3MS9A

Abl kinase in complex with imatinib and a fragment (frag1) in the myristate pocket
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
275
structure length
265
Chain Sequence
AMDPPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVSAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Binding or bending: distinction of allosteric Abl kinase agonists from antagonists by an NMR-based conformational assay.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ABL1
molecule tags Transferase/transferase regulator
source organism Mus musculus
total genus 83
structure length 265
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ms9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ms9A01
3FLZA 3CEKA 5CU0A 5IG1A 5E8ZA 4U97A 3DZOA 2QOKA 4BI2A 4EJNA 2PE0A 5DMZA 3QQLA 3U9CA 5AP4A 5BVKA 2PE2A 5AAGA 1GZOA 4QP1A 4ONAA 1VYWA 3RAWA 5E8SA 2C3IB 4BIBA 3LJ2A 3MJ2A 5DH3A 3WARA 4YJUA 2Z02A 3PVUA 5LXMA 4AG8A 1KSWA 3LCKA 4S2ZA 4IWPA 3UOLA 3BGQA 4TW9A 4EH8A 5HO6A 2X6EA 3A8WA 1DS5A 4QYEA 3R1SA 4Y5HA 2A1AB 1U4DA 3ZC6A 4HW7A 1QPDA 5IH4A 1YQJA 4FTUA 1W84A 2X2LA 2C3LA 1FMKA 4A9TA 4LL5A 4ZTMA 5CEQA 3A4OX 4YMJA 2HCKA 4YP8A 1K9AA 3MTLA 5M57A 4FICA 1KOAA 3FI8A 4J8MA 3NLBA 5HTCA 3L8PA 5HVKA 4AZEA 3OT8A 5FEQA 4RLKA 3H0ZA 4I5CA 4QD6A 4KD1A 3AMBA 3KVXA 3OWLA 4YSMA 3UQGA 4AOTA 2J0MB 4NTSA 1WBTA 3FUPA 3ZDUA 4L01A 3LFSA 1NT2A 2QONA 3QTRA 4FV9A 3HGKA 4XG2A 3RAHA 4RIOA 5HE2A 2R5TA 4EEVA 1QMZA 4QQTA 3QRJA 1UWHA 1CMKE 4Q2AA 2IO6A 4M0YA 3Q4UA 2I0HA 2WIHA 4I21A 4IHPA 3UNJA 3VW8A 3W2QA 4FGRA 3ZZEA 4DA5A 3BQRA 5L2WA 1OI9A 3ET7A 3GUBA 3QQJA 3FHRA 1J1CA 2WMXA 3PJCA 4U41A 4O84A 3I4BA 4OT6A 2NNWB 3UVRA 4FVPA 3LFNA 3RTPA 4Y73A 2B9JA 2VNWA 4G31A 3TIZA 4AA4A 2YM5A 3TEIA 2CNQA 3QZIA 2B1PA 3Q6UA 4DFLA 5EI6A 2PE1A 3QX4A 5HE0A 4LOOA 3COIA 3FMLA 1NY3A 2BROA 2RIOA 3D7TB 3EL7A 4NFMA 5AIKA 4B99A 5I4NA 2IN6A 5KCVA 4RSSA 3RK5A 3LKMA 3P4KA 4AW2A 1NA7A 1PXNA 3ZFYA 3D2IA 3FKNA 4YLLA 5DT3A 4AGWA 4FEUA 3EQFA 4G17A 3AG9A 3JS2A 4C7TA 4F99A 3VUKA 3THBA 4ZMFA 3DPKA 4AF3A 4E7WA 2O63A 2XYNA 4JAJA 5CNNA 2YEXA 2WEVA 4BWKA 4CZUA 3KFAA 3QTXA 3DJ6A 4AN9A 3VUTA 5EM6A 2PUPA 4GW8A 4D2RA 4MF0A 2R0IA 3G9LX 4N0SA 4QMLA 4Y83A 2W1HA 4CGAA 3L8VA 2PZYA 4YO6A 5LCKA 2R3PA 4WT6A 4AN2A 4Y8DA 3OOMA 2YLFA 3ELJA 4O0YA 2WTKB 3UO6A 3VS1A 3WZEA 2C69A 2QURA 1YXXA 2I0VA 4EOKA 2JKKA 3RZBA 3R22A 1FGKA 3EN7A 3I6WA 3QKKA 3LXNA 4HCTA 4BDJA 4BI1A 1WVYA 4CCUA 4BZNA 2PL0A 2OK1A 3BCEA 4D4VA 3SG8A 4OTIA 2QOBA 2F7XE 4PX6A 4QTEA 3SW7A 5J7HA 4FL3A 2GTNA 1REKA 2WMAA 2QVSE 2QOOA 4CKJA 1IAHA 4MNEA 2J0LA 4FV7A 5I9XA 3EQRA 4AZSA 3E8CA 5JZNA 4CD0A 3QTUA 4K11A 3GQIA 3U6IA 4FNWA 1YXSA 4GT3A 4QP3A 5HCXA 2XVDA 3C5IA 3DTWA 4HOKA 4F0FA 2R3NA 2WZJA 5CTPA 2C5YA 4QMTA 3QYWA 5CWZA 3SHEA 2P3GX 5DWRA 4B9DA 3FZRA 4YJVA 2EUFB 3FBVA 3P08A 3H9RA 3E7VA 3P9JA 2OG8A 5D7AA 4BBFA 5EK7A 4QT1A 5IA4A 3GT8A 4EOMA 3LFDA 4YC6A 4IWQA 3CPCA 3DZQA 5D7VA 5HD4A 3BHHA 4N57A 3HUCA 4F09A 4U3YA 3CY2A 2HK5A 3CE3A 5AA9A 2PU8A 1BMKA 3KL8A 5KBQA 4IX5A 3QAME 3CLYA 4WG4A 5IA3A 1FQ1B 3C4CA 4RRVA 4WO5A 2J4ZA 3P23A 4XV3A 4O21A 4Y5QA 4BDEA 4ZZNA 5HQ0A 1ZOGA 4IFGA 4GKHA 2Y6MA 4II5A 2HYYA 2XB7A 4UWYA 4ZTQA 5JK3A 3QTIA 4DEIA 5JMSA 3QD0A 2C1AA 3VUMA 4WG3A 4BTKA 3ODYX 2ITZA 4JIKA 4DTBA 5CY3A 3SX9A 3MPTA 4I24A 4LGHA 1OL1A 3VIDA 4C02A 3ZM9A 5ACKA 5DPVA 2ZDUA 5AX9A 4L67A 2X39A 1QPEA 2AYPA 2PTKA 3ZRLA 4QMQA 5LOHA 5CAVA 3R63A 2O0UA 5CF8A 5CU6A 2HXLA 3PJ2A 4QP2A 2PY3A 2R7IA 4TZRA 5L6PA 4QPSA 2YA9A 2Z7SA 3C13A 2GHLA 4IVCA 4DHFA 1XH5A 4UALA 3UO5A 3K5UA 2UZLA 2XCHA 3QXPA 4H1MA 4ZSLA 1H01A 5L8LA 5AR8A 5CX9A 5LJJA 1ZRZA 3SGCA 4ZTHA 2CGVA 2VWZA 2VTPA 3F7ZA 2Z2WA 5FBOA 3UYTA 3OWJA 2J0JA 2ZB1A 4CVAA 4M7IA 3HRFA 1A48A 1Q8TA 3DBEA 3V8TA 4WA9A 2QC6A 4U7ZA 5AP2A 3RNYA 1GIHA 5C03A 4ALUA 4F9AA 4TTHB 4ZJVA 3O50A 4EOOA 3UG2A 4O81A 3OW4A 5F20A 2FYSA 1KE6A 4KIKB 4XUFA 5EQEA 1J91A 1GIJA 3TCPA 3POZA 4CFNA 3R01A 1W0XC 4MH7A 3RHKA 2XJ1A 5M51A 1XR1A 4FNZA 4PPBA 5C8NA 4U79A 3ATSA 3W16A 3NMUF 2BDJA 5TKDA 3R7OA 3TDWA 2UW4A 2R3KA 3DOGA 1F3MC 3QCXA 3QWJA 3QXOA 4QYFA 2J51A 3AGMA 5CLPA 3FEGA 4FEWA 4JAIA 2WOTA 4EHVA 1OB3A 1Q97A 3L1SA 4UMQA 2J9MA 5AP3A 3CQWA 2W4KA 3LQ8A 2YM3A 4K77A 3PSBA 3ZO4A 4B6LA 4IWOA 4CQGA 4GV1A 4D0WA 5I3RA 1GOLA 2YITA 1ZMWA 3MV5A 1AGWA 1XH4A 3NNXA 3WE4A 4IANA 1PKDA 4S30A 4D58A 4OBPA 4JQEA 4EL9A 5CQUA 4NFNA 4NM0A 5IUHA 1J7IA 1MRUA 5E8YA 1DAYA 3PJ8A 4HNFA 4WHZA 4R6VA 4RVKA 5H8GA 4EJ7A 3PXRA 4I0TA 4TYJA 1ZXEA 3D15A 1WCCA 4BCPA 2XIRA 3BLQA 4FKUA 3DXPA 3F5PA 2OJFE 4I22A 4AAAA 2YFXA 2UUEA 4Q9SA 5IQFA 4D9UA 2FGIA 2XKFA 2QKWB 5IDNA 3QTQA 4DGGA 1M7QA 1UNGA 2WEIA 4YJTA 1JKTA 4FKQA 4I0RA 3IDCA 4O1OA 4AQCA 4EUUA 1W7HA 3LAUA 5ITAA 1O9UA 2JKMA 4I4EA 4J96A 5JGDA 4FG8A 3C4FA 4F9YA 3OP5A 4FX3A 5HD7A 3TV6A 4P4CA 5B0XA 3HA8A 5LVOA 4MQ2A 1YW2A 3UBDA 3U4UA 3CQUA 4QMUA 2W5HA 5KZIA 4C2WA 2XIYA 4U0IA 5ETAA 4DLJA 4EBWA 2RKUA 4F7NA 4O38A 3V5JA 5EI8A 5M53A 3GC7A 2Y6OA 4IDTA 4IADA 3E8NA 3VS0A 5ANJA 4HCUA 5DT0A 1OIUA 3V8WA 3NUYA 4I1ZA 2X6DA 4CEGA 4FEVA 1JSTA 1H0VA 4NJ3A 3BV3A 3GGFA 3BYVA 5DIAA 2WMSA 5FM2A 3O7LB 3OMVA 4W4VA 5K0XA 1JAMA 2FSMX 4ARKA 4D55A 1WBVA 3EYHA 4JIAA 2C1BA 4BZOA 5BVOA 4JNWA 4Z55A 5AR5A 2JIVA 3VBWA 3FC1X 3LFAA 4FTKA 4RVTA 2WMUA 3VHEA 5CEMA 4LI5A 3RWQA 3A7IA 5KMKA 3HDNA 3OXIA 4RFMA 2BAJA 2IVUA 3LMGA 4TWOA 3R9NA 5KO1A 2OLCA 1VR2A 1QPCA 4DH1A 4R3RA 5DI1A 1OL5A 4A06A 3OG7A 2EWAA 4O1PA 4DEGA 3RNIA 4USEA 2JKOA 3UMWA 2R3LA 3V04A 3WF6A 3BZ3A 5HVYA 2IJMA 3P1AA 2H9VA 3GC0A 3ETAA 3QTSA 3LQ5A 5GHVA 4WKQA 3MA3A 1PHKA 3KCFA 3NW6A 3DQXA 1YWRA 1M2QA 3DXQA 3UYSA 3GNIB 4PY1A 3Q9YA 3G33A 4XRJA 4D4YA 4GEOA 2QO2A 2VTAA 5TE0A 2HY81 4FNYA 4RFZA 5D12A 3QZHA 2OF4A 2XK9A 2CJMA 3FKLA 3VBVA 3Q52A 3FSFA 3KVWA 4TY1A 3FY0A 4KIQA 4B0GA 3LFQA 3KK8A 4C4GA 3UP2A 5AP6A 4C61A 3FYKX 3PLSA 4FSRA 4IEBA 3TACA 4DH3A 1VZOA 4OTHA 3BU5A 1IG1A 3KKVA 4QTDA 4D0XA 4UZDA 3TDVA 3NUPA 3QKMA 5D1JA 4GYGA 4X21A 1BI8A 3KCKA 3NUSA 3FXZA 4RBLA 3A99A 2CLQA 5LMKA 5FP6A 3HMMA 2X9EA 5BVNA 4K2RA 3B2WA 3G0EA 3GC8A 4FKGA 4C38A 5A6OA 2BKZA 2FB8A 2X8DA 2Y8OA 4UYNA 4K33A 3E5AA 1M14A 4FV2A 1W8CA 3NNWA 4RG0A 1P14A 4JQ8A 5F4NA 3DB8A 1M17A 1PXJA 3AT4A 4RWLA 5E8XA 3HYHA 4GUBA 4UBAA 5HHWA 4EH6A 3RK9A 4QYHA 1XBBA 4NEUA 3WF8A 3HV5A 5LMBA 3TNQB 2BDFA 5KHXA 1XJDA 3TG1A 2KTYA 4RFYA 4UY9A 3C4ZA 4FKLA 4IDVA 2FH9A 1H27A 5FLFA 1H07A 4LRKA 3QRIA 4IACA 4C59A 2BZKB 3O2MA 3GCVA 3FMJA 4NSTA 2X7GA 4YZDA 2VZ6A 4CYJA 4E6DA 4FKJA 5IQAA 2OH0E 3E3BX 2V0DA 4FK3A 4XV9A 4OBOA 4HGTA 4JBQA 2WNTA 3HUBA 4QYYA 3L9LA 4I3ZA 4D1XA 2C6DA 5IMXA 4LYNA 2CNUA 1JKKA 3ZO3A 3LCDA 2Z7LA 1CKIA 4RJ5A 4O22A 4D28A 2OGVA 3UVPA 3C5UA 3EOCA 3DGKA 3CD3A 3PZEA 4I20A 2VTTA 3EH9A 4ACGA 4CRLA 4YSJA 3VJOA 3KXMA 3I7BA 4KKEA 3PRFA 2I1MA 1QPJA 1W82A 3D7TA 2XEYA 1YKRA 5K4IA 3HZTA 1BLXA 4LGGA 4BDFA 5J7BA 2IPXA 3FZSA 4FIJA 5A4EA 4U6RA 5KKRB 4K9YA 3MDYA 4FOCA 4MHAA 3V3VA 3HDMA 5CSWA 4C57A 4F70A 3KXXA 2WMWA 3VVHA 2IW9A 4XP3A 4AT5A 4HVDA 5K5XA 4L3LA 4MBJA 4A9RA 2BFYA 5LVMA 2BHHA 2QG5A 3SVVA 3NW5A 3PA5A 1WZYA 4RWIA 3SG9A 1PMNA 4FIIA 3K3IA 4RPVA 3MPAA 5GIOE 1M2PA 4YZMA 4ENXA 4O7RA 4Y46A 2W1IA 5BYYA 1ZOHA 3TJCA 3U54A 2I6LA 4IAAA 3R7YA 4WOVA 4ZZOA 2Q0BA 4FZDB 2OXDA 4FZ6A 3MW1A 4XCUA 3UIMA 3V5QA 3W8QA 2PVHA 1MRYA 4E5BA 4F7SA 2F9GA 4X2NA 2VX3A 1XBAA 3P7AA 4O82A 5ANIA 3VUDA 5LWMA 4ZSAA 4P5ZA 4E6QA 5DVRA 1J7LA 3W33A 3KXHA 5C8KA 1XQZA 2YM7A 2ZV7A 2IZSA 1AQ1A 1Q24A 3AQVA 1STCE 2R3FA 2WMQA 3MVJA 4M69A 4TNBA 3UGCA 3O0GA 2XS0A 5IA0A 2JAMA 3ULZA 2W5BA 3NYNA 4I23A 3O8UA 4N4SA 5EQYA 4NM3A 3Q4TA 4R3PA 4ZJJA 4WUNA 1U54A 2UZEA 3HNGA 2W96B 5KBRA 5M56A 2VTJA 2W1FA 4BTMA 4EK5A 2WMTA 2BRMA 3CGFA 4MD9E 3WILA 4H3PA 4IH8A 3Q3BA 4DCEA 3DU8A 4O7LA 3AGLA 4W4YA 3NAYA 4FTOA 5CI7A 3NIEA 5D10A 5F1ZA 4AUAA 4A4XA 5M4CA 4X3FB 3EQDA 1UU7A 2W0JA 4XYFA 4FKRA 1BI7A 3MGYA 3A7HA 4FKPA 3MWUA 1O6LA 4FVRA 2IZRA 1VYZA 3CPBA 4XS2A 3OS3A 5JFSA 4JDJA 3QHRA 5TT7A 2R2PA 3PP1A 3W18A 4F9CA 2CKPA 4O7WA 5AR3A 3M42A 4ACHA 1V0PA 3A61A 3VJNA 3FHIA 2OJIA 2V7AA 3MFSA 4BIDA 5HG7A 5CAOA 2B7AA 2PVFA 2WD1A 3VS4A 1URCA 4LG4A 4D1SA 3N4TA 4G34A 2E9PA 4GFGA 2C6OA 4KKHA 5J9YA 3GU6A 4ITHA 3IO7A 3MVLA 1MQ4A 3POOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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