3ORMA

Mycobacterium tuberculosis pknb kinase domain d76a mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
280
structure length
266
Chain Sequence
RYELGEILGFGGMSEVHLARDLRLHRDVAVKVLRADLARDPSFYLRFRREAQNAAALNHPAIVAVYATGEAETPAGPLPYIVMEYVDGVTLRDIVHTEGPMTPKRAIEVIADACQALNFSHQNGIIHRDVKPANIMISATNAVKVMDFGIARAIATAQYLSPEQARGDSVDARSDVYSLGCVLYEVLTGEPPFTGDSPVSVAYQHVREDPIPPSARHEGLSADLDAVVLKALAKNPENRYQTAAEMRADLVRVHNGEPPEAPKVLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allosteric activation mechanism of the Mycobacterium tuberculosis receptor Ser/Thr protein kinase, PknB.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine protein kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 78
structure length 266
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ormA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ormA01
1PY5A 4R3RA 4ARKA 2CLQA 5AM6A 3EQCA 3R28A 5HNBA 1YI3A 4J7BA 2I1MA 2KULA 4WSQA 3UDBA 3GCPA 3RNIA 3V51A 3OT3A 3WZJA 1WCCA 1H1PA 4FVQA 2QOHA 5L2SA 4YGAA 1RW8A 3BHHA 4FTUA 4FX3A 4O96A 3LMIA 3NUYA 4KSPA 4M66A 3UO6A 4AAAA 1W83A 2WMRA 1O6KA 1LUFA 4J98A 3OXIA 4RVTA 4EBWA 3I0OA 1KOBA 2QKWB 4MD7E 2RFEA 2ZV9A 4B0GA 2ZM1A 2XK9A 5HU9A 2W1DA 4UZDA 3JVSA 4AZVA 3UNKA 4FV0A 5DVRA 2XK3A 3O50A 2W06A 4CTBA 5IZFA 4HGLA 5CEMA 5GZ8A 5ANKA 5IQBA 4FIGA 4M0ZA 3E64A 3EIDA 3PY1A 3F2NA 3KXZA 3UOJA 4M67A 5HIDA 3R83A 3FLZA 3LLAA 4AN9A 3NLBA 2J50A 3UGCA 4BTKA 4EZ7A 2WMBA 5IH4A 4I21A 1UWJA 4QT1A 4YHFA 3B2TA 4OGRA 2YISA 2HK5A 4OTRA 2B9IA 5GZ9A 3S95A 3VHEA 3IDBA 3W1FA 5CAUA 3ORPA 3PE2A 3UO5A 4AN3A 4FNXA 3PTGA 5H9BA 2XNBA 3A8XA 4FKRA 2YLEA 5HG9A 2P55A 5A4CA 2QOKA 2XZSA 4HCTA 4D55A 2H96A 4IXPA 1J3HA 5BYZA 3Q5IA 3V01A 2OXDA 5CQWA 5EYDA 5KHWA 5HI2A 3OY3A 1OBGA 2B9HA 1ZZ2A 2R3NA 2R3OA 4R5YA 5EK7A 3PPZA 4JDIA 1OIQA 1ZXEA 4ENXA 3G51A 4K77A 5ANGA 1W84A 3OVVA 2EU9A 4E8AA 2R3HA 4O7WA 4DFBA 4IC8A 4QYHA 5L2WA 4FE2A 4JDJA 2RFSA 4MD8E 2C6MA 4F1OA 3FC1X 3GU6A 4O2ZA 3NPCA 2X1NA 3FMKA 1MP8A 4DYMA 3ZYAA 5CEOA 4RIXB 3QXOA 4IZ5A 3NS9A 4G1WA 3MB6A 2JEDA 3DV3A 2BVAA 2QLUA 3OXTA 4FKSA 3W10A 3DT1A 4A9SA 2PZIA 4XLIA 4YURA 4Y5HA 5JZNA 3FMDA 3CE3A 2WTDA 4MHAA 4PPCA 2ZB0A 3FKLA 4ZMFA 4LRKA 4C3PA 2BZIB 2J0IA 5ETIA 1FOTA 4F0GA 5AUXA 1TQMA 2PE0A 3FY2A 3OW4A 4O7TA 3PDTA 1ZY5A 2HENA 3TNPC 4GCJA 3KF7A 5IEXA 3WF8A 3BV2A 5HBJA 5JSMA 2O64A 3AT3A 4O86A 4GFMA 1B38A 2UZUE 3RBWA 5AAEA 4G3CA 3QQUA 3FC2A 3TG1A 3PYYA 5DRDA 5AUWA 3C4WA 2R3LA 4P4CA 4C02A 5BVDA 3GU8A 2F57A 2J5FA 2Z7LA 3L9MA 5JT2A 3AMYA 4AWIA 1G8AA 4BTMA 5ANDA 2YACA 2IZSA 2RG6A 1MQ4A 4NEUA 3E8DA 4XV1A 3ZLYA 5JEBA 4MF1A 4I41A 1UKHA 2XEZA 5I3RA 4HVIA 3M1SA 1OI9A 2HZIA 3MGYA 2WAJA 4LG4A 5HLNA 4O22A 4FVRA 4FC0A 2J2IB 5E90A 4ERKA 3LJ2A 4KA3A 5KZ0A 4YTCA 4DE4A 4PP9A 4RQVA 1Y8YA 4HPTE 2OIBA 2XNMA 2BR1A 3EN4A 3NIZA 5AV0A 4D9TA 4EOJA 5EYKA 1WVYA 4C36A 2QOLA 4C61A 5KHXA 3QQLA 5E8WA 2C6DA 2VWIA 3CPCA 2BRHA 4IAZA 4S30A 5LCJA 4DTKA 4JBVA 1RDQE 2R7BA 3Q6WA 4IWOA 4OTDA 2CGVA 3T9TA 1BI7A 4V0GA 5IF1A 3NDMA 4BI1A 3DA6A 3F61A 3UMXA 3LXPA 3Q52A 4ZTQA 4FTQA 5E1SA 5FXQA 3TTJA 1R1WA 5CYIA 4BGHA 3WOWA 5IQDA 5AX9A 4WIHA 4J96A 2WKMA 2YDKA 4JIAA 4OAUC 4NT4A 4YJSA 5AR7A 5EDQA 2W4JA 4R6VA 1YDSE 4TYGA 3R9HA 4QRCA 4ALVA 3PWYA 5GHVA 2HZ4A 1DAYA 5HE3A 2GNIA 4ANSA 4BDBA 5EI8A 4FIFA 2Z7SA 5IA4A 5EQPA 1PXIA 2XVDA 4IC7A 3SKCA 4BWPA 5KUPA 5BUEA 1WBNA 3QTUA 3QKMA 1WBOA 1XKKA 3LQ8A 4I20A 3OCSA 2HYYA 2G2FA 4UN0C 3VUMA 4GK3A 4S33A 4CCUA 4ALUA 3OTVA 3F9NA 2ITZA 3QCSA 3VBTA 1IA9A 4F6WA 2ITPA 1ZYLA 5C9CA 2QQ7A 2CHLA 3UVRA 2HIWA 3Q32A 4A07A 4YHJA 1FGIA 3CD8A 5BVOA 3SOCA 4GRBA 4YSMA 2LAVA 4BY9E 3UG1A 1O6YA 4E4MA 1FBNA 2H34A 4O27B 1JKLA 3V8SA 4I4EA 5J9YA 4FV2A 4ZJVA 2XIXA 1G5SA 3WIGA 4O0VA 5JFXA 3DFAA 5IA5A 4YBJA 5HOAA 3GB2A 3V5PA 2WTVA 4ASZA 2OJIA 3D5VA 3NW5A 4IVDA 3EN9A 1QL6A 5EYCA 1M2QA 2FSLX 3DB8A 3U87A 4QTAA 4GIHA 4YBKA 2G15A 3NNXA 5HG5A 5DOSA 2QLQA 4ZTHA 4RWKA 3UJGA 3VW8A 4FNZA 2CPKE 5AUTA 4C33A 3DLSA 3JPVA 1OMWA 3R01A 4EZ5A 4RWJA 4H05A 5AV4A 1ERKA 4R7IA 3Q2MA 4ITHA 2DYLA 1XH6A 4HVSA 3FQHA 2H9VA 4FTKA 1J91A 3UG2A 1H0WA 3MJ2A 5AAFA 2R3RA 1OUKA 4X2NA 4G6NA 4DCEA 2XRWA 1P5EA 4GK2A 3I5NA 5CALA 2OICA 3ENMA 3U8WA 2WQEA 4NIFB 3VUGA 3KRXA 4CQGA 5LVMA 4NYEA 5DFPA 3BHUA 4OLIA 5DHJA 3CCNA 2QOBA 2C5NA 4CQEA 2RF9A 4B4LA 4TWNA 2UW8A 1JKKA 3VBWA 4PX6A 1MRYA 3BELA 3BLQA 2PUPA 4GU9A 2C3IB 4JQ8A 4YC3A 2VTNA 4PRJA 3PIZA 4ZTMA 2C4GA 2VWXA 3P5KA 5K9IA 3EFLA 1ZLTA 3KK9A 2OSCA 5DH3A 4IDTA 3TNHA 4F63A 2VAGA 2J6MA 3NRMA 1WMKA 2W1IA 4O0YA 5HE1A 5CS6A 3BYOA 5JRSA 2WQNA 5IQCA 3D83A 5BYYA 4WBOA 5AMNA 4E26A 1YW2A 1H01A 3VJNA 3OY1A 2QD9A 3GI3A 1DI8A 2B52A 3PP1A 2CGXA 3PLAE 3LHJA 2XP2A 3NNUA 3QWKA 4MXAA 3VUDA 3ZC6A 2PUUA 5IUIA 4U3YA 1CKJA 5CT0A 3ORMA 4D2SA 3L9LA 3GCQA 5HESA 3G2FA 3DXNA 4O7VA 1CSNA 1OL2A 3ZFYA 4WHZA 1H4LA 4D9UA 4FZ6A 2F7EE 4O7YA 5DBXA 3CQEA 3PSDA 3V5TA 3G9LX 4EH6A 2QC6A 2XB7A 2HXLA 5LXMA 4X3FA 1Z5MA 4AU8A 4OTPA 4DGNA 1H26A 2QOQA 2VX1A 1UU8A 4RIWA 2HZ0A 4DBXA 4CD0A 4E6AA 2OG8A 1FQ1B 3R63A 5CU3A 2Z7QA 3BEGA 4ORKA 4ZLYA 1WAKA 3QYZA 3WZUA 4CFWA 5CF4A 1NVQA 5HCXA 1KV1A 2PHKA 3EFKA 4JDKA 3V5WA 4JX7A 3VUTA 1BUHA 2HELA 4G3GA 4BVUA 4CRSA 1PYXA 2BIKB 5C8NA 1OB3A 5EI2A 1PXKA 4QMNA 3RTPA 3N4UA 1WBWA 2ZVAA 3KRLA 4TRLA 3ZZEA 2UV2A 4RJ7A 1XH8A 3H3CA 5EKOA 4C3RA 4KKGA 4MBJA 3NYXA 4X2GA 1M7NA 5EHOA 3R8PA 3TV7A 4C2VA 4M69A 5CZHA 3R9DA 4DAWA 3QTSA 4USFA 3UVPA 2Q0BA 3HP2A 4EWQA 4WT6A 3PP0A 3QA8A 3E93A 1Q41A 3UIXA 4KNBA 4QPMA 4YTFA 5ANJA 1URCA 3NVKI 4O6LA 2B7AA 2CKEA 3OOGA 2X6EA 3E8EA 2PY3A 1BLXA 2WMAA 5AR8A 3DDQA 5KO1A 1IAJA 2CNQA 3B2WA 3RPRA 2NP8A 3H4JA 4CKIA 5HTBA 1JAMA 4IWQA 2OXYA 4MH7A 5FD2A 5M06A 4F9BA 5L3AA 2A0CX 2GNHA 4X7QA 4M0YA 4YO6A 3V5JA 5IDNA 4YHTA 5I0BA 3UPZA 4JI9A 3C4EA 4IHPA 2F7XE 3W2PA 3GBZA 4H36A 2JDRA 3OW3A 5D7VA 2YIYA 2J0MB 2GQRA 3IW5A 3PIXA 2VNWA 2W7XA 2R3PA 4QTEA 1KE5A 1NXKA 4C38A 2X4ZA 3I6UA 4FV6A 2YABA 3F5XA 1RJBA 2BFXA 4KIOA 5AV3A 4BDDA 4IX4A 3QGWA 5AP5A 3TN8A 3VNTA 5HX6A 1JSVA 3UZTA 1GIIA 4UYNA 3DDPA 3GCVA 5HTCA 4DEBA 5TT7A 4DH3A 3UIBA 2PVFA 3HMIA 4C58A 1R0PA 4YJNA 4IM3A 4FKGA 3LFEA 2JKQA 4YUQA 3UOLA 3O8TA 3P7CA 5EG3A 4U42A 2GS6A 3DXPA 3CP9A 5KKRB 3HAVA 4MX9A 3I81A 3R0TA 1OPJA 3LJ0A 2FSTX 3E3PA 4RX5A 4EK5A 2YM8A 2QOOA 3IGGA 4I5CA 4BL1A 4CFMA 5CANA 5ICPA 4MEDA 3FYJX 3LM0A 1OPLA 4K18A 5J87A 3VS3A 3R22A 4BGGA 3CBLA 3MTLA 4YO4A 1PHKA 2J90A 3GC0A 5CNNA 3K54A 2GDOA 4UALA 5G1XA 2OW3A 3BQRA 3E63A 1YXXA 3LIJA 3O96A 3ETAA 3OWKA 4FTOA 4GH2A 4ZP5A 3RM7A 4L67A 3HGKA 2EXMA 4J71A 2C68A 4GIIA 3AC4A 3KCFA 3ZEPA 5JGBA 3PSBA 3BYUA 3GQIA 3W8LA 3SLSA 2ERKA 5IEVA 3LZBA 2R3JA 1Q61A 2B1PA 3QQJA 4AOTA 5IQIA 3DBDA 4EH8A 3ORLA 1TQIA 2XYUA 1JBPE 3JUHA 2PMOX 3LM5A 4R1VA 4XOYA 4YLLA 4UX9A 4JR3A 1ZOHA 3ZCLA 4DFLA 4DEAA 4RC2A 5CF6A 4XBRA 3LCKA 4OTWA 5IQHA 4FOBA 3UC3A 5FXRA 2NRUA 2WPAA 4AOIA 4DFXE 4JBOA 4O0XA 4U81A 4H1JA 1FVTA 3O23A 1H00A 3PJ3A 5I9WA 4BZNA 4J52A 4CG8A 3F5PA 3T8OA 3QX4A 3DQXA 4PL4A 4WSYA 5AX3A 4KRDA 1GNGA 1Q8YA 3I6WA 4Y73A 3PY0A 3V6RA 5FG8A 4W4VA 1R78A 2CLXA 3WARA 4WG5A 3D0EA 4EYMA 4GFOA 5J79A 1OUYA 2UZNA 2R3GA 2PE1A 3CTJA 3OT8A 4FKTA 2B0QA 3CQUA 3UNZA 3CLYA 1K9AA 1YHSA 3FMJA 5KNJA 3KU2A 2XKEA 2IO6A 4OTGA 4WNKA 2WTCA 5HO7A 3G15A 1ZY4A 3KXGA 4ZSJA 5CAPA 4RIXA 1U5RA 5JKGA 2ONLA 4Z3VA 4TWOA 2QODA 3BBWA 4NTSA 3RZBA 5BVWA 3OZ6A 2BAQA 4PMTA 5TR6A 1OKVA 3FKOA 5IQGA 2VN9A 3UZRA 4NKAA 1XWSA 3E7VA 4FL3A 5HLPA 1GJOA 4GYIA 4CV8A 3CPBA 1DI9A 4I1ZA 3OWLA 5GJGA 3VS5A 5CI7A 4K11A 2GFCA 4XV2A 3PPJA 4AP7A 4D0WA 4QQ5A 3NNVA 4RJ6A 4I0SA 2VO3A 3RMFA 3KMMA 3BYSA 4BDEA 4E7WA 3EQDA 2HWOA 3KN5A 3U9CA 4RRVA 4V05A 2C3LA 2IW6A 4GEOA 5TO8A 3O8UA 4GVAA 5AADA 3ID6C 4TTHB 4LI5A 2CKOA 2GHGA 4EOOA 1FMOE 3POZA 3V6SA 4D1XA 2ZMCA 3CS9A 5J1WA 3AD6A 5CI6A 3EYGA 3OF0A 5EH0A 4TYJA 3C5UA 3NYNA 4H3QA 4O0RA 3DGKA 4B6LA 4IQ6A 4F08A 2PL0A 2ITYA 3UMWA 4ID7A 2Y0AA 2C6TA 3CR0A 2XEYA 3EOCA 3FI2A 4UMUA 2UW5A 1H25A 1F5QA 4UYAA 5DLSA 2QVSE 1REKA 2YM7A 4FKWA 4RC4A 3UQFA 2R7IA 3F66A 4BHZA 2OH0E 3OXZA 3PXQA 1VZOA 4NCTA 3QHRA 3RWQA 3ZFXA 2P4IA 4AA5A 3IS5A 3MDYA 2C0OA 4JDHA 3G90X 1SM2A 5M4IA 4TYIA 2WELA 4FKIA 4FEQA 2Z8CA 5E91A 3FAAA 1NVSA 4BDJA 4G9RA 4YMJA 3MS9A 4I6FA 3NZ0A 2OJ9A 3LFBA 4F7JA 3DXQA 5E8UA 4E4NA 3ITZA 5IEYA 4R8QA 3UZPA 4QMQA 4HPUE 2GSFA 2ITUA 3PJCA 2YCRA 3EN7A 4YJPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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