3JVRA

Characterization of the chk1 allosteric inhibitor binding site
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
271
structure length
258
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Characterization of the CHK1 allosteric inhibitor binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 81
structure length 258
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3jvrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3jvrA01
5L8JA 4ALVA 5HE3A 1P4FA 3MTLA 1L8TA 3GI3A 4O7TA 3D5XA 1E9HA 2EB3A 3IQ7A 5H2UA 1KV2A 3E93A 3U4UA 3EJ1A 4FZ6A 4RWJA 5HBEA 2QURA 4GFMA 4RJ4A 4F6UA 3TL8A 4WSQA 2G2HA 3M11A 1Q8ZA 3CXWA 4MQ1A 4YP8A 1W84A 1YXUA 4HPTE 3EQHA 4BF2A 3JXWA 4NIFA 3TV4A 5GJGA 4GMYA 4F9BA 4PL5A 4QP7A 5K0KA 2IZUA 5DNRA 4PMPA 1UWHA 4U79A 5AV4A 2C6IA 4NCTC 3HDNA 5LARA 4AZWA 4C3RA 4IVDA 3BELA 2PK9A 3QKLA 2GNIA 4O0RA 2CMWA 1FVTA 2XNBA 3GXLA 4WD5A 2BALA 2UZWE 5E8SA 4BCMA 4FNYA 4I24A 3PY3A 4WT6A 3WIKA 5F9EA 4FEUA 4A9YA 2B9FA 3GU8A 4G34A 3NLBA 2C6DA 3LCTA 4XG7A 2XNPA 3NNVA 4RC4A 1UU7A 2UZOA 1ZOGA 4ENYA 4OTHA 3MGYA 3GNIB 4NFMA 3C0HA 5CASA 4ZS4A 1SYKA 3AD6A 3R7OA 4CMOA 1OPLA 4FV3A 2W1DA 2AUHA 4FTRA 4O27B 3RK9A 5FTGA 3A4PA 4ACHA 3OC1A 5CENA 3IGOA 4LMNA 3QD4A 2R3FA 1E1VA 4X2FA 5IG1A 2Y6MA 3FLWA 4NFNA 4DEDA 3N4UA 1TKIA 3KRXA 4S30A 5FWKK 5IDNA 3C1XA 3T8OA 1ZYJA 3KN5A 2PSQA 3MFRA 4KABA 4NYEA 4AW0A 4EC8A 4M13A 5FM3A 1ZYLA 5AUYA 4BDGA 5GIOE 1H1QA 3PSBA 3Q4ZA 4J96A 2I0VA 1PMUA 4XMOA 5A3XA 3QKMA 3E8DA 4N6ZA 3HGKA 1G5SA 5IZFA 2XNOA 3RHXA 3NSZA 2H6DA 4PF4A 4AE9A 3BGQA 5EOBA 3D2KA 5TE0A 3LAUA 2JDVA 4J8MA 3TCPA 4U0IA 2C3IB 3FLQA 4S33A 4HYSA 4YLJA 3ZO2A 3ZU7A 3K3IA 4BGHA 3A60A 1H24A 3UTOA 4D2RA 5CWZA 3ZONA 3QRJA 4DLJA 4IQ6A 2R0UA 2PZ5A 4FIFA 2XM9A 3O2MA 5CZHA 3GC9A 4F9YA 3NAYA 3K5UA 3GP0A 3TV7A 1U54B 3C7QA 3ODZX 4BTFA 3PIYA 3CY3A 2YIQA 4M0YA 3PJ2A 5AUWA 4C33A 5KX8A 1TQMA 1XH4A 3DKFA 3FV8A 3N9XA 1Y8YA 4XBRA 1VJYA 3IONA 4FG9A 4EONA 4RIWA 2RIOA 4AA0A 3BYSA 3PJ1A 4FV4A 2YIRA 3S2PA 5J7BA 2F7ZE 5HG7A 3P08A 5LCKA 4C4FA 2FUMA 4TKSA 5HIEA 3TZ9A 4C35A 3TXOA 1F3MC 2IPXA 3FPQA 3IW6A 1JNKA 1KSWA 4FL3A 4FX3A 1MUOA 2W96B 4LRKA 4QO9A 4EK8A 4BR3A 3OCBA 4F0GA 5HX8A 1LR4A 1R1WA 3UOJA 2WKMA 4MCVA 3DBFA 1F5QA 3ZCLA 4CLIA 1XH5A 2RGPA 4EZ5A 4IBMA 2OG8A 4RT7A 3KCFA 4A4LA 1SZMA 4O7RA 4UYAA 3VRZA 3WZJA 2PZRA 2RFNA 2V5QA 3AC8A 3MYGA 5EYDA 5JSMA 3VS6A 5EYCA 1DAWA 4KBKA 4HYUA 2VNWA 4MD8E 3UVQA 5LWNA 2Z7SA 2CNVA 1HCLA 4EOLA 2PU8A 4QRCA 2DWBA 4YJPA 5ANDA 5EH0A 3B2WA 3HMIA 5KHXA 3HEGA 3UIMA 2Z60A 3MJ2A 1LPUA 4NEUA 4QNAA 3F7WA 4PWNA 5DEYA 3LMHA 4J71A 3G51A 3C0IA 3GENA 1WVWA 3DTWA 4IC8A 1PHKA 3KF4A 5JN2A 1JSVA 1NY3A 3KVXA 2PUNA 4D2VA 3OVVA 2WMSA 3A7JA 2WXVA 3RNYA 1NT2A 1YXTA 4MNEA 4KSPA 1BX6A 3Q9ZA 3V5QA 2Z02A 1ZMUA 1WBTA 4O7VA 5L6WL 5DGZA 3ZXZA 2PY3A 4P7EA 3FLSA 4B9DA 5AP3A 4XP2A 5JH6A 2J90A 2W5BA 3MTFA 4D2SA 1RJBA 2YCQA 4QTBA 2IVVA 2PVNA 4GK3A 2YERA 3BYUA 4L7SA 4EKLA 5KMJA 4IWPA 5D41A 3KRWA 4D0WA 3ORXA 2WQOA 3GCSA 4PMTA 1OB3A 3VW6A 1W82A 4A9RA 4C62A 4EH7A 3L9MA 2VWUA 4OBOA 3OEFX 2ACXA 2R2PA 3PPJA 4EHGA 4EC9A 2BDFA 3KREA 2YCRA 3F66A 2W05A 5AP4A 4L9IA 4JX7A 2ITNA 4YBKA 4N0SA 5CXZA 5HE1A 4XV2A 4U81A 3TUDA 4CSVA 2J0MB 1ZMWA 3K2LA 3OWJA 5ANIA 4R3RA 3RMFA 1HOWA 3BYMA 1X8BA 3FZRA 3TV6A 2I0YA 5IH6A 3RP9A 3TTIA 2YJRA 3W32A 4BTMA 5KZ0A 4AX8A 2DYLA 3DLSA 4E3CA 2ZV9A 2UZBA 3IDBA 3M2WA 4YPSA 4Z16A 4U8ZA 3Q6UA 1BUHA 1FOTA 4FT9A 3TZ8A 4EOQA 2PVJA 1H1PA 4KRDA 2VN9A 4OBQA 4RJ7A 2QC6A 3P1AA 2XK3A 3KRLA 3D7TA 3VULA 1OL6A 2I40A 4O96A 5H8EA 4DEBA 4DFNA 3FZOA 3R9RA 2GTNA 2PULA 2ZMDA 3FLZA 4RVLA 3R9OA 3PXKA 4FYOA 5GZ8A 1Q3DA 1VZOA 4TRLA 4TXCA 2CLQA 2Z2WA 2BR1A 4BGGA 3V5JA 2OZAA 4LG4A 4FT7A 4ZLOA 5EI2A 4GFGA 1O6YA 4YLKA 3PLAE 3OP5A 3QA8A 3DLZA 4W4XA 1U46A 1OGUA 3LIJA 3R7EA 3IW5A 3F5UA 2XNMA 5J7HA 5AUUA 1BI7A 4IAZA 4KBAA 1IASA 4NKAA 5ANEA 1P4OA 1K3AA 3I6WA 4AW2A 4UV0A 2ITYA 4ZAUA 4ZSAA 4R7IA 5J9YA 2VV9A 3EYGA 1Q8TA 4BZOA 4DGNA 2EVAA 3MPMA 3ORIA 1R39A 1SM2A 1KOBA 3R1QA 4GT5A 2XKFA 4FG7A 4MWIA 2PVKA 1J7UA 5LMBA 4CFVA 5C01A 2B0QA 4MBLA 4X3JA 2WMBA 4K2RA 5HNGA 4HVHA 3FMDA 4AW1A 2XIKA 2JBOA 5I5ZA 2HXQA 3LVPA 4FKLA 4TN6A 2IW9A 4I6FA 1FGKA 5FM2A 4EOKA 3NNUA 1YHVA 5HEZA 4DG3E 3ENMA 5CEKA 2ZDUA 5KNJA 3D15A 2VUWA 2FVDA 3SD0A 3E63A 3UMWA 2RFDA 4GG7A 4KKGA 3HA6A 3UYSA 5C8NA 2HOGA 3KQ7A 3PZEA 5D11A 5H3QA 5JRSA 3UE4A 5BPYA 1OUKA 3W16A 1KWPA 3ZUUA 2OJFE 5FQDC 5DYJA 4AWIA 2WPAA 5L3AA 2XKDA 1YXXA 4QQJA 3EKKA 3NUAA 3SW7A 4O7ZA 4IWQA 3DQXA 4IX4A 5BVEA 2ZDTA 3C13A 4FKTA 2Y4PA 2YM7A 5AR4A 4APPA 3ATSA 2RL5A 2NRUA 5FUTA 1RQQA 4IJ9A 2QKRA 4GH2A 4U6RA 3NUUA 4FV1A 2YCFA 3KXHA 1OI9A 3PJ8A 3W18A 3TTJA 4BGQA 3OCSA 2O3PA 4F0IA 3C4WA 4F7LA 2XS0A 3ZRLA 3KY2A 4EWQA 5M44A 1OIYA 5CVFA 4BCHA 1UNGA 1V0BA 4AGCA 3QX2A 4QTCA 5IQEA 1JQHA 1YW2A 1UNLA 3BBTB 4I3ZA 5KHWA 4UYNA 3CR0A 2QHMA 2WTVA 4UMPA 1OIUA 4FKGA 2Q83A 2W1ZA 1O9UA 2XK9A 3QC4A 4KWPA 3U51A 4N70A 4QMMA 3WF9A 3TKIA 4FKRA 3U4WA 5HBJA 4I4EA 3C5UA 3RKBA 5FP6A 2E9VA 2PZPA 1VYZA 2QOFA 4ZOGA 3T3UA 3B8QA 2E9OA 3Q9WA 3GBZA 4GU6A 4FV2A 5FXQA 3RALA 4NW5A 4RC2A 4M67A 4YZBA 5I0BA 2ZM1A 5AP1A 3R04A 4UXQA 4PNIA 4FL2A 2W1IA 3KFAA 3RAKA 3KULB 3CLYA 3VS2A 3OY3A 4AS0A 5KMMA 4YNEA 1IR3A 3HA8A 3R8LA 4ZLZA 4RIXA 5E8WA 4AZFA 4FODA 4DH5A 5BYYA 3OTVA 4YJVA 1PMEA 3SLSA 3AT2A 3RGFA 5IQGA 5EG3A 1K2PA 3IDPA 3LM0A 4Y95A 3OW4A 1R0PA 2UVZA 4M14A 2CKOA 1WVYA 5T68A 3QTSA 1XR1A 4JT3A 4C4IA 1CKPA 5J8IA 2JIVA 4DEGA 4MK0A 3BV3A 2Y9QA 4G16A 3HRBA 4HVIA 4X6QC 2IW8A 4EH4A 2C47A 4JRVA 5DMZA 3MVLA 3GU4A 4H3PA 4I20A 3VNTA 1FPUA 4O1PA 4ZZMA 2A27A 2WTDA 4RJ8A 3VAPA 1YOLA 3EQFA 2QQ7A 3CPCA 1V0PA 2YLEA 3DAJA 3PSDA 3QWKA 3TJCA 3QTIA 5IQCA 3UC3A 3DBQA 4E4MA 1XH6A 2GNHA 2OF4A 2W1HA 2Y6OA 4LGGA 4ITHA 3TUBA 2XBAA 2E2BA 3QLGA 5E92A 4E6CA 3JUHA 3CD3A 4FF8A 4AAAA 2VAGA 3MVJA 1OKZA 1MRUA 2X8EA 2PHKA 4BIBA 5IH4A 3D4QA 5HHWA 5JZNA 3LZBA 3R83A 4IZ5A 2WTKB 5M09A 2XNNA 2OU7A 3QA0A 2X1NA 3ZBXA 5L2WA 3OHTA 3OY1A 2J0KA 3LM5A 4JIAA 3ZYAA 3QQFA 3GOPA 3VS5A 5IMEA 3A8WA 2QG7A 5E1EA 5JQ8A 5ACKA 4YR8A 3TN8A 3DKOA 1M2PA 4FTUA 4ASEA 2QU6A 2UW3A 4CD0A 5C26A 4BYIA 2CSNA 3SXSA 4CRLA 5AP5A 1M52A 4HVDA 3QALE 4YBJA 5HIBA 4CFNA 1M17A 3VBWA 2EB2A 3BHTA 4DG0E 2NRYA 4QMWA 3VBTA 3OT3A 1O6LA 4QMXA 1JSTA 5CLPA 1SNUA 4YTHA 3ZUTA 1WVXA 4IIRA 4UBAA 4KIKA 2GSFA 4LOPA 1UU3A 4BDDA 4D58A 1XJDA 1UU8A 2XIZA 3KXZA 2Y7JA 3EFJA 4GVJA 3RM6A 3MN3A 4HW7A 2PZYA 4JQEA 3ZXTA 3ZZWA 2CPKE 4QP6A 3CSVA 2C3KA 1NA7A 3QCXA 3Q9XA 4GIHA 4GCJA 5E8VA 3AG9A 3JY0A 3FMMA 3H3CA 4UWCA 1JKKA 4DFUA 2JAVA 3FZPA 3P4KA 3BLQA 4I5PA 4JXFA 5DR2A 3FHIA 4I6QA 3GU7A 4MF1A 4O81A 3GGFA 2XYUA 5BX0A 1KV1A 3SOAA 2WO6A 1PXOA 3ENHA 2XCKA 2ITQA 4GL9A 4H1MA 4KS7A 4MXXA 4YTIA 4L42A 3LFSA 3OW3A 2UZEA 4J99A 1H07A 5GJDA 4FKJA 4E4NA 4Y5HA 3DZOA 2XYNA 2R3JA 3HMOA 1OUYA 2UZLA 1AGWA 4UMQA 1YI3A 5IA3A 1NW1A 4BI0A 2FO0A 1OPKA 4FTTA 4WBBB 5CAOA 4DE4A 2F7EE 2XH5A 1BMKA 2YA9A 2XJ1A 1WBOA 3HRFA 4OTDA 5AV1A 5HO6A 3QF9A 4B6LA 3FC2A 4AT4A 4OBPA 3IW8A 1B39A 4RFMA 1XHAA 2WU7A 3R7GA 4JJRA 2WMXA 4LOQA 4OT6A 4RC3A 3ZFXA 4CYJA 3F5PA 3M1SA 2EU9A 2YACA 2WTWA 4R6VA 2JDSA 3CTJA 1XBCA 1R3CA 3NPCA 3NUPA 5CY3A 4BDHA 4UXLA 5HE2A 5HI2A 4YHTA 2YWVA 3QQHA 2P4IA 4O0SA 1Q99A 2R0IA 4MXZA 2BAKA 4FV7A 3DK6A 3OCGA 4ZTHA 3LCSA 3OFMA 1BYGA 3F88A 4E5AX 3RZFA 2VD5A 3TKHA 1UV5A 4DFLA 3HDMA 4XOZA 5CEIA 2UZDA 4F6WA 2X4ZA 3VJOA 3PG3A 4OTPA 2PL0A 4FVQA 5EK7A 4I1ZA 4KBCA 4FK3A 4BBFA 2C5YA 3ODYX 5DA3A 4Q2AA 5EM7A 5HCXA 1W7HA 1Q41A 5AUXA 2C5OA 1YHSA 1XBBA 5BVOA 3NUYA 1BLXA 4YNOA 5M4CA 4ZSJA 2BCJA 1Q97A 5AV2A 3RNIA 1MP8A 3V5PA 2GS7A 5H8BA 2A2AA 3TUCA 1PY5A 2VTJA 4C59A 4CMUA 2Y4IC 4RWLA 2ITXA 3OF0A 3BYVA 4FNWA 1ZZ2A 4CXAA 3VQUA 4JBQA 3WZEA 4GJ2A 3NR9A 2BDJA 4OTFA 4RIYA 4FZAB 4IAAA 4J7BA 2H9VA 1Z57A 4IANA 1ERKA 2X9EA 4EUTA 2X7GA 4EOMA 5BUEA 2J2IB 4RX8A 2VX3A 2BAJA 2OXYA 4F9CA 2ZAZA 4F70A 5K5XA 4CG9A 4TL0A 5ETAA 5L8LA 3RAWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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