3GT8A

Crystal structure of the inactive egfr kinase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
315
structure length
300
Chain Sequence
NQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMRKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Mechanism for activation of the EGF receptor catalytic domain by the juxtamembrane segment.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 300
sequence length 315
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gt8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gt8A01
4FTMA 1OI9A 3F3TA 4YJSA 3PUPA 4CXAA 2W1ZA 3MTFA 2XJ0A 3S4QA 1KE7A 3DFCB 2W4OA 3O8UA 5E92A 1KE9A 5GJDA 3V51A 5C03A 4O1PA 4L43A 5TR6A 4PP7A 4MD8E 5C4LA 4D2RA 4LGDA 4J96A 4BBFA 3F9NA 4BI0A 3II5A 3M11A 1BMKA 3PG1A 4QOXA 4AT4A 3HRBA 3NIZA 5B2LA 4ENYA 4IWDA 1ZRZA 2FSOX 4FKTA 3PJCA 4ASDA 4F7JA 3BQRA 3L8XA 4RVTA 2C5OA 4LGGA 3EFKA 3DBQA 3A7IA 3F3WA 3IDPA 4BR3A 2QHMA 3IGOA 3MVJA 2OIBA 3H9FA 2YAKA 1GZOA 2YLEA 2YM3A 1M52A 4FKUA 4FT9A 3PP0A 4C34A 2V55A 2VWXA 5A6NA 4CG8A 4IZYA 3UYSA 4EZ3A 3BHVA 4LI5A 4RZWA 3RAWA 5BYYA 4H1MA 4MTAA 3VHKA 4UXQA 3GCUA 3QQUA 4NFMA 5EYCA 3DOGA 5KMNA 3JXWA 4IC8A 5F1ZA 5L6WL 4D9UA 3HRFA 3COHA 4JS8A 3VVHA 5BVOA 4ZJVA 4XG4A 3I5ZA 4JL9A 4KRCA 3RZFA 4E3CA 1WVWA 2UZLA 4DAWA 1XBAA 3G0EA 4RIXA 4TYGA 3QTWA 4G9CA 1XH9A 2Q0NA 4C4HA 2HXQA 3ZH8A 4FEUA 3HMNA 5FBNC 4FGRA 4OTIA 1FBNA 4FG7A 3ZDIA 4QP7A 3D0EA 4GFOA 3OEZA 2XH5A 4EHVA 4Y72A 3P7AA 3JVRA 2OICA 5GJFA 4E4LA 4Z7HA 2VX3A 4RX7A 3TG1A 4XG7A 5JGDA 4GU6A 1BX6A 1LR4A 2VO0A 3D83A 3IG7A 3LCTA 3NLBA 2C0OA 4K1BA 3ITZA 4YO4A 4BDIA 3TM0A 4RA5A 3UVRA 3FLSA 4NIFA 5K5XA 2VWWA 4IX6A 5IQBA 3NNUA 4XUFA 4D0WA 4IANA 2LGCA 5HBJA 4XP0A 1FMOE 1HOWA 2WELA 4QMMA 1PXIA 3MH1A 4CG9A 2ZB0A 4ALUA 4RBLA 5E1SA 5FM2A 2HW6A 4YLLA 1S9JA 4BZDA 3IK3A 4EOJA 5J1WA 3Q5IA 4ZSEA 3VW6A 5M08A 2WIPA 4L3PA 4BCKA 4WUNA 4BGQA 3EFWA 5BVEA 4XP3A 1JVPP 1UWHA 3NNVA 3SXRA 4MNEA 2CNQA 2HY0A 2RIOA 3K5UA 3BGZA 3ACJA 2I0VA 4PWNA 1UNLA 4PMTA 4D0XA 3V8SA 4RX5A 3P9JA 1VYWA 5EOLA 1OVEA 5C27A 2VTNA 5D41A 3R9OA 3EQDA 2OIQA 4FODA 4WRGA 3CGOA 2XCHA 5IUGA 1UA2A 3NWWA 3FDNA 3REPA 1A06A 3V8WA 2WEIA 4QPSA 2QD9A 3FLYA 4ANQA 3WYYA 4QQTA 4D2PA 3E8EA 5E8TA 3PIXA 4BHNA 3BE2A 3OWPA 3R7OA 4EEVA 2XEYA 3ZRMA 4K6ZA 1ND4A 5KMIA 3LIJA 3AD4A 1Z57A 5AP3A 3UIUA 2C3LA 5KNJA 2FUMA 2X2MA 4L7FA 1F3MC 1YOJA 2PHKA 4EC9A 2GNJA 3E8DA 5DT0A 2VTSA 2CCHA 4CFXA 3W8QA 4KBCA 3QXOA 4QNYA 4ZTNA 5M07A 4IZ7A 1GZ8A 3BZ3A 4KIPA 4BCQA 4Z16A 3Q60A 2WQNA 3VF9A 3ZXTA 2C0IA 3QLFA 5CZIA 2CJMA 2X4FA 2Z7RA 3PFQA 4I5MA 4IAIA 5EKOA 3DK6A 3M2WA 4FVQA 4EK8A 2UV2A 3EIDA 3KCFA 4USFA 5AR8A 2WQOA 4FKWA 4TYEA 5FXQA 3BV2A 3FV8A 2RGPA 3QCYA 4XBRA 3VUHA 3QKMA 2W1IA 2ONLC 4RIXB 3GCPA 4FV5A 4GW8A 3CTJA 2XKCA 2OJGA 4ASZA 4UV0A 4I6FA 2IVTA 3OD6X 2DWBA 3H10A 3H4JA 5AP2A 2VTLA 3GOKA 4PMMA 4F6SA 4DGNA 1REKA 3FC1X 3MESA 4DFBA 4AP7A 3TKHA 2JDTA 5C8NA 3ZO3A 4BCIA 2R64A 2JGZA 3G15A 1W8CA 3NUPA 4OLIA 2PU8A 5HX6A 2Y9QA 4RWIA 4GFGA 4TXCA 3VBYA 2VV9A 3ZHPC 3DV3A 2FSLX 2WNTA 5LCKA 5M56A 3PXFA 4YPDA 2WMVA 2J5EA 5AJQA 4Y85A 2UW7A 1PMVA 2VO3A 4I0RA 2J2IB 5H2UA 5I5ZA 1QPCA 3KKVA 4QMQA 4ANOA 3PXYA 5CSPA 3R7UA 1SNXA 3BYUA 3V8TA 3HUCA 1H1QA 4G2FA 4JJRA 5AUZA 4BI1A 3NZ0A 3ELJA 3P78A 3QF9A 4FTAA 3VO3A 5KKRB 3C4EA 2JLDA 3GENA 4MNEB 1XH4A 4IX4A 3UJGA 2RFDA 5BQ0A 5BUJA 1DAWA 3CY3A 1PMUA 2QOQA 3N4TA 2ZAZA 2WGJA 2WFYA 4ZOGA 2DUVA 5KO1A 1PXMA 2ETMA 2F2CB 4UZHA 5AADA 5E8UA 4FKIA 1A9UA 3BU6A 2AC5A 4EH8A 3T3VA 2OK1A 1UV5A 2X2LA 4FOBA 4FK3A 2JDRA 5M51A 5CEQA 3OROA 4RC2A 4HVDA 4IXPA 2HYYA 4L46A 5J5SA 3ORLA 3OTVA 3PIYA 2ITQA 2XRWA 4EH5A 5D10A 3SOCA 2I0YA 3EN7A 3F5GA 3IECA 4ACCA 3PG3A 3UYTA 4BGHA 5TO8A 4QTEA 4E6DA 1JLUE 3SKCA 4FA2A 4MKCA 1SMHA 4GYGA 5A54A 3S1HA 3OCBA 4MF0A 1J7UA 2R3MA 2QLQA 3PPJA 4QMXA 3DAEA 4EOPA 3DAKA 4FSMA 5KZIA 4D4VA 4YNOA 1EH4A 3DNDA 4RLKA 3HV6A 4LM5A 4NTSA 2DQ7X 4YHFA 5FP5A 4JBQA 4DTBA 1PYEA 2XM9A 2CLQA 1B38A 4A9UA 5JEBA 2BKZA 3A62A 4EQCA 4HVGA 3Q3BA 4LUEA 2XS0A 3HECA 4U81A 4IQ6A 1Q24A 2CGXA 1PXPA 3LFQA 1H8FA 2C69A 2GU8A 3IS5A 5L4QA 3U6HA 2PVHA 3LFBA 3FE3A 5C8MA 3SOAA 3QUDA 5BYZA 4ZAUA 3UBDA 2XK3A 4FSZA 1P4OA 2WMAA 3VAPA 1GZNA 3BBWA 3EN4A 5DT4A 3HYHA 4QP4A 1LP4A 3EQFA 3RNYA 2IVSA 3OCSA 3GP0A 4C8BA 3DJ5A 4UWYA 2XIYA 5IDPA 3ZSGA 1CDKA 3HGKA 4GRBA 3A7FA 3M1SA 3E7VA 4J95A 3BYVA 5LARA 4H39A 4O84A 2Q0BA 2XEZA 1OPLA 4QMWA 5EDQA 4MF1A 4FTJA 4F0FA 1OIRA 4FV4A 4BWXA 3Q4UA 5E91A 5J95A 4F63A 4FNWA 4DINA 4O7ZA 4GVJA 5IZFA 5FM3A 3WZKA 2OF2A 2C6LA 3QCXA 5AWMA 2XK9A 3GUBA 4R1VA 4DH8A 2RSVA 2YCRA 5DR9A 3C0GA 4GS6A 2GFSA 3SQQA 4LRKA 4YZMA 2BHEA 4ZJIA 4RZVA 4F1MA 1OL2A 3HEGA 4O22A 3PVWA 3DTCA 4PF4A 3Q52A 2UW4A 3FZSA 3WBLA 3FHIA 3OS3A 3LPBA 3ZTXA 3VC4A 3K3IA 4YSJA 3Q9ZA 4DFNA 4H05A 3CR0A 1OKZA 1G5SA 4XV9A 2CCIA 2A1AB 1APME 3VUGA 5HX8A 2J5FA 4OTPA 4EOLA 4ZSAA 2OJIA 5C01A 1UWJA 1WZYA 2XIRA 3BV3A 4QMLA 4UBAA 1KOBA 2UUEA 4AUAA 2WMWA 3PYYA 4O0RA 3LHJA 4L3LA 2JBOA 4RX9A 4FEWA 1IA9A 4WIHA 1MP8A 1YKRA 4I5CA 4MHAA 4HOKA 3VHEA 3N9XA 5AP0A 3CS9A 2E9NA 5AR7A 4M67A 1JKSA 3AQVA 4PMSA 4BCFA 3B2WA 2ZVAA 3JUHA 2IZUA 4YZCA 5K0XA 4YZBA 5L2IA 4ZTMA 4WG5A 3DBDA 4LOQA 3VQUA 3KREA 3Q32A 1OL5A 4UXLA 2XNGA 4H3PA 4YU2A 5FUTA 4F6UA 2C5YA 4XS2A 4D4YA 4YTIA 3NUYA 5IMEA 4PL4A 3OY1A 3R8VA 3LQ3A 5CT0A 4WG4A 3G33A 3LOKA 4YJRA 4F08A 5E1EA 2YITA 3D5VA 4RJ6A 2WOUA 3QTUA 3GU5A 4FV9A 1SVHA 4P4CA 3R8ZA 3GVUA 1NVSA 4XCUA 2VZ6A 4BKZA 5J5TA 2HIWA 2VU3A 2X8IA 3EQCA 3QTQA 4B8LA 4XYFA 2BPMA 1VR2A 4E7WA 1RJBA 2RF9A 2X7OA 3BYMA 5HTIA 5H9BA 5CXZA 3E5AA 4GT3A 4XEYA 1J7LA 5HBHA 4BBMA 4WO5A 4L00A 1Q61A 4C3RA 4L8MA 4KIKB 5HD7A 3FI4A 3PVBA 3ZFXA 3TCPA 4YBJA 4OTWA 3R1NA 2PVKA 4XG9A 2C0TA 5JRSA 3R7IA 4D4RA 4PNKA 4JAJA 2W9ZB 4QYGA 5DR6A 5CZHA 5HNBA 4AW1A 3O71A 5BNJA 3TTJA 2UW3A 5IF1A 3G5DA 2OH4A 3G6HA 3R7GA 3V5PA 3BGPA 2J0JA 3RGFA 2YIRA 4C59A 3G9NA 3A8XA 3HMPA 5EDPA 3JVSA 3UOLA 3TUDA 4WOVA 5CI6A 1Q3WA 3H0YA 5D1JA 5CSWA 4AE9A 4DTAA 4O6LA 4JT3A 4GG7A 5CVHA 4XMOA 1XH8A 3QWJA 2ZV7A 4TZRA 1JSUA 4GJ3A 4XV3A 5CU6A 3UVPA 2BCJA 5E90A 4BZOA 5LVOA 2ONLA 3RAKA 3LMGA 5E8YA 4F65A 5HGIA 3RP9A 2R9SA 4I4EA 4C7TA 5I9YA 2BROA 4UMQA 3R7YA 2EUFB 1AGWA 4KAOA 4ANBA 4CYIA 3UG2A 2OZAB 4TWNA 4L9IA 2UZTA 5BYLA 4OR5A 4HPTE 3PP1A 4FKRA 4XNEA 4Z55A 1PYXA 3KK8A 4P2KA 4YUQA 4MCVA 3BU5A 2OXXA 4J52A 5AP4A 2J50A 2X8DA 2IW6A 3O8TA 2XK4A 4WBBB 3W10A 2IJMA 3ZO2A 3MH0A 1O6YA 3BX5A 3EQGA 3NEWA 4CT2A 5EG3A 4AOTA 4RLLA 4L3JA 4EYMA 3S00A 2YIQA 1J1CA 3MFUA 1GIJA 2EXCX 4QYHA 3F2NA 4HW7A 4FNXA 4QYYA 2VX0A 3O50A 2OW3A 1LEZA 4YHJA 4BCGA 3KL8A 4Q5HA 4USEA 3DKCA 1JSTA 3KU2A 3LM0A 4WNPA 3DQWA 1Y8GA 3A4OX 2FB8A 1O9UA 2B53A 4M3QA 3FSKA 3G90X 5AP6A 3RPOA 3RK7A 4FSTA 5E9EA 4B6LA 4DA5A 2BIYA 3TDWA 2C1AA 4CVAA 5DEWA 5FTQA 5IU2A 5JT2A 3VS6A 3JPVA 2QG5A 5FLFA 4KSQA 5IDNA 5JFSA 3UNKA 3AMYA 5F4NA 4OBQA 5HCXA 5HVKA 4WUAA 4OUCA 1K3AA 4FTIA 3Q2MA 2YM7A 2I6LA 5IQHA 3NCGA 3RHKA 3QYWA 3FMDA 3RM6A 4C35A 4UMPA 4E6CA 1KUTA 4FSNA 3L9MA 3UGCA 3MVHA 3SV0A 3BYSA 4FG8A 3ORPA 5A3XA 3S95A 3AC4A 4X3FB 1U4DA 1CMKE 3PA5A 3QZFA 4AT5A 2R3FA 4BN1A 4IZAA 1CKPA 3PJ3A 4UYAA 5CAPA 3ZUVA 3FC2A 3GFWA 2R0IA 4TNDA 4BCHA 1OMWA 2GTNA 3RMFA 4HZRA 4RFMA 3V6RA 4CKIA 5GIPE 4KKEA 3HKOA 4U80A 3Q6WA 4ZSGA 4EH3A 5KKRC 2F7ZE 2VTHA 2WIHA 3BELA 3LXLA 4U3YA 2PSQA 4X3JA 2CKPA 2QONA 3ZS5A 3ORXA 4RIWB 4IBMA 2HW7A 4GKIA 4AW0A 2ZM1A 1IG1A 3EQHA 3PPKA 3BWJA 4I5HA 4O0YA 4H3BA 4IE9A 3EB0A 3Q9XA 4CTCA 3ZDUA 4IW0A 1U59A 2CHLA 3GCSA 1ZAOA 2QOLA 2OI4X 1PXJA 4RQVA 5I9ZA 3RK9A 3EL8A 2R4BA 5HIBA 1P2AA 4GG5A 4BCNA 2PYWA 4A4OA 5IQAA 2F2UA 4LYNA 4YLKA 4FTKA 4Z7GA 4O86A 2ZB1A 4RVKA 3QC9A 4APCA 3LLAA 4IVDA 2OJ9A 3FXWA 2W4KA 3GBZA 2XYNA 3QQKA 4BICA 5EYMA 4EHEA 2PVFA 2X81A 5AV2A 4DFLA 5F9EA 2VGPA 5JZJA 1OB3A 2VTMA 4JR3A 4R7BA 3IGGA 4IJPA 4O7WA 3LMHA 3BWFA 2VD5A 2C6DA 3UQFA 4K77A 2VUWA 3BU3A 3ORTA 4FYNA 4ZLZA 1IAHA 3QGYA 2GPHA 2GCDA 3E7OA 3KULB 4M12A 5DEYA 2HZIA 1W7HA 1WCCA 4WA9A 3TNHA 3HMIA 4LOPA 1OUKA 5EHLA 2GS7A 5IUIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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