3G90X

Jnk-3 bound to (z)-5-fluoro-1-((6-fluoro-4h-benzo[d][1,3]dioxin-8-yl)methyl)-3-(hydroxyimino)indolin-2-one
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
355
structure length
345
Chain Sequence
NQFYSVEVGDSTFTVLKRYQNLKPIGSQGIVCAAYDAVLDRNVAIKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLMKCVNHKNIISLLNVFTPQKTLEEFQDVYLVMELMDANLCQVIQMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLASFMMTPYVVTRYYRAPEVILGMGYKENVDIWSVGCIMGEMVRHKILFPGRDYIDQWNKVIEQLGTPCPEFMKKLQPTVRNYVENRPKYAGLTFPKLFPDSLFPADSEHNKLKASQARDLLSKMLVIDPAKRISVDDALQHPYINVWYDPAEVEAPPPQIQLDEREHTIEEWKELIYKEVMN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-based design and parallel synthesis of N-benzyl isatin oximes as JNK3 MAP kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 10
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 345
sequence length 355
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3g90X02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3g90X01
4O91A 4Y46A 3ORIA 3COIA 4Y83A 5EKNA 3LFSA 3MJ1A 3R01A 4XP2A 4QT1A 4DEAA 4JQ8A 1YXXA 1GAGA 4D5HA 1H1WA 3Q5IA 2UZBA 1U5RA 2IW9A 2O5KA 2V62A 3FY0A 5LCJA 3EN4A 5KMIA 5CAOA 4II5A 3V5WA 4FV2A 4ZJIA 5IPJA 4EK5A 4GUEA 3EN7A 3QKLA 4TNDA 4BCKA 2IW8A 2YM6A 5BUJA 4L67A 4CT2A 4QP4A 5EW3A 4AUAA 2XEZA 5EYDA 2C6EA 2DS1A 3REPA 3VUTA 4KSPA 3D2KA 2PE1A 2OIDA 1OBGA 4OTWA 2OF2A 3VIDA 3FZ1A 3ZO3A 3BU3A 3RAIA 4DCEA 4IBMA 4FT7A 1Q8ZA 3IQ7A 3KXGA 3BYMA 2FSMX 4AT3A 1J91A 1UVRA 3WYXA 4PMSA 3POOA 3NZ0A 3FAAA 4R7IA 2QOCA 5IA2A 4ZAUA 1JKSA 4QP9A 2O0UA 3NYNA 3O0GA 5FRIA 4FEVA 4RJ8A 5CSVA 4GSBA 4DH1A 4BL1A 2GS7A 4FZ7A 4FK6A 3TL8A 5AADA 5LMKC 3RNIA 5AP5A 4C3PA 3EKKA 4FT9A 2PZPA 5AMNA 3EN9A 1TQIA 1H27A 3OOGA 2BAKA 3CD8A 4HZRA 4O0RA 5J8IA 3VBQA 2BRNA 3EQCA 3LCKA 5HG8A 3SKCA 4EQMA 2C4GA 4G5PA 3P0MA 4AE9A 4H3QA 2I0HA 3ULIA 5JFSA 2R5TA 5HOAA 1IA9A 4X6RA 5D12A 1ZYCA 2VTIA 3LLTA 3KMMA 4ANLA 2V7AA 3G6GA 4Y72A 5E7RA 2JIUA 4RZVA 1ZWSA 2DYLA 2EU9A 2VZ6A 3Q2MA 3F82A 4FUYA 5F1ZA 3TZ8A 4C4EA 3AC1A 3TZ7A 4XBRA 4DEBA 4TL0A 4BGQA 2X0GA 3DK6A 3SGCA 4FSWA 4EOJA 3N4VA 4FSNA 4IQ6A 4IJPA 5HNBA 3M42A 4MBIA 5J9YA 2OF4A 4RA4A 4MXYA 5J9LA 2ZAZA 2YERA 3CP9A 4EYMA 3MYGA 1CMKE 1PMUA 4H39A 3Q9XA 3KREA 2GNIA 3UIUA 1YHWA 4RIWB 3LQ8A 5DHJA 1OKWA 4UV0A 4M8TA 3WIGA 3U54A 4WNPA 4DBXA 2A19B 4XX9A 2J0LA 5TT7A 4FTRA 4YZMA 3U87A 4A9YA 2PUIA 4E4LA 2IWIA 3MPAA 4MH7A 3BHVA 5KNJA 2WMSA 5CAVA 3U55A 3E3BX 2Y8OA 2R3PA 2C3LA 3IW5A 1BUHA 3PJCA 1ZY4A 4IDTA 1P2AA 4MD9E 4YNEA 3BWJA 5FQDC 4CG9A 2AYPA 4ZOGA 5HIBA 5DPVA 2OFVA 4G31A 2PUPA 3DZQA 2X9EA 1W0XC 5C27A 2VGPA 3F2AA 3R8VA 2J7TA 3AC3A 3QRUA 5J1VA 1Y8GA 3CPCA 5DWRA 4AGWA 4UX9A 1OECA 3BBWA 3ZONA 2QOFA 4PV0A 4N70A 3QU0A 4ASZA 2QOHA 1BMKA 4B4LA 2WMXA 3TNIA 3DFCB 3KVWA 4RGJA 5ANKA 3Q9WA 4FKOA 4I92A 4RFYA 4XG9A 3O51A 2YJRA 4FV5A 5K0XA 4KKHA 5GZ8A 3FL4A 2X8EA 3DQWA 5TKDA 2YZAA 2UW9A 4FIGA 3PFQA 1O9UA 4UEUA 3ULZA 3LQ5A 4F9YA 5AA9A 1Q5KA 2R3LA 3EJ1A 1M2RA 1FBNA 3VF8A 4DF3A 4XLVA 1J1CA 1CKIA 3EN6A 2XCKA 3HZTA 4WSQA 3VUDA 2X39A 3DBEA 2GQRA 2RFEA 2EB2A 3CTJA 3D0EA 4K18A 4FYNA 1NVSA 3HUBA 4KABA 4PPBA 5HBJA 2WQEA 3ZBFA 1JKKA 2YEXA 3KFAA 4FV8A 2GTNA 3UG2A 4BCIA 4K11A 1UV5A 4EEVA 5FXQA 3GXLA 1R0PA 2VN9A 3RK7A 4CG8A 3QC9A 5I3OA 4GVJA 4FTCA 2BUJA 2PY3A 4BDAA 4RC3A 4E8AA 4AA4A 4CV9A 2C6TA 4F9WA 4FI1A 3UOKA 3ANRA 4S32A 5D1JA 4U0IA 4LI5A 4QQJA 4XNEA 1YXVA 2G9XA 3A7GA 4XJ0A 4FIFA 4C34A 1G3NA 5GZ9A 2XM8A 3MFTA 3EOCA 4LGDA 4W4XA 4IAIA 3L9PA 4MAOA 1E1XA 4XP0A 3E3PA 5HG9A 1OM1A 5IEXA 5H8GA 2WTVA 3E8DA 5CANA 3BHUA 4DEDA 4D58A 4QD6A 5A6NA 4YLJA 4WA9A 2OG8A 2Y4PA 5ETAA 3T9IA 3DXNA 2WMVA 4EWHA 4TWOA 3OOMA 3KA0A 1Q3WA 4R7HA 4YHJA 4C4GA 1DAYA 3LOKA 5T3QA 3VS2A 5BVNA 2XF0A 3IPHA 5M09A 2GNJA 4QTBA 4YP8A 1Q3DA 4AQCA 4BTMA 4D4YA 5HTBA 4FKRA 4KIPA 2ZJWA 4BCPA 4L45A 4GS6A 4O7NA 1H00A 2RFSA 3F5PA 2WTDA 5J79A 3MWUA 4C4FA 3MI9A 1TKIA 1P4OA 2UZDA 4BCNA 3ITZA 4C36A 4ZP5A 2VO7A 3QD2B 1ZYJA 2VNYA 3QA8A 4IM2A 1WBWA 3A8WA 4O6LA 4IX5A 4RJ4A 4TZRA 3POZA 5A4EA 2UW5A 3T8OA 1L8TA 3E7OA 3GQLA 2XZSA 4G3EA 3WF6A 3U6IA 5IH6A 1XBBA 3C5IA 2H34A 4QPMA 3LKMA 2O64A 2WKMA 1YWNA 3I5NA 3NUPA 4FSUA 4LM5A 3CQEA 3FLSA 3SG9A 2JKMA 4E6AA 3G9NA 4IMYA 1GOLA 4BTKA 2Y4IC 3Q4ZA 5HVKA 4XG8A 4P5ZA 3EH9A 5A14A 1JSTA 1M7NA 5K0KA 1Q4LA 2IVSA 4QMXA 5JT2A 3K3JA 3P7AA 4E4NA 3M2WA 2KTYA 2ITYA 4IE9A 4KD1A 4BDJA 3DAKA 3EYHA 4H3PA 3SXFA 3NNWA 2F9GA 3VJOA 5FM2A 3HAVA 4NW5A 3L9NA 4NM3A 5CEIA 3TNQB 5AX9A 3CJFA 4FKTA 1OI9A 2XIKA 4C35A 4YJPA 3ZMMA 3W2OA 1B6CB 3MH3A 2WO6A 3C4CA 4DFZE 2VV9A 4FUXA 2RG5A 2NNWB 2OGVA 2XYUA 2WTJA 2X9FA 4EH8A 4BTJA 4QNAA 3N4TA 3MDYA 3ZUUA 4MEDA 5K9IA 4PMPA 3PIYA 3R02A 2V0DA 4IZAA 5IQDA 3HV4A 4IC8A 4O7LA 2RKUA 3NUXA 3ANQA 1RE8A 3O8UA 5D11A 4L46A 2BCJA 1XH4A 1F3MC 2R3QA 4GK3A 3Q60A 4YBKA 5HE0A 5AP0A 2I6LA 3ZUVA 4XOZA 3Q4TA 4FOBA 3TNHA 4Z7GA 3MVLA 1V1KA 2P2IA 4ZY6A 4F1MA 1URWA 2C5NA 4XMOA 4RIYB 3V8TA 5LOHA 3H30A 3SG8A 3DB6A 5EH0A 3EL8A 4TRLA 4M0ZA 3R9DA 4X3FB 4AS0A 4O27B 3MFSA 5D7AA 4FX3A 1Q99A 3S95A 4P2KA 3ZM4A 1H28A 3NNVA 2G2IA 1A06A 3QRKA 4C59A 3TG1A 2HWOA 4ERKA 4K1BA 1FQ1B 4PDSA 1Y6AA 4QP8A 3BBTB 3ENMA 1OUKA 3PJ3A 2HW7A 3Q52A 3NNXA 3UP2A 1BYGA 4UMQA 3QKKA 3TN8A 3G90X 2E9VA 3BHHA 4EK8A 4FGRA 4GL9A 4GJ3A 3NUYA 3NUUA 4YJSA 1OIYA 1JNKA 4XBUA 3IDPA 4GMYA 5AAFA 4RG0A 4IACA 2W4OA 4GT5A 4DA5A 1GZKA 4U40A 3WF7A 2QLUA 4AZSA 5KMOA 3D4QA 4EWQA 2XP2A 3V5LA 4GIHA 5A54A 1DI9A 4XG7A 4CYIA 4TYEA 5A4CA 4NK9A 5JH6A 5HU9A 3IKAA 3FQEA 1KOBA 4XLIA 5AM6A 3WZUA 4AF3A 4EJNA 5KHWA 2VTQA 1XR1A 2B7AA 1BL6A 4IFCA 4UN0C 5D9HA 3GU5A 3RGFA 2VTPA 2XK8A 3QHWA 3QX2A 3NUAA 4XS2A 5E8VA 3FHIA 3TV7A 5CU2A 4HPTE 5HX6A 2R3JA 2GTMA 4YZ9A 4PL4A 3R6XA 3JYAA 4DH3A 4EOQA 1U5QA 4LG4A 2YLFA 2EXMA 4M0YA 3ATTA 4BDFA 3ZSIA 3UOLA 4ITHA 4U3ZA 4UY9A 2VX1A 3FI8A 3CSVA 4YJTA 4WUNA 1CKJA 4DH8A 5FTOA 1R39A 4G2FA 3BGZA 2WPAA 4V0GB 4D2RA 4DC2A 3ID6C 5CU0A 1NVRA 3C4FA 4Z3VA 2Z7LA 2BZHB 3FV8A 4UYNA 1YDTE 4EH5A 1H24A 3AD4A 3PJ2A 4FSYA 4FKJA 4QMSA 4QP1A 3QCSA 3V5TA 4YO4A 3ZYAA 5IA0A 4ZTHA 4AW5A 1Q8UA 1T45A 4YU2A 4FK3A 5AP1A 3PRFA 2J0IA 1MP8A 2B9HA 3BYVA 1R3CA 1B38A 4KRCA 3AC2A 4AN2A 3HNGA 2UZUE 1S9JA 2HYYA 1R1WA 1OIQA 3MTFA 3UVRA 4PP7A 1W82A 4BDDA 2WMQA 4E4MA 2H8HA 5HG5A 2WFYA 5C9CA 3WZJA 2QVSE 2VO6A 4C3FA 2C6MA 5EG3A 2QO7A 2R3NA 3C4WA 4YJNA 1A48A 3COKA 2ZMDA 3QYWA 4QPSA 1MRUA 5DFPA 5HVYA 3NR9A 5DH3A 2UZOA 4FTAA 4XUFA 5CQUA 5EYKA 2QQ7A 4NT4A 3ZLWA 1BL7A 5JFWA 4CNHA 1AQ1A 3A61A 3ZZEA 1YOMA 3R8PA 3CEKA 3FLYA 4RA5A 3O23A 2XNGA 4FKGA 4PTGA 4I3ZA 5KO1A 3OUNB 3QXPA 4GYGA 4L6QA 4C2VA 2J51A 4G3FA 3CGFA 3ZRLA 5IUHA 3LVPA 3OTVA 5LMAA 2WXVA 2JKKA 1TQPA 4BDCA 4EH6A 5LXMA 1JLUE 3CLYA 3QUEA 5CLPA 3ETAA 2F49A 2JIIA 4LL5A 4BKJA 3HUCA 5I3RA 4BN1A 3H0ZA 2UZTA 5BVDA 2C1BA 2YITA 2VWYA 3C1XA 3KK9A 4JX7A 1YI3A 2IG7A 5IQIA 2ITWA 3C0GA 5HG7A 3W2CA 4HVIA 2WQNA 2HOGA 4W9XA 3TV6A 1JKLA 3I79A 5HBHA 4L44A 5DEYA 4F0FA 5EI6A 4AOIA 4KB8A 5JSMA 2E9NA 2ERZE 4FV0A 4AU8A 2XJ0A 3GQIA 5I9ZA 5M55A 2X4FA 5CT7A 3QWJA 3P1AA 1PMVA 3UQGA 1P5EA 3LMGA 1ZMWA 3DBCA 1OL2A 1LUFA 3VS5A 5AUZA 4WG4A 3HLLA 3TM0A 3NDMA 4HYUA 3L8PA 5HCZA 3THBA 3FMKA 3HRFA 4OTPA 4ZK5A 4ANOA 4PUZA 5KBRA 4DH5A 2QC6A 5BX0A 2GNLA 3GCVA 4JI9A 3MV5A 2FA2A 1Z5MA 5IQEA 2P4IA 3L8SA 2OXYA 2VWIA 5EHLA 3OW4A 4CKIA 3QUPA 1OL7A 2IZUA 5BVWA 3QQKA 4CMTA 4EOPA 5K5XA 4C0TA 1PXJA 2ITZA 5CAQA 3V6RA 4YSJA 5AV3A 4PF4A 2R7IA 2W1HA 2NPQA 4M67A 1H25A 1WVXA 4WO5A 4HVSA 4ANMA 2ITNA 4EHZA 4F9CA 4OAVB 1ZMVA 4I5MA 5KKRC 3NX8A 3WILA 3R73A 4P4CA 3UYTA 2C6IA 3QHRA 5L2TA 2W9ZB 3E93A 4X21A 4S2ZA 2BZIB 4TY1A 4IZ7A 4EK4A 5GZAA 3A62A 3ZC5A 2R0UA 5HORA 3G9LX 2QCSA 5ETCA 2XKEA 5FEEA 3KF7A 2VWBA 3MB7A 4O1OA 1O6KA 4HGEA 1TQMA 3P7BA 3W2RA 3UNJA 4FSMA 2IN6A 4NIFA 4TWNA 5AP2A 4CKRA 5LMKA 5AEPA 2X2KA 3FQHA 2OFUA 3I60A 3COHA 4PPCA 5CS6A 4BDGA 4BBMA 3A7HA 4TW9A 1OPLA 1YW2A 2HENA 4IH8A 2WELA 5D7VA 4D1SA 1NA7A 3LLAA 2ZM3A 2VU3A 3V51A 5C8KA 4EQUA 5E9EA 3EQBA 3F3ZA 1H0WA 4GG7A 4BRXA 1PRYA 2B0QA 3PLAE 2VTTA 4XP3A 3RPRA 5DR6A 2GQGA 2RFNA 3RPSA 4WRGA 3R8ZA 2F4JA 3K3IA 2W5BA 2P33A 3QD3A 5JZNA 3CTHA 5HTIA 4FKVA 4V04A 5LVOA 5M4FA 4FYOA 3C4XA 3MESA 3AC5A 3LPBA 3SXRA 3W1FA 4RSSA 4I94A 4OTQA 5KCVA 3HMOA 4OBOA 1UU9A 2R2PA 5FDXA 4ZTRA 5E92A 3DXPA 4R3CA 3EN5A 4IDVA 2R64A 2CGXA 3WI6A 4KAOA 4YTFA 2EXEA 3UO4A 4FG9A 1S9IA 1SZMA 5EDPA 3W18A 5C4KA 3Q32A 4IHPA 5AP6A 4AOTA 4ZLYA 3EMGA 2UZLA 3LXPA 2YJSA 1H4LA 4U97A 1PKGA 4UZDA 4IVBA 5FM3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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