3NNUA

Crystal structure of p38 alpha in complex with dp1376
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Switch control pocket inhibitors of p38-MAP kinase. Durable type II inhibitors that do not require binding into the canonical ATP hinge region
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3nnuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3nnuA01
4E26A 4FKRA 3LJ1A 4AGWA 1UA2A 2C6OA 3FLYA 4FKJA 3VUGA 3PUPA 4U8ZA 4RA4A 1ZYCA 3LOKA 2PTKA 2AUHA 4BN1A 2BZIB 4RC2A 4G9RA 3C9WA 1PMUA 3ORMA 4APPA 4F9WA 4LRJA 2BFYA 3QWJA 5GJDA 2UW7A 1Y6BA 4MYGA 3VVHA 4EWHA 3LMIA 4BDFA 1QCFA 2BIKB 4J7BA 1OPJA 4AA5A 2YISA 3KRRA 4FSYA 3U54A 4W4WA 4EUTA 4TWNA 1ZOHA 3WILA 3HDMA 2R3GA 2YM5A 2VTAA 5HICA 1CM8A 3QTRA 1Q8WA 5AV1A 3DLSA 2YEXA 4CYJA 3LFSA 3DFCB 4U3ZA 3ORNA 4NSTA 4I41A 4CMTA 3RNYA 3U8WA 4TL0A 3JY0A 4JLCA 1S9JA 4DH3A 4DG3E 3SX9A 3KU2A 4Q9ZA 3QZFA 4U7ZA 4XH6A 3PRIA 2W99B 3FMDA 2W1IA 4BDCA 2WTIA 2BDFA 3DKOA 4FSWA 3TWJA 5IA0A 3AMAA 4O21A 2HY0A 3OROA 4O7LA 1SM2A 3A4OX 5JFWA 2YZAA 4Z3VA 2WO6A 3TEIA 4FV0A 1P4OA 2XNOA 3Q3BA 4C3FA 3RHXA 4BHZA 2GNFA 2O5KA 5AFVA 3HUCA 4JDKA 4F7SA 1Q97A 1YW2A 2YM3A 3ZRLA 3DDQA 5L2SA 4ZS0A 3EMGA 1HCKA 1ERKA 3CE3A 2XB7A 4S33A 4D4RA 1U5QA 2UW5A 5LOHA 4Z16A 3UC3A 2XH5A 3M11A 2BHEA 3MY0A 2R7BA 3G33A 4ZZMA 5AP7A 2BAKA 4EHVA 5JRQA 3DT1A 3D15A 3NWWA 3KXXA 5KMMA 4CNHA 4IBMA 2J7TA 4FKIA 4FTIA 5M4CA 4C0TA 2VTOA 4CXAA 1ZMVA 4HCTA 3NNWA 5E1EA 1P4FA 3LCTA 5KBRA 5EKNA 3IKAA 4OTIA 5HNIX 2Z2WA 5DOSA 5HNBA 4ASEA 4O7RA 4ACHA 4BDAA 2W17A 4FTJA 4YUQA 4FMQA 3ERKA 2UW9A 5LARA 4I5MA 4E4XA 3G0FA 2PVMA 5E8VA 3SKCA 3NUPA 2QOIA 3MW1A 4F9CA 4BGHA 3HAVA 2VAGA 5KMOA 4TT7A 4XRJA 5E8YA 4U45A 2GNJA 4FVPA 3QU0A 3FJQE 3LHJA 4I92A 5L2IA 1BI8A 3RBWA 4Z7GA 5CEPA 2RFDA 3U6HA 3PPZA 3Q04A 5C8MA 2P2HA 3SAYA 4EHZA 3QTSA 3PA3A 5C01A 2UW3A 2OIBA 3RCDA 1JSVA 3U87A 4QMUA 3ATTA 2R2PA 1XH6A 2I0VA 3CBLA 4KRCA 1LR4A 4RVLA 1J91A 4WUAA 4BCHA 2O64A 3LKMA 4FL3A 2JAVA 2W9ZB 3QGYA 4I6QA 2GHLA 5LWNA 3UQCA 4NTSA 1F0QA 4IM3A 3CEKA 4MTAA 3CY2A 3R8VA 2VX3A 4RX5A 1OL6A 2JFMA 1LEWA 3NRMA 3Q52A 4ZIMA 1PKDA 5J79A 2WMBA 1YI4A 4E6AA 5HIEA 5CI7A 4FZ7A 4LRMA 5C9CA 4ZMFA 3D4QA 4BCQA 3PVGA 4YLLA 4CZTA 3TZ7A 2BFXA 5ETAA 4IJPA 2ZJWA 3NW7A 2QU6A 3IDCA 4FE2A 1L8TA 4ID7A 3EWHA 3VBVA 4BC6A 1O6YA 2IW9A 2WMRA 4JS8A 5EW9A 4TWPA 4BI0A 2PZPA 3HAMA 4QYYA 4UMRA 4WNOA 5I3RA 2CMWA 3MI9A 2Y0AA 4G16A 1PMNA 4IC8A 4KIQA 4XYFA 4YR8A 3I0QA 3HNGA 1YXTA 3OY1A 4E93A 3Q60A 4NTTA 2B9HA 3C13A 5DR2A 2VO6A 4IB3A 3FAAA 4CG8A 3GT8A 1PF8A 2G2IA 4Q5HA 5CANA 3G9NA 4PPAA 4FF8A 1PXNA 2YCRA 4O0TA 5J7BA 3LMGA 2H8HA 1K2PA 3ZUUA 3OW3A 2WIPA 4OT5A 2CDZA 1LEZA 2RGPA 4XBRA 2VWBA 4G1WA 3RPOA 3RPYA 1OKZA 4N6YA 1FVVA 2DWBA 3K3JA 3F61A 3ZSIA 3FXWA 3C4ZA 5JZJA 3K2LA 4GG7A 2ETRA 3D2IA 4IW0A 4ZZNA 4CFXA 4IC7A 5IISA 4PTCA 3MFSA 4J98A 5LMAA 1Y8GA 2PVNA 4E7WA 4EC8A 4CMUA 1JKKA 3C5UA 4AT4A 4X2JA 1OIUA 4IAKA 5D10A 4D2SA 2CKOA 1YDSE 1TQPA 2W4OA 4IZ7A 3VN9A 1OL7A 4HPTE 3WF6A 3RPRA 4MWHA 3PRFA 4WIHA 4E73A 1WBSA 2C0TA 2ZM3A 5EW3A 5KNJA 1FOTA 5C4KA 3VW8A 5CF8A 4FEVA 1RE8A 1P14A 1O6LA 4JDIA 2C0OA 3DV3A 2VTPA 4C8BA 3RCJA 4TW9A 5HD7A 3BWJA 2OJ9A 5BVFA 4QRCA 3QA0A 4BL1A 2IZSA 4LUEA 3S4QA 3R6XA 3UJGA 4BCIA 5JMSA 5CQWA 4DEDA 2B7AA 5HG5A 3R71A 4DCAA 3A7IA 2Z7RA 1ZYDA 3EQGA 3T3VA 1PXKA 2FYSA 5FXQA 3E88A 3VS2A 4D1XA 3EFJA 2XIYA 3E7VA 3FI2A 3EQRA 4C62A 5K5NA 2IZRA 3R1QA 4IVCA 4B99A 3QUEA 4FODA 4G6LA 3BLQA 3REPA 4O81A 4FNXA 5EOLA 2OFVA 3SW7A 4K2RA 2WTDA 3OOGA 2OGVA 2R3RA 1F3MC 4I6HA 4QOXA 5LCJA 3DZQA 3EQCA 4O0SA 2XBJA 1FPUA 3O7LB 4MXCA 3LM5A 4Y5QA 1KOAA 2PE2A 4XG9A 4B8MA 4C3PA 5CU0A 3R7GA 5J8IA 3Q5ZA 3ZO4A 3NUUA 5AP5A 5B2KA 4BDDA 4D55A 3TDVA 5L4QA 2ZMDA 3N4TA 4AAAA 3RP9A 3A7FA 3GOPA 3RAKA 4GMYA 4E5BA 1OMWA 3VJNA 5E4HA 4PL5A 4O2ZA 3I79A 4YZBA 4BTMA 3BEAA 2JC6A 2V5QA 5H8GA 4D28A 4ZZOA 3AQVA 4EQUA 2EUFB 3DB6A 3FQHA 3NYXA 2XK7A 1UNGA 5KZIA 1H1RA 4YNEA 3AD4A 2BRMA 4KBCA 4RJ8A 3KF7A 3UO4A 3Q6UA 4PL3A 4GRBA 2QG7A 2QNJA 3TKHA 3C4EA 3ZH8A 2OXXA 4NKSA 4AW1A 3FY0A 4FKLA 5AMNA 5LCKA 4A9TA 4XS2A 4KABA 3R7UA 3MA3A 4GYGA 3OCGA 3UG2A 1OI9A 3PZHA 5IU2A 3EIDA 3FZRA 3W2QA 2F7XE 3KVXA 4C33A 2GHMA 3AC3A 4IHPA 4B9DA 3PG3A 3L8PA 4QQ5A 2UZVA 2UUEA 3ELJA 3P1AA 1U4DA 4JG7A 4ZXTA 4IVDA 3UIXA 5HU9A 5LVOA 4D9UA 1CDKA 4XHKB 3VS1A 5EQEA 3R28A 3H9RA 2H9VA 4I4EA 4EONA 3WZJA 4BIBA 4UEUA 2ITWA 4ZSJA 3GBZA 3FZPA 1VZOA 5AEPA 3HVCA 3P0MA 5CYIA 3P9JA 4AWIA 5JK3A 1PHKA 3MVLA 3TI1A 2V7AA 1KV2A 3JUHA 2X7OA 3VF9A 4NW6A 2KTYA 4K18A 2OJGA 3UNZA 1YXUA 3QHRA 4Q2AA 4NIFA 1J7IA 2PZRA 3TTJA 4AW5A 4NJ3A 2GNIA 3R7IA 3UVPA 4CTBA 4HVHA 4FKOA 4QNAA 4NU1A 2IG7A 4MD8E 4DHFA 4FV2A 4I22A 1ZRZA 4K8AA 4YJNA 2ZV9A 4PP7A 3IW6A 2PUIA 3R9RA 2F7EE 3A7GA 3R7OA 4M12A 3II5A 3IW4A 2AC3A 4HGEA 2I6LA 5M4FA 4DT8A 2HXQA 3FZ1A 5CU6A 1YDTE 1W98A 3R21A 4DGGA 5IQAA 1VEBA 5CLPA 2EB2A 4G3GA 3BHVA 4W8EA 5HVJA 1WBWA 5A4EA 2JKQA 1SYKA 2YJSA 1Q8YA 4IAYA 5FXRA 3ROYA 5DR9A 3E64A 4L8MA 2V62A 3DY7A 2XZSA 2OJFE 3PWYA 4K1BA 4RX8A 3RAWA 3UOJA 3NS9A 3C4CA 2BZHB 3KFAA 3OT3A 3EB0A 3V01A 1E9HA 1G5SA 3PJ3A 1CMKE 3UGCA 1URWA 4DBNA 3PPKA 4X2KA 5CY3A 4A9YA 2UZWE 4NUSA 4U44A 5EQYA 3LFCA 3L9NA 4PDSA 3ENMA 4WNKA 5EYCA 5AUZA 2DUVA 2QURA 4EWQA 5HLWA 5LWMA 2WFYA 4AT5A 4F09A 4M67A 1V0OA 4GT5A 4WT6A 2QLQA 4RIYB 5KE0A 5K3YA 4BBFA 2PE0A 3O96A 2V22A 4AE9A 3HV3A 4YJVA 5A9UA 2QOHA 4HYSA 2VNYA 4ZTNA 1GAGA 3QGWA 3UTOA 4DG2E 3UO5A 2YIRA 2QOLA 3FYKX 2J51A 2Z02A 3BZ3A 3GC9A 2RFEA 4YSMA 4QMWA 2PHKA 4TY1A 3MV5A 1TQMA 3ORZA 5HCZA 3PJ8A 2FH9A 3CC6A 3AT3A 3PVWA 5EDPA 4X2FA 2WQMA 2PVHA 5IQBA 2UZBA 4A4XA 4ITHA 3TV4A 1IG1A 1ZYJA 5LVPA 3HECA 2HWOA 3CP9A 4O0VA 1GZOA 3MVHA 5IA1A 5G6VA 4EKLA 5M4IA 3VBWA 2GS6A 1ATPE 3BCEA 3QXOA 2JITA 5EYMA 3KMWA 2VWXA 3O17A 4S30A 5BUIA 1O9UA 3FZTA 4BGGA 4WG4A 4ANSA 5BYLA 3OWPA 4F70A 2VUWA 4X3FC 4JRNA 3UOHA 1G8AA 1MQ4A 5AP0A 3P79A 3UPXA 1Q8TA 2R3FA 5FG8A 1YQJA 5HG9A 3ANQA 4WRGA 5HG8A 3QCSA 1WVWA 3U51A 5J87A 2QKWB 2IVSA 2BTSA 3FLQA 2XA4A 4CT2A 4EOIA 3QALE 4RMZA 3FI4A 2WPAA 1W0XC 5AV2A 3I0OA 4OTQA 5AR7A 4IFGA 2WEIA 5C4LA 3V5QA 1H07A 5L6WL 3WF5A 5KMJA 5IEYA 4IE9A 4H1JA 2F2CB 5BVWA 5BVEA 2OU7A 5DGZA 5E8SA 3QD0A 4O7TA 5C1QB 4J8MA 3PA5A 4QMSA 3CQEA 5E8UA 2EB3A 4MK0A 3TKIA 4ZTSA 4C61A 5CXHA 2VRXA 2O2UA 1JBPE 4J53A 4RFYA 3ZO2A 4L7FA 4F6UA 1WBTA 5AP3A 3VBQA 2Z7SA 2P55A 2P0CA 4UYNA 1FMOE 4O6LA 3BYVA 2PUPA 1OIYA 3CTHA 3ITZA 4QMPA 2HW6A 1WFCA 4BKYA 4EH3A 4FV7A 2CHLA 3T3UA 5EG3A 3BV3A 5A6OA 4IWOA 1JLUE 3TNPC 5A6NA 3QQFA 2CKEA 1H0WA 2J9MA 3H0YA 3IO7A 4ZJVA 3HDNA 3O8UA 3QTQA 2OJJA 5BMSA 3UQGA 1W82A 2PY3A 5D12A 2E9VA 4MH7A 4B0GA 2VWUA 1E1VA 3ETAA 3ZONA 4U97A 3QZIA 4FV6A 1XBCA 3NYVA 4J52A 5EM5A 1NT2A 3NCGA 4FTNA 5TR6A 1PKGA 3KK9A 3PDTA 3AGLA 2OKRA 3RWPA 4X6RA 4BF2A 3KQ7A 4XG2A 3IECA 3EQHA 3Q32A 4UX9A 2C3JA 2R3LA 2JBPA 3MFRA 1ZY5A 1OIQA 4IIRA 1U59A 4PY1A 5HO8A 3THBA 5AA8A 2R5TA 1DI8A 3V6SA 3V8WA 3ZRMA 4CCUA 4AGUA 4H3QA 1ZARA 4AN2A 5ANJA 4O7ZA 3Q9YA 4LG4A 4F64A 2C4GA 3CGOA 2RL5A 1UNHA 3DAJA 3OEZA 1DM2A 4RIOA 3D7ZA 4S34A 5IH5A 2XJ0A 2ERZE 4JDJA 3BKBA 3UC4A 3QTUA 4NW5A 2PVLA 2W96B 4RT7A 4DYMA 4HPUE 3I1AA 3OXZA 4PPBA 3PXZA 4BY9E 2OIDA 1WMKA 5KKRB 1XHAA 5B7VA 2VGPA 4ALUA 2WD1A 4ZS4A 3N4UA 4YP8A 1RDQE 3LW0A 3QYWA 3F2RA 3DDPA 3OCTA 4EQCA 3KXZA 1BUHA 5CAUA 3RHKA 2W1HA 3W55A 4M0YA 2VTQA 4JI9A 1W84A 4TXCA 1RQQA 2WELA 1RW8A 3SRVB 2PUUA 4FIHA 4DGMA 5HZNA 4PP9A 3A8XA 5T6KA 4WOVA 1WCCA 3KULA 3ZHPC 1E1XA 2LAVA 5C8NA 3HV5A 4FL2A 4IVAA 1ZAOA 3CIKA 4GU9A 4G2FA 4E6DA 4L3PA 4FR4A 5HTBA 4RA5A 4TTHB 3EQIA 3FPQA 3BYMA 5I4NA 3W32A 3R0TA 4JOAA 4OTHA 4DF3A 3MGYA 4XG8A 4AXAA 4GH2A 2YM4A 3GEQA 3L8XA 4FTQA 3VQHA 4BVUA 4DA5A 1YWNA 4WBOA 3VBYA 2NPQA 4F4PA 3ZZWA 5HGIA 2OG8A 4JBPA 5FQDC 3EYHA 3OUKA 5E92A 5JN2A 2J50A 2VWWA 4BDBA 4FIFA 1XBAA 3GI3A 1FINA 3C1XA 4QMTA 4GVAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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