3GC8A

The structure of p38beta c162s in complex with a dihydroquinazolinone
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
GPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDSELRILDFGLARQADEEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The three-dimensional structure of MAP kinase p38beta: different features of the ATP-binding site in p38beta compared with p38alpha.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 11
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 347
sequence length 347
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gc8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gc8A01
3IOPA 4KA3A 3FPQA 2REIA 3I1AA 4IAYA 4MK0A 3SKCA 3ZBXA 4EUTA 4YZNA 4U45A 3VUTA 5M51A 1YOMA 4FIEA 5IA0A 5AAEA 2V55A 4FKRA 3LFQA 5BUIA 2B9FA 4JAIA 3A61A 4BF2A 2YWPA 4HNFA 4O86A 1H08A 3EN5A 5HLWA 2W4JA 3CPBA 4JDIA 4BHNA 4F7NA 2V0DA 1KOBA 5E8TA 2ZDTA 1LPUA 4QMWA 5EM7A 5CEPA 5EOBA 5C27A 4X3FB 1UU8A 3PVUA 2UZLA 2YIWA 3UJGA 4BCGA 3LXPA 4YJUA 4FGRA 5CAPA 1G8SA 4A9RA 4U9AA 3QD4A 5I9UA 3NIZA 2PVLA 3E88A 2JBOA 4BCKA 1ND4A 2PUPA 4M12A 4DTKA 2C3LA 5M56A 2AUHA 3CGOA 5JT2A 4F65A 4QP1A 3MPTA 4AFJA 2OKRA 1FVRA 4EQCA 5M44A 3BQRA 2X4ZA 2I1MA 5D7AA 3LKMA 3BV2A 3CQEA 5DWRA 1PXLA 2WTWA 5BUEA 2WMRA 2UZOA 3K3JA 3G9LX 5JKGA 2GNJA 3C7QA 1BKXA 3MFUA 5A4TA 4O83A 1CDKA 3DKFA 4LUDA 4I41A 2BCJA 5DIAA 3F5PA 1SVEA 3GENA 5FWKK 4U97A 3UIXA 2O5KA 4RG0A 4JX7A 4KS8A 4KS7A 4MVFA 4ZK5A 2G2IA 3LFNA 4HGEA 4TWPA 3TNPC 2YLEA 1PMEA 5GZAA 3G0FA 4W4VA 4JXFA 2WQMA 4U79A 5KHXA 4YC8A 3KXMA 1SZMA 5DR6A 4ZTLA 4D4VA 4B8MA 1RQQA 3MY5A 4H39A 3BYVA 5M07A 2W05A 3I81A 4FL3A 4M0YA 2WOTA 4HVHA 5A4LA 3FJQE 4AT5A 1LEWA 4G9RA 2E9PA 3DNEA 4PPAA 2B53A 4GJ2A 3EQIA 5IEYA 4FODA 4K77A 1M52A 4N6YA 4QP2A 5HOAA 2X7FA 5CNOA 3ALOA 3LXKA 5C4LA 3VBWA 5EI2A 4DH5A 3DK7A 3PY0A 4QP4A 3G15A 3CTQA 1Z9XA 3R7VA 2X8EA 1YI6A 2QI8A 3EB0A 4NW6A 3VHKA 3KC3A 1ATPE 4GL9A 5HVKA 4FVPA 2OSCA 2UZDA 3RI1A 4U3YA 5M09A 4EBVA 5LVLA 4NT4A 4DFNA 5IH5A 3QFVA 3WIGA 3KXNA 4BIBA 4FV7A 1R3CA 3GCSA 2F7XE 3DQXA 4KRDA 4PV0A 3C4WA 3QAME 2A2AA 3AC3A 3MTLA 2OJJA 3OXZA 2BFXA 4JAJA 3S1HA 3RZBA 3WZUA 4JOAA 4IZAA 4FNZA 4TYGA 3L9LA 1GJOA 4HCTA 3FEGA 2YCSA 2O65A 2UZBA 4G5PA 4K8AA 3TIZA 5LVNA 4JVGA 4XV9A 3L8XA 4IM0A 2OFUA 3DJ5A 3KB7A 4HGLA 4NW5A 2Z02A 3UQCA 2A27A 1BL6A 2A1AB 2C0TA 3O0GA 3K5UA 3FWQA 2JD5A 1U59A 2FYSA 3KN5A 3O8PA 3R28A 5JH6A 3FKOA 3JYAA 1QL6A 3A4PA 2QODA 3G90X 4RIWB 4UXQA 4TL0A 2YWVA 3R1QA 2YZAA 4UMQA 4OTPA 4I24A 3LQ3A 4FL2A 1ZOEA 4EZ3A 3FQSA 2CN5A 3VUMA 2ZDUA 3ZLSA 3WZJA 4CRSA 3LQ8A 4C4GA 5CASA 4OAUC 1OBDA 4V05A 3U51A 4LV8A 3DK6A 3RALA 3SXRA 3E5AA 5CAVA 1OUKA 3QALE 2I40A 2WQNA 1H1QA 3VJOA 3HV6A 2R3HA 5DGZA 2VRXA 5KE0A 3NW5A 5KMLA 1PRYA 3CLYA 4I4FA 3R9NA 2J7TA 4EONA 5CF4A 1GY3A 1E9HA 2XJ2A 4D9TA 4NL0A 1EH4A 2J9MA 4AZEA 2XIXA 4EK8A 4DITA 4RJ6A 3P86A 1M7QA 4IZYA 3C51A 2P2IA 3S0OA 1XO2B 4ZS0A 2BDJA 4YPSA 3OWPA 1JKSA 5IA3A 5L3AA 2W5HA 1NW1A 3RPSA 3AMAA 3PYYA 3Q4TA 4FZ6A 1T46A 4I5MA 4QMTA 4QMNA 3O2MA 5E9EA 3HRBA 3TACA 4AW1A 4F6SA 5KNJA 3Q53A 4KKGA 3SD0A 4YSMA 3W1FA 2XMYA 1ZOGA 2OH4A 2YAKA 3V6RA 2PVHA 3QQKA 4MD7E 1S9JA 2WXVA 4I94A 3TZMA 4QP8A 4AXAA 2VWIA 3I6WA 4QOXA 4ZSEA 3D5WA 4RLLA 4C37A 4TXCA 4E5WA 5J9LA 5CT0A 1UU7A 1JWHA 2WMXA 3PY3A 2XK7A 3AMYA 5HO6A 3JY9A 3BYMA 2OZAB 1FOTA 3HV3A 4AA4A 2CKOA 3Q60A 2YJSA 3C9WA 3AGLA 4PPCA 5ACKA 3CQWA 2OBJA 4U6RA 1H25A 4ITIA 3Q96A 2B0QA 4FKUA 4X2NA 2XBJA 4U5JA 4FZ7A 3EWHA 2BZIB 2OIDA 3OCSA 1UWJA 1KE5A 1K9AA 3B8RA 4C4IA 3ORPA 2F9GA 3KVXA 3NUAA 2X2MA 2ERKA 4IJ9A 2ZAZA 4BYJA 1Y6BA 3O17A 3V5JA 1DM2A 5HTIA 4QMXA 3G33A 3QLGA 3PE1A 2BAKA 4XUFA 2YITA 5HG5A 2FA2A 4GYGA 4BN1A 5EW9A 3REPA 5AM6A 4E5BA 3R6XA 5J1VA 5E1EA 4NFMA 1R39A 4DA5A 5KKRB 3UBDA 1WZYA 4GEOA 4XOYA 5AR3A 1MRUA 2WHBA 4E4XA 4BTKA 2ZYBA 3OXIA 4J1RA 3O23A 4XMOA 2WU6A 2QD9A 3ITZA 4RRVA 3E62A 1B6CB 2F4JA 3ORTA 3EYGA 4K11A 2PZPA 3OBJA 4W9WA 4C4EA 1XH5A 3IO7A 4YTHA 5K0XA 1KV2A 4CV8A 1OPKA 3POZA 3VVHA 2Z60A 4O7SA 3EFLA 4IB5A 4BWKA 3PRFA 4LFIA 3ZUUA 3FKNA 3A8WA 4YZBA 3ZC5A 2P33A 2XNBA 3T9TA 2Y8OA 4DGNA 3LZBA 3IPHA 4OTGA 4U80A 4ERKA 4EQUA 3H3CA 3ORMA 5ITAA 3D9VA 2GQGA 4GG7A 5LQFA 3PVWA 1M7NA 3FZTA 5A54A 5IQGA 2VGOA 3QTSA 3VC4A 4BBEA 3DAEA 5CSVA 2WEIA 2BZJA 1TVOA 1ZAOA 2W1IA 3L9MA 3QCYA 3OTVA 4MHAA 3Q2JA 3BBTB 4AA5A 4BCOA 4NUSA 3U6IA 5BVNA 1QPCA 2FVDA 1CMKE 2ITYA 2IW6A 3EIDA 1WBPA 3HA8A 4WNOA 3A7GA 3W16A 3LM5A 3I5ZA 2ZM3A 1W0XC 2OXXA 2Y0AA 1KE7A 2XEZA 3ZSGA 5EHOA 5HNBA 3TNWA 4CYIA 5AP4A 4EZ7A 1JVPP 1O6LA 3RGFA 3D5UA 4QYFA 4JR7A 3ZUVA 4MXOA 3D7TA 2R64A 1JKLA 2UZNA 4G17A 2OJGA 5HGIA 3PZEA 4E6CA 3BHTA 4E20A 3KREA 4TYHA 3TNHA 4L3LA 4B99A 2OJ9A 2Z7RA 4FSNA 1HCKA 3ZXTA 5H9BA 3F88A 2UVYA 4K0YA 3RZFA 3MH2A 1OITA 1Y6AA 3I0QA 2BDFA 4Q9SA 4EHEA 3BGZA 3L9NA 1A06A 4F09A 3FQHA 2J0MB 1ZY5A 4ZSGA 4G16A 4PTEA 3TUDA 3UC3A 2G2FA 4E6AA 3I5NA 1PMVA 4BWXA 3V3VA 4YC3A 4FSQA 1YOLA 2PMNX 2YAAA 4O2PA 4EOJA 4QRCA 3BYOA 5JGBA 5LVPA 2FSLX 3R7EA 4PMMA 2E9NA 3BBWA 2C3IB 3GOKA 3AT2A 2HZ0A 4MQ1A 4NKSA 4QYGA 3RKBA 3EMGA 4DFZE 2OIQA 4EHGA 5FTGA 2FB8A 4BBMA 4L68A 4O0RA 4PTCA 2UW5A 5BVEA 3E8EA 2FO0A 4IIRA 2DQ7X 5D12A 4DCEA 3QX2A 2R0UA 2W0JA 3BGPA 5A6NA 3Q4CA 5CSHA 3KMUA 2XKFA 5GJFA 4AZWA 3ENMA 4K2RA 4WNPA 2X2KA 4CD0A 3BEGA 4E7WA 2R3KA 3FY0A 2OF4A 2R7IA 4IVAA 2RGPA 4JNWA 2IO6A 3QYZA 4QMPA 4PL5A 2OH0E 5CU4A 4H3BA 3VO3A 4CCUA 4F64A 4U41A 3FLZA 2W5BA 3FLQA 4BGHA 3P1AA 4FSUA 4C34A 3M1SA 1IR3A 4BZNA 4F7LA 4GUEA 1BMKA 5FP6A 3MGYA 4DGOA 1J1CA 2UZTA 2WTKB 4FT5A 4XG2A 5CS6A 3I4BA 2C6KA 2IW9A 3SX9A 4QMVA 5J7BA 4C3PA 4FV1A 1GZKA 3Q9WA 3RCJA 2C6EA 3SGCA 2GFCA 1QCFA 5J8IA 5HKMA 3A8XA 3MA6A 2RG6A 4QPMA 1TQMA 2FH9A 2WMTA 1PXPA 4BFMA 2CLQA 3C13A 5L6PA 1OIYA 3MWUA 1REKA 4RX7A 4AW5A 4DN5A 2WO6A 3ENHA 1FINA 3ULIA 3HV4A 4RMZA 3DB8A 4KRCA 4CT2A 4FBXA 5IA5A 5TOZA 4RPVA 2JKOA 5HLPA 4EOKA 2WTJA 1JBPE 2HOGA 1WFCA 4R3RA 5CXZA 4U44A 1BI7A 2GQRA 2X1NA 3C4FA 3PXFA 1FVVA 4AOIA 3NCGA 3EFWA 4XG8A 4JQEA 2BRMA 3JPVA 3UPXA 3MVLA 4P5QA 3SW7A 3IDBA 3NGAA 4C61A 5CI7A 5F20A 4G6NA 4X2FA 5EYCA 3COIA 3QZHA 4RIYA 4QMSA 4Q5EA 4XEYA 2B9IA 4YPDA 5EM5A 1V1KA 5BQ0A 4RJ8A 3RAKA 3Q5ZA 1LUFA 3MVJA 5AR5A 5C4KA 3T8OA 4UBAA 1H24A 2G2HA 5AIRA 3RAWA 3R0TA 3QTRA 4IEBA 4YO6A 2HCKA 5CAQA 3SVVA 3G51A 5C1QB 1GZOA 3DBFA 3VW6A 2J0LA 2F7EE 1H0WA 3ORKA 1IG1A 4KBCA 4RQKA 1XBBA 1ZOHA 4D0XA 4JJRA 2PZ5A 3QBNA 3QA8A 4KB8A 3BRBA 3VBYA 2O3PA 1YKRA 1U4DA 3PVBA 5D41A 5BVWA 4CTBA 3BIZA 1J7IA 2OLCA 4CKIA 4G3EA 2IVUA 4Y83A 3HZTA 5C8KA 3RNYA 5K3YA 2X9EA 2IN6A 2JAVA 4M66A 5BVFA 5EQPA 4FV9A 2ITZA 3RK5A 3NAYA 3W2OA 1UU3A 3ORXA 2G1TA 3Q5IA 4FEWA 3R8ZA 4XBUA 3V8TA 5AFVA 1Q8UA 3FC1X 5HNIX 3COMA 5J9YA 1WAKA 2Y4IC 3JUHA 5DR9A 3ZRMA 1CM8A 5BVKA 4P4CA 4GU6A 3MH1A 4IJPA 3SOCA 4F9CA 3NVKI 3LFSA 3QWJA 4RA5A 3ODZX 3ACKA 3LMGA 3PSDA 1J91A 5CLPA 3IQ7A 1W98A 5AMNA 2J51A 4GS6A 4AF3A 4FUYA 3AD6A 4JX3A 4WG5A 3U55A 4RVTA 2ZV9A 5F95A 3OW4A 2HK5A 3VS1A 4FEVA 4JBOA 2JDTA 4JBVA 4D4YA 5J79A 3W10A 3D7ZA 2BR1A 2R3GA 3RTPA 4FSTA 5A14A 3W2PA 5AX9A 4KKEA 3F9NA 5CNNA 3R1NA 3ZONA 5DMZA 5E4HA 1FQ1B 2C1BA 4A4XA 3UOLA 2ITTA 2QO7A 1Q3DA 2ZM4A 5AV3A 3R04A 1XJDA 4EK6A 4FEQA 2CMWA 3QRUA 1OKZA 3FI4A 4G9CA 4O21A 3VWAA 3ZRKA 1Q8TA 1KSWA 4XLVA 4MKCA 5HTCA 3VBQA 5G1XA 2NO3A 1MQBA 3FE3A 3DZOA 4OW8A 3Q6UA 3QU0A 4ZTSA 3MDYA 3OROA 3R9DA 3DCVA 3Q9ZA 4KABA 4UWBA 3ZEPA 4A9SA 3UZRA 3ORZA 2WFYA 5JGAA 5KMOA 2F57A 1OUYA 3LCTA 4EOMA 5J7HA 4DGGA 3R22A 5HVYA 5T68A 2CKPA 4ENXA 3C4EA 2HZNA 5BYZA 4M69A 4FF8A 4GMYA 5DYJA 1GAGA 2ESMA 3QQFA 3VULA 4FIIA 3CS9A 4LGDA 5GJDA 5E8ZA 3LW0A 1ZMUA 3W33A 2WQBA 4RWKA 4LMNA 4OT6A 4YZ9A 3VUDA 2OICA 5JRSA 1I09A 3EFKA 3HUBA 4HVDA 3SA0A 3QUDA 3ZSHA 3A4OX 3PTGA 4DFUA 1MUOA 3QQHA 5HU3A 3HUCA 5E8SA 1UVRA 5K4JA 2WNTA 4DF3A 4FIHA 4DEDA 4RWLA 3CBLA 1B38A 4ALVA 4PDSA 4O6EA 3CTHA 2XK6A 4FSWA 4RIXA 2I6LA 3QLFA 4EWQA 2BDWA 1CKPA 3HL7A 2I0YA 3ZO2A 3WOWA 3CXWA 2ACXA 4JIAA 2ZVAA 4E6DA 4ZLOA 1YI3A 3FAAA 2R3NA 5HD4A 3EQGA 3ZFXA 2PE0A 5CX9A 3DGKA 3IS5A 4RVMA 1R78A 4RA4A 3NNXA 3FPMA 1Y91A 4DTBA 4QMOA 4I6FA 5E92A 4QP6A 1WBTA 2WQEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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