3OROA

Mycobacterium tuberculosis pknb kinase domain l33d mutant (crystal form 4)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
280
structure length
272
Chain Sequence
DRYELGEILGFGGMSEVHLARDLRDHRDVAVKVLRADLARDPSFYLRFRREAQNAAALNHPAIVAVYDTGEAETPAGPLPYIVMEYVDGVTLRDIVHTEGPMTPKRAIEVIADACQALNFSHQNGIIHRDVKPANIMISATNAVKVMDFGIARAIATAAVIGTAQYLSPEQARGDSVDARSDVYSLGCVLYEVLTGEPPFTGDSPVSVAYQHVREDPIPPSARHEGLSADLDAVVLKALAKNPENRYQTAAEMRADLVRVHNGEPPEAPKVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Allosteric activation mechanism of the Mycobacterium tuberculosis receptor Ser/Thr protein kinase, PknB.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine protein kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 81
structure length 272
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oroA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oroA01
1TQIA 2JAVA 3C51A 5T68A 4EWHA 2ERZE 2BDJA 2E2BA 3PP0A 3F9NA 2JIVA 1QCFA 1KUTA 3C5UA 4J8MA 3I81A 2PZIA 2P0CA 4B7TA 3R9RA 3TNQB 4GIHA 4FEQA 3V5WA 2OK1A 3ZM4A 4HW7A 2HZ4A 4DTBA 3N9XA 3QX2A 5EM7A 4BWKA 3K54A 4FV2A 3I6UA 4AA0A 3RALA 3DZOA 4WO5A 4YU2A 2UW7A 3K5VA 4LMUA 2C5VA 4IDVA 3DAJA 4XX9A 3R8ZA 4FF8A 3VO3A 3OY3A 3Q5IA 1PXKA 3PPZA 3E63A 4V0GA 3VQHA 1BL6A 2OIBA 2B52A 3A62A 4RFZA 1YOLA 3RWQA 2YERA 3LPBA 2B9IA 5E91A 3KMMA 2C5OA 1FOTA 3BPRA 3KMWA 3R7GA 4W9XA 5FQDC 3WIKA 2I0VA 3QCQA 4YTCA 5CAOA 2C0IA 3I60A 4D2RA 2BILB 1M17A 1XR1A 3F2AA 2PL0A 4O0SA 5A54A 2IO6A 2I40A 2W7XA 5I9XA 4M14A 2FB8A 3MVLA 4MXZA 4PUZA 4JOAA 4RLKA 4K33A 2F4JA 5CTPA 1J3HA 1KE8A 3PTGA 4G3EA 2VWIA 4BCGA 3G5DA 4YZDA 3O8UA 4F7SA 2YM4A 3BE2A 5AA9A 2R3GA 4CFUA 1XWSA 1P2AA 5AP5A 4MBJA 3Q4UA 4QP7A 3EMGA 2B4SB 4RX7A 4EUTA 3MVHA 4YR8A 3ATTA 3HP2A 2VO7A 2WIHA 4KUJA 3COHA 1OGUA 2YCQA 4RIXA 1H26A 3GFWA 4X2NA 4EOIA 2XCKA 5M4IA 5KKRC 4CV9A 5K9IA 4O7WA 4KKHA 1H07A 5LWNA 1P4FA 4IADA 5TKDA 1IAHA 4ALUA 2A19B 1O9UA 3GENA 3PIXA 4NJ3A 4RQVA 4WSYA 1XH4A 4FV5A 4N6YA 4J1RA 4ZSGA 4BDAA 4JDKA 4EHEA 3FXZA 3C0HA 2F7EE 2XNEA 2QKWB 4QNYA 2P4IA 3CGOA 4ERKA 4D0WA 4K8AA 2BIKB 5KMNA 4RRVA 3WZUA 4QMVA 3AD4A 4I22A 1YXTA 5K4JA 3FZPA 3AD5A 4DH1A 1KSWA 2BRGA 3VUTA 1PXIA 1UKIA 1GZNA 3CBLA 2PUNA 4TW9A 2XK7A 4FTCA 4BCQA 3HNGA 3DZQA 3MN3A 1SVGA 3RM7A 4MNEB 3MTLA 4IQ6A 3UGCA 3RMFA 2BR1A 3LE6A 3W2SA 2XBJA 4AWIA 3NW6A 4FSNA 2W9ZB 2WMRA 3JS2A 3QYWA 3ZEPA 5LMBA 4EEVA 1DM2A 4FL1A 2J9MA 4GU9A 4IX4A 3HEGA 2QO2A 5C4KA 3A7FA 2EB2A 3RJCA 3RK5A 3VULA 3W2CA 4P5ZA 2XA4A 3CJFA 3FLQA 4FV1A 4QPAA 4I20A 3VBWA 5AV0A 4N6ZA 1Y91A 3C1XA 2GMXA 4D4VA 4RWKA 4MQ2A 2QR7A 5F1ZA 5EG3A 3TCPA 4YJNA 1FVVA 3DLSA 4RX8A 4PRJA 4TTHB 1W82A 3UOLA 5AJQA 4BTJA 4GS6A 4YHTA 5LXMA 4EH3A 5M4UA 2XK9A 5CZHA 2ITZA 5FP5A 3JVSA 3ZO3A 4QOXA 3CC6A 3OD6X 3NVKI 3OT3A 3L9MA 4X2GA 4ACMA 2PVHA 1JSTA 3UPZA 3OUKA 4XNEA 5A4QA 2YM7A 3H0ZA 2GSFA 4P5QA 4E8AA 2UW9A 3GEQA 4TL0A 4Y73A 5E92A 2YJSA 2HY81 4RC3A 3TXOA 5HNGA 4CKIA 3UZRA 5DOSA 4X3FB 4TWPA 2OXYA 3EN6A 5JH6A 1PW2A 4F9BA 4YBKA 1PXJA 3CQWA 3TDVA 4I41A 2OU7A 3HV3A 4JIAA 3U8WA 2BZJA 3KULA 2CN8A 4AN9A 4KIKA 3NUUA 4BIBA 3ENMA 1ZYDA 3ZLYA 4QMZA 5D11A 3UBDA 4QRCA 4AGUA 3QU0A 1ZYLA 2AC3A 3T9TA 5F20A 3IW5A 4EOPA 4C4FA 4XV9A 5CF6A 3FI3A 4GUEA 4FV6A 1OIUA 3IW7A 3RM6A 5IH4A 2CKEA 2A27A 2V55A 3BE9A 3EL8A 5E8ZA 1A06A 1Y8GA 4IZ5A 3GP0A 4YTHA 4QP9A 4ZY6A 2X2LA 3QZGA 5AV2A 3OZ6A 3FI4A 3CP9A 4GFOA 1TKIA 3OWKA 4PDOA 4PX6A 2B54A 2ZMCA 3U6HA 4R3CA 4PDPA 4DH3A 4O0UA 2Z60A 3D5XA 3FMKA 4DC2A 4RWIA 5AUUA 5CSPA 4FICA 2Y4IC 1KOBA 4Z7GA 3JUHA 3E3BX 2PVFA 3BRBA 3LFAA 4OBQA 4ZIMA 2OIQA 3RAKA 1ZYSA 3L8VA 1ERKA 3FV8A 3P7CA 3BU5A 2QODA 3BHTA 4I3ZA 5AP1A 1YXUA 2Q0NA 4H36A 3U54A 2W5AA 4CMOA 2XH5A 2H8HA 4AG8A 4C34A 2ITPA 5DI1A 2R2PA 3LCOA 4U6RA 3D2IA 4W9WA 2XKEA 4NTSA 2FA2A 3VW8A 4PL3A 4C4IA 1NW1A 3KC3A 1XBCA 3MFRA 5C8MA 4B99A 4OT5A 3AC8A 3VS6A 2XNNA 2R3JA 3QTUA 4O0YA 3MH2A 4L6QA 5DBXA 4Y95A 3TTIA 4BY9E 5CSWA 1U59A 5CVHA 5C26A 4ACGA 4UALA 2XIRA 2YABA 3H4JA 4IVBA 3K2LA 4QT1A 4BIEA 3ET7A 3ZYAA 5EFQA 3QRTA 4WHZA 4FYOA 2QCSA 5HCZA 2YM8A 3QQKA 1H1WA 2X8EA 2OWBA 4BDJA 4YMJA 3LFQA 2HZ0A 4LI5A 5FBNC 5IUGA 4EOKA 4YZCA 3MESA 2KULA 4MAOA 3WZKA 3VHKA 4QTBA 3QC4A 5DVRA 5L2IA 5M06A 3JXWA 2UZVA 3SC1A 3LCSA 5J79A 5HOAA 3REPA 4FKVA 3L8SA 4BDFA 2YIQA 3F3TA 5E4HA 4KRCA 2HWPA 3FMLA 3FKLA 4LGHA 4CLJA 1E9HA 5DT3A 3FMNA 3ODYX 4MXAA 4MD9E 3HYHA 4QMTA 3GQLA 3MGYA 5FBOA 3TL8A 4ANMA 5EYMA 4LL5A 4E93A 3GQIA 4FZ6A 3WILA 5HVJA 3RHKA 1MUOA 5JSMA 3PXRA 3KCFA 1PKDA 1W83A 2PE1A 3V8TA 4IAAA 1JVPP 2I0HA 3ZC5A 4K11A 2J7TA 2OH4A 3DOGA 4IB0A 3DXQA 5T3QA 3NCZA 2O63A 2W1GA 2C6LA 2UW4A 4AF3A 2VN9A 3WARA 4O91A 2VTTA 3O2MA 4RT7A 4C7TA 3EQPA 3QA8A 4QMQA 2FSMX 3EFWA 3HX4A 4IIRA 4UBAA 4BDBA 5KCVA 4OW8A 5BUJA 5EQPA 2F57A 3EKNA 2PULA 4LM5A 5HTBA 1RQQA 3NUYA 3BWFA 3IECA 4KS7A 4LMNA 4PV0A 4YURA 4NFMA 5AA8A 3UG1A 4KIQA 5M55A 3SW4A 2X6DA 4F9WA 3LCTA 3EN7A 3P4KA 3DK3A 5JKGA 3QKKA 3HMMA 3TM0A 5KMLA 2JGZA 3R8UA 2JLDA 3GU4A 2GCDA 4YSJA 1VEBA 4A9YA 4TKSA 5DR9A 4XYFA 1OM1A 4U0IA 4CLIA 4YJOA 2QQ7A 4FR4A 3RNYA 2XF0A 4LUDA 5DR2A 5HO8A 1Q8YA 4Q5EA 5JFSA 3IO7A 2WMVA 4RQKA 3TZMA 3MFSA 5IA5A 3C0GA 3P9JA 3NAXA 4G3GA 5HCYA 1YWRA 4FEXA 2CGXA 3FL5A 5AX3A 4AQCA 4UZDA 2WXVA 4MWIA 1PXPA 4FC0A 2A4LA 3NDMA 4BZDA 2W1ZA 2PUPA 3KREA 4H3QA 3VUIA 2ZB1A 2OF4A 5CASA 4EWQA 2YAAA 2G9XA 5FD2A 3DNDA 4NM5A 2YDIA 3COMA 4OGRA 5AP0A 4O7YA 5DWRA 2BRMA 3LQ5A 4X2JA 3NWWA 3OBGA 4FTNA 4EH8A 4BBFA 5I9YA 1JBPE 4DH8A 5CENA 5J9YA 1ZYJA 4G6LA 5DHJA 4ZTNA 3RPSA 4UWBA 4AUAA 3FZTA 3CTJA 1DI8A 3P7BA 4K9YA 3WYXA 3PRIA 4D2TA 4D58A 4XP0A 3EFJA 5E90A 5IDNA 1W0XC 2ZMDA 4TWCA 4CTCA 4M0ZA 4AXAA 3S00A 4ASEA 4PY1A 4GUBA 4PTEA 3DS6A 5TT7A 4XBUA 5JQ8A 4WG4A 4IM3A 5DEYA 3V51A 3Q53A 3BEGA 5IQEA 4KS8A 3DBCA 2WB8A 4BDDA 1M52A 4WRGA 4PNKA 4HYSA 4IACA 5IQAA 3P78A 1F0QA 3KY2A 4TN6A 4YLLA 3H9FA 4F08A 1IG1A 2Q83A 3COKA 3GGFA 3W33A 4GT5A 4YJVA 4C58A 4IXPA 1OPJA 3EQGA 3IW8A 2GNIA 3QLFA 5HX6A 4DEHA 2P2HA 4L68A 1YHWA 4ONAA 3R7VA 2WNTA 4O38A 5C8NA 4HPUE 4UV0A 4A07A 5A6NA 3W2PA 3NRMA 3QTQA 3FYJX 5HHWA 2FO0A 4OTPA 4GT4A 1ZOHA 4IAYA 4A4OA 4C3FA 4EQCA 3W8QA 5FLFA 1OECA 3UPXA 4ANQA 4AZTA 4I4FA 5L6OA 3G9NA 1IA8A 2R3FA 4FIGA 5EHYA 2RFDA 3QTWA 3QZHA 4FTMA 1BLXA 5EHLA 4DFXE 4TNBA 4EHVA 1H25A 3E7OA 4O7TA 3C0IA 4C2VA 1QL6A 5KE0A 3BLRA 4N4SA 3N51A 5I3RA 5A4TA 2VTSA 5DNRA 5CEOA 2PE2A 4XG3A 5EI2A 3TACA 4NYEA 5GZAA 3VNTA 3T9IA 2GFSA 5IF1A 3IG7A 4EK3A 4WNPA 2YISA 4IVCA 4DBNA 5J8IA 1BI8A 3ZUTA 5A3XA 5EI6A 2OJIA 1UU7A 2G15A 3ITZA 3O23A 4YP8A 4H3PA 3RKBA 3FJQE 4L44A 5IEXA 5D12A 3NR9A 4WG3A 3E8CA 5A46A 2YACA 3TT0A 3ACKA 4KSPA 3DXPA 2C6IA 4G34A 4AZFA 5EOLA 3IONA 4C36A 2GQRA 3RPVA 4II5A 4OBOA 4QYHA 2WMQA 5BX0A 3VHEA 1A9UA 4YSMA 3ZO2A 3O7LD 3HECA 4E4XA 3PRFA 4BF2A 3KL8A 4ARKA 2R3LA 3HL7A 5L2WA 1ZWSA 3A60A 4FV9A 3UIMA 5HU9A 2W99B 2WD1A 3OTVA 2WTKB 3F69A 3QGYA 4HGTA 4J52A 5L2QA 2R9SA 4HNIA 4XJ0A 5HVYA 4ASZA 5CU4A 4UXQA 3E3PA 3LXPA 3RPRA 5E8TA 5AUZA 3OXIA 3PZHA 5AR3A 5CF8A 2B1PA 3MY1A 3TNWA 4I93A 4KKEA 3BYOA 4RJ6A 4APCA 1ZMVA 1XO2B 2HAKA 4KD1A 4MXYA 3MYGA 2JKQA 4GFMA 4YO4A 3BGZA 2XRWA 3IK3A 4JVGA 3TDWA 4KA3A 3F6XA 4I24A 5FP6A 4FV8A 4FI1A 4CTBA 4FYNA 1H1RA 3IOKA 4RGJA 2CCHA 2Y8OA 5BYYA 1ZY5A 4FT5A 3ZO1A 4CZUA 4ZJVA 3E8NA 2R3QA 2XS0A 5D7AA 2WMWA 1J7LA 2WTDA 4GEOA 3CTHA 5AM6A 3HGKA 3FQSA 3QCYA 4GG7A 5I3OA 4BIDA 3NSZA 4FSMA 4JG7A 5T6KA 2BUJA 2GDOA 3G6GA 4Z9LA 1H27A 3CLYA 3JY0A 3E92A 3G15A 2R3PA 2ETMA 4PPCA 4M7IA 4QMNA 4OTFA 4QNAA 3TIZA 2IVSA 3CPBA 4CFWA 3O96A 3EQCA 4G16A 4PMPA 5L6PA 2R7IA 4FZAB 3RTPA 4RIWA 5HG5A 4TYEA 4PPBA 3DKGA 2YIWA 5JEBA 4CQGA 2WTVA 4FVRA 3F3VA 4BHNA 5IEYA 5DT0A 3SGCA 3D2KA 3Q04A 3EQDA 3HV4A 3GI3A 4AZSA 3R73A 1R0EA 3NUXA 5E1SA 4BWXA 1B39A 2VAGA 3D7ZA 2UZOA 1YHSA 2XRUA 2BKKA 3O7LB 4WOVA 1UA2A 4E5BA 2GQSA 3UP7A 5L6WL 3PPKA 4AFEA 3F5UA 2CLQA 5TR6A 3U4UA 2R3HA 5H3QA 3BZ3A 2ESMA 3S0OA 1WVXA 3V8WA 2BALA 2O8YA 3UIUA 4OTIA 4JG6A 4IW0A 3FZOA 3NUAA 2P2IA 3DKCA 4AN3A 3I5ZA 4BC6A 2OSCA 3SRVA 1Q62A 2YFXA 1Q8ZA 1MRYA 3E7VA 3KMUA 1XHAA 3LFCA 1IASA 1OPKA 3QUPA 5HD4A 2B9FA 3SW7A 1S9JA 4YJSA 3C13A 3IOPA 1OL7A 4FSZA 2G01A 4RZVA 4W4YA 4PMTA 3U6IA 2GPHA 2NP8A 3PSBA 4ZLOA 4FEVA 2C3KA 2JDVA 3EHAA 3RNIA 2F49A 3FZRA 5FUTA 4EBVA 3KXNA 3T3VA 5AX9A 1CKIA 2GHGA 4GW8A 4ZTMA 2YIRA 2UZTA 3R9NA 3UYSA 5AAFA 2RGPA 4QTCA 3UO6A 3PG3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TQI A;  2JAV A;  3C51 A;  5T68 A;  4EWH A;  2ERZ E;  2BDJ A;  3W0M A;  2E2B A;  3PP0 A;  3F9N A;  2JIV A;  1QCF A;  1KUT A;  3C5U A;  4J8M A;  3I81 A;  2PZI A;  2P0C A;  4B7T A;  3R9R A;  3TNQ B;  4GIH A;  4FEQ A;  3V5W A;  2OK1 A;  3ZM4 A;  4HW7 A;  2HZ4 A;  4DTB A;  3N9X A;  3QX2 A;  5EM7 A;  4BWK A;  3K54 A;  4FV2 A;  3I6U A;  4AA0 A;  3W0O A;  3RAL A;  3DZO A;  4WO5 A;  4YU2 A;  2UW7 A;  3K5V A;  4LMU A;  2C5V A;  4IDV A;  3DAJ A;  4XX9 A;  3R8Z A;  4FF8 A;  3VO3 A;  3OY3 A;  3Q5I A;  1PXK A;  3PPZ A;  3E63 A;  4V0G A;  3VQH A;  1BL6 A;  2OIB A;  2B52 A;  3A62 A;  4RFZ A;  1YOL A;  3RWQ A;  2YER A;  3LPB A;  2B9I A;  5E91 A;  3KMM A;  2C5O A;  1FOT A;  3BPR A;  3KMW A;  3R7G A;  4W9X A;  5FQD C;  3WIK A;  2I0V A;  3QCQ A;  4YTC A;  5CAO A;  2C0I A;  3I60 A;  2XAR A;  4D2R A;  2BIL B;  1M17 A;  1XR1 A;  3F2A A;  2PL0 A;  4O0S A;  5A54 A;  2IO6 A;  2I40 A;  2W7X A;  5I9X A;  4M14 A;  2FB8 A;  3MVL A;  4MXZ A;  4PUZ A;  4JOA A;  4RLK A;  4K33 A;  2F4J A;  5CTP A;  1J3H A;  1KE8 A;  3PTG A; 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