3H9FA

Crystal structure of human dual specificity protein kinase (ttk) in complex with a pyrimido-diazepin ligand
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
280
structure length
260
Chain Sequence
FQSMSVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDGTVNYMPPEAIKDMSKISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Small-molecule kinase inhibitors provide insight into Mps1 cell cycle function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity protein kinase TTK
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 260
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2009-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3h9fA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3h9fA01
5A4CA 5HD4A 5IF1A 5DH3A 3TJCA 4PL4A 4E5AX 5KUPA 4ASXA 2X8IA 4JJRA 4I24A 2BR1A 4F7LA 1OL6A 3BLHA 2HENA 1M7NA 3R8VA 2YM7A 2J4ZA 2WQBA 4AFJA 3CD8A 3V6RA 5BVWA 3ZFMA 3H3CA 2CPKE 5BVFA 1XJDA 2QOHA 4FVPA 4H39A 5EYCA 4ASZA 5AUXA 2HWOA 4QTBA 3DJ7A 4F4PA 4WNKA 3QCYA 3RCDA 4S32A 4DCAA 5HO8A 2OJGA 2BZJA 2HZ0A 5CU3A 5JEBA 1JKKA 3NIZA 4MXOA 5L2TA 4I41A 4MD8E 2YWPA 3E93A 4XV2A 3VRZA 4EOJA 1SVEA 3L8XA 5IMXA 2BDJA 4IH8A 3MFRA 3ZDUA 4DFNA 5IPJA 3GCVA 2O2UA 2HAKA 3IPHA 4Z16A 3NUPA 2O0UA 1FGIA 2Y4IB 2WTCA 4K6ZA 4E26A 3NCGA 4JVGA 4QYEA 1H08A 3F3TA 2G2IA 2YAAA 4FL2A 2QO2A 4P5ZA 1H1WA 4XEYA 3ZC6A 5A4QA 3IOKA 2PZYA 3EQGA 4JQ7A 4FK3A 4TRLA 5AFVA 3GI3A 3LFNA 5G1XA 4BI0A 3LOKA 4RVMA 1H1RA 3FI4A 5EDRA 4FTNA 3ERKA 2PE0A 4CFUA 4HCVA 5HHWA 2O63A 4MWIA 1XH6A 4UZHA 4ZTSA 4O1OA 3BHVA 1ZOHA 4RC3A 3CD3A 4PUZA 3LXNA 5D41A 3UC3A 4D1XA 4O6LA 3EQBA 3MS9A 3HVCA 4FKWA 3SLSA 1Y8GA 2JEDA 3SXSA 5HTBA 1YXXA 3WARA 4UZDA 4KUJA 4FV9A 3DFCB 4GYIA 5CX9A 2PVHA 2BRBA 4CFXA 2IO6A 5IDNA 5HNBA 5AV3A 1TQIA 4FTQA 3ROCA 5KBQA 3PWYA 3NUAA 1PRYA 4QMLA 2NNWB 2IWIA 5IQAA 4JDHA 5C26A 5AP6A 2QLQA 3HZTA 3M11A 5DLSA 4BDIA 4BZNA 5JN2A 4DTAA 1M2PA 3CP9A 3ZC5A 3O17A 1XO2B 5IA0A 1H28A 4QQJA 5A4LA 3NDMA 4K9YA 4Y5QA 5J7BA 3GENA 2QOOA 2VZ6A 5J7HA 1J7LA 3AC1A 4AW1A 3AD6A 3P7CA 4LOQA 4OBQA 2QU6A 5CQWA 3FBVA 4RJ7A 4BL1A 2IW6A 2VTMA 4A9TA 4Y73A 3DPKA 5I4NA 3NS9A 3R9DA 1STCE 4PL5A 4ERKA 2AUHA 2J50A 2PVFA 2X2MA 4XLVA 3UVQA 1ZOEA 3HLLA 1QL6A 2XM9A 3MYGA 5HG8A 3R28A 4UWBA 5E8ZA 4HZSA 4JT3A 5CNOA 3C0GA 3MPMA 2RFNA 3OWJA 3ZFYA 3C4XA 2CN5A 2XKFA 2OGVA 3PSDA 3GQLA 4OBPA 4PPBA 3TZ8A 2XNPA 3DDQA 5CLPA 5E8SA 3MY5A 4Q5HA 3REPA 4F6WA 3QLFA 4APCA 5F9EA 4RSSA 2OZAB 4FIHA 4C62A 4CEGA 3HV6A 5CAQA 3E8DA 1YHWA 4QYGA 2HW7A 4G3GA 3FI2A 3UP7A 1ZMVA 5E8UA 5ANJA 5IQIA 2YERA 2PMLX 4UYNA 1Z5MA 4FKVA 2CLQA 3A62A 3RAHA 2WTVA 3PXRA 4GU9A 2QR8A 4PMPA 1JLUE 3R21A 1KUTA 4RFZA 4TW9A 4DLIA 4FUYA 5HO7A 4O0UA 2YIWA 3QGYA 3QRIA 3OT3A 4WSQA 5HLPA 3COIA 4BYIA 2C3LA 2XK9A 5L8JA 4TYEA 5EHYA 4M14A 4GRBA 4XOYA 2QODA 2JAMA 2IVVA 2O65A 3DU8A 2PPQA 4BI2A 2Y6OA 4IE9A 3R7YA 4HNIA 1GZOA 2R7BA 3VS1A 2AC3A 3LVPA 2VWVA 4IM0A 5HVYA 3FHIA 3D7TA 4NEUA 3NYNA 1XH5A 3KRXA 5HE2A 3PVGA 3TCPA 3KRRA 2XIKA 3PY1A 3QUEA 2XIYA 4C4GA 1KWPA 4DTKA 2YWVA 4AX8A 5EYMA 1ZRZA 2SRCA 2CN8A 3IDCA 3LFEA 2VTIA 2VWUA 4WSYA 2BKKA 3ORIA 4IM2A 3GU7A 5EK7A 1A9UA 3R7EA 1JBPE 4NIFA 5CY3A 4DC2A 1MRVA 3LFFA 4DH1A 3A60A 4EHZA 3MH2A 2VTJA 1CKIA 3R04A 5EDQA 3W8QA 5DR6A 3IKAA 5F95A 5M55A 2ZV8A 2JC6A 3LFCA 4NUSA 4CRSA 4D28A 3IGGA 5EI6A 2YDIA 2YJRA 4UYAA 5DEYA 1MP8A 3C51A 4PV0A 3ZM9A 4FTMA 3QTQA 3BEAA 3PPJA 5HCYA 4BDCA 4AGDA 2CGVA 2UUEA 3P0MA 2KTYA 3MVLA 3PXYA 4ZJVA 3KVXA 4GU6A 2C0OA 3CTJA 4AOJA 2WTJA 5HX8A 1P2AA 2J6MA 3DXPA 4YTIA 2XIZA 4AQCA 4N6YA 1M52A 1U5QA 2ITWA 1YOLA 2ZOQA 3DJ5A 3U6IA 3BGZA 3GU6A 3EKKA 1F3MC 1NT2A 1KE7A 4YTHA 5DWRA 3QD4A 5EG3A 3O8PA 4ZXTA 4Z3VA 2VWXA 3HECA 4GS6A 2YEXA 3A8XA 3GB2A 4GUBA 3V5TA 2C5OA 2RL5A 4CVAA 3Q9ZA 3QZFA 4QQ5A 4JI9A 4D2SA 3COHA 2ZV7A 4F0IA 4RVKA 4FTUA 2OICA 1PF8A 4KIKA 1W0XC 1P5EA 1GJOA 4IB1A 4RZWA 4WO5A 4FZAB 4I5PA 5KMOA 3EN7A 3P7BA 2EB2A 3DBCA 2C0IA 3UOJA 3KB7A 5JKGA 2X4FA 5HKMA 1OB3A 3OW4A 3E64A 1YHVA 5E4HA 2JBPA 3FXXA 2WMTA 3Q4TA 3K3IA 4HGLA 3BBTB 3B2WA 1OL5A 4J8NA 5ACKA 3EYHA 1Q62A 4XH6A 4CZYB 3UNKA 4TYIA 2PL0A 2W5AA 4FI1A 1Q41A 3PFQA 5AR3A 3OW3A 4B4LA 3JPVA 4C2VA 3OXTA 4YHFA 1ERKA 1F5QA 3ZYAA 5I9XA 4L53A 2J5EA 3OUNB 2C3JA 5AR2A 3HV7A 4ZMFA 2G2HA 3QTRA 3DAJA 4RJ4A 2FB8A 2VWZA 3PG1A 3GOPA 1PJKA 4QTAA 5ETIA 3TIYA 4GMYA 5I9VA 2X7GA 3L8PA 4GK3A 4MXCA 5JGBA 2CLXA 3DOGA 3E8EA 3QTSA 4J7BA 2FVDA 4RBLA 4RIYA 3ZCLA 4AU8A 2WMXA 4YC3A 1PXOA 4YZNA 3QFVA 3BE2A 3PP0A 3PZEA 4Y5HA 4OT5A 1PYEA 2IZUA 5AR7A 4Y85A 4AA0A 3U9CA 4GK2A 1YOJA 2E9NA 4ZOGA 5JZJA 4JRNA 3VIDA 3MVMA 4O82A 1K9AA 5E92A 4PQNA 3WZEA 3ZXZA 2J0IA 3AOXA 4UMTA 3HAVA 3F5GA 3QU0A 5J8IA 5GIOE 3R00A 2XNOA 3H0YA 4J52A 5AADA 4DEBA 3CS9A 5EDPA 3OY1A 4IB3A 2C6KA 4LRKA 4ZTHA 5CVFA 4D4RA 2GQSA 3QHRA 5M06A 1DI9A 5L6PA 3QCXA 2HXQA 2VWYA 4F1MA 3FUPA 5FP5A 1OIRA 1T45A 3POOA 4HYSA 4I6HA 4C4JA 4RJ8A 4QPSA 3KN5A 4BBEA 4TN6A 2J0MB 2DQ7X 3S3IA 1FVTA 2XZSA 4OTWA 5BUEA 3GCSA 1L3RE 4FMQA 4U3YA 4E6CA 4MAOA 1HCKA 3PXKA 3MWUA 4O7VA 1OIUA 5KMMA 4E5WA 2R3MA 2CCIA 1WAKA 3DQWA 2EXEA 3AD4A 4J97A 4O0SA 3ZSGA 5LMKC 5LWMA 4O2PA 3W10A 3TEIA 3P7AA 4B7TA 2XRUA 3QKLA 1AGWA 4XV3A 4FSRA 3O71A 1WBOA 3QYZA 4ZLOA 2V0DA 3VNTA 5K9IA 3S0OA 5HVKA 2W1EA 5T3QA 3UP2A 5L8LA 5BMSA 4ID7A 4X3FA 2PUNA 5KE0A 1M7QA 2GTNA 1PW2A 4X2KA 3HL7A 1OL2A 4J8MA 3IW5A 2C0TA 4RVTA 4C4IA 5B2LA 4X2JA 4AG8A 4BTKA 4F08A 5CU0A 2VAGA 4KIOA 4P5QA 3QX2A 5H8GA 4HVHA 4QTDA 3BHUA 3OTVA 2LGCA 4FNXA 3A4PA 3SGCA 1PXMA 2QOLA 3EZRA 3PIXA 3Q9WA 4YJTA 3G2FA 5DN3A 5IH5A 1KV2A 3R83A 5EM6A 3C4EA 3GUBA 4YLLA 4BY9E 5DT0A 1H0VA 3C0IA 3OCGA 4YHTA 3LCSA 1R1WA 4XV9A 5JZNA 3C1XA 2XF0A 4KRCA 5T68A 5AA8A 4N6ZA 4C7TA 2WELA 3UNJA 3Q52A 3HV4A 3R8ZA 4JG8A 4MF0A 4UXLA 2QD9A 3R8MA 5AP1A 3SX9A 4E6AA 4HVIA 5CANA 3K5VA 5KKRB 3FMDA 3R1YA 3GVUA 2UZBA 4C02A 3RMFA 4I5CA 3BU5A 4XCUA 4IVCA 1P4OA 5BYLA 4ZSGA 1GIHA 4G34A 5BUIA 4EJ7A 3EQRA 3FZ1A 2QI8A 3VS5A 3DZQA 3WF8A 3DXNA 2OFUA 4MXXA 5ETCA 5E7RA 1S9JA 4EQUA 4XBUA 2GFSA 4YJRA 4DGNA 2RKUA 3OS3A 3HRBA 4YO6A 4C8BA 5CWZA 5FD2A 4JG7A 4KBKA 4NFMA 2VO3A 1KV1A 4RJ3A 2FO0A 2GNHA 4CZTA 3ZZWA 1Q3DA 5IKWA 5AA9A 3E7OA 5IQBA 4FYNA 2J5FA 4ITJA 1GZNA 5H9BA 5E90A 4L68A 3THBA 1H8FA 3D7ZA 4A9RA 4L44A 5HE3A 4FL1A 3Q5IA 1ND4A 4YP8A 4IX6A 4BDEA 4OTHA 3AXWA 2VTAA 4FTTA 5AV1A 2GHGA 4ZTMA 3MA3A 3D7TB 3MVJA 4L3JA 4CRLA 2ETKA 4U9AA 5J5SA 5EW3A 3W2OA 4IDVA 1NA7A 1XBCA 3DJ6A 3ZMMA 5CAUA 3DCVA 4E6QA 3Q53A 3G51A 3N4TA 1ZYCA 1B38A 3FZOA 1Q8UA 4J96A 4IAKA 2UVYA 3CC6A 1QPCA 4YPDA 3WF6A 3AT2A 5DYJA 4PPCA 4DE4A 4ENXA 5HVJA 4EBVA 3WIKA 1PXPA 3FQHA 3I6WA 3QZHA 5J9ZA 1W83A 3KCFA 3HMMA 4GT3A 4B8MA 3K54A 4W4YA 3KF7A 2GQGA 1FINA 4QMQA 2C1AA 4V0GB 4TTHB 4AF3A 4UB7A 4ZS0A 2W06A 4M3QA 1XBAA 4RFYA 3OF0A 4FKQA 4ITHA 4J95A 2Z7QA 4CLIA 3A7HA 2BMCA 2X81A 3L9NA 2B9FA 2ITYA 3PYYA 4P2KA 3JYAA 3ZSIA 3SQQA 4FBXA 1KSWA 4ZJJA 4AWIA 4RIWA 5DRDA 1NVSA 4BZDA 3BV2A 2VTPA 4QMXA 3POZA 3DA6A 2Z7RA 2PWLA 3RPVA 5J95A 1OKYA 3OOGA 3E8CA 1ZYDA 4ONAA 4XG8A 1NXKA 4BDKA 1GY3A 5EI8A 3ZS5A 4H1MA 3DT1A 3DAEA 1VZOA 3ENHA 2BRMA 4IWPA 3BV3A 5IQFA 3UIBA 5KMJA 3R7GA 4FG9A 5C9CA 3VBYA 2H9VA 4XHKB 4FTJA 4CQEA 4WKQA 5AR8A 3S4QA 3QKKA 4I6QA 2W1DA 3UVRA 2WTDA 4PP7A 4FT9A 3CQUA 4R1VA 1OL7A 2GCDA 2PZIA 3RM6A 3EFJA 4R7IA 4Q9ZA 4Y46A 4GFGA 5AP3A 4F9AA 1OPJA 5T6KA 3W18A 3U54A 2H8HA 2BROA 3KRLA 5BNJA 2PMNX 4XG3A 3CLYA 4EOMA 4G17A 3ODZX 3GC8A 4EK8A 4J71A 3MB7A 4AT3A 4L01A 3Q5ZA 5HGIA 2OLCA 4LOOA 5M08A 2WQNA 3R7IA 2V7OA 4FVRA 4IZYA 3FKOA 5KHWA 2W1IA 1QPJA 1WMKA 4GK4A 3QC4A 5FM2A 3SXFA 4FA2A 1R0PA 4HJOA 3WYYA 4GG5A 1WVXA 2JDTA 5CF5A 4GKHA 3MIYA 4PTCA 5CSHA 2A2AA 3L9MA 2WQOA 5B0XA 3IS5A 1UKHA 3F6XA 3RK7A 4PWNA 4W9XA 4AW0A 3JR1A 1WBWA 1L8TA 3OBGA 3RALA 3MFSA 3VC4A 2R3LA 3E8NA 3PRFA 4RFMA 1DM2A 2A27A 2Z7LA 3KL8A 4XLIA 1NVQA 1P14A 3TACA 2B53A 4U40A 2BCJA 3Q60A 4O7YA 3QZIA 3D9VA 3LLAA 3EFWA 1OBDA 4EHVA 3QD0A 4W4XA 3FAAA 5JRQA 2HZ4A 1WVWA 4P4CA 5BVNA 3NVMB 3I1AA 4NZWB 3A61A 3TTIA 3BYOA 4USEA 2WOUA 3BWFA 1DS5A 1XBBA 3GQIA 2QHNA 5E8VA 4DGLC 3OEFX 5EI2A 2VX0A 3C50A 4A9YA 3MSSA 4EZ3A 4F64A 4XG2A 4DFZE 3VUDA 4KKHA 2P2IA 2XS0A 4H58A 5IDPA 3KF4A 2R3NA 3TNIA 3DK3A 4PL3A 3LMGA 3BQRA 2C5XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5A4C A;  5HD4 A;  5IF1 A;  5DH3 A;  3TJC A;  4PL4 A;  4E5A X;  5KUP A;  4ASX A;  2X8I A;  4JJR A;  4AXC A;  4I24 A;  2BR1 A;  4F7L A;  1OL6 A;  3BLH A;  2HEN A;  1M7N A;  3R8V A;  2YM7 A;  2J4Z A;  5BPY A;  2WQB A;  4AFJ A;  3CD8 A;  3V6R A;  5BVW A;  3ZFM A;  3H3C A;  2CPK E;  5BVF A;  1XJD A;  2QOH A;  4FVP A;  4H39 A;  5EYC A;  4ASZ A;  5AUX A;  2HWO A;  4QTB A;  3DJ7 A;  4F4P A;  4WNK A;  3QCY A;  3RCD A;  4S32 A;  4DCA A;  5HO8 A;  2OJG A;  2BZJ A;  2HZ0 A;  5CU3 A;  5JEB A;  1JKK A;  3NIZ A;  4MXO A;  5L2T A;  4I41 A;  4MD8 E;  2YWP A;  3E93 A;  4XV2 A;  3VRZ A;  4EOJ A;  1SVE A;  3L8X A;  5IMX A;  2BDJ A;  4IH8 A;  3MFR A;  3ZDU A;  4DFN A;  5IPJ A;  3GCV A;  2O2U A;  2HAK A;  3IPH A;  4Z16 A;  3NUP A;  2O0U A;  1FGI A;  2Y4I B;  2WTC A;  4K6Z A;  4E26 A;  3NCG A;  4JVG A;  4QYE A;  1H08 A;  3F3T A;  2G2I A;  2YAA A;  4FL2 A;  2QO2 A;  4P5Z A;  1H1W A;  4XEY A;  3ZC6 A;  5A4Q A;  3IOK A;  2PZY A;  3EQG A;  4JQ7 A;  4FK3 A;  4TRL A;  5AFV A;  3GI3 A;  3LFN A;  5G1X A;  4BI0 A;  3LOK A; 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