3I5NA

Crystal structure of c-met with triazolopyridazine inhibitor 13
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
295
structure length
280
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNREVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery and optimization of potent and selective triazolopyridazine series of c-Met inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 87
structure length 280
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3i5nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3i5nA01
2JDOA 4CYJA 4C0TA 1XH5A 2FSTX 2CPKE 2WQOA 1SZMA 4OTRA 4LOQA 4NIFB 2G9XA 4RC4A 3DS6A 1IA9A 5JRSA 2IN6A 4ZIMA 4DH8A 1Q97A 4EH9A 2H34A 1OL5A 1TQMA 1ZMVA 2C1BA 3GCQA 1MRYA 4UWYA 2CKQA 5I9UA 3IONA 4OTHA 4PTCA 5E92A 2YIRA 3PTGA 3QTRA 4OT5A 4GJ2A 4IIRA 3DXPA 2V0DA 2GFSA 4F9WA 4OGRA 4X2FA 4DLIA 2Y7JA 2B4SB 4C33A 3QHRA 4NFMA 4OUCA 4D28A 3R2YA 3IQ7A 2V55A 3R1NA 4C3PA 4ZSEA 2GS7A 2RSVA 3C50A 3TV7A 3FL4A 3LVPA 4O0VA 1TQPA 3FPQA 4GCJA 2Z7QA 3L1SA 3VHEA 1FMKA 2W1CA 2HELA 4KKGA 2FA2A 4AN2A 5F94A 4NWMA 1WBPA 5HE0A 3LLTA 5EHOA 5LWMA 2IW9A 3MB6A 4B0GA 2C3LA 4UV0A 5HCYA 3ATSA 4DF3A 4DE4A 4KWPA 2R3QA 2GTMA 2OH4A 3LPBA 3QWJA 4KIQA 4MWIA 1XH4A 1ZMUA 2XK4A 5L2WA 2C5OA 1H1WA 4LUDA 1PKDA 2GHMA 4DTKA 5K4JA 5CEQA 3ACJA 3R7EA 4PWNA 3CS9A 1V1KA 1BL7A 4IX6A 5HI2A 3WIKA 4QMLA 3GCUA 4IVCA 4EZ7A 3UQCA 3LIJA 3SLSA 3N4VA 2VTJA 5LCJA 2O0UA 5C4KA 3I81A 4FG8A 1H0WA 1TKIA 1XO2B 4IZ7A 1OGUA 2C30A 3CY3A 3OY3A 3KREA 4MD8E 4PL5A 4I21A 4U9AA 2DS1A 3UG2A 2HW6A 3Q9XA 3UE4A 3QU0A 5ANJA 3COKA 3GFEA 4MXAA 5D7AA 4I93A 3QTXA 3LFFA 4EL9A 3I0QA 4O38A 4XH6A 3UZPA 2BAKA 4BBMA 4BF2A 2C3IB 5CI7A 3DK6A 3G5DA 1EH4A 4ASZA 2X4FA 1PYXA 3NCGA 4CRLA 2PE2A 3EQIA 3Q9ZA 4JL9A 2P2IA 3HV7A 3PZEA 4N4SA 3R22A 4UWCA 4TN6A 5KZ0A 2PMIA 1OECA 1L8TA 2BCJA 2W17A 2OKRA 2ITUA 4JJRA 3ULIA 2AC5A 4PY1A 4ITHA 1Y6AA 4XRLA 4O7TA 5HIBA 2XMYA 4CFXA 5JFXA 2VV9A 4FT5A 2ZV8A 3UO6A 2WGJA 3HNGA 3C5UA 4ITIA 5CU4A 4BDKA 4BCKA 4CZTA 3DV3A 4FUXA 2HY0A 4FV7A 5JKGA 5EW3A 3SW4A 2CNUA 4ZAUA 4Z55A 1M7QA 3VUMA 4Q9ZA 4QYFA 1ZYDA 3ORZA 2OWBA 3QBNA 2WTKC 2J4ZA 4XG8A 4BCGA 2XCHA 4H1JA 2R64A 4CKIA 2GDOA 3DKGA 4LGDA 3UVRA 3VS3A 4YBKA 3RAIA 5DMZA 4EYJA 2IVUA 4KBCA 4AZTA 2CKOA 4QMMA 2O65A 2FVDA 3BIZA 4U80A 4YTIA 4D9UA 3EMGA 3W18A 4DFZE 5L2IA 2A2AA 4NZWB 3R9NA 5C1QB 2WMXA 3PJ1A 1T45A 2Y6MA 4FKVA 4PP7A 3KA0A 4D5HA 3OCBA 4IAKA 2BZHB 4PPBA 2C0OA 4NYEA 3CD8A 4GYGA 3PLAE 2E9NA 4EC9A 1ZZ2A 3ORLA 3SG9A 3QRTA 4G3EA 4TTHB 3O8PA 3AXWA 5IU2A 3MPTA 4Z16A 2C6MA 3QGYA 4AU8A 1U54B 5AJQA 4FL3A 2ZMCA 3PJ2A 3MFSA 5I9XA 5M4IA 3LMIA 1VR2A 4YMJA 2XIXA 4C35A 3IG7A 4JOAA 2PZIA 1PMVA 2JKKA 3LJ0A 3MH2A 1PMEA 4D1XA 3KC3A 5HESA 4KAOA 4UMTA 4MK0A 5FTGA 4ASDA 4ACCA 4IX4A 3V8SA 5BNJA 3CJFA 3Q4ZA 1KV2A 4M97A 3VJNA 4C34A 3PXFA 4UALA 1GZKA 3LCSA 3QXPA 4EK3A 2A27A 2Y8OA 5EM8A 3EQGA 3V8WA 4EOKA 4ZS4A 1XWSA 3V5QA 3R9HA 1DAYA 2BAQA 3OW4A 1ZMWA 1M2QA 1YXSA 3C4WA 1O6LA 4FKWA 5KMMA 1YHSA 2W99B 3TJDA 2VWBA 3QRUA 4C2VA 3ODYX 4QMZA 4M69A 3DKOA 3FKOA 2O3PA 5E8UA 2QI8A 1J1CA 4M12A 5L2TA 2XA4A 3EN9A 3WOWA 5CF5A 4FT9A 2I6LA 3SD0A 4X21A 5EKOA 4CMOA 5GZ8A 4RX7A 3QD0A 5ANOA 5T3QA 4BGHA 3OZ6A 5E8YA 5GJFA 3B8QA 3QKMA 3IOPA 4I94A 5EYKA 4EOMA 5I3RA 4BI1A 3AMBA 3U8WA 4GUBA 1CTPE 3FQEA 3TWJA 4FNZA 5HICA 1QL6A 2WMVA 4IJPA 2VAGA 4FT7A 3ULZA 2CKEA 3GI3A 3UZRA 3FE3A 3QF9A 2GS6A 3AC1A 4CZYB 2VWUA 4Q2AA 2OF4A 2FGIA 3Q4CA 4UX9A 2YZLA 4DT8A 4F65A 3G0FA 3VAPA 4NL0A 4WNPA 2XBJA 1XBCA 3MVJA 1NVRA 3LFDA 5ANKA 3R30A 1LR4A 3AQVA 3P7BA 4IWDA 1B38A 5HQ0A 3I60A 1YI4A 4D2SA 2C6LA 2A1AB 4IX3A 1PKGA 4RJ7A 3NUUA 2I0EA 4C4EA 4AA0A 3MJ1A 3RNYA 1YVJA 2Y0AA 3QZGA 4QP6A 3BHVA 4D2TA 3TT0A 5E8SA 3RBWA 3W1FA 2QD9A 3F2RA 5IQCA 5J87A 3CEKA 4MVFA 3ZM4A 1UV5A 3FV8A 4E6DA 3UVQA 2XKEA 3F66A 4BCNA 1W7HA 3E88A 3KRXA 1E1XA 3ZO2A 4BYJA 2BFYA 2G2IA 5CEOA 5IDPA 3GP0A 3MGYA 3KY2A 5HIDA 3C0HA 3RZBA 3NVMB 3PG1A 3ORIA 2QR7A 5HD4A 3GCVA 2BDFA 3THBA 2HK5A 4IFCA 3FLYA 3QC9A 2YIWA 4RIYB 3H10A 4F9AA 4CG9A 2DWBA 2C4GA 3I6UA 3IPHA 3NIZA 4V04A 3EJ1A 1FINA 4TYEA 3BEAA 4YJNA 5J5TA 2QOKA 2J90A 3KXGA 5AIRA 5EK7A 4YLKA 3WARA 3WZDA 1OKVA 3OWKA 3G6GA 4RQVA 2X9FA 1SNUA 2JKQA 5M4FA 4K2RA 3COMA 4QMQA 2P0CA 1WBOA 3NNUA 5B0XA 4E5WA 4BIEA 4ZY5A 2OFVA 5LMKC 4G6NA 4AN3A 2R0UA 2WELA 3KVWA 2B1PA 3LHJA 2CGUA 3O51A 2GQSA 4IACA 5JFWA 4XBUA 1KUTA 3ZBFA 1JOWB 3A99A 3SOAA 3UMWA 1CSNA 4CFVA 2VO6A 4W4WA 1KOAA 4TYHA 4FV5A 3RP9A 2VRXA 3FI3A 5JH6A 4GUEA 3LZBA 2GQRA 3B2WA 5HVYA 1FQ1B 3HX4A 4FKOA 4HZSA 2A19B 3UO5A 1B39A 3CGFA 5J7HA 3F7WA 5ETAA 1S9IA 3LJ1A 4BHNA 4CNHA 5HU3A 3EIDA 3CQUA 4FKPA 5ETFA 4P5QA 2EUFB 4FG7A 3LFEA 1YI6A 3REPA 5J7BA 4CGAA 3KXNA 5E8ZA 3NAXA 4O83A 4R3CA 2XIYA 4GL9A 4IQ6A 4YZBA 2BRMA 5IQEA 3NUPA 4WRGA 3QTZA 3FQHA 1OIUA 3HMNA 3QQKA 2QOQA 4GEOA 5I9ZA 4FGRA 4NM7A 4R1YA 4EORA 5KE0A 3NUSA 4NSTA 4IM3A 4DFXE 3TACA 5AEPA 3RCDA 4C37A 1GIJA 1UU9A 2G01A 4OTWA 4RX5A 3KRLA 3MH1A 5LVPA 2X6EA 3CD3A 5A4EA 2JDSA 1J3HA 4HJOA 4RFMA 3D7TA 2P2HA 5EW9A 4QMUA 3UYTA 2PWLA 3G0EA 2BDJA 4LL5A 3FKNA 5KKRB 2XM8A 4QNAA 4DAWA 4WSQA 5E8WA 3AC8A 4EEVA 4JR7A 5IISA 3GCPA 3M11A 5AUWA 4JG8A 2WD1A 4C57A 1IAJA 4QMTA 5ITAA 4FKJA 5IQBA 4EK5A 4D2RA 4DEHA 2HAKA 2CNVA 3PA4A 2OU7A 3HV4A 5CU6A 3BEGA 2BPMA 3A60A 5CU3A 2DQ7X 2LGCA 5KMOA 1XKKA 4YNOA 1VYWA 2C6KA 3PJ3A 4FVRA 5BPYA 3TNIA 3NPCA 3P08A 2R3GA 4Y85A 2WQEA 5K5XA 4GK3A 4R77A 2Z8CA 4K8AA 4MD9E 4Q5EA 5LOHA 4PMMA 4L67A 4OTQA 4GU6A 4M15A 3U9CA 4IVAA 4ZTQA 3UPXA 4EOLA 2SRCA 3G51A 3ZUUA 4FIEA 1YQJA 4NJ3A 1NXKA 3NGAA 3OG7A 4FKRA 5HHWA 4H3QA 4LV5A 3KULB 5AV4A 4HYHA 4CQEA 3H30A 2FUMA 2W96B 2JEDA 1KE7A 3TTIA 4EBWA 4IWQA 3HMPA 4H1MA 3V5TA 1J91A 2ZM3A 3RM6A 3HRCA 4JBQA 3ZO1A 3LCOA 5AFVA 3P5KA 3IDBA 2OLCA 4G2FA 3EFLA 4NCTC 4ZJVA 1RDQE 5J1WA 4JDJA 4DGGA 4CFUA 3LM0A 2BUJA 1M52A 3R7IA 2VTTA 5ANGA 3QC4A 5CWZA 3RINA 4AA4A 2J0IA 3DLZA 3NUAA 4BKJA 5CSWA 4Y8DA 2BHHA 2WMAA 2BTSA 3FLQA 4BWKA 1FBNA 3GBZA 2VO3A 4YPSA 2BKZA 2WMSA 4ITJA 4AG8A 2ZB0A 4AOTA 2OK1A 4E7WA 5EYMA 3C9WA 4FEQA 4FSTA 2C69A 5D9HA 3ZUVA 3SG8A 4KNBA 4ANLA 4YZMA 3FZOA 4IDTA 4R3RA 5EDQA 3R6XA 5HEZA 4CXAA 5A54A 5DEYA 4A9TA 3R9RA 3IW8A 1OL1A 3IDPA 4K11A 4QPAA 2DYLA 2JGZA 2WMQA 3AGLA 3C1XA 5DN3A 5GJDA 5CENA 4ACDA 3RCJA 3SRVB 3NW5A 3ZZEA 3AMYA 1YWNA 2WB8A 4UN0C 5FD2A 3IOKA 2QKRA 4P5ZA 4BCPA 1GIIA 3TUBA 5DH3A 3M1SA 2XH5A 3SOCA 5BUJA 4FVQA 3QALE 4FGBA 4RIOA 4CLIA 3W2OA 3ZCLA 4USDA 3TKHA 4BWXA 2C5VA 3CTJA 4NTSA 3ZLWA 4BDCA 5FDPA 3B8RA 3EKKA 2FB8A 4G3CA 3RGFA 5BVEA 2QLQA 4BTFA 5EM7A 3EH9A 3R71A 5IMEA 1Y91A 4PQNA 3DZOA 4TWNA 3M2WA 4IAZA 3UOJA 4JXFA 5C01A 3FZPA 5IA1A 2YFXA 2Z7LA 3NNXA 4NW5A 1KE8A 4V01A 4ALWA 4FEVA 2B9JA 2XB7A 4C3FA 5AM6A 3GNIB 3F9NA 4WRSA 4WNOA 2XK3A 3BWFA 4AXAA 5BVWA 4CTCA 5IMXA 5LCKA 3ZHPC 5IH6A 2CCIA 2GNLA 2J0MB 5HVKA 5M53A 3S2PA 4M3QA 4ERKA 4B99A 4EYMA 4QTBA 4D2WA 3AT4A 1W82A 3DAEA 3FEGA 3M42A 2VX0A 3KXMA 3KN5A 4JG7A 1JAMA 1FGKA 3KEXA 2PUUA 4I6FA 4BDDA 5IQHA 1NA7A 2GNJA 4AFEA 3OW3A 1WBVA 3W2RA 2QOOA 2ZVAA 3KKVA 4BC6A 4DCEA 5IA2A 1UWHA 3W2QA 5JMSA 4FR4A 1OIQA 4R8QA 3TZMA 2HZ0A 4DEGA 2R7IA 3CY2A 1FVRA 1W98A 4J8NA 1QPDA 2Z2WA 4WOVA 4YZNA 5AP7A 1RQQA 3TL8A 3ZFYA 2ACXA 3VN9A 5IUHA 2HXQA 1OZ1A 2RFSA 3FWQA 2WMUA 3FJQE 4KS7A 3KMWA 5FEEA 1Q8YA 5J9YA 4UXLA 1NT2A 4GT5A 5CZIA 2OIQA 4KKEA 4ANQA 3F3WA 4PPAA 4PDPA 5JGBA 2ERZE 4EH4A 3ID6C 4HW7A 3BE9A 3PIYA 4DG3E 5DT0A 5HX8A 3QCQA 3C4CA 5L6OA 3OY1A 3CKWA 3BLRA 5EM5A 4Z7GA 4L42A 2W1DA 4YSMA 4FTIA 2J5FA 2PVJA 3HZTA 3PXYA 2W5AA 2YDIA 5K0KA 2R3NA 4FTUA 3LKMA 5CX9A 4FMQA 3K5UA 4UZHA 5AUUA 5GIPE 1CKIA 4L3PA 4FNXA 4L9IA 5TOZA 2DUVA 4RG0A 4QMSA 4PV0A 4U0IA 3RHXA 4IANA 3KFAA 4ACGA 4E4MA 1UU3A 3HLLA 4UMUA 1OI9A 3VBYA 3A4PA 4HPTE 5CSPA 4HZRA 1VYZA 4KSQA 3A7FA 3FQSA 2WEVA 4FOCA 4X2GA 3VUDA 4HGLA 3GCSA 3VUHA 4RFZA 5DLSA 5IDNA 2VTMA 2OZAB 3MSSA 4A4XA 4I3ZA 3PSBA 4RGJA 1CMKE 4EOPA 5H2UA 2X7OA 4DGNA 4BDHA 4DT9A 3PJCA 3JVSA 4W4YA 4ZY6A 3QTWA 2YCRA 2PK9A 2PY3A 3LFBA 3ZLYA 5M08A 3NVKI 3UIXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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