3GOPA

Crystal structure of the egf receptor juxtamembrane and kinase domains
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
343
structure length
300
Chain Sequence
KRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGGTVYKGLWIPEGEVKIPVAIMELKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDEDSNFYRALMDVVDADEYLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The juxtamembrane region of the EGF receptor functions as an activation domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 90
structure length 300
sequence length 343
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gopA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gopA01
1H00A 3RAWA 4BDCA 3CXWA 3QD3A 4C37A 4E4MA 4ANLA 1KE7A 3TV4A 2YA9A 3LE6A 3LFBA 4FSTA 3OCBA 4Y83A 4Z7GA 4EZ7A 3AMBA 1OB3A 1UNGA 2GS7A 5HIDA 3R8UA 3KMWA 5EQPA 4BCHA 2FB8A 3I0QA 5T68A 4GRBA 4RQVA 4MF0A 4PTCA 3RP9A 3ZLXA 5C4LA 4MNFA 2YAKA 3P9JA 4OLIA 4NT4A 1A06A 5CVHA 4FMQA 5FTQA 5IA3A 4C59A 4FV8A 3HECA 5DNRA 1QL6A 3FMNA 2R7BA 3BLRA 2H96A 4FKPA 5HKMA 1IA9A 2VGOA 3RZBA 4QTDA 5CXZA 3LFQA 3R7GA 3RCDA 3NCGA 2RSVA 3KREA 3RVGA 3CLYA 2OIQA 3ZBFA 4A06A 3PY3A 4NCTA 4ASDA 3N4VA 3EFJA 5DMZA 3DFCB 4PY1A 5IH5A 5AUVA 2WQMA 4A7CA 3HP2A 5IA5A 4FKRA 4ASEA 4YC3A 5M44A 4YMJA 2I0EA 4O81A 3KN6A 4BCFA 3R7UA 3L9MA 4RGJA 3W1FA 3FHIA 3NIZA 4YBJA 3IW8A 2C4GA 5L2SA 4IM3A 1CSNA 3H0ZA 4GK3A 4RIYB 1FOTA 4WHZA 3VRYA 3GU7A 1ZXEA 3BYOA 3QRIA 2EU9A 5EG3A 3V5TA 1UNLA 3R9RA 4M0YA 3OUNB 2CCIA 4I5PA 3D7TB 5AP0A 4O0TA 4O0YA 2JEDA 4KKEA 4JG8A 3TV7A 1SZMA 3OF0A 4QQTA 1K3AA 2PVHA 1L3RE 4WNOA 2FSTX 3ZSIA 4E6CA 2J0JA 4RFMA 5AEPA 4CGAA 3LXLA 1J1CA 3M11A 3DKGA 2R3GA 4X3FC 4AW0A 3C50A 3ORXA 4FBXA 3QUEA 4BN1A 5HQ0A 4UX9A 5JRQA 4YNEA 3GNIB 4RQKA 5AAGA 2C6KA 1AQ1A 2C3LA 5IPJA 2XUUA 4LRJA 2WPAA 3BHVA 5KKRB 4ZTLA 1ZMWA 4MAOA 3PPZA 3DK6A 3PZEA 3GCSA 4GSBA 4AW5A 2BFXA 2XKFA 4RIWB 4IDTA 2OI4X 4PPAA 5GJGA 4HVDA 2WKMA 2EB2A 4OGRA 4TWPA 4U43A 3BEAA 5FBOA 4EH7A 4WNMA 2EXCX 2VWWA 3LMHA 1H08A 4JRNA 4K0YA 2WMAA 2Z7RA 1ZMVA 3ZZEA 3RK7A 3MY1A 4I6HA 5A3XA 3GC8A 4K2RA 1YI6A 3EKNA 2ZMCA 3T3VA 5IQEA 2YISA 4WOVA 3ZONA 3ORPA 4TT7A 5CAVA 3ODYX 3GQLA 2BDJA 2GPHA 4CZUA 4OTFA 2R5TA 3IGGA 1LEWA 2QLUA 5DT0A 3WE8A 4U80A 5EI2A 4C58A 3P08A 3MFRA 1XHAA 3D83A 4FTCA 3E87A 2O3PA 4LMUA 3HL7A 4FTJA 3RAHA 2JKQA 2WIHA 2QU5A 5CTPA 4YBKA 5IQGA 3MSSA 5EYDA 4F63A 3O8UA 2XKEA 3DXPA 4O2ZA 3HGKA 4AS0A 3VBTA 5I9XA 3MW1A 4RVLA 2UW8A 3C0IA 3SA0A 5EM8A 4ANBA 4LI5A 3UYTA 5BNJA 4X6RA 3C5UA 2C6OA 5D11A 3ZXZA 2GQSA 2NRYA 3EQPA 1UU7A 4OBPA 2XH5A 3OOMA 4ACGA 4NKSA 2WXVA 3TIYA 4ZJIA 2GHGA 4Y95A 5IEYA 2I7QA 2QI8A 2B9IA 4ZLOA 5CS6A 5LVNA 4HVGA 4KRCA 3F66A 3G90X 3P0MA 4O6LA 3UOJA 1Q8ZA 3Q4CA 3QC4A 2IW6A 5HI2A 3UG2A 3FPMA 4O21A 3EL7A 2VTAA 1WBWA 2UW7A 4ZTRA 3VS7A 5EKNA 2W17A 2XK3A 3U4UA 4GCJA 3VS6A 3NW5A 3HUBA 2XK6A 5CEIA 1Q4LA 3O8TA 3U87A 3NCZA 5B2LA 2R3FA 3B8QA 1ZZLA 4ZMEA 5JZNA 4QRCA 4RSSA 2QR8A 4W9WA 1G5SA 3QQKA 4CFMA 3OY1A 1JQHA 2QOFA 4QMSA 1P2AA 2RGPA 5L4QA 2X8DA 2PZRA 4FNYA 1TVOA 5J1WA 3TUBA 4YR8A 4I5HA 5K0KA 3WZEA 3FBVA 3NUXA 5KMJA 2OH0E 3M1SA 4IH8A 2RFNA 3PVBA 5AM6A 2WTKB 5EK7A 1DI8A 2JAMA 3F2NA 2W1EA 5TR6A 3NVMB 4A9UA 2B9HA 1ZARA 2XK8A 3G5DA 1FBNA 4YZDA 1GJOA 3TN8A 3NRMA 1JKSA 1FVRA 1Q8UA 4GKIA 3F61A 4XBRA 2HCKA 2QNJA 3GCUA 3Q3BA 4PPBA 2GCDA 3OEFX 5FGKA 1NVRA 3C0HA 3OT8A 2XIZA 2GNIA 2RKUA 2PULA 3BQCA 3F9NA 4ORKA 2WMQA 3DKOA 1YQJA 4TW9A 1HCLA 4ALVA 4A9RA 3D15A 1K2PA 4RJ5A 3WYYA 1XWSA 5EDPA 5HO7A 3QD2B 4FKOA 5A6NA 2W1HA 1KOAA 1H26A 3DXNA 4RZWA 3O7LB 4C33A 5CF5A 5E8VA 3VW8A 4AGCA 4D4VA 4O38A 3HLLA 5DWRA 1YXUA 3V5JA 3VJNA 2V55A 3LFAA 2J0IA 4E3CA 2OF2A 3L8PA 4YJQA 2CKOA 4X2KA 1JKTA 2JC6A 3RZFA 3Q5IA 1Q8WA 4O0RA 2J4ZA 1ATPE 3R8VA 5CNOA 4J7BA 5T3QA 3KRLA 4YC8A 2C0TA 5CNNA 5FM3A 5AX3A 3A4PA 4GVAA 5IUHA 3RAKA 1ZZ2A 3BU6A 3FXZA 3DV3A 4DTAA 4BC6A 5FQDC 1JBPE 2R3MA 4OTDA 4ZLZA 5M4UA 4GK2A 2GHMA 4YHFA 3BPRA 3R2BA 4IW0A 2Z7SA 4PTEA 4TWOA 5M55A 3FHRA 4X3FA 2VUWA 4N6YA 4EHEA 3MIYA 4Y8DA 2F49A 3UE4A 4D4RA 4D5KA 3VBVA 1YXTA 1UWJA 3O23A 3LHJA 3COKA 4RWIA 5L3AA 3QCQA 1RE8A 4LGGA 2PVMA 1Q99A 1FMOE 3IGOA 3HV4A 3BHTA 1GNGA 4CTBA 1PKGA 3BRBA 1ZY5A 4ZAUA 3UOLA 3ZXTA 1WFCA 2VX0A 4YURA 4ONAA 5DGZA 1KSWA 2ZDTA 2ZJWA 5AP1A 2PY3A 3RM7A 3CGFA 3CPBA 1GZKA 3LMIA 4EOQA 4YC6A 4XG9A 4LOQA 4HOKA 3SOCA 4JBQA 4AA0A 2YWPA 4GG5A 4MWIA 4AOIA 2WQEA 2WTKC 4WNKA 4AF3A 5EI6A 1YHSA 2XK4A 3P7AA 2PUNA 5JN2A 1M2QA 2BR1A 5AMNA 3R7YA 4ZSAA 3NUNA 4I24A 4EOJA 2YN8A 5EI8A 3MGYA 4CTCA 1NA7A 1YWVA 5IA4A 4EBWA 4O1OA 4FTOA 3I60A 4D2SA 4ZTHA 3TZ7A 2OG8A 4Y73A 5M4CA 2CLQA 4QQJA 3TM0A 3R30A 3BI6A 5KNJA 5M09A 2F7EE 3L1SA 3UZPA 5HZNA 4D2VA 1S9JA 5HOAA 2CKPA 2GHLA 4I4EA 5AR5A 2W5HA 4M69A 2QC6A 4EC9A 3U55A 4QP4A 4II5A 3FXXA 2PVKA 4IE9A 2WOUA 2J51A 4L7FA 4BDHA 4QTCA 2YFXA 2RG5A 4USDA 4U40A 5CQWA 2C6DA 4D0XA 3K5VA 3EN6A 3F5GA 1FGKA 5HX8A 1KE9A 4LRMA 4YHJA 3Q2JA 4HVSA 5GIPE 1H01A 4FSQA 5IMXA 1SNXA 3GU4A 3CY3A 2E9NA 3SW7A 4X3JA 3RJCA 4IWOA 5DVRA 4GU6A 4U7ZA 4MH7A 3D5VA 2YDJA 5E90A 3VW6A 3D7TA 3PXFA 4CYIA 4BWKA 3LOKA 2CGVA 4QMTA 3BKBA 3P86A 4MHAA 4AX8A 4D2PA 4DLIA 3HMOA 3VRZA 2Q83A 4CFNA 3Q9ZA 1CKJA 4U97A 4ZY5A 4FSYA 4GJ3A 3NDMA 4BHNA 2HYYA 4X21A 5KMMA 1VJYA 1WBTA 1WVWA 1OKZA 4KS7A 5I3OA 4TL0A 1ZOHA 4OTPA 3HAMA 5H2UA 4ZXTA 3GFEA 4F9AA 2BILB 2BAKA 2PMLX 4BIBA 5F94A 4DGMA 4J96A 3D2IA 4EYJA 1ZLTA 2ZOQA 4RLLA 5AV0A 5I0BA 5I9VA 5IQCA 4BCGA 5EM7A 3KL8A 4FTNA 4G6NA 4RIWA 4GUBA 4BWPA 2WU7A 3OXTA 5HD7A 3VQHA 3DLSA 4AE6A 3MFTA 4IVAA 4DCEA 2PE2A 2CKQA 3HV6A 2YAAA 4C0TA 4BB4A 2BAQA 1SMHA 2GFCA 3GOKA 2XNPA 4BDGA 4GFOA 3MB6A 2CGWA 2CNUA 4BCKA 3NUYA 1M2RA 4F65A 3BYMA 4F7LA 2XIYA 3UOHA 3BLQA 5CF8A 3SW4A 4WBOA 3F3TA 1XBAA 1FVTA 4A4LA 3PXQA 5CU6A 4FVQA 3B2TA 3BBTB 4HYIA 4MNEB 3W55A 3GVUA 4BDIA 4BCPA 4DGOA 3ZUUA 2YCRA 5HTBA 2F7XE 3Q4ZA 3DOGA 5AV2A 4YO6A 4JS8A 5TT7A 3U4WA 2O65A 4I20A 2WAJA 4O27B 4I23A 5JEBA 3VJOA 2WIPA 4E93A 4NM7A 2ZV2A 3DTWA 3MPTA 2C5XA 2RFDA 2ITNA 1FINA 2AUHA 2R3KA 2R3IA 4P5ZA 4XLIA 1IASA 4BZOA 3PDTA 3KK9A 4J1RA 1VEBA 4FKVA 4LV5A 3HMPA 4PL3A 4J52A 4YLKA 3BHHA 4F09A 5FXQA 4F1MA 3LW0A 3IW7A 3S0OA 1BKXA 3LFFA 2BDWA 3E7OA 1OL7A 3NYVA 3D5UA 3ZYAA 4AP7A 4EKLA 5HGIA 3NW6A 1GY3A 5FUTA 4E1ZA 2XJ0A 3ZH8A 4QMMA 1UU8A 2H9VA 4R7IA 4QYFA 2UZEA 2GDOA 2XYUA 3ZC6A 3DU8A 5D9HA 5AADA 4ZOGA 3QU0A 4EHVA 3UVQA 4O6EA 2YIRA 3ROCA 5HD4A 3VBWA 5A9UA 2Y0AA 3K54A 3P78A 5IA2A 2X9EA 5L8LA 4BTJA 3JVRA 2E9VA 2OK1A 4GVJA 4EUUA 5IF1A 1J7LA 2UZBA 3KY2A 1PXOA 5M07A 5JSMA 1Z57A 5L6PA 3CGOA 1UVRA 2B52A 2XMYA 1Y91A 3MWUA 4NYEA 2VTHA 2I0VA 4OTHA 3ZHPC 3EN9A 5IA1A 4NKAA 3RI1A 3UNKA 3QALE 4FEUA 5EDQA 5FG8A 3DJ5A 1O6YA 4MBJA 2XS0A 2AC3A 5IH6A 2C47A 2X39A 5LMAA 2O63A 2PZYA 3KC3A 5DLSA 1TQMA 2BRGA 3FQEA 3PG1A 3QLGA 1TQIA 2PTKA 4QMUA 4PNKA 3KRRA 4XG7A 4AXAA 3CJFA 5M53A 4TWCA 3OTVA 5CF4A 2DWBA 5EW8A 2WTWA 5K3YA 4XV3A 3VF8A 5IG1A 5EDRA 3VVHA 4BVUA 3BX5A 4I3ZA 3EFKA 5AX9A 1R3CA 3CJGA 4JVGA 2VTIA 2PL0A 3GC7A 3QD4A 2PVFA 2XIKA 2XNMA 4AZTA 3VBXA 2OJ9A 2R2PA 1JSUA 3BELA 3OWPA 4GYIA 3WIGA 4NZWB 3LM5A 3DAJA 4FZDB 3MA6A 5E8WA 4X6QC 3HMIA 4F0FA 2XP2A 3BE2A 3D2KA 4KUJA 2BVAA 4JQ8A 5IMEA 4I93A 2W9ZB 5CASA 4IZAA 5FEQA 3PJCA 4Q5EA 2UVYA 4ZK5A 3LFEA 4E5BA 4F99A 3VUHA 5A4QA 5E9EA 3DBQA 1SVEA 3SHEA 4DFNA 2V0DA 3LFCA 1PHKA 2PUIA 2R3HA 5EM5A 1F3MC 5DR6A 2LGCA 4HGTA 4GT5A 5KHXA 4IX4A 3FE3A 4IVCA 2VTTA 4F9BA 5C8NA 2JIIA 3RHKA 4M7IA 2HWPA 3PVGA 4L68A 4O7TA 3GGFA 1H0WA 5LVPA 4NCTC 4QMPA 3V01A 1QPCA 2PVLA 3SXRA 4FYNA 3QF9A 3LPBA 4RIXA 4WG5A 3W32A 1H25A 4YP8A 3RK5A 3VBQA 4OAVB 2CNQA 4XP2A 1W98A 4XYFA 5FLFA 3LQ8A 1LR4A 3AQVA 4RFZA 4YJOA 4XLVA 4DGNA 2PE1A 4YHTA 1VYZA 3PRIA 3UVRA 3Q6WA 5FTOA 3TI1A 5HCXA 4U45A 4R3RA 4DINA 2YM7A 3E92A 1PMNA 3DPKA 5AM7A 3NUUA 4QPMA 4RFYA 5IKWA 2JGZA 4U79A 3VUGA 3I5ZA 4BI1A 2HIWA 4AGDA 3OCGA 3RPVA 4D9UA 1OL1A 4K9YA 2JIVA 4RJ3A 1PMVA 3ZO2A 4C4JA 4ZZNA 2B54A 4O0WA 4AZSA 4A9SA 5HBJA 2ITUA 4D58A 4WG4A 3IS5A 4FOCA 4FKSA 4NTTA 3SLSA 5EQYA 3IDCA 3Q5ZA 3OROA 2BRNA 4AUAA 3FMJA 3RPSA 2C5VA 2VTOA 4PDOA 4FKIA 5HVYA 3W2OA 4EHZA 4CVAA 1H24A 3DDQA 3OXZA 4RX7A 3IDBA 4LGDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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