3OBGA

Conformational plasticity of p38 map kinase dfg mutants in response to inhibitor binding
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
348
structure length
332
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDGGLATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG motif mutants in response to inhibitor binding
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 94
structure length 332
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3obgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3obgA01
2J2IB 1WBSA 4YC8A 2Z7RA 3ORIA 5CSXA 5AP0A 2BTRA 4JVGA 4L7FA 4BCMA 4BTKA 5DGZA 3QGWA 4G17A 1BKXA 1ZYDA 3CLYA 4FEUA 5HLPA 3IPHA 4J71A 3IO7A 3WYXA 5HG9A 3UO6A 2O8YA 3F69A 4YNEA 4CKJA 2OLCA 2V7OA 4XV9A 4C2WA 2XCKA 5DHJA 4ANBA 2RSVA 3Q6WA 3DOGA 4MBLA 5ETCA 3N4VA 3CD8A 4AGDA 2YITA 1GOLA 3C9WA 3MH1A 3PPJA 4DGNA 2X6DA 4GU9A 4JBOA 2WPAA 3S3IA 4M12A 2ZM4A 2XRWA 4IZYA 5DI1A 1GZ8A 1Z9XA 2YDKA 4BBMA 4O0UA 2VTMA 4QQJA 3D2IA 2GS7A 5L2QA 3LKMA 1XBAA 2R3RA 4ZS4A 4KIQA 3BWFA 4O81A 2JAVA 1SYKA 4TWCA 4ONAA 1UNHA 5HX6A 3HLLA 4KWPA 2WMXA 3E87A 4C2VA 3VS3A 3SAYA 5ETFA 3V8SA 4E20A 1JKLA 2OFVA 1GZOA 2VO3A 4FKLA 4MVFA 1KE6A 5KZ0A 1RW8A 2VU3A 3PIYA 4OBOA 3U9CA 3GQIA 4BN1A 4E26A 1NY3A 3C4CA 5A46A 4D2SA 3LCOA 1BL6A 4GL9A 4EH3A 3COKA 4TZRA 5KX8A 5L6PA 3LLAA 3WI6A 3U87A 4GH2A 3HP5A 2F2CB 2O63A 4TKSA 4XV3A 4U97A 4XOYA 5C26A 4R7IA 4Q5EA 4UXQA 2W5HA 3W55A 2OJ9A 4J96A 3FC2A 1REJA 2ITTA 4L53A 3EFKA 4PPBA 4BZNA 4P5QA 4M97A 5AA9A 4O7ZA 4GT4A 4X2JA 4PV0A 3ACKA 4BZOA 4I5PA 3W32A 2LGCA 4TYGA 5L2SA 2HZNA 2PHKA 1GY3A 1U5QA 5EM8A 4DGOA 4QNAA 3E93A 4I4EA 3PE1A 3WBLA 4JJRA 2BHEA 2R9SA 2GNFA 4Y5HA 5CANA 3TKHA 3IOPA 2A19B 3VBVA 4ANQA 3QQLA 3DAKA 2O65A 2VTPA 3QTWA 4MNFA 4YLKA 3TZ9A 4RT7A 4FOCA 2Z8CA 4ZJJA 2OF2A 4BDFA 4AW0A 4RLKA 3PUPA 1YDRE 2J5FA 2ESMA 5HCYA 1WVXA 4C4IA 4EQUA 4QMSA 5J7BA 3NUYA 3TNQB 4UWCA 4FTJA 4QMMA 1CKJA 2JKOA 1YQJA 3ALOA 4PMTA 4I3ZA 5CNOA 4EK6A 1L3RE 3Q9YA 1MUOA 2J50A 1VYZA 3DQWA 4FVRA 4FK3A 4BIBA 3H30A 1NT2A 3NUPA 1H07A 2NRYA 2Y4IB 4FTOA 4DE4A 2PVNA 2VD5A 5FXSA 4KBAA 3TI1A 4OBPA 3BE2A 3R7UA 3KK8A 1WBTA 5E8XA 3I1AA 4FT5A 3ROCA 2ITNA 3LFEA 4FG8A 3DKCA 4HZRA 3BI6A 4U8ZA 3ZRKA 3QYWA 4EHZA 3UNKA 1V0PA 1CKIA 4CKRA 4WG5A 2YM4A 5EQPA 4AW2A 1XBBA 4X7QA 4LUDA 5C4KA 4ALWA 4BIDA 5KKRB 3DJ7A 5CQWA 1W82A 4IAYA 5CAVA 2CJMA 3NIEA 4AA4A 5HG8A 5D1JA 4FTAA 3T9IA 4IANA 2X4ZA 3FLYA 4UZHA 5A14A 1P4OA 4TYIA 5AR7A 1LEWA 2PVMA 2WOUA 2RIOA 3RJCA 4FV5A 3V6RA 1M52A 3OBJA 4AN3A 3AD4A 3NPCA 1ZZ2A 3V5QA 3EYGA 5KMIA 2I7QA 2ITZA 5HX8A 4KA3A 2WHBA 3TZ8A 1M2RA 4PL5A 4AGWA 3O2MA 3TNPC 3IG7A 4TYJA 2PYWA 5H8BA 4MQ1A 5CAOA 2XRUA 3LFFA 5CAPA 4QP4A 3UQFA 4WG3A 2YERA 3R1SA 4FT3A 5I0BA 4O7YA 1YHWA 3V5WA 1XBCA 1UWJA 2BHHA 2Y6MA 3QCYA 4G9RA 5I9XA 2VO0A 1KV1A 1PXKA 1R3CA 4ZIMA 4UALA 4G5PA 4LFIA 4OTQA 2PVKA 5EM7A 2YDJA 4IB5A 3D15A 5BYZA 4DH7A 4PNIA 3LQ3A 4FKVA 4Z55A 1TQMA 2QO9A 1YOJA 4GK2A 4DFLA 1TVOA 2ETKA 3OXZA 4O2PA 3DFAA 3E92A 2J0LA 4EOMA 4RFZA 4OTHA 3EHAA 5K0KA 3KRRA 3E5AA 3F5GA 3TG1A 1UVRA 3C51A 3K2LA 1JSVA 5AADA 5IEXA 3V3VA 5AV0A 4O7NA 3SGCA 4CYIA 2C6OA 3DKFA 4FEVA 2WB8A 1O6LA 1VR2A 4WBBB 5DWRA 4DAWA 5JZJA 4XG2A 3IK3A 5M4IA 4JT3A 3W2CA 2BKKA 3VQUA 2QLUA 3LJ2A 2HELA 3L8PA 4JQ7A 4KKHA 3V5JA 4BDJA 4BDCA 2R7IA 4DTBA 4L68A 3H0ZA 2VUWA 2XIRA 4X3FC 3P0MA 2XNMA 4IC7A 3HP2A 4FIGA 4Y85A 3BZ3A 4YJVA 3R83A 5HO7A 4H3PA 4QMOA 2YAAA 1K9AA 1M7NA 3VN9A 4EJNA 4ANMA 3PJCA 3NYXA 3MA6A 5AP5A 5EKOA 4WNMA 3ULIA 4XH6A 2DUVA 4TXCA 5DH3A 4FOBA 5CNNA 1WBWA 3MW1A 4EOQA 4HOKA 2ZDTA 3TIYA 2R3LA 2RFSA 2VWBA 1YWNA 3E7VA 4HNFA 1FOTA 4BI0A 4OTIA 1BUHA 5E4HA 4G3FA 2J90A 4J98A 4XLIA 4D1SA 4AGUA 3L8VA 3QA0A 1I44A 4CQEA 1QPDA 4LOPA 1PY5A 4GYGA 4YSMA 4BDBA 4KIKA 2J0JA 4APPA 1PW2A 5HD4A 2XM8A 2OIQA 1PXMA 4DEHA 2XK8A 4UMPA 4NZWB 3VVHA 4BTFA 3MFSA 1YXVA 4F99A 3LOKA 4TL0A 1OL2A 4FTNA 4FZ6A 3VS6A 4RIYA 4Y72A 3W8QA 4GMYA 3FLQA 3M11A 1W0XC 3QTXA 4YZBA 4F64A 5FD2A 3KMMA 4J8NA 4RJ5A 3C0GA 2JD5A 3DV3A 4F9WA 3PIXA 1Y6BA 1UV5A 2OBJA 2EVAA 2NO3A 3BEGA 3LCKA 3R01A 1SVGA 3NS9A 3BU6A 4RIWB 4UB7A 3MA3A 3R1YA 5C01A 4QMUA 5DRBA 4A06A 4BI2A 4EK3A 4ZLOA 2UZDA 2R3MA 3PSBA 4MNEB 1Q8UA 2DS1A 4FSZA 3HEGA 2YEXA 3O23A 3V51A 4QMPA 4HGLA 3ORPA 4PUZA 3EL7A 1IAHA 2GPHA 3G90X 2YM5A 4NW6A 3Q04A 4R5YA 5I9UA 4DC2A 4LG4A 4QMZA 5DBXA 4C8BA 2UW3A 5F95A 4MD8E 1U59A 2E9VA 3AT3A 4QTBA 5ETIA 5CAQA 4TWNA 2QD9A 3R7YA 2CNQA 1XJDA 3FZRA 2XKFA 4YPSA 4FEQA 5CVHA 4BFMA 3IDBA 1M14A 4WNOA 3Q2JA 3MFRA 2UZVA 2YCQA 4DINA 3A8WA 3TCPA 5IMEA 4MX9A 4BHNA 2IW6A 3QZGA 3EQHA 2HIWA 3CSVA 4C4EA 4CT1A 5AM6A 3FLSA 5E8TA 2IZRA 5AUTA 5AIKA 3C5UA 2WEVA 3QRTA 3Q4UA 5IEYA 4WSQA 4B4LA 5BVKA 5FEQA 3EN6A 3PY0A 4GUEA 3NLBA 2R3HA 2YN8A 3CQWA 3DS6A 3FL5A 3C4EA 2CCHA 3HECA 3LW0A 1DI9A 4DH8A 5BVNA 4MD9E 3CD3A 3WZJA 4ERWA 2HZ0A 2QHMA 3UTOA 3OMVA 4HYUA 4KKGA 3GCQA 4WOVA 3ZC5A 2IVSA 4BWXA 4RX5A 4JR3A 1WBNA 3IW8A 3TZ7A 1LP4A 1O6KA 4LI5A 2W1CA 4ORKA 3KFAA 1H4LA 3EN5A 3P5KA 4V0GA 4YZMA 4EZ7A 5JKGA 3RBWA 2CDZA 4O21A 3DNEA 3NX8A 4BGGA 3QD3A 1OPLA 3GB2A 1KV2A 4ZS0A 3FL4A 5C8NA 3QTQA 1Q61A 1QMZA 2VTLA 4IWPA 5BPYA 3S0OA 3P78A 4E5WA 3LVPA 4O22A 3HMNA 4BBEA 3TJDA 3BRBA 5A4EA 4NT4A 2QI8A 2J7TA 3M1SA 1OMWA 2P0CA 4NWMA 3RCJA 2XNBA 3QZIA 3R7IA 3QZFA 4CSVA 5DEWA 4JLCA 4E3CA 2ACXA 5HHWA 1LPUA 1W84A 5IZFA 5JRSA 3SG9A 1G5SA 3OWLA 3GU4A 1PXJA 2YWPA 3CPCA 4H3BA 1NVQA 1TQIA 4JDJA 4ANOA 2R0IA 3QD0A 1H1WA 4UMUA 1JSTA 3OD6X 4O0SA 2PMLX 4RQKA 4ZK5A 3MPAA 2Q83A 2WGJA 4K33A 4BGHA 5AV3A 2C6IA 4L67A 2JDTA 4H39A 2X7GA 4GV1A 2YIRA 1ZYJA 1SVHA 4O83A 2PZRA 5IKWA 2BAQA 2J0MB 4E7WA 3U51A 3FI3A 4X3FB 4PMMA 5CU6A 3ETAA 5HE3A 4EBWA 3QFVA 1FBNA 3ZMMA 2H34A 5C03A 5KHXA 3ZSGA 3DAJA 3K5VA 2IWIA 5KMNA 1BLXA 4QT1A 3LFBA 4KS7A 3ZDUA 2WTIA 3R73A 4I23A 3A7FA 4G3GA 4CYJA 4EKLA 4F1TA 5A6OA 4XBRA 4BDAA 4ZTHA 4RFYA 3RMFA 1P5EA 3BKBA 4JS8A 1J1BA 4RX7A 5BVDA 1SZMA 4O1OA 3OW3A 4QOXA 3OWJA 4MBJA 4FKTA 4CMUA 1CTPE 2HOGA 4O38A 3UODA 2OH4A 1H1SA 5EK7A 5AR5A 3SOAA 4HVSA 4U81A 2GTNA 3F82A 1UU8A 3LJ0A 2VTIA 3EN9A 2ZYBA 5M4FA 3CJGA 3VULA 5T3QA 5JZNA 4GKHA 1KE8A 2QOQA 2VWWA 2OJFE 3FZTA 3OCTA 1EH4A 2C1BA 4IFGA 3RM6A 5M57A 3EYHA 4GKIA 4YJTA 2WIPA 3RTPA 1YOLA 4AX8A 5CF6A 3UVPA 1R1WA 3IW6A 2VWVA 2W9FB 4MKCA 4ZLYA 3COMA 3HAVA 1ZMWA 2YISA 4EYJA 5H8GA 2BR1A 1FPUA 3Q9ZA 4CFXA 3QRUA 3FQEA 3SW4A 4B7TA 4QTEA 2WXVA 2OZAA 4K9YA 4V05A 2YABA 4RA4A 2YLFA 4MYGA 3F2NA 3QCQA 5IQGA 1QL6A 1YKRA 3MJ2A 5JQ5A 3BX5A 1PXOA 2C5YA 3CC6A 3GCSA 3BV2A 4FKUA 3OFMA 4HGTA 4MXYA 5E8YA 3R9OA 3HRBA 3OUNB 4F9BA 1XH9A 3CCNA 2ITUA 4EH8A 5LWNA 1A48A 2HW7A 3DBEA 3DAEA 3HKOA 5EYCA 1CDKA 5LVLA 1VEBA 1F0QA 4HVIA 5IH6A 5HE0A 3LFQA 3MESA 3Q9WA 4ZMFA 5BNJA 3VNTA 4F0IA 2Q0NA 2JBPA 3AC1A 3EZVA 4MEDA 3WE8A 4PP7A 2ZMCA 5E91A 4HVHA 5M56A 4F1MA 2YWVA 1OPKA 1Q3WA 2Z60A 4E5AX 3QX4A 4O6LA 4YHFA 4JRNA 3D7TA 5AP6A 2G9XA 3VUKA 4S33A 4AT3A 1Q24A 2PMIA 4WUAA 2BUJA 4W8EA 4PX6A 3KN6A 3KU2A 3OTVA 4M7IA 2IW8A 2UW6A 3PJ1A 4D0WA 3DTWA 3D5UA 2V5QA 4MCVA 5DT0A 4YBJA 4JXFA 4ZSJA 4OBQA 2OJIA 2UVZA 5HIEA 3DPKA 3RPVA 3O51A 3R9DA 4EOSA 3NDMA 4RWIA 3K5UA 5KNJA 3QF9A 4M69B 4CGAA 3O50A 4NJ3A 1W83A 5CU0A 2WD1A 3GOPA 3ZTXA 4CFWA 5L2WA 2VV9A 4I41A 4FZ7A 2QG5A 5I5ZA 4DFYA 2XBJA 5F1ZA 4AOJA 2B9FA 3EFWA 3VAPA 4EORA 2FB8A 3S2PA 3S4QA 4EZ3A 3G33A 3QQHA 1H27A 3PVWA 4X3FA 1YW2A 4CMOA 4M68A 5EQEA 1Y8YA 2RG5A 2QG7A 2F7XE 2WTWA 3VHKA 2WTKC 1OKYA 3MPMA 2R3NA 1KSWA 3GXLA 3QKKA 3RINA 4XOZA 4WBOA 4FKRA 1BI8A 4JR7A 1JPAA 4BICA 2BILB 4Y73A 4HCUA 4PMSA 2X0GA 3F7ZA 3OWKA 4J99A 4RC2A 3EKKA 3LXKA 4AZWA 5E8UA 3GCPA 5JFXA 4C4FA 4QP8A 2PU8A 5FM3A 3F5PA 2V55A 4YMJA 3C5IA 4EL9A 3RAIA 5I9ZA 4J53A 2JDSA 5I3RA 3UP2A 3UQCA 2XP2A 3FPMA 4KS8A 5LVPA 4KIOA 4TY1A 4LRJA 4FSTA 4OAUC 3A2CA 5IDNA 3FI2A 4LUEA 3E63A 2HZIA 5FTOA 3I6WA 4UWBA 3VRYA 4JDIA 2AC3A 3TT0A 4J1RA 4D9TA 2XK7A 3QWJA 3VBWA 5M53A 3UQGA 3R2BA 4RQVA 4AG8A 5M09A 3NUXA 3QKLA 3GOKA 4TT7A 2X6EA 4AZSA 3LCTA 1JSUA 3EQPA 3ORMA 1JAMA 4XRJA 4DGMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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