3O17A

Crystal structure of jnk1-alpha1 isoform
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
DNNFYSVEIGDSTFTVLKRYQNLKPIGSGAQGIVCAAYDAILERNVAIKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLMKCVNHKNIIGLLNVFTPQKSLEEFQDVYIVMELMDANLCQVIQMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLARTAGTSFMMEPEVVTRYYRAPEVILGMGYKENVDIWSVGCIMGEMVCHKILFPGRDYIDQWNKVIEQLGTPCPAFMKKLQPTVRNYVENRPKYAGYSFEKLFPDVLFPADSEHNKLKASQARDLLSKMLVIDASKRISVDEALQHPYINVWYDPSEAEAPPPKIPDKQLDEREHTIEEWKELIYKEVMDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of JNK1-alpha1 isoform
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 8
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3o17A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3o17A01
2NPQA 5HHWA 4K6ZA 3BE2A 4DCEA 3PG3A 3UIMA 5K0KA 5A4EA 4Y85A 3EN4A 5HQ0A 3LLAA 5JFXA 3HMIA 4QP2A 3MFTA 5D7VA 4I6BA 4JDKA 1UWHA 5TE0A 3HVCA 3FMMA 4ORKA 3MY0A 4AOIA 3TCPA 3E3PA 5HO6A 3GQLA 5ANDA 4ITJA 3QQKA 3TKHA 2PMIA 3ETAA 5FDPA 2QOCA 4FOCA 2FO0A 2J0MB 3P7BA 4LOQA 5M09A 1FOTA 3BX5A 5H3QA 3GEQA 4FV1A 4UWBA 4BFMA 2JIUA 3BELA 3DNEA 3MVJA 3Q3BA 4J99A 2OJFE 2G2FA 4O2PA 4ONAA 3S95A 1F0QA 5HG5A 4QMNA 4EC9A 1ZOHA 2R3IA 4ID7A 4TZRA 3T3VA 2H96A 1PKGA 4TYEA 3RAWA 3B8QA 1GIJA 2UVZA 3ENMA 4FZFB 5EYKA 2QC6A 4QMOA 1STCE 3FLNC 3KULA 5AV2A 3ALNA 5DWRA 1FMKA 2PVYA 4FTAA 4CD0A 2Y4PA 1E1VA 1MRUA 2GHMA 4RVLA 5LARA 3JS2A 4C8BA 4RA5A 4RX7A 4U80A 3VRYA 2B53A 1Q8WA 4GEOA 2WELA 5DNRA 4PF4A 3PVUA 4GV1A 4C4IA 4DFZE 5LOHA 5C4LA 2W9FB 4FNYA 5LVLA 1XHAA 3SG8A 5GIPE 3SC1A 3OP5A 2I6LA 2ITTA 4FMQA 3RNIA 1KE8A 4G9RA 4H58A 3DAJA 3ZSIA 3NCGA 4U44A 1NVRA 4WG5A 5BVOA 3DKGA 2HY0A 3N51A 4KABA 3HA6A 3DFAA 4X3JA 1E9HA 4HYIA 5A46A 3PJ8A 1SNXA 4G3DA 2WMXA 4I0SA 1ZY4A 5AP0A 4D2VA 3LAUA 2XKDA 5EK7A 4EJNA 4KS7A 4RVKA 4BCKA 3BKBA 3OC1A 4GFMA 2WMRA 4QMVA 3A8WA 2QOLA 3FI3A 1WBTA 5I9WA 3PG1A 4GG5A 2XBJA 2I0EA 4X7QA 4CKRA 3KXXA 4BCPA 3KC3A 1QPJA 3QTZA 3C5UA 2R2PA 4IWOA 4FTUA 4EK4A 1YHWA 3QD0A 4PDPA 4EL9A 2XCHA 2HAKA 3PP1A 3R02A 4IVDA 2Z60A 4U45A 5HG8A 2O63A 5HE3A 1WBVA 4MBIA 4O0SA 3RWQA 5CANA 3DAKA 5M06A 5CEKA 4KIKB 4GRBA 2OLCA 3DOGA 4O22A 3IQ7A 4W4WA 4M14A 4RJ8A 5FTQA 4X3FA 4XV9A 1MRYA 5L6OA 4WD5A 3IO7A 2FGIA 4CT2A 3K5VA 3OS3A 3R8VA 3V3VA 4CZYB 4FX3A 2W0JA 3QZGA 4DTAA 5IQBA 1R78A 3ZYAA 2CHLA 1PMUA 4K11A 5ANEA 2WTKC 4KKGA 3UNJA 4I6HA 4S32A 3WZJA 1KE5A 4C4FA 2XCKA 3FQEA 3QHWA 5AR7A 3THBA 5HESA 3DBDA 3HGKA 3PVBA 4BTJA 1RW8A 1TQIA 5IQGA 4J97A 3OT8A 4GYGA 4BGQA 4GIIA 1K3AA 2R5TA 2CGVA 5B2KA 5ETFA 3NAYA 2VUWA 3M2WA 3WF6A 4DN5A 5D41A 2UW8A 5CAOA 5CEOA 2XKEA 5IA2A 4CQGA 4OAVB 2A0CX 2UZUE 3NPCA 3LFSA 3NR9A 4N57A 1KUTA 2E2BA 4OT6A 3RPRA 4W4YA 5DRBA 2C0TA 3BV2A 5J8IA 1XWSA 1ZMWA 2VAGA 3QCSA 3W32A 4APCA 4JDHA 4TWCA 5JGAA 4CCUA 2BILB 3ODZX 3LCKA 3DKFA 4HYUA 3SW4A 4QMPA 4RPVA 1UU3A 2HIWA 3IPHA 3HRFA 5CNOA 1DI8A 1PHKA 2V0DA 4S31A 4C59A 4MXZA 4E26A 4E4NA 2BTSA 1G5SA 3RKBA 2WMVA 1UU9A 4E5WA 4BCMA 4ITIA 3E8DA 1RJBA 4M13A 4JBPA 3A61A 4QYGA 5HE2A 5CXHA 3LIJA 3R7YA 4W4XA 3BHVA 2OIBA 3OWJA 4D9TA 4ZTHA 1O6LA 4UXLA 1JSUA 2OZAA 5C1QB 3SA0A 3RPOA 2P2HA 2JKQA 2CKQA 4GH2A 3BRBA 4X21A 1Q3DA 2A4LA 3C0GA 5BVEA 4BI1A 4RC2A 5FM3A 4FV4A 3KMWA 2C5YA 3V5LA 1OKWA 4MNEB 4NJDA 3Q9ZA 4K2RA 3D7ZA 1M17A 3F5XA 3FAAA 4ANBA 2E9UA 3L9LA 2H6DA 2ETRA 2VTIA 4HOKA 2B52A 3C9WA 3UZPA 5FEQA 3QFVA 5CQUA 4M3QA 4ASZA 3C4ZA 2XNPA 3GCSA 3TEIA 2O8YA 5A4CA 3QGYA 2XK4A 4KNBA 3BQRA 3V5QA 4D0XA 4FVQA 1FPUA 5A6NA 4DBXA 3VQHA 4CNHA 5LVOA 1V0BA 3ET7A 4FTNA 5B2MA 3B2TA 2YWPA 3FE3A 4YLKA 1W83A 2ITVA 1H07A 3L9MA 2W4KA 4DFLA 4Z3VA 1J91A 1Q24A 5LMBA 1ZLTA 2WU6A 3F69A 3PXYA 2I40A 2UVYA 3VVHA 4MXOA 2IW6A 4J8NA 3DNDA 3WIGA 5LJJA 3DS6A 4Y95A 4IXPA 5HOAA 1CTPE 4ANQA 4FZ6A 4FIFA 2GHLA 4FKSA 1CSNA 1Z57A 2XIRA 4OGRA 4DYMA 3FKNA 1E1XA 4DH1A 4JL9A 4FKQA 3HMPA 4Q5EA 3WF7A 1ND4A 4BCHA 3DXNA 1YDTE 4FSQA 5FXQA 2X6DA 4BWXA 4DEGA 1OBDA 2PYWA 2REIA 4RIYB 2SRCA 5J95A 3QRJA 1PXPA 4FG7A 4PP9A 4UMQA 4XG2A 4J98A 1DAYA 4UBAA 3DK6A 2E9PA 3WYYA 4O7ZA 1Q61A 4M69B 2R3FA 4FUXA 2JAVA 3L9PA 2QURA 4FTMA 4MXXA 2OXYA 4OTPA 4NKSA 3EIDA 3EN6A 3AMYA 5HICA 4ASDA 3E88A 3GFWA 3MY1A 2GQSA 4I5CA 1ZZ2A 2GTNA 4FSNA 2JEDA 2YN8A 5K4JA 2ERZE 2R3OA 3MPAA 1YHSA 2ZDUA 3DBQA 3Q04A 3DTCA 3QQUA 3RCJA 3SW7A 4WOVA 3TNIA 4ACGA 5CYIA 2NP8A 4IZ5A 4EZ7A 4ZZMA 3MB6A 4IVCA 3BU5A 2F2UA 2R3JA 2VZ6A 3GC0A 3G9LX 3W18A 3ZSGA 2PHKA 4LV8A 4CZUA 3UO6A 4V04A 2YA9A 3EQHA 3IG7A 3QXPA 4BDKA 1FGKA 2BCJA 4JQEA 2GNHA 4HPTE 4IW0A 2QOIA 2X1NA 4GJ2A 3C0HA 4OLIA 3PTGA 5F94A 4W8DA 4YSMA 3EN7A 1Q62A 2OGVA 2E9NA 4KBAA 2W96B 2BZHB 4AZFA 2XKCA 4FGBA 3KXHA 2RKUA 5LVNA 5CT7A 2VNWA 2E9VA 3TNQB 5EFQA 4YPDA 4FV3A 2F2CB 4CTBA 4TYIA 2GQRA 2GHGA 4RJ7A 3ORNA 4OUCA 3C50A 3SOCA 2YCFA 3LW0A 2UW7A 2G01A 4WNMA 3H3CA 5AWMA 5I3RA 1BKXA 5CSWA 4C0TA 5AMNA 4FSZA 3TTIA 2ITQA 5E8VA 4CVAA 4B8LA 5FG8A 1BUHA 3AC2A 5LVPA 3O71A 2C6MA 4E6DA 4RX9A 3NVKI 3DAEA 3HUBA 2BMCA 3IK3A 3ZFYA 4BDIA 4CLIA 4FUYA 1IA8A 3AC8A 4G3EA 3UZTA 2ZOQA 2UZTA 5JMSA 3WARA 3OWKA 1VZOA 5FP6A 3A7HA 2FVDA 3GVUA 3NDMA 4AAAA 4P4CA 4MF1A 4IVBA 5T6KA 2PE2A 2UZOA 4FICA 2G2HA 5LMKA 1P4OA 3VHEA 2VGPA 3DKCA 2O3PA 3FMKA 3QLGA 3OXTA 1RQQA 3VS0A 3W8LA 4O7SA 3UGCA 2DQ7X 3DCVA 4R6VA 4B0GA 2DYLA 3G2FA 4MWHA 3TZMA 3W33A 5A54A 3FMJA 2WTWA 3EQBA 4Z7GA 1Y57A 2PY3A 4XV3A 1B38A 2XNEA 4P5QA 5K0XA 2WO6A 3E93A 4XG3A 5IA1A 5CLPA 3HV6A 3NLBA 3O50A 3BU6A 4APPA 4QPAA 3OBGA 1YXSA 2H8HA 2Y4IB 2OXDA 2YDKA 4H3BA 4V01A 3ZC5A 4RFZA 2QG7A 4W9XA 3V51A 2XH5A 5AAGA 2W4JA 5C01A 3OOGA 1YXTA 4NKAA 5CWZA 3VJOA 2X2LA 3CKXA 4EQCA 3MTLA 2VTAA 3NGAA 4GFOA 3OWLA 5L2SA 4C3FA 5IQEA 5IDNA 1IRKA 3W55A 4ZS0A 5TR6A 2IW9A 2C0IA 4PNIA 4QMMA 2FB8A 2QNJA 1OGUA 3SDJA 3KRJA 2CNUA 5DG5A 1CM8A 3QQJA 4FT7A 3HV3A 2GNLA 3ZRKA 2G2IA 3DV3A 1UVRA 2VWVA 4ZSJA 2BR1A 1OM1A 5LQFA 3I79A 3TZ8A 2WHBA 4RIXB 2UW0A 1MQ4A 1LUFA 3L8VA 4MHAA 2IN6A 4MTAA 3ODYX 2W1EA 2XBAA 2C6EA 4M97A 4N0SA 4X3FC 5HLNA 4JBOA 4I0TA 4FYOA 3RM6A 5TKDA 2B54A 5H8GA 2OIDA 3A4PA 3EB0A 4EUUA 4DFBA 3Q9XA 3FEGA 4NFMA 3G0FA 1J1CA 2VX0A 4IAYA 2PVMA 3ANRA 3C51A 5DT4A 4H1JA 2HOGA 3QHRA 4KS8A 5ANIA 5L2IA 5IA3A 4DEAA 4CFXA 5CF6A 3CY3A 4I92A 4MKCA 4O91A 1JKTA 3D83A 4U3YA 3MBLA 5ICPA 4F9BA 3FSFA 5AUYA 5AUXA 2W1FA 4HCTA 4FV9A 4EZ5A 4BKZA 5JN2A 1G8SA 2CGUA 3R2YA 4FSUA 4JRNA 4BHNA 2PZIA 4FK3A 3BYMA 3NYOA 1Y6BA 3ITZA 3DFCB 2XMYA 3ZXTA 2EXEA 2YERA 2VWZA 3UVQA 4FTKA 4FBXA 4PMPA 2PWLA 2RG5A 5EDPA 3QU0A 3TNWA 1B6CB 4FIIA 4QMLA 4XOZA 3ZRLA 2R64A 3O8UA 4YC8A 5DRDA 1H0VA 5D1JA 4EWQA 4IE9A 5EKOA 2NNWB 2XB7A 1Q3WA 2UW9A 4O38A 3LFDA 2BFXA 3BLRA 2W06A 3PPZA 5AIKA 5HKMA 1YI3A 4EC8A 4NTTA 1JNKA 5IISA 5CU2A 3MWUA 3UO5A 3PA3A 4RFMA 1A06A 2W1HA 4FZ7A 2JITA 2RG6A 4Q9SA 2VX1A 3ORIA 2VX3A 3BHUA 2R4BA 4G34A 2VWWA 4Y72A 2YM6A 1MUOA 2PMOX 3JPVA 5BVDA 3OBJA 3LFNA 1OL5A 3Q5ZA 4GMYA 3MPTA 4BI0A 3A99A 3L8XA 4L68A 3SRVB 2V62A 4CV8A 3U87A 5KHXA 3O17A 2BKKA 4C37A 1JAMA 5AUVA 5HZNA 3LMHA 3L9NA 2YM7A 5L2TA 2OF2A 2YCRA 3JR1A 2UW5A 4C3PA 3LMIA 4EOIA 3DK7A 3FHIA 5E8UA 3F88A 4G6OA 2YM8A 4ZIMA 1BI8A 3DB6A 2LAVA 5HE1A 4UB7A 5CEIA 4ACHA 2JLDA 3I1AA 3CQUA 3QQHA 3WF9A 4YPSA 4M68A 2XVDA 3K3IA 3LMGA 4WIHA 5IEXA 2WXVA 4AOTA 4FL2A 3KK9A 5E92A 4E1ZA 3UIUA 4N4SA 5IH4A 2YJSA 4JI9A 3TIZA 5DOSA 3SOAA 4DGLC 1ZRZA 5DA3A 4BDJA 1REKA 2ZV8A 3EFLA 3ZMMA 3UG2A 3C4CA 5IKWA 3VIDA 1ZYJA 4L53A 3FI2A 3HL7A 5EW9A 4FEWA 3ZO1A 4G6LA 2WMTA 4ZK5A 4AN2A 3RK5A 2XNGA 2ZB1A 2WGJA 2YFXA 3GU4A 3IW5A 3CGFA 3LQ8A 3VUHA 2C3IB 1T45A 2C69A 2NRUA 3CPCA 4G17A 3BHTA 4Y5QA 4ZY6A 3Q4ZA 3TNHA 1UV5A 1KOAA 3DDQA 3HMMA 2OU7A 3PIZA 5CI6A 4MVFA 3VS3A 5J87A 3O51A 1OZ1A 4RWJA 4R1YA 1OKVA 4YP8A 4F6WA 4YO4A 1Y91A 4MF0A 5M4IA 1OPJA 3UQCA 1YWNA 3Q53A 4WBOA 5H2UA 3Q9WA 4FF8A 3BU3A 3MH2A 2WIHA 3EZRA 4IMYA 4D4VA 4F1OA 4Y73A 3DLSA 4GL9A 2QOKA 4QRCA 3B2WA 2CLQA 4QQJA 5AIRA 3S2PA 3K3JA 1Q99A 3TUBA 5EG3A 3COIA 5BYYA 4EH7A 4ERKA 4C4HA 5B2LA 2GQGA 3MVLA 5HX6A 3ROCA 2V7AA 3H0ZA 3UDBA 1U54B 3FXZA 3NW6A 4GT3A 3VW8A 5D11A 5AV4A 5J9LA 4FT3A 4BR3A 3U54A 3N4UA 3R71A 3L1SA 2BRBA 2XJ2A 2WB8A 1PJKA 3DKOA 3NNXA 3QAME 3SG9A 1Q4LA 2GNGA 4R8QA 2BKZA 3QD4A 3A7GA 3RVGA 4R3CA 4BWKA 3FKOA 4I94A 4HPUE 3UIXA 2RFNA 2ITYA 2XF0A 3W2CA 4MD8E 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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