3QHWA

Structure of a pcdk2/cyclina transition-state mimic
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
GHMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Briefly Bound to Activate: Transient Binding of a Second Catalytic Magnesium Activates the Structure and Dynamics of CDK2 Kinase for Catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase/protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qhwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qhwA01
1OMWA 3CJGA 4AZWA 5F94A 4O0VA 5C8MA 2NRYA 4FKVA 4EH4A 1YXUA 2UZBA 2O0UA 2WQEA 2YM6A 2WGJA 2C69A 4Y73A 3IW6A 5AP7A 3TNQB 3C0IA 2JIVA 4WA9A 3LQ3A 1M2PA 2EWAA 1JSTA 4IJ9A 2VRXA 3FZRA 3NAXA 5CU3A 5AX9A 4BWKA 4FL2A 4CFMA 3R9RA 2WFYA 3EYHA 3PPJA 1KWPA 3UC3A 4E4LA 3SG8A 3EN4A 4QO9A 2PHKA 4O7ZA 3GFEA 4I5PA 4MTAA 3FSFA 4HYIA 2YLFA 1JSVA 4KBAA 4QMYA 4JIAA 4TPTA 5DBXA 4CKJA 3R73A 3C51A 3MBLA 2B54A 3BE9A 2J0LA 2JDOA 3NWWA 1XKKA 2QO7A 4I5CA 3TIYA 2OFVA 4J97A 3PVGA 5HBHA 3MN3A 2WQNA 2JFMA 3KMUA 4GRBA 4RC4A 4CGAA 1UNGA 4PP7A 5K3YA 3QQFA 5BYYA 4TXCA 4AZEA 4E5WA 3KN5A 4FV4A 4LM5A 4FTIA 3BGPA 4RZWA 5FP5A 4DAWA 4F9WA 1IA9A 1IAJA 3TUBA 3ZO1A 4FTAA 1Q99A 1VYWA 2CKEA 3PSBA 3Q6UA 4EOKA 1W84A 1PY5A 3BQRA 4PDSA 3NW7A 3FC2A 5E8VA 2BTRA 3WZJA 3LFEA 3P0MA 1W7HA 1XO2B 5D1JA 1ZOEA 2HCKA 5HO6A 2VWVA 5AP3A 4QMQA 3BE2A 2XB7A 5IMEA 3S3IA 3VRZA 2QG7A 4KSPA 5LVNA 3FQEA 4I24A 4BYIA 4PL5A 4MCVA 3U4UA 1Q62A 3C13A 4V05A 4BL1A 2I0EA 3AC2A 3IW5A 4OBPA 2NP8A 5HG9A 3R7OA 5JQ8A 2I7QA 2R3HA 3PSCA 4WOVA 1GY3A 4QTEA 4NK9A 4YC3A 5IF1A 1OZ1A 1QMZA 4MNEB 3QCXA 3HP2A 2LGCA 2NPQA 3V8TA 4EUUA 3TV6A 1TVOA 4ZTHA 2AC5A 4F63A 4BWXA 5IDPA 1YWRA 4BY9E 2B55A 3FPMA 2VO0A 4X3FA 4XS2A 5DYJA 2BILB 4F6WA 3QQJA 3LM0A 5IKWA 4GU9A 1FPUA 4HCTA 3FL5A 4NCTC 2YIWA 4P7EA 4EH7A 4RPVA 4X2KA 1MUOA 1CKJA 3BHHA 3QTZA 5IA1A 2XA4A 3ZSGA 2A2AA 4CFUA 3V5JA 4DTBA 2W17A 2ZMDA 3ENMA 3CKWA 2OH4A 4XYFA 4U8ZA 4OTPA 4QP2A 3FZSA 5CEOA 3UVPA 4QMZA 1ZRZA 4EZ3A 1RJBA 4DHFA 4YZ9A 5CT0A 5BYLA 3FI2A 3G9NA 3RP9A 2XIYA 4R3PA 3VS0A 4MF0A 5ANJA 4TKSA 2YWPA 3PXQA 5JK3A 4YLKA 2XK8A 3UVRA 4EEVA 4BDBA 2OZAA 3UQGA 3W10A 4CV9A 1YOMA 4D2WA 4MQ2A 4NKAA 3GVUA 5ACBC 3EYGA 5ICPA 5E8XA 4C3FA 4Y85A 3C4EA 5FXQA 4R1VA 4DLIA 5A54A 2XEYA 1WBVA 4R8QA 5B2KA 4AXAA 3CD8A 4C37A 5CQUA 3OWKA 1JKTA 3R71A 5DT4A 5TOZA 4BI0A 3EQBA 2B4SB 1GIJA 3GU7A 1OIYA 4TWOA 5AUZA 3Q52A 4I6FA 5DFPA 5E9EA 3LCTA 3P7BA 5IA5A 4BICA 3V5PA 4D4YA 3QQUA 3O0GA 5HIBA 3ROCA 3QALE 3IDCA 1JAMA 3EQPA 3QYZA 4KSQA 2VTRA 4RRVA 4CRSA 3W33A 1BYGA 2YIRA 4M13A 2Y6OA 4H58A 5L2SA 1KE8A 1F3MC 3PJCA 2W05A 1UVRA 1XBBA 2ITZA 5TKDA 2JIUA 2GHLA 4FL1A 3ELJA 5IH4A 3UO6A 1MQ4A 3MI9A 3HAVA 4QP9A 4ZMFA 4RC2A 2ZM1A 1UNHA 3LFAA 4FKQA 3UTOA 5IUHA 1PXIA 3BIZA 3QA8A 2VX3A 3SXSA 3T3UA 3MV5A 3VW6A 5AIKA 4BCKA 3MFTA 2YDJA 3RHXA 2CKOA 4G31A 4OBQA 5GZ9A 2B53A 1OKZA 4U81A 4WRSA 4HPUE 3PJ1A 4BRXA 1ZMUA 3G0EA 2XNEA 1U5QA 2YJRA 3PXFA 4EHZA 4LOOA 2GS7A 3K3JA 4OGRA 4LUEA 3MTFA 3R7UA 2R3QA 3R2YA 4FV5A 5DA3A 3KFAA 4WSQA 3KEXA 3R7EA 3FZPA 2P33A 3H0ZA 3COIA 1UNLA 3IW8A 4PMPA 1ZOGA 3CR0A 3HECA 3KGAA 4RFMA 1G5SA 3CQWA 3QQLA 4B99A 4FTTA 2OJIA 4IX3A 4YLJA 2R7BA 3AD4A 3V8SA 2XKFA 3POOA 3G9LX 1YHWA 4I0TA 4F9CA 4D28A 5JN2A 2UV2A 5A9UA 3BGQA 3WE8A 3S00A 2BUJA 3LW0A 2HIWA 3B2WA 3ZTXA 4RA4A 1ZAOA 4IM0A 4QP8A 3CTQA 3AMYA 3GENA 4QYGA 5HNBA 5LMAA 4K2RA 4UALA 5HCYA 3DQWA 3GQLA 4II5A 4NEUA 3WIGA 2XNGA 2PK9A 4H1JA 5M4IA 4XX9A 3ZO2A 3RPRA 4Z3VA 2GMXA 5A4CA 4O21A 3TUCA 2BHHA 4XUFA 4FIIA 3LJ0A 5H8EA 3KVWA 2OIQA 3PXKA 2WTWA 3EZRA 4BWPA 4YTHA 5FDPA 1PF8A 5JMSA 3UOJA 2YM7A 3KF4A 4DGGA 2WHBA 2W4KA 2WU6A 3A4PA 3HYHA 4FSQA 4M15A 4QP3A 5EI6A 3TZ7A 4AGWA 4DITA 2ZMCA 4IADA 4ITHA 1J91A 2UZNA 3JPVA 4FZDB 4P4CA 4I0SA 3L1SA 3MYGA 3A61A 5D41A 3RK7A 1BMKA 2IVTA 2WQMA 3KXXA 3VW8A 1PXOA 3AQVA 5J5TA 5L3AA 5CANA 5AUVA 2Y4IC 3BYUA 4BCQA 1UWJA 2VN9A 4GL9A 5JQ5A 4A06A 3A7IA 3DBDA 3FHIA 4RWKA 2GPHA 1YDTE 1ATPE 1PHKA 3O2MA 4W9WA 2JDSA 4KABA 1J3HA 3R7GA 4L6QA 1EH4A 1NVQA 4HVDA 2C6KA 3OHTA 5JSMA 1JSUA 3E8DA 4ITIA 4CTCA 4MXCA 1R0PA 4YGAA 4FGBA 3LIJA 5HORA 4AF3A 4LGGA 2PVRA 3A2CA 4RIXA 2VUWA 4S30A 3DXNA 5HE1A 4ZTMA 3UGCA 4XV2A 2PMNX 4G3FA 4C4EA 5M4CA 4R7HA 2Y8OA 4YLLA 3C4WA 4D0XA 1P14A 3ETAA 5IQBA 5CASA 3F2RA 1H0WA 3ZH8A 5GJGA 5BVNA 2PUNA 4BZDA 3IG7A 2A0CX 4I94A 1JNKA 3TN8A 1WVYA 3AC5A 3IOKA 5C03A 1JWHA 5J7BA 3TM0A 2JAVA 4O0UA 3ZO3A 3O7LD 4BHNA 2XYNA 5HICA 1Q8YA 2W1EA 4QQTA 1M2RA 1Q61A 4NM0A 4UXQA 3D4QA 3LHJA 4RIWA 3POZA 4XG8A 3UIUA 4IAKA 3A60A 2BHEA 2PE2A 3AT4A 3Q32A 2YM3A 3RJCA 3VF8A 4PDPA 2CCIA 4ACHA 3Q4CA 2XCKA 1APME 3R83A 4R7BA 4KS7A 4IB3A 4BCMA 5CEQA 4QYEA 2WNTA 3QRJA 2O2UA 4X6RA 2FA2A 3JUHA 3TZMA 2BDWA 4GKIA 4ORKA 3PIXA 5EG3A 4FT5A 2VZ6A 5DRDA 3EQRA 2V7OA 3R1NA 2C1AA 1SM2A 4GH2A 4LI5A 4WHZA 2CLQA 1M14A 3BHTA 3EWHA 3MPMA 4G9CA 4WIHA 2VO7A 4FKGA 5L2QA 3GUBA 2QG5A 4J71A 4O0TA 3ZUTA 4EQMA 4HGSA 3FMKA 4Q2AA 4BIEA 3F61A 3PA5A 4MK0A 4XRLA 1M2QA 3CE3A 4FF8A 5GNKA 3G5DA 4C57A 3MH3A 3Q5ZA 2X4FA 3S2PA 3BQCA 3NNVA 4HGEA 3TL8A 4EHEA 3TDVA 3NCZA 2J5FA 2R5TA 3E8CA 3COKA 1OI9A 3QXPA 4AOJA 4FUYA 4WG5A 3IGOA 2Z7QA 1J7UA 1MRVA 3TKUA 3KY2A 4DEEA 5HX6A 1LEZA 3E7OA 3RPSA 4ANOA 5CI7A 3O50A 4AE6A 3U4WA 3GOPA 4HOKA 5CQWA 4ZTLA 5IA2A 1URWA 4PV0A 4IIRA 1BX6A 4HW7A 3P7AA 2CHLA 4B9DA 3F66A 4GJ2A 3R8VA 3DNDA 2CN8A 4NIFB 1GOLA 2WELA 2R3KA 4LL5A 3RGFA 5IU2A 4D2SA 4L3JA 5HTIA 5CU0A 4OTIA 4QPMA 1MQBA 1CMKE 5CVGA 5AP2A 4ZTSA 1DI9A 2BDJA 4E6QA 3KN6A 4J95A 3ZLXA 4L43A 3WYXA 1LEWA 4IM2A 3UBDA 4FIEA 4UMRA 4AACA 4IX6A 4GV1A 5FTGA 2ESMA 4W8DA 2ERKA 4J1RA 2PU8A 4BCPA 5J1VA 5M56A 4X3JA 5F1ZA 4Q9ZA 1FBNA 3GC8A 3HNGA 4BVUA 4FKOA 2YDIA 3QZHA 5AR7A 2UW9A 2YN8A 4RX5A 4R1YA 3GI3A 3FMMA 3QRKA 3W32A 2CGXA 4YUQA 3R8MA 2WMSA 4ERKA 2WMWA 4MNEA 1SNUA 5D7VA 3NUSA 1Y8YA 4PL3A 4D58A 3MVLA 5K0KA 2QHNA 3FJQE 2FSMX 4GUBA 3SG9A 2CN5A 5AR2A 3BLQA 5FM3A 3UIXA 3AXWA 3BCEA 2YHVA 3DAEA 5A4QA 1R78A 2QKRA 1Q41A 2QKWB 4CMOA 2DUVA 2WB8A 5CXHA 4IB0A 2ZM3A 4PMSA 3GFWA 4EK3A 2R3OA 5C8NA 2PWLA 3EZVA 4OR5A 4O38A 4XG4A 4O7YA 5HVJA 4DT8A 2GTNA 4CVAA 3ZS5A 5IQGA 5HNGA 4H39A 4U41A 1KE7A 3GB2A 2F4JA 3PIZA 3QWKA 4JDKA 3GCSA 2J6MA 4O86A 4FVQA 5FGKA 4UMUA 2YFXA 5HEZA 2YCFA 1RW8A 4WO5A 2QU5A 3I5ZA 3UP7A 3FKLA 4Z7HA 3NR9A 3FLZA 3OW4A 3QX2A 3D5WA 3HLLA 4LV5A 4ZJIA 3UMWA 2QO2A 3ORPA 4DEAA 4JDHA 3S95A 4DFXE 3A8XA 3ORIA 5AADA 5JT2A 5DVRA 2O65A 2G15A 3ACKA 3EL7A 4GKHA 2OKRA 4FR4A 5BNJA 3Q53A 4M8TA 5JZNA 4A4XA 3HAMA 4AT3A 2JBOA 2Z7SA 5ANGA 4D9TA 3HUCA 5I3OA 4GT3A 4C7TA 1H4LA 3OUNB 4RT7A 5AUYA 4TYJA 4ZEGA 1OITA 2CGUA 3G6HA 4BTFA 4CD0A 4NSTA 4BDJA 3H9OA 4YZDA 5ANEA 4ALUA 4I6QA 5D10A 4AZSA 1YI6A 3MVMA 3VUKA 3ET7A 4UN0C 4JIKA 4JG6A 2W96B 4Y95A 4WNMA 4EORA 3I60A 3OCSA 5KO1A 5M55A 3MB7A 4ZLZA 4DFYA 2BKKA 1H00A 4GCJA 3I6UA 4WUAA 3VRYA 3TUDA 1OKVA 2IVSA 1ERKA 3UQFA 4ZLYA 3EKKA 3II5A 3FC1X 2B52A 4ANQA 4FG8A 5KHXA 1TQMA 3LM5A 3QAME 4XG7A 4CXAA 4KIKB 3MPAA 3KRWA 2F49A 3QRTA 1JOWB 4RC3A 3DFCB 2R3JA 4C4GA 5GZAA 2WD1A 5J79A 2GFSA 1JPAA 3ZU7A 2CCHA 3SVVA 2PUUA 2JC6A 3U6HA 2V5QA 1YRPA 1BUHA 4UB7A 4YZNA 4ERWA 3CKXA 3OOMA 4FSTA 3R02A 4Y83A 2G01A 4IJPA 5EW3A 4GEOA 1KUTA 2QONA 4GG5A 5KMNA 5L6OA 5EI2A 4F9BA 3KF7A 5ETIA 2OJGA 4F08A 3NNWA 3KB7A 3HEGA 3TDWA 2HW6A 2W1GA 2VD5A 2WTKC 4N70A 2W0JA 4QPAA 4UXLA 5DR2A 5KZ0A 2GS2A 5EYCA 2J5EA 3R0TA 2XKEA 1XH4A 1P4FA 3KULA 3OT3A 5D12A 3NVMB 2QU6A 4NUSA 5M08A 3PA3A 4XG6A 3UZTA 3E7VA 5FD2A 1DI8A 4QD6A 2QHMA 3PPZA 4GK4A 3VBYA 3ZLSA 5LWNA 2XH5A 3WIKA 3IECA 3DLSA 4GT4A 5JZJA 2CDZA 5CT7A 3WE4A 4U5JA 2W9ZB 3OY1A 3QXOA 4AU8A 1E9HA 3ZC5A 2GU8A 2YISA 3PXYA 2C6MA 1OKWA 5CVFA 5C9CA 3V5WA 3MA3A 3IW7A 3G2FA 2EB3A 5E92A 4EQUA 4IANA 5AP5A 3W16A 4A07A 2X9EA 2FSLX 4O7VA 5KHWA 2XUUA 3I1AA 4W9XA 3SXRA 3QA0A 5FUTA 2BIKB 5AM6A 1UU8A 3Q9XA 4F7JA 4PQNA 1IG1A 3R7IA 2X2KA 4E26A 1B6CB 3ZMMA 2OO8X 2YDKA 5HU9A 3KQ7A 4XH6A 4QYHA 4KUJA 1FVTA 3FQHA 2I0HA 3H9RA 3SC1A 3DLZA 4TYHB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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