3OOMA

Crystal structure of the acvr1 kinase domain in complex with the imidazo[1,2-b]pyridazine inhibitor k00507
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
TVARDITLLECVGKGRYGEVWRGSWQGENVAVKIFSSRDEKSWFRETELYNTVMLRHENILGFIASDMTSRHSSTQLWLITHYHEMGSLYDYLQLTTLDTVSCLRIVLSIASGLAHLHIEIFGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGQCCIADLGLAVMHSQSTNQLDVGNNPRVGTKRYMAPEVLDETIQVDCFDSYKRVDIWAFGLVLWEVARRMVSNGIVEDYKPPFYDVVPNDPSFEDMRKVVCVDQQRPNIPNRWFSDPTLTSLAKLMKECWYQNPSARLTALRIKKTLTKID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the ACVR1 kinase domain in complex with the imidazo[1,2-b]pyridazine inhibitor K00507
rcsb
molecule keywords Activin receptor type-1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2010-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oomA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oomA01
5AA9A 3AG9A 3PE1A 4QMSA 2WMAA 3AGMA 2ZM3A 3BGZA 2WQOA 3LFFA 5CVHA 4O21A 4EWHA 2KULA 4QP3A 4YMJA 3GU6A 3TM0A 2HWOA 2ZM1A 3AD6A 3PWYA 4CYJA 4FT5A 4FV1A 2GSFA 2JDRA 3GNIB 4FICA 3M2WA 4YO4A 4AZVA 4HVGA 2GDOA 4Y5HA 4KS8A 4GFGA 5GJFA 4CV8A 4N6ZA 2XA4A 3MA6A 1XBAA 1W83A 5IMXA 2PVJA 2OIDA 2GHGA 4H58A 2R2PA 5G6VA 4HYIA 2I1MA 3IW6A 5IG1A 3NUNA 3TNHA 4C57A 3LCOA 4R3PA 2X1NA 4G1WA 4HGEA 4FV8A 4A9UA 3C50A 4BWXA 4XMOA 3BU3A 1OKVA 2W1EA 4BBEA 4D2WA 4F0IA 2IPXA 1APME 4DEAA 4M14A 2WMRA 2GNIA 2YIRA 2IJMA 4IAYA 4XG3A 4WG5A 2PE0A 5GIPE 2HYYA 1H0VA 2V7OA 2YAAA 4R7HA 4HPUE 4BTFA 2UW8A 4N0SA 4RVKA 4N57A 4ANSA 2P0CA 3H30A 3G0EA 4DINA 2BHHA 1PMEA 2O0UA 3HMOA 3RK7A 5BQ0A 4QTCA 4QMWA 4PP9A 2B9IA 1FQ1B 2XK6A 1CMKE 2AC5A 3FXXA 4IVBA 1FVVA 1JWHA 3U6JA 3BU5A 4FVRA 3IPHA 4KBKA 5LOHA 3NYVA 3SG8A 2BDWA 3SLSA 4F6UA 4PTGA 3SAYA 5I9UA 2UZDA 3CKXA 3DKCA 5DPVA 3OT3A 4E5AX 2QVSE 2YIWA 5DYJA 4D0XA 5FDXA 3NYNA 4YZDA 3D5XA 2DWBA 4L52A 4M8TA 4FEUA 3TIZA 1SVGA 3EB0A 3SA0A 4ANLA 3PSCA 2CGXA 2DUVA 1X8BA 2WTKC 3FMHA 3R8UA 4C34A 4TL0A 2ITNA 4O27B 3BX5A 4IWQA 1URWA 4E5BA 2WQMA 3W2RA 4EZ3A 2VWIA 2WTIA 1Q8WA 3DS6A 3OEZA 4UZHA 3RP9A 2YM8A 4L67A 3JR1A 4ZLOA 2XIXA 1JKTA 4BZNA 4B0GA 4J71A 2WMXA 3TTIA 2HELA 3LCDA 4C4IA 4DH7A 4FTUA 1MRYA 3R1SA 2UW0A 3Q4TA 2R0IA 5EKOA 2QR7A 3OXTA 1PJKA 4LI5A 4E5WA 1W7HA 3CQEA 5CEOA 2WEVA 3C4XA 3ORKA 3FI4A 3HLLA 5HG9A 2C0IA 5A4TA 4FV7A 4RJ3A 2I40A 3FI3A 3GP0A 3ZO2A 4I5HA 4YNEA 3BHHA 2OSCA 3KC3A 5C03A 1H1SA 4MD9E 3TV6A 4IX3A 4E6AA 3QCXA 2R3PA 5CEQA 2R3NA 1OIYA 5GNKA 2UW7A 4AZTA 2XCKA 2VN9A 2BR1A 3BV2A 5KKRC 3F2NA 2OJGA 4ZS4A 3LQ3A 1DI9A 5JN2A 2QNJA 4RFYA 2BTRA 4BDHA 1H28A 2BRGA 3BLRA 3VS1A 4LRKA 2J51A 3IO7A 4A4LA 4CG8A 5EHOA 5L8LA 3ZC5A 4DLJA 3NYOA 1QPJA 3S00A 4LV8A 4I4FA 3COMA 5G1XA 5LVPA 4FTOA 1OECA 3GB2A 3FMJA 3R1YA 2ZAZA 3UP2A 1Q61A 3FC2A 3VF8A 3ZM4A 2VTHA 4YJPA 3D94A 3L8SA 3SG9A 4TYEA 4A4OA 3EQRA 2QG7A 4GVAA 3M1SA 3TZ8A 3KULA 4EH5A 4U8ZA 4DEDA 4E3CA 3ATTA 2HZ0A 4Y83A 5F94A 4BZDA 4X2GA 3UBDA 2ZB1A 2XKCA 5I9VA 2HWPA 3R7UA 4P5ZA 2YM3A 2RG5A 4V04A 4NCTC 4EJ7A 1YHVA 2P2HA 5ANDA 5BMMA 4YTFA 4YC8A 3NW7A 3TDVA 2RL5A 2V55A 4BZOA 4PDSA 1YVJA 3ZLXA 2I0EA 4MXXA 3QQHA 4EQMA 5LCJA 5IUIA 4DH1A 3EZVA 2DS1A 2XIZA 1W84A 3UZPA 2PVNA 3BHTA 5B2MA 4GYIA 2GTNA 1SNXA 3ACJA 4FKSA 4LQMA 4O0VA 3L8PA 1W0XC 4FTKA 1Q8TA 2YLEA 3TXOA 3PPJA 2OF2A 2X8EA 4G2FA 4DEIA 4EKLA 4BKZA 1PMNA 4UEUA 3ZLYA 4R5SA 3BLQA 3V5PA 1YI4A 2GFCA 3SX9A 4V0GB 4L7FA 3SV0A 4PPCA 3HDMA 4FE2A 2H9VA 3KU2A 2PSQA 3VUGA 3GFWA 3R04A 3U6IA 3H9OA 1LEZA 3KL8A 4IJPA 4D9UA 4M68A 1BI8A 2PUNA 4PPBA 3UQFA 5EYKA 3JY0A 2UZWE 5FM3A 2F2CB 5DR9A 2BDFA 3TEIA 2J5FA 1K9AA 3OOGA 4IVAA 4ZTHA 3MVJA 3UQGA 1U5RA 3R1QA 4LGHA 4I6BA 3LHJA 3CR0A 3G6GA 4IQ6A 5I3RA 3JXWA 4NYEA 4RG0A 5L2WA 2B9HA 2GPHA 2JKQA 3KXNA 4WG3A 4ACHA 4W9XA 4II5A 1UNLA 4GJ2A 2IW6A 2VO6A 4O83A 1A06A 5FGKA 3C0GA 2VWVA 1YOLA 4IX4A 2Y4PA 2JDTA 3JYAA 3WF5A 3QQKA 2OBJA 5AUVA 3SQQA 3L9MA 4EQCA 2Z7SA 1WAKA 2CNVA 1BL7A 1JKKA 2Y6MA 2ITOA 2QURA 2J7TA 5CSPA 2R3KA 3UIMA 3FHRA 3PIXA 2OK1A 4IE9A 4YJSA 4H05A 2C3KA 4J8NA 4ALVA 4WOVA 3IDPA 3ZFXA 3H0YA 2QLUA 4UV0A 5HTCA 4L01A 3F7WA 4QTDA 3ET7A 4QPAA 3QHWA 3HUCA 1ND4A 1AQ1A 2OIBA 3C4WA 1P4FA 4K11A 3HAVA 4CKIA 1YXUA 4JJRA 5M06A 3HMMA 3T3UA 3QWKA 2G2HA 1H08A 3AT4A 3MGYA 3MS9A 2OH0E 3PXQA 4FKJA 4IAKA 4AOIA 1ZYJA 2Z7RA 1LR4A 4HNIA 5DBXA 4OTPA 4YP8A 4USEA 3C0IA 1FPUA 2J4ZA 3V3VA 4BI0A 2B9JA 2YDKA 4F6WA 5LXMA 4WD5A 3TUCA 2PZYA 3AMBA 4HZRA 5HHWA 3O96A 1M2RA 1R0EA 4FZDB 4UMTA 5FWKK 4C36A 3DBEA 1HOWA 3GEQA 4E4LA 4K33A 4MXZA 4I5PA 5HNGA 4RJ4A 3PVWA 2PWLA 4FL2A 4KIOA 3KXGA 1XH4A 5BVNA 3IOKA 3A7GA 5LVNA 4XOYA 5J9LA 4DFBA 3GCUA 3HV7A 3W32A 4EHEA 4U41A 4GYGA 4CCBA 4DBXA 3KN6A 3RAHA 2PZ5A 4BY9E 3W1FA 2W17A 3ELJA 1RE8A 2J0IA 3F3WA 5AR5A 1MQBA 4DGNA 4GW8A 2XM8A 3ZUTA 2VGOA 3DB6A 4OLIA 5DEYA 3V6SA 2WQEA 2YM7A 3FZPA 1XR1A 3NS9A 4LRJA 4V01A 4EOOA 4R3CA 2LAVA 3WYYA 5K4JA 4LUEA 4BVUA 3EYHA 4HGSA 4DFYA 4GKIA 1H26A 1OVEA 3ZBXA 5IUGA 3R21A 4ZP5A 3WZUA 2WQBA 2YM4A 4FV4A 4FOCA 3LLTA 4ANMA 4RVTA 1JAMA 4YSJA 5E91A 3KREA 2UZLA 1LEWA 3PY1A 5E8ZA 1XO2B 4AW0A 2CJMA 2C5NA 4F4PA 2O65A 4QMLA 3B8QA 3MH1A 5KMLA 4ALWA 3RK5A 2VTOA 3UO6A 2HXQA 4O0SA 4EOJA 5I9ZA 5L6OA 5H9BA 4IACA 3G33A 4KINA 3QX4A 4IX6A 5IA1A 2C47A 3VJNA 4FZAB 3LM5A 3R6XA 5CI6A 4JIAA 2WOUA 4WA9A 3FZRA 3LQ5A 3HV3A 4EH8A 4GEOA 1QPDA 3IQ7A 2VO7A 4U7ZA 4AGUA 4C2VA 3BHYA 4OBPA 3P79A 3IONA 3D5VA 5IMEA 2R3LA 3HZTA 4JDKA 1YOMA 3MV5A 4W4VA 5I9YA 4GU6A 1UU7A 5HG8A 3QX2A 4RIXB 3RKBA 4GUBA 4UY9A 3LPBA 4O7WA 2UVXA 3NW5A 3MWUA 5EOLA 3CGOA 2B4SB 3Q5IA 4X3FA 4YZCA 4LFIA 4HYSA 5D11A 3R7IA 4NM7A 3ENMA 3RI1A 4MBLA 3WBLA 4QNAA 3VO3A 3NNWA 5HVJA 3C4ZA 5EYCA 1PXJA 4JVGA 4U42A 3TKUA 2XP2A 1OMWA 4CFFA 3FMKA 4XP0A 5C4LA 4E6QA 1IAJA 4RPVA 5BUJA 3TUDA 3VJOA 3SXSA 2W1IA 3I6UA 3NNUA 3OZ6A 3UOKA 3NR9A 5ETFA 3TNWA 4FTRA 4FKPA 4MXYA 4AT5A 5AMNA 4ZJVA 4U5JA 3NUUA 5CLPA 4IWDA 3MY0A 3EQPA 2VWZA 1IR3A 1CKPA 1A9UA 1KUTA 3ZC6A 2J5EA 3P78A 4V05A 4IC8A 4C3PA 2Z7QA 4O0WA 3DXPA 3E63A 1R39A 1TQPA 3I79A 3Q9XA 4MXAA 4UBAA 5FD2A 3E88A 5M51A 4RWLA 4FV9A 4KSPA 2JDOA 3F5XA 3AT3A 3UMXA 4AP7A 4NZWB 1Q3DA 5IQCA 1QPEA 2BVAA 4RLLA 1KV1A 1NXKA 4PDYA 3LAUA 4D28A 2E9PA 2QOHA 4E73A 4MKCA 4R7IA 5E8WA 2UV2A 3ATSA 2VNWA 3DAEA 4DEBA 5EI6A 1PXOA 3SW4A 1CDKA 2IWIA 5EHLA 5IQDA 1YW2A 5C1QB 4Z16A 2WTDA 2J0MB 3BWJA 1V0PA 3HRCA 5KMNA 3NVKI 4FOBA 5EW9A 4MQ1A 5HO8A 3PSBA 3KY2A 3MY5A 3OTUA 4FSYA 4TW9A 3ZUVA 4F7LA 3FLYA 3QZHA 4FKIA 3NVMB 2QOFA 4EOKA 3O23A 3JY9A 4M0YA 4UWCA 3W18A 4CKRA 3SRVA 4W4XA 1T45A 1UU9A 4CQEA 3FEGA 4WHZA 3U9NA 3OBJA 4FG8A 3F88A 4FT0A 3ULIA 4D2PA 4DC2A 1BL6A 2WTVA 3Q6UA 2FVDA 2YHVA 5JQ8A 5DN3A 2GQSA 3DJ7A 2QODA 5HVKA 2OU7A 2VGPA 2Y7JA 3ORZA 4PNKA 5LVMA 3RJCA 3ZONA 2H6DA 4BDAA 1XBBA 2VZ6A 2Y0AA 5IZFA 4NH1A 5JQ5A 5LMKC 3PPKA 4DFLA 2XYUA 5KKRB 2HY0A 2OO8X 2E9UA 3BE9A 1OGUA 1WVYA 2DYLA 2WELA 3FMEA 4ANNA 4BDJA 2EXEA 4JX7A 4NJ3A 1XJDA 4KIQA 3CC6A 2HCKA 4DE4A 3SW7A 2A27A 3C7QA 3HDNA 3O51A 5CAQA 3DTWA 4PWNA 5F9EA 4DTBA 4BCHA 4CFNA 4ZTSA 4MF1A 4GIIA 4ZK5A 1YOJA 4XG8A 1EH4A 3L1SA 4QPMA 4W4WA 4H3BA 3QUDA 4JAIA 4YHTA 3ZU7A 2R64A 3L9PA 2ETMA 4U81A 1DAYA 2J90A 3D7TA 3KF4A 4E6CA 5I0BA 1UV5A 3GI3A 4UMRA 4EK4A 2C4GA 3D5WA 4ZSLA 3NCGA 1FGIA 5F4NA 3WIKA 2BFXA 4F7JA 3VW6A 4P4CA 3A7HA 3RPSA 3O0GA 3QA0A 2R3IA 5AX3A 2DQ7X 3TKHA 4CFUA 5CSVA 4L9IA 3ITZA 5JZJA 2XIRA 3Q9WA 5HCZA 5J8IA 4BDBA 4U97A 3FC1X 1XH6A 5AR3A 4C02A 4APPA 2IVTA 2GHLA 2WIPA 1AD5A 2KTYA 5AR7A 3OC1A 5AAFA 2C6KA 3KA0A 4BGGA 4DEEA 4FV0A 4G3GA 5E7RA 3FQSA 5AX9A 1YXTA 4CNHA 4ASZA 1XWSA 1U59A 3D2IA 4ZZNA 2OXDA 3AD4A 4G17A 2B52A 5BVKA 3UG1A 2W5HA 2OLCA 3GC9A 5K5XA 3PY0A 4U44A 3RINA 3DK7A 3CCNA 2XKEA 3LFQA 4D5HA 4NUSA 2R3HA 4XRLA 3ZMMA 4DG3E 5CNOA 3DCVA 5IH4A 1KE9A 4E4NA 3EYGA 4LM5A 2ITUA 4AT3A 4Q2AA 3PVGA 4BB4A 5EI2A 2WXVA 3MB7A 4PMMA 3ZUUA 5C8NA 3C5UA 4HOKA 2XMYA 4R6VA 4DGGA 4FUYA 1LP4A 2J0LA 3E8DA 5E9EA 4QO9A 4EHGA 3TDWA 5CVFA 4O81A 3ULZA 3TZ7A 5CX9A 4HW7A 2XRWA 1UNHA 3MTFA 3C9WA 5D41A 4C59A 3GU4A 3P4KA 4MNEB 1SYKA 4EK8A 2W1DA 1Q62A 3QQGA 3O71A 4J95A 3FMNA 4FTMA 4C3RA 5IEXA 2VD5A 3H3CA 4EQUA 3NUSA 3OT8A 4IVDA 3RCDA 3KXMA 3N4VA 1J7UA 5J5TA 4FV3A 4IJ9A 4L6QA 4J98A 4C0TA 4RA4A 1R1WA 4AT4A 3TNQB 5J1WA 2NO3A 2R5TA 3MI9A 4NM3A 3R2BA 4L42A 4USDA 3UODA 4EH3A 4TY1A 4X2NA 5M55A 3D0EA 3VRZA 2C6DA 3QD2B 3E93A 5M4FA 2XEZA 3TNIA 1P4OA 5IQEA 3UG2A 2PVMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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