3LCSA

Crystal structure of the anaplastic lymphoma kinase catalytic domain
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
304
structure length
304
Chain Sequence
YCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRAGYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the ALK (anaplastic lymphoma kinase) catalytic domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 304
sequence length 304
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lcsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lcsA01
3TTJA 3B2TA 3RAWA 3IKAA 4JG7A 2JIUA 2WMTA 4KSQA 2JGZA 1FGIA 1MQBA 4R1YA 4YP8A 4BN1A 4LOOA 4CFFA 3UNKA 4PUZA 3EB0A 4ENXA 3MESA 3Q53A 3VBXA 3IO7A 1XR1A 2BIYA 2FVDA 2YN8A 4CRLA 4XJ0A 3G2FA 1R0EA 4QPAA 3COKA 2IJMA 1TQMA 4I5HA 1PKDA 2C5VA 4CMUA 3QD0A 4RIOA 2X7FA 4KBKA 2PZ5A 4JI9A 5CS6A 4ACMA 1PXKA 2C6OA 3MY1A 3WZKA 3LAUA 3FC1X 5TT7A 5E8XA 3O51A 3PA5A 4QP9A 5CAOA 5CNNA 4FEVA 3T8OA 4OGRA 3UYTA 1YOJA 4AW2A 4FVRA 4I6HA 5TE0A 3WZUA 4PPAA 5KMOA 2G2HA 2XUUA 3GEQA 3OXZA 4FK6A 3RCDA 3BE9A 3O8UA 3QKMA 2J0KA 4QMWA 1M14A 3BQRA 4DEHA 3CPCA 4CFNA 3CBLA 4LRJA 3NYNA 3PPZA 3QAME 4FA2A 3HV5A 3MBLA 5GJFA 4ACGA 2YIXA 4BCGA 4EBVA 4F08A 4I5CA 1GJOA 2XS0A 4FIGA 5DH3A 2E9PA 4K8AA 4CFUA 4WRGA 2BDJA 3PSCA 2VAGA 3ATTA 2OXDA 1YXXA 5AR4A 3R7OA 2C1AA 4FTCA 4QYEA 5AADA 5AR7A 2NRYA 4I93A 4NCTC 3IW7A 1XH8A 4FIFA 3IOPA 3UGCA 3PJ2A 4CQEA 4BDCA 4NSTA 3L1SA 2QVSE 1E1XA 3NAYA 3QUEA 4RWKA 3UP2A 4ZS4A 2FGIA 2C68A 3PWYA 4YNOA 3TT0A 3PXQA 3O2MA 2VTSA 2ITOA 4D28A 4L6QA 5F95A 3ZLYA 5HTBA 3OVVA 4XV1A 2KTYA 4OAUC 3AGLA 3QXPA 3DK7A 1K3AA 4N6YA 4PL4A 3O8TA 3F5GA 5TO8A 4W4XA 3HA6A 2OIBA 5CVFA 1Q8ZA 3GFEA 4FSRA 4YMJA 4IXPA 3DPKA 4AA5A 3GENA 4QP6A 4H1JA 3ZXZA 2WMQA 3MVMA 5HVYA 3HDNA 1FOTA 4S31A 5KBQA 4FSYA 3LFQA 4U41A 2WXVA 5I9XA 4PP9A 4CV8A 4F65A 4GG7A 2B53A 3FXXA 3UIBA 5IA4A 2ZM1A 1PF8A 2PSQA 1JSTA 3HMOA 2JBPA 4ZLYA 4ZSAA 2YEXA 3N9XA 3I5ZA 4HVSA 4BYIA 4KKEA 1Q97A 1OITA 2PUUA 1J91A 4R8QA 4ANBA 3GXLA 2XKDA 4G9RA 4H1MA 4XRLA 4YJVA 4G3GA 3VBYA 4AE9A 5IA3A 3D14A 4QQCA 4IVDA 3WZEA 4HGLA 4APPA 3R7EA 4GKHA 4PWNA 3UBDA 5J79A 3QUDA 1OM1A 4XH6A 5FEQA 3SG9A 5JK3A 4DFUA 1CDKA 3OOMA 2W06A 2W9ZB 2PK9A 2XRUA 4FK3A 2ZOQA 4U9AA 3RZFA 3NRMA 3TDVA 5JN2A 1ZYJA 4I23A 4YJUA 3VF8A 1H8FA 3BHVA 1JPAA 4WG4A 2R3IA 3O71A 2A19B 3FY0A 3KN5A 4AE6A 3LQ5A 1VEBA 1UU7A 2C3KA 2QCSA 4I0TA 2A27A 3ZSIA 4YTIA 2VNWA 3JUHA 3OS3A 4HNFA 4BRXA 3PFQA 2A4LA 2F7XE 2ZV2A 4LGHA 3ROCA 4ZP5A 4UX9A 5EHYA 3F3WA 4MXOA 4FKJA 4R3RA 4L9IA 4IQ6A 4AN3A 3VRZA 5KBRA 3NUYA 4BDAA 3O23A 5LCKA 4XG2A 5AUZA 3R8LA 4TKSA 4QTEA 1Q8WA 5AM6A 2QO9A 3CC6A 2R7IA 4W9XA 4N70A 3MVLA 4FTMA 4DEDA 3SD0A 3PLSA 3G33A 3ZOSA 3A8WA 2VUWA 3CTJA 2SRCA 2O8YA 4H3QA 4O0WA 2WAJA 4F0GA 2R3QA 3OW4A 4TNBA 2WMAA 2R3JA 3Q9ZA 4CFVA 2C6IA 3ULZA 5TKDA 3FHIA 4D0WA 3MH3A 4LL0A 5DT4A 4BBEA 5IDNA 2RF9A 4O0UA 4BCJA 1R39A 2R0IA 4I5MA 3ZRMA 3GI3A 4X2GA 3PJ3A 3NW5A 4DLIA 3ZMMA 1H01A 4IACA 4U3YA 4O0VA 4RIXB 5A54A 3GQIA 1H08A 4AZEA 5J1VA 4QMPA 5KMLA 4TRLA 1R0PA 2XCKA 2VTTA 1UNGA 4G2FA 4BWXA 3IDCA 5AP1A 4IAKA 3HV7A 3I79A 3ZBXA 3NUAA 4O38A 3W16A 3ZLWA 3KMMA 2VTMA 4ACHA 5M57A 2XYNA 5EKNA 3H3CA 4ZSJA 2C5XA 3EQDA 3VW8A 1ZYSA 3MIAA 4F1OA 5HO8A 2DS1A 2OLCA 2B54A 4IC7A 3RZBA 3MH0A 4RC3A 3NDMA 3DKGA 4QTBA 5FGKA 2QU5A 2UZTA 2A0CX 4FIEA 4H3PA 1J1BA 2QOCA 3NNXA 3K5VA 3F9NA 3UC3A 5CEMA 4KIKB 3HV6A 5J95A 3TKHA 1OIQA 4A7CA 3KQ7A 4FEWA 1OMWA 2GU8A 1YWVA 2X1NA 3QTZA 3ZYAA 2OG8A 2WFYA 1J1CA 2OJIA 4R7BA 4MX9A 1ZYCA 3KVWA 2C1BA 2VTNA 2C3JA 4FZDB 3QTUA 3Q60A 4ZTRA 3BIZA 2FA2A 2J0IA 4YJQA 4MD9E 4QMUA 1MUOA 4FKUA 4MEDA 4QT1A 2IZRA 3KFAA 1VYZA 3Q9YA 4UEUA 2ITXA 5TOZA 1ZOEA 3WILA 5AV3A 3LCSA 4AACA 4HW7A 3G6GA 4GCJA 3E8DA 2HCKA 3GFWA 3OT8A 4G5JA 3H0ZA 3FPQA 2W99B 4BC6A 1O9UA 2XKEA 4XX9A 2JAMA 4MVFA 3R7VA 4JQEA 2CJMA 3F2NA 3KVXA 3EMGA 3RK5A 3NNUA 3V8WA 3K54A 4RC2A 4AW1A 2Y4PA 3K5UA 3ID6C 1R1WA 3ZCLA 3OUKA 1ZY5A 3NYXA 3QTQA 5IA0A 2YM5A 4P90A 4BICA 1XBBA 3I5NA 4H58A 4RFYA 3TXOA 3N4VA 4XEYA 2CPKE 1ZWSA 2RKUA 3FY2A 3PYYA 3F7ZA 3GU5A 4J99A 3T3VA 5EYMA 3PIXA 4NJ3A 3CQWA 2J6MA 2ZB0A 3OEFX 5CQUA 4QP1A 4BI0A 2XIKA 4MXAA 3WYXA 4QMMA 3FMDA 3CIKA 3KK9A 3PA4A 5TF9A 2XKFA 4Q9ZA 4FUXA 5CAUA 3N4TA 3R6XA 5DRBA 4L67A 4JX7A 3V5PA 4GIHA 2E9NA 3PSBA 4ZLOA 3P0MA 3QL8A 4FVQA 4G16A 4BDFA 1PXNA 4Y73A 3F3TA 2NRUA 4OW8A 3R2YA 2YFXA 2CKEA 3FLZA 5LARA 4PNKA 2JEDA 3UQCA 4BTJA 1QPDA 4ASZA 4FSNA 4QQ5A 5ANDA 4AW0A 5BYLA 2VX3A 4EHEA 3IPHA 4A4LA 4K18A 3UE4A 4D9TA 5BMSA 3GCUA 2PWLA 3P23A 4TWCA 2IZTA 5HG7A 3RNYA 4BDHA 4ZMEA 3HMPA 2DQ7X 3C13A 5AP2A 3U55A 1YI4A 3D83A 4FTUA 3WF7A 4DAWA 3I7BA 4GU9A 3KEXA 5JRSA 3MPAA 3C5IA 1Q99A 3JY0A 1A06A 3GC8A 5LMBA 4EKLA 4L68A 3TKIA 4GG5A 1R78A 3QC9A 4XLVA 4XV2A 4AGDA 4BZDA 4LQMA 3S2PA 5H3QA 3G9LX 1VYWA 2PMNX 3V04A 2VGOA 1YXTA 4MF0A 4X0MA 4DEBA 3S1HA 5M06A 4C3FA 2PE1A 4J53A 3VS6A 3F61A 2X9EA 2WU6A 1P4FA 4C36A 3MS9A 4E5BA 4BGQA 3QTXA 4EKKA 1OL1A 4OBOA 4Y83A 3L8PA 1YXVA 3G51A 4QP7A 4IEBA 2XF0A 3BE2A 3FI2A 4JOAA 4C33A 2BILB 5H2UA 4DN5A 4UV0A 4A9YA 3BHTA 3ZZWA 4BDJA 4F7NA 3LM0A 5E90A 5KKRC 4NZWB 1QL6A 2I0EA 2GTNA 4XG8A 1DM2A 2J5FA 4MTAA 2CKPA 3AG9A 1Q62A 4DLJA 4Y72A 4KABA 3BLQA 2YISA 4PDPA 4IM2A 4NJDA 3RHXA 3QKLA 5IQGA 4FKSA 1Q8UA 4GU6A 4R5SA 3ALNA 4NM3A 3V01A 4AT5A 4R77A 2QLUA 3DXNA 1P4OA 4ITHA 4OTFA 5H8EA 1JBPE 4YJOA 4U7ZA 2G2IA 3TV4A 4O7LA 4ONAA 4PDSA 3F69A 3CD8A 4BB4A 1PRYA 2DUVA 1REJA 2XNBA 2WTDA 3EYHA 4CV9A 2B0QA 3CY3A 2GNGA 3UODA 2X6EA 3V8SA 2ESMA 3W2QA 3ZFMA 5E1SA 5BUEA 2QKRA 4FYOA 5C26A 1M2QA 4C34A 1V1KA 2O64A 1XH5A 2YIRA 3B2WA 5F20A 3RINA 4I24A 4QMZA 3RWPA 1OKZA 5IMEA 4D9UA 4ZZNA 1AQ1A 2HW6A 3ZUUA 2YCSA 3QD4A 4NEUA 3VW6A 3ZHPC 5DGZA 3R9OA 3RTPA 4EH2A 4OTPA 1J3HA 4WUAA 2CKOA 5M56A 5HD4A 3CJGA 1RQQA 4O91A 3FZRA 4QYFA 5AJQA 3DBQA 5FDXA 1Q3WA 5C03A 3VWAA 3BU5A 4K1BA 1H4LA 4D1XA 3NS9A 3OWJA 4DITA 4CKRA 4UMUA 4CZYB 2OH0E 2YITA 3DS6A 3KCKA 4B6LA 2IW9A 4WNPA 4BL1A 1WBPA 5AEPA 1SVHA 3PRFA 1V0BA 3IONA 5IUIA 3QQJA 3LFAA 3KXHA 4FT0A 2CNVA 5DG5A 4M8TA 5L6PA 4X2FA 4C02A 2Y0AA 4EH4A 5BNJA 1CTPE 1WZYA 4ANLA 2BFYA 4LUDA 2R0UA 3QU0A 2G1TA 4IADA 4O96A 5HI2A 2YCFA 4YTHA 1I44A 1STCE 4FV5A 3RALA 5IQCA 3C7QA 5I3RA 3A7HA 2HZ0A 3KULA 2ZMDA 4TWNA 1BMKA 2CMWA 1KE8A 3KC3A 4OT6A 5HX6A 3ZDIA 1MRYA 2VWVA 3FSKA 3GVUA 3HMMA 4LUEA 4GK3A 4JS8A 4V01A 5DIAA 3O8PA 3TV7A 5HU9A 4Y5QA 3P4KA 4V04A 1TKIA 1OIYA 3DLSA 3L9PA 4J71A 4P4CA 4PQNA 5B2KA 1Q4LA 4JBOA 2CNQA 5DT0A 4E4MA 3CJFA 1UV5A 5CF8A 5T68A 1A9UA 4UYAA 5DE2A 4C8BA 3R9HA 1WVYA 3ZUTA 3OF0A 1UKIA 3EIDA 2PVNA 4I6BA 5FDPA 3U9CA 5HQ0A 3FZOA 5BMMA 5J7HA 1LUFA 3W18A 4CKIA 4U79A 2B4SB 4LRKA 4D1ZA 5JZNA 4NUSA 3F7WA 4BKYA 4XG9A 2C3LA 1UKHA 4UMQA 2I0YA 5LOHA 5L2IA 1OUYA 1ATPE 4O7YA 4EEVA 3NZ0A 2ZV9A 2HW7A 4PTEA 4KKGA 2YLFA 5HBHA 2J0MB 5K5XA 3WE4A 2J4ZA 3VUMA 3RPSA 5HX8A 5HLWA 3F3UA 2R5TA 4A07A 3AQVA 3T3UA 2IVSA 4O1OA 3NUXA 3FKNA 3KXGA 4NM0A 3UMWA 5J5TA 4EC9A 2UUEA 4XS2A 2BAQA 4EK8A 3VF9A 3NUSA 4I6QA 3ZLXA 2VTOA 4ZJIA 1V0OA 4DGGA 4G1WA 5DOSA 4ALUA 3FLSA 3GU7A 3UG2A 3R21A 4IVCA 4BZOA 5GZAA 3MSSA 3VRYA 3LKMA 2IWIA 1GZNA 4L3PA 1OL5A 3F5XA 4DG3E 4GT3A 4FTNA 1J7IA 5JH6A 3LW0A 4F64A 5AA8A 4EOLA 3CD3A 3R1YA 3E92A 3H30A 4KRCA 1OECA 5M07A 4O84A 4U80A 4FIHA 4F6UA 5JFWA 2CNUA 2BKKA 4OUCA 3P5KA 1DI9A 2PVLA 2BRMA 4ITJA 1PYXA 4OBPA 3WZJA 1FMOE 1CMKE 1OL7A 4IX4A 4EH8A 4CTCA 3EN9A 3PA3A 3Q52A 4XBRA 5B0XA 1RE8A 1FGKA 3LXPA 5HHWA 4M67A 4CLIA 4AGCA 2J0LA 2VWWA 2ITPA 5EK7A 4BWKA 3AT3A 4RIXA 4YZNA 3TV6A 4DH8A 4FKOA 4BCKA 4PDYA 4JAIA 2IO6A 2XIZA 4UWCA 1UVRA 2R3RA 1QPEA 2AC5A 1JNKA 2JD5A 1U5QA 2R2PA 3AD4A 2Y6OA 3AMAA 3DKOA 3FMNA 4FVPA 4C62A 4EUUA 3FMJA 4YLLA 4XP3A 3I60A 4KA3A 4DBNA 3S4QA 5AR5A 1H1SA 4J8NA 2QC6A 4FV9A 2XM9A 2ETKA 5IQEA 3QRKA 5HE2A 3EKKA 3HUCA 5HESA 3PRIA 3NAXA 4KIKA 3W2RA 3C4XA 2BCJA 3RHKA 2Z7SA 3EYGA 5E8UA 1M52A 4O6LA 3EQFA 2XIYA 1UU9A 2QOFA 1U59A 3FJQE 3W2PA 4CMOA 4ANQA 4E1ZA 1DS5A 5HLPA 5J7BA 4Y85A 1JAMA 2BZHB 3WF9A 2OZOA 3UOJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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