3OEFX

Crystal structure of y323f inactive mutant of p38alpha map kinase
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
348
structure length
334
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARTRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPFDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Active mutants of the TCR-mediated p38alpha alternative activation site show changes in the phosphorylation lip and DEF site formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 110
structure length 334
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oefX02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oefX01
2YAKA 4AT4A 4YU2A 3NSZA 4IM0A 4I92A 3U9CA 3WF5A 4DFNA 5HNBA 2IVTA 5EM5A 2I7QA 4GKHA 3NVKI 1DI9A 5CT0A 4Y73A 3SRVA 3MDYA 2WOUA 4FTMA 2PZ5A 3DZOA 1H07A 4I93A 3UC4A 4Z7GA 5HCXA 1JSTA 3WYXA 3FLWA 5C8MA 1DAWA 4RIWB 3CJGA 1IG1A 2CNQA 2GHLA 4AT5A 4L67A 4FICA 2OJ9A 4GMYA 1ZMWA 4BKYA 4PDYA 4K9YA 2BTSA 2YJSA 1YI3A 3WE8A 5K0KA 3FY2A 4FKRA 5LMAA 2PY3A 2WZJA 5FP5A 2C3KA 3GCUA 3HL7A 5HD7A 3NUNA 4UX9A 2UZLA 4X2JA 5HE0A 1BX6A 3LZBA 3PPJA 4FG9A 4NTSA 3PFQA 5HKMA 4AA4A 3ZZWA 4D58A 5CEOA 4NFNA 1Q3WA 4QMOA 5D10A 5EG3A 3W18A 4F08A 3UODA 1H1WA 2C6KA 4UEUA 3DA6A 3PP1A 5FEDA 4PX6A 4YTHA 3IW7A 3TV4A 2X7GA 3DNEA 1Q4LA 1R1WA 3NNXA 4FG7A 4ZTHA 3ANQA 3NIEA 4QP9A 4XRJA 4DA5A 1KWPA 4USEA 4K0YA 1BL7A 3DQWA 3NIZA 3C4EA 3FJQE 5JK3A 2XK9A 3KA0A 4D9UA 2C3LA 3ITZA 4FKVA 4GT3A 4FV8A 4MXZA 3ZYAA 3PXKA 4M0ZA 3QA0A 2GS2A 5KNJA 2XM8A 3HVCA 3A7GA 3GU8A 2J51A 3OEFX 3R02A 4UXQA 4XS2A 5E1SA 3RNIA 4KRCA 4D4RA 2QU6A 3MFTA 2UW7A 4F7JA 3ZLWA 5FXQA 4LMUA 3P7AA 4QQ5A 3PY0A 3TTIA 4TT7A 4O0RA 4L68A 5C8NA 3QXOA 4AACA 1MQBA 1XQZA 3IOPA 4FIJA 3MVHA 4FTTA 5AR2A 1O6KA 3IOKA 3JVSA 3BYMA 3JYAA 3M11A 3FHIA 3PSDA 2HOGA 2VWYA 4RVMA 3VF8A 3BE9A 5CEPA 4G1WA 4QP2A 1KUTA 4E4LA 1PF8A 3BYOA 3AMYA 5IEVA 4MEDA 3QRUA 5A3XA 4ANMA 5KMMA 3GU4A 3QUPA 5D11A 4TYGA 5FM3A 5L8LA 1REKA 3MY1A 3U6HA 2B54A 3EN5A 2OZAB 2PVMA 3K5UA 4F70A 4K8AA 4S34A 1XH6A 2ZM4A 3OWJA 1M7NA 4I3ZA 4XUFA 4D2SA 4EOKA 1PXPA 5DVRA 2WMSA 4ALWA 5HBEA 2ITUA 4F4PA 1AQ1A 4B0GA 4CGAA 4AG8A 5EYDA 3FLSA 4QQCA 5FEEA 3IW8A 3ZSHA 3UIMA 3VUMA 1BUHA 5E8XA 2W05A 4CZTA 4QP6A 3EFJA 3WOWA 1WVYA 3A7IA 1OPLA 4GIHA 3HA6A 5EKOA 3NNWA 3RNYA 2BRGA 4H58A 2VD5A 4NW5A 1P5EA 4NEUA 4UMQA 4IFCA 3VW6A 4B8LA 4FTQA 4RFMA 2PVFA 2PVJA 3BBWA 2G2FA 4OTPA 4X7QA 5ETIA 1YXUA 1WVXA 2A0CX 4LL0A 4ZZNA 2G1TA 4X21A 2GNGA 3GXLA 3PA5A 3LCTA 4USFA 2IZTA 3QTQA 4QTCA 4CFFA 2RFNA 1VYWA 4BGQA 4I23A 1RQQA 2X8IA 4BCJA 2X4ZA 3KRWA 4DHFA 4O22A 5IDPA 5AUXA 5E8VA 3F2RA 4CEGA 3IGGA 2O5KA 2X39A 3KC3A 3LMGA 3BU3A 2XBAA 3CP9A 4XLVA 4R77A 5EK7A 4ASXA 3E62A 3I6WA 3DCVA 3Q4TA 2ITXA 1XH8A 5GJGA 3VULA 5L2IA 1UNGA 2Z02A 3TI1A 4F0GA 2J2IB 3K5VA 2HZ4A 3QGWA 2WIPA 5K9IA 2PZIA 4IZYA 2IVSA 3P9JA 4GIIA 3WF7A 4G3FA 3VUHA 5BQ0A 2GMXA 2ZV2A 3R1SA 5AWMA 4F65A 4HVIA 3NCZA 4ZS4A 5M4CA 5HO6A 1UNLA 1FQ1B 3UG1A 4AZEA 2OZAA 1PHKA 4AGUA 3R8VA 4BDIA 1H4LA 4R5SA 4UMPA 4Z9LA 2YACA 5FLFA 4QYFA 3CJFA 2IW6A 1Q8WA 3VHEA 4YHTA 5HNGA 3D7ZA 3DJ6A 4CFVA 4OAUC 3SXFA 2YZLA 4CNHA 4FKOA 1OB3A 1J91A 5LMKC 2VTNA 4JQ8A 3K2LA 3ZTXA 4CG9A 3TACA 3ZH8A 2YDIA 4DG0E 5A4LA 3MFUA 4O7VA 1TQIA 2B9FA 2CHLA 2YIQA 5KMKA 1G8SA 1BKXA 4LGHA 2FO0A 1E1VA 2VWBA 4RA5A 1PMUA 4DEDA 4F6UA 3HAVA 4J8MA 5AP2A 4BIEA 3PA3A 3KK8A 4LFIA 3SGCA 4EYJA 4QTBA 4TN6A 3CC6A 4PMTA 5ETCA 1FVTA 1O6LA 3LCOA 2XZSA 3FSKA 4EYMA 3MJ2A 3PG3A 4QP1A 1DI8A 4W8EA 4JG8A 3CGFA 5AUYA 4BTKA 3U4WA 2PUUA 2V55A 3D5UA 4OUCA 4AGDA 5D12A 2LAVA 5CTPA 5BVDA 5AUZA 4ID7A 4JS8A 3MH2A 4U0IA 4PUZA 4AOIA 4BDCA 3DLSA 3ENHA 3RMFA 4ANQA 2XK6A 3JUHA 3PZEA 1J7LA 3II5A 2J0JA 3FZSA 3CIKA 4JBVA 3D5WA 5BVKA 5JRQA 2UZEA 4IC7A 3SXSA 4A9RA 3UNJA 4A7CA 3QCYA 4O91A 3QQUA 3E8EA 3VIDA 1NA7A 3OBJA 1GNGA 3F3TA 3CLYA 3OXZA 4AW1A 5EW8A 4D2RA 2O64A 3AC5A 5IA0A 3FLNC 2JIVA 2YIRA 4EOLA 4JJRA 4E5WA 3C13A 3PPKA 2OH4A 4EL9A 3QF9A 4L42A 4CKIA 4L43A 1XWSA 1XBBA 3M42A 1YDRE 4FIFA 2ZDTA 4YR8A 5HZNA 3KN6A 5KX8A 5L2SA 3HMMA 3IO7A 3VS7A 4AA5A 2I0VA 3QUEA 4L00A 3UOKA 4FSUA 4N4SA 4AN9A 4YJUA 1E1XA 4NJDA 3KU2A 5FD2A 2BILB 4S2ZA 3PPZA 5KO1A 1U46A 5CSVA 5BUIA 5FTGA 4CFWA 4L7SA 1TKIA 3ZEWA 1URCA 4YBJA 2B55A 4O0WA 2YCQA 4ZAUA 4MVFA 2OFUA 5L3AA 4X2KA 3MTFA 4KBAA 3OC1A 4U6RA 4FR4A 3DS6A 4EKKA 2OG8A 2V0DA 4PPCA 1PYXA 3KCKA 4FSTA 4FVPA 4JQEA 4WD5A 1M7QA 4DGNA 4AW2A 4NWMA 5EFQA 2FA2A 2JD5A 3UVRA 2UZUE 4EKLA 5CU0A 3SVVA 1F5QA 1Q8YA 3D0EA 3NPCA 1PXKA 2JIIA 3FMMA 5I9WA 2W1EA 2J4ZA 3CKXA 5LVNA 1PRYA 3PXZA 3VS3A 5L6OA 4IIRA 4D1SA 4AZSA 2R3FA 3DK6A 3PIZA 3MA3A 2QVSE 3BX5A 5DWRA 4FC0A 1CTPE 3AQVA 3BLHA 4MQ1A 5IA2A 3F3VA 3FLQA 3KXNA 1A06A 2PZYA 1OIQA 3EB0A 3QCSA 4NFMA 5FDXA 4BGGA 1JWHA 4IB0A 3ZLYA 3TG1A 5CF8A 1PY5A 4R3CA 1KOBA 5HE2A 2IO6A 2W1HA 4S33A 4IACA 4O0XA 4L9IA 4FKUA 4JRNA 3TZ7A 3WIGA 4ZZMA 5KZIA 2XBJA 4O6EA 5F20A 5D9HA 3R30A 3UOJA 4DEHA 2XMYA 4X2GA 2AUHA 4K2RA 2FH9A 4DC2A 5CF5A 1I09A 4BCHA 2DQ7X 3PJ2A 3QTZA 4EH8A 2X2LA 2PMIA 3G9NA 5HLWA 2UVZA 5AUWA 3ATTA 3RAHA 4O0YA 4J97A 4GEOA 2WO6A 4F09A 2F2CB 1XBAA 4D2PA 4FTIA 3FQEA 3OCSA 5IQFA 3H9RA 3RAIA 1P2AA 2PE1A 1WZYA 4LOQA 2XEZA 4M7IA 2BZIB 4N6ZA 4U3YA 3QTXA 2B9HA 3BYUA 3EWHA 2CCHA 1YQJA 5KCVA 1YVJA 4FKTA 4J52A 3ZC5A 1SM2A 5C1QB 4C8BA 3FZOA 3M1SA 3TNIA 4BWXA 4PMSA 4RSSA 5AIRA 2C30A 4EH5A 2REIA 4WT6A 5EHOA 3Q3BA 4BF2A 4GH2A 4ACDA 1OKVA 2SRCA 2W99B 3OWKA 2UV2A 1H00A 4CCBA 3QC4A 4HGTA 5HG7A 4A07A 4EH7A 5GZ9A 3VQUA 2WEVA 3DXPA 2ESMA 2CLXA 5CQWA 4RGJA 4CV9A 2X9EA 5CLPA 4BI0A 5L6WL 3WE4A 4C38A 2ACXA 2R3MA 3LLTA 1IA9A 4IB5A 4BDHA 3ZO4A 2WXVA 2UVXA 3UIBA 5EM8A 4ALUA 4F6SA 2CKOA 5E1EA 4O38A 3PVBA 2ZOQA 3DBFA 2XKEA 4GVAA 4UXLA 5K3YA 5KZ0A 4R78A 1CM8A 4RLKA 4BVUA 2J5FA 4HVDA 1ZMVA 5M4FA 2R3HA 1P14A 5CENA 3UC3A 2BAKA 2FSMX 4U80A 3PRFA 2GPHA 5CNOA 4KS7A 4QQJA 4E26A 4TXCA 3MN3A 4F99A 1CMKE 1YDSE 5FEQA 2EUFB 1WFCA 3R9OA 4MXCA 4BR3A 2X8DA 3DQXA 4JAIA 3QRKA 1JQHA 4TWPA 5HIDA 4DLJA 3OBGA 3DBCA 4QMMA 3OROA 1QPCA 2R3NA 4I5PA 3UBDA 4EH4A 4IH8A 5M51A 2F7ZE 2DWBA 4IAFA 3ZONA 4LRJA 2UZWE 3SOCA 3KXZA 2Y6MA 4O81A 4FA2A 2YN8A 2BVAA 2C47A 2C0TA 3BHVA 4YJPA 3F61A 5ITAA 3GQLA 2CNVA 3P79A 3ZS5A 3DAEA 1SVEA 1W82A 2JLDA 3HKOA 2JAMA 1YI6A 2Y4IB 2Y4PA 4FV7A 5EQYA 1ZRZA 3DBDA 1OZ1A 3GGFA 1IR3A 4GFOA 4H3BA 5ANDA 5FM2A 3RAWA 2E9NA 2RF9A 2OSCA 4GK3A 5ANJA 3ZC6A 2XCHA 3EN4A 2OLCA 2XRUA 4R3PA 4KKEA 5CAOA 4NYEA 3I5ZA 3E3BX 1ZY5A 1AGWA 2OZOA 3LXNA 2CCIA 4RJ7A 3ZXTA 4HVHA 3G6HA 5FGKA 4FTRA 1H27A 4DH7A 2PVNA 2BAJA 4JR3A 4OLIA 2CMWA 3F5UA 4L45A 4M8TA 4EORA 5J7HA 1NVQA 3F7ZA 5HTBA 5AP4A 2XKCA 1J7IA 4HYUA 3L1SA 4QRCA 1KE6A 1P4OA 1KE8A 2I40A 3FZTA 3RZFA 5J1VA 1XH7A 4M3QA 2XH5A 2KULA 5DRDA 5AAFA 4OR5A 3BBTB 2C3JA 5JFVA 2A1AB 3PVUA 1IEPA 5AIKA 1GZNA 1VJYA 3LFQA 5H3QA 5CEQA 3UJGA 4USDA 2ITTA 3P1AA 5IQDA 3ENMA 5JZJA 2HELA 3UQGA 4LYNA 4XH6A 3H9FA 2R7IA 3OW4A 3QAME 3CY2A 4LV8A 4D0WA 5IA1A 4GG5A 4R7BA 4DBNA 2C3IB 4GK4A 4DFBA 3NMUF 2QO2A 3HDMA 5CZHA 2C69A 4X6QC 4CQEA 5CAPA 3PY1A 5AM7A 3ORXA 4D2WA 3HUBA 3BQRA 3TL8A 4YZDA 4IAYA 4EJNA 3DY7A 3B2TA 2YWVA 2VTRA 5IQAA 3QUDA 3CSVA 4O7YA 1JKSA 4FIIA 4C62A 3G33A 4YPSA 5C26A 2WAJA 2QQ7A 2J6MA 4RWKA 4UYNA 2W4JA 3FI4A 3R8MA 4AGCA 5JGAA 4HCTA 2R9SA 2FUMA 4EC8A 3F5GA 3HMNA 3TN8A 3MPAA 3CTHA 4QMLA 2WTVA 2GFSA 4ZOGA 5HO8A 1ZMUA 5M08A 3O0GA 3CGOA 2WHBA 2B9JA 2YM6A 5FXSA 2W1CA 1T45A 5IMEA 3NDMA 4DGOA 5HG9A 3V6SA 1T46A 4OT6A 1J1CA 4YBKA 4BWKA 4GKIA 5EH0A 5E8UA 2PSQA 3LLAA 4GW8A 4BICA 4RG0A 4BZNA 3F5PA 1LPUA 4TYJA 4BZDA 1NVSA 3QTSA 5AR5A 2Z7SA 4V01A 4FV1A 3V5TA 3C50A 5IZFA 4O1PA 4JLCA 1LUFA 2JIUA 3R01A 3TNPC 1H25A 5KHXA 2X2MA 4Y5HA 4KIKA 4XBUA 3P0MA 4IZAA 2CN5A 4GJ2A 1LR4A 2HCKA 3FAAA 4A4OA 4UB7A 5C27A 4RZWA 2YCRA 3E87A 2XB7A 3ORIA 2W1IA 3MWUA 2GNIA 3AOXA 4C33A 2WQNA 4O82A 3TJCA 4CZYB 3L9MA 3F6XA 3DLZA 1ZXEA 3NEWA 3PYYA 3MSSA 3LMIA 1DAYA 1FINA 3UNKA 4U42A 1OECA 2OFVA 4I6QA 2YM4A 4EWQA 5JH6A 3TNQB 1O9UA 4QYYA 3N51A 2IN6A 3FXXA 1ZYJA 5D7AA 3QLGA 4IVBA 4QTEA 5JGBA 4DCEA 3RPSA 4ZLZA 4O0UA 4OT5A 4CYIA 5K5XA 4CD0A 3BCEA 2GU8A 4A4LA 5A4QA 4RRVA 1YXTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YAK A;  4AT4 A;  4YU2 A;  3NSZ A;  4IM0 A;  4I92 A;  3U9C A;  3WF5 A;  4DFN A;  5HNB A;  2IVT A;  5EM5 A;  2I7Q A;  4GKH A;  3NVK I;  1DI9 A;  5CT0 A;  4Y73 A;  3SRV A;  3MDY A;  2WOU A;  4FTM A;  2PZ5 A;  3DZO A;  1H07 A;  4I93 A;  3UC4 A;  4Z7G A;  5HCX A;  1JST A;  3WYX A;  3FLW A;  5C8M A;  1DAW A;  4RIW B;  3CJG A;  1IG1 A;  2CNQ A;  2GHL A;  4AT5 A;  4L67 A;  4FIC A;  2OJ9 A;  4GMY A;  1ZMW A;  4BKY A;  4PDY A;  4K9Y A;  2BTS A;  2YJS A;  1YI3 A;  3WE8 A;  5K0K A;  3FY2 A;  4FKR A;  5LMA A;  2PY3 A;  2WZJ A;  5FP5 A;  2C3K A;  3GCU A;  3HL7 A;  5HD7 A;  3NUN A;  4UX9 A;  2UZL A;  4X2J A;  5HE0 A;  1BX6 A;  3LZB A;  3PPJ A;  4FG9 A;  4NTS A;  3PFQ A;  5HKM A;  4AA4 A;  3ZZW A;  4D58 A;  5CEO A;  4NFN A;  1Q3W A;  4QMO A;  5D10 A;  5EG3 A;  3W18 A;  4F08 A;  3UOD A;  1H1W A;  2C6K A;  4UEU A;  3DA6 A;  3PP1 A;  5FED A;  4PX6 A;  4YTH A;  3IW7 A;  3TV4 A;  2X7G A;  3DNE A;  1Q4L A;  1R1W A;  3NNX A;  4FG7 A;  4ZTH A;  3ANQ A;  3NIE A;  4QP9 A;  4XRJ A;  4DA5 A;  1KWP A;  4USE A;  4K0Y A; 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