3I79A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
463
structure length
455
Chain Sequence
AIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Toxoplasma gondii calcium-dependent protein kinase 1 is a target for selective kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Toxoplasma gondii
total genus 154
structure length 455
sequence length 463
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3i79A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3i79A01
2C5YA 2Y9QA 5ANOA 3DTWA 1WAKA 5LMAA 1NY3A 5GIPE 3KN5A 2IVUA 3O51A 2HW6A 5L8LA 3Q9ZA 4RJ6A 4EI4A 5K0XA 3IW7A 4FL2A 4K77A 1XR1A 3GGFA 3SX9A 4AW1A 2B55A 4PF4A 2J50A 4RA5A 4D28A 2BRHA 2W06A 4IDTA 1BKXA 1ZARA 3LFBA 3KCKA 3MPTA 5I5ZA 3EQRA 2YM6A 3ZLXA 4CFMA 5KBRA 3TNPC 1J3HA 4I23A 3BELA 2UV2A 3FXWA 3IDBA 2BPMA 3WE8A 5IUGA 3O8PA 1J1BA 3D2KA 4WNMA 2XK8A 5JZJA 4BDIA 1DI9A 3FV8A 5GNKA 4MH7A 4DGGA 1J7UA 3QZFA 1K9AA 3UZPA 5IQDA 4JNWA 4CGAA 3R7YA 2GTNA 2YCQA 3LW0A 2XBAA 4DG0E 2XJ0A 1G5SA 3Q2JA 4C3RA 4FIJA 3SW4A 1X8BA 5M57A 2GNFA 5GHVA 1M2RA 2IPXA 3QRIA 4IAIA 3FQSA 1H1QA 3QTWA 4R5YA 3MH3A 3Q6UA 4A06A 1Q3WA 3O71A 3OZ6A 2HZIA 2H8HA 2XVDA 3T8OA 4B7TA 4FT5A 4BKZA 5M09A 3VHEA 4DT8A 1WBWA 2GS2A 4GK3A 2BALA 3ZO3A 2IZSA 4E5WA 4FSWA 5CF4A 2I0EA 3PXZA 4IAYA 4TWNA 5LVOA 3TCPA 2W1CA 4GL9A 3VC4A 4FNWA 5C8NA 5H3QA 3N9XA 4I0RA 4Q5EA 3VF8A 2WMXA 3W2SA 2VTIA 4D9TA 4D4VA 3RVGA 3DK6A 2C6LA 1PMUA 4BTMA 4U9AA 5JGBA 4D2WA 4DH1A 4ENXA 3D15A 1YHSA 4DFUA 3C0GA 4IW0A 5JH6A 3HV3A 3PY1A 3R30A 4D2TA 2Z7RA 5EW3A 2Z60A 2UZBA 1R39A 1U54A 4JJRA 4M67A 1YVJA 3E3PA 3OCTA 5HIDA 5HNBA 3RHKA 4O0RA 3V5PA 3RAIA 3ZOSA 1ZRZA 2BZKB 4G3GA 4YBKA 3THBA 4AW2A 3CTJA 2YDJA 5F94A 3HX4A 4WO5A 4FKPA 5I9UA 1S9JA 4IB5A 1QPDA 4DGOA 5D7AA 2IVTA 4GSBA 5CAOA 5CU3A 4FIEA 5M56A 3A7IA 5AP5A 3WF9A 3QKKA 4EC8A 1H1WA 1WBVA 4EZ7A 1U59A 3MPAA 4ZSAA 2Z02A 2X7FA 3Q2MA 4FTCA 5I0BA 1Z9XA 4C4IA 5IH6A 4KS7A 2GHLA 3QWJA 4RPVA 2F2UA 4MXOA 4D0XA 5HD4A 1ZOEA 3QQJA 3PYYA 2UZEA 3IOKA 2C47A 2PE0A 3DBCA 3QXPA 3CP9A 4Y83A 4RIYA 4FKWA 3D7ZA 4I5MA 4EOSA 4JDJA 4H36A 4L7SA 3LHJA 2WQMA 1XKKA 2ZDTA 3DT1A 4UALA 3RTPA 1GNGA 2OO8X 4Z3VA 4HYHA 3G2FA 2ITUA 3A7HA 3EFWA 3GUBA 3VS4A 5J7BA 4QTAA 5AA8A 2GHMA 4PL4A 2YIXA 1TQIA 5HIEA 1QCFA 1SVHA 5HEZA 3ZO1A 2YIQA 4GMYA 2BRMA 2OIBA 5DPVA 4FK3A 2UW3A 3NW7A 2C5NA 4FYOA 3R9DA 4AN9A 5J9YA 4BTJA 2WQNA 3OFMA 5CY3A 3RAWA 2VTOA 3CIKA 2UZTA 4AUAA 1MUOA 3LM5A 4I1ZA 3HKOA 3W32A 4LG4A 5HESA 2VRXA 3ACJA 2O8YA 2R7BA 2YITA 1XH6A 1W8CA 4L8MA 4RVKA 4Y8DA 5IKWA 3WZDA 4C4JA 4BKJA 2XKEA 4UEUA 1OIUA 1LUFA 4X7QA 1KWPA 5DFPA 3TZMA 4D2VA 4F6UA 3CY3A 4FK6A 2G2HA 4E8AA 5LVMA 2WOUA 3G90X 4CQEA 1JKSA 4R6VA 3IW4A 2QHNA 2XIKA 2UW4A 3BHTA 4NCTC 5F1ZA 3RKBA 3JYAA 5FBOA 3RI1A 1IG1A 3C9WA 4BIEA 3BI6A 4JAIA 5EK7A 2R64A 4AW0A 1CMKE 1GOLA 4EKKA 2OJIA 4HVGA 2XNBA 3V3VA 4FKLA 3GOKA 4RIOA 4WSYA 4ASZA 4EBWA 3SAYA 3FXXA 1O9UA 4ACDA 3FKNA 4IWQA 3AT4A 4OGRA 2XM9A 4OTGA 5BNJA 4ZXTA 1E1VA 4FSTA 5M44A 3W2QA 3UO4A 2WMUA 3ZM4A 3OW4A 4FSRA 1ZYLA 4JRVA 2C69A 3EJ1A 3GC8A 4ZMEA 3UNZA 5HTCA 2JFLA 5DLSA 3FMLA 1DAWA 2ZM4A 2B9HA 3F5GA 3FC1X 4J1RA 5FEQA 4BCNA 4WG3A 5AUVA 4AFEA 4YPSA 3F3ZA 3ORLA 2CN5A 3EIDA 4FV1A 3EL7A 5D7VA 4AA0A 2ZOQA 4KKHA 5AP3A 2CPKE 4KIOA 2DS1A 5IMXA 5JGDA 3NUYA 3OMVA 3L1SA 4D2SA 2ONLA 5IQHA 3H30A 5HKMA 4EOOA 3RM7A 3D5XA 3AC8A 4V01A 1OIQA 2KTYA 3ELJA 3MH2A 4FBXA 3KXGA 4U7ZA 4C38A 4DH5A 3EN9A 4JVGA 2SRCA 5IISA 4IVAA 4Y85A 3UIUA 3NW6A 4S2ZA 4BCPA 4DFLA 3DY7A 1ZMUA 2QC6A 2XS0A 3DQXA 4KSQA 2X7OA 3W18A 2PY3A 3QUDA 2ZVAA 5DRBA 3ZO4A 2X9EA 4AN3A 5AJQA 4CFVA 2PMLX 4I5CA 2RG6A 4FGRA 4ZTQA 3W2RA 4YTCA 2BROA 2X2KA 3DGKA 1AGWA 3VBQA 3LIJA 2ITNA 1KOBA 3UC4A 3OXZA 5JEBA 3FMHA 4NTSA 3LAUA 4NKSA 4CV8A 3SXRA 4UB7A 5BX0A 4EQCA 3A7GA 3LFQA 2UZOA 4DE4A 3HDMA 2OSCA 2PE2A 4YNEA 3FI4A 3UPXA 5JK3A 1O6KA 3LOKA 5EM5A 1G3NA 3SVVA 3PIYA 1KV1A 1OUKA 3II5A 5EHOA 3HUCA 2PU8A 4EH3A 2R3RA 3DLZA 2VUWA 2ZAZA 3R9RA 3EZVA 4FSQA 3V5LA 4MCVA 2DWBA 2W9ZB 3QCYA 5HOAA 1H0WA 4DH7A 3S0OA 2G01A 5FUTA 4CKJA 3OTUA 1YHVA 3Q96A 3QFVA 3I81A 3COKA 4KAOA 4RJ5A 4D1ZA 4E1ZA 5IZFA 2QOFA 2W05A 3KMWA 4X3JA 4YZNA 2UW9A 5AUUA 4JX7A 4YHFA 5EQEA 2X9FA 4OBPA 2F7XE 4U41A 4JG7A 3KK8A 4QQTA 1UU9A 3OTVA 3H9FA 1OKZA 2J0JA 5HU3A 3GC9A 2JD5A 4PDYA 3RPOA 1GJOA 2W1GA 1PKGA 3VUIA 5F9EA 4TXCA 1BUHA 2P2HA 2ZB1A 3MY5A 5ACKA 4CLIA 2C5VA 4DLIA 5BUIA 4HZSA 3UQCA 4F7JA 1ND4A 5BVEA 4GG7A 2XNGA 2BUJA 3AC5A 5AP7A 4FKSA 3VBXA 3LJ0A 5D12A 3ROYA 4CQGA 4DITA 3QZGA 4QP3A 4TL0A 3CJGA 3NIZA 4CMUA 3GCQA 5CSVA 2B4SB 2PWLA 2RKUA 4QMVA 3RMFA 3OBJA 2X6EA 3KKVA 4RLKA 3CLYA 2ITVA 5ANJA 4F9WA 1QPJA 3GQLA 3MY0A 4AACA 2OLCA 4CRLA 1Y8YA 1UWHA 2WMBA 1PJKA 4KS8A 5K5NA 5KMLA 3F5PA 3MB6A 4FTAA 4QMTA 2XYUA 4BCJA 4EUUA 4JQ7A 2DYLA 4XRLA 2OFVA 2PUUA 4AT4A 4YZMA 5TOZA 3O8TA 4BY9E 3RK9A 3U4WA 2RGPA 4OUCA 1VR2A 4J99A 3P4KA 1LP4A 5JFVA 2XJ1A 3PG3A 5CEKA 1TQMA 1YWNA 3DBFA 3Q5IA 3V04A 3ANRA 3F3UA 3R00A 4EK8A 3BYOA 4NWMA 4HPUE 3WYYA 3EH9A 3DZQA 2RFNA 3FJQE 3UG2A 2ITYA 4QP2A 4BDJA 3LCKA 3C4CA 2W0JA 5CEIA 3UE4A 5CSPA 2JKQA 4NEUA 3HA6A 4ZSEA 1H1RA 4IMYA 5A6OA 4IC8A 1IEPA 4FIHA 2PUPA 3FLZA 5IH5A 2BVAA 3H0YA 5G1XA 3RCDA 4TNDA 4R3RA 2ITQA 1IASA 4DHFA 3SXSA 2OI4X 4F7NA 4ERWA 2C1AA 3GB2A 3OD6X 3M2WA 4L45A 3OC1A 5JSMA 2P33A 4FEUA 2VO7A 3ORZA 4GW8A 2QOIA 4DA5A 3NAXA 3AT2A 2PSQA 3PUPA 3D5UA 4YLKA 5A4EA 3C5UA 3R1YA 2WMWA 4FKVA 4KINA 4WHZA 5C4LA 4TZRA 2X0GA 5EI8A 3KXZA 1R1WA 4G5PA 3NCZA 3DXPA 3F69A 5EM6A 2XIRA 5AUXA 2NRYA 4FF8A 2WOTA 4GJ3A 2OH0E 2XRWA 2HELA 4X21A 4RWLA 5LJJA 2BZIB 4HCVA 4AGCA 4NH1A 3VIDA 4XG7A 4O0YA 2X7GA 2JC6A 4ITHA 3QTXA 4GV1A 4J8NA 4WIHA 4FSMA 4EYMA 5CAPA 4FZAB 3QYWA 5J9LA 5HICA 3R7IA 2WMTA 4O38A 4XBRA 4M7IA 4ASDA 4FV9A 3PPKA 3BLQA 5HBJA 4KBKA 5EYDA 4AXAA 2F4JA 4JDHA 1KUTA 4C37A 4U3ZA 5FEDA 2OJJA 3ZO2A 3GU8A 4AGWA 4ZZOA 3TM0A 2CJMA 4RBLA 4FVRA 3N4VA 4M14A 3S1HA 4FKRA 2BFXA 4X2KA 3V8TA 2BKZA 4E26A 4EUTA 4PDSA 3WF7A 2XYNA 2R3KA 4BN1A 4QPMA 3F2RA 4PNIA 1YXTA 4C61A 3SLSA 4BCOA 5IUIA 4NL0A 3N4UA 1H24A 2C3IB 2CKOA 1G8AA 4S31A 4F1MA 3D7TA 4B0GA 4AE9A 3LFAA 3ORPA 2PZYA 3CKXA 3R02A 3UVRA 2Z7QA 3WE4A 3RAKA 1VYZA 2YJSA 4J98A 4NIFB 3LCDA 1Y8GA 4O0WA 5JFWA 4O1PA 1MRVA 3WBLA 3NUUA 2HZNA 3TIYA 4W8EA 5K9IA 4ZJVA 2ZMCA 1J1CA 4FUXA 4IQ6A 3CC6A 5DR9A 2A2AA 3FWQA 3R0TA 3BV2A 2UZVA 4PMTA 4FC0A 2OZAA 1NT2A 3UZRA 3LXPA 2QG7A 4I6HA 3L9NA 1UKHA 2UW6A 4WSQA 1V0OA 4R77A 3HAVA 3RJCA 5HVKA 3ZHPC 4AE6A 2XK4A 2ZDUA 3IW8A 4XEYA 4XX9A 3TN8A 4YZCA 3QQGA 2QO9A 2RL5A 5I9VA 5EDRA 2F2CB 4BCFA 3D5WA 4N4SA 1BYGA 2O3PA 4V04A 4WA9A 5J8IA 5CENA 2CCHA 2QCSA 2JIIA 3HMPA 4MNEB 4V0GB 3LE6A 3HA8A 4RWIA 3V01A 1JKKA 2C0OA 4C02A 2G1TA 4O0XA 2RFSA 5T3QA 4RC3A 4QMZA 3QD3A 4ASXA 4H1MA 4MD8E 4WNOA 3AMAA 1SNXA 4O2ZA 1R0PA 2GS7A 3LFEA 1PXMA 4IANA 3FI8A 4USFA 4NJDA 2QR8A 4QQJA 2HXLA 2VWZA 2X8EA 3TV4A 2ITXA 2UW0A 2W1EA 1YQJA 3U55A 4YZDA 3BKBA 1OI9A 3ZONA 2R0IA 3NVMB 3UOLA 3VUHA 4IAZA 4ZSJA 3C4EA 3WYXA 2PVYA 3A99A 4ZY5A 3MVJA 3V5TA 1JOWB 1XH7A 4DGLC 4EEVA 1H27A 4M12A 3A8WA 4EOKA 3RK5A 4G6LA 3LPBA 4P5ZA 3SC1A 3NYXA 1ZYDA 5AP0A 1LEWA 1P5EA 3R8MA 3MDYA 5IEVA 3DCVA 5FXSA 4Z7GA 2IZRA 5ETFA 1URCA 4OBOA 5B2LA 3VQHA 5KMIA 3G0EA 1Q97A 1PRYA 3DNEA 4A4LA 3RPVA 4ITIA 3POOA 2YCRA 3F2AA 2E9OA 2VGOA 3DKFA 4I4FA 1UNLA 2B1PA 4UN0C 4KIPA 2NPQA 2EUFB 4TKSA 1R0EA 2XKFA 5AR3A 4IVDA 4QOXA 2I0YA 3UPZA 3QKLA 5KMOA 2JKMA 4JBPA 1OL2A 3VF9A 3P1AA 4N57A 3A7JA 3C4ZA 3QQUA 5KMNA 4FZFB 3F61A 3LZBA 4JG8A 2B9IA 3G5DA 3NNXA 4AOIA 1YRPA 4X2JA 5E9EA 4BI1A 4F9CA 4FZ6A 5CEQA 5FD2A 4G3FA 3H4JA 4FOBA 2B53A 5AUYA 4I5HA 3VUTA 3ZU7A 1OBGA 2QOOA 3FZSA 4EKLA 3HEGA 4GVJA 4RIWA 2JDOA 4D9UA 2JBPA 2QOKA 3MFTA 1E9HA 3EYHA 3I5NA 3VW8A 5AUTA 2ZB0A 4C35A 5FQDC 3M1SA 2YCSA 3BE9A 5FG8A 5EHYA 4FMQA 4GJ2A 5CASA 5IA2A 2X2MA 3QLFA 3PPZA 3L8SA 4F63A 5J1VA 4GEOA 2VZ6A 1YXVA 3QTUA 1PHKA 4QNYA 4Y95A 4ANMA 4OBQA 4DEBA 3FMNA 2GCDA 2Z7LA 4WNKA 1V1KA 5HO8A 5M06A 3MA3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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