3JS2A

Crystal structure of minimal kinase domain of fibroblast growth factor receptor 1 in complex with 5-(2-thienyl)nicotinic acid
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
302
structure length
295
Chain Sequence
ELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel fibroblast growth factor receptor 1 kinase inhibitors by structure-based virtual screening
pubmed doi rcsb
molecule keywords Basic fibroblast growth factor receptor 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 295
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3js2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3js2A01
4RJ6A 2Y4IC 3BHHA 3FLNC 1G8SA 5EK7A 2YM5A 4FV3A 3W8LA 4E4MA 3NYVA 4NM5A 4U9AA 3UP7A 5K5XA 1JSTA 4HCUA 3R83A 4AA4A 5EQEA 2WTCA 3LXKA 3VBXA 2X39A 1BI7A 5CS6A 3BZ3A 3ZFMA 4BYJA 3SQQA 3DAEA 4X2NA 4FTMA 4TYEA 2ACXA 5H8BA 3VUMA 2UW5A 2EXMA 2OIBA 2YM3A 4DN5A 3NVKI 1P14A 3C50A 4F64A 5IQEA 4YR8A 3ROYA 5AUUA 3F2AA 2O8YA 4N70A 2SRCA 4IAZA 1JSVA 5EOBA 4HJOA 2CGUA 1H0VA 3QTIA 3D7TA 3MGYA 5IPJA 3A8WA 4CZUA 4QMNA 4YMJA 2PL0A 4L6QA 1BLXA 4ASZA 2G2HA 3PIYA 2DUVA 3KRLA 4QPAA 4F9WA 5I5ZA 2WTWA 4FGRA 3BLQA 4ZZNA 2HY0A 3KULA 3CE3A 4DCEA 3PA4A 2R4BA 3EH9A 4WA9A 3VF8A 3NGAA 3V5PA 4KRDA 4BDGA 1GNGA 1TVOA 2WTJA 1X8BA 2PMNX 2ZAZA 3PA3A 3BYOA 4D1XA 1F5QA 5CAUA 4E6CA 1I09A 2CCHA 5ANDA 1H1WA 2RL5A 4L53A 2ITXA 4O2PA 2C5VA 4FG9A 4G9CA 4X3FA 4D2RA 2A2AA 4D0WA 3BX5A 4ZY4A 3C4EA 3NIEA 2QQ7A 3QKKA 4FK3A 4RLKA 4G17A 4EHGA 1XO2B 3TNQB 5DMZA 4DGGA 3IOKA 5HICA 3MJ1A 4FG7A 4AP7A 4UMPA 5E8YA 4O27B 4RVTA 3WF8A 5IA2A 4XP2A 5K0KA 3NS9A 2JKMA 4O0XA 3DTCA 4XCUA 4UZHA 3VNTA 3SVVA 3R6XA 1FOTA 3VUKA 3CS9A 2A1AB 1Q97A 3QKMA 4V01A 1M17A 3TNWA 3UG2A 4DYMA 3MH0A 2GS6A 3HV5A 4V04A 4JDKA 3MV5A 3R8LA 2YZLA 2I0EA 3KMMA 2QOKA 1OUYA 4F7LA 1XBBA 4AE6A 1JSUA 4BF2A 3VRYA 2OXXA 3PY3A 3R7GA 2C5YA 1W0XC 5A46A 1ZYCA 4RVKA 5EW8A 1B39A 2VRXA 2E2BA 2WQEA 1ZRZA 3GCSA 4IVBA 4ZP5A 4LYNA 5CVGA 5J87A 4DH5A 3O17A 3LQ8A 2OF2A 2AC5A 4C0TA 3UVPA 4UV0A 2OH0E 3MIAA 3OY1A 5IUGA 4AT3A 2I40A 3TJDA 3QQUA 2GNHA 5ACKA 4BKZA 5A6NA 3OC1A 2NRYA 3EYGA 3VHKA 4TYHA 2Y8OA 3S3IA 4XG9A 2C6IA 5HG5A 3UODA 3OROA 5HBHA 3ZO3A 4PNKA 4RIYB 2CN8A 4AW2A 4C38A 1QCFA 3PVBA 4H1MA 3QAME 4JAJA 3JY9A 3DKGA 3QQKA 5FLFA 1E9HA 4GIHA 4RWJA 1S9JA 1TQPA 4QYEA 3VW8A 2Z60A 3DBEA 4ITIA 4D28A 3GQLA 2W4JA 1KWPA 4PMTA 5EW9A 4FKTA 2ZDTA 4FR4A 3MJ2A 2VTHA 2J9MA 3LM0A 2UVZA 3R1QA 4YJPA 4C2VA 4OTGA 2ITNA 5D41A 4EC9A 3QLFA 2X8DA 5E8ZA 4RPVA 4UX9A 3FQHA 4L52A 3QCYA 1REKA 2W0JA 4W4YA 4FTCA 3OWLA 4G5JA 4F9BA 5FBNC 4BGGA 3MPTA 5JK3A 2R3IA 4FKQA 2P55A 2W1CA 4CG9A 4CSVA 3EN7A 1YDRE 3KF7A 2E9NA 2QOOA 5TE0A 2WELA 1ATPE 4DFUA 4FUYA 2C30A 4YTCA 3LCTA 2BDJA 4QOXA 4YBJA 4FMQA 4H3PA 5L2SA 4EL9A 4P5ZA 3DXPA 2VNYA 4YJVA 5A4QA 4XEYA 4N57A 3CD8A 5AR2A 2NNWB 2LGCA 3OWPA 4EQUA 3KVWA 3ZTXA 3KMWA 4ZY6A 4ZJIA 4B0GA 5KMOA 3VAPA 4RC4A 3KCKA 5IA3A 3OW3A 3ORPA 5AP3A 4MKCA 1GIHA 3VJOA 1H0WA 4NJDA 4J7BA 3WARA 3P5KA 2YIWA 3DXQA 3IOPA 4FIHA 2JFLA 4U40A 1RQQA 3IECA 2X4FA 1GZ8A 2VO3A 2X2MA 2IVVA 4EHZA 5HTIA 3DK7A 1GY3A 1KE7A 4BZOA 4UZDA 3T3UA 1J3HA 1OB3A 3KN6A 3PPKA 5K0XA 3CLYA 5EYKA 2W4KA 4IVDA 1HCLA 2JFMA 1YVJA 2RG6A 1H25A 3MYGA 1HCKA 3NEWA 5ETFA 4MQ2A 5CAQA 4FZFB 4FEWA 4M84A 5EQPA 3P9JA 5CU2A 4M15A 4MD8E 4GSBA 1JKKA 3FWQA 4MNEB 4AW1A 5KMLA 4FKVA 4R3RA 5AAGA 4I20A 4TN6A 3JVRA 3AC2A 2BPMA 3CKXA 4PTEA 4OT6A 3COMA 2FGIA 3K3IA 4IJPA 2PUUA 3UO6A 1NT2A 3D5WA 3BQCA 1M52A 3UG1A 3OEZA 2CMWA 3VRZA 4AG8A 4GU6A 4BWXA 5LMKC 3DV3A 1U54B 3BLHA 4NIFA 3DFCB 3QGYA 4I23A 2XNNA 4Z55A 3EQHA 3VIDA 1OBDA 3QUDA 4KB8A 3QX4A 2B9FA 2EU9A 2G2IA 3BBTB 3PJCA 4I94A 5CXHA 4E73A 2JIUA 4FIFA 4EHEA 3S1HA 2KULA 1TQIA 2OU7A 3SG8A 4R78A 3C5UA 4EWQA 5L3AA 1CTPE 2REIA 4DHFA 3MPMA 4ZSLA 3GCUA 3VW6A 2PMLX 4EZ7A 2B52A 2V55A 3F3WA 3FI2A 4CEGA 4D4YA 2VWYA 4FX3A 3ITZA 3UIBA 1P4OA 5FUTA 1JPAA 4F9CA 3A99A 4K6ZA 4WHZA 2CNQA 3R30A 4RT7A 3RI1A 4AFEA 1R78A 2CNUA 1RE8A 4H1JA 2GS2A 5DLSA 4YNOA 4EH7A 1BUHA 4DGNA 4XNEA 2QNJA 4C37A 3HZTA 5FDXA 5M06A 1YXVA 2OH4A 4LG4A 2IW8A 5AADA 3NUPA 4D1SA 4BTJA 4FT9A 2FSTX 3IW6A 4C62A 1Y8GA 5IH6A 5K9IA 4BCFA 1PXOA 5DIAA 1Y57A 2QG7A 2XNOA 3UZRA 5EI8A 3VF9A 1ZZ2A 4IAIA 5E8XA 5IF1A 1IRKA 4JQEA 4CRLA 4E6QA 4OGRA 2B53A 3NRMA 4O83A 1FVVA 3EQCA 1R0PA 2HENA 3QD3A 5HE2A 4FKGA 3QLGA 4IAKA 5G6VA 3EQIA 3Q9XA 5HO7A 3PP1A 3OW4A 4MD7E 2WTVA 1YI3A 3OT3A 3Q4UA 3BHTA 3LCSA 5CSVA 2PWLA 3R8UA 3KU2A 5HE3A 5JZNA 5A54A 3OG7A 1PRYA 2WXVA 4F6UA 4USEA 1O9UA 3LE6A 3LMGA 3MSSA 2YISA 3MY1A 4DH1A 3OUNB 2XIYA 4FODA 2X6EA 4HOKA 4I24A 4TYIA 3H30A 4YZCA 5AJQA 1ZARA 5HVYA 4ANOA 4O7RA 3W2QA 5GIOE 4E5WA 4YZNA 5AP6A 3EZRA 5AV2A 3GC9A 2VTAA 1OL2A 1W7HA 3OVVA 3QZHA 2UUEA 4LRMA 5J95A 1FVTA 2PULA 4HGLA 4R7BA 2WMSA 3ZXTA 4DTBA 1YQJA 2QOQA 2YLFA 4OR5A 5HCXA 4DFBA 4WNOA 1KE8A 5H2UA 5FXRA 2ITQA 3NNWA 1ZYJA 2VWXA 4Y73A 4FVQA 2PE1A 1IAJA 4EH2A 4FA2A 3F5XA 4F9AA 3P4KA 4RIXB 3FUPA 1AQ1A 3K54A 4LOQA 3R7OA 5LMBA 1Y91A 4ID7A 4BCKA 3BBWA 3ZYAA 4E7WA 2JKKA 5JQ8A 4CYIA 5E4HA 4QNYA 5CASA 2VTOA 3G51A 3FEGA 2XM8A 4C7TA 4BCPA 3F2NA 3DAJA 1HOWA 2Z2WA 4G31A 5IDPA 4CMUA 4QP4A 5C8MA 2O5KA 4O7TA 3G33A 4S2ZA 4YLKA 3AG9A 4BZNA 5F9EA 4JDIA 3UQCA 3NVMB 3FMEA 4WNPA 3U9NA 2ITVA 4KKHA 3GENA 3LFBA 5A14A 5H3QA 4ANNA 4D4VA 2EWAA 4RA4A 3SG9A 2BZIB 3C0HA 4G6LA 2QD9A 4L67A 4S33A 5CU3A 2F57A 5JFXA 1WBWA 3ZUVA 4EOSA 3UMWA 4CRSA 4IMYA 1Q99A 3WZUA 3FKLA 1ZOHA 5EKNA 2GNLA 3KB7A 2XNEA 3LMIA 1CM8A 1Y8YA 5CAOA 3PYYA 5DA3A 1QPDA 1UKHA 3PPJA 3O0GA 3PVWA 4I6QA 4IX4A 4HVIA 5J9YA 3UBDA 3L1SA 4BDCA 1YI6A 4YUQA 3AC1A 1PF8A 3ID6C 2FB8A 2QONA 2F4JA 4BYIA 1IASA 5J9LA 2YITA 5KZ0A 2OFVA 3OP5A 4NCTA 5DR9A 3FXZA 3RCDA 4AA5A 2PTKA 3D94A 1OGUA 4DGLC 4KUJA 4PWNA 3IW8A 1OKZA 4FKPA 4L7FA 4RX9A 3OXZA 4EH6A 5KMKA 4O7LA 4GK4A 3AGLA 4TYGA 4MXZA 3SGCA 3MBLA 1WBNA 2VTTA 3DB6A 5KUPA 3NUUA 1DM2A 4W4XA 3TT0A 2YIQA 3ZO4A 3CCNA 1XBAA 3UPXA 4UWBA 4E8AA 2JD5A 3GU7A 3OS3A 3QQLA 5IA5A 1YHVA 5CWZA 3P86A 5GNKA 4DFYA 2VNWA 3ZHPC 4FSRA 3UOJA 2QCSA 1FBNA 4L44A 4AGCA 4I4FA 2QHMA 1ZY5A 2PE2A 3PSBA 4GT3A 4RVMA 3ET7A 4AA0A 5KBRA 2J0IA 3AC3A 2WZJA 4FYOA 4I5HA 4MQ1A 2RFEA 2WKMA 3UGCA 2OF4A 4BDEA 1OITA 1G5SA 4PNIA 5CEKA 1ZOGA 3H4JA 3Q4ZA 4JQ8A 3F82A 2E9PA 1MQBA 4QP1A 4K0YA 3JS2A 3NR9A 1URWA 3SLSA 4IAFA 2XP2A 4IAAA 2GQRA 5M55A 3FLWA 1R1WA 3IQ7A 4R8QA 3RNIA 4DEAA 5J7HA 3FQEA 3VQUA 4YJOA 4AOJA 2BMCA 4ACCA 4BCNA 4C3PA 3NPCA 3W2CA 4AN9A 3CQWA 2F9GA 4U3ZA 2OO8X 3G6GA 4G3CA 3CKWA 4I41A 1YOMA 5IA0A 3S0OA 2W1FA 3L9PA 5HG9A 4DEBA 3QA8A 3R7EA 4Q9ZA 1J7LA 5FXQA 3ZFYA 5EDRA 3WZKA 3KXHA 2YCFA 4QMTA 4R1YA 5IH4A 5AIRA 4L46A 3OCTA 3LFAA 2JAMA 4O91A 5GZ9A 2IJMA 1XWSA 3AMYA 4ALUA 4PP7A 3UPZA 4O82A 3ZSIA 3G0EA 1NY3A 4W9WA 4XLIA 3ZLXA 4MXXA 3QD4A 3DB8A 1DS5A 1OI9A 5CEQA 3SHEA 1H1RA 3DU8A 4FL2A 3SOCA 5JMSA 5KKRC 2PK9A 2WEVA 4XG6A 3LQ5A 3ZOSA 4NJ3A 4PMPA 3NUXA 3VULA 4LQMA 1ZWSA 2ZV8A 3UOHA 4B8MA 2V0DA 3OXTA 3VUIA 3AGMA 4ZTMA 4EOMA 2F7EE 4DT8A 3CP9A 4S32A 3UIXA 4CD0A 1XKKA 2BHEA 2JEDA 2PZ5A 2W96B 4TRLA 2A19B 2FVDA 5FM2A 4QMUA 3EIDA 2B54A 2KTYA 4U43A 4EQMA 4YTFA 5AA9A 4NUSA 4YC3A 2PMIA 1Y6BA 1XH5A 1YXTA 2OBJA 3KEXA 3ZRKA 3PRIA 4A9SA 4F0GA 5DHJA 4HNIA 4E4LA 5JKGA 4ITJA 4UY9A 2C0IA 2C5NA 5EHYA 3G90X 2C6LA 3DS6A 3KXNA 4RWKA 3RINA 3Q5IA 4CTBA 5AV1A 1GIIA 2C4GA 2C6KA 2LAVA 3CY3A 4OT5A 4EKKA 5CEIA 3FLYA 3BGPA 3LW0A 4BFMA 4F6SA 3H10A 4M69B 2O63A 1WBOA 4QMMA 4QMVA 1UNHA 1H4LA 5DR6A 4DEDA 5ICPA 2DYLA 4PQNA 2J6MA 4J98A 1LP4A 4YU2A 1SM2A 4AZTA 4MAOA 5FM3A 4G2FA 5M53A 2Q0BA 2XNGA 2GDOA 2PZPA 4QP2A 2PUIA 1DAYA 2F7XE 4IM0A 3UNZA 2ITZA 3TKHA 1ND4A 4L3LA 2UW3A 4YZMA 4Y83A 5LXMA 3QZGA 4FVRA 4PPBA 3UP2A 4DFXE 4XG8A 5JGBA 4O7YA 4XG3A 5C27A 5LCKA 1BMKA 2XA4A 3Q3BA 5LMKA 3NAXA 3RAKA 3KRJA 3BGQA 5A3XA 5JZJA 3FDNA 3FSKA 5AX3A 2X8EA 4BCJA 2VTMA 4KABA 3ZM4A 3EOCA 2JKQA 5EW3A 3FMKA 3POOA 3QQGA 5C4LA 1Q8YA 2UW4A 2W9FB 4MVFA 3A4OX 2GTMA 2QOHA 4IZ7A 5EFQA 1OIYA 1YW2A 5CU6A 3U6IA 5K4IA 2X1NA 4NH1A 5DH3A 3PRFA 4S31A 4BY9E 3VQHA 4Y46A 4YSMA 4YHTA 4O7WA 3MVMA 3W2PA 4CT1A 1Q3DA 3V5QA 4EK5A 4HYIA 3MI9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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