 5AP1A 1ZY5A 3PVWA 2VWVA 4I4EA 5KMJA 3GBZA 2PULA 2IWIA 2C6DA 3B2WA 5LWNA 2I0YA 5DT3A 4U42A 1JOWB 3L9LA 4FYNA 4MYGA 1B38A 1PKGA 4ACHA 5CLPA 2OI4X 2X4ZA 4Q9SA 5JZJA 3Q5IA 2OZAA 1MRVA 2PMOX 2XBAA 3R1NA 3GC8A 2UVYA 3UP2A 4DTKA 2W9ZB 4PNIA 2QONA 3MH1A 2XJ0A 1H4LA 4EK3A 2C5NA 3EQHA 5HG8A 5HNIX 3S2PA 4UYNA 3O7LB 1SZMA 3KVWA 4B8LA 4FSWA 3PSDA 3C7QA 2BMCA 4FTKA 1WCCA 4IWPA 3FMNA 5DLSA 2WTDA 4HVHA 4Q5HA 3GCVA 4NK9A 1WAKA 1ZZLA 4H39A 5HVJA 5ANOA 4NIFB 1L3RE 2V0DA 2XBJA 4UZDA 3V51A 4ZZOA 1WBWA 3ORPA 2GDOA 3UG1A 5JRQA 3KRWA 3AGLA 2EB2A 3MS9A 1KUTA 3ZOSA 3DKOA 2QQ7A 5HHWA 3QCSA 3MA6A 3OFMA 3Q52A 3E87A 3CBLA 4U5JA 1TKIA 1UWHA 3GB2A 4ACMA 5CQWA 3TZ7A 4FKIA 5CANA 4GUEA 3QTQA 3F69A 2X7GA 5KMNA 5A46A 5EYMA 1VJYA 3I7BA 3OCGA 1AD5A 3ANRA 4MK0A 4RJ4A 4ID7A 3QQKA 5E8TA 4XG3A 3GC7A 3MFRA 5GNKA 5AM6A 4KSQA 5HTBA 1FVRA 3FZOA 4LRJA 4CTBA 5E9EA 3BV3A 3QCXA 3TKIA 3R7EA 1FMKA 1JVPP 3FUPA 4CQEA 3O8UA 5L4QA 4B8MA 3H3CA 1NW1A 5LJJA 2UZTA 3N9XA 4GT5A 3OMVA 1KSWA 4AF3A 4CFFA 3QBNA 4OAUC 4M15A 2C47A 4ANBA 5HX6A 4F9YA 2RIOA 2OIBA 4MCVA 4PP7A 5IDPA 3CKWA 4I22A 1FGKA 3BIZA 2VWIA 5DR9A 4BZNA 2WTKC 1PKDA 3RK9A 3T3UA 4TRLA 3V5QA 4C38A 3VS0A 3H4JA 4JIKA 5KZIA 3RAHA 4JIAA 3PE2A 3RCJA 4BCGA 1UNHA 2W06A 3HV5A 4W9WA 4G3DA 4RFYA 4B4LA 3W18A 2C68A 2C5OA 3F66A 5HD4A 4EI4A 3L8PA 5LMKA 3HP5A 3HV4A 4HVSA 3W32A 1H27A 3TV7A 2YEXA 5AUUA 4O7NA 4MD9E 1KV2A 4CZYB 4E6QA 4I5MA 4IX3A 4BDDA 4W4YA 3KXXA 2PTKA 3PVBA 1Q8YA 4F65A 4D0WA 2J5FA 3NGAA 3MESA 4CG9A 5CF8A 5DT0A 1NT2A 1LP4A 2J7TA 3LJ1A 4YC3A 5DG5A 1GOLA 2ZDTA 4NCTA 5AWMA 3UQFA 4E26A 4FKUA 2RFDA 1LEZA 2BAQA 4D4YA 3LW0A 4YPSA 3FQEA 4CT1A 3DCVA 4HCTA 4XCUA 4AAAA 2W1CA 5KO1A 4DBNA 2UVZA 3BHYA 3DOGA 5JZNA 3VRZA 5CALA 5HE3A 4RJ6A 4FKGA 3LHJA 4HYHA 3I5ZA 1Q97A 4P5QA 5HE1A 3ZRMA 2W0JA 1DAYA 3GQLA 4ACDA 2FGIA 2R2PA 2RFNA 3C0IA 5B2KA 1XQZA 4X2NA 3N4VA 4ZSJA 3ZS5A 4HNFA 4GG5A 2C6TA 3G0FA 4D2PA 2W1DA 1ZMVA 4PP9A 5KKRC 4X2KA 4EHZA 2E9OA 5CEOA 3FLZA 3JXWA 4P7EA 4QPSA 4GV1A 4QQTA 4P90A 2UW9A 1G3NA 3BRBA 4N70A 5CXHA 4PQNA 4S32A 5CU4A 3NAYA 3E8EA 5AR7A 2XEYA 4OTWA 2C5XA 4IQ6A 4AZSA 5E8UA 4YO4A 1LR4A 2VTQA 3DKGA 4ZSEA 3OEFX 4OBQA 2B52A 4L53A 3OXZA 2Z7SA 5FGKA 5AUTA 4DF3A 3QQGA 2DYLA 4KIKB 2QKRA 2PZPA 5HG9A 3EQRA 2HXLA 3LMGA 2WTCA 3DQWA 2HOGA 5CAVA 3EQBA 3ULZA 3CGFA 3ZM4A 1WZYA 2BAKA 2CKEA 5EDPA 4PMMA 4E73A 2C6EA 3NNUA 4CKRA 1URWA 2QU6A 3NYOA 3UYSA 1PW2A 4JDKA 3ZSHA 5CAOA 2HIWA 3R8VA 1ZARA 1PMNA 1M7NA 5AADA 4GSBA 2ACXA 3LFDA 2W5HA 3CSVA 2WU6A 3F6XA 3N4TA 4C62A 3AQVA 3LFEA 1XWSA 3AMYA 4N4SA 5CEIA 4DFBA 5CENA 5BMSA 2W1HA 3OG7A 4RWJA 5IG1A 4NT4A 1IAJA 2OIQA 4R1VA 2J4ZA 3RAIA 2R4BA 3KY2A 2PUPA 3MVMA 3GVUA 3ZEWA 4E4XA 3MJ2A 5JFWA 3LCSA 1FMOE 5BPYA 4KBKA 4EBWA 4GJ2A 4ZJIA 3U9NA 2YCFA 3U6HA 3KC3A 4C4HA 3UIXA 1ZLTA 3OBGA 3ROYA 3MV5A 4J7BA 4O0SA 5EI2A 1FQ1B 4KIKA 3ZRLA 2VTAA 3NNXA 4E3CA 2YERA 2OJIA 2WHBA 3QL8A 4E7WA 5BX0A 3PJ1A 4TKSA 3TKUA 5KNJA 3Q4ZA 4II5A 3KU2A 2Z7RA 1KE5A 4BI0A 2YLFA 3BU6A 5C27A 3SOCA 2YZLA 4C3RA 1Z57A 3E8CA 3EQPA 3R7GA 3NDMA 3ZO3A 2QOCA 3RNIA 2HY0A 3AT2A 3UVQA 4BGHA 5I0BA 3G9NA 3QZFA 2OU7A 3FHIA 4CT2A 3FJQE 4FTTA 4N6YA 3OCSA 1KE6A 2PVMA 1YXUA 5AR3A 4AQCA 3EJ1A 4NM0A 2H8HA 3HMIA 5HESA 2R3HA 3W10A 4ZY5A 5CU6A 5IU2A 2GSFA 2BPMA 3R2BA 4GK3A 4WNKA 4XG7A 4LM5A 4YLJA 4YZBA 2V55A 2P2IA 3U87A 3E3PA 4PDPA 3PVGA 2BTSA 3COIA 2JKQA 4M13A 4AOIA 4RLKA 4C61A 3CCNA 5CTPA 4RVTA 4CZTA 2VN9A 3HUCA 3ZFYA 2E9PA 3MVJA 2B9JA 5KZ0A 5FUTA 2CDZA 3KB7A 2XK7A 5E8YA 3FPMA 3OOGA 2QD9A 3VJOA 3PZEA 5CSVA 4O83A 5DN3A 4G3CA 4EOSA 4U6RA 3CTJA 4BDEA 1NY3A 2HW6A 2J0JA 4P4CA 3LLTA 3NS9A 2AUHA 2EXCX 4TYJA 2FO0A 4KSPA 5B2LA 1E1XA 3IW6A 3UOKA 4OUCA 4R77A 1OPJA 3EN6A 4XHKB 3VUHA 3QRTA 1OPKA 2WGJA 3JPVA 5EYDA 3EOCA 2J51A 2ZVAA 4YZNA 3RPRA 1XO2B 2YACA 4XP0A 5GZ8A 2UUEA 1Z5MA 4QD6A 3R9DA 5DRBA 5AX9A 5EFQA 4G2FA 3P23A 3E92A 4RA5A 4F1TA 1ZYDA 4AOJA 4QPAA 3VW8A 3A8WA 4CLIA 2C3KA 2C1AA 4KRCA 1ERKA 4J95A 1XH8A 3NR9A 4MBJA 4QYHA 3Q2MA 4EK8A 1OBGA 3LM0A 5FG8A 4AT3A 1NXKA 5B0XA 2VD5A 1VR2A 4FZFB 3W8QA 4EWHA 4FSTA 3NW7A 3DPKA 3ORTA 2CNUA 4G9CA 2F49A 2Y6OA 4BL1A 2VGOA 4C34A 1A9UA 2R3QA 3IW5A 1BYGA 4WO5A 4MBIA 4FF8A 4HGSA 4XV9A 5HOAA 3C4EA 3PUPA 3VQHA 1ZMWA 3LAUA 4D4SA 1H08A 1CMKE 2ZMCA 3E63A 1CDKA 2GNLA 3ZO2A 4NM5A 5H3QA 2F4JA 4EC9A 4RX7A 4C37A 4FI1A 1J1BA 2R9SA 3OD6X 5C03A 1OL1A 4D1XA 5HU9A 5FEEA 5FXSA 2AYPA 3BPRA 2VO7A 5HO8A 5L6WL 4JQ7A 5CAUA 2Z02A 4C02A 5DOSA 4RVKA 5K0KA 3QRKA 3DBDA 2A19B 4OTRA 4IAZA 4AS0A 2XMYA 4F63A 2UW8A 4F6SA 4NM7A 3W1FA 4XUFA 3MIAA 3OCBA 3DTCA 2C3IB 3HECA 5DRDA 2I1MA 1G8SA 4FEUA 3I0OA 1BMKA 1QPJA 4RIXB 4ZJJA 4FIEA 4GG7A 5ETIA 3NSZA 1E1VA 4FL2A 4C0TA 1FBNA 4FTMA 4DE4A 1Q62A 5M57A 2YIQA 1W8CA 2HZ0A 3L9MA 1JKKA 3LPBA 4G9RA 2XK3A 2B54A 2HW7A 4A4XA 3MFSA 2C3JA 2J0MB 4PUZA 4QP8A 3Q60A 4EORA 4W4VA 4MX9A 4BTJA 4WSQA 3UOJA 5IZFA 1Q8WA 3MTFA 4O7ZA 1U46A 2O63A 2G2FA 2IVTA 3L8SA 5J9ZA 1OBDA 3F61A 5GINE 4D9TA 2J9MA 4I92A 4YZDA 4WOVA 4F4PA 1XH6A 5K3YA 3ZH8A 5HVKA 2JITA 5HLNA 4JBQA 4BCPA 1JLUE 3KRXA 4YJPA 3K2LA 3TI1A 4H3PA 4O2PA 1CTPE 3WYYA 4C33A 5IUHA 3GOKA 2EVAA 2I0EA 2X8DA 5I3RA 2IVVA 4O0VA 4NFNA 3QKKA 4O7VA 3R30A 1WVYA 3NCZA 2XNNA 1FVTA 4GW8A 4RVMA 4W4XA 1O6YA 4FL1A 3EKKA 4EOLA 1UU8A 5L6OA 5AUXA 4DEEA 1JSUA 4U45A 2DWBA 3ACKA 1H1SA 4EH2A 5J87A 1SVEA 2FSOX 2O0UA 4X2GA 3P4KA 2Z8CA 2VTJA 3LZBA 3BE2A 3R6XA 1H1WA 4KA3A 3FMLA 4RJ7A 5EOLA 4YJQA 4G3GA 1PHKA 3FE3A 4QTDA 5IKWA 4XMOA 1DM2A 3V5PA 3HL7A 2A0CX 3I1AA 4AT4A 4DT8A 4KNBA 4AP7A 1HOWA 2X81A 5ICPA 3V8TA 1KE7A 1WBVA 4BHNA 4FK6A 3L1SA 3ZO1A 3BQRA 1OKVA 1H01A 2VU3A 4S30A 5AR8A 3WZUA 4EWQA 3NW5A 2GNFA 4IH8A 1YWNA 1WMKA 4OR5A 3UOHA 4BCHA 5DYJA 4C3PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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