3JVRA

Characterization of the chk1 allosteric inhibitor binding site
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
271
structure length
258
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of the CHK1 allosteric inhibitor binding site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 81
structure length 258
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3jvrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3jvrA01
4KABA 5FM3A 3U9CA 1WBVA 4NU1A 4XH6A 1NA7A 4HGTA 1B38A 4YJOA 5DGZA 5HVYA 3VBQA 3OVVA 5TR6A 5CALA 3NR9A 4DFBA 2XK9A 4BIEA 5CZHA 2V62A 4DF3A 1IEPA 3TV6A 2VTRA 3ATSA 4EZ5A 3QLFA 4RZVA 2OWBA 3HGKA 3GU8A 5CSVA 5FP6A 3LCOA 2VWUA 3GOKA 1OPJA 2ZV7A 4N70A 4FA2A 1OIYA 4DINA 3FY2A 2PYWA 1QPDA 4OAUC 3DB8A 3PG3A 2WTDA 2YLEA 3AXWA 1P2AA 2XF0A 4FT5A 4G3EA 3DJ6A 3FC2A 3RAKA 2XK6A 4GIHA 3VHKA 5TO8A 2OK1A 4GT4A 3L8XA 5J87A 5E1EA 4EOJA 4ZJVA 3W10A 5BYYA 2CGXA 4QQTA 4NM3A 5FP5A 3VW8A 3O96A 4BWPA 1NT2A 3BWFA 4J1RA 2CKPA 4BCPA 3MPTA 3D5UA 5L6WL 4HPUE 4ZTMA 5AR2A 4R3RA 1BKXA 3I5ZA 4CEGA 3SXFA 2JIVA 3IGGA 4X0MA 1ZMWA 4O7YA 3K5VA 2F7ZE 2PMLX 4J7BA 1ZARA 2B9IA 4OTWA 4DEGA 4O91A 4FV3A 3F2RA 2C5OA 4IX5A 5HLNA 1OUYA 2W1FA 2OLCA 4UWYA 2G2FA 3MFTA 4W4XA 4MHAA 3O8PA 2EB2A 3FI4A 4OTHA 2Z7QA 3ORIA 3DKFA 4M0ZA 4LMUA 3U51A 4BDGA 2G9XA 2VNWA 3BU6A 5CF6A 5DRDA 3ZO1A 5CF4A 4CYJA 1GZKA 3VRZA 2VTNA 3FZOA 4MAOA 5IISA 2VTLA 2BDJA 4R7IA 3WYYA 4BR3A 2UW3A 3MJ1A 4O7LA 2Z7LA 5IH4A 2IO6A 3R8UA 4HPTE 4GG5A 3DXNA 4FTJA 4ITJA 3ZU7A 3WIKA 2NP8A 3ORPA 4YJSA 1OKWA 2OIQA 4FKGA 1J1CA 4PMMA 4GJ2A 4E6CA 3BYUA 2GCDA 2XCHA 1PXKA 4G34A 2QNJA 3PPZA 4F7LA 3C4FA 2BIYA 4YZBA 3FMHA 5CU2A 4BCFA 3R7UA 4AOIA 3SQQA 3Q2JA 1P4FA 2B7AA 4QMNA 1JSUA 4DE4A 3KMMA 3AQVA 4KBKA 4FTTA 5ACKA 1WBSA 4P2KA 3CQEA 4QP3A 4BCGA 4NFNA 4I5CA 4J98A 4F9WA 3PE1A 4U5JA 4X7QA 2EWAA 2UW4A 2J50A 5E8VA 2OJ9A 3A61A 4RA4A 5JZNA 3TEIA 2DYLA 1V1KA 4E5AX 5IEXA 1OECA 2PZPA 4N57A 5C4KA 5TKDA 4EWHA 2W7XA 3EN6A 4BDDA 4NYEA 5KKRB 2CLQA 2WNTA 1BLXA 4D4SA 4IZ5A 5KBRA 1XBAA 2CLXA 1W0XC 3PUPA 2ZM4A 2BRNA 3EYGA 3PXZA 5HZNA 3E87A 3SC1A 2UZBA 5AP3A 5HTIA 2WMUA 3HP2A 4X21A 3H9OA 4IB1A 3E8NA 4FV9A 4JBQA 3NYXA 2UW6A 4RWLA 4JIAA 4BBMA 2GHMA 4U41A 4LRJA 5D12A 4L3LA 2XYNA 3TXOA 4D2VA 1Q62A 2QHMA 5BVKA 3LW0A 1MQ4A 2C3LA 2R4BA 3D7TB 5IA2A 4D2TA 4IC8A 1JOWB 3AC4A 4IAAA 3I81A 3PYYA 5LVMA 4UXLA 5L2IA 4ZIMA 2IVUA 3ITZA 3MESA 2OF4A 1AD5A 2W17A 2ITUA 4M84A 4RVMA 4ZSLA 2P3GX 3MW1A 4EBVA 3EQDA 5CNNA 5CNOA 4ZZOA 5JFVA 4LGHA 4EH2A 2HIWA 4HCUA 3WI6A 4D1SA 3GCSA 4NKAA 4FC0A 3AC8A 4J97A 1V0BA 3FI2A 1SMHA 3F7WA 4IQ6A 4NFMA 3N4TA 4OGRA 4NW6A 3WF8A 2G15A 5E92A 2NO3A 3JXWA 4FI1A 4F7JA 4U6RA 2OKRA 4FIHA 2WTCA 4V05A 4L53A 4X2FA 1V0PA 1UU8A 5J79A 5L4QA 3R30A 4Z7HA 3GOPA 1PKDA 4DFYA 1WBNA 1R0EA 3O2MA 3QQUA 3VUDA 2CCHA 3VBVA 2KULA 4FTNA 1ZAOA 4NW5A 5AV0A 3C7QA 3L1SA 4DN5A 2W4KA 2BZJA 2GNHA 1NXKA 4WRSA 2WEVA 4KS7A 5BYZA 2RFSA 4KUJA 2F57A 1XKKA 2UV2A 2IG7A 2VO3A 3NAXA 1H1SA 4QMQA 3Q4ZA 3KQ7A 3QL8A 5FG8A 2H6DA 4G9RA 3QGYA 4A07A 1IRKA 4ID7A 5D9HA 4GU6A 4IWDA 2YWPA 5GZ9A 4IE9A 3TZ8A 5CSPA 1W98A 2I6LA 3LOKA 4ALWA 2E9VA 5FRIA 3DJ5A 3NUXA 3A62A 3GFWA 4IVCA 2Y8OA 3LZBA 4WSQA 3DTWA 2VGOA 1OL1A 3NYOA 3V8TA 3CTJA 2BRBA 5FDXA 4PY1A 4I20A 3TUBA 1LPUA 4PV0A 1PXMA 5EYCA 4G1WA 4WG4A 5I9WA 4IM0A 4ZMFA 3NYNA 1MP8A 2CKEA 4O0SA 2LGCA 3ULIA 4LOOA 3V6RA 3F2NA 3IW5A 3NW5A 4G6LA 5HG5A 3U6IA 2AUHA 3W1FA 3MB7A 1YRPA 2ESMA 3HNGA 3QX2A 3RPSA 5JFWA 2YZAA 1KE7A 3Q6UA 3RHXA 2YIWA 1F3MC 2NRYA 3L8PA 4WSYA 3PVUA 3ZO4A 3TDWA 5BVEA 1AGWA 2VWWA 4TYEA 1DAWA 1W83A 5I5ZA 3KRRA 5HNIX 3AG9A 3GBZA 4EOSA 3GCQA 2OIDA 4K77A 5AFVA 2IVSA 1OL2A 2R3FA 5ETIA 5KMJA 4RT7A 4R5SA 3LMGA 3Q9XA 4FIEA 3R7OA 2VWXA 4JDKA 4F9BA 4JQ8A 4EH6A 4X3FC 4O86A 2QOOA 3P7BA 3CD8A 3GXLA 3IG7A 5A4EA 3LQ8A 1PW2A 5IH5A 4ZJJA 2Z2WA 5EH0A 3KRWA 3KGAA 4I21A 2WXVA 3BELA 4PL4A 4V01A 5HQ0A 3QGWA 4LFIA 4MTAA 4DFUA 2I0VA 2I0HA 4MBIA 4GJ3A 4NJDA 4A4OA 3V5QA 2DUVA 4Y72A 2PUPA 4JNWA 3FLQA 3QKKA 1OI9A 1X8BA 3QQHA 4HYUA 4PNKA 3DBEA 2R3RA 4AW5A 4DH7A 2G1TA 5ANIA 1PRYA 2A27A 4TYHA 3VQUA 4CT2A 3BZ3A 4FEXA 5J1WA 4DHFA 3E3BX 4ZY6A 1SNUA 4EQMA 2YWVA 3FXWA 3I0QA 3QRJA 4FV0A 1UA2A 4AGWA 1MRYA 3V6SA 4M67A 5IEVA 5CAUA 2CGWA 3TV4A 2OFUA 4PDYA 3C0HA 4GYGA 2HW6A 1BUHA 4IAYA 4TPTA 3ZDUA 4C59A 4I5MA 4IB5A 2XYUA 4ONAA 4C3FA 4EJNA 2YAAA 3UC3A 1BX6A 5HO7A 2PTKA 2RG6A 3COIA 3OHTA 4UZDA 4YZDA 5AMNA 3T3VA 3ZRLA 3ZUUA 4F65A 2ZV2A 1GOLA 4M0YA 4F1TA 3LCKA 3CPCA 4GK2A 3Q32A 3O50A 4G3DA 3A2CA 1ERKA 4FTLA 3LCDA 3ZSIA 3QALE 4GK3A 1EH4A 4AACA 3UO6A 4O7ZA 3ACKA 4GYIA 2PUUA 2YM6A 2ZAZA 5FWKK 1M2PA 1BMKA 1Q99A 4Y8DA 3OUNB 3FSKA 1YWVA 4WNPA 2PVLA 4K6ZA 3NZ0A 4C62A 3UIMA 5E8ZA 4NJ3A 1M7NA 3CXWA 5F4NA 2YZLA 3UG2A 5K9IA 1JKKA 4B99A 3U6JA 3MFSA 4MQ1A 3EN7A 3R7GA 4A9SA 5EKNA 4MBLA 3D5WA 4S32A 3FXZA 2QO9A 3JY0A 4AFEA 2ONLC 4U40A 2VD5A 5C8KA 2VO7A 2XH5A 2YISA 3MS9A 2X8EA 1ZRZA 4KIKA 3FZPA 5L2TA 4DFNA 4G6OA 4YSMA 4AZTA 3OWLA 4TNDA 4UB7A 4CCUA 4RA5A 3VS6A 2WQOA 2HZIA 2XUUA 3W2RA 4YLJA 3TNIA 4GV1A 2C47A 4ALUA 1M2RA 1ZY4A 3ORZA 1PMUA 3ULZA 4QP9A 2DWBA 4AT5A 3ORKA 4HGLA 3RNIA 3DAJA 2BIKB 4YJRA 4C4HA 5HG8A 4D2WA 1APME 3GC0A 4CLIA 1ZMUA 3TIZA 4BDAA 2B4SB 5HOAA 1WBPA 3LAUA 3SXSA 2BZHB 2PMNX 2XIYA 3QX4A 2QOLA 4A9TA 3HV4A 4UALA 1ND4A 2EXCX 4LGDA 2XNPA 3WBLA 4EK6A 1Q8TA 2CMWA 3HMPA 4L52A 3GU4A 3BRBA 4RIOA 2OZOA 2X2LA 4U97A 5AAGA 5KKRC 4G3FA 4RJ3A 5AEPA 2W5HA 5HU9A 2XKFA 4FODA 2XS0A 5H3QA 4C8BA 4XG9A 3VHEA 2IZUA 3NWWA 3R22A 3BHHA 5DHJA 4BZNA 1BI8A 3BGPA 3DKCA 4FKIA 3E62A 5CY3A 1KWPA 4F0GA 2QOKA 5AP4A 3TTJA 1OUKA 5ANEA 4PTGA 4FIJA 4DH8A 1NY3A 3FHRA 3DNDA 3KF4A 4ZMEA 1TQIA 3ORLA 4QP6A 3T8OA 2B1PA 5DEYA 2NRUA 3MTLA 1L8TA 4QPMA 3OTUA 1GAGA 2FSMX 1K9AA 3GU7A 3R1NA 3Q3BA 3QQGA 4CV8A 5IA4A 5FUTA 1WMKA 5E8YA 1H08A 3V8WA 2XNEA 3TNHA 5FBOA 4DGOA 2J2IB 5HBEA 4JR7A 1DM2A 4YJVA 4BI2A 5CEPA 1Y8GA 1YW2A 3BWJA 4IACA 4IWQA 4QMLA 3D7ZA 5IKWA 2R3JA 3I1AA 4R5YA 3VS5A 2ZOQA 3NAYA 4EI4A 2VU3A 3LE6A 4PF4A 1GIHA 4IB0A 4QMMA 4RLKA 1S9IA 4B6LA 1UKIA 3EQGA 2YM4A 4ZY4A 3FLNC 5IA5A 3NUNA 1OM1A 2C6MA 4FF8A 4X2NA 3RM6A 2XIKA 4U7ZA 5AP0A 4TTHB 4Z3VA 5JN2A 5HI2A 3UTOA 4CTCA 3OWJA 4O21A 3LCTA 3V5TA 2YM7A 5CXHA 2WO6A 2UZDA 3HEGA 3IO7A 4YLLA 1CM8A 3QRTA 3KK8A 4G16A 4MEDA 2RFNA 4RIWA 4YJNA 3AGMA 1TQMA 3I60A 5EHLA 2BKKA 3WYXA 4AF3A 4F9CA 5CAPA 4QO9A 2R3NA 3UP2A 3FQHA 3SXRA 4BDBA 4YHTA 2W0JA 3TIYA 3IK3A 4V0GB 4FIGA 4B4LA 2UW0A 1GIIA 2XBJA 3GCUA 5J1VA 4MF1A 4FEUA 2FYSA 4IAZA 4XNEA 4XG2A 4ZSEA 3OWPA 3SOAA 1MQBA 3OF0A 2X9FA 1TKIA 3NNWA 2WMSA 4I6BA 3G9NA 4JVGA 4YTIA 4EQUA 5CI6A 3F3TA 4DCEA 5IQFA 3QC4A 2FUMA 2P4IA 4Q5EA 4WUNA 4BDKA 2ITWA 2FB8A 4P7EA 3C13A 3WE4A 1Q8YA 3B2WA 1R1WA 2FA2A 4F70A 3R1QA 3TZ9A 2C6KA 2VTPA 2OJGA 1WBWA 4CD0A 2G2IA 3ZMMA 2QOBA 1OL7A 1RW8A 3UYTA 4FSZA 4MXOA 3VBWA 4F64A 4ZP5A 4QYEA 4X6RA 1A9UA 3RAIA 5ETCA 2X8IA 4CKRA 3LCSA 4ACHA 3IW4A 4JBOA 2Y6MA 3VJOA 3GC7A 5F94A 3SG8A 3PJ8A 4F7SA 3OXZA 5DH3A 4ALVA 5IMEA 3IECA 4O7NA 5CT7A 4KKEA 1YI4A 2BDWA 5IPJA 3UYSA 2IW9A 5AADA 3ANQA 3KMUA 2FSLX 5HKMA 2JBOA 3DK3A 4PPCA 5EW3A 4HJOA 1U54A 2UZNA 4F7NA 1H01A 4O0YA 3HMIA 4MD7E 5IU2A 4GSBA 3R02A 2J5FA 3NW6A 3DDPA 4WNMA 1YXSA 2R64A 4GUBA 5AV3A 3BE2A 4RJ4A 3TKIA 1CDKA 3PDTA 2F7EE 5M4CA 3KREA 3FMMA 4GRBA 3KU2A 4BCHA 5A9UA 3HV6A 4H1JA 4RWJA 2YN8A 3MGYA 3G0EA 4DEIA 1YXVA 4FIIA 4YNOA 4R1VA 2YLFA 4FT3A 2J90A 3MPMA 5KNJA 3AGLA 4MD8E 3UNZA 3HAVA 5FD2A 3PSDA 5AJQA 3SX9A 3GT8A 4KAOA 5K0KA 2XEYA 3PXKA 3NLBA 4YTHA 5C01A 4E4MA 5HORA 4QMYA 4YNEA 3AC2A 4PMPA 2QKRA 4PWNA 2OJJA 4LG4A 2J0LA 3CEKA 3FY0A 3FZSA 3WZEA 4FVPA 4IB3A 4BHNA 2WGJA 3CJGA 2XRUA 5I0BA 2PVNA 2WMAA 4EH5A 5IQHA 4L42A 4L44A 1WAKA 4BDCA 1W82A 2I0EA 5CX9A 3NMUF 4U3YA 3LJ0A 3AD6A 4U0IA 3T3UA 3SHEA 2ZB1A 3II5A 3R83A 2BRMA 2C1AA 4CKJA 3R2BA 4MNEA 3NS9A 4MWHA 5LARA 1IAHA 4R3CA 2X7OA 5M07A 3RHKA 4BCIA 1KE5A 5IQCA 3QWJA 4TWCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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