3KCFA

Crystal structure of tgfbri complexed with a pyrazolone inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
330
structure length
328
Chain Sequence
ISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDINHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pyrazolone based TGFbetaR1 kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 91
structure length 328
sequence length 330
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2009-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF08515 TGF_beta_GS Transforming growth factor beta type I GS-motif
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kcfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kcfA01
2WQBA 4FIGA 3VS3A 3MW1A 3NCGA 3TACA 5ACKA 2RF9A 4FZAB 2XIYA 4TTHB 1E9HA 1WBOA 3PIXA 4IE9A 3R1SA 2QU5A 3EQCA 3OXTA 4X2KA 3LMHA 4BGGA 4D5HA 1XQZA 5KZIA 2IN6A 4QP8A 2VTNA 4L45A 3W2OA 4OLIA 3WE4A 4UWCA 3MESA 3HZTA 3P86A 1CKJA 4FEVA 2R3IA 2XCHA 4RIOA 4AN9A 2VTJA 3H10A 1H00A 4GRBA 3QKLA 4E26A 4M12A 2R7IA 5FQDC 3I6WA 5LVMA 2QONA 3S2PA 1QPJA 4QP1A 2XJ1A 3BYOA 3OXIA 2W1CA 4GT3A 5I4NA 2OO8X 3G6HA 2JEDA 3UQGA 4LMUA 2EUFB 4R5SA 2XM9A 3QRUA 2P3GX 2XK3A 3DPKA 2WQOA 2GHLA 2PZRA 4J71A 1IEPA 3SA0A 4DTBA 5AR2A 2XRUA 3QUDA 2CKQA 5TOZA 3ORKA 3UC4A 3UTOA 5CEQA 4A9YA 5EK7A 1YHVA 5LMKA 1PKGA 1XHAA 3CTHA 3F9NA 4EYJA 2DWBA 4U42A 5CF6A 4AGDA 5KMMA 4OUCA 5DG5A 4EHZA 4ZSJA 3W10A 1G5SA 2EB3A 4AA5A 4CMTA 3OUNB 2R4BA 2RFEA 5AV3A 3QD4A 1JPAA 5DYJA 3HV6A 4QMZA 5EFQA 2ZV7A 1H08A 5E8YA 5CNNA 4QTDA 5GIOE 5JK3A 4G9RA 3T9TA 4DFZE 2ZVAA 3VF9A 1XR1A 4EUTA 3ORNA 3EN6A 3RCJA 5HEZA 2VU3A 3ENHA 4JXFA 5KCVA 4I3ZA 2UW6A 4IZAA 2VWIA 2F7XE 5FXSA 5JMSA 2PHKA 2UZNA 1R39A 5CU0A 4EONA 3FMLA 4ENYA 3KULA 3LXLA 4CG9A 4IWQA 4Z3VA 1SVHA 4UZHA 4WSQA 1OL7A 4QNAA 2R3FA 2Q0NA 3MDYA 3G2FA 1R78A 4AOJA 1Q41A 1IAJA 4E8AA 4R1YA 2WZJA 4QYGA 4D1XA 1GIHA 3QQLA 3LCOA 3MH0A 2GS2A 3OCTA 4TN6A 4WRSA 3V01A 2WU6A 3ZEPA 2XEYA 4E6CA 4D55A 5LVPA 3U9NA 3PDTA 3UVPA 5C4KA 5IQDA 5EYDA 4B8MA 3PUPA 3A8WA 5IKWA 1KWPA 2PZPA 3NWWA 4PMPA 5I3OA 1M2PA 4FTCA 2KTYA 5DMZA 2XM8A 3LAUA 4D4RA 3ZBXA 4NZWB 5KZ0A 1BL7A 3FXWA 3Q6UA 4A9TA 4LV8A 2JLDA 3A7IA 2Z7QA 4JDIA 4YJPA 5AR5A 2F2CB 3QXOA 3TZMA 4ANBA 2BHEA 4D0WA 5HO7A 2R3KA 1P5EA 4IBMA 3CXWA 2PVNA 2RGPA 4L3JA 5I9XA 5A4LA 4IDTA 2R3RA 4MXCA 5ETIA 4R78A 3KFAA 5HCZA 3FLZA 2J90A 2ETKA 3DZQA 2A1AB 2BR1A 4F9WA 4QTEA 1UKIA 5AP4A 3R8PA 3S1HA 5BYLA 4DH8A 3RTPA 4BCIA 5BVWA 3I0OA 3BHYA 3H0YA 1PKDA 3DB6A 4L53A 3WE8A 3HMOA 4BN1A 2BTRA 2C69A 3DBEA 3ZU7A 4PMTA 3II5A 4XYFA 3EYHA 3IO7A 4IAKA 1WBTA 4JVGA 4ANOA 4Y72A 1OBDA 3E7OA 3GCPA 3BQCA 3NNXA 4ANSA 5HVKA 5DIAA 5HCXA 4JNWA 5IA5A 2C6MA 3RKBA 3OFMA 4HW7A 3EH9A 5IQGA 4RIXB 3T3UA 3KK8A 3T3VA 2YWPA 5CVFA 3SXRA 3RNYA 1OPLA 2XK7A 5LVOA 3QRIA 2JDOA 3BX5A 3VUHA 4HGSA 4RLLA 5C26A 2C4GA 4AFJA 4BDJA 3FZSA 3UIUA 4YTHA 5HOAA 4N4SA 3HYHA 3ZLWA 4CFNA 4U79A 1JSUA 5DN3A 4EBWA 4IM3A 1JKKA 3FLQA 3F6XA 1IASA 4JR7A 5L6WL 2JD5A 1GZKA 3G90X 2Y6OA 4OTRA 4EOOA 2JDTA 2BDJA 5CI6A 1LPUA 2DYLA 5DPVA 5HX6A 2EXMA 4FV7A 3JYAA 4BIEA 2C68A 3D5VA 1MP8A 3NEWA 3WILA 2IZUA 4FTIA 4BYJA 3SW7A 3OMVA 3UQFA 4BCOA 2XNPA 3PPJA 5FTGA 5AUUA 3DBFA 3QUPA 4JX7A 5CXHA 5E90A 3R9NA 4ANNA 1Y8YA 3C9WA 3HUBA 4NTSA 1MQBA 3QZGA 2RFDA 2XIXA 4IB0A 3HDNA 5KMLA 4YC8A 4BCKA 3OZ6A 1Q8WA 2B9FA 4Q9ZA 5AA9A 3DLZA 2J7TA 5E8VA 1ND4A 4K33A 3FWQA 1JNKA 1U5RA 2F57A 4G6NA 4C0TA 5CSPA 2QLUA 1PXIA 3RPSA 3PE2A 3P9JA 4L7SA 5ETFA 3W2RA 5EKOA 4AG8A 4DTKA 4EH6A 2WAJA 2YCFA 3B8QA 5E1SA 1STCE 2BROA 5CYIA 4XP0A 5JKGA 1H0VA 2C6EA 2ERZE 2J0KA 3QQKA 4PTGA 4RA5A 4RFYA 5EW3A 4IMYA 3KVWA 4IWPA 3HA6A 2J0JA 3BZ3A 2PVLA 4FKPA 3R7VA 1Y6AA 4FL1A 5IQHA 2H34A 2QO9A 4FEQA 4JLCA 4TWOA 4ASXA 5K9IA 4O7VA 3P0MA 4RIWB 4YJVA 3MJ2A 1YW2A 5FEEA 3U6HA 2ZAZA 1OL2A 2JFMA 2PZIA 3DCVA 4ERWA 4F7LA 2LGCA 2I1MA 4G3EA 2QLQA 2XRWA 2PVFA 2ITVA 3FQSA 3JVSA 3Q6WA 4FGBA 4FNZA 4S34A 1KE9A 4USDA 2FYSA 2VTTA 4RIXA 3ZUTA 4ZTRA 3EKKA 3KXXA 3S95A 4C7TA 2A19B 2VWBA 3BE9A 4UB7A 5EDQA 3TEIA 5KMJA 4B7TA 3JXWA 3VJNA 4K2RA 1JBPE 3VC4A 4FMQA 1HCLA 3UBDA 3MSSA 3VBYA 4I20A 4M0ZA 2OJJA 4PPBA 2XZSA 3NYOA 4FSQA 4D2WA 4ZLOA 3L9MA 4G3DA 5D7AA 5GJFA 1UA2A 3Q2MA 4I6BA 4MVFA 1H28A 4WNOA 4BDHA 4ZTSA 4O7WA 5IQBA 3GUBA 1H4LA 2OJIA 2UW9A 3F3WA 5A6OA 4B4LA 4DE4A 4UXQA 5HIBA 5AJQA 2O63A 2UZDA 1MRYA 2R64A 2VTLA 4H39A 4XV9A 4YZCA 4BWPA 1H1PA 3CCNA 4X0MA 4F6SA 3JY0A 4FTAA 4XG9A 1NVRA 2PSQA 5AV1A 1F3MC 4F7NA 3BGQA 4I0TA 5A46A 3TM0A 1W98A 2IVSA 2EXCX 3PIZA 2E9UA 5JGDA 3BGZA 4GK2A 3UVRA 4RZWA 2ESMA 3CE3A 4KIQA 2UVYA 3ALNA 3LQ5A 4NM0A 4IVDA 3TKIA 4CFUA 3NR9A 1ZZ2A 4F63A 4JG7A 3TN8A 2XF0A 5M57A 1CKIA 3COKA 3RAHA 4K11A 5C01A 3LMIA 3L9PA 5KX8A 3QD0A 4CFMA 2BAKA 2UUEA 3FMNA 5IMXA 2O2UA 1GJOA 5AR3A 5AUTA 3PG3A 4GU6A 3ZXZA 3RAWA 3FL4A 3DKGA 3REPA 4FZFB 2QC6A 2X0GA 2JDVA 2JBPA 4MD7E 4NWMA 5CTPA 4BCHA 4X3FC 3TV7A 5JQ8A 3UOJA 3MFRA 1LEZA 2Z7SA 5AP1A 4RQKA 5EOBA 1FVTA 3EIDA 5M4UA 4JRVA 3R8ZA 4AGWA 4E6DA 2J51A 3ACKA 2C6TA 3FBVA 3GQLA 3BYUA 2JKQA 3Q9ZA 1J7IA 4HNFA 3HRBA 4CNHA 2ACXA 3DJ5A 4ALVA 2G01A 5FBOA 4YHTA 4IFCA 4ZJIA 4CYJA 3LZBA 5DT4A 5KMOA 4ORKA 5E8SA 2BHHA 3EN9A 2YIRA 4WG3A 3KRWA 3TNWA 4EQUA 3QA8A 3R7IA 2BILB 2X6EA 4OTFA 3T9IA 3NW5A 4FOCA 4EZ3A 3NAYA 4RWIA 1S9IA 5I9UA 1Q62A 2VTRA 1Q4LA 4FKUA 4QPSA 5CQUA 4C4EA 4CTCA 5HU9A 4FR4A 1FVRA 4FX3A 3K5VA 3DU8A 3D5UA 2W1GA 2X8EA 2VV9A 3QC4A 3LMGA 1YHWA 4MF0A 3W2QA 5AP7A 4IC7A 4O0UA 4RJ6A 2F4JA 2WTWA 3NUAA 5LMBA 4IX4A 4P5ZA 4GUBA 2P2IA 3GP0A 4R7BA 2ZV9A 2OH0E 4IFGA 4GUEA 4NFMA 4OBPA 4E5AX 5JRQA 1Q8TA 3UOLA 5BUIA 2VWUA 3KN6A 3ZO1A 1F5QA 4BDAA 1YXUA 2ZDUA 3SRVA 3VS5A 2C5XA 4O0RA 4XMOA 3P1AA 5LWNA 2ERKA 4FL2A 3RGFA 3V8TA 3L8SA 5BPYA 2HZ4A 4NCTA 4QP6A 4EWQA 5HTCA 5ANEA 3K3IA 4EBVA 3PVGA 5IISA 4FICA 4U0IA 4ZTHA 1L3RE 1RDQE 4IM2A 5L3AA 3FKOA 4BKJA 3D4QA 4E73A 4YBJA 2VN9A 5HVYA 2WMXA 3CJFA 5EQYA 4FNXA 3OCBA 4YNEA 5LWMA 4ARKA 4BI1A 3VS4A 5EI8A 2YA9A 2CGWA 2HAKA 3EB0A 4I5MA 3A8XA 4DGNA 5JFVA 5AP2A 3GCQA 5M4IA 4ZSLA 2QODA 4HCVA 5CALA 3H4JA 3DB8A 4O7LA 3HMPA 4DG2E 3TNQB 3WF8A 3WF6A 2W4JA 4XCUA 5JRSA 3U51A 4C37A 2V0DA 4A4LA 2OICA 3BYVA 4MNEB 2PMNX 4O7SA 1XBAA 3LJ1A 2OU7A 4FYOA 3DNEA 4N6ZA 5DWRA 5ANIA 3TV6A 2YDKA 4W9XA 2B55A 5AIRA 3VAPA 4J96A 2WGJA 2YM3A 3K54A 4BFMA 3UO4A 5K0XA 5C4LA 4WO5A 2G2HA 2X7OA 2JAMA 3EQHA 1XJDA 2FVDA 4IB1A 4HOKA 3BLQA 2A0CX 4O83A 5C1QB 4QOXA 4FKVA 1MRUA 5IDNA 2QOLA 2OKRA 3IGGA 4HGEA 3THBA 1UNLA 2AC3A 2W1FA 3UYSA 4BDFA 1UVRA 3KA0A 4U9AA 5DR2A 2ZB0A 3MJ1A 4ITHA 4IVBA 2OLCA 4ZOGA 4IAIA 3UP7A 3AGMA 4LFIA 4WHZA 1S9JA 4LL0A 5EW8A 4RT7A 4WNPA 3NIEA 4GJ3A 4LG4A 2H8HA 4W8DA 2RFSA 4R3PA 4KWPA 2A27A 2XEZA 3ORIA 3BPRA 5EG3A 2VGOA 5DT0A 4EQMA 3U9CA 4JS8A 4CCBA 3ZDUA 3A4PA 1BI7A 3G6GA 2J2IB 3FSKA 4FBXA 3M11A 5AX9A 5JFXA 4O7YA 4II5A 1WVXA 3W8LA 3U4WA 2O65A 3QYZA 4UBAA 2BVAA 3PJ1A 4EWHA 3PXFA 3U6JA 3LPBA 2WMUA 4HZSA 1FVVA 4W4YA 3IW6A 3FLWA 3ORMA 3IOKA 3LCTA 4C4HA 4DH7A 5IEVA 3QLGA 3LOKA 3AD4A 3Q3BA 3WZDA 4EOKA 4C35A 3UOKA 2VO6A 2W1HA 3H9FA 3PWDA 4QTAA 4WBBB 4Y83A 3ZC6A 4LL5A 3ODZX 4HVSA 3VBWA 4RJ8A 4IWDA 4AT3A 4U41A 5EHLA 3I81A 2AC5A 3LFSA 4FG9A 2E9NA 1E1XA 4J99A 5HESA 3VHKA 1J1BA 5EW9A 4BHZA 4O7ZA 4BVUA 5LCJA 3KN5A 4RFZA 2W0JA 5B2KA 4F9AA 4ACMA 3EJ1A 4IXPA 4MNEA 5D11A 1ZAOA 4ASEA 2CKPA 1X8BA 3MIAA 3TDWA 3L8XA 3P4KA 4IZYA 2ETRA 3LQ8A 3QQJA 4AX8A 5DRDA 3KMMA 2VTQA 4JX3A 3ORTA 4EEVA 3OP5A 3V04A 2OJGA 2YM4A 5CEKA 3F5GA 4ZS4A 2VTOA 5AUZA 4BHNA 2JIVA 5J5TA 4QP9A 3PVBA 2GQGA 2I0YA 1U54B 3DAJA 3OTUA 4BI2A 2UZEA 4K77A 2Z8CA 3K2LA 3ANQA 3HV7A 3L1SA 3BIZA 3DJ7A 3WF9A 4B9DA 5BVEA 5BVOA 2QI8A 2WEVA 2YJSA 2WTJA 3KGAA 4M0YA 4HVHA 4I6FA 3SD0A 2EWAA 4FTLA 3KXGA 2WO6A 2Z02A 2XMYA 4LOQA 5AUYA 3U55A 3BWJA 2CLXA 4I93A 4Z16A 1JWHA 1JVPP 2JC6A 4ONAA 3LM5A 4CRSA 2XYNA 5IUHA 1M7QA 5HGIA 4M84A 5T3QA 4IAYA 3E63A 3ZO3A 4L52A 2VX3A 4D1SA 3A7JA 5JFSA 3BGPA 4E4MA 4F64A 4UMPA 3ORLA 4JAIA 4XV3A 2W5BA 4GH2A 4YLKA 1GAGA 3MS9A 4CMUA 5CX9A 1OPJA 3BHHA 2WTKC 4CVAA 3HEGA 2XK6A 2XBJA 4KRDA 5DFPA 3AC3A 2EB2A 4IJPA 4FGRA 4IVAA 5L2QA 4FUYA 1IA8A 5KE0A 3P08A 4AW5A 2AUHA 3O2MA 3Q5ZA 4WNMA 5LVLA 3G15A 3C4XA 3HP2A 5HE2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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