3MWUA

Activated calcium-dependent protein kinase 1 from cryptosporidium parvum (cpcdpk1) in complex with bumped kinase inhibitor rm-1-95
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
471
structure length
447
Chain Sequence
LYFQGTFAERYNIVCMLGKGSFGEVLKCKDRITQQEYAVKVINKASAKNKDTSTILREVELLKKLDHPNIMKLFEILEDSSSFYIVGELYTGGELFDEIIKRKRFSEHDAARIIKQVFSGITYMHKHNIVHRDLKPENILLESKEKDCDIKIIDFGLSTCFQQNDRIGTAYYIAPEVLRGTYDEKCDVWSAGVILYILLSGTPPFYGKNEYDILKRVETGKYAFDLPQWRTISDDAKDLIRKMLTFHPSLRITATQCLEHPWIQKYSSETPTISDLPSLESAMTNIRQFQAEKKLAQAALLYMASKLTTLDETKQLTEIFRKLDTNNDGMLDRDELVRGYHEFMRLKGVDSNSLIQNEGSTIEDQIDSLMPLLDMDGSGSIEYSEFIASAIDRTILLSRERMERAFKMFDKDGSGKISTKELEQVDNNKDGEVDFNEFVEMLQNFVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent and Selective Inhibitors of Calcium-Dependent Protein Kinase 1 (CDPK1) from C. parvum and T. gondii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 161
structure length 447
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3mwuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3mwuA01
4IBMA 3F3VA 4YTIA 5HORA 3CCNA 3HRFA 3UVPA 3VULA 3DFCB 3KULB 3NIZA 3PY1A 4K77A 4NTTA 4UEUA 1SM2A 5DR9A 4YMJA 1V0BA 1SNUA 2CLXA 3OW4A 4JQEA 4FV7A 5ETFA 3NNXA 2R3OA 4Y8DA 3AT2A 3HV6A 5FXRA 2R3JA 4ORKA 4KB8A 4O7VA 1GNGA 2RG6A 3DZOA 3D83A 3W2RA 3C7QA 3I5ZA 3MH3A 3WIGA 1WBVA 3IOPA 4ACGA 4BDIA 5F9EA 3Q96A 5D9HA 4FL2A 2X2LA 5FD2A 1KOBA 3NYXA 1YDRE 3FDNA 4IX5A 4QNYA 2AYPA 2OF4A 3OY3A 2XB7A 4GCJA 4J97A 3LHJA 4XG9A 3IPHA 3EQPA 4AZWA 1TQIA 5E8VA 3WE4A 3F88A 5JFWA 5E8XA 1PYEA 5M53A 3UOJA 4O0TA 2DUVA 1OMWA 3QXOA 3HAMA 3AD5A 2VTHA 3KRLA 1WVYA 5IH4A 4ANLA 3DU8A 4CZUA 2KTYA 2VX3A 4CT1A 1DM2A 2ACXA 1YI6A 2IG7A 2BKZA 4HCVA 4HGTA 4LL5A 4G16A 4RA4A 4YLLA 3VS3A 5CS6A 5DYJA 1YDTE 4X3FA 3GOPA 5HBJA 5I3RA 4L3JA 3SV0A 2XA4A 5LCJA 1NVQA 5HEZA 5AUUA 3HRCA 3R0TA 2CJMA 2OJIA 2W17A 4I5MA 4ALWA 1URCA 2RGPA 1MRVA 3MGYA 2XH5A 3H0ZA 3IDBA 4O2PA 4J95A 3EN9A 4ZSJA 1H00A 4AZEA 2UZBA 4B6LA 4DCEA 4F1MA 1YOJA 1SZMA 4C7TA 5EHOA 5K5XA 4Z7GA 4ZTHA 4ZIMA 3OVVA 4K1BA 2ITVA 2WD1A 3A62A 3ORKA 3EN7A 2Y8OA 3FYKX 4J53A 5I5ZA 4IB0A 5J7BA 1Q8UA 2Y4IC 3KC3A 2XBJA 3GCPA 1UKHA 4HGEA 4TYEA 4AGWA 4CYJA 3KXGA 3FSFA 4BCMA 5FTGA 1M2PA 4FL1A 3OT8A 4X6QC 3NYVA 2ITWA 3FLWA 3R1NA 5FGKA 4BB4A 4CTBA 3C13A 4FKPA 3QD4A 2W4KA 4RZVA 3RHXA 4F7LA 4ZZOA 2UW7A 5IUIA 2BIYA 5A6NA 2CKPA 2ITXA 4NU1A 4FNXA 5AR3A 1YQJA 3R9HA 3HMNA 1ZMUA 5LWNA 2WTKC 3KRRA 2GSFA 3LM0A 3W10A 2Y7JA 5AM6A 5J8IA 3NRMA 3V5PA 3FMEA 5HZNA 3DBQA 4ACHA 4PDYA 4FI1A 2HZIA 2XKCA 3Q4CA 1WFCA 2C0OA 4MD9E 4D5HA 5LARA 5CNOA 3F82A 1H26A 4NZWB 5K3YA 2XCHA 3L9NA 4X2FA 4FV0A 4C4HA 4RJ7A 4BIEA 3CP9A 3IECA 5DG5A 5JFSA 2EB3A 1REKA 3QQFA 3KRJA 4NUSA 5I9VA 3ZLXA 4KNBA 1OPLA 3IW6A 1IA9A 1KE5A 5LWMA 3R1QA 4PP9A 1GY3A 4QP4A 3I4BA 5CVGA 3VHEA 3Q32A 3EN4A 4D2PA 1PY5A 4LV8A 4O27B 4OT5A 4EK3A 2R3MA 4E93A 4O0VA 5M56A 2R7BA 1I44A 3ORZA 3U9CA 1L3RE 4U41A 5B0XA 2UZVA 4CV8A 3FZRA 3ZFXA 4BY9E 4DCAA 5HU3A 2J0KA 4YJUA 4ZZMA 3UZPA 1CKJA 2F2UA 2UZEA 4FZFB 5CLPA 2XRWA 3UVQA 1J91A 4OAVB 3ZC5A 4U8ZA 5IQGA 1RDQE 3FUPA 3MTFA 5IMEA 5HTCA 4HVSA 3DQWA 3E64A 3FMJA 4BGQA 3LLAA 3JYAA 1W0XC 4L68A 3ZXTA 4HCUA 5EKOA 5HG9A 4TN6A 3VHKA 4YZMA 5DVRA 4WHZA 3ZS5A 5JQ5A 4UWYA 3CPBA 1QPJA 5FDXA 2OBJA 3TI1A 2X2MA 4QMLA 3WF6A 5KUPA 4F9YA 3U4WA 2AC5A 4CCBA 2VN9A 1TQPA 2VAGA 4P90A 1M7QA 4NCTA 4WNMA 4IAYA 4J8NA 4XV3A 4ZZNA 3FZPA 2WMSA 4XYFA 3SDJA 3FLQA 2BR1A 4AOTA 3FKLA 5AV3A 4AZSA 5DR2A 5HE0A 4CMTA 1NXKA 4DITA 1HCLA 3O17A 3V6SA 4R3PA 4WOVA 1CDKA 2WMVA 2BRHA 5HG8A 5A4QA 4HVDA 4FTCA 3SX9A 2JDSA 3U51A 4DF3A 1H1RA 1OBDA 5KMKA 3ATSA 4PV0A 3UG1A 3R7OA 2HY81 3FPQA 2VGOA 1FQ1B 3VS2A 5KMIA 4ANOA 3BEGA 3GU4A 4DC2A 3ZZWA 2YWVA 4C33A 2E9VA 4FIEA 5C4KA 4AW5A 1HCKA 3CGFA 2I6LA 3R9RA 4QQCA 1SVHA 2JDTA 3JXWA 2BZKB 3C4FA 4MH7A 4X3FC 3FMNA 4EC9A 2H9VA 3BELA 3KULA 3FI4A 3NR9A 3V6RA 3AC3A 2R0UA 4UX9A 3CPCA 3CTJA 3MBLA 3ORXA 3UTOA 3AT3A 4ZLOA 3JY0A 3V5TA 4V01A 2A4LA 3RAIA 1PMNA 2ZM1A 3C0HA 4EH6A 1GZNA 4AWIA 3HRBA 5L4QA 4BKYA 3DK7A 4DFYA 5AUZA 2OXXA 3NCZA 5H8GA 2W9FB 4RA5A 2XMYA 3RBWA 4FSUA 5CI7A 5CU3A 4FKVA 4JX3A 2GCDA 5M06A 4E3CA 1QPEA 4RZWA 2W7XA 1MQ4A 2WB8A 2IVUA 5KCVA 3ITZA 3UNJA 4BZNA 2CGXA 2JEDA 4PQNA 4ZJIA 4QD6A 5EI8A 4A4OA 2PU8A 1M7NA 1UU3A 4APCA 4BICA 3O7LB 3PSCA 2VX0A 4DEAA 1OI9A 3MFTA 4GK2A 2YACA 4ZY6A 3QTZA 4PP7A 3DGKA 2HWOA 3FZSA 3QTRA 1U5QA 2BPMA 4Y85A 2XNOA 2GNFA 3MYGA 4AG8A 3O51A 2VO3A 2BRMA 4FSWA 4QPSA 4WT6A 4F64A 3AMAA 3LMIA 4IB3A 3NEWA 5TO8A 5HCXA 3VUHA 2R4BA 4AP7A 5LJJA 5M44A 3QX2A 5C03A 3NAXA 4GJ3A 3OCGA 3T3VA 4GVAA 5AA9A 2Y4PA 3SW4A 3TIZA 3MTLA 4RVKA 4NM0A 3U9NA 4FNWA 1K2PA 4YHTA 4BDAA 5HO8A 5M09A 4LMUA 4BI0A 2QU6A 4D9UA 5CSHA 4QYHA 4FICA 5BVWA 4QYYA 3RNYA 3MW1A 2G2IA 4NKSA 4YP8A 3ZRKA 2F49A 5IA2A 2Z60A 1PJKA 3F5XA 3BQRA 5FEDA 1OBGA 4TNDA 4BDCA 5HTIA 3TKHA 3P0MA 5JH6A 4Q5HA 4WBOA 4BTMA 3QQKA 4QMMA 5AR7A 2RFDA 4WRGA 2E9NA 5E90A 3TTIA 4F1OA 2R3PA 2J5FA 1O6LA 3L9LA 2ITZA 4E20A 2R3HA 2GNLA 4IADA 2J0LA 3U6HA 4APPA 1PKGA 2UZLA 5E8YA 2ETMA 5GINE 4U45A 2CGWA 4XHKB 3D94A 3L8VA 3QGWA 4HOKA 5IA3A 3CY2A 5IA1A 4AQCA 5IDNA 4IHPA 4BBFA 2R7IA 2XEZA 2W06A 4J71A 3GGFA 5ACKA 2X2KA 3G9NA 4B4LA 4AGDA 1ZOHA 5HCZA 3B2TA 2PE0A 3LFNA 4WO5A 4DAWA 5LCKA 3FZ1A 3AGLA 3I5NA 1VZOA 2NP8A 2R3GA 3B8QA 3QYWA 4QTAA 3MFUA 2Z7LA 5I9UA 4PL5A 1GIHA 3NDMA 5AV4A 2CKOA 4RC4A 3OCBA 5ANDA 1B6CB 3A7HA 2P33A 3GU8A 2YHVA 3TDVA 3L9MA 4IEBA 4AZTA 1Q8WA 3NCGA 4BCGA 3OCTA 3LJ0A 3GBZA 2JBOA 3I1AA 3F5GA 4H36A 2C6KA 1EH4A 2QO7A 2X6DA 2O65A 3FC1X 1KOAA 3GI3A 3K5VA 4UXLA 4AX8A 3Q5ZA 3AMBA 2VU3A 2B54A 2Y9QA 3ALNA 4TL0A 3FE3A 2X81A 3MPTA 2XCKA 4O82A 1Q8YA 4DFXE 4XV1A 2QOLA 3EL8A 4ASZA 1BKXA 4PNIA 4F6SA 2OIDA 3TZ9A 1OL7A 2VWUA 3LCKA 2ZV7A 4QTDA 1YOLA 4TTHB 3ZM9A 3QTSA 4KIPA 5FLFA 3TACA 3ZUVA 4FC0A 4LGDA 3ZYAA 5EI6A 3TNHA 4ZMEA 1F3MC 3F3WA 3FI2A 3FXXA 1M52A 3QCXA 3TXOA 5CQWA 2C5VA 2CMWA 2I7QA 3AOXA 4NFMA 3HL7A 5ETAA 3EJ1A 4BF2A 4D2SA 4A06A 1VYWA 3D7TA 5EYMA 3BU5A 4ZAUA 2WQEA 4QP7A 2ITOA 5CNNA 2CNVA 2JLDA 5JQ8A 1ZRZA 4L52A 3UNKA 3VS4A 3GCUA 1MP8A 3BYOA 1TKIA 2YABA 4QMYA 3EFKA 2WTDA 3TUDA 4EBVA 1W7HA 3IW5A 4C4GA 4QTEA 3P7CA 4RX9A 4KS8A 4WA9A 3L1SA 5H8BA 3GC0A 4CTCA 4TWOA 3P9JA 3R7EA 4AUAA 4AT4A 1UV5A 3G51A 5HNGA 3KGAA 4O7LA 3SGCA 4JDJA 4O7TA 4IAIA 4W9XA 2VO0A 3HA8A 1ND4A 3W18A 3KF4A 2VTQA 3R22A 5CY3A 5E8ZA 3TV4A 3A7JA 3ACJA 4L6QA 2P2HA 4I20A 4GU6A 5KMJA 4QMUA 2EU9A 5HI2A 5FG8A 1OPKA 5FEQA 1HOWA 3KF7A 4RWLA 4DEHA 5JMSA 1FGIA 3GNIB 3KCKA 4OUCA 4FSTA 4U97A 2WU6A 3V8SA 3ET7A 3GVUA 3R30A 4G31A 2XUUA 4G6OA 4IX6A 4BGHA 4ZMFA 4OW8A 2ZMCA 5AAGA 4PUZA 2IZUA 3CJGA 3WIKA 2G2HA 3TKUA 1XKKA 2OSCA 3D4QA 3PJ1A 5GZ8A 4N6ZA 3MVMA 3WARA 3EL7A 1P4OA 3QUPA 2BRNA 4H3PA 5KBQA 3VUGA 1JAMA 3FMHA 3WZJA 4AACA 4AZFA 4IACA 4CSVA 3KMWA 4EOQA 3R7VA 3W2QA 3LXNA 4MNFA 3T9IA 2CLQA 1WZYA 3EZVA 2XBAA 3NIEA 3OCSA 4X2JA 2PVNA 2X6EA 2HW6A 5DI1A 4F09A 4Z7HA 4U42A 3QUDA 3HMPA 3R7GA 2JIIA 2UZWE 2HOGA 2FGIA 4AE9A 5E91A 2ITTA 4BCNA 2WTIA 3D9VA 4U3YA 3HNGA 3SG8A 4LRKA 1Q24A 3WF8A 3E63A 1H1SA 4YJQA 3C50A 4YZCA 3NVKI 2BAKA 2IVTA 3WZKA 2PUPA 4I6QA 2W0JA 3AC5A 3PPZA 5DRDA 1YOMA 3ENHA 3TNWA 2YLEA 1ZYLA 3II5A 4HYHA 2R5TA 4C4JA 1YI4A 3NUPA 2RKUA 5HKMA 3MS9A 3EQIA 4O0SA 2WELA 3ANQA 4FODA 4RT7A 3WE8A 3FI3A 3PXRA 4OTFA 4G34A 3G15A 1RJBA 2GS2A 4KSQA 4OTQA 5HLPA 4O84A 4FV8A 3P5KA 4ZXTA 2ETRA 2XS0A 5K0XA 3GOKA 3FLNC 4GRBA 3Q9XA 4GT4A 5JGAA 1I09A 5JKGA 3ZEPA 3QCYA 4R77A 5A9UA 4FOCA 4JRVA 2IW9A 1K9AA 3LFQA 3M2WA 1FGKA 4BCHA 5LVPA 1ZOGA 3ERKA 4P5ZA 2Y6OA 4AS0A 4DLIA 2OWBA 4F7JA 3S95A 4QMNA 3GEQA 4UYNA 4DGGA 3GP0A 4NM3A 4E4XA 2FYSA 3PYYA 3PY3A 2PVRA 3I60A 1ZYSA 3KMMA 3QX4A 2PE2A 3REPA 4ENXA 2YIXA 2QOHA 4ZS4A 2JITA 3PRFA 2WHBA 3SXRA 3R02A 3RTPA 4AGCA 2E9UA 3GC8A 4D4SA 3LIJA 3VS0A 3UNZA 4XH6A 2C5XA 5E8UA 3OHTA 4CFMA 4YURA 1J3HA 4FK3A 4U0IA 2AUHA 2WZJA 4GT5A 4D9TA 3PRIA 4NEUA 5HHWA 4MYGA 1Q8ZA 4MXCA 4AW2A 3D5VA 3L8XA 3K54A 3DT1A 3MA6A 5LQFA 2EWAA 2VWIA 3A7GA 4RVTA 4EWHA 2I40A 2G1TA 2YM8A 2YZLA 4MD8E 3ZFYA 4BYIA 4I92A 3BPRA 1JSVA 3VC4A 4N4SA 5ETIA 3ACKA 4E6DA 4Q2AA 4BDGA 4EJNA 1DI9A 2PVMA 3NNVA 2X1NA 4KAOA 2WMTA 3HEGA 4O21A 4TWNA 4ARKA 3WF7A 4I0RA 3UO5A 3QQGA 4OTDA 3LFFA 3DDPA 3HGKA 3TV6A 5FP6A 4O7ZA 3HP5A 5K5NA 3ZSGA 1Q4LA 4UYAA 1XQZA 2VWBA 1V0OA 3BV2A 3QTXA 4QTBA 5HD4A 2Z7SA 4FKLA 4XG2A 2JIUA 3AG9A 2ZV9A 1OKWA 5CU4A 1X8BA 4LGHA 1AQ1A 3PZEA 4FNZA 4E6CA 2C5OA 4CLJA 3PA4A 4TKSA 2BCJA 2Q0BA 5CANA 2PUNA 3UC4A 3O23A 3KXZA 4FSNA 4ITIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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