3MH0A

Mutagenesis of p38 map kinase eshtablishes key roles of phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel dfg-out state
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
348
structure length
332
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDAGLATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutagenesis of p38alpha MAP kinase establishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-OUT state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 332
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3mh0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3mh0A01
2NRYA 4IDTA 5EDPA 5JT2A 2WQBA 5C26A 5CAVA 2QG5A 5J9YA 4QNYA 2CMWA 4NM3A 1ZMUA 4ANLA 2HWPA 1K9AA 3GNIB 1OIUA 4O0TA 4BN1A 2XRUA 4CYIA 2XNPA 1M2RA 2P2IA 2PZYA 1WBTA 4J99A 3WZUA 4WNPA 3C0HA 2PHKA 5AP4A 4L00A 3R7IA 4WNMA 1MRVA 3FLYA 3LHJA 3S2PA 2QONA 4TZRA 2IZSA 3PWDA 4BCQA 3UIUA 4GUEA 5CSVA 3EFJA 2E9NA 5L2WA 3DDQA 5JGBA 5TOZA 2BIYA 1XH9A 4IADA 2VTOA 2ERKA 3OD6X 3MI9A 3QCYA 5HG7A 5LMBA 2UW3A 5E1EA 3OEZA 4EK5A 2OJGA 4IVDA 4U43A 3F7ZA 2CLQA 3AMBA 5J1VA 3QZGA 2UVXA 4YPSA 3ZRMA 2Q83A 2WOTA 3EQRA 4QP2A 4BGGA 2GHGA 2BFXA 3ZLWA 2C1BA 4JBPA 4D2TA 3QD3A 3VUTA 1TVOA 5JGAA 4U3YA 4IANA 4EI4A 1OKZA 2ONLC 3HECA 1H25A 3FKLA 4AN3A 1JSTA 3DKCA 3QC4A 3TTJA 5BVEA 3I1AA 1ZOGA 4PDPA 1ZOHA 2ZYBA 4WG3A 4EYJA 3O7LB 3KVWA 4CMTA 5CT0A 1OVEA 3PVBA 3FZOA 2PUUA 3I60A 3LCKA 4MXCA 4FYOA 4F70A 4H05A 5IA3A 2BKKA 3P9JA 4W8EA 3LXKA 3FHIA 4L42A 4EHEA 4F64A 2AUHA 3TDVA 1SVGA 3BYSA 4IFCA 3TACA 2ZDTA 4WUAA 2XH5A 2C4GA 4EYMA 4YZMA 2PU8A 1UWJA 3QGWA 5T68A 3QF9A 1IRKA 4P4CA 4V01A 3SXSA 3UIBA 3MFRA 5AR8A 4GKHA 2ZM4A 5KZ0A 4IAFA 2HENA 2WTVA 1OIYA 2XIYA 3OXIA 3PE2A 1REKA 4GG5A 3HMPA 4H3BA 3A4PA 3R1NA 2Q0NA 4X3FA 5G1XA 3ZO1A 5DMZA 1IG1A 3RZFA 2IW6A 3RPSA 5DT0A 2W9FB 4E6DA 5DNRA 4CYJA 3DQWA 3CS9A 2J2IB 3R7UA 4CGAA 2VTAA 3HVCA 3OS3A 5ETCA 2GNLA 1UU7A 2ZM3A 2R3NA 2HXLA 3DFCB 5EM7A 4HNFA 4X2NA 3SRVA 5EQYA 2B54A 2BRBA 4FZFB 4FODA 4KSPA 4FT0A 4YNOA 1M7QA 2ITWA 2QC6A 3LJ1A 4L53A 4MYGA 3Q4ZA 4M8TA 3R9DA 4AGCA 1LUFA 4NUSA 3AMAA 3OY3A 4AGDA 2UZUE 5T3QA 3LQ8A 3L9MA 4BCHA 2Y0AA 4WOVA 2WTJA 2E9OA 5F95A 5E8VA 2OICA 3PPZA 2YAKA 3ZLYA 2UZLA 3SV0A 4E20A 1OGUA 2VZ6A 4XUFA 5CU2A 2G9XA 5KBQA 3KULA 2YLFA 4EZ7A 2ZJWA 4I41A 4DGMA 1TQMA 1CTPE 5L6WL 3VWAA 4IM3A 3BPRA 3D2IA 2PUNA 4IWOA 4YUQA 4XP2A 3OF0A 5E9EA 2XVDA 3FE3A 3UVPA 2R3KA 2R5TA 5HNGA 3THBA 3ZFMA 2YZLA 4UN0C 5HE3A 2BRNA 3AC1A 3WARA 4X3FC 5I3RA 5EW9A 3AGLA 3FZPA 4LUEA 2WOUA 2GHMA 2GSFA 3JUHA 4S2ZA 2FO0A 4ZSEA 2X7OA 1Y8YA 2WMXA 4LGDA 4MD8E 3QTIA 2O3PA 3DTCA 4AZSA 4O84A 4W8DA 3VAPA 1Q3DA 2IPXA 4LL0A 3FKNA 4G9RA 4RC4A 1GZOA 4XV3A 3TKIA 4RIWB 5FLFA 4AU8A 1L8TA 4NYEA 4D5KA 2BUJA 4EHVA 1Y6AA 4O0VA 3ACJA 1GZKA 3FPMA 4B99A 2E9VA 1OPJA 3ACKA 1NT2A 5TO8A 2OH0E 3NYOA 3FEGA 1IASA 4IBMA 2VTLA 2VO6A 5HX6A 2DQ7X 1JLUE 2WQOA 3UJGA 3EL7A 4OT6A 1ND4A 3FYKX 2XMYA 4FR4A 3MFSA 3A8WA 3O51A 4NM7A 5AP6A 3LFCA 2HY0A 3UQFA 5GIOE 2BKZA 3AC8A 3IW6A 2O8YA 3H10A 4G34A 4L3LA 4ONAA 4R7IA 5EI2A 2OJFE 3C1XA 3PY3A 4BDBA 4XBUA 4Y95A 3T9IA 4AE6A 2QLQA 4IMYA 4ZJVA 4KA3A 4AXAA 3EQIA 5AV1A 1XH7A 3TTIA 4G5JA 2X2KA 3MW1A 5KKRC 4IM0A 1ZOEA 4MTAA 2VTNA 3LXLA 4S32A 4YZNA 1APME 4GU9A 3QQKA 4QT1A 4ZJIA 4R7HA 2X9EA 4ORKA 5IDNA 2PY3A 4V0GA 2C3JA 4JBVA 3B8RA 2W5HA 3KRJA 3CIKA 4XLIA 4DTBA 4M69B 4LV8A 3TDWA 3K5UA 5EFQA 3HRCA 4WSQA 1R0PA 5HLNA 3VNTA 2JIIA 1WBPA 2R3MA 3PP0A 2DS1A 4RJ5A 4BCPA 5HO6A 3C4WA 3N51A 3G0EA 3Q2MA 4L46A 2GQGA 3GVUA 4P90A 5FTQA 4ANNA 5L2IA 5M09A 3BLRA 1QPCA 5AV2A 3R73A 2IVVA 3EN4A 5LMKA 5IQHA 3KF4A 3RAHA 5E91A 4PMSA 5EM8A 3UOJA 3CR0A 4GKIA 3WILA 2A4LA 2E9PA 5IEXA 4U42A 1GJOA 2WEVA 4FTUA 4TWPA 3OROA 4CRSA 4MXOA 2YITA 1ZYLA 3KMWA 4FTKA 4A7CA 3E8DA 5JEBA 2I0HA 3I0OA 2QHNA 4IWDA 1JBPE 1H0VA 3IDBA 4K18A 2X2LA 4NSTA 2XK7A 4X0MA 5EYDA 4YJSA 1UA2A 4I3ZA 5E8TA 4F1TA 5CEKA 4RX8A 5AAEA 5IMEA 1KUTA 4ZSLA 4E6AA 5BVNA 1PHKA 2Y8OA 1JKKA 5DT4A 3CLYA 3KRRA 3Q32A 3TIYA 4AGUA 5IEVA 5CEQA 4D2WA 4JRVA 2JGZA 2WIHA 4CMUA 4F7LA 2HZIA 4DFNA 1OL6A 4GSBA 3ORLA 2XIZA 4RVLA 3KRXA 1U54B 2B9JA 4X7QA 2UZWE 1OIQA 3G9NA 3QRKA 4G3CA 3OHTA 2A1AB 3MB6A 4P5QA 1W8CA 4LRMA 4RFMA 4O22A 4WA9A 3VBWA 4C37A 4BDKA 3P7CA 4D4SA 2BIKB 2NP8A 3I5NA 3RP9A 4K9YA 5KNJA 4RRVA 3RALA 4FV7A 2RG6A 4HGLA 4USDA 5AX3A 5BMMA 5A46A 5HLWA 4KKHA 3TZMA 3QUEA 3BHTA 4EUTA 4EK8A 4TW9A 3NVMB 1T46A 5FGKA 3QQGA 3K5VA 4FKIA 3NAXA 5CI7A 4CFNA 3SA0A 3N4UA 5LMKC 4GRBA 2UVYA 3D5VA 4GU6A 3TL8A 1QL6A 4G6NA 3QHWA 4LGHA 1M17A 1Q8UA 5HBHA 2GS2A 2ZAZA 3S1HA 3HZTA 3P5KA 3MY1A 4LMUA 3WF8A 4K2RA 3LFQA 4KRCA 3LAUA 4FEWA 4ERWA 1ZZLA 2XCKA 3NCZA 3GEQA 5EW3A 3BHYA 3NGAA 4RMZA 3TN8A 4FX3A 4PMPA 2IZUA 3COKA 2WTCA 3LCSA 5HNIX 3EQHA 3MIYA 4IB1A 2R3RA 4U45A 3EZVA 3MH1A 2YIYA 1V1KA 3LM5A 2HY81 4GMYA 2YZAA 3VS4A 3IDPA 1YWNA 4BBMA 2CDZA 2JD5A 3NNXA 1V0PA 4U40A 2XM9A 3LMHA 3QCSA 2WTKB 1R3CA 2BR1A 4G3DA 5D11A 4ZMFA 1H1WA 4QQ5A 2JBPA 2QVSE 5EHLA 4JAIA 3QX2A 4M3QA 3EFKA 4CCUA 4KUJA 4EBVA 2OO8X 2WHBA 3ORKA 3QQFA 4NT4A 5L2QA 3WF7A 2ZM1A 3PXKA 3K3JA 1RE8A 2OI4X 5AV3A 2RGPA 4PPBA 3TNHA 4TXCA 2WELA 2Z7RA 3O71A 4OTHA 4LOPA 3DOGA 3AC3A 2HELA 4FKRA 5AWMA 2WEIA 4HGTA 2YDIA 3BQCA 2ITQA 3TNIA 1OUKA 1M2QA 3TUBA 2PUIA 4RJ6A 5CU3A 4RVTA 4F9YA 5E1SA 4O0XA 3Q5ZA 2R3PA 4Q2AA 4Q9SA 1J91A 2B9FA 2J0MB 5TKDA 1PKGA 3JR1A 4Z7HA 3DY7A 3ZRKA 4JG7A 5E92A 4N57A 5IQIA 4NM0A 3ZBFA 4K8AA 4RT7A 5AM6A 3NZ0A 3LJ2A 3PXYA 4YSJA 4YJNA 4IWPA 4BCKA 2HOGA 4IAKA 2E9UA 2GNHA 4FTLA 4KIQA 3ODYX 3TZ9A 4RLKA 3KF7A 2PZIA 2ITZA 4R7BA 3I7CA 1A9UA 4IE9A 5D1JA 4AT4A 4R1YA 3VRZA 1K3AA 3QQHA 2HIWA 2OIDA 3KXXA 2B55A 3CGFA 4NTSA 4FEXA 3EHAA 1BI7A 1RW8A 2H9VA 2PVRA 4A06A 5IISA 3KQ7A 1SM2A 4MWHA 2PTKA 3QKKA 5HVJA 3I0QA 3MN3A 4IB3A 3LZBA 2VTRA 4S31A 5IA2A 3BU6A 3KB7A 4OAUC 4FF8A 4L8MA 3C13A 4EOLA 4CV8A 4IACA 4DLIA 2WZJA 5FBOA 4YHJA 3R9NA 3BX5A 4A9TA 2ZV2A 3UO6A 4MH7A 2NNWB 2B52A 4ANOA 4D0WA 4RJ8A 3MH3A 4LRJA 3QA0A 2XNBA 3KXMA 2CJMA 4XG6A 4XHKB 2ZMDA 2NO3A 3VS0A 4JQ8A 2YJRA 2YFXA 4GV1A 4HVSA 2BTRA 3BIZA 1WVWA 2V22A 3OCSA 4IZAA 3V5LA 3PZEA 3SQQA 3DAKA 5CI6A 3DGKA 3VS5A 5CEMA 3R01A 4RFZA 3KK8A 3CE3A 2YM6A 1UNHA 4PY1A 2PL0A 2C5NA 2OU7A 3EOCA 4FVRA 4L9IA 5CU4A 4YZDA 4ZSGA 4IX6A 3QCQA 3MY0A 4BKYA 2W1ZA 4J71A 4APPA 2YM3A 5LQFA 2YDJA 3LCTA 3NUXA 3KN6A 4ITHA 2XK9A 2DYLA 1VYWA 3DT1A 3RCJA 1I09A 4DEEA 3BYUA 1FMKA 3A8XA 5CNNA 5DBXA 3W2CA 3BV2A 3PLSA 4QPMA 5A4TA 3IDCA 3MVMA 3BYOA 3I81A 5CEIA 4FZ6A 4D2SA 5BQ0A 4AACA 1SNXA 3MA6A 4PWNA 3E93A 1GZNA 2RFSA 4O27B 4II5A 5J5SA 3B2WA 5CY3A 1R78A 2W05A 4M67A 1OBDA 3D7TA 1KE8A 4R3RA 4F7JA 5CAUA 4OTRA 3RNIA 4JR3A 3G90X 3FSKA 2CCIA 2WD1A 4X3JA 4RBLA 2J0IA 2C69A 3HDMA 3DAEA 4GFOA 4MF0A 3OCTA 4CG9A 3PUPA 3V8TA 4XBRA 2BVAA 5L4QA 4EJ7A 4U5JA 3N4VA 4JQEA 3V6SA 1YXSA 3KU2A 3RAKA 4I6BA 3R9RA 4XP3A 4OTDA 5CSPA 2C6LA 3FXXA 2XNMA 3C4CA 1BLXA 1Q8TA 4EH4A 5FM3A 4FOCA 2WAJA 4G31A 3UO5A 3OC1A 3GU6A 5AA9A 5I0BA 4UWCA 5AR5A 1PRYA 3AOXA 4JLCA 4LL5A 4ZIMA 5AM7A 3U9CA 3CJFA 4AF3A 5C1QB 4G3FA 4JVGA 2GNGA 4LOOA 2QO2A 3ENMA 4F0IA 2XJ0A 3CXWA 5H3QA 2PVKA 2XKCA 4D1XA 1WBNA 4FKWA 4MKCA 4QTDA 4IXPA 3NS9A 3P79A 3DLSA 4YJUA 5EW8A 3CKXA 3EQGA 4BDJA 5J8IA 4CFXA 2PPQA 5AFVA 2OKRA 4I0RA 2QKWB 3I6WA 3H9OA 4C8BA 3UC3A 4L7FA 4I5HA 5HE2A 4HCTA 4ZY6A 3RAWA 2C0OA 4AE9A 2VWVA 4BDGA 5AP3A 5K5NA 1JKSA 5K0KA 3UYTA 4YBJA 1PXIA 3P1AA 5EM5A 1FPUA 4EC9A 3KY2A 4FKQA 5DIAA 3DJ7A 4KBKA 2CNQA 4M7IA 5AP1A 4JDJA 4TYHB 4FV8A 5ETIA 5CAOA 4M15A 3Q9YA 4AG8A 4YMJA 3ENHA 4JX3A 4DEBA 3W32A 1H27A 3C7QA 4DG0E 4AA5A 3UOHA 2I40A 4MXYA 4WIHA 4C58A 4E4MA 4WKQA 5I9VA 5H8GA 3A60A 5JFSA 3WIKA 4W9XA 2F7EE 3DNEA 3VQHA 3ATSA 1XQZA 4TY1A 2G01A 2CNVA 2ETKA 1XHAA 5CF5A 5KUPA 4ASXA 4FTOA 2REIA 5KO1A 4DGLC 4C0TA 3Q4UA 4J8NA 2PVLA 3TI1A 4EK4A 3EKNA 3CQWA 2BFYA 4ZTMA 5HTBA 4BKJA 3MFTA 5FBNC 2R4BA 3JVSA 4CNHA 3OFMA 4F63A 5M07A 5EH0A 4IC7A 2R2PA 5L8KA 1CDKA 4NIFB 2VX1A 4YU2A 4FT9A 2VAGA 3OWKA 3W2OA 2BRHA 4WO5A 4QTEA 3S4QA 3EN6A 4XOZA 4YTFA 3ORNA 2C0TA 2PMNX 3UDBA 4O7RA 4EH9A 2IW9A 5CEOA 4R1VA 4NU1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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