3QHWA

Structure of a pcdk2/cyclina transition-state mimic
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
GHMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Briefly Bound to Activate: Transient Binding of a Second Catalytic Magnesium Activates the Structure and Dynamics of CDK2 Kinase for Catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase/protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qhwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qhwA01
5EG3A 4XG2A 5LVOA 3L1SA 3MDYA 4H36A 4ANQA 1JVPP 3LJ1A 4MXZA 3IDBA 5DRBA 3OW4A 3LIJA 3ZZWA 4ZLZA 3ERKA 4CZYB 4EHEA 3Q2MA 4FT3A 2FSLX 4AA0A 2ZMCA 5CLPA 1MQBA 4KKHA 4M66A 4YC3A 2OXYA 2GNLA 3E92A 3VS3A 4NJDA 4CV9A 3ROCA 2JFMA 4K2RA 3VS1A 4C36A 4DT8A 3GUBA 2GFSA 3KGAA 4TY1A 3WF5A 1Q62A 4IACA 2VWXA 1IR3A 2DYLA 2YAAA 2ZM1A 2VTHA 4Z9LA 3RNYA 2WMRA 2PZIA 2WEIA 5IZFA 3R8LA 3UIBA 4I93A 4O2ZA 4R3PA 1H27A 3FMDA 5FD2A 2I7QA 4FE2A 3WILA 4LGDA 2QC6A 4B8LA 2JKKA 5CQUA 1B39A 2XNOA 4YJQA 3WIGA 3DB8A 2XEZA 4D9TA 5HTBA 4O0TA 2PY3A 2XK4A 1XJDA 4FNYA 4DLJA 2FB8A 3SD0A 4WD5A 2PTKA 4A7CA 4O83A 2P3GX 2OU7A 4OUCA 4BIEA 5FBOA 3V01A 4IB0A 3AG9A 5AUVA 4Y8DA 3I7CA 2HWOA 2UVXA 3AT2A 4HYUA 4O2PA 4CMUA 5CAVA 3U6HA 2RFDA 2W99B 2UW6A 2UZEA 1JNKA 2YABA 4PF4A 3G51A 1JKTA 4HOKA 3NCGA 3IDCA 4IX4A 3SGCA 3U54A 2XMYA 5M07A 2VWVA 4FV2A 4I20A 4QP7A 4B9DA 4Z7GA 1WAKA 3UQGA 5CANA 4EK6A 2PVRA 2XNEA 4EOLA 5KBRA 3TV4A 4I0TA 3SDJA 4E5AX 2WHBA 2BHHA 3PJ8A 2PVNA 4U79A 4NWMA 5I9VA 4DC2A 4RVTA 4XOZA 5I9YA 3R7IA 3OF0A 1YI4A 3MPTA 5DT0A 2O2UA 2CNUA 4UEUA 3CQEA 3QHWA 2HAKA 4KIPA 4ZSLA 2PE1A 4QRCA 4CQEA 3SC1A 2ZM3A 4JQ8A 4EQUA 1GAGA 4L01A 2QO7A 4FKPA 1M52A 4PUZA 4RWJA 3KRXA 3COKA 4D0WA 3COMA 2ZV9A 4IB3A 4B8MA 4ID7A 3GFEA 5EHYA 4HCTA 2HY81 4HGEA 3SX9A 4L9IA 3QQKA 4F1TA 4EH5A 1U5QA 3FKOA 4QYEA 2X7GA 3AOXA 5E8SA 3CJFA 1R39A 2FH9A 4ACCA 3LCTA 3NNWA 2P33A 3MIAA 4HPTE 1E1VA 3IW4A 2V7AA 2R3KA 5IA3A 1S9IA 4RMZA 4TTHB 1QPDA 2XIXA 5JH6A 4YZBA 4U81A 3DKGA 2IW9A 1UWHA 5K5XA 3QRIA 3QTRA 4RA4A 2F57A 5FEQA 1Y8YA 4F65A 5IKWA 5GINE 2A19B 4XCUA 3FHIA 3ZZEA 4EH6A 5JQ8A 1M2QA 5EYMA 4FOCA 3TWJA 4Y83A 4BCQA 3BE9A 1PMEA 2J0IA 3UIUA 4ZTNA 3TL8A 4YUQA 5HGIA 3R1NA 3KQ7A 4UMTA 4AZEA 4CCUA 3QTUA 3MTLA 4LUEA 2HZIA 4EOSA 2UZBA 2UZLA 2QI8A 3G5DA 5L8JA 2UV2A 3KMMA 4GIIA 4F63A 4N57A 1NVQA 2W05A 2YZAA 3D4QA 1ZLTA 4IJ9A 2JBPA 4IVAA 3FXXA 4YHFA 3LVPA 1TQPA 1BI7A 1UV5A 4NIFB 3QXPA 4FV1A 4CT2A 3UIMA 2FGIA 2J2IB 4C3FA 3BIZA 4QMVA 3QUPA 4GRBA 2JFLA 2QKWB 2DQ7X 4N4SA 5BMSA 2RFEA 3BHHA 4QPSA 3PSBA 3ZC5A 4I5MA 3VUMA 4F99A 1BLXA 2PMLX 4S34A 4P90A 3W8QA 4YLKA 5IMXA 1Q61A 4IM0A 2CGVA 2VNWA 3KRLA 4FIEA 4C02A 5H3QA 2YISA 4QQ5A 5A6OA 4JS8A 2XKCA 5A4QA 2Y8OA 4OAVB 4MF0A 4S30A 3JR1A 2Z7SA 3NNUA 2EU9A 4S33A 2JLDA 1YRPA 3F2AA 4RJ5A 3ZCLA 2WQOA 3E8DA 2HK5A 5HBHA 1J7LA 4Y5QA 5DPVA 1PXMA 4AN9A 4FZ6A 4WG3A 4K18A 5E8VA 2BRHA 4EZ7A 3REPA 2BFYA 2I6LA 4BDKA 5JRQA 2O65A 4IFGA 2VTNA 3KCKA 3NS9A 4FIGA 4IZ5A 4DTKA 3QUEA 3QTIA 4NSTA 4D4RA 1A06A 4GCJA 1KV2A 3CTHA 5EM7A 4I94A 5DBXA 3UPZA 3AD5A 1PY5A 3A7IA 4DYMA 3GT8A 3LAUA 3FZOA 4GVAA 3RPYA 2QOKA 2OO8X 1JBPE 4J8MA 2OH4A 2IW8A 3ROYA 2O64A 4MF1A 3R7EA 2I0EA 2OF4A 3QRUA 4XLIA 2UZUE 2ITZA 4FTOA 1OB3A 2RFNA 4X6RA 4AWIA 5E4HA 3FYKX 4XH6A 4J95A 4MH7A 5DFPA 2RKUA 4ZMFA 4CG9A 4FSUA 3EQFA 2GQRA 3RHXA 2VV9A 3Q5ZA 2PVJA 3ZO4A 3NVMB 3OWPA 3ORIA 5HLNA 5K5NA 2ITTA 2I0HA 3LHJA 5LVMA 5BYLA 5AP7A 3GOKA 2UVYA 3I5ZA 4A4OA 4AAAA 3VO3A 2BHEA 2GDOA 3EQIA 2FUMA 5J7HA 4I41A 4WIHA 2OXXA 2XRUA 4ZIMA 4FUYA 4O1OA 3W33A 3FLYA 5K9IA 1YOLA 3QC9A 2QURA 2R3LA 4BDJA 4N0SA 5DWRA 1OIUA 2V0DA 2B9IA 1FVRA 3PSDA 4TNBA 4QP2A 5AR7A 5ACBC 3OUKA 2G9XA 4FSRA 4BI2A 3QD3A 4QMOA 4X2KA 3C5IA 4F4PA 3ZEPA 4EWQA 1XKKA 4H3QA 1GZOA 2YCFA 4J98A 3DLSA 4WO5A 3LM0A 3EN4A 3QQFA 4FODA 3R2YA 2QG5A 1ZYCA 4RIYA 4M7IA 4QTEA 1KV1A 3CBLA 4L46A 4X21A 3F5XA 3PYYA 4C4HA 2WTDA 3KU2A 3C0HA 3MB7A 3VS7A 4OGRA 5ETAA 3PP1A 3WBLA 4AOIA 3UYTA 2WMXA 4LRMA 3CY2A 3QLGA 2R3IA 4ZY5A 4IZ7A 2VN9A 4ASXA 3FI2A 4FEXA 4DFUA 2XK9A 2YJSA 3Q04A 2R3HA 3NDMA 4DH1A 1YHWA 4DG2E 4WA9A 4Y46A 2W4KA 3OCBA 3FI8A 3BGZA 3CY3A 3NGAA 3VULA 4FTUA 3LOKA 4PTGA 1MRVA 4XV2A 5DEWA 4NW6A 4BY9E 3LFNA 3HUBA 5BVNA 3E64A 2X4ZA 3S00A 2JDSA 1ZMVA 2UZOA 2X6EA 3VS2A 2VAGA 4LMUA 4IWDA 4NFMA 4XG3A 3UNKA 3LCDA 4Y72A 5B2LA 4PL3A 5I5ZA 5J95A 3I81A 4ITJA 5IA5A 4RBLA 2B52A 2ONLC 3DCVA 4B4LA 1GIJA 5H8BA 4YU2A 4G5JA 4L00A 5HEZA 1OUYA 4S2ZA 5CU4A 3DNEA 2W4JA 5D41A 3UDBA 4D4VA 3TKHA 1GZ8A 3KULA 4CTBA 2BRBA 3BV2A 1FMOE 2ZDTA 4PNKA 2BR1A 4BYJA 3I0QA 3SXRA 3QX2A 5ITAA 3D83A 4MNEA 4BZDA 5I9ZA 5L6OA 3UZRA 3QUDA 1URCA 5E90A 3UVPA 4S32A 4AW2A 4EHGA 5FLFA 2JITA 3PJCA 3NW7A 4U43A 2Z60A 3LXKA 4RSSA 4OT5A 3V5PA 3CSVA 5C9CA 5EYDA 4IDTA 2CKPA 4CV8A 4K8AA 4B7TA 5HCZA 3B2WA 2YA9A 3CR0A 3PE1A 5E8UA 4R3CA 3A7FA 4GJ3A 2X2KA 3BHUA 5C4KA 2QOOA 4AG8A 4XX9A 3F5GA 3WF9A 3FQEA 5IQHA 1OIYA 2C6DA 5IQBA 2W1ZA 4C4FA 4EK4A 3RTPA 3MV5A 3MSSA 4FKGA 3Q4TA 4KIOA 5IUGA 3BCEA 3LCKA 3HV3A 4GUBA 3QWKA 2OZAA 2QOBA 3CIKA 5AV4A 2GNHA 4CG8A 1ATPE 5IA0A 3S0OA 3U9NA 3BEGA 3BU3A 2PSQA 5CEOA 4QP1A 3FL5A 5JT2A 3PZHA 1SYKA 3CLYA 4FKWA 3GBZA 3JY0A 3QC4A 2C6MA 2YCSA 3UZTA 5HD7A 4KS8A 4QYGA 4OTFA 5HI2A 2BCJA 3GFWA 1BKXA 4R7IA 3IECA 4KNBA 4BKZA 2FA2A 3D0EA 1RDQE 5IPJA 3CE3A 3ORPA 3PTGA 5AUYA 4ANSA 2Q0NA 3DKOA 4EYMA 2BRNA 3MW1A 2OJJA 4B6LA 1XH8A 2F9GA 3IPHA 4DGNA 3SG8A 3AMAA 3MFRA 4LOOA 1YWRA 3DJ6A 1H08A 2PHKA 4ZTSA 3PXFA 4ZAUA 1NW1A 3CPCA 4FG7A 2IVTA 4DFBA 1OIQA 2PVFA 3BWFA 4AE9A 4D2PA 3TUDA 1H01A 5LWNA 5JRSA 4IZAA 4BDGA 1OIRA 4QP9A 3CJGA 3HEGA 3KL8A 3NW6A 2QHNA 1BX6A 5EI8A 3C4EA 3ATTA 2XNMA 3RK5A 2XBJA 4RVKA 2W0JA 3S4QA 5A4EA 4J71A 2P55A 5FP6A 2CN5A 2W1DA 4FKUA 2CLQA 4USEA 2XCKA 4RX8A 1KE5A 4U8ZA 4I6FA 5KMLA 2PUNA 4F7NA 4YSJA 1JKSA 4C3PA 4W4YA 4X2FA 4NFNA 3KF7A 1PJKA 2JEDA 4YC6A 2W96B 2EWAA 3I6UA 4NTSA 3G15A 4GJ2A 3E8NA 5EQYA 3FAAA 3VUKA 1KOBA 4Z16A 3O7LB 4F09A 2XKDA 2VWYA 4E6DA 1LEWA 2UVZA 3COHA 5DT4A 4JT3A 3GOPA 1J3HA 2NRUA 3HMMA 5LMAA 2VO7A 3PPJA 5CI6A 1SM2A 5LVNA 3CD8A 2IG7A 4CFWA 4ACGA 4KA3A 4K1BA 4DCEA 1DAYA 3WZKA 2G1TA 3DBDA 3NAXA 5HICA 4QYYA 2WOTA 2PZ5A 4DEIA 3MY1A 5ANJA 3IQ7A 2G15A 2C3LA 1ZARA 5CSWA 3C50A 4C59A 3COIA 5DR2A 3V3VA 3VS0A 3DDPA 3DNDA 1L3RE 4LOQA 2XJ0A 2WQMA 1OL6A 4CTCA 3FEGA 3CXWA 3CPBA 5KZ0A 4LGHA 2PVHA 3AXWA 3LMGA 3OS3A 4IANA 5J5SA 4BKJA 3OROA 4AF3A 5TF9A 5CQWA 3A99A 5EW8A 4PPBA 3SV0A 3EFJA 3OEFX 4U3ZA 4Q2AA 5KX8A 4TKSA 4ZP5A 4UX9A 4LGGA 3ORZA 1TQMA 4F6WA 2XH5A 2EXMA 2UW4A 3C51A 4AZFA 4GFOA 3FMMA 3I0OA 3PE2A 4WBBB 1Q8WA 2BILB 4KIKA 3GU7A 2YZLA 4FV8A 1O9UA 1J91A 5M4CA 1FINA 3GC8A 3LQ8A 4YJSA 3KK8A 4ZK5A 3ZFXA 3E3BX 4P2KA 4PP7A 3ATSA 4AX8A 3QF9A 3G9LX 4G6NA 3GENA 2X2LA 2YEXA 3TDVA 3CP9A 4MXYA 4EH9A 2OK1A 2RGPA 4BCIA 2UZNA 1A48A 3OWKA 4HYSA 4BTJA 4ERKA 4MXCA 4RQVA 4FTJA 2C6TA 4CMTA 3MVLA 4YZNA 5JFWA 3EMGA 1XR1A 5BUJA 4I1ZA 2VWZA 1W0XC 5L2QA 3VVHA 4ERWA 2IZUA 3UOLA 2JC6A 3HVCA 3MGYA 4ACDA 3R1QA 3AQVA 3DPKA 3MVJA 4YPDA 5AADA 3TIZA 4XP3A 4FKSA 4B99A 4X0MA 3VUHA 1M7QA 5ICPA 2PMOX 5GNKA 5AUXA 4MXAA 4TXCA 4XRJA 3NYOA 4ZZOA 4E3CA 1Q8ZA 4NH1A 3HL7A 2ETKA 1H00A 1WVXA 2HY0A 3CTJA 3Q9XA 4U40A 4X2JA 1SNXA 3G6HA 2J50A 4YJUA 2ACXA 3EKKA 2XIRA 3QCQA 1H1RA 3QLFA 5FWKK 3KN5A 2O8YA 3KULB 1P4FA 1OZ1A 2B7AA 5AP1A 2VWUA 1PRYA 4ITIA 2P0CA 4LG4A 5EM6A 2OJGA 3ZONA 4UYAA 4ZTHA 2XCHA 4C7TA 4FYOA 5LWMA 2FVDA 2OIQA 2VTTA 4MNEB 1FMKA 2R7BA 4M68A 2OF2A 3V51A 4M14A 2OSCA 2IVUA 4U7ZA 2W9FB 4EOOA 5HO7A 3LFEA 3GQIA 5CENA 4EOMA 3NMUF 4TWCA 4O1PA 4BIDA 3WOWA 3F7ZA 2WZJA 3FY0A 5CVGA 4D4SA 2ZB1A 3LPBA 1DM2A 3DK7A 4KWPA 2Q83A 2BALA 2G2FA 4F08A 3ZUVA 4GSBA 2VNYA 3NYVA 2XBAA 5HTCA 4AXAA 4EWHA 2BIYA 3GVUA 2OXDA 4PV0A 4I6BA 3CC6A 4U5JA 4CT1A 4XRLA 3QRKA 3QQLA 4O21A 3UIXA 3S3IA 4O96A 3MS9A 3O2MA 4Z55A 3W32A 1OI9A 4IFCA 4X3FC 4I3ZA 4QYFA 2VO6A 2UW3A 2W5AA 5DMZA 4F9BA 3BLHA 3VBQA 3FQHA 1JSUA 4BDDA 1GJOA 4U9AA 5ANIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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