3QD2B

Crystal structure of mouse perk kinase domain
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
332
structure length
271
Chain Sequence
ASRYLTDFEPIQCMGRGFGVVFEAKNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLETPPEKWQEEMDEPKVYLYIQMQLCRKENLKDWMNRRCSLEDREHGVCLHIFIQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKVGDFGLVTAMDQDTHGQVTKLYMSPEQIHGNNYSHKVDIFSLGLILFELLYSFSTQMERVRIITDVRNLKFPLLFTQKYPQEHMMVQDMLSPSPTERPEATDIIENAIFENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The structure of the PERK kinase domain suggests the mechanism for its activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3
molecule tags Gene regulation
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 271
sequence length 332
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qd2B02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qd2B01
3BHTA 5EHOA 2UW9A 2BAKA 4RG0A 2PE0A 2XM9A 1A48A 5CAQA 3FSKA 4XCUA 3K54A 3TKUA 2YJSA 4JT3A 2VWXA 5IMXA 5CQWA 5IDNA 4YHFA 3Q9ZA 5C8NA 4BDDA 4AGDA 1CM8A 1OITA 4YJPA 3IS5A 3OY1A 5HVKA 1ZYJA 4GEOA 4RFMA 1B6CB 4HNIA 4M97A 5EKOA 5EW9A 3DV3A 4JJRA 3VN9A 5HD7A 5GJFA 4F65A 5CEMA 5I5ZA 5LMKC 3CR0A 2C6LA 5M09A 2FO0A 3LOKA 4U81A 3EQPA 1U54B 5HGIA 4D4VA 4R3RA 3K3IA 3E87A 4KBAA 2BPMA 4YO4A 3DBEA 3R7GA 3P7CA 3PSDA 4GUBA 4ORKA 4LRMA 4IZ5A 4RMZA 3Q53A 3E8EA 4YURA 3K3JA 4UMTA 1SNXA 2BZIB 5IQCA 5CI6A 3BWFA 4ZY5A 3FL4A 4LL5A 5DE2A 5L3AA 3KXMA 1TQIA 2C5NA 4MD7E 1CSNA 2R3IA 3MH3A 4WSQA 3FLWA 1U59A 1YOMA 2ZB1A 3QTQA 5I9YA 5IEVA 5KE0A 4ID7A 3GXLA 4L00A 5DT0A 3EQDA 1Q97A 5HEZA 4L6QA 2VO6A 1Q8ZA 3V5PA 4DCAA 3LXLA 5GJGA 3JR1A 3TN8A 3L8XA 5HE1A 2ITZA 3FXZA 4RJ7A 1J91A 2YIRA 1DM2A 4PNKA 5LVMA 2WIPA 4DA5A 3R9HA 3PXFA 5F20A 4HPTE 4I22A 4J95A 4L3JA 5DA3A 3FQHA 4FKTA 5JFVA 4FIJA 1RQQA 4QP4A 1QPDA 3RK9A 3SV0A 3PE1A 1YVJA 4RC4A 4ZS4A 2W1ZA 4AACA 1BYGA 5CSHA 1XO2B 1MUOA 2QNJA 4O7TA 3LJ1A 4S32A 4MF1A 2IVSA 3TZ9A 3HZTA 1PXJA 4EL9A 4EC8A 1PF8A 3DDQA 3NCZA 5FTQA 3PJCA 4FV7A 2A0CX 3V5LA 5D9HA 4C3RA 3QKLA 2YERA 4B9DA 3C4XA 3EFJA 4U3ZA 4JBOA 3CD8A 3TCPA 4PDPA 3PZEA 4EQUA 3VC4A 2WMTA 2JKQA 5AUYA 2PYWA 3CD3A 5AP5A 3R8ZA 3F2RA 2J0KA 3I0QA 3NNVA 1ERKA 1PXKA 4TXCA 1CKPA 2XKCA 3FKOA 2YLEA 3PFQA 3TJCA 2BRHA 2PL0A 4UXQA 3VBYA 2CN8A 4K0YA 2J9MA 4IZAA 3VBQA 4O0WA 2VWZA 2Y4IB 4BF2A 3EH9A 1OUKA 2OBJA 4C4EA 1REJA 1AGWA 2ACXA 2ZDTA 4FR4A 5FDXA 3BYOA 3EN9A 3PLSA 1G8AA 4L42A 4EONA 4RBLA 3GUBA 4TRLA 4U45A 3S3IA 1UWJA 5M55A 4ONAA 3QTIA 3TZ7A 5BNJA 4NM7A 2WTVA 3IW4A 4RA5A 3KVXA 5DRBA 1E9HA 3LFCA 2W5HA 3BWJA 4PF4A 4Y72A 4GYIA 2QO2A 3KB7A 5EHLA 5AR3A 1Z9XA 4DBXA 3OXIA 3QHWA 4MQ2A 4EOIA 4EZ7A 4QYYA 3ODZX 4OLIA 5HNIX 4Q9SA 4HVIA 2ZM1A 3VUIA 2X0GA 2JBOA 4S31A 4U97A 2YAAA 4MKCA 2PUPA 2WAJA 4F7LA 3A99A 2XEZA 4FV6A 3GGFA 5CVGA 4EOJA 3VIDA 5L8LA 2BFXA 4HGEA 4O7ZA 2KULA 4HGLA 5AUVA 3VHKA 2DS1A 1KV1A 2EB3A 3F3VA 4RJ4A 1WVXA 3HGKA 5AR7A 4AA4A 4YC6A 2PK9A 4KKHA 3KULB 4FKPA 5AP3A 4DBNA 4O81A 5EM6A 4BWXA 4I93A 2AC3A 3PPJA 2XVDA 3TV6A 2O8YA 1B39A 4CEGA 1UWHA 4G3CA 4GG7A 4XJ0A 3RNYA 5I9XA 5H9BA 4BCNA 5AUXA 3QA0A 4RWIA 4LGHA 2QD9A 5JN2A 4LI5A 3DNEA 2PMLX 2C68A 4HGSA 5IA4A 5D11A 4C3FA 2PVHA 3BU6A 4YGAA 4KBCA 3Q4TA 4JRNA 4OBPA 3LFNA 3TV4A 4N6ZA 3ZBXA 2VTAA 4C34A 3FI4A 3KU2A 3I4BA 4NL0A 4QP8A 2X7GA 3LFEA 3F61A 2VX3A 3ZLWA 3ZOSA 3FHRA 2P55A 3U9NA 1H0WA 4JS8A 3POZA 4NYEA 5BVOA 3FSFA 4KIOA 5AA8A 4M68A 4QMYA 2W1CA 3H9RA 4XOYA 2W5BA 5HG8A 3NMUF 4GFGA 3C4EA 4BC6A 5CAUA 4I21A 1O9UA 5BVFA 5IPJA 5M4FA 2B52A 3O8UA 2VTMA 2E9OA 3VBVA 2GTNA 4FGRA 1XBCA 3D5XA 1Q8WA 3ZUUA 1G8SA 1WBTA 3KN6A 4PTCA 4XP0A 3RAHA 4HVSA 5KO1A 2I0HA 2OK1A 3KXHA 4WSYA 3EQHA 4W4VA 3TNPC 3ZU7A 3GU8A 1H1WA 4CZYB 5E91A 5JFXA 2WB8A 4FEVA 2OH4A 2GFCA 4L43A 5CT7A 2EVAA 4DFNA 1H1QA 3NDMA 5HE3A 3TNIA 3NYVA 4O91A 3F7ZA 3FLQA 4ENYA 3SD0A 3UGCA 2C4GA 4DFZE 4XNEA 4I24A 1YOJA 3LFFA 3CPBA 3RHKA 4BDFA 2ZV7A 1UKHA 3NNUA 3TACA 4FSWA 3RNIA 2ZM3A 3VRYA 4BZNA 2BMCA 4XMOA 4ERKA 3A60A 3H0ZA 1K9AA 3QQHA 2ITQA 1PMUA 4IAAA 1YXVA 5AM7A 3BBTB 3NUXA 1UU7A 3ZLXA 2GCDA 3MDYA 3H0YA 4BZDA 5JRSA 3E5AA 3N4VA 5I9WA 3L9PA 4K77A 3UOLA 2PUIA 3NGAA 3UZTA 5HOAA 5AR5A 3KFAA 4DC2A 1ZOHA 3DBFA 2PVLA 3FPQA 3DPKA 5IQIA 4BCOA 4O0XA 3DTCA 5DEYA 4IM2A 2J4ZA 4H3QA 3NUUA 5FBOA 4I20A 3HUBA 5B7VA 2GNFA 3ZSIA 1LR4A 4W4WA 5IQEA 1ZOEA 4EKKA 4EBVA 2PVNA 3V3VA 3VNTA 2F49A 4IW0A 4WOVA 4ZSEA 3Q96A 2QG7A 4B7TA 5LWMA 2P4IA 2X39A 1Q8YA 3EZVA 4UB7A 2GDOA 4HYIA 4U9AA 3AMAA 3OD6X 4Y8DA 3UMXA 5CF8A 2QLUA 1QPEA 4U7ZA 4BCPA 4IHPA 5FGKA 4JIAA 3E8DA 4XBUA 3ZDIA 2YDIA 4PDSA 3UDBA 2RF9A 3A7HA 3R30A 3C50A 1OPKA 1GAGA 4DEHA 4X2FA 4E5AX 3PY0A 2C3JA 5L2QA 4CFVA 4EHZA 4NK9A 5EM8A 5KHWA 2PUUA 3ZFXA 1FMOE 2F57A 2BR1A 5I9ZA 4QP1A 3QRUA 3GC7A 3MJ2A 1DAYA 2PZ5A 4RZVA 4W4XA 3ZHPC 4BVUA 5M06A 4XG4A 4CQGA 4PNIA 3L9LA 3E8NA 4IADA 4USFA 3UZPA 4FYOA 4G3DA 4WT6A 3AXWA 3ZM9A 3V5TA 3HDNA 2R3HA 3HA6A 3ZC5A 4ACCA 4ZTNA 1Y6BA 4OUCA 1VR2A 2LAVA 3C5UA 3OZ6A 5BMMA 3DAKA 3VS6A 5JGDA 4NUSA 3Q4ZA 2C1BA 2XK4A 3UC3A 3IG7A 4I6QA 4AU8A 4XG7A 4TZRA 4AE9A 4TKSA 2OSCA 4NKAA 2VWUA 3R01A 3LLAA 4JVGA 4AA5A 1H1RA 4N6YA 3PVWA 4M13A 4BBFA 2I7QA 4H36A 3F5GA 3OTVA 4YZNA 4AW0A 5J8IA 4FV8A 4MNEA 1BI7A 2VTOA 4W4YA 5F94A 5CF4A 1IEPA 1YQJA 1WCCA 3W2PA 2E9PA 5E92A 5BQ0A 5HTCA 4Y95A 3D4QA 5E1EA 3R04A 2VWYA 3PG1A 3MI9A 4JDHA 2YCRA 1W0XC 2HAKA 4JL9A 3O23A 3QL8A 1UNLA 2J0LA 3RMFA 3VWAA 1PRYA 4MHAA 2QVSE 3ID6C 2B9IA 3EYHA 5C8KA 4O2ZA 3ZO1A 1BL7A 3IW6A 4G9CA 4WD5A 5JFWA 4DTBA 2VGPA 5G1XA 4ARKA 4DFYA 5CEIA 5JK3A 4IE9A 4U42A 2UW7A 4ZTHA 5CWZA 4OTRA 3W2SA 5CT0A 3RKBA 2O63A 4FT3A 3VUHA 5IA3A 3VBXA 1U5RA 4JIKA 5AP1A 5IA5A 3IDBA 5EI2A 2PVRA 2ZAZA 2BTSA 2VWIA 2VWVA 3OW3A 1E1XA 4BI2A 4QP7A 4E4LA 4A07A 4L7FA 4QYHA 1R0EA 3D5WA 4YC8A 2XCHA 3T8OA 3R9DA 4ZP5A 2QOHA 4U40A 2BKZA 1JKTA 2WPAA 3LMGA 4L9IA 4NTSA 1OBDA 2HW7A 2YEXA 4X3JA 3VS1A 4RX8A 4F09A 4UXLA 1GZOA 2BCJA 3DKCA 3QQLA 4C37A 5L6OA 2HZNA 4RT7A 5CQUA 4FZ7A 5M07A 2VTPA 5DMZA 3GCPA 3LVPA 3NUYA 4NM0A 4O0SA 3QX2A 5ETCA 3L8SA 3LCOA 2QURA 3JY9A 5DHJA 3G0FA 3LHJA 4GIIA 3Q5ZA 1FVVA 3C4CA 3MBLA 2VRXA 4Y5QA 4E6AA 5TF9A 2RFSA 2X1NA 4IIRA 4QYGA 4PTGA 4A9RA 2HW6A 2QOKA 5IEXA 3H3CA 3U6HA 3OCGA 3FLYA 4FIHA 4X2JA 5JMSA 2ZDUA 1RDQE 2PMOX 3CQEA 3HKOA 3O51A 4IJPA 5DH3A 4KUJA 3QRIA 2EXEA 5DI1A 5K9IA 5HIEA 2WO6A 3UIXA 1KE6A 4FKIA 2JC6A 4QD6A 3V5QA 3IQ7A 4ASEA 3PWDA 5KMKA 3PDTA 4RJ6A 2XJ1A 2XKDA 3AT4A 4P90A 3NVKI 3EQFA 3VULA 2WTIA 3AT2A 4O2PA 3D7TA 2EXCX 5KZ0A 3QQFA 5CTPA 3ZXTA 5IQAA 3MFRA 4XV2A 5H8BA 5HE0A 1M7NA 2V7OA 2O5KA 2C5YA 4ALUA 3U55A 1M2RA 2OIQA 3BU5A 4F0FA 3BYMA 5IQGA 4I1ZA 3SXFA 4F70A 2V7AA 3DKOA 4MH7A 4F7SA 4D5KA 4X7QA 1YWVA 1CKJA 3MPTA 1P4FA 2UZVA 3NVMB 3RPOA 4RQVA 4FEUA 3DTWA 3GBZA 3REPA 1SVHA 1XH8A 2CLQA 3HEGA 5AP0A 3F2AA 4FBXA 4DEGA 1LUFA 3FY2A 1UVRA 5B2LA 5CXHA 4OW8A 3ORZA 3UQFA 4WUAA 5IA1A 4CGAA 3QQGA 4RJ5A 2OLCA 4O7NA 4E4MA 4O0YA 4JXFA 2Y4PA 3G9LX 4RIXB 5LWNA 3DZQA 2FVDA 3DNDA 4JG7A 3EL8A 3S1HA 4GT3A 3W16A 4F1TA 4BDHA 3UO5A 3BELA 3D14A 1PMEA 1L3RE 4WA9A 3HMMA 3ZSGA 4D1ZA 3QTZA 2H34A 5EQEA 3BI6A 3FZSA 1ZZ2A 3QCXA 5E8YA 3ALNA 5HO6A 3W2QA 5JSMA 4BDKA 4UEUA 3SQQA 2C0TA 3A8WA 3DK6A 1IRKA 5CSWA 4YLLA 4FKQA 5C9CA 5KKRB 3PY3A 1KOAA 4QP6A 4IVCA 5HX6A 4KSQA 3PG3A 4G6NA 4GYGA 1YKRA 4KIQA 2IZTA 4C4GA 1L8TA 3H4JA 4Z7GA 4E93A 3SG8A 5FXQA 4FSNA 2Y9QA 3QCYA 4BGQA 5HBJA 1M14A 3OT8A 3PXRA 5M53A 2QONA 4HCUA 2OJ9A 4PDYA 4GJ2A 4WNMA 3PIXA 5KZIA 5L4QA 4L67A 4KS8A 2VWWA 2HZIA 2OKRA 4YZ9A 4FZ6A 2R7IA 3FDNA 4RSSA 2BKKA 4AT5A 4DEEA 4MK0A 5D41A 5LCKA 2VX0A 4M67A 4AE6A 2Z7QA 4XG2A 2WNTA 4YZBA 3BLQA 4E73A 1NXKA 3NAXA 4EK4A 4O96A 1KE9A 2PU8A 4MX9A 3SDJA 2XIZA 1H26A 3SAYA 3P7BA 4OT6A 4V05A 4XBRA 2W96B 3FEGA 1XBAA 4E4NA 3QTUA 4OGRA 1YXTA 4G31A 4BYJA 5M51A 2OF4A 2QOLA 2ZB0A 3UOHA 2OXXA 3W10A 2AYPA 5AFVA 4L3LA 3TG1A 4O84A 3UQCA 3VS5A 3KRXA 3HV7A 4J71A 3RK5A 3BE2A 1ZZLA 1XH7A 3PA3A 3P23A 4I4FA 5AIRA 3H9OA 5FEQA 2B0QA 3HAVA 4EQCA 1H4LA 5GNKA 3RAKA 3S95A 4B8MA 3MH2A 1HOWA 3WZDA 3K5VA 3VO3A 4FKUA 1PXMA 1KE8A 3OBJA 4K18A 4BR3A 3CTJA 3OWJA 4D55A 2EB2A 1YRPA 2FA2A 2R0IA 3FMKA 3C4ZA 3LFQA 4DITA 3JUHA 4V04A 4AZWA 3RPRA 3UC4A 5BUJA 4L68A 4DFUA 4YZCA 5CAVA 3IGOA 1SM2A 2GQGA 5E7RA 3F3UA 4PUZA 4RPVA 3UYTA 3R00A 2OW3A 1W7HA 5HVJA 4WNKA 4ZTSA 4L3PA 3F3ZA 3NIEA 3WF5A 4R6VA 3OXZA 1WBOA 2QHNA 4CYJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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