3KB7A

Crystal structure of polo-like kinase 1 in complex with a pyrazoloquinazoline inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
290
structure length
289
Chain Sequence
EIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPFSIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of 4,5-dihydro-1H-pyrazolo[4,3-h]quinazoline derivatives as a new class of orally and selective Polo-like kinase 1 inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PLK1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 289
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2009-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kb7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kb7A01
3AC1A 1O9UA 3HMMA 5KMLA 4QP6A 4CGAA 3AQVA 3I4BA 3CE3A 4Z16A 4K0YA 3BGZA 3FPQA 3T8OA 5JQ8A 4OBOA 2OIQA 4FYNA 5IZFA 4NYEA 3B2WA 3C4EA 3FL5A 4QT1A 3II5A 2C69A 3R04A 3WBLA 3A7JA 4IANA 3NUUA 5HCXA 3TNIA 3AT3A 5C4LA 5GIOE 4I6HA 3NZ0A 2WMAA 3R73A 4D4RA 4H3PA 2WMRA 4S34A 1U4DA 3I5ZA 3SXFA 3IW6A 4JBPA 3FJQE 3QTRA 2W1GA 4QD6A 4ZSLA 3E63A 1JBPE 1REJA 2VTJA 4AOJA 2GNFA 3PPJA 4BDDA 3LKMA 3H30A 4OTQA 2B55A 3HV5A 2YHVA 3COIA 3QD2B 3DK3A 1IG1A 4RC2A 4V01A 3WZDA 1MQ4A 4NSTA 3CY3A 3GU5A 3TZ9A 2VU3A 4O7LA 4ERKA 5CF6A 4FZAB 1STCE 4IJPA 3VUTA 3EOCA 1YW2A 4DH3A 5IA0A 2PE0A 5LVLA 4GG5A 3C4ZA 2J0MB 3NUSA 2Y7JA 3FKNA 3HA6A 2OXYA 3P5KA 4G6LA 3V8TA 4BKJA 5IA1A 2V0DA 2ITYA 2A0CX 2PUPA 5HVJA 3FHRA 4R7IA 2QC6A 5D11A 5AUWA 5DVRA 3TTJA 4PP7A 2VTRA 2X6DA 3G33A 4O22A 3HX4A 4AP7A 4RZWA 3QXOA 4O6EA 3DOGA 1KOAA 3RGFA 4O1PA 5KHWA 5FBNC 2ZDTA 4FVQA 4DFBA 5T6KA 4QP9A 3PXQA 1Q8WA 3NAYA 4LV8A 4XG8A 5E91A 3UC3A 3IQ7A 4YR8A 1GZ8A 3QD4A 4CYJA 3CJGA 3O51A 1FGIA 2C5VA 4GT5A 2XNPA 4IAYA 2HWPA 3ALOA 4DG0E 2X39A 3SD0A 5IQDA 2RG6A 4D2SA 2R4BA 3CQWA 3UO4A 1PXOA 3NUXA 2P2HA 4IACA 4BI2A 3DKCA 3P86A 2H9VA 4K8AA 3CEKA 2XCHA 4KS8A 4EOSA 4CMOA 2X8IA 3V3VA 5EH0A 5I9XA 4KINA 5GHVA 5CANA 4FL2A 3AD6A 3TNPC 4ZK5A 4E5BA 4IAFA 1REKA 1YWRA 2G2HA 5CEMA 4CKRA 5LMBA 4ENYA 4XUFA 3E88A 2BVAA 3A99A 3IDCA 2C6KA 4RZVA 2JITA 5EM6A 4EH5A 5KNJA 2JLDA 1KWPA 4FNXA 4O0TA 3VBYA 2VO6A 4NW6A 1JLUE 2IZTA 2QOIA 1R0PA 2XK9A 4NCTC 5HG8A 2ETKA 3MFSA 1EH4A 2HCKA 4G3GA 4U42A 3NUAA 4CZYB 4O1OA 1MUOA 2W5HA 3FYJX 3SGCA 4RIOA 2B7AA 2QQ7A 3VBTA 3F3UA 2WTVA 4U44A 4K9YA 4I1ZA 1H08A 3W2OA 1NVRA 1OKVA 2WZJA 4X0MA 3RAWA 4QPMA 4W8DA 3HZTA 2DYLA 3R00A 3VO3A 1KE5A 2Z8CA 4ZOGA 3W1FA 4JI9A 4Y85A 2CPKE 1GIJA 3C1XA 5L8LA 3PJ8A 2BTSA 4FZ6A 3GCVA 2VGPA 3QHWA 4TYGA 3LQ5A 3GFEA 4UWCA 3HAMA 4RJ8A 4EWHA 2OXDA 4EKKA 4LGDA 3PJ3A 5BMMA 5LCKA 4UX9A 1Y8GA 4U3ZA 3DXPA 5EQYA 5AP7A 3EYGA 5EQPA 4NM0A 3QQKA 3BHVA 3G6GA 2C6IA 4EOQA 1WBSA 4FV4A 4GRBA 3VUGA 2O5KA 4ASXA 5F95A 2YITA 3UBDA 2YIWA 3G9NA 2YERA 3RK7A 4U45A 3FLYA 3L8PA 4U79A 2BALA 3IS5A 4PDYA 1J1BA 2QD9A 3UZPA 5E8YA 1VZOA 3WYYA 3TTIA 2YM3A 5JN2A 3TCPA 4GKHA 5HO6A 4DFUA 2JKOA 2J2IB 2G01A 4UZDA 4BCHA 4DEHA 5JRQA 2CDZA 3EQFA 1XH5A 2P33A 2BAJA 4JR7A 4AGWA 3C5UA 3IECA 4CRSA 5KMKA 3ZRKA 4CLJA 2VTLA 3R83A 5CU6A 1E9HA 3R7YA 4D2RA 2B1PA 5M09A 3GQIA 3C9WA 5DEWA 5BPYA 2WMVA 4BCOA 2W7XA 2X7GA 3KXXA 5DT3A 4M15A 3UNJA 4JG8A 2PTKA 4BWXA 3ATSA 3U4WA 1APME 3RNIA 4IX3A 3PSDA 1CKIA 4RJ3A 1BYGA 3FY2A 5DFPA 4CMUA 4NZWB 3BZ3A 5HG7A 3Q3BA 3MY0A 3LFQA 4XX9A 3ZBFA 4MQ2A 1WVYA 3LQ3A 2X1NA 2PVRA 3PE2A 5IU2A 3R02A 2GS6A 1G5SA 4EOJA 5IQHA 2BRBA 1HCKA 2Z60A 1DI8A 5AV4A 4R5SA 3L9MA 3MVJA 4NKAA 3VC4A 3N4VA 3DZQA 3OUKA 2BUJA 5HVYA 2OH4A 3UMXA 3MPAA 1Q8YA 1DAYA 2E9OA 3PJ2A 4R1YA 2PVKA 3ROCA 2EXEA 5J9YA 5A14A 4OAVB 3H9OA 4FSZA 4DT8A 1ZXEA 3PIZA 3GT8A 3G15A 4YHFA 3FMHA 4RJ4A 3LMHA 4H36A 5GZ8A 2J0LA 2VWYA 2UW6A 3OXZA 5J95A 5CAQA 3I79A 2W1FA 2YDKA 4C2VA 3UG2A 2WMSA 5AV0A 4LG4A 4FA2A 4AFJA 5I9ZA 5HGIA 2YM6A 4IAIA 3PWDA 3Q53A 2ETMA 2P2IA 2RFDA 4NM7A 4X2NA 3D0EA 3AC8A 3F69A 4IZ7A 4E93A 2R3PA 2HZ4A 4QTAA 2XKDA 2VZ6A 2GTMA 3G9LX 3HV3A 3IDBA 4MWHA 3EQGA 4PTEA 3U9NA 4AFEA 3U6IA 3F61A 3KF4A 3ZYAA 3AMYA 3MFUA 5GJFA 2AYPA 3FZPA 2QI8A 4QNYA 4U80A 2W4KA 1U54B 4NIFB 5FBOA 4O21A 2VTNA 2XNOA 1MP8A 3RCJA 4WNPA 3GCPA 4IC8A 2BDJA 3QQUA 3BE9A 3KXHA 4YHJA 5F94A 2IO6A 4WG3A 1J7UA 1F5QA 4M66A 3O23A 4XV3A 5FGKA 3EQHA 3SX9A 5M4UA 5FEEA 4FUYA 4YTHA 3ZSGA 5I0BA 1UNLA 2ACXA 5CEQA 4ZZMA 2VTHA 5HORA 3RVGA 4UYNA 1FVTA 2E9PA 3MFRA 4C62A 4DTAA 3DTWA 2R3HA 3IK3A 2YN8A 4TYHA 1RE8A 3U4UA 4BBEA 5IF1A 3I81A 3TEIA 1QPEA 4GJ2A 4RIXB 4YJOA 4FKLA 1K3AA 3DK7A 3W33A 2FSMX 4D1XA 4FKIA 5M44A 3DCVA 4KBCA 4MCVA 1JKTA 5D7VA 4DEDA 2ITPA 4TW9A 5M06A 3FAAA 3VW6A 2IVVA 4EUTA 1ZLTA 1JSUA 1CSNA 3EQDA 4FT9A 2OSCA 2P0CA 3DKFA 3KB7A 3FQHA 5BVOA 5C26A 4IWPA 4PPBA 5CEPA 4MK0A 1YHWA 3AC5A 4OW8A 1TQPA 1GAGA 4BCPA 3CGFA 5IEXA 1IAJA 4GT4A 1ZZLA 3G6HA 3A4PA 3KXNA 4LMNA 3F6XA 4EK6A 1X8BA 5ANEA 5M55A 3QQFA 4GL9A 4FTOA 4AW2A 2RGPA 2X7FA 4FICA 1SVGA 3PJCA 4QQ5A 5CVGA 3KK9A 4YUQA 3PLAE 1Y57A 4RA4A 4GK4A 4BZDA 4F9CA 4YTIA 4FKWA 2FSTX 4MKCA 3THBA 1JOWB 2JAVA 4PV0A 4U9AA 4EQUA 1KOBA 3PY0A 4FKJA 3DTCA 3H0ZA 4BTFA 2WMUA 2QHNA 3Q96A 3VULA 4YJVA 3DBFA 3TV7A 4AZEA 4B7TA 5ICPA 3TL8A 4F99A 4MXCA 1UA2A 1SVEA 3PIYA 4MXXA 5AA9A 5M51A 5FLFA 5FTQA 4FG8A 5C1QB 5K4IA 3LW0A 4B0GA 3U6JA 5J1VA 3ZRLA 1PRYA 4R3PA 1K9AA 1QPDA 3UYSA 4BI1A 4F0FA 5AM6A 4FEXA 2OZAB 4DHFA 1ZZ2A 2J51A 2UZUE 1YQJA 1MRUA 3O7LD 4CYIA 4RWLA 4XBRA 3R7UA 3PA3A 4JDHA 3GC0A 3KK8A 3NUYA 5J5SA 4EZ7A 3TUCA 2KTYA 1PMEA 3E3BX 3MA3A 3F2NA 4ITJA 2F2UA 4J8MA 2QODA 3ORXA 3PXZA 1YHSA 2PUUA 2ZB1A 1PKGA 3R9HA 1BKXA 2J4ZA 5A54A 4EK8A 3F3WA 2O0UA 3WE4A 3W2CA 5DMZA 2BR1A 2RFSA 3FHIA 3DQWA 4LRKA 4O27B 2RFNA 3GC8A 1PXMA 2JDVA 1S9IA 3K54A 3S00A 4WUAA 2DWBA 4JVGA 4AA5A 1XBBA 2B53A 4YU2A 3GEQA 2YCSA 2PVNA 4BBMA 4FKPA 3S0OA 4FGRA 4LGGA 5EM7A 4YURA 3D83A 1FVVA 2C5NA 4WNKA 5LMKC 2I40A 2EXCX 4Z3VA 1ZYDA 4BCJA 1H1WA 2ZM3A 3EL8A 1YXTA 3FQEA 5JSMA 2UZBA 3FMKA 4Y73A 4GS6A 4RX7A 2UVXA 2GHLA 2HYYA 2VTQA 2F4JA 3GGFA 2W99B 5E8VA 2W4JA 4K18A 2BMCA 3VWAA 4C4GA 4QQJA 3E92A 3OWJA 5HTCA 3BI6A 3OW4A 1OMWA 4YO6A 5B2LA 2HOGA 4G9RA 4ZSAA 2XIRA 4CCUA 4E5WA 4ZTHA 3UPXA 4G3CA 4EOKA 3HYHA 5DRDA 3V51A 3Q9XA 1OBGA 2HZ0A 4UZHA 3BQRA 4II5A 1UU9A 2XKEA 4PL3A 5C4KA 4NWMA 1AD5A 3PPZA 2W1EA 2XIZA 3FEGA 3FDNA 1PW2A 4EKLA 4BWKA 3L9PA 2QOLA 3OHTA 5CSVA 4DGGA 2YZLA 1BLXA 1A9UA 4Y95A 3ODZX 3QKKA 4XMOA 2XM9A 4DCEA 2PE1A 3Q32A 3B2TA 1M2PA 4RPVA 4E7WA 3KRJA 5AWMA 3PLSA 4UEUA 4EH3A 2O3PA 4FKTA 4E5AX 3TDWA 1Q61A 4UALA 3AGLA 5H8GA 4PQNA 1Q8ZA 1SM2A 3L8VA 4KIKB 1ZMUA 4ACCA 2O64A 5L6OA 2W17A 5FEQA 3QLFA 2G2IA 1CKPA 2GFSA 2OIDA 3W2SA 2F2CB 3COKA 4MBJA 4QMXA 2Z02A 2FSLX 3CJFA 4MXAA 5HCZA 3GB2A 5HHWA 4YC8A 4GFMA 3R8LA 5AV2A 1UU7A 1J91A 3KMMA 3D5WA 2UUEA 3PPKA 4FVRA 4GUBA 1YOJA 4QQTA 4YNEA 2ITTA 4R1VA 4L45A 5AUTA 4NFNA 2XJ1A 4HVGA 5J7BA 5DG5A 4ZTNA 5E4HA 2QO2A 4O0VA 4BN1A 3ULZA 1YVJA 2OJGA 1PXKA 3W2PA 3I1AA 4TYJA 4I5CA 4FEVA 3DJ5A 4TY1A 3BIZA 3PVUA 5CU2A 1FMKA 2BFYA 4G31A 3DJ6A 4ZSEA 3IGOA 4IB1A 2XNEA 2Y4IB 4PNKA 2H8HA 4QTBA 5A4TA 4FTMA 1LEWA 3DB8A 4DH7A 3R9OA 3FE3A 3R21A 4F0GA 4FIGA 4TN6A 4WHZA 3UPZA 4B6LA 1PMUA 4I5HA 4J96A 4ZAUA 3IW4A 4R6VA 3SKCA 5CF5A 4FE2A 1V0OA 4X2JA 3OVVA 3KU2A 3SV0A 2QOKA 3DFCB 3GBZA 4XG9A 4EK5A 4J95A 5FM2A 5J87A 5E90A 4F1TA 1H0WA 4QO9A 4OT5A 3NVMB 4AACA 1Y6BA 2H96A 2NO3A 2WNTA 3FV8A 3QTIA 4IWDA 4KBAA 3OCSA 5FG8A 3VQUA 4C4FA 4F6WA 3O71A 4W4YA 2QKRA 2R3RA 2VWXA 3PWYA 4NT4A 4LRMA 4EK3A 1W82A 4R3RA 2BRMA 4BGGA 3MH1A 4FTJA 5DPVA 5HIBA 2B54A 2GTNA 3QC9A 3D5XA 3ZO2A 4IVAA 3ZTXA 2BHEA 3D5VA 3PYYA 2BROA 1U5QA 3QZIA 4TWCA 5EFQA 4I0TA 1CKJA 4NH1A 5K5NA 4HCVA 4RWKA 2I7QA 4EORA 4QTEA 4I6QA 4LQMA 5CAOA 3FPMA 4ZTSA 4BZNA 3V8WA 5EI8A 1OIYA 4ZSJA 5JKGA 4J7BA 3RK9A 4BCQA 2C1BA 3Q4CA 2PVJA 2VGOA 4QP8A 1M52A 2ZJWA 1JPAA 1LEZA 3EN4A 3OBGA 4JQ7A 5B0XA 5BX0A 2WIHA 3DBDA 4E4MA 4DBXA 5KX8A 5DT0A 2CLQA 4C7TA 4XV1A 4I41A 1OIRA 4QMVA 4FTQA 4CFMA 2WU7A 3R71A 1YOLA 4DLJA 4M67A 2FYSA 4Y5HA 2Z7LA 4X2KA 4IM3A 1OL6A 1YXXA 4ZS4A 1GOLA 1PXLA 3K5VA 2VTAA 2YABA 2RKUA 3TJDA 5HLNA 4RIWA 3I60A 3QA0A 5HCYA 4MF1A 5TOZA 1HOWA 3HL7A 3UTOA 4IIRA 4BCIA 4JRNA 4JBVA 3R8PA 4USDA 2R7BA 4EBWA 5IQEA 3FMMA 3ZDUA 5HG9A 3KKVA 2PMOX 3FQSA 3S95A 3C51A 1WCCA 5FEDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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