3OXIA

Design and synthesis of disubstituted thiophene and thiazole based inhibitors of jnk for the treatment of neurodegenerative diseases
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
355
structure length
322
Chain Sequence
NQFYSVEVGDSTFTVLKRYQNLKPIGSGAQGIVCAAYDAVLDRNVAIKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLMKCVNHKNIISLLNVFTPQKTLEEFQDVYLVMELMDANLCQVIQMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGVTRYYRAPEVILGMGYKENVDIWSVGCIMGEMVRHKILFPGRDYIDQWNKVIEQLGTPCPEFMKKLQPTVRNYVENRPKYAGLTFPKLFPDSLFPHNKLKASQARDLLSKMLVIDPAKRISVDDALQHPYINVWYDPAEVREHTIEEWKELIYKEVMN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design and synthesis of disubstituted thiophene and thiazole based inhibitors of JNK.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 10
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 322
sequence length 355
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oxiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oxiA01
3VS7A 5AX3A 3NUXA 1L8TA 5CALA 4JX7A 2FUMA 3RK7A 4DEDA 5IA0A 4X2JA 2CPKE 5HVKA 3VS1A 4I41A 4D1ZA 1IA9A 3DAEA 4FKGA 5J79A 3VC4A 4OTDA 2C5NA 4QNAA 4L7SA 4CMTA 4F6UA 2VTTA 1H1PA 2E2BA 4GFGA 2PMOX 4MH7A 3NEWA 5JRSA 1H25A 2W1ZA 4X2NA 4CRLA 1V0OA 5CXHA 5BVOA 3FMNA 3Q4TA 3TTJA 2F7ZE 4NTTA 1H8FA 3TIYA 4ITIA 4N6YA 3AGLA 3ORLA 3QTQA 5HE1A 4U8ZA 2DYLA 5D9HA 2CMWA 2UZUE 1BLXA 3BLRA 1U5QA 2WTKC 3FMLA 3FY0A 5AIKA 3RAHA 3SW7A 1LEWA 2VNYA 3CP9A 2ZYBA 3KA0A 4FNXA 4OAVB 2W1DA 2B55A 5KBQA 3C4XA 4BDGA 1UU7A 4F70A 3OF0A 2XJ0A 3RK9A 4WBOA 2BTSA 1QPDA 2WMQA 3HYHA 4IB1A 4S32A 2C3LA 4FIJA 3NUUA 1BX6A 4FKRA 4BB4A 2XM8A 3PIZA 2BRMA 3DXQA 3KXXA 2C6OA 2YITA 3R73A 5B0XA 3UE4A 4D58A 4DA5A 3MN3A 5H8EA 4PRJA 4ANSA 3OOGA 4YZCA 2XIXA 3ZCLA 4JNWA 1E1XA 5CEPA 3HMIA 4JDIA 4R7IA 4UBAA 3KU2A 3EZRA 3MFTA 3NIZA 5CZHA 3SAYA 2C1BA 2W1FA 4YURA 3V5LA 3OOMA 4W9WA 4ZTRA 1M7QA 2YZAA 1SYKA 4H36A 4G5JA 4L00A 4C3FA 1XH8A 5K3YA 1H07A 4FVRA 1XH7A 4NT4A 4OW8A 3RINA 3HV7A 2EVAA 4USEA 2YLEA 2OXXA 3QQHA 5AP6A 5ITAA 4YLKA 3OCGA 4ALUA 3W2QA 2X8IA 3RPVA 4HYSA 4ARKA 4FKSA 1O9UA 4EOMA 4GT5A 1FMOE 1YDTE 4FV9A 4HVHA 1Q4LA 1CMKE 1J3HA 2GHGA 5T6KA 2PYWA 4JQ7A 4EH8A 4L3JA 4N4SA 3TNWA 3HECA 4R3RA 4CYJA 3DOGA 2VTPA 4TNDA 4JLCA 3VJOA 4BF2A 1FVTA 2AUHA 3FUPA 3MVJA 5L6WL 3L8VA 3ZSHA 3LOKA 3R8MA 4E20A 2VUWA 5K4JA 5AAEA 4FSQA 3ZSGA 3DY7A 3QQFA 2XKCA 2ERZE 2Z7QA 3ZBXA 4DH1A 4XG8A 3R00A 2XUUA 4GK4A 1ZMWA 2YCFA 3KRRA 4C4GA 4BZDA 2DQ7X 2YZLA 5LWNA 1E1VA 3EN6A 2J50A 4G31A 4JRNA 4FTQA 5E8WA 1BL6A 1FVRA 4O0SA 3COMA 2ESMA 2PTKA 5H8GA 5GZAA 2B53A 5DRDA 4C36A 3R0TA 1WFCA 3OY3A 2P0CA 4V04A 3FXWA 4O2PA 4XLVA 3E7VA 4D0XA 2PUIA 2CGWA 3I4BA 3GENA 2WD1A 2YIQA 2JAVA 5EQPA 4ZTHA 2C5VA 4RIYA 4HPUE 5IZFA 5IKWA 3LCKA 1ND4A 4GEOA 3HV3A 2GCDA 2JFLA 1PJKA 4KNBA 4IEBA 3BGZA 3UC4A 4ZLOA 4BBEA 4BN1A 4UYAA 2BDFA 4QMTA 4CTBA 1UKHA 2VNWA 1PXLA 4BVUA 2R3OA 5DMZA 3IW8A 4I6BA 4AQCA 4DFNA 2CLXA 5AEPA 2ERKA 3OCBA 4ACCA 5L2SA 4TYHA 3SW4A 2X81A 3OEZA 4AT5A 2GNIA 5ANIA 3OWPA 3LKMA 3FQHA 4IWQA 5H2UA 2C6IA 4XG4A 3PLAE 2C6TA 3F5PA 2VTMA 3FL5A 3A7JA 2R3PA 3EH9A 4FX3A 4FV0A 2VRXA 4F6WA 1E9HA 2B1PA 3V04A 4D9TA 4KKHA 4RIYB 4FYOA 2WEIA 5HCZA 5J7BA 2QURA 2V7OA 5DBXA 1ZMUA 4EBWA 3EQDA 3NYVA 2Z7SA 4HOKA 5HNBA 3RNIA 2ZM4A 4K8AA 3ZYAA 3U6JA 3TKHA 3NUNA 4H05A 1WBOA 5M55A 4CV8A 1PXNA 4PF4A 5FD2A 3LQ5A 2OJ9A 4IE9A 3MJ2A 4IQ6A 4P4CA 3TDVA 3QD0A 3DT1A 3SA0A 4FIGA 4PMSA 4TYHB 5KCVA 4ASEA 1IAHA 1ZMVA 2HOGA 5CWZA 5E8SA 2RSVA 5E8YA 3FMMA 3OCSA 1GZNA 4HCTA 2WQNA 3RZFA 4Z7HA 3L8XA 3BCEA 5LMBA 5I0BA 1NW1A 4YO4A 2X8DA 3FLQA 2YDJA 5HHWA 3UQCA 3O8TA 3AD4A 5AR8A 4YSMA 4F7NA 5J1VA 2VWXA 4QYGA 4IM2A 2C6EA 2GTNA 3VS2A 3NVMB 2UVZA 5I9ZA 2W05A 3KB7A 4FSRA 4WNKA 5FXQA 4OTGA 4GK3A 1Z9XA 5C4KA 3D5WA 3WZEA 4FYNA 4CT1A 3EN5A 4EH7A 3QCSA 1RDQE 1RW8A 1WMKA 5IQAA 5AIRA 3FMJA 4QMMA 4YPDA 1H00A 5CASA 3VBQA 4K2RA 4OBQA 3NAYA 1PXMA 2ETRA 4YTFA 5A3XA 3HP2A 5ETAA 4DTKA 4FV7A 3JY9A 3CTQA 4RIWA 2XIRA 1UKIA 3P4KA 5IQGA 2YIWA 5EI2A 2J0IA 2WPAA 4U43A 3C51A 3KMUA 4FKQA 4JRVA 4F0GA 3EFKA 1OITA 2ZV8A 4I6HA 4U5JA 3CGFA 4CXAA 5CQUA 3MY5A 5IQDA 2CKQA 2B9HA 4FTJA 5DE2A 5CAVA 2GQRA 4CLIA 4BIBA 3PP1A 5KE0A 4DH5A 4E73A 4IBMA 4C0TA 1XWSA 4KIOA 5IQFA 5FTOA 5JZJA 2HYYA 1OI9A 2JKQA 2WTVA 4MD7E 4RT7A 3E88A 3VULA 5K0XA 4O7VA 5A4CA 4CQEA 2R64A 2F4JA 3GCPA 3QYZA 2CNUA 5ANDA 4FKIA 4FTAA 5HE0A 4RIWB 3EB0A 3PTGA 1GIJA 3SQQA 2G9XA 2RG5A 3BYUA 4F9BA 3W2PA 2XNOA 4FT3A 3KXZA 3NRMA 4GFMA 5LCKA 5EYDA 1Y91A 4XOYA 4C7TA 1PW2A 2QU6A 5DGZA 4EKKA 4BGQA 1REJA 1T45A 4FKWA 2XF0A 3V5TA 1UWHA 3ZM4A 3NW5A 3KKVA 5I5ZA 5ETFA 1JNKA 3W8LA 2VTSA 5HGIA 3ZXZA 3SGCA 5GIOE 3C4FA 2PU8A 2YHVA 4FA2A 4ZS0A 1G8SA 3U51A 3R63A 5IISA 5AP3A 1GZOA 2XYUA 4E5WA 4RGJA 1UA2A 1GZ8A 4RA4A 2VGPA 2WQBA 2QOIA 3KK9A 3UJGA 3UNZA 4WNMA 5C4LA 5HIEA 3EL8A 4YZBA 2PE1A 2O64A 5J95A 4EH6A 4EK4A 5AM6A 4FBXA 4U3ZA 4BHZA 1OVEA 1GY3A 3R8PA 1YDRE 5BNJA 4CKJA 5HD4A 1KV1A 2ETKA 3Q04A 1U59A 2HAKA 1IA8A 3A7FA 4I5PA 3K3JA 3FI3A 4D0WA 5HIBA 3NWWA 4C4IA 4Q2AA 4DEIA 5FGKA 3LMIA 4M0YA 4F1MA 1IEPA 1J7IA 5JFSA 3PP0A 2HXQA 4MEDA 2HW7A 2WFYA 4A06A 4C34A 4EBVA 5C8KA 3DLZA 2QR8A 3VJNA 4JX3A 3FXZA 1IAJA 4FTCA 4LFIA 3BEAA 3DBFA 1SNUA 4O21A 4EZ5A 4X7QA 3M42A 4B0GA 1RJBA 2F9GA 2IWIA 2Y7JA 2OGVA 3FMDA 4A9RA 5LJJA 2PVFA 3D0EA 3LJ0A 1YI3A 2BPMA 1KE9A 4C37A 2YACA 4IAKA 5ANGA 4GS6A 1Y8GA 4FV3A 5D11A 4DFXE 5IH4A 5C01A 3ZMMA 3BIZA 5AUZA 3I60A 4S30A 2X4ZA 4FGBA 2XK8A 2HZ0A 1OL6A 4C4EA 4FNWA 4MD8E 4YHFA 1OPJA 2ZB1A 4HZSA 4LGDA 4U42A 1OL7A 1YWNA 5DNRA 5L4QA 5CVFA 5JN2A 2CCIA 4WA9A 3CCNA 4FMQA 4YC6A 4LOOA 4IACA 4Z7GA 3ZHPC 5HKMA 4C58A 5A14A 3F2RA 2W17A 3EQRA 2WTJA 4DH3A 1H4LA 4GW8A 5FDPA 5M53A 3O8PA 4FK3A 5CENA 4IANA 4RSSA 3RAIA 1SZMA 4L46A 4ASDA 2HZ4A 2YIRA 1GNGA 5JFVA 2XK6A 2PHKA 5IUGA 3ZFXA 3EFJA 4AOTA 5EHLA 2WXVA 2X39A 2VTAA 5AV2A 4I1ZA 3QGYA 4YJVA 2Q0BA 4BCJA 2W1GA 4JBOA 5A4QA 1KUTA 5EYKA 5BYYA 5E4HA 5HBHA 4S34A 4DEAA 2EB3A 1YKRA 2W1EA 3R8ZA 2JIUA 4GKIA 4XG7A 2C5YA 4F9WA 4XV3A 4BTMA 3SD0A 3O0GA 2ZB0A 3LMHA 3QZHA 3QYWA 3F66A 2P55A 2R3KA 4O1PA 4DTAA 4G2FA 2ITOA 4EJNA 2BUJA 3WBLA 2J0LA 2WMXA 4PMMA 4E5BA 4EK6A 5AUVA 2XIYA 1PKGA 3Q32A 2VTIA 3V6SA 4RA5A 1SVGA 1W82A 1AQ1A 4TWOA 2VX0A 1JKTA 4ZIMA 2YDIA 4I0SA 4PDOA 3KULB 3SOCA 3WF5A 1YW2A 3NW7A 1H1QA 5JKGA 4CZUA 4I4EA 4EH4A 4C59A 3A8XA 3BYOA 1Q24A 4Q9ZA 1I09A 3VHKA 1QMZA 3UODA 3VHEA 3V8WA 3TWJA 4RQVA 4QYHA 3QHRA 4FL3A 2OWBA 2PVRA 4RLLA 1PF8A 1UNHA 3C50A 2GQGA 2UW6A 4QMOA 4WG3A 4BICA 4ERKA 4Z3VA 3I7BA 2OFVA 2XNNA 4Q5EA 1G3NA 1OUYA 4CFMA 4BTFA 3BQCA 1BMKA 3DBDA 3ZEPA 2YAKA 1TQIA 3IOKA 2CCHA 5D7VA 3NS9A 2QO2A 3SX9A 4O7RA 3CD3A 3UO4A 4RWIA 4OT5A 3SHEA 2JDRA 2C47A 4MF0A 1R0EA 3HV6A 4APCA 3TDWA 1H26A 2F2UA 1TKIA 4X6RA 4HVIA 4I92A 4EOOA 1JWHA 3RM7A 1JSTA 1YXTA 3NDMA 4KWPA 4AGCA 5BMMA 2FH9A 4FOCA 4RC4A 4LV5A 3N51A 2F7XE 3QF9A 4AA0A 5HORA 4BCMA 5DRBA 1ZRZA 4DT8A 3HDMA 2A0CX 1EH4A 1JQHA 3BKBA 3KMWA 3ZO3A 1JOWB 2W1IA 2R5TA 3OWJA 3EQPA 1IASA 3BLHA 4FV5A 2I0YA 3OWKA 1KV2A 3GB2A 2Z8CA 5E8XA 3OXIA 1ATPE 3ALOA 4YP8A 3A99A 2XB7A 4KUJA 4IB0A 3MVHA 2JDOA 2WOTA 3FBVA 2IZRA 2QVSE 4V0GA 3HMOA 3QU0A 5ANOA 2ITXA 1R0PA 3I5NA 5TO8A 1B39A 2PZPA 3GUBA 2W96B 3AD5A 2W0JA 5HCXA 4IAZA 2C0TA 4TYIA 3DBCA 4I21A 2X2KA 3CEKA 4OBOA 3NGAA 4IFCA 2YWPA 1YXSA 4ONAA 2VO6A 2I0VA 4RJ7A 2X7FA 2CGUA 4OBPA 3EN4A 3HDNA 3Q5ZA 4NTSA 4Z9LA 2HENA 4UB7A 3RI1A 2BAKA 4EORA 1YWRA 1REKA 4YBKA 3FAAA 3EYGA 3FSFA 5FM3A 4CQGA 2UW9A 5CF4A 5A4TA 3U4UA 4NUSA 4II5A 4M68A 5EM5A 3RGFA 1W84A 1H24A 1XJDA 5HNIX 4FKTA 5IEVA 4MQ1A 2ITZA 3CR0A 3P86A 4V0GB 5E8ZA 5EM6A 4EOLA 5HLNA 4FEVA 2R3NA 3ZO4A 5DWRA 4PV0A 2QO9A 4G3EA 5JGAA 2BRHA 1FGIA 3JXWA 4EQUA 3BHYA 5BYLA 2C5XA 1LP4A 4QP7A 1OKZA 3DBQA 3MFSA 3FZOA 4J71A 2QOKA 3FWQA 3AOXA 3LCDA 3S95A 3TZMA 5AV1A 2WIPA 5IA2A 3MV5A 4R3PA 1YRPA 4JBQA 4FK6A 2YM6A 4WRSA 3S1HA 4L01A 4YTHA 3P5KA 4PDSA 5IA3A 3S3IA 1BL7A 3G15A 4YJRA 3QRJA 3Q2MA 4YJTA 2VWYA 3D5VA 3VBTA 4ERWA 3LVPA 5EM7A 3EQIA 1YHWA 2YISA 3PJ1A 3VUKA 4EOSA 2ETMA 4M15A 2BAJA 4R5YA 1MP8A 4FICA 4EJ7A 4MHAA 4W4XA 4HYIA 4I3ZA 3ZRKA 1YXXA 2XK9A 3S00A 3Q4UA 2W4KA 1MRUA 1OPKA 2YM4A 4FL1A 3G90X 2E9VA 1OIYA 4FSNA 4MTAA 4O0VA 5BYZA 3CQEA 2YABA 1UU3A 2WTCA 4YMJA 4AGUA 4ANMA 3HZTA 1K3AA 3NYOA 4XUFA 3AG9A 4WSYA 5CLPA 2Y6MA 3IECA 2IW9A 2A2AA 3QAME 4ENXA 4QMPA 4RZVA 2RFEA 1J91A 4G5PA 5C9CA 3U87A 3PIYA 2W4OA 4QYYA 3DTWA 2BFYA 3DA6A 3G9NA 3BRBA 4IJPA 3RM6A 3GCUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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