3HP5A

Crystal structure of human p38alpha complexed with a pyrimidopyridazinone compound
Total Genus 106

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
347
structure length
330
Chain Sequence
PTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (8-13)TI2 (43-46)TI1 (21-24)TIV2 (30-38)S3 (24-29)S4 (37-43)EMPTYS5 (48-55)TI3 (44-47)TIV4 (57-60)TIV3 (55-58)AH1 (62-77)3H5 (306-308)AH11 (299-304)3H1 (96-98)TI4 (80-83)S6 (88-90)TI8 (313-316)AH3 (124-144)S7 (102-107)AH4 (191-195)S8 (111-112)AH2 (113-117)AH8 (253-261)TII1 (117-120)3H4 (293-295)S9 (156-158)3H2 (153-155)TIV5 (148-151)S10 (164-166)TI5 (159-162)3H3 (185-188)TIV6 (197-200)AH5 (202-218)AH7 (244-248)AH10 (279-289)TII2 (274-277)TIV7 (290-293)TI7 (309-312)TIV8 (314-317)3H6 (326-329)TIV1 (12-15)S2 (16-21)TI6 (308-311)TVIII2 (221-224)AH6 (228-239)AH9 (270-274)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of N-substituted pyridinones as potent and selective inhibitors of p38 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 106
structure length 330
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3hp5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3hp5A01
1OIYA 2QLQA 3IKAA 2W05A 3S1HA 3BBTB 4IB5A 1ZOGA 2YEXA 4NTTA 4AF3A 4H3BA 3FLSA 3GC9A 5E8ZA 1OPKA 4NT4A 4YZNA 3UG1A 5A4LA 3L8PA 2BMCA 4FIEA 4AZVA 4FEQA 3A4OX 3DS6A 4I41A 5JGDA 2OF2A 3KULB 4J98A 3TKIA 4I23A 3GFWA 4TWPA 3H30A 4PMPA 3AT3A 5IDPA 4UZHA 4G1WA 2WNTA 4N57A 1EH4A 3RGFA 1H08A 3COMA 4J8MA 5EG3A 3SQQA 3I7CA 5E1EA 2YJRA 1DS5A 3FI2A 4Z9LA 5H8BA 2PZRA 4EH5A 3SOAA 5JSMA 5J87A 3R9OA 4EI4A 1OECA 3EB0A 3KRWA 4X3FB 4XOYA 2VX3A 3V51A 3V8TA 3IW4A 1KOAA 1JOWB 3FLNC 3Q9XA 4D55A 2I0VA 2UUEA 2XA4A 3GC0A 4YZCA 1ZXEA 5AP5A 3DK6A 1ZY5A 4CTCA 3JUHA 2E9PA 4NCTC 4CFMA 4HVHA 2WTDA 4QP8A 3KY2A 4FIGA 4C37A 5LXMA 2RFSA 5HBJA 5HE3A 4EYMA 4LUEA 1OPJA 4AFEA 5KZ0A 5I3OA 5BUEA 5HORA 2C0OA 2CGWA 3O71A 4FKRA 2JC6A 3CXWA 5HVJA 3PG1A 3KF7A 3QQHA 5HD7A 1IRKA 1PY5A 3PPJA 4PPAA 3FMNA 3IW7A 2AC5A 3LE6A 3UNKA 3OEFX 2V7OA 3GUBA 4D2SA 1IG1A 3R04A 1PMEA 4XG8A 2IW8A 4UN0C 5FD2A 4M69B 4DHFA 4LRMA 3R7UA 2HOGA 5CXHA 3AC3A 4FKQA 3RAWA 2ZV9A 5L8LA 4FV1A 2YZAA 3QRUA 4MXOA 4NKSA 4J53A 4XUFA 4C7TA 4E4MA 4IB3A 4I92A 3GU8A 1U46A 3O51A 4BDJA 2XCKA 1UVRA 2FB8A 1PXIA 4XH6A 4JJRA 2VO7A 2XK4A 3POOA 4ZY5A 2WTCA 1JQHA 4LL0A 2OO8X 2XBAA 1FMKA 1RJBA 3LOKA 3ZLWA 3NRMA 3FZOA 5E8VA 5C8MA 4IB1A 4DGMA 4EOSA 1YI6A 4QMYA 5EOBA 1U54B 3N51A 3VWAA 1VYWA 5FEEA 1ZRZA 1UWHA 4RSSA 2CLQA 5AUWA 5DNRA 3E8CA 4FTNA 4R1VA 2XBJA 3HUCA 2YITA 3A7GA 3LJ1A 4YHJA 4APPA 5AR7A 2W96B 4R6VA 2VTTA 2W0JA 5TT7A 4ALUA 3KXZA 3V5LA 3FQEA 2UZTA 3R21A 1GZ8A 1PW2A 2ZV7A 2EUFB 1GZNA 4O0SA 4TY1A 5IMXA 4CNHA 4Z3VA 5ETFA 2J0LA 5CAOA 3BYMA 3IS5A 5HTIA 5BX0A 4FTOA 4AOIA 3VHKA 4D2WA 3UQCA 4O7ZA 2JAMA 4F1OA 2XJ2A 4FKGA 1QL6A 5BPYA 3DBEA 1Q8WA 2GNJA 1P5EA 5LWNA 3KFAA 1VYZA 2NRUA 3ODYX 4JL9A 4CRLA 4LUDA 4IADA 4IDVA 4Q9ZA 3U87A 1LEWA 2QODA 5AP2A 3AXWA 2DS1A 1FVVA 4RMZA 3HNGA 3VBVA 5E91A 5HHWA 4GIHA 4G16A 2BDJA 3LZBA 3GCUA 1OUYA 3AC8A 4DFUA 2UZOA 2EU9A 3ZO1A 1FINA 4NM5A 4OT5A 2JFLA 2CCIA 4C02A 4XYFA 4FA2A 2WEIA 4OTRA 5DE2A 4QT1A 4K6ZA 4C8BA 3P08A 4EONA 3COKA 1OB3A 2VZ6A 4YJQA 2BZJA 2WMSA 3C4FA 4AA0A 3KL8A 2XNPA 2ZDTA 4ZTQA 4BWPA 4PQNA 4QMVA 1YXVA 4QOXA 4UYAA 3S4QA 1MQ4A 3BYOA 3JYAA 1NVQA 3PZHA 3QA8A 4DEDA 1TKIA 3TKHA 4LGDA 4WNKA 2CGXA 4F99A 4UMUA 2R3IA 5CSVA 1Y57A 3GB2A 1WVYA 3P7AA 4EOIA 2Y0AA 4MX9A 2VTLA 1OI9A 3DKCA 2YN8A 4QMQA 3RPOA 3NUXA 4Q5HA 4U0IA 2CSNA 5HICA 2IO6A 3TCPA 3ZBFA 2WEVA 3KKVA 3RHXA 4EOPA 2VTNA 2PMNX 4X6RA 5EYKA 5I9ZA 3Q9ZA 4BGHA 2C3JA 3I0QA 5DYJA 3O96A 3GCVA 1TQIA 4PDPA 3ET7A 1M7NA 4GYGA 4AXAA 3TUDA 2WOTA 5KUPA 2ZVAA 5DBXA 5HIBA 5EKOA 2Y7JA 4IBMA 4RJ6A 3OXIA 1OKWA 4RC4A 5AUVA 5BYZA 4AG8A 5JQ5A 3TJDA 5FTGA 2XIXA 5IU2A 4H36A 3UIUA 5JRQA 4G5PA 2YISA 2ZM1A 2PULA 3DPKA 4O0VA 1J7UA 5EQYA 2J0MB 2QOOA 5FGKA 2IW6A 5CAUA 4WNMA 5DH3A 2HY81 5IQEA 1YHVA 1AD5A 4AN3A 1NW1A 4QMUA 4CFNA 3PWDA 5M4UA 3R2YA 1PYEA 2VO0A 2VTQA 5EOLA 3AC5A 4EZ3A 3FZTA 3O17A 4XG7A 4I5HA 3RK7A 2UW7A 3UDBA 3W2RA 4CG8A 1CM8A 1STCE 5HG7A 4UWBA 4G3FA 4CKIA 5L8KA 3CQWA 4IZ7A 4EWQA 1KV2A 5HOAA 2RIOA 2WMRA 3V8SA 3FYJX 4HZRA 4IAFA 2GNHA 3AQVA 4WO5A 4FTKA 2XNMA 3DT1A 5B2KA 1CKIA 3QTIA 3RM7A 5EK7A 2VU3A 3ZUVA 1LR4A 5HIDA 2PU8A 2OXXA 4AACA 2XNBA 1SNXA 1U4DA 2HZIA 5H9BA 4IZYA 5LJJA 1NVRA 3GCSA 1WBOA 3PXRA 3O7LB 2WHBA 3AD6A 3KVWA 4MBIA 3Q4UA 3NUPA 5E9EA 3FQSA 2X7FA 5F95A 4FSTA 4AZFA 4F9BA 4U45A 4CKJA 4CMTA 4YZDA 3H9OA 3DK3A 4IX6A 2QCSA 5CSXA 5AADA 5CEPA 4JAIA 3R9HA 4M97A 4G6LA 3NAXA 3UOKA 2YM6A 3ZC5A 4HCUA 3NCZA 4FNXA 5HG9A 3OUNB 2WQOA 4BDDA 1QCFA 3HL7A 3HKOA 3MS9A 3NW5A 5DEYA 3ZSGA 4CQGA 2Z60A 5K0XA 1CKJA 2RFDA 3ERKA 4FTIA 3R7IA 3IDPA 3AMYA 4YZ9A 3WYXA 5AM7A 3L9MA 5L6PA 4I94A 4MBJA 4YJTA 4AU8A 5IQAA 4ITHA 4K18A 4U9AA 3UVRA 5JZNA 4O7TA 3NR9A 5I9WA 3NPCA 3UMXA 3VS1A 5IISA 2WU7A 4RJ7A 2OIQA 3F3UA 5IZFA 3ZYAA 2UZDA 1UU7A 2YCQA 1QMZA 2WOUA 3NIZA 2IJMA 2OH0E 4G9RA 3BV2A 4BKZA 4DTAA 2PHKA 3W2SA 4QMPA 4LMUA 3DLSA 4NIFA 3TZ7A 5LVLA 4HVGA 3BI6A 3A8XA 5KKRC 4R5SA 2WXVA 4F1TA 2NNWB 3N4UA 4PTCA 2O2UA 4XV3A 5HKMA 4OT6A 4ASZA 2VRXA 4EH8A 3JR1A 2CPKE 4XV1A 4OBPA 4KD1A 3T3VA 5CAPA 5HU3A 5LMKA 5L6OA 1YOJA 2C0TA 3R28A 4OR5A 1VR2A 3FQHA 3ACJA 2VWUA 3BYUA 3FLWA 5FRIA 3NGAA 1YKRA 5E8YA 1H07A 5J8IA 4EUTA 5FDXA 2C5XA 1XH6A 4RT7A 2AYPA 5HCZA 4N4SA 4PTGA 4BB4A 4J7BA 4CV9A 5BMSA 1Q24A 3REPA 2PUIA 4HYIA 3WZDA 4FV3A 2XUUA 2BUJA 3EQRA 1KSWA 5HE2A 4ZOGA 4ACCA 4O96A 5AUYA 2W1ZA 2WTVA 2OI4X 4FKLA 5DR2A 3PDTA 3TNQB 1ZYLA 3LXKA 2BFXA 1OKYA 2H96A 4FG9A 3AOXA 3L1SA 5FP6A 4F6SA 4Y46A 5JQ8A 2FA2A 1B39A 5CZIA 4L9IA 2VTHA 2CN8A 2QO7A 4NK9A 1CMKE 3LM5A 3S2PA 5JMSA 4BWKA 3UZTA 3MW1A 5E8XA 1XBAA 2OICA 2PTKA 4OGRA 2OSCA 5GJFA 3CEKA 3K54A 3NNWA 4FV9A 1YOLA 2YAAA 3F5UA 2VUWA 4ZJVA 4I4FA 2C0IA 5ETAA 2BTSA 4FEWA 1Z9XA 2BVAA 3HRBA 4IHPA 2B9HA 2C5NA 3R8ZA 3PP1A 3CGFA 3NYVA 3VUDA 4LMNA 5DIAA 5ANJA 4ACHA 1Q41A 3ZXTA 5KCVA 5DG5A 4CLIA 3CD8A 2C5OA 3VF8A 4D2TA 4FKVA 1YDRE 3ZS5A 4E5BA 4F0FA 3B2TA 4RC3A 4FIJA 1BUHA 4GH2A 4BCFA 4H05A 1URWA 3LIJA 3OW4A 2B55A 3A4PA 4EZ5A 2GMXA 1WBPA 2W1HA 2XEYA 3L9LA 4LGHA 4O91A 2WAJA 3G5DA 4E4XA 2F2CB 3SD0A 5M4FA 3C13A 3ZM9A 3DJ5A 3U51A 4BVUA 4W9XA 3E88A 3P86A 3RWPA 4CYIA 3GCQA 4D5KA 3QZGA 2W4JA 1ZLTA 4MWHA 4WA9A 3W18A 2YIXA 2PVJA 2WIHA 3KN6A 2QURA 3P0MA 4CZUA 2OBJA 4FTRA 3FL5A 3QRTA 4L43A 1S9JA 4C33A 4IW0A 2YCFA 4TW9A 4CTBA 3PP0A 3W2QA 2B4SB 5C01A 3E3PA 5KMLA 5M51A 1Q61A 3EFWA 2YA9A 2HELA 5L2QA 2J7TA 2VN9A 2A4LA 5CSPA 1Q8YA 1J1BA 4N6ZA 1ZY4A 4ASXA 3G0FA 4JT3A 4G3GA 5DWRA 2V0DA 4YLLA 3ZH8A 4DG0E 1OKZA 3FAAA 1DI9A 2GNGA 4EBWA 3PJ8A 3KB7A 4E4NA 4NWMA 1XWSA 5JFWA 5CU4A 3HP2A 3VUGA 3QUEA 4FICA 4CFVA 4IX3A 2JKMA 4J8NA 4OBOA 4OTHA 4ID7A 5AV0A 3W2PA 4KABA 4JG8A 3GT8A 4RZVA 5BYLA 2C6EA 5EI2A 1WZYA 1KE6A 4MD7E 2WFYA 4S33A 1Y8GA 3WOWA 4HVDA 2PMIA 2EB2A 3LCTA 3KQ7A 4A4OA 3SLSA 5C1QB 1SZMA 1V1KA 2O3PA 3TM0A 3U55A 2WTIA 3OTUA 3N4TA 3EHAA 5IA1A 4XG2A 3BZ3A 4NW5A 3EZVA 1OUKA 3IW8A 2YDJA 2ITOA 4IQ6A 5AV4A 3PE2A 2C6DA 5FTOA 1YDTE 1O6KA 4F0IA 4B8MA 3VC4A 3O8PA 3PVWA 1CKPA 1V0PA 3QXOA 4QQCA 5M09A 4PDYA 2OIBA 4TYHB 4X2FA 2OK1A 3OG7A 4AS0A 4F70A 2GNLA 4TRLA 4WRSA 1PXMA 4FSUA 3FJQE 5CAQA 1U59A 3LFQA 4QP4A 4UMPA 4TWOA 5DRDA 3W10A 2B9IA 4FT3A 2VTOA 4V04A 3C0HA 3R8PA 5EW8A 4FGBA 4AA4A 4BL1A 2UW9A 4LOOA 4FEUA 2OH4A 4BBEA 5FUTA 4M12A 4J97A 4PRJA 3MDYA 2HIWA 2PVMA 3BHHA 3DBCA 4BR3A 5TO8A 2X4FA 1PMNA 4ACGA 3R7YA 3MESA 4ITIA 4PPBA 3OHTA 2UZUE 2VWXA 4C57A 4UY9A 3IECA 4AGCA 3F7WA 3QQLA 5K5XA 4BDAA 4TTHB 3GI3A 4BCMA 4IAIA 2X1NA 4I5CA 3LQ3A 3QAME 3R71A 2DYLA 4U3YA 1UNHA 2I0EA 3TI1A 4KUJA 2JLDA 2BRGA 4X2NA 2PZYA 5J79A 5DT0A 5KHXA 2PPQA 1E1VA 4MXZA 5AR3A 1XBCA 5LARA 4EK4A 2JKQA 3A60A 3R8UA 3Q60A 5IUHA 1YXUA 1VJYA 3DU8A 4MTAA 4I21A 3P79A 5LQFA 4QD6A 4M13A 4P5ZA 5CZHA 4EQCA 3A7IA 4YMJA 3CE3A 3HP5A 2ZJWA 1IAJA 5DR9A 4L52A 1JKKA 3QTZA 5BVKA 4NCTA 5A4CA 5J1VA 3I79A 5LVPA 3AMAA 3U9CA 3OROA 3VBYA 3PSBA 4DFLA 4GVJA 4L46A 3TNIA 5HEZA 5D7VA 3FI4A 4YJRA 4EJ7A 4KIKB 5K5NA 1HCLA 5BVEA 3MH2A 2Y4IC 4FBXA 2X6DA 4CV8A 2I40A 4HYSA 2EB3A 3IW5A 3R1SA 2X2KA 3E3BX 4I5MA 4OW8A 5A46A 2QD9A 4RJ8A 1XH4A 3W2OA 4ANNA 3RZFA 4OAVB 2F4JA 4L45A 5KHWA 3G51A 3OCTA 4CCBA 3BU5A 3TZMA 4LL5A 3D2KA 2WZJA 4G31A 2PE2A 2XM8A 4L44A 3MBLA 1ZOHA 2E2BA 4ALVA 3DXQA 2BRBA 3CIKA 4M8TA 4RPVA 3VUHA 1GZOA 2V22A 4RC2A 5AUXA 2G01A 3W8LA 2HZ4A 4USFA 5AIRA 5HBHA 1JKTA 3FKOA 3ACKA 3FY0A 3P1AA 4O7YA 4A9SA 3KXMA 5AFVA 4JX7A 5FDPA 4I3ZA 5LVNA 3QZHA 4JQEA 4DEEA 3PY1A 3V5JA 4C3RA 3ZO3A 2UVYA 1Z57A 2PVFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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