3LQ8A

Structure of the kinase domain of c-met bound to xl880 (gsk1363089)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
293
structure length
278
Chain Sequence
IDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDDKEYYSAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of tumor cell growth, invasion, and metastasis by EXEL-2880 (XL880, GSK1363089), a novel inhibitor of HGF and VEGF receptor tyrosine kinases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 86
structure length 278
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lq8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lq8A01
2R2PA 3NX8A 4IC8A 5HBHA 4FF8A 2C0OA 1OB3A 1STCE 3L8VA 4GV1A 2YIXA 4GU9A 2PZYA 3QTXA 2OXDA 3LQ8A 1PXJA 1PF8A 3DDPA 2W9ZB 3PA3A 3P7AA 4LOPA 4BYIA 2YJSA 5FDPA 1TKIA 3U87A 2UVZA 4MXAA 4GT5A 3E5AA 3HRFA 3ORZA 3TUCA 4NM5A 3FMHA 1I09A 5BNJA 1SM2A 3LJ0A 4BKZA 2HY81 3ZO3A 3GCVA 2VTHA 4KRCA 4ZSLA 1IEPA 4CRLA 2W05A 1OL2A 3DLSA 4M0YA 5LWNA 1SYKA 3B8QA 3C13A 5A3XA 4CCUA 5EYMA 5CENA 5HBEA 4EOLA 3PE1A 3F3UA 1H8FA 2WMVA 4QP2A 4R77A 5FD2A 5LCKA 3NVKI 2UW9A 4O7YA 4DBXA 3WBLA 3VBQA 4GU6A 4E3CA 2VTQA 2BAKA 2B52A 4QTAA 3HYHA 4IZ7A 4RIXA 2J4ZA 1G8AA 1J1CA 3R8MA 2G15A 3W2OA 2GPHA 4FSMA 3KRLA 5CWZA 2PE1A 1PXOA 4P90A 4U9AA 2PZIA 4BI2A 4APPA 5FUTA 1P2AA 4EOIA 4QYHA 3MS9A 4NU1A 2V55A 3QZIA 5HLPA 4G3EA 5E7RA 2GHGA 2OXYA 4CT1A 5IQGA 4MWIA 3TZMA 1PXKA 3ULZA 3TNPC 2GS2A 3C4CA 3W32A 4EL9A 5I9YA 4MEDA 1Y6AA 3UP7A 4ALUA 5GJDA 4PMMA 4BDEA 2PVLA 4FOBA 4MXYA 2QU5A 2Y4IB 3GU5A 3EQRA 3OC1A 3OFMA 3QKLA 3GC8A 4F7LA 3QRKA 4P7EA 5JQ8A 2R3NA 2PY3A 1V1KA 5I9UA 1CKIA 3ENHA 3L1SA 3V6SA 3KN6A 3SOCA 1KE5A 5I5ZA 4CZUA 5HX6A 3DTCA 3F7ZA 2P2IA 4IZYA 3R1SA 4GK4A 4RZWA 4F9WA 4KSQA 5GHVA 4MXXA 4OTRA 3TCPA 4BCFA 4F70A 4YUQA 3FKNA 4X2GA 5EDPA 3GB2A 4FTJA 5KHWA 3LJ2A 5JFVA 5L8JA 4MD9E 2ZMDA 4JG7A 2WMXA 4NCTC 4BWPA 4F4PA 3CGOA 4O7TA 4DH3A 4I6QA 5GZAA 1OITA 2XBAA 3Q2MA 3ZRMA 3BYOA 3D83A 4I93A 4K0YA 5LVMA 1GJOA 4QP6A 3HA6A 3W55A 4TL0A 2YJRA 3CKXA 2PZPA 2QC6A 4ENXA 4CG9A 2OK1A 1JLUE 1SZMA 4IANA 4MQ1A 4DH8A 3OOGA 2XNBA 3QZFA 3F9NA 4KKEA 2ITQA 4FMQA 3VS0A 2VTNA 3V5JA 4ACHA 3HECA 4L53A 4NW5A 2IPXA 3QUPA 2IW9A 2W1EA 3IGGA 2YAAA 4YMJA 1QPEA 1ERKA 3VS1A 1XWSA 3NYOA 5FG8A 3DT1A 3A8XA 4G9CA 3TKHA 4YTCA 3KA0A 5K0XA 5LQFA 4FR4A 4TW9A 5HCZA 4G16A 3WF5A 4XRLA 1WVYA 3BHUA 3PXKA 3QD3A 4RWKA 4AN2A 3Q52A 4XBUA 3ZBFA 4WNKA 5LMBA 4IH8A 4UXQA 2CGUA 3UPXA 2OBJA 2WD1A 1LUFA 1MQBA 1GOLA 3PJCA 4L7SA 3F2RA 4LM5A 4LL0A 3VS2A 2Y9QA 2PUIA 4QTDA 4CKIA 4BHZA 4AU8A 1BX6A 3AMYA 4E7WA 1PXLA 5FWKK 4JRVA 3GCUA 3HNGA 4G3DA 3MA6A 4C58A 3QTZA 4S2ZA 1FINA 4KKGA 4PPCA 4BHNA 3VS6A 3OBGA 3BU3A 3MA3A 3WE4A 1B38A 5CSWA 3QLGA 5HNIX 4UMUA 4EK3A 3SXRA 5M51A 3KEXA 4FKTA 3VRYA 4FSUA 3VC4A 3R8PA 4RWIA 4GG7A 4QQCA 3VUHA 5KX8A 2XK9A 5E92A 4ACDA 4IVDA 4L3LA 3A7FA 4C8BA 4EOPA 4Q2AA 4FV9A 4RFZA 4EONA 4PMSA 1JNKA 2BMCA 3EFJA 3TT0A 3V8SA 4XJ0A 3NS9A 3VWAA 3D5VA 2YIYA 1IG1A 3P23A 3KGAA 4FZ6A 2C69A 3GBZA 3ZO2A 4WSQA 5E91A 4A4OA 4C4HA 1YDTE 4FTAA 2DUVA 3DGKA 3WZEA 3EN5A 3KN5A 4I6HA 3G9LX 4G3GA 4X3FA 4BGGA 3Q6WA 4JDJA 3NMUF 2X7OA 3AC3A 3SVVA 4H05A 4GK2A 2QO9A 4FG8A 3VUDA 2PUPA 5JGDA 4IX6A 3R83A 4G6LA 5JZJA 3UG1A 4RC2A 4AF3A 3BU5A 3QALE 3UIXA 4ALWA 4U3YA 3P9JA 4HGEA 3UVRA 3HKOA 3DKOA 4G34A 4BCMA 1W83A 4EH4A 3CPBA 4PRJA 4E4XA 4KUJA 4GYIA 2C1BA 1ZOHA 4FTKA 1H07A 2J0IA 3FDNA 3BLQA 4RJ4A 4FV5A 4MBIA 5J5TA 2OLCA 2RF9A 5KCVA 5AUTA 4CG8A 2OIBA 3DK7A 3DKFA 3FZSA 2B9HA 4ZTHA 4PDPA 4HCVA 4AA0A 4AN9A 4C34A 3HRCA 4Y83A 3IDBA 2J5EA 4ZTQA 5HLWA 4FKUA 5LVOA 3Q04A 1M2PA 4BDIA 1ZZLA 1EH4A 2A19B 4JS8A 3PVGA 4JQ7A 4XG3A 5AV0A 2FVDA 4R5SA 4S32A 3TIZA 3HL7A 3OZ6A 5M53A 3DFCB 2CHLA 5DN3A 2XA4A 4NEUA 1SNXA 3PG1A 3R8LA 1ZWSA 1FMKA 3EMGA 1RE8A 4J99A 3BWJA 5G6VA 4ZOGA 4EQMA 4TWOA 3UO5A 1FQ1B 4YZ9A 2ITYA 3BIZA 3C50A 4BC6A 3ZYAA 2J90A 3L8PA 5AADA 4JBOA 4G3CA 3HZTA 5A14A 4A9RA 4CNHA 5HE2A 2PU8A 2JFMA 3ZM4A 5H8BA 3OT3A 4ZTRA 2SRCA 3D5XA 1SVEA 4ZTSA 2AC5A 3Q5ZA 4I4EA 3S95A 3BV3A 5AIKA 2VX3A 3F3TA 4O86A 3Q9YA 4JAIA 4HVSA 5JK3A 5AV2A 3UJGA 4W8EA 5HQ0A 4Y73A 2C6TA 3ZEWA 3W10A 4GSBA 3ZXZA 4ANSA 2XK3A 3GCSA 3P86A 5IU2A 5K4JA 2VTRA 4YJRA 1U4DA 2HWPA 5AX9A 5AA8A 3BYUA 1KE9A 4ORKA 2GSFA 1CKPA 1XKKA 3T9IA 4AZSA 3TDWA 2XF0A 5HG9A 1GAGA 2OKRA 2OXXA 2R0IA 4HVIA 4DGLC 1Q3WA 2KTYA 2ZM3A 4W9XA 4HVDA 4UXLA 5FM2A 3HEGA 5J87A 2EXEA 5KBQA 2XM8A 4U41A 4BGHA 3C5UA 1XBCA 2JFLA 2GS7A 2FA2A 5JKGA 4AZFA 5H8GA 4F9BA 5CTPA 2UVXA 4IW0A 5ICPA 3EFLA 3JXWA 4N4SA 1J7LA 4UEUA 3F66A 5DOSA 3W2PA 2WEVA 3EOCA 4M12A 5AV1A 2UZUE 5A4CA 5CF4A 1ZZ2A 3VBVA 2B0QA 4BIEA 2DWBA 1FGKA 2XZSA 4WG5A 3HMMA 1R0PA 3AMBA 5TF9A 4DAWA 4XLIA 1XBBA 4V0GB 3VS7A 5AAFA 4O2PA 4F65A 3KK8A 4JRNA 4WNMA 2W99B 4EQCA 4EWHA 3N4UA 2GU8A 4NJ3A 2GMXA 4BKYA 5CAVA 5KMOA 3LFBA 4DFYA 4WA9A 4OR5A 2WMBA 3FI2A 4GUBA 2CSNA 3D5UA 3MVMA 4NYEA 4QD6A 2FSMX 3R7UA 2VAGA 3KRXA 4NW6A 4BCQA 1TQMA 5G1XA 5LXMA 2C6OA 4EK8A 2BKKA 5EI6A 4QQJA 4IAIA 4FTQA 4PP9A 3RPOA 4D1SA 5BYLA 3VF9A 4C4JA 4BICA 4FODA 1YW2A 4Z9LA 1HCLA 4GEOA 3O0GA 2J0LA 1XO2B 4F1MA 2CMWA 1JBPE 3EQIA 3HMPA 3IOKA 4IAAA 3WIGA 4W4VA 4GJ2A 4EHZA 5FP5A 4JLCA 3REPA 1JSVA 1YOJA 3P79A 2BHHA 5KE0A 1U46A 1Q3DA 2X7GA 3AXWA 2V22A 3A8WA 4YJSA 3VUKA 1IAHA 3SGCA 1WVXA 3OW3A 5HESA 3KCFA 4YURA 3E88A 3NZ0A 5E8XA 3V5QA 5JH6A 3VJOA 2QO7A 3UNJA 1PRYA 4FTMA 4FTUA 1Z9XA 2YAKA 4LGDA 4RSSA 5KNJA 3S0OA 2ERZE 4AACA 4Q5EA 2C5XA 4MWHA 2OIDA 4UZHA 1WBNA 3LM5A 4LL5A 3DXQA 2BALA 2J2IB 4JDKA 3W2SA 3COHA 1YI4A 2ZAZA 3FI3A 2LAVA 1DI9A 2BIKB 3D15A 3QLFA 4YJUA 3ZXTA 3PVWA 5C4KA 1YDSE 2RG6A 3L8XA 4F1OA 5I0BA 2VWIA 3NR9A 4J96A 3UG2A 2ZOQA 3SQQA 5JGBA 2PUUA 3CBLA 3NEWA 3TNQB 5BUEA 4NT4A 4RJ8A 1KSWA 1XHAA 4OT5A 3C9WA 3BYVA 3GP0A 4W8DA 4C37A 2ESMA 5HO8A 4BWXA 3NLBA 4MBJA 1YWRA 1ZLTA 2V7OA 3QRIA 4DN5A 4FA2A 4GG5A 4CFWA 4C59A 4HW7A 5BVOA 3ROYA 3ZEPA 3JVRA 2QOCA 5L6WL 1PXIA 4U7ZA 4BCIA 3DLZA 3W2QA 3R21A 3TKUA 4YHFA 5ETAA 3FZTA 4FL3A 4OBPA 4C61A 4FSWA 3TV6A 4B6LA 3L8SA 4YZCA 3RAIA 5L8KA 4MF0A 3QCSA 3A4OX 3QQKA 4RFYA 1M17A 1MRYA 4TYHA 4YZMA 4QMTA 3BELA 4XG4A 4C62A 4PP7A 4PDOA 5CSXA 5CEOA 5EQPA 4E5BA 5DNRA 1FMOE 4O2ZA 5DBXA 5B2KA 2YM8A 2XK7A 1M52A 4EEVA 4MD7E 1BL6A 4DFBA 2C6EA 2EB3A 3JPVA 4GUEA 5HLNA 2E9VA 2IZSA 2ONLA 2JKKA 4FT3A 3DZOA 2UZNA 2VGPA 3BHTA 4CVAA 3TDVA 5AR7A 2DQ7X 3R22A 2EXMA 4RPVA 2WKMA 1ZYJA 4YGAA 3JS2A 5AAEA 3N4VA 4TPTA 1LP4A 1OL7A 4N70A 4YC8A 3NYXA 5EM6A 4CTBA 2JD5A 4JG6A 4L8MA 3UC4A 3UOLA 4QMLA 3P7BA 4QP3A 4M67A 4OTGA 2G2FA 2XIYA 4ACCA 4A06A 5L6OA 3SOAA 3EL8A 3U6JA 4LGHA 4ANMA 4D4RA 2WNTA 1CDKA 3TJDA 4ZZNA 4GRBA 3UPZA 5IA4A 4ZSAA 2QG7A 5A46A 2XNEA 4PWNA 4BBEA 4XOYA 3TL8A 3VUIA 4CQEA 3PJ1A 4RG0A 3KY2A 3TUBA 2P3GX 4CFVA 3V8WA 3MGYA 3C0HA 4FEVA 5HTCA 4U44A 3GCQA 2P4IA 3ODZX 3VHKA 4CKRA 2UW0A 4U80A 4O0XA 4LQMA 5E1EA 3VUGA 2BROA 3MFUA 4Y72A 4BIBA 1T45A 3PJ2A 3O17A 4F7JA 4A9UA 3V5PA 5KKRB 3AC4A 3W8QA 4J1RA 3LCTA 3GGFA 4TWPA 2BUJA 4XEYA 5CX9A 5I3OA 5CLPA 3ET7A 1BUHA 2WAJA 3MIAA 4JR7A 3RINA 3LFAA 4F7SA 3IS5A 3H0ZA 4BYJA 4IEBA 3Q5IA 3OWKA 2X6EA 2X8EA 5F95A 5BVKA 3COKA 3M1SA 3SHEA 4YTFA 2JDSA 3G2FA 2Q83A 2HZ4A 4HYSA 4LOQA 2V7AA 2ETMA 5LMAA 2W4KA 5J1WA 1NXKA 3I6UA 1H1QA 3QGYA 3DBCA 4FVPA 2C68A 2IWIA 2PVJA 2QOQA 3QGWA 4I4FA 4H1MA 3C0IA 3R04A 3UQFA 3ATTA 2R3MA 4EBVA 3LVPA 3IQ7A 5EM5A 4O21A 4Y95A 5DGZA 3E3BX 4PTGA 4D5KA 2HZNA 5CAPA 1UU8A 3D5WA 2XUUA 3HRBA 1J3HA 4RVLA 3QWKA 2R4BA 5CT0A 4EYMA 4O6EA 4EHGA 2YCSA 2BAQA 1FVTA 4G31A 2CPKE 3PZEA 1UV5A 1DAYA 1Q99A 3OVVA 3DJ7A 4RIOA 4QQ5A 3QHWA 4QTEA 1IASA 4IQ6A 4MX9A 3VN9A 1K2PA 4DEAA 4C4IA 5HVKA 2J0JA 3AOXA 1WBVA 5GIPE 3R1YA 3SV0A 4C35A 1BLXA 5B2MA 4UX9A 4G6OA 2FSLX 3MIYA 4WKQA 4YJVA 5HICA 3EL7A 2JAVA 1TVOA 2CJMA 3E62A 1W84A 1Q62A 3RCDA 4O7LA 2AYPA 2PMLX 3FMKA 5EHYA 3EN7A 4GFGA 1KWPA 1UA2A 3K5VA 4L3PA 1BI8A 4C2WA 4EH9A 2C6KA 2XCKA 2WQOA 3F5GA 5DEWA 3ZRKA 4D58A 4X2NA 3UNKA 3KF4A 4NTSA 4QP1A 4FKQA 4K77A 3PZHA 4QP7A 2ITTA 2W17A 3RZFA 4CSVA 4DYMA 1NVRA 4O82A 3R73A 2W4JA 4IB5A 1S9IA 3PVUA 4G9RA 3W1FA 1SVGA 3H4JA 5AWMA 1J7UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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