3GCPA

Human p38 map kinase in complex with sb203580
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
349
structure length
337
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGLCTRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of a fluorescent-tagged kinase assay system for the detection and characterization of allosteric kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 337
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gcpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gcpA01
2PE1A 2JEDA 3S3IA 5AUUA 5CSVA 2SRCA 4G17A 4CD0A 3ZMMA 1O6LA 3E7OA 1Z57A 3VULA 4FYOA 3FL4A 1OECA 2OJ9A 3IGOA 4RFZA 4EYJA 4GYIA 2W7XA 4QP3A 5L8LA 2C0OA 1VYZA 4BIDA 3F88A 5BVNA 2JAMA 1YI6A 2WU7A 3O8PA 3OUNB 3W2SA 2QQ7A 2WTKC 3LW0A 4BWPA 4ZTSA 3H0ZA 2H9VA 4AZSA 4WNKA 3FJQE 3FMMA 5IA2A 4L00A 3LMIA 2BFXA 4IAYA 2YHVA 3O8UA 4C34A 1W7HA 1GIHA 4AT4A 3QRJA 4MEDA 1YWVA 4FUXA 4IADA 2ITTA 3QUEA 4FT3A 4U42A 4DAWA 5L3AA 4ANLA 4FTUA 1SVGA 5KKRB 3D5XA 4TNBA 5GZAA 3W2PA 5EYMA 1JAMA 3FMKA 2XK8A 3A7HA 3KMMA 3R0TA 3CXWA 4YJSA 4DT9A 4ZK5A 4DG0E 5DN3A 4TKSA 4I24A 5AP6A 3IW5A 2W5BA 2VTPA 3SAYA 2VTRA 5IQGA 3N4UA 4MF0A 1QPJA 4ACGA 4GU6A 1P4FA 1H07A 4AOTA 5AAGA 3LKMA 2J50A 2X7OA 2XB7A 3FMHA 1PRYA 3W55A 1QPDA 3FZRA 4L3PA 4TWCA 3GVUA 2R9SA 2QODA 3Q52A 2HELA 1Z5MA 3COKA 3FI4A 3LFNA 4DGNA 4KBKA 1MRVA 5J7BA 5EQEA 2Y4IB 4NW5A 3CIKA 3DB6A 5AP7A 4D1SA 3HV6A 4EZ7A 1YDTE 2UW3A 3DOGA 3DS6A 3LJ1A 4WSYA 3TDVA 3AD6A 2YAAA 5TF9A 4R7HA 4EOSA 3N9XA 2O64A 3DTWA 3LXNA 2WMXA 3E63A 3NUSA 4JG8A 4FG9A 1HCLA 1LEWA 2X8EA 3R7GA 4YPDA 4USEA 2XRUA 2V7OA 2OGVA 3FZSA 2PMIA 2QKRA 4UWCA 4YJRA 2CKEA 1U54B 1OL5A 1WVWA 4R3CA 4CTBA 4PMPA 5EYKA 3QALE 5IH6A 3BZ3A 4KRDA 5HU3A 2YM3A 4USDA 4AUAA 4FGBA 3WI6A 1YOJA 4Q9ZA 5J9ZA 1BUHA 2BRNA 2JIUA 3AT3A 3P7AA 2YLEA 4W9WA 3NYOA 2REIA 1O6YA 3ORIA 5AR5A 5IEXA 5HEZA 3UQCA 3PPZA 4C4EA 3VS5A 3GCSA 1AGWA 3ZM9A 4GCJA 1UNLA 2OFVA 2QCSA 3CKWA 3UE4A 4RX5A 5IA3A 5HHWA 2Y4PA 2QI8A 3ETAA 3L9NA 3ALOA 4I6QA 4KSPA 5DRBA 4E5AX 4D4RA 1Q8TA 3OWLA 3PJ1A 3HRBA 4UEUA 3RZBA 4ANOA 2W5AA 3FPQA 3RPOA 2PPQA 2P2IA 4BDEA 2XK7A 3ZTXA 4JG7A 4Y72A 5AR7A 5DR9A 4FIGA 2CCHA 3EN5A 4U6RA 4B7TA 3SOAA 4AOJA 3ZUTA 3FI2A 2XKCA 3PIXA 4GK3A 3ULZA 3NRMA 5IKWA 5KBQA 1CSNA 2B9IA 3NUYA 3U4WA 5C27A 2F2UA 4OT5A 5ANKA 2PZ5A 2WTDA 4GV1A 2ITPA 3BU3A 3CJGA 4JR3A 3OHTA 3VC4A 2R7BA 2GMXA 2X0GA 4EI4A 3V5JA 5K5NA 1LUFA 2ETKA 4ACHA 2P0CA 4WD5A 2XK6A 3LHJA 3UVPA 4OAVB 4M97A 3ENMA 2EUFB 1UU3A 2C0TA 4WIHA 3HVCA 1VZOA 4FZ6A 4XNEA 2HXLA 2RG6A 3C0IA 2C1AA 4TN6A 3ORTA 1XBAA 1B39A 4TYHB 1LP4A 4MNFA 5K0KA 4CMUA 3BQCA 4M13A 4EQCA 3EHAA 3JVRA 3R8ZA 4RWLA 3MH2A 4FX3A 5CALA 5I0BA 1UA2A 4KAOA 4IFCA 4ANMA 5FXSA 4ZTLA 1DAWA 3E7VA 2CKPA 2R3JA 3PXRA 1MUOA 3BWFA 3P9JA 3EYHA 4Y46A 4J97A 4CKJA 3T9IA 1H4LA 3OXTA 4MVFA 3VUTA 4QTEA 3QXPA 3FE3A 3R2BA 3EQDA 4Y5QA 4FGRA 5JFWA 1ZAOA 4ZXTA 4IX5A 4L53A 4XRJA 4CFNA 5IQCA 1RQQA 2IW9A 3R8LA 3V8TA 5AV4A 4OW8A 4BY9E 4BCQA 3LQ5A 3KVWA 4II5A 4DH8A 3OEFX 2G2FA 3CTHA 5AAFA 5ANGA 4Z16A 4YZ9A 4HYHA 1UU8A 3EQPA 4EK8A 4R77A 2XA4A 5HG8A 4G34A 4D2TA 2J4ZA 3U6JA 4OUCA 5J87A 2J51A 2VN9A 2YCSA 3G33A 2PZPA 4QNAA 4WO5A 3IW6A 5FTGA 2C6EA 4QMOA 4WG4A 1MRUA 1OKZA 3ORNA 3A8WA 1IA8A 4QO9A 4C2WA 1W84A 2V0DA 4IM2A 3VRZA 3NUPA 5EI6A 3HDNA 3NUAA 3TNQB 5G1XA 4XMOA 3SKCA 1M2RA 3KRRA 2CNUA 5IA4A 2W0JA 3LQ8A 4U81A 4PV0A 3P1AA 4DBXA 3R9OA 3BLHA 5H9BA 4MQ2A 3R7UA 1WVYA 5JKGA 4MAOA 5C1QB 4AFEA 4AOIA 1T45A 1XH5A 3GCUA 1CDKA 4D2RA 1GZNA 3PTGA 1V0BA 3FQSA 5A3XA 3ZSIA 4I5HA 2G01A 2VO6A 3UG1A 5I9ZA 3C5IA 1FGKA 4D1ZA 1Q8ZA 2J0IA 4EK4A 5KMJA 5B7VA 4NFNA 4WSQA 4F4PA 4FV7A 2Q0NA 4AGWA 5JH6A 5CF6A 2BRHA 3SXFA 3ZS5A 4MKCA 5I5ZA 2PVJA 3BU6A 4R1YA 3IKAA 1GNGA 5EI8A 5E8XA 4BZDA 2J0MB 3KREA 4ACCA 4PNIA 5HGIA 2GS2A 2VTOA 4YSJA 1M17A 3TN8A 4RZWA 4EZ5A 5ACBC 3A99A 1NA7A 2RGPA 3KF4A 3TNPC 3VBTA 4N4SA 4WNOA 3Q2MA 4CFXA 4XP0A 2XKEA 4JBOA 4OTFA 4ANNA 3UVQA 2IG7A 3QQUA 1B38A 3NWWA 4GRBA 4IFGA 2WEVA 3GB2A 3GU6A 5GINE 3Q6WA 4BCOA 5AIRA 1UWHA 3KULB 2O3PA 3DKOA 3FMJA 1TQIA 3JPVA 3A60A 3P7CA 2JD5A 4JIKA 5DA3A 4FVRA 4L01A 4N70A 5CXHA 5H8GA 1PF8A 2W4OA 4U3YA 5EW9A 3UOHA 4JQ8A 1JKKA 4D4SA 3V5LA 2JDOA 5HKMA 3PSDA 2UVZA 1H28A 4IQ6A 5KHXA 4HYIA 5CWZA 4BI2A 2R0IA 4QP4A 3AXWA 5J5SA 3SG9A 2I40A 4AGUA 4E5BA 4D0WA 4YNEA 2YLFA 2QR7A 3DDQA 4GS6A 1OVEA 3K54A 2R4BA 3PIZA 4F0FA 4UMPA 2ZV8A 4B0GA 4RWIA 4U0IA 4G16A 3C4ZA 3I7CA 5KCVA 4YHJA 3C1XA 2C6TA 1XH6A 3AGMA 4QPMA 2GDOA 1DM2A 2CN8A 1ZYLA 3CQUA 2WZJA 4UWYA 4O91A 1LR4A 4U79A 1H24A 4FEQA 5FBNC 4I41A 3PJ8A 3R00A 3B8RA 2OU7A 3QQLA 4R6VA 5DR2A 4C4FA 5CEMA 4GW8A 4QTBA 4G6OA 5HQ0A 3K5UA 3CE3A 1BL6A 5CT7A 4ID7A 3FLQA 3RI1A 5E1SA 2IVTA 3MB6A 2WEIA 3R8UA 2BZHB 3QZHA 2PVYA 4YNOA 3PG1A 4EKLA 3BGQA 3MS9A 5IDNA 5DR6A 4EK6A 3C0GA 4FKLA 3C13A 4RX8A 3N4VA 3PIYA 5FM3A 1NVQA 5A54A 5HLNA 3P0MA 4RRVA 5AJQA 1URCA 3LFDA 4M3QA 3WARA 1WFCA 2VTLA 4YJPA 3ZLYA 3FAAA 4ACMA 4BTFA 4RFMA 2R3QA 4FIIA 3DLZA 4EWQA 5EKNA 2FH9A 3CY3A 2W1GA 4L46A 4ZY4A 4QTDA 5AR2A 4C58A 1OUKA 1XWSA 4NEUA 2F49A 3ALNA 3SRVB 2ETRA 3G6GA 4G9CA 3F3ZA 5E8VA 3TT0A 4FK6A 1PYEA 3F82A 3MH0A 4I6BA 4PPAA 3P4KA 5I9YA 2PSQA 2YFXA 3DCVA 3QQKA 1H26A 4IM3A 4MD8E 4P90A 4RJ3A 3MJ2A 3O17A 1R78A 5KNJA 4MTAA 1OIRA 5FLFA 5HD4A 1YVJA 4AW5A 5HLPA 3LFCA 2OXDA 4NL0A 3TIZA 4NWMA 2LAVA 1ZLTA 5CEKA 3NEWA 3L8PA 4A4XA 4QYGA 2BRBA 3R7EA 5IA0A 2V7AA 3CQWA 3RAKA 2GNJA 2RIOA 3BYMA 3NW5A 3BCEA 3CCNA 4O27B 3NS9A 5BX0A 2W1IA 3OCTA 3W2OA 2ITXA 1W83A 3BBTB 5HLWA 4UMUA 5AUYA 3D5VA 3GU4A 2P33A 3COIA 3TV4A 4QPSA 5J8IA 1GJOA 2QU6A 3QC9A 4WNPA 5A4QA 2BZJA 1XH7A 3EQCA 5IA5A 2QOOA 1I44A 3ENHA 4YC8A 2QONA 1UVRA 3ZFXA 3T8OA 4C62A 2DUVA 3DAJA 3R1QA 3DBDA 3E64A 4C7TA 5LVOA 2OXYA 1E1VA 3D5WA 1WBTA 3ERKA 4UMTA 4XLVA 2YM8A 1M7QA 2Z8CA 4QTAA 5L6WL 5LMBA 1W8CA 4C57A 5BVOA 4I93A 3WF7A 4FNYA 2GHLA 1S9IA 3W1FA 1Q61A 2WELA 2ZV7A 3D7TB 4FYNA 3V8WA 3ZO2A 2GTNA 4UMRA 3HAVA 5IQEA 4FVQA 3AGLA 3MVHA 2YWPA 5E8UA 1SVHA 1LEZA 3ZUUA 5DRDA 3RALA 4YLKA 4IZ5A 3H9OA 2YDJA 4JG6A 2F9GA 4JL9A 3PVGA 3LCDA 1H0WA 4FKWA 3V3VA 5BMMA 3E8DA 3FSKA 3U51A 3VUHA 2C6OA 3A7FA 4FNXA 5E8TA 4QMUA 3RWPA 4RA5A 3G90X 3VBYA 1J7UA 4IVBA 2GCDA 5HE1A 3ORKA 4IBMA 5E8YA 2QVSE 3Q4CA 4WT6A 5L4QA 2BAQA 2B1PA 2PTKA 3RM7A 5E8SA 4BZNA 4G6LA 5K4IA 3MVJA 4QP6A 4EQUA 2YAKA 2FA2A 5L8JA 4O22A 3WF5A 1S9JA 1KWPA 3OFMA 4AE6A 2P3GX 1MQBA 2QOFA 4DFXE 4FKUA 2XKDA 1WBPA 3DJ5A 3L1SA 4MXCA 2BVAA 4MCVA 4RC4A 2QU5A 4YC3A 5CAQA 2BMCA 4BF2A 3R1YA 3UOKA 2GNHA 3TDWA 4FKTA 3EZVA 3HZTA 2RFDA 4KB8A 5AM7A 4F0IA 5EOBA 5HCZA 5M44A 5HE2A 3FQEA 4Q5HA 3FLZA 4R5SA 3QRTA 2ZYBA 4IC8A 4X7QA 1BI7A 5AP2A 1G5SA 3FV8A 3U4UA 1SM2A 3MFSA 3UQGA 4KIOA 4EONA 4N6YA 4RQKA 1OITA 3DY7A 4HCVA 4JI9A 1LPUA 2EWAA 4AZFA 5HIDA 3GCQA 4QP2A 4H05A 5L2TA 2B9JA 4C3RA 5BVEA 3EQGA 4O2PA 3KQ7A 3O7LB 3OBGA 3UMXA 4MK0A 4R3RA 1KV1A 3R9NA 2YJRA 3IONA 2ETMA 3GQIA 3OTUA 4X6RA 3C5UA 4LUDA 3FY0A 4ZTQA 4APCA 2OZAB 4CVAA 2ZMDA 1V0PA 2ZB0A 2B9HA 3EQFA 3I5ZA 4DH7A 3QWJA 4I5CA 3PA4A 5CI7A 4EOQA 2WMVA 5K5XA 4LGGA 1Q5KA 1YXTA 4PDPA 1WBOA 2CNQA 1OPJA 2BZIB 1PXNA 1FBNA 3D2KA 3SDJA 2HK5A 2OICA 4I6FA 4XP2A 1H1RA 4FOCA 1PXJA 4MHAA 3QYWA 4EOJA 3JVSA 4AN2A 3ULIA 3QA0A 5TT7A 2J2IB 3KRLA 2ZM4A 3ORXA 4XG4A 4QQCA 3NYVA 3F3TA 4C37A 5IUHA 1ERKA 3HMOA 2X9FA 4HCUA 3V51A 3ZDIA 5CEOA 3ZEWA 2QLUA 4RVMA 4F1MA 2XZSA 2W1EA 4S34A 1I09A 3IK3A 4RIYA 4DG2E 4QP7A 2VTJA 2X6EA 4MXZA 5CU4A 5ANDA 5J79A 2YN8A 3LCSA 4C33A 3D5UA 3F2AA 1H1QA 3QD0A 3OROA 4XV3A 4DITA 3VUMA 1VJYA 1OB3A 3COMA 5AADA 5CZHA 3RNIA 2BKKA 3JYAA 4HGEA 3ZU7A 3P5KA 4CGAA 4GUBA 4L68A 5EK7A 1EH4A 4W4XA 3MH3A 3TCPA 3P79A 4AW1A 3KRWA 4GFOA 5HTBA 2JBPA 2Z7SA 4ZJIA 3WIGA 2PWLA 2R0UA 2W9FB 3EQHA 1YW2A 4XG6A 3T3VA 4XOYA 3E92A 3NYNA 2WQEA 3QTRA 3EYGA 2B4SB 3CGOA 2OH4A 3QTUA 4Y5HA 5HG7A 2YITA 1UKHA 3CPBA 1JSTA 4JAIA 5M4IA 5AUWA 2CSNA 5HOAA 5KUPA 1G3NA 3HDMA 4PPCA 3MN3A 3PSCA 3LPBA 4K33A 5AR4A 4FKJA 4AE9A 2WO6A 4G3CA 5DFPA 3VBWA 2PVRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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