3GEQA

Structural basis for the chemical rescue of src kinase activity
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
286
structure length
272
Chain Sequence
GHMQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLAAANILVGENLVCKVADFGLARLPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Comparative analysis of mutant tyrosine kinase chemical rescue.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 77
structure length 272
sequence length 286
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3geqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3geqA01
3KXNA 3UQCA 3NGAA 4IDVA 5JQ8A 3DY7A 2C68A 4CYJA 3WARA 2PSQA 3CGFA 5HHWA 3GCQA 4RVMA 4AN3A 3AXWA 1URWA 5EI8A 4BZDA 3LAUA 4J1RA 4MBJA 4U79A 5J5SA 2XA4A 4EOSA 3KXXA 4BHZA 2NRYA 3MGYA 3QTZA 3QTXA 2B9JA 3ZLWA 2G2HA 4S2ZA 3UNZA 3Q4CA 3P78A 4DEBA 3H4JA 5HKMA 3R28A 2RG6A 5CALA 4I92A 3VIDA 4AE9A 3CD8A 3QTUA 4FKIA 4M8TA 3EOCA 4CV9A 4X3FC 3EQRA 4FUYA 3PUPA 3Q4ZA 4ANQA 2ETKA 2FSTX 2J0LA 1T45A 2VX0A 3SX9A 3BEAA 3T8OA 3A99A 4BR3A 2C6KA 1NA7A 4BICA 4X2GA 3OCGA 3QQJA 4FTNA 2GQSA 4NM3A 1BYGA 3VHEA 1ZOHA 5JK3A 4QP1A 5LMBA 3RPYA 1APME 3GC8A 1UU3A 4CT1A 4KUJA 3UZPA 4DBXA 4A9SA 3OF0A 4BKZA 2Y6MA 3BLQA 4FOCA 4G9CA 1BL6A 4FV4A 4FTOA 4BRXA 5IU2A 4IACA 5FBOA 1H01A 3AMAA 5HBEA 3ATTA 5FUTA 3GB2A 3VUGA 2BR1A 2X9EA 3E88A 2BILB 4EONA 4FEXA 1NVSA 3BE2A 4UWYA 3MVMA 4L7SA 5GNKA 4EOIA 5LWMA 3MWUA 3VS4A 4GKIA 2YM8A 1PXOA 4JI9A 3ELJA 4YJOA 5FM3A 3TIYA 4GIIA 4NJDA 5CXHA 4CMUA 3F5UA 4C8BA 4D0WA 4DE4A 1NY3A 3LFSA 2BZKB 2HELA 3QCYA 2OZAA 2PY3A 1XH9A 4C59A 4C62A 3FQHA 2W0JA 3V5JA 5AA9A 5IDNA 2PE1A 4DFUA 5E4HA 4XG7A 1E1VA 2P2IA 2QVSE 3OW4A 3D2IA 4OLIA 2DYLA 3QQGA 4WOVA 1VZOA 3FMEA 3NRMA 2R3JA 4IWQA 4MQ2A 4IM0A 3VS6A 1E9HA 1FGIA 4AWIA 2WQEA 2NO3A 2V22A 2ACXA 2JDSA 3G9NA 4XEYA 5E9EA 2R3NA 3VWAA 3TNQB 5ETFA 4OTPA 3GCSA 2ITVA 4RSSA 3W18A 3MH2A 3R7OA 4G17A 3PSBA 5AUVA 3SHEA 1XO2B 4BBMA 4DLIA 5CEMA 3KRLA 4WRGA 2V5QA 4JXFA 1OIQA 4GS6A 1LEZA 4RIOA 5LQFA 2C6IA 3R8VA 2J4ZA 3WIKA 1BX6A 5CF8A 2Q0BA 5BUEA 3IOPA 1UU7A 3FLSA 3JY0A 3HV6A 5BVOA 5HO7A 2ONLC 3PXRA 3PSDA 4CSVA 5JH6A 3W2SA 4LGHA 1WBSA 3O7LD 3KF7A 3AD5A 1NVQA 2YIXA 3NDMA 4IXPA 2ERKA 3GC9A 2W1ZA 5KBRA 4RFZA 1QPEA 4Y73A 4C2VA 5DMZA 1G8SA 2BAQA 3WI6A 4EOPA 2XB7A 3TM0A 4H36A 2OJJA 2XS0A 3UNJA 3UO5A 2JFMA 3DBDA 3UDBA 2UVYA 2YACA 4FVPA 1U4DA 4GKHA 4CQEA 4GT4A 3WZDA 1JSUA 4FNWA 5HU3A 2UVZA 4KNBA 4IH8A 2DS1A 4A06A 3BWJA 3DV3A 4RVTA 3S95A 4R7IA 2C3JA 3TV6A 4EYJA 3QRKA 2OI4X 3SD0A 1Q61A 3LFDA 4DCEA 4DGLC 1AGWA 3VQHA 3DQXA 3UGCA 2JBOA 3FUPA 3ODZX 3ZHPC 4JT3A 3O51A 4C0TA 3IPHA 3AT2A 3NW7A 3CTHA 2O2UA 4K9YA 4CTBA 3UPXA 4P4CA 2VTQA 2QG5A 4LRMA 3A60A 5HG5A 3DTWA 5CASA 3AC4A 3WF8A 1VJYA 5KMMA 4DT9A 4ONAA 3ZSGA 4BC6A 4FZ6A 3RAHA 3FLNC 5B2LA 3FEGA 2OXDA 2QONA 4HGEA 1OMWA 5CAPA 2OG8A 4YZ9A 2VX3A 1OUKA 2FSLX 3P1AA 3QC9A 4FYOA 4JIAA 4OTIA 3NVMB 4O0TA 3FZSA 4MBIA 2A4LA 1KUTA 2OJFE 3GU6A 5IEXA 4GUEA 4AGCA 2R7BA 3CTJA 3ZO1A 4E26A 4XH6A 5LVNA 4KBAA 3RBWA 4MHAA 5DT4A 5HORA 4YZDA 4KIOA 4CKRA 3RZFA 3I1AA 5DT3A 2YIRA 3SG8A 5AR7A 5HE0A 2WEIA 5IQHA 2UZNA 4YJSA 3N4VA 2E2BA 2VTRA 1Q4LA 3FMHA 4CFUA 3TJDA 1TQPA 5KKRC 4CRSA 1KOAA 4C58A 3FC1X 2VGPA 3ENMA 3D5XA 2NRUA 4M15A 4RC3A 5AV1A 4ZJIA 4ZJVA 4E6QA 2QU6A 5CU4A 2PU8A 3OXZA 4FSMA 3QRIA 4F9CA 4MXYA 1Y6BA 4GFOA 3NS9A 2I7QA 3WYYA 3QX4A 2YIQA 3V8TA 4BDFA 1YVJA 4K0YA 2B9HA 4R1VA 4L01A 3EN7A 4O2ZA 4C4FA 4O7NA 1SYKA 3R73A 4EHVA 2QG7A 2LGCA 1YW2A 2C5NA 2E9NA 3GXLA 4FIEA 4TRLA 1KOBA 3CPCA 3RI1A 4A9TA 3W2CA 4L00A 1K3AA 4XNEA 2VNWA 2UZEA 2YN8A 3ZC5A 2BFYA 1WZYA 2WMWA 4YJUA 3UQFA 2JIIA 3EN4A 2QLUA 3QQHA 2WQBA 4RQKA 2GMXA 3VBYA 3OY3A 4Y5QA 5FM2A 3ZYAA 2X7FA 1M14A 3VULA 4EUUA 5A46A 4ZY4A 4ZSAA 4USEA 2GQRA 4O84A 1UA2A 5CQUA 5B2MA 5IA2A 1PY5A 4E4LA 3MY1A 3MH0A 2YJSA 4EJ7A 3NUXA 4OR5A 2YFXA 3COIA 4EH7A 4AGUA 5ETIA 4EYMA 3E5AA 5B7VA 2JAVA 4O7LA 5CZIA 4O0RA 4N0SA 2GDOA 4ZLYA 4JQEA 5AFVA 4ANBA 4RX8A 3SAYA 3PDTA 3B2WA 4ZS4A 3U9CA 4PWNA 3Q96A 2X7OA 2Y7JA 3UO6A 4O1OA 5GZ9A 3V8SA 4Q2AA 1ZZ2A 5IF1A 1M7QA 4HGLA 4HYHA 4KSPA 4B4LA 3FYJX 2VV9A 5A6NA 4YHFA 4MXOA 3GU5A 2R3MA 3KN5A 4FVRA 4WG5A 2A0CX 4U7ZA 4HVGA 2R3LA 2R3IA 2W99B 3FZRA 4G2FA 3LFAA 4FV6A 2WELA 4CLIA 5AAEA 1HCKA 1UKHA 4D9TA 5FP6A 5JFVA 1QCFA 3DAEA 3H3CA 2WMAA 2C30A 1Q8YA 3VW8A 3C4XA 3OWJA 3RWQA 3A62A 5GJFA 4LMUA 4U40A 4UMUA 3SVVA 3CSVA 3GQIA 4GU6A 1OBGA 1LR4A 1W8CA 5J8IA 2PVFA 2BZIB 4C4HA 3PZHA 3QYWA 4E73A 3R63A 2R2PA 1TVOA 3QD4A 4XV3A 3PY0A 3ZSHA 3LMIA 4HGSA 2BRMA 4PP7A 4YC3A 5AEPA 2F57A 1H1SA 1U5QA 4RLKA 4ENYA 4F0GA 3QZFA 4G6LA 5A4QA 2VO7A 3V5LA 1T46A 2X4FA 3FSFA 4FKQA 2LAVA 2CSNA 3NW5A 3QHRA 2XRUA 4PMMA 4BVUA 3E8EA 4UBAA 4G1WA 2V7OA 1YDRE 4QTCA 3DGKA 5CWZA 3ZFYA 4BWXA 3OOMA 4C36A 3WZKA 3AC1A 4XV2A 5ACKA 2VTMA 2BALA 5CSXA 3QCQA 3UQGA 1UNHA 3F7WA 3EYGA 4U43A 2XKFA 5I0BA 2VTTA 5HO8A 5DLSA 1JQHA 1OL2A 2CGVA 3LFEA 2CNQA 4GT5A 3MTLA 4JIKA 4NTTA 3R9OA 1OZ1A 2G2FA 3OVVA 5C8MA 3V3VA 5AM6A 1U54B 2P0CA 4G31A 1IA8A 3S00A 5IQDA 3R7VA 4IW0A 2G15A 4GSBA 3AG9A 3CGOA 4K77A 3QQKA 4BBFA 4PDSA 3S3IA 3UYSA 4DEEA 3AMBA 1FMOE 4M67A 4V0GB 2VWBA 2BIKB 3KRXA 1F3MC 2W4OA 4YSJA 3TIZA 4NYEA 2YERA 1MRYA 3QRJA 4O7SA 4GIHA 2B53A 2QOFA 5AUXA 1WBTA 2ZDTA 3N51A 4J53A 3Q4UA 4W4VA 1HCLA 4W4YA 4U6RA 3EH9A 4IFCA 3OBJA 3I4BA 5IA1A 4JOAA 3UP7A 5ANGA 5ITAA 2C6MA 1MQ4A 2V62A 3LIJA 1PKDA 3MYGA 4B9DA 4BDKA 5I9ZA 4OAVB 5AWMA 4DT8A 5KMNA 1Q8WA 3DOGA 4F63A 2IO6A 4D55A 3NLBA 2UW6A 4RQVA 2BTRA 1Y8GA 3BKBA 1ZYJA 1YQJA 3NYNA 2OW3A 1JLUE 2OGVA 2ITOA 2PHKA 5DWRA 1M2QA 1RJBA 3E62A 3PVWA 3TZ7A 5D10A 3TACA 4JG6A 2JC6A 3EQHA 4N70A 4RJ5A 3U4WA 4F6WA 4YR8A 2R0UA 3LQ8A 5HBHA 3PP0A 5G6VA 4FE2A 2WMTA 3W1FA 4EZ3A 5E8UA 4FVQA 4BCQA 1O9UA 5EW8A 3V01A 3U6JA 4X2JA 4WUAA 4D5KA 4BI2A 4D4RA 4BYIA 5E90A 3HP5A 1OPLA 3DFAA 3E63A 3G9LX 4APCA 3A7GA 3ORLA 3FHRA 5L8KA 4MVFA 4I23A 3BPRA 4LG4A 1SVEA 2HYYA 3OWPA 3PVBA 5E92A 1QPDA 4MK0A 5AP3A 3ZCLA 1Y57A 4AOIA 3DQWA 3KL8A 4MAOA 3DU8A 2BUJA 3LQ5A 5CENA 4AZWA 3WF7A 3TUCA 2QKRA 3PXKA 4F0IA 4NCTA 5K5XA 3LM0A 3HRBA 4ARKA 4IJ9A 3GQLA 1OB3A 3ZTXA 4CFWA 4NFMA 1P2AA 1M52A 4RZWA 4F09A 5AUZA 5A6OA 3PZEA 4EH2A 4B8MA 1WAKA 3QZIA 4L67A 3PA3A 5HD7A 4BGGA 5IA4A 2WOTA 5CXZA 2RIOA 4YTIA 3WIGA 4PDYA 4F64A 1FGKA 3MVLA 2HZIA 3F5GA 3BHTA 1V0BA 3KEXA 2E9VA 2EVAA 5K0XA 1Q62A 2XKEA 4C4JA 4I3ZA 3TNHA 3F61A 3ZOSA 1XH7A 2OIDA 3B8QA 4U5JA 3LZBA 5DT0A 2UW5A 4FK6A 3Q2MA 4GL9A 1IASA 3OD6X 3P7CA 5GINE 4DFYA 3Q2JA 4S31A 4PF4A 4CFNA 3EHAA 3VRZA 4N4SA 3FXZA 1ZAOA 3VS0A 4X0MA 4O6LA 4OTQA 3TNWA 3PWDA 2XRWA 3WZEA 2R3KA 3G51A 4FV8A 4D4YA 4J98A 3ENHA 5CTPA 3K2LA 5LVOA 3DFCB 3NPCA 4PMSA 4PMPA 4QP8A 1OKZA 2JGZA 3AGMA 3KCFA 4GVAA 2IZRA 3ROCA 3MIYA 2QOCA 3U54A 3R7UA 3K5UA 4KBKA 2X2MA 4WO5A 2RGPA 5DIAA 3EYHA 5AP1A 4CMOA 2VWXA 3SC1A 1FPUA 3EKNA 2PVLA 3RPRA 3FMLA 5KMIA 3EMGA 4JBPA 4WNMA 2IN6A 4E7WA 3FKOA 5KCVA 3BV3A 4B99A 4CZYB 5IA3A 2RKUA 2XJ2A 3QTRA 5LJJA 2UZOA 3DTCA 3LXKA 4ZZOA 2GFCA 4XLIA 4CKIA 3R2YA 5DPVA 2PVKA 4DFNA 5J5TA 3PXFA 4AZSA 5L3AA 3DA6A 2B0QA 5H8EA 3G15A 2XJ1A 2CGWA 4OBOA 4EBVA 3IO7A 3FDNA 4S32A 4A4OA 2WTVA 3IS5A 1KSWA 5HD4A 2Z7LA 3T9IA 3EKKA 4MF0A 3QQFA 2SRCA 4GK4A 4RC4A 3EL7A 2ITYA 1P4OA 3NUUA 4JNWA 4A9YA 3N4UA 3FC2A 3EFJA 5I4NA 3ATSA 4FTLA 3W2RA 4FYNA 3PIZA 4ZMEA 3EZRA 3RNYA 2O5KA 3EB0A 3P7BA 3R1YA 2W1GA 4IVAA 5DFPA 3VF8A 4QQTA 4TYEA 4CCBA 4QPAA 1YHVA 3LCDA 2BKZA 3QF9A 2PTKA 4NTSA 5E8TA 2BDJA 4IDTA 2PMLX 2A27A 5BQ0A 5JRQA 4ERKA 2HWOA 3HDMA 3NIZA 3BYOA 1OVEA 3GEQA 3EQFA 4O83A 3P9JA 3CLYA 4HCTA 1NW1A 2KULA 5AP0A 4ZSJA 3AC8A 2VWZA 4JDJA 4RJ4A 4PDPA 4U42A 4BIEA 4ZP5A 4D2TA 4D1XA 4R1YA 4NM0A 3CE3A 2WTDA 3QFVA 5IQCA 4LI5A 3BELA 5JFSA 4FNZA 4FSNA 5JZNA 4D2SA 1OL6A 4ZZNA 3G2FA 1U46A 5M4FA 4YTCA 1URCA 3VUHA 1DI8A 4L3LA 2C6DA 3F3WA 5EI2A 4YJNA 4FV2A 4EK8A 2REIA 2YWPA 3L9PA 4YJQA 5EDRA 3IOKA 3A8WA 4QMTA 3V5PA 4AX8A 2PULA 2WAJA 3QZHA 3D5WA 4FTCA 4UMTA 4FV5A 3FKLA 5L2SA 3RGFA 2J7TA 5B0XA 3I7BA 4I41A 4ANOA 4C7TA 4ENXA 3OZ6A 2XP2A 4ZAUA 3DXPA 5K0KA 1W7HA 5AMNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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