3OTVA

Crystal structure of the intracellular domain of rv3910 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
VQLVPGARIANGRYRLLIFHGGVPPLQFWQALDTALDRQVALTFVDPQGVLPDDVLQETLSRTLRLSRIDKPGVARVLDVVHTRAGGLVVAEWIRGGSLQEVADTSPSPVGAIRAMQSLAAAADAAHRAGVALSIDHPSRVRVSIDGDVVLAYPATMPDANPQDDIRGIGASLYALLVNRWPLPEAGVRSGLAPAERDTAGQPIEPADIDRDIPFQISAVAARSVQGDGGIRSASTLLNLMQQATAVADRTEVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A phosphorylated pseudokinase complex controls cell wall synthesis in mycobacteria
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROBABLE CONSERVED TRANSMEMBRANE PROTEIN
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 70
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3otvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3otvA01
4QOXA 3P7CA 2E9OA 5HZNA 4FT3A 3DJ6A 4F08A 4ZSAA 3D0EA 5D10A 1WVYA 3QAME 4LMNA 3AMBA 4HNFA 1VYZA 4M15A 2OF4A 1CKJA 5HG9A 4JBPA 2IO6A 2XS0A 3EZVA 4WNOA 2YABA 4IH8A 4FEWA 4FR4A 5AP0A 2J4ZA 1H8FA 5CASA 1H24A 2X8DA 1SVHA 4FTLA 3V5JA 4EH8A 2VTSA 5JFXA 4FV6A 3QTXA 3S3IA 3GENA 1UU9A 3UO6A 4R3CA 3RBWA 2RFEA 4FI1A 4IHPA 1TKIA 3D9VA 3C13A 2BAQA 4JNWA 4V0GB 3AC3A 4UX9A 5DRBA 2ZMCA 4QMVA 3PZEA 1OMWA 5CLPA 4BTMA 5CSWA 1OPJA 5JRQA 2PHKA 1JSTA 4ZZOA 4JBVA 2G15A 4PF4A 3GFWA 3DAEA 3VAPA 2QO2A 3UDBA 2ETMA 5JMSA 5AUYA 5HO6A 5HLNA 4YR8A 2ZMDA 4AW2A 1MQBA 4KNBA 3KMUA 4KIPA 5KO1A 5HE1A 3TL8A 2ITTA 2PUUA 3BV2A 4GRBA 4LG4A 1PMNA 3C0GA 3FEGA 3UNJA 5ETIA 2H34A 2YN8A 3FV8A 1M7QA 3HKOA 3Q4TA 4RWLA 4X6QC 5AP4A 5AA8A 5L6OA 2PPQA 4NJ3A 2QOBA 4O81A 5AM6A 3PXRA 2C6MA 4R6VA 5CU2A 3QL8A 2WTKB 1K3AA 2ITXA 2XVDA 5KKRC 2UZOA 3BGPA 3QA8A 3NNUA 5L2WA 4X2JA 4K77A 3U6IA 4L67A 3CC6A 5L2IA 4GSBA 5HVKA 2PUPA 3SD0A 4AGDA 3ZO1A 2X7GA 5E7RA 1OL6A 4UB7A 2R7IA 4XCUA 3ACJA 2XEZA 4RJ5A 4M69B 3PIYA 5GHVA 4PMTA 3R9RA 5AEPA 1CM8A 3MI9A 3CP9A 3B2TA 4U81A 5CZHA 1XO2B 2PWLA 3KULB 4EBWA 4GG7A 4K1BA 5T6KA 5AUTA 3JR1A 1DM2A 3QALE 1BYGA 2NO3A 4IM3A 1UU7A 3FLYA 3ROYA 4EKKA 2O2UA 2JDRA 4N6ZA 4TYHA 5E91A 5L8KA 2BILB 1PYXA 3MW1A 5HKMA 5EI2A 3EMGA 5I5ZA 2CKPA 5F9EA 4ZTQA 4L6QA 4AUAA 5IA3A 4AX8A 4FKUA 4D4SA 2H6DA 3OY1A 4FVPA 4D2SA 2VTQA 3PRFA 3FMDA 3BGZA 4ZJIA 5ANIA 4CYIA 5E8ZA 1PXNA 3WZEA 1Q8WA 5CSPA 2WU7A 4I5CA 4E7WA 3SDJA 1TQIA 5IQAA 5A6NA 1YXUA 3SKCA 3PG1A 2P2IA 2QOIA 4P5ZA 1SZMA 2WD1A 2WTIA 4J71A 2BKKA 4FKRA 4TYIA 3FY0A 4Y95A 4GKIA 4BI2A 2UUEA 3BHUA 3PXYA 4RVMA 5I9WA 2OKRA 5C4LA 4O0TA 2C5OA 3UOKA 1M2QA 2ITUA 3LJ2A 4S2ZA 4DFXE 2XM8A 1E1XA 3ZFXA 3NIZA 4CZUA 4YZNA 5IDPA 4BB4A 3KGAA 2A1AB 3F5XA 4X2GA 3W32A 3SX9A 5IQHA 5DT3A 3BPRA 2IW9A 4D0XA 1IEPA 3GXLA 3HUBA 4O7LA 3KCFA 3W1FA 3ZLYA 4WD5A 3LM5A 5CT0A 3QRKA 2CGXA 4DH1A 5CU4A 1XH6A 2CMWA 3CGFA 2C30A 4FMQA 1JNKA 3C5UA 4QMOA 2Y4IB 5I9YA 4FTMA 3OCBA 1DAWA 4NJDA 3PXQA 4RA5A 3SG8A 3Q4CA 3OWKA 4X3FB 4OW8A 2CPKE 4IFCA 4D4RA 1H07A 1PXOA 3F3WA 4FKTA 4L3LA 2B4SB 5H2UA 3ZLSA 4AGUA 2X81A 2OU7A 1PHKA 5M09A 3NCGA 4FF8A 2F2CB 3M2WA 4HGEA 4K2RA 5CEQA 4GYGA 5EG3A 5CU0A 1YOJA 5AAEA 2PUNA 2ZM3A 3RPYA 3NUAA 1PXMA 1OPKA 2DYLA 4RC2A 4BDEA 4OTIA 3T9TA 4JOAA 4XG8A 3LW0A 2R3PA 3ROCA 3HDNA 2OXYA 3WILA 4ZLOA 1G8AA 1IR3A 3G0EA 3I60A 4L43A 3Q04A 4KSPA 2HYYA 2JAMA 5J9YA 4PDOA 4E5AX 4FKVA 5A3XA 3FKOA 3QZHA 4YMJA 4RMZA 3E3PA 4AS0A 3ZFYA 2OZAB 1Q3WA 4NWMA 3TUBA 3B2WA 4UZHA 4I20A 4XJ0A 3UVRA 4XNEA 1ZLTA 1RJBA 1OITA 2H96A 4E6DA 1ZOEA 3OWLA 2Y9QA 3VNTA 5EKOA 1JSUA 5K4JA 4QQJA 5J7BA 2C6OA 3LQ8A 4A9UA 5I9UA 2HWPA 3PJCA 4K33A 4M66A 4QPMA 4BY9E 4ZZMA 5C03A 3R6XA 5EYCA 4BRXA 2C3IB 1OM1A 3FMLA 1FVRA 4FE2A 5IUGA 3ORXA 5C8KA 5DE2A 5EK7A 3T8OA 5JGDA 3MB7A 3ERKA 5LMKA 2R3JA 3DLSA 1GZOA 3C4FA 2WZJA 3COIA 4DGLC 2EB2A 2VAGA 2VWIA 4L7FA 4X6RA 2ZM1A 4ACDA 1OPLA 4U42A 1W0XC 4D2PA 1XWSA 5BVOA 3ANRA 3BCEA 3AC8A 3Q60A 1HCKA 2GS6A 4G6OA 4M13A 5E1EA 4CKIA 2QOFA 4DH8A 4FTTA 3CKWA 3EQCA 5M08A 4O2PA 1GJOA 2QO9A 2C5XA 2AUHA 4IAFA 4L42A 4MNEB 1MRUA 3ACKA 3AMAA 1UA2A 4EK5A 3TNHA 3D7TB 3ENMA 2BAJA 1VYWA 2WMQA 1YXSA 2P33A 1JWHA 3OXZA 2ZAZA 3IKAA 5EHOA 5J7HA 3IGOA 3BE2A 4FV5A 5CQUA 1KE9A 2WTCA 2O3PA 3VBWA 3R1YA 2XNEA 1ATPE 3WF6A 1QPDA 3RCDA 3PPZA 4QMUA 3F66A 2AC5A 4EOPA 3C7QA 2PYWA 4HYSA 4F9AA 4JAIA 4DTKA 2GDOA 4O7RA 1H0WA 4FTNA 3WI6A 4C4GA 1T46A 3CTHA 3CJFA 5HBHA 3F88A 1FVTA 3LLAA 1MP8A 1H00A 5GIPE 2BRHA 4L45A 2X4ZA 4XS2A 5FD2A 2V5QA 2XIZA 4OGRA 3QHRA 4BCQA 4R7HA 3H9RA 4FV1A 4ZSJA 2CKQA 5LVPA 1SVGA 1LR4A 3DOGA 4MVFA 3E92A 3RKBA 2J50A 3RWQA 5KZ0A 5CAUA 4O96A 3FKLA 3NDMA 3VS5A 3ZUTA 4MBIA 2R3NA 5KHWA 5HD4A 4LUDA 2J0MB 3BBTB 2B7AA 2JC6A 3HV6A 3DAKA 4OTHA 3WE8A 3ZSIA 4BCOA 2WTWA 4I5HA 2UZDA 2W7XA 4E5BA 4RVTA 4D9TA 3MTLA 2ZVAA 4R5YA 3FI4A 4G6NA 2IZTA 4EONA 1YHSA 2XYNA 3MS9A 3BHYA 3D5UA 2J51A 4DCAA 3Q5IA 4GW8A 3P78A 5FTQA 1Y8GA 2XNPA 4RSSA 4IVBA 5L2QA 2W06A 3NLBA 4CLIA 2QODA 1WBTA 2WIHA 4ANOA 1E9HA 3OEFX 3P23A 3ORPA 4UYAA 3ZU7A 1O9UA 3ANQA 3JVSA 5DNRA 4XP3A 2F7EE 4JRVA 4AF3A 4DFZE 5IA4A 1PXLA 5HICA 3EFJA 3OTVA 5A4LA 3Q2JA 4BGHA 1Z57A 5LMAA 5DGZA 4B8LA 4BIDA 1G5SA 5ACKA 3A60A 4B4LA 2Z7RA 3QKMA 2VGPA 2WEIA 5EDPA 5EYDA 3ETAA 4F1TA 2OI4X 1G8SA 3KK9A 3LIJA 3WZJA 5AP1A 2VO0A 3N9XA 3AXWA 4NU1A 2NNWB 2FGIA 1KSWA 4C38A 3MPMA 1FINA 2GTNA 4BDFA 5CEMA 3HUCA 2NRUA 3VUGA 4LRJA 5IA2A 5KKRB 4ZY5A 3Q6WA 1H1PA 5GNKA 1SMHA 3RINA 5HO7A 4CGAA 1WBOA 4KKGA 1VR2A 4M14A 4KWPA 2DWBA 5C8MA 4IMYA 1UNGA 4ZK5A 2QQ7A 4UYNA 2W1ZA 2XK9A 4W9XA 2QOKA 4D2VA 5E92A 4BDBA 4OAVB 4H1MA 3R8PA 2J5FA 5CF4A 3KXNA 3SRVB 3OP5A 3QHWA 4QTBA 3NUUA 2W4OA 4A06A 2YCFA 2PZYA 1Q5KA 5HESA 3RPSA 3HP2A 4IJPA 4E20A 3ODZX 1KOAA 3PE1A 3C4WA 4IE9A 1M2RA 1Y8YA 3AD5A 4JDHA 4M0ZA 4QTAA 3BV3A 3G9LX 4OUCA 3DTCA 2R3RA 3RI1A 4I0SA 3AT4A 4HPUE 2YIYA 3LFNA 4X0MA 5CQWA 4E73A 4IVAA 3VW6A 4AW0A 3OUNB 4JIAA 2PVNA 4AZSA 1VJYA 3PVWA 4F0FA 2W5HA 4NIFB 3EN5A 4P90A 3K3JA 3WF8A 4F9WA 5CI6A 4CFMA 3ZC5A 3QTUA 1NY3A 3VS1A 1JKKA 1LEWA 4WNKA 4MHAA 5HU9A 3FWQA 2X7FA 2B0QA 1V0BA 4ZS0A 4JBOA 4Y83A 2R9SA 2HW7A 3LVPA 3Q5ZA 4FTQA 2B52A 3D7TA 3E7OA 1Q97A 3E62A 4WOVA 3R9HA 2RFDA 4GFOA 4Z55A 4NTSA 4EOJA 2CGVA 4TYEA 4QP7A 3NUPA 3A4OX 4FVQA 3V6SA 4D1XA 4YJVA 2XZSA 2X9FA 4AAAA 4Z7GA 3PSBA 1Z5MA 3ZHPC 5AAGA 5HBJA 4G3GA 3R02A 1Q8TA 3MIYA 4A7CA 4BZDA 2OZOA 4JI9A 2VWBA 3FLNC 5J8IA 5TO8A 3RK9A 5AAFA 3UVQA 3OHTA 4KRCA 5CAPA 5AR5A 1W8CA 3GC9A 4KA3A 3BLQA 4EK3A 1ZYDA 4OR5A 4JBQA 4R7BA 4HNIA 3O8UA 2YAAA 2A2AA 3FZOA 2Q0BA 4WO5A 4CFFA 1Q8UA 3Q53A 3AC5A 5GINE 3QRIA 4DG3E 3HMMA 3V8WA 2GFCA 2QCSA 3UC3A 4AA4A 3MVHA 4OTGA 3LPBA 4UN0C 5IDNA 3F2RA 1OKWA 3BQCA 2JD5A 4EH9A 5ETCA 3C0IA 2DQ7X 5F95A 4RIYA 5I3RA 4WNMA 5AV1A 4EORA 3LMIA 5H8GA 2XJ0A 2WIPA 2PVFA 2UW8A 2WQEA 3EQIA 4LV5A 4FTIA 3R83A 3VF9A 2PVJA 5KCVA 3U87A 2GHLA 4FYNA 2ITVA 5E8XA 3NZ0A 3PY1A 5CENA 5IG1A 4FV0A 4W4VA 3MFUA 5E1SA 4AA5A 4QP4A 4GUEA 2VTAA 2C6EA 5M06A 5LARA 5BQ0A 4G2FA 4FOBA 4B99A 1YDRE 4FICA 1I44A 4CZYB 1WBSA 4NEUA 5ANJA 5I9ZA 3MIAA 4MQ2A 4G3EA 4NK9A 3TJCA 2XUUA 4CKJA 3W2QA 4KAOA 1UV5A 2ITYA 1XQZA 1PMUA 1ZYJA 4U6RA 2OLCA 2Z7LA 4JX7A 4YBJA 3ZUVA 2WTKC 5LMKC 3ATSA 4R3PA 3BU6A 3V04A 2OFVA 5J1VA 2WMRA 4CXAA 1XJDA 2X0GA 2GPHA 2V55A 4BKJA 2IG7A 4HVGA 4QP9A 1YKRA 1OI9A 2W4JA 4BYIA 3UZTA 5AV0A 2EU9A 4O7WA 2XKDA 3QCQA 3UQFA 4F7JA 4RPVA 5F94A 3CKXA 2JFLA 2OJGA 3CEKA 5HEZA 3ORKA 3OC1A 2ZM4A 5KMLA 5LVLA 2FB8A 4YLLA 3SG9A 3MB6A 2ZV9A 2ETRA 3D94A 4A9SA 3R8UA 3Q6UA 4PWNA 4UMQA 4PP9A 2W1GA 3R8VA 3BZ3A 4G17A 2WTDA 3UIBA 3CXWA 2YLEA 3BU3A 1IA8A 2UZNA 3E87A 4EOOA 1H25A 2R0UA 4OLIA 4IDVA 3UG1A 5I9XA 3QUPA 4EH7A 1J7LA 4XG9A 4F7LA 2R3KA 4RFYA 3WZUA 2W9ZB 3R73A 1OIQA 3H30A 3PJ8A 5BVKA 4OTQA 3TN8A 5AX9A 1S9JA 4KBKA 3EJ1A 4RJ8A 4CCBA 4YGAA 4HVDA 3VBQA 2CCHA 4MWHA 3ZYAA 5FDXA 2WOUA 3OG7A 4E4NA 4KSQA 4C33A 2PVKA 3LFQA 2C0OA 4GCJA 5DMZA 1URWA 3FLZA 4FUYA 4QRCA 2YWVA 3PPJA 3R28A 5HIEA 3MFRA 3VS7A 3R9NA 3T3UA 1PY5A 3PG3A 3VBXA 4C2WA 2C68A 1DI9A 3NYXA 2GQGA 3B8RA 3L8VA 3QLGA 4HGLA 3WIGA 4F1OA 2Y6MA 4USFA 1VEBA 3QGYA 4PY1A 4W8DA 4ASXA 4K9YA 3MVJA 3I7BA 1WMKA 4C3FA 4I6QA 3HLLA 3DFCB 1ZRZA 3LCDA 4IX5A 4BDKA 4E6AA 2UZUE 4MTAA 4F64A 1FBNA 3TG1A 4PNIA 3FI3A 3VS2A 5A4EA 4RZVA 4IVCA 4X3FC 4EOKA 1BUHA 5I0BA 3WF9A 1WCCA 3IGGA 5HI2A 3RPVA 4EOMA 5CU3A 4HOKA 3OROA 4I6BA 5CNNA 1O6YA 5BUJA 2PZ5A 4FSUA 1YI3A 4P2KA 4GH2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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