3K5VA

Structure of abl kinase in complex with imatinib and gnf-2
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
287
structure length
286
Chain Sequence
AMDPSSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVSAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Targeting Bcr-Abl by combining allosteric with ATP-binding-site inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ABL1
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 88
structure length 286
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3k5vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3k5vA01
2XEZA 4HVGA 2ETMA 5HO8A 5HVYA 4IAZA 3W16A 4C58A 3DQWA 2PZRA 4RIXB 3C5UA 4H36A 1ZMVA 4KS7A 4RFMA 3E3PA 4NZWB 4AQCA 4IXPA 3ZOSA 2CSNA 3COKA 4J52A 4DF3A 4IVBA 3WYYA 4BKZA 5CALA 4TWPA 3F2NA 1OVEA 1W84A 3NGAA 5DIAA 4QNAA 3K3IA 3DKOA 2OZAB 5EFQA 4IVDA 3R8UA 4O7TA 3HV7A 1CSNA 2YABA 5ETFA 1WBSA 2JGZA 2R4BA 4PTEA 4EQCA 3BHUA 4CFVA 5LQFA 1F0QA 4FV1A 4BVUA 3JY9A 1FMKA 4XBRA 4XOYA 2WIHA 4BR3A 4Q5EA 3PIXA 3P7BA 3DJ6A 2IW9A 3NAXA 2WFYA 3RAWA 3FLQA 3QALE 3HV5A 3BYOA 3WF6A 5I9WA 4EONA 3G33A 2W4JA 5KUPA 4D58A 5IH6A 4LM5A 3I1AA 5CWZA 5DT0A 2PSQA 3SDJA 1IA9A 2J5EA 4WG5A 3VS5A 4BTJA 2OFVA 4KA3A 4CTBA 3F66A 4C3FA 3R8VA 4ALWA 3AT3A 4J1RA 3A7FA 3PJ1A 3DKCA 4LV5A 4WRGA 3A4OX 2ITYA 4WG4A 4FV6A 4KKEA 4EH6A 1GNGA 3VBWA 4AZVA 5ANJA 3RCJA 1X8BA 4FZFB 4JIAA 3RGFA 2X2MA 3WILA 1E9HA 4XCUA 2DQ7X 5L8JA 2IW6A 4PL5A 4WBOA 3W2OA 4OTWA 4CRLA 3SA0A 2RFSA 3NNWA 3R7GA 4IX3A 4WKQA 3NIZA 3EWHA 4BBFA 4OAVB 4O6LA 1Q8UA 1A06A 1ZYJA 1UNHA 2BKZA 3BEGA 3KL8A 3MY1A 3C7QA 4X3FC 4YJVA 4RC4A 2F2UA 4K9YA 4U45A 3QZFA 5EQPA 4DEEA 5TE0A 5CEOA 2O5KA 3MWUA 3TKIA 3ZU7A 4ZSEA 3RBWA 1JBPE 2DYLA 1MRYA 3ORXA 4QP6A 4RC3A 4BDIA 5K5XA 2JBOA 5FXSA 4X6RA 2J0MB 1Z9XA 2R3MA 2PMIA 3PJ2A 2QOOA 1NXKA 3QZIA 2HXQA 4EH7A 4KWPA 4YHTA 5TO8A 3UMXA 4E6DA 3HEGA 4I21A 4UEUA 2JFLA 4XS2A 3D5WA 2XIXA 3ANQA 4RRVA 3L9MA 4G1WA 4M97A 4C4GA 4O0SA 4LUDA 2BROA 4S2ZA 2C68A 3AC4A 2WTCA 3U9CA 4QYGA 4BCQA 4J99A 1U5QA 2YZLA 3IG7A 3KU2A 3LPBA 2GQSA 3QQKA 4QP8A 3OC1A 3W1FA 3HV6A 4CT1A 4CSVA 4L6QA 5E9EA 3HYHA 1V0PA 1YXTA 2CDZA 4FNWA 4AA5A 2O63A 4YNOA 5E8ZA 3QX2A 4ZTQA 3RALA 5KO1A 3AT2A 4LG4A 5HO6A 4DH8A 2C6MA 2JFMA 3KC3A 2WTWA 4QMZA 3T3UA 1U54B 3R21A 4IM3A 2F7ZE 3O8TA 4NW5A 1YHVA 1JSVA 3GP0A 4Y72A 2QOKA 4FKSA 2C5XA 3EH9A 4C35A 2GTMA 3QD0A 1H0VA 2QONA 2ERZE 3EL8A 4KBCA 3SLSA 5CU3A 4WA9A 3QQGA 3FQHA 4XOZA 4PV0A 4ANQA 5AUTA 2AC5A 5FM3A 4X2KA 5J9LA 2JEDA 2R0IA 4R7BA 2C6DA 3OWKA 5EM8A 4ACMA 1M2QA 3FLZA 1U4DA 5G1XA 5LVNA 3KMMA 4ZLYA 3ZLWA 1LEZA 4FICA 4GK4A 4IB3A 4OUCA 4TYJA 3OTUA 3UODA 3G6GA 4JT3A 4C8BA 3VUTA 5JGAA 2C6OA 1ND4A 3LFAA 3FHIA 3R1NA 3VO3A 2IVTA 2BZJA 3S4QA 4GFOA 3R8MA 1W8CA 5T3QA 1SM2A 3AG9A 3MFSA 5DH3A 3HP5A 3R63A 2YCFA 4LRMA 3LQ8A 3ZS5A 4CMOA 4ITHA 3VWAA 3RPYA 3R02A 4ARKA 4MD7E 3FLSA 3CJGA 2OJFE 1ZARA 5H8GA 3KMWA 4X2FA 1UWJA 3M42A 3NUUA 4KRCA 4JI9A 5TOZA 3VJOA 2XRWA 3EOCA 2J51A 4DGGA 1S9JA 2WEVA 4JS8A 3A8WA 2UZDA 4L00A 3ZRLA 4E5WA 1H24A 3U4UA 4GJ2A 3PRFA 2WTVA 4D5HA 4R3RA 4O7YA 3I7CA 4ANNA 3Q6UA 4IWOA 3G5DA 4D28A 3Q4ZA 4EH3A 4YPDA 2UV2A 3EFLA 4L7FA 2G01A 4YJPA 5DA3A 3LMIA 5I0BA 3RINA 5HIBA 3TXOA 3FLYA 4L8MA 3TV7A 3LFSA 3GC8A 4FI1A 3VJNA 5EHOA 4EOLA 2Z7SA 3POOA 3BU6A 2F7EE 2YISA 3IGOA 5HTCA 3ANRA 1AD5A 4O1OA 5C8MA 2VWVA 5JK3A 5L2IA 4YZNA 3EFKA 3UO6A 2H9VA 3OUKA 4ZEGA 1R78A 4MD8E 3EFJA 3GC9A 3PY1A 4NTTA 2F7XE 4KABA 4D4RA 4QMTA 1UKIA 2BCJA 3BYVA 4YC6A 4MQ1A 1OBDA 4U3YA 3PVWA 4OTFA 4O84A 4PPAA 4X2GA 2XK7A 1B6CB 1TKIA 4LGHA 4IJ9A 4QMOA 3U4WA 5ICPA 3D5VA 5CQUA 1PYEA 4EOIA 5C9CA 2F2CB 1VYZA 1YWRA 4UMTA 3R1YA 2H8HA 2JLDA 4QYEA 4XYFA 3KRLA 4AG8A 1QPJA 5JQ5A 4XLIA 4FOCA 3WF8A 3OF0A 3CD8A 2BR1A 5IH5A 5IISA 3A60A 4EOOA 4GUBA 3TIYA 2QVSE 5IDNA 5JFVA 3KXNA 1UA2A 3RPOA 3ZEWA 4FT0A 4BCPA 3IW8A 3OWLA 3P1AA 4O0WA 1ZOGA 3MB7A 4UMQA 3KRRA 5DGZA 5E8VA 2C6EA 4ZY4A 1REKA 4YLKA 4P2KA 5F9EA 5HBEA 4FKLA 4RX7A 4JDIA 1MP8A 3DK7A 4EYMA 2C3JA 5K4JA 3TL8A 2PVFA 4KINA 4ACGA 4ANBA 5M06A 1W98A 1XR1A 3HP2A 2GCDA 4G2FA 4J8NA 3ZRKA 1UV5A 1BL7A 4OBOA 3UQGA 3HAVA 5HOAA 5ANEA 2B9IA 4I6QA 2R3QA 4GMYA 3C4ZA 4O91A 3QGYA 3MPMA 1JKKA 5HKMA 1WFCA 4I24A 3MPAA 2OSCA 1KWPA 3P7AA 3K3JA 3JYAA 4NFMA 4C34A 4ZSAA 2XM8A 3UNKA 1ERKA 3UIMA 3VW8A 2RGPA 4IZ5A 4K8AA 2YCQA 4L3PA 3T3VA 1O9UA 3CQEA 4DH3A 3PWYA 4RX8A 4QMNA 3H3CA 3FAAA 4NWMA 4DFXE 1XQZA 3QYWA 4D4YA 4FA2A 5DT3A 4HPTE 5DRBA 4PY1A 2Y4PA 4QTBA 4W9WA 4UALA 5CF4A 4OBQA 5KKRC 3E7VA 3LFFA 1OL1A 3Q9YA 1UU7A 2R3KA 4KIPA 2BFYA 5CNNA 3RAHA 3EQPA 3O0GA 4GL9A 2C0IA 3EKNA 4YLLA 4I0RA 4XG6A 4RJ6A 3TJDA 4OTQA 3ODYX 1O6YA 1OIYA 3FKOA 3BHHA 2FA2A 4HGTA 2XZSA 2H6DA 2HOGA 2IZTA 4IM0A 3VUHA 5BUJA 5LMBA 4MBIA 4JAJA 1H1SA 1WVWA 4FV0A 3LMGA 4RJ8A 5AUZA 2RKUA 4E4MA 5FUTA 2OH0E 2I0EA 4EQMA 5M56A 3NX8A 1T45A 4AGCA 4L42A 5IQGA 4PDOA 1XBCA 2ACXA 4ASDA 4GKHA 4BDGA 3R73A 3KREA 1JLUE 4FKWA 4G16A 4W4VA 4MXCA 4F6SA 3W8QA 3IOKA 4ZY6A 2BAKA 2OJGA 3Q4TA 5CF6A 2CLQA 2YAAA 4IVAA 1ZZ2A 4KD1A 5FBNC 4FIEA 3I6UA 5FEQA 2V7AA 1B39A 2Z2WA 4ZS0A 2RG5A 1UWHA 1TVOA 4PMSA 4FZ6A 2X1NA 4QYFA 5JZNA 2VWWA 2HYYA 1OB3A 4NCTA 3ZYAA 3MSSA 4K18A 2PHKA 5AR5A 4PL3A 4BYJA 4A07A 1PRYA 1DAWA 2PUIA 3NYVA 4B4LA 5HLNA 3MVHA 1YI3A 1J3HA 4DG3E 5M57A 3KK9A 4GFMA 3F9NA 2CMWA 2QODA 4O0YA 5JN2A 4IADA 2R3PA 5DYJA 3WIGA 3C4CA 3N4UA 3VRZA 2PMLX 3DTCA 4UWCA 3ORNA 4FTLA 4FV8A 3TJCA 4R5SA 2R3HA 4MXZA 1YXSA 4YZ9A 4FT5A 5ETIA 4A9YA 4C33A 2UW5A 3C50A 3QTIA 2OJ9A 3GBZA 4GS6A 4LRKA 3ZDIA 3AMBA 3EQIA 5DWRA 4Z9LA 1VYWA 3C4WA 2CLXA 3S95A 1ZYSA 3D14A 1H08A 3BELA 1JNKA 5HE1A 3R9RA 2GNLA 3HRFA 1Q61A 5AADA 1JSTA 2WZJA 3W32A 4UMRA 2RG6A 3VHKA 5L2SA 2ITQA 2WQBA 4V0GA 4J7BA 3R00A 4XX9A 4BN1A 4XBUA 4BDHA 4Y73A 3IW4A 4FV9A 5JFXA 2I6LA 2C0OA 2A4LA 4X2NA 4ZTRA 4DGNA 3DJ5A 4DGMA 3DFAA 3H4JA 4QPSA 4HVDA 5IMXA 1FINA 2ZVAA 3DGKA 3ORMA 3R28A 2QURA 4ENXA 2BRMA 3NCZA 3V04A 1STCE 5M4UA 4ONAA 5DI1A 1RE8A 3UIUA 4D9TA 3E63A 3KFAA 3PDTA 2ETKA 3PJ8A 4M67A 4M84A 2PU8A 3ACJA 5AAFA 1PXNA 3LQ5A 5CSWA 4IAYA 4HNFA 1FVVA 5F20A 5J7HA 2UVYA 2V7OA 3AD4A 4PUZA 5D7VA 3G6HA 3H0ZA 3IONA 4OT5A 4LOOA 5HEZA 5KMOA 5L8KA 3EQDA 5CZIA 4F9YA 5C01A 5GIPE 4LI5A 1AGWA 4JRVA 4D1ZA 3OT8A 4D0WA 3FMKA 4GVAA 4AX8A 2FH9A 1ZY4A 4ZOGA 4YJNA 3FY0A 3R7YA 2RL5A 3NCGA 4B99A 4KS8A 4GKIA 5L6OA 4WRSA 3AD5A 4MXXA 3R83A 4JBPA 5CEMA 4R3PA 5HE2A 1BI8A 4WUAA 3C0IA 1JKLA 3DBEA 3JPVA 2NRYA 3F7ZA 3DBCA 4BDBA 2JD5A 2UW0A 3R8PA 3DJ7A 2X81A 3OXIA 4P5QA 4NJ3A 3QZGA 5EHYA 3BZ3A 3QQJA 1UNGA 4XHKB 3EKKA 3NAYA 2YM8A 5T6KA 5AV0A 4AZEA 4M7IA 4KIKA 4AA0A 3LLAA 5AIKA 3C4FA 3UC3A 4YJSA 3RM7A 5G6VA 4FTCA 4O82A 1SVHA 2BUJA 1H07A 2PUUA 4IVCA 1H28A 4YC8A 1FPUA 2WMVA 3A61A 4EK4A 4CT2A 5A54A 4CMUA 2W9FB 4G3FA 3MH3A 3THBA 3P86A 5EI2A 4TWCA 4A06A 4A4LA 2QOLA 3Q96A 4RIWB 2YFXA 1UVRA 3OP5A 5D1JA 3W10A 5IDPA 2XBAA 4FTMA 4M14A 4C0TA 5FTQA 4CG8A 4DC2A 1JAMA 1K2PA 5IQFA 4A9TA 3IW5A 3AGMA 5A6NA 4U42A 3KXZA 4BGGA 2QOFA 4YNEA 3CIKA 3VULA 4I6FA 3KK8A 1QPEA 4LGGA 3AMYA 4CYIA 3QQHA 4CKIA 4JJRA 1SMHA 4R78A 2F4JA 2QG5A 5AAEA 2WMRA 4J8MA 3E87A 2X9FA 5HE0A 2WQEA 3HRCA 3DB6A 3PA4A 4G3GA 4I5CA 5M44A 1YXXA 4O0RA 4XG3A 3FKLA 1DS5A 5LVPA 1XO2B 3QL8A 4FSRA 5HG5A 5EYCA 3WARA 4BI0A 4D4VA 4ASXA 3TWJA 1LEWA 5C4KA 3ZMMA 4QTEA 3QUEA 3LZBA 4C37A 2UW9A 4HOKA 3ZFMA 3PIYA 2IVVA 2XKDA 3D9VA 2KULA 2RIOA 4YZDA 2VTTA 3AC3A 3HMPA 1ZZLA 2ZB0A 1K3AA 2PTKA 3C9WA 2GPHA 3AMAA 4MF1A 1DI9A 4F6UA 4DBXA 2QU6A 4C02A 3MN3A 4EKLA 5J5SA 3TKHA 2CNQA 1DM2A 4IDTA 1WAKA 2WMSA 4M69A 4BDCA 3S1HA 4FV5A 5AR8A 4DFBA 2HELA 4F9WA 3QRJA 4DEHA 2B1PA 2CKQA 4UV0A 5M07A 2XKFA 3KVWA 4MNEB 3EQHA 3AXWA 2QOQA 4ZZOA 5BUIA 3W33A 2QU5A 5LMAA 3R9OA 3RCDA 2W5AA 5AIRA 4ALUA 3LXLA 4IEBA 5DT4A 3DT1A 2YM5A 2QO9A 2YCSA 3TV6A 4ID7A 4EC8A 2I0YA 4ANSA 4C3PA 1YW2A 2UW7A 3QGWA 4NK9A 1OI9A 4ZSGA 3DB8A 3SGCA 3NNUA 4Y8DA 2WMUA 4Q9ZA 3SHEA 2OJIA 3U87A 4BF2A 4ZZNA 4XG9A 4QMXA 3BGPA 4OTHA 5HCZA 2P55A 3HV3A 4BYIA 2XEYA 4GH2A 3G2FA 2UZUE 5CAQA 4AZSA 4M0YA 5BYLA 4JNWA 3WF9A 4C2WA 2QNJA 3FZPA 2FSMX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XEZ A;  2AQX A;  4HVG A;  2ETM A;  5HO8 A;  5HVY A;  4IAZ A;  3W16 A;  4C58 A;  3DQW A;  2PZR A;  4RIX B;  3C5U A;  4H36 A;  1ZMV A;  4KS7 A;  4RFM A;  3E3P A;  4NZW B;  4AQC A;  4IXP A;  3ZOS A;  2CSN A;  3COK A;  4J52 A;  4DF3 A;  4IVB A;  3WYY A;  4BKZ A;  5CAL A;  4TWP A;  3F2N A;  1OVE A;  1W84 A;  3NGA A;  5DIA A;  4QNA A;  3K3I A;  3DKO A;  2OZA B;  5EFQ A;  4IVD A;  3R8U A;  4O7T A;  3HV7 A;  1CSN A;  2YAB A;  5ETF A;  1WBS A;  2JGZ A;  2R4B A;  4PTE A;  4EQC A;  3ML1 A;  3BHU A;  4CFV A;  5LQF A;  1F0Q A;  4FV1 A;  4BVU A;  3JY9 A;  1FMK A;  4XBR A;  4XOY A;  2WIH A;  4BR3 A;  4Q5E A;  3PIX A;  3P7B A;  3DJ6 A;  4DDI A;  2IW9 A;  3NAX A;  2WFY A;  3RAW A;  3FLQ A;  3QAL E;  3HV5 A;  3BYO A;  3WF6 A;  4MUQ A;  5I9W A;  4O4F A;  4EON A;  3G33 A;  3KIO C;  2W4J A;  5KUP A;  4D58 A;  5IH6 A;  4LM5 A;  3I1A A;  5CWZ A;  5DT0 A;  2PSQ A;  3SDJ A;  1IA9 A;  2J5E A;  4WG5 A;  3VS5 A;  4BTJ A;  2OFV A;  4KA3 A;  4CTB A;  3F66 A;  4C3F A;  3R8V A;  4ALW A;  3AT3 A;  4J1R A;  3A7F A;  3PJ1 A; 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