3OXTA

Human camp-dependent protein kinase in complex with an inhibitor
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Fragment based drug design on PKA
rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2010-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oxtA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oxtA02
4XNEA 4EH5A 4XCUA 4ZJJA 5DA3A 2YIXA 3R9OA 4E7WA 4AUAA 3Q32A 2WEIA 2G2IA 3ZOSA 4G34A 3FBVA 4FV9A 2X9FA 4BDAA 3BYUA 2FB8A 3FLYA 1VR2A 1SM2A 3JS2A 3PXFA 3W1FA 3GCPA 2OI4X 3A7IA 2ZVAA 3ZEWA 2PUIA 3BI6A 3GCVA 5T6KA 4IBMA 3QCXA 2XK8A 3MVJA 3LQ5A 3II5A 4G16A 1H25A 3T9TA 3V6SA 3NVKI 3ODZX 3P78A 4A7CA 1OPJA 4G3GA 3LLAA 4FV6A 1R78A 3V01A 1UWHA 3CS9A 4OTIA 2YM5A 3RJCA 4L3LA 2QU6A 2GFSA 4MEDA 4JRVA 2X39A 4QNYA 2YM7A 3BBWA 2J0IA 3PJ3A 4R3CA 4D5KA 1Y6AA 4GKHA 4AW0A 4QMSA 1CKJA 3IDCA 3ETAA 4HYHA 4CMOA 1H1WA 5AA9A 3SDJA 2FYSA 3E87A 2OZAA 4GIIA 3EQPA 3QX2A 3PVGA 2X8IA 4AACA 1XJDA 2VRXA 3A4OX 3CKXA 4QP6A 5F94A 5K9IA 2PZPA 2WMQA 5M53A 1OL1A 1UNLA 1YXSA 3BLQA 4OW8A 5DVRA 3ROYA 4PY1A 4ZJIA 2WTVA 4FV7A 3UOKA 4KIKB 4GG5A 2WEVA 5EKOA 3RPYA 5JZJA 4KS8A 1GZNA 3EN6A 3ZS5A 4PMPA 1PXJA 4GFMA 4HGLA 2F2UA 4LQMA 2VTHA 4FEXA 4B6LA 4QYGA 2G9XA 4HGTA 5CYIA 1JSVA 3RWPA 4LI5A 5HORA 2J5FA 3QQJA 1SMHA 5HG5A 2VV9A 3UVPA 2H34A 1B39A 2CDZA 5HG7A 3RBWA 2BTSA 2PYWA 2VTQA 3A7JA 4MCVA 2E9OA 3C5IA 4DCEA 2UZWE 2PHKA 5L2IA 3BE2A 3HKOA 1PMUA 3Q2MA 4JR3A 3Q52A 3HV7A 5DT4A 3HMIA 4ZS0A 4ANOA 4NCTC 1LP4A 2BRNA 2R3PA 3DCVA 4D5HA 4HVIA 3PSDA 2UVZA 3NNVA 3QHRA 4RLLA 3IG7A 5EH0A 3ZFXA 5L8LA 3OFMA 4TXCA 4U9AA 2IVSA 2UW7A 1NT2A 3PPJA 5AUTA 3NMUF 3AT3A 4PL5A 2CKOA 4UMTA 3I79A 5CAPA 3GP0A 4AW5A 2FO0A 3C4ZA 4NJ3A 1J3HA 3BQCA 3F3UA 4FUXA 4IB1A 4U3ZA 1E9HA 3POZA 5HE1A 3Q9YA 3UVQA 2VO7A 4A9YA 3UG1A 4QP7A 4JI9A 2HK5A 3P79A 4L7FA 3M42A 2B9FA 5H8BA 4O27B 4I6QA 4Z16A 4ZZOA 4BCQA 2Y0AA 5HEZA 3UNZA 4PTCA 4O38A 5FP6A 4TYHA 3UZRA 5JQ5A 4FNYA 4FKJA 4K1BA 1WVWA 5A9UA 4RC3A 5AIRA 4BIEA 3D7TB 3LCSA 3LOKA 3LJ0A 3ORNA 4BRXA 5KMLA 4UN0C 4NT4A 1R3CA 2OG8A 3CJGA 4XV2A 3D9VA 3OW4A 4C4JA 1OKYA 2VWIA 4OTFA 3UNJA 2R3LA 4G3EA 4IJPA 1OVEA 1MP8A 3MB6A 3ZLWA 4AE9A 4AZEA 2OF2A 4EQUA 1KSWA 5CXHA 2PZ5A 3HAMA 4RRVA 2JDOA 1GJOA 2V22A 3IKAA 3SW4A 2VTJA 4QO9A 4O7ZA 4PNIA 4XP3A 4GT4A 4I24A 1SVGA 2XNPA 3CP9A 3EL8A 4S30A 2G2FA 3MH3A 5M4FA 3A2CA 4Z7HA 1PXPA 3Q9XA 4GJ2A 3C9WA 3IOPA 3ZO4A 4AZWA 3F3ZA 1YI3A 4LOQA 5HHWA 4X3JA 3GU6A 4DT9A 2C69A 2EXEA 5KCVA 5CU4A 4KIKA 2UZUE 2OJGA 4JT3A 4H05A 3QX4A 2J4ZA 3ZUTA 3LM0A 4K8AA 5BX0A 2BUJA 5A4QA 5HLNA 2OH0E 2QO7A 2WTDA 4FSZA 4K0YA 5CSVA 3V8WA 3TCPA 2GDOA 3E64A 4WIHA 5L8JA 2QOLA 4ZIMA 3ZONA 3ZXTA 4BDKA 4HVHA 3FPMA 2J50A 4OTPA 5IUIA 3GCSA 4IZ7A 4IW0A 5DR2A 4F0GA 4PMSA 4M14A 4USEA 5L2TA 5E91A 2VD5A 1JOWB 3BGQA 1OKVA 2ZM4A 3E92A 2HY0A 2YZAA 4LM5A 4QP1A 1KUTA 1DS5A 1PXIA 2C6KA 4RJ4A 3UOHA 4DGMA 4G3CA 2CJMA 1Q3WA 3R01A 2DWBA 5ANEA 4WBOA 2JKOA 2HIWA 3Q5ZA 2JITA 3Q60A 3GC0A 4CFWA 3BU5A 1M2RA 3QBNA 3R9NA 3H9OA 4BTMA 1YXVA 4JJRA 4BC6A 4GRBA 3F3VA 3EOCA 5I9ZA 2BZHB 3OXTA 3UZPA 3HP2A 3GU5A 2GHGA 1M14A 3S1HA 3RALA 1SVEA 4NFNA 4XJ0A 3SXRA 2XNBA 4BDJA 2F9GA 2C6IA 2H6DA 2OJFE 3QFVA 1ERKA 5M51A 4DFBA 3P86A 4Y5HA 1YXUA 2RKUA 2C30A 3BEAA 2CGVA 3QA8A 5C27A 4DITA 1XBCA 4CFNA 4EBWA 2JFMA 1PXOA 1PXNA 2UZNA 4BGHA 4DGLC 4ZMFA 4X2JA 4BTJA 5L2WA 2XJ1A 2UW8A 1CTPE 1GIJA 1K9AA 4QP4A 4BZNA 2UZEA 4E1ZA 1Q62A 3CLYA 4RVKA 3ULZA 4EH9A 3ELJA 3E88A 4RIXA 3NUPA 3EQHA 4ZSGA 1OPLA 2QLUA 1GNGA 2WMVA 4FKVA 4CNHA 3CY3A 3UTOA 3C4XA 2IWIA 3VULA 2CKEA 2ITUA 5F95A 3RWQA 5JKGA 5BVOA 3ID6C 3POOA 1Q8UA 1P4OA 5ETAA 5EM5A 4FNWA 4TTHB 1ZZLA 4GUEA 2WMAA 5IUGA 4PDSA 2ERZE 3B2TA 4UY9A 3D7TA 2B1PA 2E2BA 4F6WA 5CU6A 3DJ6A 4A9RA 4UWYA 3RINA 1ZOHA 4R8QA 1UU7A 5AMNA 4XG2A 3WZDA 4E6DA 2QOHA 4F63A 4E3CA 2PVKA 3ZRLA 2XIRA 4ITHA 3KVWA 3A99A 4JDJA 5AX9A 1K3AA 3LFSA 4HZSA 4YZNA 4MF0A 3DPKA 3E3PA 2C6TA 2V0DA 3F82A 3G51A 3QRTA 4B9DA 2VAGA 1XH7A 1H24A 5JZNA 3VJNA 4RGJA 3UIBA 3MTFA 2AYPA 3BU3A 2ZAZA 2E9NA 4P90A 2W0JA 4GYGA 3LQ3A 4FVRA 4ONAA 3OTUA 4AWIA 1LPUA 5J7BA 3IQ7A 4JG6A 2R2PA 4YPDA 3I6UA 4TYEA 1Y91A 3CIKA 3I5ZA 2BFYA 3HL7A 4MD9E 4Q2AA 4FKIA 3TI1A 3QXPA 3KULA 5IQGA 3BHTA 4L3PA 5AFVA 3CC6A 3SGCA 2C5YA 3GU8A 2QO2A 2JEDA 4G1WA 3AOXA 1REJA 2G1TA 3HDNA 4E4MA 3R1QA 1FOTA 2W5AA 3Q4TA 4U8ZA 1JQHA 1WBOA 5CAUA 4IAFA 1KWPA 4GEOA 3R2YA 4I1ZA 4FODA 3G33A 4GU6A 2VUWA 2HWPA 3FZTA 2XCKA 5EG3A 4D2WA 4D4VA 4QTAA 3UYSA 3ZTXA 2JGZA 3PP1A 3D0EA 3RK7A 3F69A 2JD5A 2UW0A 5HO8A 4JNWA 3GC7A 4BL1A 2YERA 1WZYA 1ZOGA 4J99A 1HCLA 1H28A 2ITWA 5HX8A 4HYSA 4J96A 2I6LA 3K3IA 3FY2A 1IEPA 4HPTE 4QMXA 5M08A 5HKMA 5KHXA 2FGIA 1PMNA 5EM8A 3O96A 4Y95A 3FYKX 5CF4A 3ORZA 4F1MA 5KMIA 1PKGA 4RIOA 3NYXA 3P5KA 4G6OA 4BGGA 5DG5A 4FYNA 3QTXA 5FM3A 5GINE 4LV8A 4WT6A 3SC1A 2QOIA 3IK3A 5ETIA 3TDVA 4H3PA 4NU1A 2A1AB 2CNVA 3KXMA 3KK9A 5TR6A 4RWLA 4DH5A 1H01A 4FT9A 3DU8A 1G3NA 4XG7A 5KZIA 4KIPA 4QMZA 5D11A 4RT7A 3PXYA 4K9YA 3WZKA 4EUTA 3PLAE 4FTTA 4CZYB 4A4LA 3QUEA 4W9XA 2R64A 4ZP5A 2O8YA 2QR8A 3GU7A 5EDPA 2FH9A 3LFEA 3MY5A 5IA5A 1OMWA 3NUAA 2F4JA 1YOJA 4XUFA 4ITIA 4EC9A 2XCHA 3ERKA 4FZ6A 4ZSJA 5A54A 4XV1A 4DTBA 4IEBA 3ZDUA 3VC4A 3GB2A 2W5BA 4DFYA 3E8EA 2OICA 3MWUA 3NVMB 2YEXA 4O81A 2HOGA 4TN6A 3UMXA 3BGZA 5GJDA 1R1WA 1CKIA 2EVAA 4OTDA 2YLEA 3FQHA 3O51A 5I9WA 5EDRA 2XB7A 4U80A 2Y4PA 3FYJX 1Z5MA 3CTJA 4R7HA 3KREA 3E8CA 2REIA 3QD4A 2BDFA 1Q41A 2XUUA 3EQGA 5ACBC 3MJ1A 3VS2A 4USFA 2UW5A 4MXAA 4LMNA 5I0BA 2R3JA 5J1WA 4CG9A 3EQCA 3DNEA 2YA9A 5I9VA 1YVJA 4M97A 2WIPA 2P2IA 2J0JA 2WZJA 4MXCA 5IF1A 4S2ZA 1O6LA 3FAAA 1JWHA 3KKVA 3ACKA 3HMMA 3E5AA 5L8KA 2P55A 3QTWA 5AV4A 2W96B 2OIDA 4YR8A 4I92A 5IDPA 2P0CA 4RX7A 4GL9A 3QTQA 3WE8A 3S4QA 2QD9A 5DN3A 4IM2A 3E62A 4JBVA 4AQCA 4MTAA 5CF6A 4DH1A 4D2TA 2I1MA 4U97A 3RAWA 4DYMA 2WPAA 3K5UA 4HGEA 5AP7A 4K2RA 3OVVA 4RWKA 3EIDA 1KE8A 4IMYA 3W2SA 2CLQA 3WZJA 4QMTA 4E93A 2BILB 4FTMA 4YZCA 1Z57A 3SXSA 2CN5A 3FMLA 3PDTA 3DDQA 2B7AA 5CENA 2XNEA 1KV1A 3LCTA 3GENA 3QQUA 4LUDA 2E9UA 3JUHA 4EJ7A 4OGRA 2A27A 4OR5A 3PIZA 2R3RA 5HTBA 3OCBA 1FVVA 3NWWA 2NRYA 3NUNA 4FV0A 5DBXA 2BCJA 4Y72A 4I0TA 3UQFA 4HPUE 3JY0A 4GU9A 4NZWB 5J9LA 3QA0A 4EONA 5H8GA 4BFMA 3RM7A 2OIQA 5EYCA 4ZJVA 4Y46A 4YJVA 2BDWA 2JKMA 3DAKA 1QCFA 4JL9A 4GYIA 3EB0A 5C9CA 1I09A 4ACCA 4IB5A 3IS5A 3ROCA 5CXZA 1ZYJA 4GMYA 3QRJA 4PQNA 5AP5A 4JDKA 5HCZA 3H4JA 5F1ZA 4D9UA 1H07A 5HE0A 5A6OA 5A4CA 2JDTA 2BZIB 3EJ1A 4TKSA 2PSQA 5D41A 3PWDA 3H0YA 3LJ2A 3IPHA 1QPDA 4NK9A 1YDRE 2QR7A 4XBUA 4XX9A 4C57A 5FGKA 4S34A 3EL7A 1ZYCA 4APCA 3VS7A 2FSOX 3BRBA 3R1SA 2OKRA 3I81A 4PX6A 4CT2A 2CLXA 4IM3A 3AC4A 3Q4CA 3N4TA 4DBXA 4YJSA 5GNKA 2XJ0A 4GIHA 3P08A 1FVRA 2HZNA 2RFSA 2XEZA 5FEDA 4BZDA 4EYMA 5JMSA 5M57A 4CYJA 2VTTA 2F49A 2WGJA 4MX9A 4CRSA 4D55A 1MRVA 3KU2A 2UVYA 2OBJA 3V8TA 5M4IA 4IX5A 5I5ZA 3BX5A 3FMNA 3QC9A 2Z2WA 2W1DA 4MNFA 3TWJA 3S0OA 4O0RA 1XWSA 1Q8ZA 4XG6A 2QG5A 5D10A 2J9MA 2B55A 3ORMA 3FLSA 2V7AA 4A9UA 2GS6A 1JPAA 4EK4A 4I22A 2EB3A 3NSZA 1G8AA 2XBAA 1ZZ2A 2YN8A 3F61A 4ZMEA 4B0GA 3ANQA 2PVLA 5AIKA 3DK7A 1F3MC 4IZYA 5IQCA 5LCKA 5IEYA 4NCTA 3A7HA 1SNUA 2BROA 3BE9A 3L8VA 2A4LA 2HCKA 3DLZA 1XH9A 4O7WA 2CCHA 1U5RA 1MQ4A 1YDTE 3NNXA 4TYJA 2DYLA 3MSSA 2ZB1A 2R4BA 3R8MA 5GIPE 4UWCA 4CSVA 2YAAA 4QMUA 2JDSA 4U79A 2WU7A 1NA7A 3P7AA 4EK3A 3TUBA 1BI7A 3RK5A 4RPVA 3W16A 2OZOA 3MI9A 5LCJA 1W7HA 4BWKA 5E4HA 4FT7A 4AGUA 3GFEA 1Q3DA 5LARA 4D4SA 2X6DA 1WBSA 2B53A 4OTHA 5EOLA 1E1VA 2R0IA 4Q9SA 4FV2A 4UEUA 4NUSA 4AN9A 5EOBA 2IZUA 5CWZA 3ZLSA 3WF6A 2A0CX 2R3MA 5HGIA 3FLQA 4O96A 4CZUA 1UKHA 3GT8A 3UOJA 4O7NA 4AT4A 3K54A 4MXOA 1IA9A 3ZFYA 4J52A 4AF3A 5BUIA 3FL4A 4EYJA 4KS7A 2RG5A 3CGOA 3QQFA 2XIZA 3C0IA 4NWMA 3WF8A 3GI3A 5K0XA 3CR0A 4CQGA 4JRNA 3OWPA 5F20A 4AGWA 3E8NA 4D4YA 3NW7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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