3L8XA

P38 alpha kinase complexed with a pyrazolo-pyrimidine based inhibitor
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
349
structure length
326
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARATRWYRAPEIMNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Pyrazolo-Pyrimidines: A Novel Heterocyclic Scaffold for Potent and Selective P38 Alpha Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 326
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3l8xA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3l8xA01
4HCVA 4YZBA 3E8CA 2C6KA 3OBGA 4O7YA 3N51A 5E1EA 4QYFA 4BICA 4NTTA 5DYJA 4DT8A 1ZXEA 5L6PA 2QKRA 5CSWA 3UNZA 4DEDA 1ZRZA 3EYHA 3GFWA 5K4IA 1I09A 2W4OA 4PMPA 5LWNA 3ZHPC 3ZLXA 4BIDA 3DFAA 4UMPA 4Y5QA 4BBMA 1JOWB 3UDBA 3ZH8A 3UZTA 3OCTA 3COKA 3WF5A 2V62A 1OZ1A 2Y6MA 2YM4A 4X3FB 3VHEA 2VO3A 3AC1A 5BNJA 3IONA 2Y9QA 3MFRA 4PL3A 1UU7A 5AR7A 5J5SA 3H3CA 2DS1A 4RRVA 5FDXA 3UNJA 4U43A 3KULA 2Z8CA 4MXZA 4C4JA 3MWUA 2F57A 2RF9A 4ZY5A 4X6RA 1JLUE 2YCSA 3BQRA 5CAOA 3PXRA 4UXLA 5IA5A 2WIHA 5DR2A 5BYLA 3LXNA 3TACA 5AUTA 5EDPA 3LJ2A 3D2KA 4RVKA 4IX6A 5M4IA 3QKLA 5TOZA 3UOHA 1OPJA 4UN0C 2BZIB 5LMAA 3RAKA 4AF3A 5HE0A 2O3PA 2XF0A 2W4JA 2XRUA 3QCXA 5LCKA 2OFUA 5TKDA 4E6DA 3QCQA 1H1WA 4HJOA 1P4FA 1YKRA 5AAEA 3UO4A 4BDKA 4GK2A 4ZLZA 1ZOHA 3KCKA 2BAKA 3D83A 4EUTA 5IA4A 4KINA 5F4NA 4R7HA 4AZFA 4BI1A 3FZSA 2ETMA 4DGGA 3BX5A 5HOAA 2BHEA 1NVRA 2HCKA 4E6CA 4II5A 1ZOEA 3PA3A 2C6LA 3P7AA 5FXSA 4Y72A 3F3VA 4LGHA 4FTAA 4M14A 2XUUA 3P5KA 1R78A 2F7ZE 2QVSE 3FMHA 4TYHB 2R3OA 2C1AA 2Z2WA 5AP4A 2R0IA 5HE2A 3OC1A 1H26A 5C01A 2IW9A 2ZJWA 4MXAA 3PJ1A 2VWUA 3W2CA 5B0XA 4GRBA 4BCIA 2W1DA 4XEYA 3O7LD 5JQ8A 5C4KA 1BI8A 2X0GA 4B7TA 3KXGA 5HTIA 5AM7A 3PPZA 4JLCA 3BWFA 3S2PA 4CLJA 2QOIA 4YR8A 2ITYA 5D7VA 2BZHB 3JS2A 4EONA 2ERKA 4F63A 4PF4A 3V5LA 3SXSA 4RIWB 5FDPA 3BHUA 3NIEA 4NKSA 5J7HA 5M51A 5D7AA 5AP6A 5HD4A 4GSBA 3H0YA 1CTPE 3CQUA 4YPSA 3VS6A 3CS9A 4QRCA 5E90A 1T45A 2F9GA 1IA9A 4CKIA 3AMYA 5C4LA 3EFLA 4IWPA 1JKLA 3GCUA 4N0SA 2VRXA 3OEFX 5F9EA 2YISA 2W96B 4LRMA 2DUVA 4FSUA 1QMZA 4C33A 3R83A 5K4JA 3NYNA 4ZTLA 3LMHA 3QQFA 5ANKA 4BDCA 2X4FA 4JIAA 3UGCA 3SW4A 2A0CX 2Y7JA 4LMUA 5CS6A 3CY3A 1H01A 4L3LA 3MVMA 4I4FA 1H27A 4ZSJA 3R9RA 3BU3A 1W98A 4JI9A 3CKXA 1CKIA 2WMAA 4C36A 3DBEA 2V7AA 2ZV9A 3D5XA 5H8GA 1ZOGA 2QOQA 2FA2A 1KOAA 4EOSA 3B2TA 2IW8A 3TM0A 4WT6A 2XNEA 4EBVA 3WF7A 1OM1A 2EWAA 2XIRA 2J4ZA 4OTQA 4S2ZA 4X0MA 4ZMFA 2PVNA 2GS2A 3OWLA 2A19B 4G3DA 4QMWA 5BYZA 2WO6A 4D55A 1Y8GA 4KKGA 3FYJX 5KBRA 3UP2A 5A4CA 4LFIA 3NW5A 3PWYA 4RC2A 3VS0A 3ORIA 4EYJA 5CSHA 3CY2A 4W4XA 3RHXA 3OCGA 3R22A 1W8CA 3R04A 5M53A 1RJBA 3FKOA 5D11A 3QD2B 4JG8A 3BYUA 1PXKA 2X7OA 2X6DA 3O2MA 2UW6A 1J7IA 1IAHA 1FVTA 3NZ0A 3QC9A 3RWQA 3TKHA 4C0TA 1WFCA 3GB2A 3OOMA 3R8UA 4YU2A 3R9OA 5CZIA 5IQAA 2WQMA 2ZM4A 3I81A 3Q6WA 4BDDA 3F88A 2FH9A 3EQPA 3QCYA 2W5HA 1R0EA 4PRJA 4YZCA 3NGAA 4IAAA 4S34A 4ALUA 4F4PA 3PSCA 4LRKA 1UU3A 3OUKA 2PU8A 4QP9A 1OBGA 4PDYA 2OSCA 2BTSA 3QLFA 1YI6A 2PMLX 4DFLA 5ANIA 3II5A 4P5ZA 3FV8A 3VUIA 4W4VA 3F6XA 4R3PA 4XP2A 4O82A 4S33A 4DINA 4G3FA 4NUSA 2XBAA 3CQWA 4LUDA 5CTPA 1FMOE 2XJ1A 1AGWA 4YJTA 2QODA 2HYYA 4HPTE 4K6ZA 3RK9A 1PYXA 3CBLA 3Q4UA 4JOAA 4AN3A 2I0YA 3F3UA 1Y91A 3MVHA 4IJPA 5HIDA 5CQWA 3KY2A 5AAFA 5L2TA 3EWHA 5E91A 3IDBA 2O64A 5LVOA 4I6BA 2HENA 1K2PA 2BDFA 4QMZA 4RJ5A 2B54A 2HXQA 2OK1A 4QTBA 3FLYA 3Q9YA 4YTHA 2QOKA 4ZSAA 3SG9A 2ZVAA 4YJVA 2CMWA 4HVSA 2ITPA 4G3CA 5AV3A 1JQHA 4EH8A 3TG1A 1O6YA 3ODYX 2J51A 2BRMA 2WTKC 3D14A 2WGJA 1M7QA 3GXLA 3M42A 3VS1A 4L8MA 4QYGA 3VBWA 4MQ2A 2XEZA 3HDMA 1PKGA 3E64A 3Q9XA 1V0BA 3V51A 2CGUA 3U9NA 3UIUA 5I3RA 2XRWA 3SW7A 2IWIA 3MY5A 1Y6AA 1WVWA 2XM8A 3D2IA 3Q60A 4LI5A 4FL3A 3F3WA 5B7VA 5IA2A 1UWJA 1EH4A 3AT4A 3EQDA 4AGDA 3OT8A 3VS5A 2CDZA 5JK3A 1UNGA 4RWIA 4QMXA 4ORKA 1JSVA 5AX9A 5DBXA 3UQFA 4DITA 4E4XA 2FSLX 3UQCA 1Q99A 3NW7A 5BVEA 3AT3A 3I79A 3RHKA 3FEGA 2PTKA 3EN9A 5IEXA 1M17A 4C4IA 2BROA 2HZ0A 4WG3A 5CYIA 5GIPE 3ZOSA 3RPOA 4AN2A 1B38A 2FSOX 3R30A 3KMWA 4QP7A 1W84A 1Y57A 3BHHA 1OITA 2UVYA 4U45A 4KS7A 4AZVA 4YC8A 2R3NA 2HY81 3GU5A 5AIRA 4E8AA 1HCLA 3VQHA 5GZAA 1TQPA 3I6UA 2PVHA 3MPMA 4P5QA 1RDQE 2W4KA 4FTNA 3BIZA 4G34A 4LUEA 3PVGA 4BCGA 2BAQA 1APME 3E8EA 1ZAOA 5IQIA 2JFLA 4PPCA 3OOGA 3AOXA 3KGAA 2WNTA 3ZC5A 5FGKA 3FI8A 4FVRA 3DQXA 4RVLA 2WQEA 1RW8A 4XS2A 3C9WA 3VF9A 1G5SA 2BALA 2YIWA 4QTCA 2GPHA 4WBBB 3O23A 4WNOA 1MRUA 3DPKA 4HOKA 4BYJA 2R3MA 2VAGA 2WMWA 3EYGA 5HG9A 5C8MA 3QTRA 1GIHA 3R71A 4JVGA 5L3AA 4UBAA 5JSMA 4AZTA 2BFXA 4JG6A 4NU1A 4FT3A 4IJ9A 3ULIA 1FGKA 1DAWA 2BRNA 4LGDA 5FEDA 2P3GX 3TXOA 4AZSA 4O7TA 1G3NA 4H36A 3TNQB 5ANGA 5CWZA 3DKGA 4DEBA 3COIA 4IDVA 5BQ0A 3V5TA 3LXPA 4J97A 5AP0A 1QPEA 1XH7A 5LVPA 3EN7A 3C4FA 2GHLA 3QBNA 4CD0A 4BL1A 4CXAA 4BZDA 3ZO4A 3RNYA 5C26A 4IVDA 3MA3A 2C3LA 3FMMA 1WVXA 4C8BA 4M12A 4M66A 4J53A 2OJFE 3KRXA 3C51A 2B1PA 4O0XA 2YM6A 5HE3A 1OL7A 5BUEA 4F7SA 2QR7A 3F5XA 3UP7A 4BYIA 4DTKA 1Z57A 4EH5A 2QKWB 4AGWA 5DA3A 2PE2A 5HTBA 5EM8A 5E92A 4DFNA 3UG1A 3BHVA 3OHTA 3R2BA 3QTUA 4I6HA 5KZIA 5CEKA 2CKQA 2CNUA 3F5PA 3VHKA 3W18A 4RT7A 5JFVA 1H1QA 1PW2A 3PY3A 5KMIA 2NPQA 4QMMA 3T3VA 3ZC6A 3D4QA 4XBUA 5LJJA 2O0UA 4XJ0A 4EOOA 4O21A 4C4EA 3FMEA 2WMTA 2WXVA 3D7ZA 1PYEA 3DB6A 3M1SA 3BQCA 4FT7A 4F1OA 1BLXA 4UMRA 3NUSA 3F3TA 2PVLA 3HP5A 2C3JA 2VWZA 3CJGA 5HNGA 4FV4A 4RSSA 4V0GA 4LQMA 5AIKA 4E6QA 4YJSA 3EQCA 3GCVA 3QYZA 4RA4A 4DH7A 3O8PA 4G6LA 4ZY6A 3U8WA 4M3QA 4BKJA 4C3PA 3UNKA 1OKZA 5CU6A 3R9HA 3IKAA 3ZXZA 5CEOA 1YHSA 1JSTA 3NYVA 4FKOA 3Q9WA 5TR6A 3V5WA 2XK4A 3PUPA 4O0YA 3VUHA 4R5SA 3OW4A 1WVYA 2C3IB 1KE9A 3BE9A 4AT5A 5LOHA 5M4UA 3LJ1A 5AP2A 3NIZA 5IA3A 4WBOA 4RX9A 2CLQA 5DG5A 2CN5A 4O86A 4XNEA 1O9UA 1XH8A 2DQ7X 4UZDA 2BFYA 5AX3A 5HEZA 2VWYA 4IQ6A 2IZUA 3FXXA 3GUBA 4O7NA 4Z7HA 4G2FA 3ZCLA 3F2RA 5IA1A 1YOLA 4FEQA 2PPQA 4FX3A 4L67A 4ZK5A 5DGZA 3IOPA 3NEWA 1KE6A 4C62A 3TCPA 1OL5A 4PDSA 4YZNA 2UZTA 4DG0E 2F7XE 1TQMA 4ZXTA 3ORZA 1YDRE 2OLCA 4AS0A 2W7XA 3FUPA 1VJYA 4R1YA 1O6KA 4G9CA 5AWMA 4QQ5A 3FMKA 3OFMA 3UO5A 4DC2A 4W8EA 4H05A 4BR3A 3ID6C 4AU8A 2EXCX 3CCNA 4FEWA 2QU6A 2C5YA 1CKPA 3DB8A 3DJ6A 4WG4A 3T9IA 2FSMX 3UTOA 1PMUA 4F0FA 4KWPA 3IS5A 4HVDA 5DNRA 4AP7A 3U6HA 4KNBA 5HO6A 4ID7A 3P86A 4ZEGA 5A4TA 3QD3A 1ZWSA 3QZGA 4CGAA 2IPXA 4CMUA 2O65A 3PSDA 4DLIA 2ITTA 3ODZX 3PPJA 4NEUA 2VTOA 2W05A 4BGGA 4D2TA 4QMNA 2E9PA 1JSUA 3MPAA 4Z16A 3QKMA 1ZMUA 2YJRA 4FV3A 5GZ8A 5ICPA 4EEVA 3UVQA 1SM2A 3B8QA 1DI9A 3UG2A 2R7IA 5J87A 3KXMA 4IWDA 3ETAA 4WIHA 3GQIA 3S95A 3E3PA 4AOTA 3MTFA 3RCDA 4WRSA 4AT3A 4U80A 4O91A 4IX5A 3DNEA 5CSXA 4FT9A 2UZBA 5EFQA 3ZM9A 4RIYA 4UY9A 2UW3A 4IAZA 5A6OA 5JGDA 4PNIA 3ATTA 3E92A 3MH3A 4FL2A 5BUIA 3DTWA 3OVVA 4C4HA 2I1MA 2VU3A 2JAMA 5FTOA 5K5XA 4FV9A 2R3RA 4MD8E 3FL4A 1BKXA 4RIOA 2BIYA 4RC4A 2YAKA 4TNDA 3SOCA 3IGOA 4WSQA 5GJDA 4BHNA 4O6LA 4CCBA 5HD7A 1M2RA 3DTCA 4X2NA 4I0RA 2V55A 3VS7A 3ERKA 4BHZA 4YLJA 2BR1A 2J0LA 5I9UA 4BTFA 4D9UA 4OTFA 3MN3A 3BGZA 1GNGA 3PIXA 5CQUA 5DEYA 5IEVA 4QMUA 1XH9A 3TNIA 3MGYA 3OCSA 4C34A 3C13A 2VTIA 3ELJA 2FO0A 3I1AA 4FIGA 1P14A 4RLKA 4ZP5A 5IISA 4KAOA 5GINE 4IACA 3HV4A 3IO7A 3NUAA 3UC3A 4IZYA 4GIHA 3UOKA 3ZFXA 4TW9A 4FE2A 3D15A 2QURA 4O0RA 5CSPA 4O0WA 3CE3A 3TNWA 5A4EA 4L46A 2UZUE 3QXPA 2YLEA 4R78A 2B55A 5ANJA 3WYXA 5M4FA 2PVKA 5HNIX 1NW1A 2XIZA 3S3IA 1FVRA 5A54A 3QZFA 4U41A 4XV9A 5KMKA 4Q5HA 4ZMEA 2WTCA 4DLJA 3MFSA 4YHJA 2ETRA 2YJSA 1FPUA 5TT7A 4MQ1A 4GUEA 4HYUA 3SHEA 1P5EA 2G9XA 2A1AB 3BI6A 2ONLA 2O63A 4DGOA 5G1XA 1VYWA 5ETFA 3FY0A 3TV7A 3RJCA 3EN4A 2OU7A 2A27A 4FEXA 4FIEA 3LFBA 2CGWA 2R4BA 3I5ZA 4MBIA 5EM6A 4ZIMA 5TF9A 2OIBA 4FZAB 3NCZA 3OW3A 4TWPA 3FBVA 4NSTA 1HOWA 3LCOA 4RC3A 4FOCA 4IWOA 5CSVA 3G6GA 3PIYA 4MAOA 1OMWA 4YO6A 5DI1A 3EOCA 5GIOE 3NVKI 5CALA 2G2HA 1S9IA 1WAKA 2PVFA 4V05A 1XHAA 1LPUA 4KIKA 2Y4IC 3FAAA 3QHWA 3FZTA 2UZVA 2JIIA 3E3BX 4G6OA 3VVHA 3EZVA 2VO7A 4JNWA 4HGSA 2OF4A 2W1ZA 4W9WA 4YZ9A 3QUDA 4YBKA 5AR3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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