3GCSA

Human p38 map kinase in complex with sorafenib
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
348
structure length
331
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGTRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of a fluorescent-tagged kinase assay system for the detection and characterization of allosteric kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 331
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gcsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gcsA01
3QZFA 1CKIA 5BVFA 1ZYCA 2XIRA 3DK7A 3OEZA 4O38A 4CT2A 4HYSA 2C3IB 4QD6A 4YPSA 4LOPA 3S95A 3IECA 4BKYA 4RJ4A 3CKWA 4A9YA 4P90A 1BI8A 5IDPA 2V62A 2E9UA 1XH7A 3QRUA 5EQYA 5F1ZA 1UNGA 4UN0C 2C6LA 2GQSA 1H24A 4GT5A 4LM5A 4H05A 3QQGA 2BZJA 4JRVA 4GIHA 4XG6A 1OIUA 3GCSA 4HNIA 4JDKA 4Y73A 3SVVA 3ZSGA 5LQFA 3RNYA 3I4BA 2BKZA 5GZAA 3ZM9A 2QVSE 3MH0A 1B39A 2VX1A 4FV4A 2QOIA 3Q32A 1YVJA 4RWLA 4UYAA 4C4GA 4ENYA 5I5ZA 1SVEA 3R2BA 4FG7A 4BDBA 5G1XA 5A6OA 2YM4A 3LQ5A 3IQ7A 1VYWA 4OAVB 4NIFB 5BUJA 1PXMA 3V6SA 3QQJA 3V5QA 4PX6A 5EM7A 4ZLZA 4Y85A 4EH2A 3UQCA 3NRMA 1PMVA 3QXOA 3EKKA 4GUBA 1L3RE 4KAOA 5F95A 3RM6A 3Q9YA 3AOXA 4D4VA 5BVDA 4FL3A 3UMWA 3CTJA 3G15A 4QMXA 4IB3A 4RRVA 4XOZA 4XX9A 5FRIA 3DZQA 2IVUA 2VN9A 3M1SA 3P08A 5E7RA 5GHVA 5KMLA 4NJDA 1W83A 5JEBA 3I60A 3P1AA 4D2VA 5AIKA 5FLFA 3IDBA 5HBEA 2LGCA 4O0VA 4C38A 2PL0A 5IA2A 3QTIA 2V22A 3AC4A 3GFWA 2ZYBA 4GW8A 4JDJA 5EQEA 2G2HA 3B8RA 1R78A 2Y6MA 3SW7A 4QMTA 4FYNA 4G3FA 3BQCA 2PK9A 2R4BA 3OW3A 1W82A 3PJ2A 4RIWB 5J7BA 1WBNA 3OCGA 1W84A 2QO9A 4ZJIA 2CGWA 5TE0A 3FLWA 1OKZA 3DNDA 4RX7A 1NVQA 4FSTA 3HDNA 4PDOA 5HHWA 4U3ZA 4BI2A 3QD2B 5TKDA 5KNJA 3ORZA 4YR8A 3FLYA 4FV0A 2VTTA 5HIDA 3MFUA 2QOFA 4L00A 5DN3A 4FSMA 4GJ3A 3V5TA 2A2AA 4DFZE 3ZZEA 4F08A 1M14A 5CF8A 3HL7A 4P5ZA 1WAKA 3I5NA 5C9CA 3LHJA 4CTBA 2AYPA 1JSTA 2XNOA 4KSPA 2E9NA 5M51A 5A9UA 2Z7QA 4G3CA 1LEZA 1XBBA 3GU7A 5E8XA 1P14A 2AC3A 2UW8A 4DFUA 2GS2A 2X8EA 4LYNA 4I24A 3VBVA 4U6RA 4M14A 1KE5A 4QTAA 5KKRB 3GC7A 2DQ7X 2NO3A 3IONA 4LFIA 2QO7A 3AC5A 4E6CA 4TNBA 4AA4A 2YCSA 2BHHA 1VEBA 3AC1A 4M8TA 3IW6A 4JS8A 2WTIA 3D5WA 3GENA 4UALA 4DLJA 5LVPA 5LWNA 4O2ZA 3QUDA 4H3BA 3N9XA 2RG5A 4CYJA 1Q3DA 4XV3A 3MJ1A 1U59A 4QMPA 2ZDTA 4FKTA 4IMYA 3VS4A 3MFSA 4WNPA 5AP4A 3TTJA 4ZZNA 5ETAA 1UNLA 5DH3A 5I4NA 3PG1A 3F66A 1PW2A 5AV4A 3HV7A 4JBVA 1T46A 3GVUA 3UNZA 3VS7A 4OGRA 3G33A 3DK6A 2Q83A 2ETKA 5DEWA 4QP7A 5HTBA 2GFSA 3U4UA 1G8AA 3F69A 2QU6A 4EC9A 5HVJA 4GG7A 2BVAA 2UW5A 1G3NA 2Y0AA 4KBAA 4YSJA 2J5FA 5DT3A 2W9ZB 1YQJA 3QRJA 3G0FA 5HU3A 4ITHA 5A46A 1AQ1A 2CPKE 3HECA 3ZO3A 3OWPA 4FICA 5TOZA 3VWAA 3ZXTA 3NUUA 4F64A 1JWHA 3R7UA 3PVUA 4D5HA 4HCTA 3UZTA 4AW0A 3NDMA 3OT3A 1OL7A 4DCEA 4B4LA 2OGVA 3NMUF 5HOAA 3DJ5A 2W4JA 3M42A 3BV3A 5CVHA 4JXFA 5L8KA 2X6DA 4F9WA 1XR1A 5AADA 2XIYA 4ACGA 2NRUA 3OF0A 4FTQA 3TUDA 2XYNA 3KMMA 4NM5A 4TYGA 4BCMA 2XP2A 2X39A 4NZWB 3FL4A 4IXPA 4QQJA 1IASA 2OG8A 2QKWB 3A2CA 3W2QA 4RWJA 4F7SA 5M4IA 1KE9A 2PMIA 4TTHB 3R7YA 3UMXA 2PULA 3F3VA 4O7VA 4A4XA 4PQNA 2C6MA 1UWHA 2PYWA 1FMKA 3R30A 3MSSA 4JR7A 1JAMA 5IA5A 3D7TA 3KRLA 2WU6A 3UNJA 4I6FA 3FMEA 4EUUA 1REKA 1GZKA 1Y8YA 5EW3A 2VD5A 5M08A 3C5UA 3E87A 2X2MA 1WVWA 2UZNA 3ATTA 3MVHA 2OJ9A 5DR9A 5IUHA 2UW9A 2VWUA 4YJVA 5K5XA 1TKIA 4AE9A 5E8WA 1GIHA 3D9VA 4M7IA 4IAIA 3FPQA 3TDWA 4IJPA 1PKGA 5CAQA 4PP9A 4DLIA 5IDNA 3P4KA 4I5MA 4MAOA 4NWMA 1PXLA 1J7IA 3DB6A 3ORLA 3TTIA 1Y6BA 2A1AB 5HE1A 3VBWA 2IZTA 4O7ZA 3FMJA 3I1AA 5ANJA 4M12A 3R6XA 4AW1A 2VWXA 3MVJA 3LM5A 3KL8A 2C4GA 3ZDIA 2F7EE 3IGGA 5K4JA 3D15A 1PMEA 3FL5A 3R01A 5ACKA 4RA5A 1Z9XA 2ACXA 2OJJA 2RGPA 4FMQA 4FVRA 2W17A 4EQUA 4CKJA 3FKOA 2F2UA 1QPJA 3TIZA 3OCSA 2CKEA 3HMIA 4NEUA 5FG8A 4EH8A 3UQFA 4QP1A 2VTLA 4S2ZA 4U7ZA 4KKHA 4CNHA 3R21A 4KKEA 2A27A 3UVRA 4RLKA 3VW6A 4FTLA 5AA8A 1SVGA 4G9CA 3R8PA 3KF4A 4ANLA 4PMPA 4OR5A 2Z2WA 3BHHA 3UP2A 4D1XA 4W9XA 4WHZA 4DEIA 1Y91A 3WZEA 2OJFE 3RZFA 2XK7A 4P4CA 3ZSIA 4O81A 1M52A 1ZMWA 3QCXA 4QMMA 1YWNA 3A7IA 3AMAA 3KCKA 2QURA 2RL5A 3ELJA 3NUSA 4XEYA 4IX4A 2PY3A 2PVFA 2W1CA 3KK9A 4TXCA 4YJQA 4IVDA 1H28A 4Y83A 2CNUA 3H9FA 3RNIA 4UY9A 4BCHA 4CD0A 4MWHA 3OHTA 3REPA 3FZRA 3FUPA 5DOSA 4C7TA 3HMMA 5JSMA 3UODA 4PP7A 1DAYA 1PMUA 2I6LA 2YM6A 2E9VA 5AAEA 4I4FA 4CFNA 2OKRA 3Q4TA 5FBNC 4LUEA 4ANNA 4RQKA 2VWWA 1F3MC 2YISA 3VS0A 3DXPA 3HAMA 2X7FA 3S00A 1ZY4A 5GJFA 3U8WA 4FV2A 4K9YA 5EI2A 4CKRA 5AV3A 2GS7A 5M06A 3IW5A 4MVFA 4AZVA 5JZNA 4FKPA 4DG3E 1CMKE 4EOOA 4I5CA 4AQCA 4G3GA 2GHMA 2X2KA 2XUUA 3R04A 4E7WA 1W98A 1U54B 3BYVA 3F5PA 3EQHA 1ZYSA 3VF9A 3MB6A 4BCIA 1Q99A 2B55A 4PY1A 4IWQA 4X2JA 2NP8A 2WMQA 3PUPA 2WU7A 4X0MA 3ACKA 1H1SA 5J5TA 1H07A 4GUEA 4GU9A 4NFNA 5A3XA 5ICPA 2OICA 4II5A 5E1EA 3Q4ZA 3UOKA 3PA5A 4YJSA 3LCSA 4KKGA 5C8MA 3JR1A 3Q4CA 4I3ZA 4Y5QA 4BICA 4ANSA 4GV1A 3ZLSA 4BDJA 4C62A 1M2QA 3QQUA 2WXVA 3GEQA 4QP2A 4J1RA 2XCHA 1Q24A 4O83A 3FWQA 2BROA 4QTBA 2XK8A 3R8UA 3Q5ZA 3KF7A 3UO5A 4YZMA 3SW4A 3I0OA 3MH2A 2FGIA 2QHNA 3E8EA 3LW0A 4J97A 2R3QA 4MH7A 4MXAA 3OEFX 4A4LA 4BBEA 1XBCA 4H3PA 5ANIA 3I6WA 4S32A 4ASDA 5KBRA 3A7FA 2ZMDA 3PXFA 3DBFA 4AUAA 4FNYA 2CNQA 5HCZA 2CSNA 2FA2A 4YC8A 4XP3A 2V5QA 5FEQA 4AT3A 4BWXA 5JFVA 3C5IA 4K6ZA 1XH5A 3CPCA 4XHKB 5DIAA 2J0JA 3AC3A 4ITJA 4HVHA 3SAYA 4ZTMA 2WMAA 5L2IA 2HIWA 4OAUC 3N4VA 2ZAZA 4BDGA 3P79A 2IW6A 3ZO2A 4N70A 4AU8A 4OW8A 4DG0E 3Q5IA 3D94A 2B53A 4JBPA 5I9UA 3UC3A 1OM1A 2WMUA 3R7GA 4KNBA 4QMLA 4ANQA 5CAUA 2FB8A 4DTAA 3ENMA 2FSTX 5FM2A 4J53A 4QP8A 3F82A 4E73A 3ZLYA 3BHVA 3LOKA 2Y4IC 3HEGA 3ALOA 3GCQA 4F9BA 1G8SA 1MUOA 3CBLA 3FMHA 4MXOA 2YWVA 2YIQA 2UW3A 5CWZA 3OROA 4OBPA 3OS3A 4QMYA 5KMMA 1GZ8A 4RVKA 3HMPA 4C33A 5JN2A 4P2KA 2IPXA 3AMBA 1YXSA 2GSFA 4RSSA 4DTKA 4XS2A 1GOLA 2IVTA 2QC6A 4K2RA 3A4OX 4KWPA 5CSPA 4G17A 5EHYA 2GDOA 4MD7E 4JVGA 3BGZA 4FGRA 4HGSA 2QOLA 2W1HA 2NRYA 4B6LA 5EI6A 5AR3A 3QGYA 4PWNA 3BGPA 3KB7A 4FZAB 4YTFA 3KXXA 4UMUA 3UOLA 1RW8A 2JEDA 4IC8A 3O2MA 3RPRA 4Q2AA 4FIJA 2FYSA 2YM8A 3IW8A 3EL8A 3EJ1A 3HUCA 4G3EA 3R9DA 3VIDA 4CRLA 3ZYAA 2BFXA 3E3BX 1DI8A 5DNRA 4D55A 2GHGA 2OF4A 3FLSA 3D5UA 3O71A 4BRXA 5LVNA 3AGLA 5C27A 2VTHA 4S34A 4RPVA 1YWRA 3BE2A 4XP0A 3DKCA 4DFYA 4FA2A 5BPYA 2RFEA 1OZ1A 1JBPE 1YW2A 2WAJA 4L3LA 4EZ5A 2PZYA 3R9NA 4QMNA 3MYGA 2GPHA 5JFWA 4W8DA 1JKKA 4RC3A 4BGHA 5EYMA 3MB7A 3VULA 4YSMA 1SNXA 3FI8A 3C0GA 3H9OA 4PTEA 5CI7A 2WPAA 3DTWA 4Z7HA 4PNIA 1IRKA 4BDKA 4USFA 1YOJA 4LG4A 3KXNA 2VTRA 4IM2A 3Q6WA 2FH9A 3MJ2A 2J0IA 2OZAA 4W8EA 2BRMA 3ODZX 4KRCA 3LQ8A 4AZSA 5HX8A 4C0TA 4G6LA 3BHTA 3ROCA 5J1WA 2E9PA 3LPBA 2OXYA 4H3QA 5T3QA 4WUNA 1MRVA 2BTRA 2B4SB 4GL9A 1NXKA 3BELA 3GC8A 1SM2A 4IAZA 1BMKA 3U4WA 4GFMA 5F4NA 4W9WA 5GZ9A 1OPLA 3QFVA 4FG8A 4I41A 2XS0A 2JIVA 4FSNA 1H8FA 3KU2A 3PPZA 4NT4A 4EH5A 1J7LA 1IA9A 5IF1A 3H9RA 4FSQA 3COKA 3ORPA 4FNXA 5DGZA 2OW3A 5E8YA 2BZIB 2QG5A 3MY0A 4JBQA 5IH5A 5KCVA 5L8LA 4UYNA 3C4CA 3PSDA 3WZKA 4TYHB 3T9IA 2HW7A 2VGOA 3U9CA 4IDVA 1H25A 4C4FA 1UKHA 3ZDUA 5KO1A 1KV1A 3KGAA 5D7VA 3WE4A 4K8AA 4OT6A 4X3FA 2CN8A 2BFYA 5BVEA 2B9JA 1FVTA 4ACDA 3ORNA 4BWPA 4BB4A 3NWWA 4AAAA 3QQKA 4LMNA 4AN3A 2AC5A 5E8SA 3V5LA 4D4YA 2OLCA 1WMKA 3PY1A 3NAYA 4FKSA 1RE8A 2X8DA 3QTUA 4FSRA 4G31A 3LZBA 2BKKA 4ZMFA 4DN5A 3VRZA 4AZEA 3RHXA 5IQIA 3HA6A 3ODYX 2Z7LA 3LXPA 2G01A 2Z8CA 4GSBA 3FZPA 3F2RA 3E92A 1ZAOA 3BEGA 4AACA 5F9EA 4Y95A 4M97A 4K18A 4RX8A 4BZOA 3AD6A 3NVMB 3A62A 3RHKA 4JIKA 4WT6A 3TV4A 2OIBA 3VHKA 5A4QA 2PMNX 2OXDA 4G16A 4ZIMA 3VJNA 1UKIA 3PXYA 5IQAA 2CMWA 4ZJJA 3BQRA 5LMAA 1ZMVA 3IOKA 5CNNA 4U44A 4O7SA 3UP7A 5DRBA 3W2SA 2WMTA 2YFXA 3JPVA 4HCVA 5EOLA 3L9NA 5HBHA 2JKKA 3ZMMA 4O86A 2DWBA 3GP0A 4PRJA 3MIAA 3OTUA 4I1ZA 1Z5MA 3BHUA 4L7SA 4WOVA 4ZP5A 5A4TA 4FV6A 4RWIA 2XNEA 2CLQA 4C8BA 2XIZA 3JY9A 1OBGA 2Y4IB 3HMOA 3TNWA 4HGEA 4TKSA 2UUEA 5FEEA 3PSBA 4KABA 4O7TA 5HQ0A 4F6WA 1OBDA 4C34A 5HU9A 2BDFA 3D7TB 5HNBA 3TUBA 4C59A 4ENXA 5M4FA 4IZYA 3GQLA 2G2FA 4F7NA 4O0SA 3SQQA 4X6RA 4E4NA 1A06A 1FOTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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