3QALE

Crystal structure of arg280ala mutant of catalytic subunit of camp-dependent protein kinase
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
350
structure length
339
Chain Sequence
GNAASVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKAFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A conserved Glu-Arg salt bridge connects coevolved motifs that define the eukaryotic protein kinase fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
total genus 106
structure length 339
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qalE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qalE02
1GIIA 4CKJA 1R3CA 4BCOA 2VRXA 2J5EA 5BMMA 4I41A 5TF9A 4C62A 5M4CA 4FT0A 2JKOA 4RA4A 1APME 2IW8A 3R8UA 5I3OA 4IAIA 3OXTA 3KVWA 3LOKA 5BVFA 4EHGA 2WEVA 3HRCA 4NJDA 2PHKA 2A0CX 2XF0A 2PL0A 3G2FA 5DT4A 5HLWA 4GIIA 5IUGA 5KO1A 3BEGA 3H0ZA 4HCVA 4YJUA 1WBSA 1SYKA 2QOBA 2F9GA 3R22A 1ZAOA 2C6IA 4OT6A 3ZXTA 1JOWB 3ENMA 3GNIB 4NIFB 3GCSA 4UEUA 5BVNA 4MQ1A 5FDXA 5EKNA 5LVMA 1GZKA 1A48A 2HZ0A 1ZWSA 2RKUA 2WZJA 3F2AA 4FKSA 4GVAA 4A7CA 1Y6BA 1E9HA 4RJ8A 5IISA 4EOMA 1URWA 5HE1A 3G9NA 2PMIA 4QP9A 3CY3A 2AC3A 4J53A 4V0GB 5CEQA 2QC6A 4DEDA 2C6DA 2PULA 1H1RA 1JNKA 4CGAA 4FKLA 1VJYA 2R3NA 2JBPA 4KD1A 3TIZA 4D4RA 5L6OA 3KK9A 5LVNA 4BWPA 4D2VA 2CGXA 3D5UA 3ITZA 4RX8A 3UIXA 4A07A 4BKZA 4BY9E 3BHUA 4ZMEA 4R5SA 5D11A 2O63A 2X7FA 3DBEA 3BX5A 5LWNA 4KBCA 4BWKA 3AOXA 4IJ9A 4U44A 4YJSA 1E1XA 3WZDA 1CDKA 4QQTA 4DGOA 4F64A 3NMUF 1PW2A 5DGZA 3QRIA 3VBTA 4CFFA 4B7TA 3UMXA 4BL1A 4LGGA 5F9EA 1REJA 3DBCA 2C30A 2VNYA 4YTFA 5HTIA 4B4LA 4BDJA 4RIOA 3VF9A 2ITXA 3AT3A 2G15A 2OGVA 1I09A 2BFYA 3W2RA 2ERKA 3G0EA 4HVDA 2BR1A 4QMQA 3DY7A 3QALE 4QYGA 4ZAUA 2R3MA 4EORA 3VUDA 5CU0A 2I0VA 3LCOA 3PJCA 3EFLA 2F49A 4G3FA 5AP0A 3SHEA 2B9HA 1WMKA 2C6OA 2DUVA 4FNZA 4O0UA 4D5HA 2WQNA 5L2WA 5L8JA 4ACHA 1JKKA 1R0PA 3ZOSA 4AOIA 3PJ2A 4JDHA 4BHZA 4EH3A 4N57A 3IDCA 2RF9A 2J0LA 4WO5A 4C57A 4GUEA 4YLKA 4ZK5A 4EZ5A 4JL9A 5LVOA 4UMUA 2C3JA 4Z7HA 2JIIA 2WIPA 3AMAA 1XBAA 1ZMWA 2UW7A 1OUKA 4O6LA 2VTQA 4WNKA 2EXCX 4JX7A 1Z57A 4CT1A 3B2WA 1O6YA 3GC9A 4FL1A 5EW9A 3VHEA 5DN3A 3CCNA 4F1TA 4E6CA 4BICA 3QUPA 3ZC6A 2GS6A 5CT0A 4EBWA 4GVJA 4F7NA 2X6EA 4UWYA 3HP5A 3PPJA 4FIEA 4PTCA 3TWJA 2I6LA 3W8QA 3MN3A 5GZ9A 5HBJA 2JAVA 2XIRA 2R7BA 4E4MA 2P3GX 3AC1A 5E90A 3QQJA 4FTMA 4MAOA 2VGOA 1ZYSA 1GIHA 3RJCA 5GJGA 1ZOGA 5CU3A 2UZWE 5JGBA 2EB2A 5CASA 4TN6A 4AZSA 3U9NA 3PXQA 3A8WA 4LGDA 1U54B 4KKHA 3NZ0A 3TCPA 1NXKA 4CLIA 3EL8A 4YJOA 5TOZA 3I4BA 3H0YA 4BBMA 1F3MC 4OR5A 4QMLA 4TW9A 3B8QA 3IPHA 2IZRA 3K3IA 4HCTA 3UOHA 4L46A 1XH6A 5EK7A 4A4XA 2CJMA 2H34A 5CU4A 5ACBC 4EH6A 3FBVA 4QMWA 3BE9A 3HVCA 3H9RA 2C6LA 5HHWA 1SVGA 3QYWA 4L9IA 3ZM9A 2QOCA 2ITYA 3SKCA 2A4LA 2PVLA 3PLSA 3TXOA 1R78A 3A7JA 4CD0A 2GNGA 1WVXA 5DA3A 3FI8A 2P0CA 3DKGA 4KIOA 1OITA 5C9CA 3Q5IA 4N4SA 2XJ1A 4DGGA 3I7CA 2BDJA 2VWZA 3OMVA 2CKQA 4EC9A 3FMNA 1Y91A 4LM5A 4M0YA 3F2RA 3E87A 1UV5A 3RK7A 4YUQA 3KRWA 5CLPA 5FP6A 4IVCA 1TQMA 2JBOA 2RSVA 2CSNA 2X9FA 3AXWA 3F5UA 4FNWA 4HNFA 4IJPA 5C8MA 3A4OX 3UOJA 3F82A 1F0QA 2AYPA 3KRXA 4K18A 4YO6A 4B9DA 3VQHA 4DFZE 1OECA 3PXYA 2BTRA 5E8XA 3WZJA 4L53A 5KKRB 3D4QA 4GUBA 2C6EA 3ZSIA 4IM0A 3UO5A 4PDPA 5AV3A 3MVJA 1H26A 4EHVA 3TUDA 4R3CA 3RBWA 3NS9A 1PMEA 3FI4A 3MA6A 2C47A 4P5QA 4LRJA 2YCFA 2R3KA 4ANOA 2XS0A 3PE2A 2PZRA 4RX7A 3KXGA 3CPBA 1FGKA 5ANOA 5M53A 1QPEA 5E9EA 3WZEA 3ZEPA 3Q32A 1UWJA 2WU6A 3R1QA 2J7TA 5DRBA 1PMNA 4ZOGA 4ZSEA 4EL9A 3KFAA 4S34A 3F3WA 4KBKA 3KKVA 4BCFA 3QQKA 5A4TA 1CKIA 3UZTA 2XIZA 4QTCA 4YZMA 3ZO2A 1W84A 3P4KA 5CAOA 4YTIA 3IKAA 4CYJA 4YHJA 3EN4A 4NU1A 5H8GA 3FXZA 1XJDA 3COKA 1H4LA 3KU2A 3C4XA 4I20A 3UOLA 1T45A 4KRCA 5G1XA 5HLNA 1H27A 2YM4A 2Y4IC 1J7UA 3IGGA 3W2OA 4EZ3A 5L8LA 4FYOA 4OT5A 5EM8A 2ZV8A 4XV3A 3ZEWA 4OAUC 5IQGA 4RQVA 2C4GA 3PFQA 4O7SA 4O7TA 3C4ZA 3F88A 5DR6A 3NW7A 4RWJA 5DE2A 3HGKA 3AD5A 4UYAA 2C6KA 3P7CA 1UU7A 3PRFA 3QD0A 2IN6A 3FPMA 2YIXA 4EOKA 5I9WA 2UZTA 4LRMA 4WRSA 1KWPA 1ZOHA 2VZ6A 4MD8E 4BR3A 4CG8A 5DOSA 3W2PA 2H96A 3WZKA 2CCIA 4ASZA 1JLUE 3KXHA 4M7IA 5DFPA 2BHHA 3LJ1A 4CLJA 2VTIA 2R3JA 4CEGA 2WIHA 2BRMA 5TKDA 2IPXA 4PTEA 4O7VA 3RPRA 3PRIA 2OWBA 3QCQA 4MNEB 5DVRA 4J8NA 4NJ3A 3QYZA 4QQJA 5HQ0A 4GMYA 4QT1A 3DXNA 4FEWA 3BQRA 3VS0A 3ODYX 2XZSA 4RC3A 3RK5A 5HESA 4ZS0A 1U59A 4DG3E 4KB8A 3DK7A 2B7AA 3OEFX 3QHWA 4TYHA 2XM9A 5KMKA 3RCJA 3P1AA 3KVXA 3T9IA 2F7EE 3OC1A 3SRVA 3A61A 1HCLA 4K6ZA 4EUTA 2OICA 5ETCA 4DFYA 3KC3A 3UNJA 3VRYA 2HENA 5IMXA 4EOSA 1NA7A 4I6QA 3UG2A 3NLBA 3L8SA 2XJ2A 4AT3A 3ZZWA 1MRYA 4I5MA 4CFXA 1CKPA 5AUWA 3VO3A 3H9OA 1FINA 3KMMA 2R0UA 4YJRA 4IC7A 2Y0AA 2GNFA 4FL3A 2Y8OA 2JKQA 2PVHA 3BIZA 4QPSA 3D9VA 5AP7A 3KEXA 4XH6A 1SZMA 4QMZA 4DCEA 4ASEA 3KF4A 4EK8A 5J5SA 3FMKA 2UZVA 2C5OA 3ZUVA 2HZ4A 1NW1A 4J71A 1R0EA 2E2BA 4I23A 4QP2A 3NW5A 5AP5A 2GNJA 4QNYA 2P2HA 4KBAA 4J7BA 5EHLA 2PVNA 3LZBA 3TG1A 2HIWA 2XK9A 1JPAA 3O50A 2PMOX 4NSTA 1DI8A 3W2SA 2VTLA 3O17A 1PYXA 2ZVAA 3MSSA 4FOCA 4I6FA 4JQ8A 4NM5A 4Y85A 3FPQA 3TTIA 2C3LA 1E1VA 2JDRA 4KAOA 2OH4A 4OTGA 3Q6UA 2Y9QA 5D10A 3TACA 2NRYA 4ZSLA 4BCNA 3CKXA 2G01A 4W8EA 3BWFA 5KX8A 1MQ4A 2VUWA 1RW8A 2Z2WA 4IX4A 2F7ZE 3H4JA 3F9NA 3O96A 2CKOA 2B54A 3IW6A 3BU3A 4XS2A 4NM0A 2QO9A 5BYYA 5JGDA 2J4ZA 3QXOA 4FL2A 4BTKA 1OPKA 3K5VA 3RPVA 4AA5A 2CMWA 3K2LA 4JOAA 4HJOA 2V55A 3NNWA 4EH5A 5CAUA 4C3RA 5AIKA 2B52A 2J90A 2V5QA 2PY3A 2V7AA 2FSMX 5H8EA 4G16A 3VUMA 2VX1A 3DPKA 3OTUA 4HGSA 5EFQA 4XX9A 4V01A 3E7VA 4HGEA 1IA9A 2OIQA 4APCA 2CNQA 2YZAA 2JGZA 3LFNA 2PVRA 4IWDA 2GHLA 3UYSA 5E8YA 2XK7A 3OZ6A 4BTMA 2E9OA 5EOLA 3ULIA 3WF5A 2QU5A 5EM5A 4PX6A 1FGIA 4IADA 4I0TA 2UW4A 2HWPA 4C3FA 2VN9A 4RFMA 5HE0A 4YU2A 3CE3A 3EQDA 3LFAA 1DI9A 2PUUA 3AMBA 3OXIA 1SNXA 4XCUA 5F20A 2VWYA 3I0OA 3OF0A 4RJ4A 1PMVA 5HLPA 3BGQA 4EOIA 3CJFA 5FUTA 5M4FA 3F2NA 1Q8UA 1UWHA 2OFVA 1OIQA 5IA5A 3DS6A 3CY2A 4M8TA 3CD8A 4GEOA 5BVOA 1ERKA 4BZNA 3QD3A 5M4UA 2GQSA 4FSTA 4UALA 4ONAA 4FTOA 5JFVA 4CV9A 3GU4A 4XHKB 3TV7A 1XBBA 2W1FA 4BCMA 3DXQA 2QR7A 3F69A 4WNMA 3ZH8A 1VYWA 4F08A 4X6RA 3D7TB 5AR7A 5HORA 2VD5A 4O38A 3C0IA 2QLUA 3EKKA 2YEXA 4MD9E 4AA0A 4C3PA 1Q8YA 4EI4A 5BNJA 5IQDA 2P2IA 4DITA 5AR4A 4O7LA 4AG8A 4GSBA 5AM7A 5L2QA 2Q0BA 2XYUA 2H6DA 3QUDA 4U6RA 4DTBA 2YIRA 5AUVA 3SA0A 4GK3A 3UZPA 4EK6A 3Q2JA 4EKLA 4D2SA 2XJ0A 5DNRA 3R7YA 3ZMMA 3R8ZA 3ORKA 4O0VA 4GG7A 3ZDIA 5C1QB 1ZZLA 2ZYBA 3BGZA 4V04A 5L2SA 4LOPA 5EYDA 4E4XA 4MQ2A 2YM8A 2ZV9A 1PXNA 3REPA 1OVEA 4GJ3A 4TY1A 3U54A 3KRRA 4FSWA 3W55A 3FY0A 3EQCA 4ARKA 3ZO1A 4ZY4A 1H0WA 4IVDA 3QC9A 2X4ZA 3ZCLA 4L3PA 3VS2A 4DA5A 2QOOA 2W0JA 4TWCA 3HDMA 1M7QA 5GIOE 4K77A 2PVMA 4TZRA 5EHOA 4ZTLA 2RGPA 4RVTA 3R00A 3GCVA 3MS9A 3VBYA 3VW6A 5J9LA 3WI6A 4AN9A 4F6WA 4D0WA 4G3DA 5B2KA 5HVYA 5K0KA 4PNKA 4ASDA 2YISA 4XP3A 4L8MA 2OKRA 3SW4A 4BIEA 3R30A 2BDWA 3OCBA 2ZOQA 4RJ5A 4O91A 3B8RA 5B2MA 1RE8A 1J7IA 2IVUA 4UMTA 3R7UA 3HMPA 2OF2A 4L3LA 2YJRA 3FQHA 4NCTA 5JZNA 5IUHA 3LXNA 3W10A 5M56A 4O7YA 2W1IA 2GS7A 4QMVA 2BHEA 5A6OA 4IFGA 4IAKA 5CEIA 4BVUA 4JS8A 4YJVA 5JRQA 3DKCA 3I81A 4IB3A 4HNIA 2IVTA 3PJ1A 4Q2AA 1K3AA 4MTAA 4NZWB 4KINA 2G9XA 4IX5A 3UQGA 4XEYA 1U4DA 2OXDA 4AN2A 2BMCA 1XH4A 2Z7RA 4ZLZA 4L00A 3ZONA 4EHZA 4FYNA 4C36A 5BUJA 3WE4A 4DEBA 4DEAA 4EK4A 4F63A 3NUAA 2B55A 5CSXA 3P7BA 1YI6A 1ZMUA 4FR4A 5IUIA 4F0GA 5DIAA 4RVLA 3ZUUA 3L1SA 2OU7A 5J1WA 5HE2A 3FLSA 4AOJA 1CMKE 3EB0A 1QL6A 1FMKA 3KXNA 3P0MA 3PVGA 4QPAA 2YCQA 3HRFA 4Q5EA 2J6MA 3HMNA 3OBGA 1XKKA 4F65A 5DWRA 3TNIA 3R6XA 4EQCA 4FKRA 3KXZA 4DT9A 3C4CA 4FTRA 4BDCA 3POOA 4OTQA 3BRBA 3ZU7A 4DF3A 2BKZA 4DC2A 3DDQA 2B9IA 4KS8A 1H1WA 1BX6A 3MIAA 4FODA 4X2FA 4L43A 3H9FA 4HYSA 4E73A 4O22A 3TKHA 4L45A 4YJNA 4QNAA 3T3UA 4XG7A 3HMMA 3UP2A 1KE7A 4BF2A 4EONA 3ROYA 3UPXA 2WTKC 3KRJA 3A7HA 2BTSA 2E9NA 2W1HA 2GNHA 4TWNA 5IQHA 4LMUA 2V22A 2ZB0A 5A9UA 2P33A 3NR9A 5FLFA 2I0YA 3DTCA 5BX0A 3QD2B 4BCJA 3K54A 5AA9A 4QMTA 1A9UA 2A19B 5K5XA 1KV2A 3M42A 2ITQA 4G3CA 3TJCA 5EYCA 4D1XA 3ZHPC 2Z8CA 2FYSA 4MX9A 3P08A 4QQCA 1OUYA 4WKQA 3CQEA 4X2JA 3H3CA 3EQBA 4XG9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4KBA A;  4J7B A;  5EHL A;  2PVN A;  3LZB A;  3TG1 A;  2HIW A;  2XK9 A;  1JPA A;  3O50 A;  2PMO X;  4NST A;  1DI8 A;  3W2S A;  2VTL A;  3O17 A;  1PYX A;  2ZVA A;  3MSS A;  4FOC A;  4I6F A;  4JQ8 A;  4NM5 A;  4Y85 A;  3FPQ A;  3TTI A;  2C3L A;  1E1V A;  2JDR A;  4KAO A;  2OH4 A;  4OTG A;  3Q6U A;  2Y9Q A;  5D10 A;  3TAC A;  2NRY A;  4ZSL A;  4BCN A;  4AXE A;  3CKX A;  2G01 A;  4W8E A;  3BWF A;  5KX8 A;  1MQ4 A;  2VUW A;  3AKK A;  1RW8 A;  2Z2W A;  4IX4 A;  2F7Z E;  3H4J A;  3F9N A;  3O96 A;  2CKO A;  2B54 A;  3IW6 A;  3BU3 A;  4XS2 A;  4NM0 A;  2QO9 A;  5BYY A;  2X0O A;  5JGD A;  2J4Z A;  3QXO A;  4FL2 A;  4BTK A;  1OPK A;  3K5V A;  3RPV A;  4AA5 A;  2CMW A;  3K2L A;  4JOA A;  4HJO A;  2V55 A;  3NNW A;  4EH5 A;  5CAU A;  4C3R A;  5AIK A;  2B52 A;  2J90 A;  2V5Q A;  2PY3 A;  2V7A A;  2FSM X;  5H8E A;  4G16 A;  3VUM A;  2VX1 A;  3DPK A;  3OTU A;  4HGS A;  5EFQ A;  4XX9 A;  4V01 A;  3E7V A;  4HGE A;  1IA9 A;  2OIQ A;  4APC A;  2CNQ A;  2YZA A;  2JGZ A;  3LFN A;  2PVR A;  4IWD A;  2GHL A;  3UYS A; 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