3GQLA

Crystal structure of activated receptor tyrosine kinase in complex with substrates
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
312
structure length
287
Chain Sequence
YELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLDLSMPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The selectivity of receptor tyrosine kinase signaling is controlled by a secondary SH2 domain binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Basic fibroblast growth factor receptor 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 287
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gqlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gqlA01
2GHLA 3PXFA 4E20A 2GQGA 1FINA 2PVJA 2V62A 4OTPA 3TDWA 4BKZA 2Y8OA 2YITA 4ITJA 4R3RA 4RC2A 2IZUA 4Z16A 4KKGA 4RJ6A 4FYNA 3PDTA 3PIXA 2QODA 4ORKA 3BHHA 5E8WA 3HNGA 2CMWA 4AN9A 4C02A 3IPHA 1BL7A 3HUBA 4EC8A 4CKJA 5IQGA 3TI1A 3PRFA 3H3CA 5ANIA 3UGCA 3ZZEA 3CC6A 1ERKA 4EHGA 4TWPA 3MVLA 4D9UA 5HBHA 3VVHA 1VEBA 3FHIA 5FEDA 2B9IA 4FKUA 5BUEA 4KKHA 5IQAA 5AR3A 2W9FB 5KHWA 3C5IA 3G15A 1E1VA 3KQ7A 2XEZA 4IM2A 1I44A 5J95A 4CRLA 3AD5A 5DOSA 3F5GA 3FV8A 2ZV8A 3UVQA 4K9YA 4CGAA 4G6NA 2RFEA 2WZJA 4BTMA 2WTCA 4GIIA 2C6LA 2X2LA 3OWKA 5IUHA 1G8SA 3HAMA 5B0XA 1Q8WA 2QOOA 3GFWA 5IU2A 3NUSA 2PUNA 3UP2A 3FC1X 1H00A 4JX3A 3QL8A 5HEZA 3U4WA 4RWKA 5E91A 4CLIA 1U4DA 2PMOX 3FDNA 5H2UA 5HOAA 5KE0A 4JIAA 3ZRMA 5A6NA 3RI1A 3OUNB 4NW6A 1ZYJA 3D94A 3QHWA 4O22A 5KMJA 3A99A 1WVXA 2VO7A 4CKRA 2XYNA 4TYEA 1OI9A 3REPA 3KULA 4ERKA 4JXFA 4AP7A 3QXOA 3AQVA 5D12A 4YSMA 3IDCA 4XH6A 4GT3A 4GEOA 5D11A 4P4CA 1SZMA 2BCJA 2NPQA 3NUYA 4TYJA 3K3JA 4HYIA 5LVMA 2GCDA 3QWKA 3DBQA 1YQJA 3K3IA 1OPKA 1JSUA 3L1SA 3E5AA 3NUXA 5HNBA 1OIQA 1XWSA 4BI2A 4BCQA 3CTHA 2FO0A 5TR6A 2VAGA 4FV6A 4F0GA 3R7VA 2PWLA 3O8PA 2YIWA 4FGBA 1SMHA 1OIRA 3EN7A 5C03A 5GHVA 3CD8A 5CXHA 5KCVA 4DH3A 3ZBXA 4XV1A 4AW1A 2OF4A 4EHEA 3NAYA 4F9WA 4DH8A 4H3QA 5FEEA 2JAVA 1YI6A 5K9IA 2NP8A 3NW7A 4IWPA 2YM8A 5A4EA 2BROA 4X2FA 5J9LA 4FSQA 3A62A 3Q9ZA 5IQBA 2C69A 4ZJVA 4RX5A 4O7SA 1R0EA 3DB6A 2ZM1A 3Q9XA 2YIYA 5CWZA 4UWCA 3IDPA 4FG9A 3EOCA 5A6OA 3LFEA 2ZB1A 1UWJA 1OL5A 2QOLA 3PXQA 4MKCA 3BGZA 4NEUA 3VUMA 3TIYA 4AGUA 2PVFA 2V5QA 3QD4A 3SD0A 3O71A 4EHVA 1W0XC 3ITZA 4FL2A 2I7QA 4YC3A 1MRVA 1XBAA 3BELA 2QKWB 4BDKA 3PJCA 1OL1A 1Y6AA 5LVLA 3MTLA 3VNTA 3SA0A 3MH1A 3KK8A 5IH4A 1R78A 1LR4A 3R22A 4CD0A 4WNPA 4FKTA 5E8UA 3OXIA 1UV5A 4FA2A 4S33A 3WE8A 4ASDA 2H9VA 5IQEA 3KMMA 3IW6A 5FP5A 3HUCA 3QUEA 1JNKA 2WPAA 4NZWB 1VYWA 2O3PA 2OG8A 1RE8A 3AMAA 3DBEA 3LZBA 3G90X 4XG9A 3TV6A 3R63A 2XIXA 3LAUA 4FVQA 4PTGA 1WAKA 3UMWA 4ACDA 5HKMA 2C5VA 4EOPA 2GMXA 2WD1A 3DA6A 2VTTA 4O21A 4W4WA 2IZSA 3U87A 3OS3A 4EZ3A 4F9CA 1M2PA 1YW2A 4E4MA 1H0WA 5LVNA 2G1TA 4YO6A 3PRIA 5L6PA 5BVNA 2QLQA 3U6HA 4E5AX 4RFMA 5CZIA 5LVOA 1OL2A 4EUTA 3COKA 5TT7A 5AFVA 4MVFA 3GCPA 3VO3A 5EKNA 4B4LA 4E6QA 5HBJA 3HV6A 4EJ7A 3QTWA 4CT1A 2CGWA 1F5QA 3OFMA 3WE4A 2XEYA 5LWNA 4R1VA 4MXXA 4J8MA 4IIRA 3VS0A 2DQ7X 4MNEA 1KV2A 1NXKA 3LHJA 2NRYA 2V55A 3GVUA 3ZONA 5CF8A 4NW5A 3MH0A 5HORA 2VTSA 2VTAA 2XCHA 2YWPA 3R83A 1ND4A 3KF4A 3R0TA 3R1QA 3MPTA 2JIVA 4JQEA 3R28A 3ROYA 5E92A 2HZIA 3SRVA 4QPMA 2FGIA 3CGFA 3V04A 5C8MA 3FBVA 3AGMA 4BRXA 3FUPA 3LM0A 4JNWA 4I0SA 4PPAA 3IQ7A 4XP3A 5HBEA 2ETKA 3AC8A 3V5QA 2FSTX 5AEPA 4A9TA 2Y9QA 2RG5A 4NKSA 4F08A 5E8XA 1OECA 4ITIA 4IACA 3NYVA 4HJOA 2GQRA 3OW3A 4PUZA 5HIDA 3QU0A 4R78A 3JYAA 3ZM4A 4OR5A 3EQPA 4R8QA 5IQIA 4Z55A 3KK9A 2HY81 4ANLA 4FEXA 3H9RA 2WAJA 4QNYA 4LV5A 1U5QA 3FMJA 4E93A 4XOZA 5HU9A 3QAME 4UBAA 2BKKA 3UQCA 1Q3DA 1A48A 4XMOA 3KCFA 4CFMA 3NNVA 4QTAA 1J1CA 2J5EA 2YLFA 4RMZA 3F61A 3FI2A 4OAUC 4EUUA 4EH3A 4EH7A 5FBNC 3EH9A 2C0OA 2PUPA 3KL8A 1Q62A 3MIYA 4NM5A 3DAKA 3W2CA 2WO6A 2OIDA 4KKEA 4BIBA 2JKMA 2UZDA 2FSMX 4R7BA 3NGAA 3FSFA 3GT8A 4GUBA 3WZEA 5JFSA 3FXXA 2QG7A 3O7LB 3UQGA 1JKTA 1KOAA 4BGHA 5AUUA 4IZ5A 2YAAA 4IB3A 2QU6A 3QZGA 4ZZMA 2QURA 1XBBA 4ENXA 1PRYA 4I6HA 2XNOA 3KVXA 4FNZA 5E8SA 4RX9A 4TYIA 3UMXA 4EK3A 4F0IA 1ZZ2A 3OWPA 2WMWA 2IVSA 4QOXA 2IW6A 4DEBA 1W83A 4OAVB 2VTMA 5CNNA 5ANGA 2Y6MA 4L3PA 4UYAA 2HXQA 4L8MA 4PV0A 2V0DA 3E88A 4UYNA 5FUTA 4ZXTA 3NS9A 3LJ0A 2XF0A 4HGEA 3EN4A 5BUJA 3QD2B 4JS8A 2J0MB 2EB2A 1FVVA 2WKMA 2BTRA 3PY1A 4FODA 4V0GB 2J2IB 4F7JA 1JBPE 4Y73A 3Q4UA 5M4CA 3ETAA 4WKQA 3ZM9A 3CPCA 3DB8A 3ZLYA 2CGXA 3DOGA 3LM5A 3SXSA 2GSFA 3MFRA 3ATTA 1J7IA 2JGZA 4FIHA 4X3JA 4IM3A 2XIYA 3MVMA 3RINA 1URCA 3A8XA 4JRVA 4D5HA 4EKKA 3ERKA 4BBFA 4HYHA 4BC6A 4APCA 2VU3A 2QD9A 4WNOA 3DQWA 2C6OA 3C1XA 4BCJA 2X2MA 3ZTXA 4FC0A 3P7BA 5AX9A 4E7WA 2XM8A 3OTVA 3VRZA 2JD5A 5DFPA 4RA5A 4H1JA 3BBWA 4UV0A 1FMKA 2O0UA 3PLSA 4RQVA 3D7TB 4YC8A 4F9BA 1ATPE 3QLFA 5AUWA 4QMZA 4DEAA 2F49A 4E4LA 4K77A 2ESMA 3JS2A 4UMUA 5CVFA 4C3PA 4IX6A 4U97A 4Q2AA 2HOGA 3A4PA 3HEGA 3BGPA 4QYYA 2YZLA 3OF0A 1YOLA 4QMWA 4PMPA 1TQPA 5EM8A 4V04A 3L9PA 4H36A 3EYGA 4F64A 4ZY4A 1JPAA 4JDIA 3RBWA 3R9NA 3G2FA 3RJCA 3QQHA 2QKRA 3VBQA 4U3YA 3O8TA 1MRYA 5JZNA 5AV3A 3CQWA 3D5WA 4D4VA 5CAOA 2LGCA 3R8VA 2PVMA 1KUTA 4RIXB 5G6VA 5L6WL 3QQGA 3FMLA 2OO8X 2UV2A 4R5SA 4CFUA 3EN6A 4KBCA 2Z7LA 2UZVA 3EZVA 4HNFA 2ITNA 3R02A 4QP2A 4K11A 4QT1A 5ACBC 4HCTA 3ZRLA 5EH0A 2X8IA 3NRMA 4CRSA 4FT9A 5A4TA 1MRUA 2B9FA 4USFA 5J9ZA 2EVAA 4FZDB 3C7QA 5CZHA 4EZ7A 3UNKA 3PXZA 4WBOA 1LEZA 4ASEA 3D5XA 4YJNA 2ITZA 3DV3A 2B7AA 4WBBB 3TDVA 1U46A 3JR1A 4FGRA 3SXFA 3OCSA 3EKKA 4IC7A 4RFZA 4S2ZA 5E8VA 3O51A 1O6KA 3BWJA 3C4FA 3MJ1A 3QRTA 4H58A 2WNTA 4O7YA 4EJNA 5FDXA 4XG2A 2Y7JA 2HWOA 4RVMA 1ZYCA 4AA4A 4YSJA 4A9YA 2HZ0A 3GC7A 2IN6A 2QQ7A 3OEFX 3OW4A 3EWHA 3VUKA 2BAQA 2VV9A 3W2PA 4BKYA 5JT2A 4KIKA 2IVTA 2B52A 4XG7A 4WSQA 3E7OA 3G33A 4C37A 5CEPA 5GJDA 3AXWA 4QYGA 3ZBFA 3LCKA 4TKSA 3PSDA 5AR2A 4HZRA 4TN6A 3R71A 2WMBA 3P4KA 5IA5A 1YVJA 3RVGA 4QP8A 2UUEA 4FTTA 2E9PA 3HRCA 3KRXA 1Z9XA 4BDBA 1H1WA 3FYJX 3L9NA 3PVWA 4EORA 5E7RA 3SDJA 5DEYA 4RIYB 4JG6A 2I6LA 4EOOA 2VGOA 5DGZA 5IPJA 3M11A 3MW1A 3DS6A 4OBPA 4QMYA 4EI4A 1GZOA 3BHUA 4MWHA 3LFDA 5HIBA 2NRUA 5EKOA 4EK4A 1Q8ZA 1CKJA 2W1EA 3MIAA 4YZMA 1XJDA 3POZA 3TTJA 4X2NA 2UZNA 3QKKA 3BU6A 4S32A 3BHYA 4U79A 1ZY5A 3HDNA 3ZEPA 3U54A 5L2SA 3KXXA 4GIHA 3T3UA 3F3TA 2VWIA 4RQKA 1JWHA 3OXZA 2R64A 3GI3A 5LOHA 2J7TA 3FLZA 1H1SA 4KBAA 3FHRA 3FJQE 3P9JA 4FE2A 5B2KA 2BILB 3BLHA 4QMQA 3WARA 4R6VA 3EQGA 4LV8A 5DN3A 5AP5A 5CU0A 2JBPA 3JY0A 4CFNA 1QCFA 4NUSA 1MP8A 4JQ8A 3BRBA 3G6HA 2WMXA 4WD5A 3OBJA 3P7CA 2X9FA 4DITA 3R8UA 2IJMA 4RX8A 4AUAA 4G31A 4AZWA 4AS0A 4N70A 4F9AA 2BDWA 2GNFA 3DBFA 3PYYA 4WUAA 2EXEA 4BCGA 5C4KA 4DLJA 3PA5A 2X8DA 3MFTA 4XRLA 2OF2A 3AMBA 2VWWA 1Z57A 4Q5HA 4Q9ZA 4OTHA 3WBLA 4IAAA 3FPMA 3ZDIA 4O6LA 4CZTA 1H27A 4PDSA 3VUIA 2BAJA 3OMVA 1OKVA 1JKLA 1U54B 1PF8A 2JITA 3FXWA 1L3RE 3OTUA 2O63A 3OZ6A 4GFGA 4IX5A 1RDQE 3UOKA 4ZOGA 4S30A 3TXOA 3C13A 3W33A 4O7ZA 5C8NA 1WBSA 1NVRA 4LRKA 4AGWA 4QMLA 1ZYLA 2P33A 2E9UA 3KCKA 3R7YA 2XNPA 4PY1A 4EOIA 3MI9A 1ZMVA 2OH4A 4FKVA 5DBXA 4UALA 4H3BA 4ZTSA 5FG8A 3DDPA 4UWBA 4CG8A 3DDQA 3OUKA 3UOJA 5KO1A 4DGMA 3DBDA 5JKGA 2IWIA 2PZPA 3PXRA 4X7QA 4RT7A 5AA8A 4RIWB 3PXYA 1DAYA 5M44A 4AW5A 3ANQA 3WI6A 5EI2A 3GBZA 4ALVA 4J95A 4M7IA 4O27B 1G3NA 3ACKA 1O6LA 3KMUA 2OZAB 1GZKA 1OKZA 4NIFB 3N4VA 4IWOA 4QMNA 4RFYA 4FV1A 2F57A 4GU6A 3I7CA 4J97A 2OJ9A 4FICA 5EFQA 1KSWA 3GUBA 4G5JA 4FV4A 4WNKA 3C0HA 3QCQA 5KBRA 4TRLA 3A2CA 3AC4A 3MBLA 5TE0A 5CENA 3MA3A 4C34A 4AN2A 3QX2A 3I0OA 3S0OA 3U51A 3JXWA 1F0QA 1P4FA 2XBAA 2YZAA 4PL5A 4XP2A 3LQ3A 4G6OA 2YEXA 5LMBA 4A9SA 1LP4A 4E6DA 4U40A 5JQ8A 5GIOE 3BQRA 5AAFA 4DFXE 2GS2A 4YURA 1QL6A 5CQUA 1KE8A 1QMZA 3H0YA 2Z7QA 5JRQA 4FT5A 3LCSA 5IKWA 4YTFA 2BFXA 4W4XA 4I20A 4O81A 4L01A 3EQIA 3ZC5A 3FQHA 5LMKC 2PY3A 3I1AA 4JX7A 4ZZOA 3MY0A 2WOUA 4DGNA 4ZTNA 1H8FA 3RK7A 5L2QA 3LFAA 4IAKA 4UMTA 3TKUA 4AAAA 4C57A 1M7QA 3GNIB 1PXLA 3QTSA 4DBNA 4UXLA 3GU6A 2XZSA 4FV5A 3E87A 1QPEA 3NSZA 4FTCA 4EOSA 3LXLA 3AGLA 5GIPE 3QTZA 3Q6WA 3R9OA 3VRYA 2W5HA 3FY0A 3VW6A 3W18A 1F3MC 4LMNA 5L8KA 2R3QA 1WFCA 4I3ZA 4E5WA 2BR1A 1FPUA 3GC0A 4I41A 5DIAA 2HW7A 5H8EA 4E1ZA 3BI6A 1YXTA 3MH2A 3R7GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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