3GQLA

Crystal structure of activated receptor tyrosine kinase in complex with substrates
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
312
structure length
287
Chain Sequence
YELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLDLSMPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The selectivity of receptor tyrosine kinase signaling is controlled by a secondary SH2 domain binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Basic fibroblast growth factor receptor 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 287
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gqlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gqlA01
4O0YA 3QC4A 3R0TA 4FI1A 4Y8DA 4H05A 1KE6A 1M14A 4BDEA 4D1XA 2O2UA 4O0RA 5ANGA 3N4TA 1QPJA 3P0MA 2OBJA 5CSVA 4QQJA 4GMYA 3AT2A 3DGKA 3K2LA 4WSYA 5J95A 4PPCA 4XMOA 5JK3A 1Y8YA 1KE7A 4RRVA 1J7IA 1L8TA 2OI4X 3ZFXA 3ZH8A 4TWNA 1QL6A 1U54B 4RPVA 4WT6A 5AV0A 3H9FA 1Q62A 3CQEA 2CCHA 5ICPA 1NVRA 4FEWA 2FYSA 3MVHA 3R7VA 2WQBA 2JDOA 2DYLA 3F2NA 5F95A 4EOSA 2RFNA 4L45A 4ANQA 4FKSA 2UW4A 1CKIA 3MIYA 5EYDA 3U4UA 4QTDA 5GJGA 1Q8ZA 3CJFA 3O51A 5E8TA 4JG8A 4LGHA 4O7NA 3KGAA 5JH6A 1Q3DA 3G2FA 2J51A 3FI2A 4IB0A 4AGDA 4BF2A 3D7ZA 4ASDA 2WMVA 3F61A 3F5XA 3FUPA 5AV4A 3O71A 3QWJA 5DOSA 4FUYA 3EB0A 4OTDA 3PVGA 2REIA 4Y5QA 4OTPA 5BQ0A 4ENXA 1FBNA 2OF2A 4W4WA 4N57A 4UXQA 4R6VA 4H3QA 5M44A 3O0GA 5I9WA 3VHEA 4I21A 5J9LA 4EOMA 2H6DA 3HV6A 2C5VA 3BBWA 3TKIA 4E7WA 3ZTXA 2JDVA 2JIUA 4FODA 3SKCA 3FXWA 5EDRA 3NW7A 2V55A 3UO6A 3JXWA 4CZTA 4D2PA 3SLSA 4CT2A 2JDSA 4E6QA 1X8BA 2BFYA 3K5UA 4JQEA 3U6HA 1QPEA 3LFBA 4K33A 4IAFA 4E6AA 2LGCA 4NTTA 3EMGA 4ZMEA 4BDDA 3MYGA 5KO1A 4ZEGA 2HZNA 2R3IA 2W1EA 4HPUE 3BBTB 4IX3A 2EB3A 4ACHA 2ZV9A 3PG1A 5AMNA 4APPA 5CQWA 1YHVA 2Z2WA 4L46A 3ZYAA 2WU6A 3S1HA 2WTKC 2YCSA 5AUWA 4BCIA 4ALVA 1PXMA 4CV8A 3QZGA 4ITIA 3NLBA 1XBAA 5H9BA 4P5ZA 4AN9A 2PVNA 3GU4A 1UNLA 4AOJA 4DCAA 4MWHA 3GBZA 5AP6A 4GU9A 4RIWA 4PNIA 4D0XA 4JBVA 4RX5A 3BYVA 4I6BA 4IWDA 4ASZA 3IOPA 4QYHA 3A62A 3R7OA 4ARKA 5J5TA 4R7HA 2NRUA 3L1SA 4BY9E 1P14A 2GHGA 2QG5A 3DZOA 3LFCA 4LUDA 4A9UA 4G3GA 5HLNA 1JWHA 4YO6A 4GT5A 4M7IA 1JKKA 3LKMA 4QT1A 4U44A 2OLCA 2PPQA 2P2HA 3D94A 3RK9A 3W16A 1YWRA 1GAGA 1FVRA 3FKNA 4GUBA 4CFWA 3EKNA 3AT4A 3GUBA 4ZZNA 5IG1A 3VS6A 1MP8A 3H9RA 4FV1A 2X4FA 3R21A 1R39A 3CPBA 3FC1X 4F09A 5B2KA 2QU5A 4BDCA 2VTRA 5DT0A 4L67A 3JYAA 3NUYA 2WTCA 1SNUA 2X7GA 5EW9A 4AN2A 1UWJA 5BVFA 5GJDA 3BPRA 3KRJA 4TYEA 3ORTA 3KRRA 4IADA 4CZUA 2XNEA 5HHWA 1QPDA 2CKEA 3DQXA 5DR2A 3D83A 3OBGA 3QHRA 5C26A 2IVVA 1G8SA 3HNGA 4EH7A 3AMAA 3KRLA 3Q52A 3FXZA 5CAOA 2A27A 3BQRA 3I6UA 5EKOA 3SX9A 1IEPA 3RPSA 3DK3A 4DH3A 4UMQA 4EK4A 1G5SA 1Q41A 5EW3A 4JAJA 4UWBA 1GY3A 2DWBA 5E92A 3UMWA 1PJKA 2W99B 2I0EA 1YRPA 3VNTA 3Q4UA 1Y8GA 4K6ZA 1XKKA 3OEZA 2UZNA 4NEUA 4BFMA 5DRBA 4L01A 3PLAE 2VTIA 2I40A 2VX1A 4NM0A 1KOAA 5A4LA 3VVHA 1UNHA 2QC6A 4NW6A 5KHXA 2X2MA 3R28A 4X3FA 1I09A 4RZVA 5FEEA 4F08A 3R1YA 3NNWA 5CALA 4FT3A 3Q4CA 1JAMA 5BUJA 2IW8A 5HO6A 2WO6A 5K5XA 4QMSA 3A7FA 3PXZA 4C33A 1JSUA 5HEZA 3EL8A 4FNZA 4NJDA 4QOXA 2R64A 1FGIA 3DY7A 4OBQA 2J90A 2PE2A 3IECA 2OFUA 3PE1A 3KF4A 5CU3A 4EHEA 4UY9A 4TPTA 3UNKA 5EI2A 3I0QA 3KY2A 4Z16A 2QG7A 4I20A 4M84A 3L9PA 2VTSA 3ZM4A 3TNWA 3FMKA 4ANOA 3C4CA 3PXFA 3ZBFA 2CJMA 2I6LA 3OXIA 4LYNA 4O6EA 4U6RA 2O65A 2VTMA 5FQDC 3TJCA 5DEYA 4DYMA 4CKRA 3A7HA 4X21A 1P4FA 4Z9LA 4MXZA 4R1YA 4XG3A 2QODA 2YM6A 5CWZA 4AQCA 5EQPA 5EQEA 2BCJA 2HCKA 2PE0A 3F7WA 1A06A 2WHBA 4GU6A 2X39A 3KCKA 3V8SA 1YXSA 4IWPA 4L42A 4BCPA 2XJ1A 2QKWB 1UU3A 5A9UA 4KAOA 4MVFA 2F57A 2GS7A 4GL9A 3LLAA 2YZAA 3F5PA 3V5LA 3NRMA 2R3PA 3E3BX 5D10A 2C5NA 1YWNA 3DB8A 2A2AA 4UZHA 2XNOA 2E9UA 3ZLXA 3UIMA 2QOIA 3VUTA 3DKGA 3ZUVA 4CQEA 2BDWA 4CLJA 4LRKA 2C6LA 3ANQA 2VTPA 4XOZA 4XUFA 4J52A 2HWOA 2XNGA 5AIRA 3OWPA 4HZRA 3W2SA 3ZOSA 3NCGA 5A46A 4JLCA 5JFSA 4RX8A 5ANDA 5AUYA 2ZJWA 4G3EA 1MRVA 4GIIA 4GFOA 3HP5A 1OKWA 5DN3A 5BVDA 3RALA 2A0CX 4EONA 5DT3A 1PXLA 3R9RA 1NXKA 3PP0A 4CCBA 4R7BA 5A14A 3HX4A 1YXUA 3BGQA 4I6QA 5IA2A 3I0OA 2R3GA 4NH1A 4O2ZA 4EBWA 1G8AA 3F3ZA 4BIDA 5LMBA 5AWMA 3NMUF 2PZPA 2BRGA 2ZM4A 4J99A 3O50A 4LRMA 5DE2A 5L6WL 3RK7A 2HYYA 1FPUA 3P08A 3NDMA 5JGBA 4R78A 3DQWA 3FC2A 3KRXA 4NM7A 5FTGA 4EOPA 2GS6A 4EHVA 4FSNA 4LV5A 1PHKA 3WYXA 3DJ5A 1PXKA 3V3VA 4G3CA 4RIXB 5JN2A 3E64A 3PRIA 3RHXA 4PPBA 4U3YA 1OPKA 2XNBA 3RHKA 3N9XA 3NGAA 1HOWA 1YDSE 3BU6A 4UWYA 2BKKA 4JG6A 3A4PA 3R8PA 4A4XA 3RJCA 2UZWE 4EWHA 3GU8A 5DMZA 1XO2B 1M7QA 3GOKA 5BNJA 2G2HA 4PDYA 5H8BA 2IZTA 2RF9A 3E7VA 5HE2A 5CI7A 2Q0BA 3QZHA 3FZRA 4DG3E 2BDJA 4U9AA 3QWKA 2EU9A 5IQIA 3E8NA 3A2CA 4N6ZA 1GJOA 4IB3A 3H30A 3W1FA 1YI4A 4CTBA 3SXFA 3KU2A 4KUJA 2F7EE 3BLHA 3C4EA 3CE3A 3NEWA 1APME 4XHKB 5H2UA 4CFXA 5I3RA 5I9ZA 3R8ZA 3HA6A 1W98A 3OCGA 4BCMA 4WNKA 2HENA 4GW8A 3LMHA 3Q5IA 5CU4A 1BL6A 2BIKB 3N4UA 2RIOA 2X9FA 2IZRA 2ZV7A 4BTKA 5AP3A 4OTIA 3L9LA 1B6CB 3DBDA 3NUXA 4QP6A 5IKWA 2OXYA 3ZC5A 4BDJA 2VRXA 2XKCA 4E8AA 3EQBA 3K3IA 2VU3A 3PLSA 4F7LA 4KB8A 4FZFB 3BHUA 3KA0A 3Q5ZA 4OAVB 3EYHA 2QKRA 4FIIA 2PTKA 1IAJA 3V5TA 3EFWA 5C27A 1JSTA 2J5EA 3MFTA 3COKA 3C9WA 4W8DA 4GIHA 4X0MA 1YI6A 2ZM1A 3SRVA 3T9TA 4C0TA 4DFYA 2PU8A 4JDHA 5C8KA 3PIYA 5IQHA 1WFCA 2ONLA 3PXKA 3DNEA 4K18A 4NCTC 5C01A 4ZP5A 5HOAA 3UP2A 4E6DA 2F2CB 3UZTA 5HO7A 4KSPA 4DAWA 2XH5A 3EFKA 2VO6A 4Q9ZA 2CHLA 3IKAA 5FP5A 4EUTA 3WE8A 4OBPA 3QKKA 3TKHA 3QUDA 1WAKA 2XK3A 5CXHA 1SMHA 4FOBA 4KKHA 3ZO4A 2JFLA 5IF1A 4IXPA 3R9HA 2EXCX 2YFXA 3C7QA 4RVKA 3FBVA 3R7IA 2XM9A 2QHNA 4JG7A 3DB6A 5CENA 5BPYA 4F4PA 4O0WA 3R6XA 4WO5A 2WEIA 1YXTA 3CY2A 3OCTA 4U81A 2WQMA 2UZLA 2C3JA 2KTYA 1VYZA 3KFAA 5E90A 4K8AA 4HVHA 4PL3A 2YZLA 4ACCA 4FMQA 1XHAA 5M53A 1BKXA 3FZTA 3Q9YA 5GZ9A 2QI8A 4JAIA 2F2UA 3FY2A 3QTQA 4NW5A 5CSHA 1Y57A 2XYNA 1Q8YA 1ZYDA 2J7TA 4OT6A 3MV5A 2H8HA 4FSTA 2CGXA 4F70A 4C36A 3FHIA 4AWIA 2RKUA 2CPKE 2IVTA 5M4CA 2RFSA 3CXWA 3OCBA 3R04A 3AD5A 4R7IA 4D2TA 1GIJA 2WZJA 4C02A 2RGPA 3AC4A 3GNIB 4TT7A 2H96A 4A9RA 4OTWA 5BVOA 4B8MA 5IDNA 4MNFA 3DLSA 3NW5A 4IAIA 3BCEA 2GPHA 1BL7A 1T45A 2G1TA 2JKQA 3LFDA 4N70A 3UC4A 1YXVA 4I92A 2WQNA 4N6YA 4ZSEA 5CASA 5KX8A 4DTKA 3AOXA 5C8NA 5HCYA 2JKKA 2W06A 2GS2A 2BTRA 3HECA 4GT3A 4YU2A 2BIYA 2ITTA 4UMPA 3VUDA 4E5BA 3DBQA 3W55A 2F9GA 4FEVA 3CS9A 3NUNA 3O8PA 5E91A 5AP4A 2Y7JA 4LGDA 5HTBA 3NS9A 4FZ6A 1BMKA 3AC3A 4DFLA 5D9HA 1RDQE 4IQ6A 3RGFA 4E4MA 4MNEB 1TQPA 3QC9A 2XM8A 4D2VA 5L8KA 4R5YA 4M69A 5M4UA 2OG8A 2XCHA 2W1ZA 2F4JA 1U5QA 3I79A 3JS2A 2OZAA 4KSQA 1BI8A 1STCE 5ANOA 5FGKA 5HKMA 3RNIA 4BDAA 2C1AA 2XK7A 4P5QA 2C6TA 5K3YA 4YZNA 5AUUA 3P7BA 2X6EA 2O0UA 3U8WA 2VZ6A 3ZEWA 1L3RE 2VAGA 4GYGA 2RFEA 4DFXE 1UWHA 3UYSA 4HVGA 3R9DA 4CRSA 1OB3A 4XOYA 2R5TA 3OT8A 2OK1A 1OL6A 3QA0A 4GVJA 4QMXA 4GK2A 4GSBA 2GHMA 2CLQA 3R30A 3TZ8A 5L4QA 4O84A 4G16A 5IUIA 4NKAA 5JSMA 1P4OA 4PPAA 1Q8TA 5FXRA 4D0WA 4HGLA 2GNHA 1OIRA 4FTMA 4ZOGA 4C37A 5J1WA 4O27B 3TACA 4O21A 4QPSA 1Q4LA 2BILB 4U97A 5TO8A 1S9IA 3EN4A 3DDQA 3PA5A 2B53A 2GNGA 1YDRE 5HBEA 3SXRA 3ZM9A 3O8UA 5LVPA 4BCQA 4IEBA 4FKIA 3IW5A 1M2RA 3MFRA 5E1EA 4AW5A 5A4TA 4EEVA 5DGZA 1OBGA 2WB8A 4MWIA 3P86A 5IMEA 4EOLA 4RT7A 3GXLA 2WIHA 3HV4A 3RMFA 4ZZOA 3QGYA 3LVPA 4ZJIA 5AA9A 2W4KA 1ZMWA 4YPSA 2BPMA 4B99A 4O86A 5IQEA 1AD5A 4FIFA 5IDPA 3CC6A 1ZMVA 3FMNA 3UJGA 5E1SA 4YZCA 5C4KA 3DBCA 3V5JA 4CZYB 4N4SA 5JT2A 1B39A 4B7TA 3QRIA 1EH4A 4G6OA 2VTLA 3DLZA 4ZAUA 5DBXA 3WF6A 3MY0A 2WTKB 3PVBA 3IK3A 3V6RA 2E9NA 3HMIA 2JFMA 3MBLA 3ZMMA 1OVEA 5K4JA 4ORKA 1H8FA 2XEYA 3BGPA 3GQIA 3QYWA 4EKKA 1K9AA 1ZY5A 4AF3A 1IAHA 5H8EA 3NAXA 3RTPA 4I5MA 5K0XA 3QTRA 4C58A 3ZCLA 3QXOA 4L6QA 2V62A 3PA3A 3RVGA 3FLZA 2YIXA 4GT4A 4HCVA 4IX5A 4Q2AA 2J6MA 4O0VA 4YHFA 4QP7A 5HBHA 3DBEA 1OKYA 4XG4A 5DLSA 4I0TA 4UMUA 3UBDA 5DI1A 5CF4A 4B4LA 3DFAA 4K77A 3VRZA 4ENYA 3TG1A 1Q8UA 3H0ZA 4ZS0A 3WE4A 1XQZA 3POZA 4CG9A 4MXXA 4C34A 2RSVA 1K3AA 3GENA 4W8EA 4IZYA 1FMKA 4Y85A 5CVGA 2BDFA 5BYZA 3VUIA 4YZMA 4BBEA 4JJRA 4FT7A 3RKBA 3GFEA 4O0TA 3VBYA 3FE3A 2UW3A 5FXSA 3HUCA 5IZFA 4F9CA 3WARA 2JLDA 2XK9A 5JQ5A 1F5QA 1V0BA 1YHWA 4WD5A 3WZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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