3QGWA

Crystal structure of itk kinase bound to an inhibitor
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
261
structure length
244
Chain Sequence
IDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIKEGSMSEDDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGFPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and structure-activity relationship of 3-aminopyrid-2-ones as potent and selective interleukin-2 inducible T-cell kinase (Itk) inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 244
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qgwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qgwA01
1BI8A 5A54A 4QD6A 5CU4A 2CGVA 2JDSA 4Y72A 3VS7A 4MQ1A 3W2CA 1OIQA 3C51A 2BUJA 4APPA 4G9RA 5M57A 3PWYA 4IC7A 2PULA 4LOOA 4R5SA 3V8WA 2BDWA 5DR6A 2CN8A 4YMJA 3H9FA 3F5GA 3PY1A 2IVSA 4JBPA 2O2UA 1BKXA 4IAKA 5CEPA 5FP5A 3GCSA 3FLYA 3RPSA 3T8OA 5LWMA 3SGCA 2OJGA 3UG2A 3RHXA 4HVIA 4ZZOA 3NNXA 4H3PA 5IUGA 2WMAA 4ZY4A 3ZM9A 3ZONA 4FSMA 4QMSA 4UZHA 4M69A 5FM3A 4AA0A 4AU8A 4BZNA 5CU3A 3BBWA 4L3JA 4ASDA 5C8MA 4OT6A 3LFCA 1ZMUA 3P78A 3TIZA 1SZMA 3EQFA 3OBGA 4DEBA 4FV4A 4DN5A 4OTPA 1Q4LA 5AUZA 5KCVA 3CS9A 2BRNA 4R1YA 4BCPA 4BN1A 4ZZMA 1PF8A 4DA5A 4WSQA 4LI5A 3C4CA 2GDOA 3PE1A 4RJ8A 3KXMA 4DLJA 2OI4X 1K3AA 3F7ZA 4DBNA 3FHIA 2IZRA 3P7BA 4IJ9A 5GZ9A 2ERZE 5CXZA 4ANMA 3TM0A 1ZARA 3DOGA 4MEDA 2WQNA 4IX4A 1PXNA 2O63A 3R7UA 4BCNA 4DG0E 2WU6A 4LMNA 3V6SA 4B99A 3KFAA 2PK9A 4BIDA 2XVDA 1H0WA 2BRHA 3GENA 3NAYA 3COKA 3NS9A 4O0XA 3QKKA 4O27B 4QP6A 4H3QA 5TE0A 3O8UA 1ZY4A 4L52A 4A9UA 1KV1A 3F6XA 5HKMA 4CKRA 1Q99A 4LRKA 2P33A 3LCSA 3NZ0A 1YVJA 2BZKB 3MY0A 3BYVA 3GNIB 3OZ6A 4UALA 2Y8OA 3V3VA 3VN9A 4QYGA 3RM7A 3QQKA 2VTQA 2Y6MA 2UW9A 2PE0A 3OFMA 2F7ZE 3D14A 4KB8A 4NH1A 5CAQA 2P2IA 1G8SA 4ZTMA 1K9AA 2R3KA 5CYIA 4FKTA 2OIBA 4O22A 4FEQA 2OBJA 3QF9A 3WF9A 4DGNA 3F2AA 3RNYA 4GJ3A 1J7IA 2OLCA 1ZYDA 2ZB1A 4HCUA 2ZAZA 3CTQA 2RL5A 4PPAA 3FEGA 3NYNA 3PZEA 4GH2A 4IWPA 3VUDA 2UW7A 3EQIA 4LRMA 3COIA 2HOGA 1L3RE 2PVFA 4JQEA 5LARA 1H4LA 3KL8A 2Q83A 4FSQA 4I5PA 3ORLA 4LOPA 3NEWA 4RIYA 3NCZA 3BYUA 4RX5A 1OUYA 4WKQA 3M42A 1JSVA 1OITA 2G01A 3H9RA 3AD6A 3ZU7A 5IISA 5J7BA 2CNUA 3FPMA 5HIBA 5IZFA 4FGRA 1PXKA 1FGKA 3T3UA 3ZFXA 1UU9A 3RAKA 4KS7A 3FYJX 1CKJA 4G16A 4AT4A 2XUUA 2R64A 5KKRC 1XH6A 3OMVA 2R3GA 4ACMA 4YURA 3LJ1A 1XWSA 3QCQA 5HX8A 1ZWSA 3E63A 5DE2A 1JOWB 1F3MC 4MBJA 3AOXA 4GFGA 3LM0A 4NIFB 3MFTA 4YLKA 3VS5A 5JGBA 3WE4A 3OWPA 3CKWA 2R9SA 2ITZA 2YN8A 4C4HA 3WF5A 4FZFB 4O7LA 1M14A 4AGDA 2ZM3A 4N70A 4YZNA 2P2HA 3LXLA 4GJ2A 5BVWA 3MBLA 5HE1A 1V0BA 3FBVA 4D2VA 5HEZA 1ZY5A 5GJDA 4EH6A 2R5TA 5HCXA 3ZOSA 1YI4A 2W17A 3Q4TA 5DEWA 3TKUA 3GC9A 2JBPA 2RFNA 4XLIA 2HK5A 2UZTA 5J1WA 1YXXA 4GVAA 4F4PA 4DH3A 4Z3VA 4QRCA 3QA8A 3I0QA 2X2LA 3UIXA 5CF6A 3DFCB 4F7NA 3RGFA 2O65A 3IW6A 2V22A 4ANNA 1ZMWA 4FK6A 4XP3A 4L7SA 2XJ0A 3FI4A 5ANDA 4XLVA 2YM3A 1SNUA 4OTGA 1R3CA 5F20A 5KMLA 3T9TA 4ZS0A 3E62A 3AGMA 2IW8A 4D4YA 1K2PA 2VGOA 2YZAA 2PPQA 2OH4A 3QHRA 4FA2A 3DBEA 3TT0A 4PTCA 3R9HA 2B9HA 3P0MA 4CFVA 4I92A 2XNGA 3K54A 2YISA 5D11A 1R0EA 5CANA 4KIQA 2JITA 4E8AA 4EUUA 3BHYA 4LGGA 4BGHA 4TXCA 3E3BX 3EYHA 3EQPA 4C4GA 5TR6A 3E8DA 3TIYA 4HGSA 4EH3A 4J8NA 4AW0A 4YO4A 2C6MA 4E3CA 5EOLA 4USEA 5DGZA 2JDVA 4I23A 4R8QA 3ORNA 1GZOA 2JC6A 3ODYX 4C35A 2VX3A 1U59A 3WIGA 2GNFA 2BZHB 2R3OA 4WA9A 3TNWA 2J90A 1OIUA 5J9LA 2UW3A 1VYZA 2ITUA 1SNXA 5EM7A 3FZRA 1H08A 1IASA 2XIKA 1YDSE 1Y6AA 1YI6A 2BRBA 3C1XA 2VTPA 2VWUA 2VTTA 3EFWA 4GK4A 2CN5A 4M0YA 4O0RA 4S32A 5EFQA 1H1QA 2QG5A 4WIHA 4ZAUA 2YDKA 5A4LA 1Z57A 5HVYA 2X8EA 3SQQA 5IKWA 4FIGA 4FSUA 4XHKB 4I6FA 2QLUA 4ERWA 3IDBA 4DFLA 5CASA 5J5TA 3M1SA 4CYIA 1BX6A 5KE0A 4C37A 5M44A 4WO5A 3GVUA 3THBA 4DITA 3QC4A 3R73A 4I6QA 4D4SA 4Q5EA 3A62A 2YJRA 2UW5A 3HP5A 2R3PA 2QI8A 3BQCA 3NSZA 3Q5ZA 3V04A 1IAHA 1MQ4A 3PJCA 4EK4A 1VZOA 3QRTA 4DE4A 4ANLA 3CPCA 1JKLA 2EXCX 2HZ4A 4IE9A 4M69B 4BDIA 3C9WA 4F99A 4IB0A 1H1PA 4ACHA 4KUJA 3PY0A 4YZMA 4QYHA 4ZSLA 2JD5A 3GT8A 3KREA 1XH5A 5CSVA 3VBXA 2W05A 1TQPA 2YM7A 3A99A 3CKXA 3ORPA 2OGVA 5AA9A 2R0IA 2O8YA 2GNGA 4KKHA 1JSUA 5BX0A 4MCVA 4GVJA 4F1MA 4JL9A 3ZZEA 4FC0A 3HYHA 1OECA 4OTQA 5HESA 5BVOA 3NWWA 5ANEA 2CCHA 1G5SA 1SM2A 2X2MA 2Y4IC 3MGYA 4NU1A 3UE4A 3V5QA 2B4SB 2VWWA 3OT3A 4ZZNA 1XBBA 1YWRA 4AZSA 4BDFA 4MHAA 2CSNA 2H9VA 1FOTA 4APCA 5M4FA 2V7OA 4Y83A 2IVVA 2JDTA 4CYJA 3G2FA 2VNYA 2BRGA 5EI6A 3T3VA 3CPBA 2WQEA 4BWXA 5FGKA 4EORA 2VRXA 2F9GA 3EFJA 4MD8E 1MUOA 3HAMA 5H9BA 1CMKE 4FEUA 1WBSA 1R78A 5FDPA 5HNIX 4CGAA 3FSKA 4UMTA 4CMTA 4NCTC 3G51A 3MTFA 4FT9A 2HZNA 3VS3A 4EHZA 5AV4A 5IQHA 1UNGA 3O7LB 3R7VA 4FNXA 4BCGA 5L4QA 4XS2A 2Y6OA 2FO0A 3EH9A 2QR7A 4BBEA 1UKHA 3VAPA 4Y46A 1ZZ2A 4FKUA 5KZIA 3A7HA 3HX4A 3AC1A 3HECA 3BWFA 1Q3WA 4YUQA 4CFFA 2KTYA 4C36A 2PHKA 3FZSA 2QOBA 3KU2A 3R28A 3QUEA 5K4IA 4O84A 1TKIA 3FLZA 4NW6A 1XJDA 4WG4A 2HCKA 2IVTA 1QCFA 2X4ZA 4G34A 3DKFA 4AUAA 4R3RA 4O86A 2XEYA 5JRSA 1G3NA 3I81A 3R1YA 1S9IA 2X9FA 4CTBA 2QG7A 4HVGA 2B1PA 3IPHA 3KRWA 4MQ2A 2Z7RA 2W4KA 5DWRA 3W55A 2OO8X 3ORXA 1KWPA 1G8AA 4LFIA 4RG0A 4RIYB 1OGUA 4DT9A 4ZTNA 4DTBA 3ZDUA 4ERKA 2C6OA 5KO1A 2Y4IB 5KHXA 2XKFA 4GYIA 2EU9A 4FNWA 5FEDA 4DCEA 5DYJA 2GNHA 3AGLA 3VIDA 2PVYA 4YNOA 3HV6A 1P5EA 4QP3A 4RVLA 3BZ3A 2X7GA 3Q60A 5J1VA 4E4NA 4BDKA 3C4FA 5C27A 3WZJA 4FYNA 3DAEA 3R9RA 4B7TA 2F2UA 1OPLA 3BI6A 3H4JA 2OK1A 4FKSA 5A4QA 1H8FA 3PPJA 4DFUA 5CQUA 2X39A 3BHUA 1IG1A 3VS4A 3DDPA 4Q5HA 4EHVA 5KBQA 4C4EA 2GSFA 3CD8A 4BTJA 3LMIA 4JRNA 1Y8YA 2O5KA 4ANOA 5AUTA 2HWPA 2QLQA 5IMEA 3WILA 2J4ZA 4L67A 5GIPE 4TL0A 4U79A 3GXLA 4XG9A 2XK7A 3ZDIA 5LCKA 5A3XA 3VUIA 2UW4A 1W0XC 4FOCA 3R8LA 4TYHB 2F7EE 3R00A 5AUUA 4X3FC 2IJMA 4K11A 3E92A 3NUXA 3RK5A 3QZFA 4QMMA 3V5TA 2C5YA 5K5XA 3VBQA 4MXYA 1JSTA 3HNGA 3Q04A 4PNKA 2R2PA 5E8SA 3KN5A 3CQWA 3KMMA 2QC6A 3AG9A 3QA0A 5CAPA 4IBMA 3ZC6A 2JGZA 2WNTA 3KEXA 4IDVA 4ZJIA 3KA0A 4BHZA 3EMGA 5AEPA 1P4OA 2YEXA 5JGDA 1XH7A 3NVKI 4OUCA 4FT0A 4RFMA 5FTOA 1NT2A 5IQCA 1M2PA 2EWAA 1PKGA 4I4FA 3UVPA 2VX1A 3R22A 3ROYA 1KOBA 1Q97A 2OWBA 3DTWA 2AUHA 2WTDA 2ESMA 5EW3A 4KIOA 4PPCA 4F70A 5A46A 2C47A 4OAUC 1W82A 4GIHA 2E9PA 5GZAA 3QWJA 3FL4A 4U6RA 3TUDA 5ANIA 2FH9A 3PA3A 3P9JA 4IANA 5HG9A 5FWKK 3WZUA 3LQ3A 4EL9A 3D5VA 3FZ1A 3I79A 4IH8A 4TYEA 5EI2A 4O7NA 4O7WA 4I1ZA 3FZOA 4BC6A 3DS6A 3EN6A 3UNKA 3EN9A 3QLGA 2WD1A 1GOLA 1WVYA 3HVCA 5JKGA 1L8TA 2YM4A 2RFEA 4IJPA 4P5ZA 5DR2A 4XOZA 1JQHA 4KIPA 5HO7A 3RI1A 3RWQA 4XP0A 4IX3A 4TWOA 3NLBA 4FOBA 3MSSA 3DU8A 4UZDA 2NPQA 4KWPA 4F6WA 4PTGA 4X3FB 4AN2A 3O96A 3PG1A 3R63A 4FSZA 5HO6A 3WYXA 3KULB 4BDCA 4EUTA 2PMLX 3R8MA 2FSLX 4L7FA 3P1AA 1LUFA 1PXJA 4G6NA 5CU0A 2PVNA 3AMAA 2OW3A 3LFDA 3NNVA 3U4UA 3TG1A 4TN6A 4BCFA 2WHBA 3A7FA 1OL7A 4PL4A 4BCIA 3PXKA 2C0IA 2QD9A 3FI2A 2IW6A 4MH7A 4A4OA 4F9WA 3WZKA 4FZ6A 4JG6A 1PXPA 1SVGA 4FKOA 1DI9A 5IEYA 4A7CA 3DA6A 3ZFYA 4C0TA 3ZXTA 4GL9A 2XNPA 3C0HA 3HV5A 4U80A 3SV0A 4EK8A 4EOJA 3AC8A 3DLZA 2E9OA 5JK3A 1QPJA 2C5OA 2YLEA 3BE9A 1E9HA 2I0EA 2ITOA 2W4OA 3G9LX 4GS6A 4NM5A 5ETAA 3LM5A 1OL5A 4ANSA 2WU7A 1PYEA 5C4LA 3BCEA 4GU6A 3VNTA 4ZEGA 2YIWA 2DS1A 3AT2A 4JAJA 1BUHA 4FR4A 5AV2A 2XKEA 5C9CA 4V01A 4EC8A 3OUNB 4DFYA 3EB0A 4JIAA 5E8YA 3R0TA 3NIEA 3LMHA 4QMWA 3PZHA 4C59A 4YZDA 4DEGA 5C4KA 3DQWA 4F7SA 1Q8TA 4K2RA 2YAKA 3WYYA 4AW2A 3QTXA 3GU5A 3I4BA 1IEPA 4FVPA 4ZIMA 5IA0A 3NYOA 4E4XA 2C30A 2PE2A 2B7AA 2UZWE 1ZYSA 2RSVA 3JYAA 3LCKA 1U5RA 4DYMA 4YJRA 5JEBA 2ITYA 5TKDA 3Q2MA 3GI3A 4QPAA 5CWZA 3OCBA 4IVAA 4RIXA 1BLXA 4F7JA 5EKNA 5EQPA 3FV8A 5I9XA 2HXQA 1PXOA 4GUBA 4JDJA 3MB7A 4D58A 3CQEA 4DCAA 4BKJA 1XR1A 4XBRA 1R1WA 3DKGA 2BCJA 4WNKA 4Y8DA 5L2QA 1WCCA 1J1CA 1KE7A 1KOAA 4FSNA 5I9WA 4CLJA 2NNWB 4IZAA 5AM6A 4UN0C 4QMQA 4II5A 2B9IA 4IWOA 5ITAA 4TW9A 2BDJA 4Z9LA 3C5IA 3HUCA 4CVAA 3PVUA 3MVJA 2ZDUA 4FVQA 4NIFA 4RPVA 1OVEA 3F3VA 2VTSA 3HDNA 4I5CA 4CRLA 4CG8A 2GNJA 3QQJA 4QTAA 2RG5A 2VO7A 5CAUA 2B53A 1JWHA 5KZ0A 4QQ5A 3BRBA 4IB1A 1B6CB 1B39A 3E3PA 3R6XA 3KXHA 1OL1A 4BGGA 1OKZA 3E64A 5JFXA 4UYAA 5DIAA 5ANGA 1CM8A 2H6DA 4R7BA 2WTCA 2C1BA 3QHWA 4M12A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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