3MY0A

Crystal structure of the acvrl1 (alk1) kinase domain bound to ldn-193189
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
300
structure length
296
Chain Sequence
MQRTVARQVALVECVGKGRYGEVWRGLWHGESVAVKIFSSRDEQSWFRETEIYNTVLLRHDNILGFIASDMTSTQLWLITHYHEHGSLYDFLQRQTLEPHLALRLAVSAACGLAHLHVEIFGTQGKPAIAHRDFKSRNVLVKSNLQCCIADLGLAVMHSQGSDYLDIGNNPRVGTKRYMAPEVLDEQIRTDCFESYKWTDIWAFGLVLWEIARRTIVNGIVEDYRPPFYDVVPNDPSFEDMKKVVCVDQQTPTIPNRLAADPVLSGLAQMMRECWYPNPSARLTALRIKKTLQKIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A small molecule targeting ALK1 prevents Notch cooperativity and inhibits functional angiogenesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase receptor R3
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 296
sequence length 300
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, V, W, X
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2010-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3my0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3my0A01
4QP7A 5CEMA 1YI6A 4ZOGA 1ZRZA 4M97A 2GNLA 3D5UA 3BHYA 3UIBA 4EH7A 2XF0A 2ERKA 2VWXA 2VTSA 5F20A 1LPUA 4IEBA 4AGCA 1ERKA 1H07A 1Y57A 2GMXA 2W1FA 2Y4IB 4LFIA 4QMLA 3ZDUA 4BZNA 5L8KA 5H3QA 2ZV8A 4AW2A 4FKIA 5EDQA 1I44A 4K8AA 3S95A 3GC0A 4ALVA 4MNEA 2JBPA 4W9XA 2Y4IC 3UQCA 4QTCA 4R6VA 3TI1A 4P7EA 5IQAA 2BPMA 4R5SA 4DGOA 4FEVA 1OKVA 4CFXA 4EZ7A 1KOBA 2JIIA 5HE3A 4EOOA 3V5QA 3R8UA 5IQDA 3MB7A 5AR7A 1TQMA 4B0GA 3KK8A 3BGQA 5A6OA 2LGCA 1R39A 4U3ZA 3D5WA 5DH3A 4WA9A 3LFSA 4RJ4A 2YLFA 4I20A 3R1YA 3RM7A 4BDBA 3U9NA 2YM8A 4F70A 1JSVA 3COHA 2PZIA 3DJ7A 4FIGA 4E6AA 5K9IA 3OOGA 5KX8A 2XJ1A 4FI1A 3VW6A 4ANOA 4APPA 4BKYA 4CD0A 2J50A 2VV9A 3LE6A 4MNEB 4YHTA 4ZXTA 4ZTMA 3CJFA 3DZOA 1MUOA 5CF8A 3WZEA 4G3CA 3QHRA 4UALA 3H10A 5FBOA 2X39A 4QTAA 3WZJA 5HVJA 3G90X 3ACJA 4FTMA 2IW9A 3I5NA 3NX8A 3ZCLA 4BIBA 2IPXA 4M15A 2VWIA 3R7YA 3OT8A 2GDOA 2VNWA 4MBIA 2W9ZB 4X2JA 5A3XA 3KXZA 4FNWA 1X8BA 2IZTA 4NL0A 3OEZA 1H1QA 3QRUA 5IEXA 3OZ6A 3BV3A 4I6FA 4ANNA 2IW8A 3CQWA 2VTIA 3BWFA 3R7IA 5ETFA 3P23A 2OGVA 3ZO1A 3FZSA 4D2VA 3R00A 4J95A 2GU8A 5BUEA 2WAJA 1Q8UA 3CY2A 1TQIA 3GC9A 1SVEA 4S32A 5LMKA 4BCNA 5KZIA 2XB7A 5KMNA 3RGFA 4U79A 3THBA 2QD9A 3DOGA 3W10A 4GJ2A 5AX9A 3R04A 1JNKA 4B8LA 5T6KA 3P86A 2CKEA 3P78A 4G2FA 4NIFB 4DC2A 2ZM4A 5ITAA 2H34A 4D55A 2QQ7A 2GSFA 3U51A 4BHZA 3F3UA 3ZLXA 2NNWB 5M09A 3MDYA 4NWMA 4XP0A 4F6SA 1Y6BA 4QRCA 5M4CA 3FC2A 3NCZA 3QTWA 2XNMA 3IW7A 4WBOA 3WF8A 2NPQA 2REIA 4IQ6A 4EH9A 4C3FA 2J5FA 3U8WA 4D5HA 1SM2A 4ZY5A 3V3VA 3KN6A 4KD1A 2B9HA 2BRGA 2WQNA 3GGFA 3V04A 2EU9A 5AV1A 4YNOA 4TWNA 1Q8TA 3PXQA 4L8MA 4O0UA 3ZU7A 1JKTA 4FV7A 4AZWA 4DAWA 5J7BA 2C6IA 4FR4A 4PMMA 2WU6A 1JVPP 4FE2A 4RX9A 3DS6A 3TZ9A 2HY0A 2I40A 3OCTA 4OTHA 3V8SA 3LHJA 4LV5A 2ZV7A 2OH0E 4IB3A 2IZRA 2PZ5A 4YLKA 3MS9A 4FEQA 5CXHA 5M08A 3HRBA 4KIKA 3ETAA 3TIYA 4C62A 2YERA 5J7HA 4OTDA 4ZJIA 3DLZA 4MVFA 1YWRA 3NUSA 3PLSA 4FSZA 4JBPA 1OIYA 4KIOA 4EEVA 5CANA 3C4WA 4C4HA 3QUDA 5A6NA 4H39A 5IPJA 4ZSLA 1U54A 5ANDA 3QRTA 2GCDA 1JLUE 3RZBA 3WIGA 3HMOA 3VS4A 2BTSA 5E8ZA 1ZLTA 3BGZA 2BHEA 2IZSA 3DPKA 1M2RA 3OWLA 3PZEA 4KKGA 4FIEA 3PSCA 2XM9A 4HCTA 3UDBA 5CU6A 4Y73A 2QHNA 2CGWA 2GHMA 5KMKA 1GIJA 2VTOA 3E64A 1H1PA 3JS2A 1OL5A 2P33A 3FPMA 2GQRA 3OMVA 3KC3A 2V55A 4L68A 4IWDA 2W1HA 5KUPA 5L2WA 3FBVA 4JJRA 4U8ZA 4F9CA 5HE0A 3DJ5A 3K5UA 3I79A 1UKIA 4IAYA 2QO7A 4RC2A 3TUBA 1PW2A 4ZS0A 3BIZA 3VUMA 4AN3A 2XRUA 1IAJA 3BCEA 2XBAA 4IM3A 4UYNA 3PWYA 3TUDA 5E9EA 2HWPA 1NVRA 4E4LA 4X7QA 3K3JA 5J5TA 2BDWA 4KA3A 2WTJA 3OHTA 3OUKA 5BNJA 5IMXA 2WD1A 5J1VA 3RCDA 2UUEA 4MEDA 3QX2A 2YITA 2FO0A 2PVNA 2VTRA 4YO4A 3LQ3A 3KRLA 4IAKA 1FOTA 1YXUA 1Z9XA 4O2PA 5M56A 3IPHA 2VN9A 4I4FA 4FV9A 4CMUA 1YDTE 4HGLA 4RPVA 1LUFA 3F5XA 3Q4ZA 5TF9A 1PXLA 5AUXA 3CBLA 4PNKA 5AEPA 3A62A 4AACA 4R7BA 3BYVA 2Q0BA 3N4VA 4R1VA 4EHVA 5B2MA 3SXRA 5BX0A 3L8PA 2YCFA 3TDWA 3H30A 2OK1A 3I6UA 3MVMA 3WZKA 4A9SA 4IB0A 2ETKA 2XNPA 3POOA 5I0BA 4GH2A 2ZB1A 3VS1A 4E6QA 1ZOHA 5I9WA 4MNFA 4USFA 3BHHA 4FV3A 4RFZA 3KVWA 4ZMFA 4A9RA 2VTLA 4CG8A 5CSHA 4GG5A 5IUGA 3MY1A 4A07A 2IO6A 1ZYSA 2VNYA 1YHWA 2WMUA 4KUJA 4D5KA 3DKFA 3DJ6A 5EM7A 1OKYA 3SVVA 5FUTA 5D7AA 2GHLA 4J53A 4E4XA 1SNUA 1YW2A 4RJ6A 5TT7A 4FTUA 3R9DA 4JX7A 4M68A 2YWVA 4NW6A 2HZNA 1ATPE 3FYJX 3ZLYA 5DN3A 4EK5A 5DYJA 3KEXA 4DEHA 3QZGA 3ORTA 2OH4A 4XP2A 4JBVA 5D1JA 5IQIA 4O0XA 4IADA 3GCUA 5CVGA 2Y9QA 3NUNA 2XNOA 2O5KA 3ORPA 4CTBA 4BCOA 2HW7A 2PL0A 4X2GA 1U59A 3HV6A 2C68A 3F3WA 1K9AA 2JGZA 3MJ2A 4I23A 3OXTA 2W05A 4YPSA 3I81A 5C8KA 2IVTA 3DBQA 2YZAA 3ZO2A 4TW9A 1UNLA 5JFVA 4J1RA 2EXCX 4TY1A 2P55A 3FZ1A 3PZHA 4YZDA 2A4LA 3Q6WA 2OBJA 3ET7A 3MH2A 4ZTLA 2JFMA 2UW4A 4KSQA 3A7IA 4I93A 2OZOA 4UMQA 4DEEA 4WHZA 3FLNC 2G1TA 3QTIA 3BPRA 3NUYA 3PPZA 3QXPA 4I5PA 3E93A 5DNRA 3U4UA 4BGGA 4Z16A 3DNEA 5D9HA 1LP4A 4DGMA 4CKJA 5GZAA 5JEBA 3WILA 4KRDA 3JPVA 1OL2A 1O6YA 1OPKA 4HVSA 4PPCA 2DUVA 2O2UA 3ID6C 4D2TA 3HA6A 5IZFA 1FMOE 3HAVA 3QTXA 4C4JA 3C4FA 4M13A 4NFNA 3HRFA 3MA6A 4ITHA 2BUJA 4G5JA 2YN8A 3A2CA 2Y8OA 3E88A 4QP6A 3G33A 5LVLA 4AFEA 3DA6A 3QA8A 3CTJA 5GHVA 3RPYA 3D0EA 4BCPA 4YJVA 4J7BA 2W9FB 1YOJA 4LOOA 4Y95A 3L8XA 4EH5A 2P0CA 2UZDA 4JRNA 4O38A 5E8SA 3KXHA 4NJ3A 2WEVA 3MY5A 4FUXA 4K9YA 3BKBA 1J1BA 1YWVA 3IQ7A 3RVGA 1A06A 3W2QA 4F7NA 5TKDA 2WZJA 3K2LA 2QODA 3OBJA 1M7NA 4K11A 3DKOA 4PP9A 4QP1A 3FEGA 4JLCA 5AX3A 2V7OA 3ORNA 4O84A 3GC7A 3LFAA 4LGDA 5HORA 4O21A 5E4HA 2BAQA 2PMOX 3QRIA 4RMZA 5EQEA 5EM6A 5DHJA 3BHVA 3CC6A 3NNUA 3UIXA 4UN0C 4IHPA 4QP4A 5C26A 1H4LA 3ZO3A 4EH3A 2WGJA 5JZJA 3FMNA 2YWPA 1ZOGA 1ZZLA 3W2CA 3ZFMA 2HZIA 3F5GA 4JG8A 3LLAA 4MD8E 4IB5A 4LMUA 4V04A 1XWSA 3W2PA 3GC8A 3F2AA 3L1SA 3ANQA 4D4RA 4UMRA 1PF8A 1B38A 1M2PA 4UWYA 3TL8A 4F7SA 2RKUA 3AG9A 4BDJA 4A4XA 4I41A 5GZ8A 4CCBA 3VULA 1ZWSA 4KKEA 3LLTA 3MTFA 4D2WA 3LZBA 2YFXA 2ZV9A 5M4FA 2EXMA 3LOKA 3MI9A 4U0IA 5KMMA 4YZMA 4RFMA 3K5VA 4ASDA 2C69A 2Q0NA 3RPVA 4O82A 3OFMA 3QWKA 4YHJA 3DK6A 4MYGA 4BCGA 4LL0A 3QZFA 1SZMA 4XCUA 4D2RA 4G17A 4QPAA 2QC6A 4YJOA 4FKTA 4EQCA 4RX8A 1W84A 3UPZA 5AP0A 4CKRA 4ZZOA 4RWJA 4YJNA 2E2BA 3HMNA 1LEZA 3LXPA 1OM1A 4IFGA 5AP3A 4YTIA 4AFJA 4YO6A 4F7LA 4TT7A 4YSJA 2VTTA 4W8EA 5HO8A 4O7VA 2BHHA 2PMIA 3UMXA 4AA4A 4YJPA 1ZMVA 5M07A 2ZYBA 3AOXA 2YM3A 2YAKA 4Q9SA 4FEXA 3TCPA 5AUZA 5M4IA 3FJQE 5I5ZA 4OLIA 4BBEA 4IVAA 4OBQA 4C4FA 2UVXA 3PVUA 4TNBA 2HCKA 4ASEA 3BYSA 3RKBA 2GQSA 1H00A 3G2FA 3EQRA 3AC8A 3T3VA 5HIEA 5J5SA 4ANLA 5J9ZA 1F3MC 3C1XA 4FBXA 4CZYB 5D10A 4USDA 3R1SA 2OJ9A 2QHMA 3VWAA 3NZ0A 3V5PA 4HCVA 1XR1A 4NW5A 4BC6A 3LVPA 4EONA 4C58A 4C37A 4PV0A 2ITZA 3B2TA 4U42A 2E9VA 2WMXA 3PXKA 5HEZA 4ASXA 2W1DA 1GIIA 4BDAA 1FBNA 4FTCA 5AV2A 2LAVA 4DYMA 4FV6A 3AT4A 4OTGA 3E8EA 1KE9A 4MCVA 3CTHA 2R3KA 4L44A 1V0PA 3BGPA 2F57A 1CKJA 4RC4A 4WUNA 3KRXA 3SOCA 4GEOA 1P4OA 3I5ZA 4J99A 1RQQA 4LM5A 3M42A 3ZMMA 3ZRKA 3D7TB 3MGYA 2RFDA 5C01A 1WBPA 2QKWB 2WKMA 4FV4A 2QI8A 5A4EA 5CAQA 3ODYX 1Q62A 4YZNA 4XG9A 2PVYA 3QQJA 4HPUE 2WOTA 2FB8A 3QUPA 3UP2A 3BE2A 3TM0A 2ZOQA 4U7ZA 5HE2A 2BZHB 2X8DA 3H0ZA 4PMPA 2O63A 3HYHA 4UMPA 1OITA 4CRLA 3AD6A 4YZ9A 1CTPE 4YZCA 5H8EA 3AC4A 4U9AA 4XG3A 4CEGA 4ANMA 3MN3A 1YDSE 3VBXA 3PIYA 5FG8A 4FEUA 3CIKA 4OW8A 3BYOA 3PIZA 3TZ7A 4ZS4A 1ZOEA 3HUBA 4TWOA 2F4JA 2E9PA 1YI4A 2V7AA 3DBFA 4JDJA 4LI5A 4LYNA 3UE4A 3ZBXA 5LOHA 1SYKA 1R78A 3F2RA 3GENA 4M0YA 3GCQA 4S34A 3MJ1A 1NVSA 4FV0A 2C0OA 1VR2A 2B7AA 2BZIB 1REJA 4WNOA 1AD5A 5EYCA 2JDTA 2RL5A 3EB0A 3QRKA 3OD6X 3FMMA 5BMSA 3FC1X 4E5AX 4WNMA 3LCOA 2C5VA 4RGJA 2R3LA 2EXEA 4EJ7A 4EWHA 1F0QA 2C5OA 4UX9A 3WOWA 2FVDA 3LCSA 4QD6A 5KZ0A 3RAWA 5F94A 2W4OA 4R3RA 3COKA 3UMWA 4C2VA 1L3RE 5FXSA 4RRVA 4BWKA 1J7LA 4G6LA 5G1XA 3L9LA 4CKIA 2W96B 4CZUA 3U55A 3C4CA 2EVAA 4I24A 4V05A 5L2QA 5EYDA 4DH1A 5A4QA 4JQ8A 5CU3A 1KV2A 5I9ZA 5DT0A 2VX3A 4DEAA 3L8SA 2BRNA 3MFSA 4YZBA 4DEIA 3KKVA 5HG7A 3UOLA 2J2IB 2F2UA 4C2WA 2VWVA 4IVDA 5BPYA 2UZLA 4IDVA 2R5TA 5JT2A 4FVRA 4DG0E 5GINE 3TG1A 5HBEA 4PP7A 1GAGA 2R3GA 2WOUA 3UNZA 2ITNA 4ZTNA 3PY0A 3C5UA 4HZSA 3OWKA 3VQHA 5IH4A 1KV1A 1STCE 2QCSA 4QMNA 1WCCA 3PG1A 1OIQA 4O0WA 5CX9A 5L2SA 3TV7A 3MVLA 2X9EA 5C8NA 3BEAA 4P5QA 3D83A 4FTRA 2YCSA 2JAVA 2P2IA 4C57A 1BX6A 4YMJA 4R78A 4YP8A 4EOLA 2WMQA 5E8WA 2JITA 2VU3A 2VWYA 4XG4A 5LVPA 1BUHA 3TNPC 2X9FA 3DKCA 3H9OA 4JXFA 5ANJA 4ERWA 3O8TA 5CT0A 2B9JA 3GB2A 4YJUA 4JG6A 4OTWA 4II5A 5DR6A 2J0KA 4XMOA 3SGCA 2HWOA 4C61A 1R1WA 4OT5A 4U41A 4ZAUA 5L6OA 5CSPA 4AN9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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