3QL8A

Cdk2 in complex with inhibitor jws-6-260
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ql8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ql8A01
3QYWA 1AGWA 3KEXA 2FYSA 3DBCA 4LI5A 4EEVA 4ERWA 3ORPA 4NSTA 3RAKA 3IW4A 3SXSA 4FKIA 4RQVA 1R3CA 4FSRA 3W1FA 4WG3A 5J1VA 4JNWA 1JAMA 5AV2A 1P2AA 4HVGA 4PL4A 3RP9A 4IWDA 3NYOA 3EWHA 3FI8A 5H2UA 1U5RA 3GCUA 3VVHA 3NMUF 2J6MA 1OM1A 4JIAA 4YSMA 2C1AA 2GFSA 1JVPP 3O8UA 1Z57A 2JLDA 3FLNC 4XOYA 3DTCA 4NJDA 3CPCA 5FTGA 3D2IA 4CEGA 4K0YA 3DXQA 5HG8A 4RLKA 1F0QA 4QMUA 1IEPA 2QNJA 3EYHA 1R0PA 4FE2A 3BU3A 2GQRA 5K3YA 3MFTA 2E9OA 2GU8A 3RNYA 4BYIA 5FG8A 5AUVA 4IFCA 4YJUA 4AZFA 4WRSA 2QI8A 4G9RA 3MN3A 2C1BA 3CJGA 4RX9A 1MQBA 4YC3A 5ETIA 1WVYA 3FJQE 4GUBA 5DMZA 2PPQA 1I44A 4JL9A 2VWYA 1DI8A 4NFNA 1PXKA 1SMHA 5M08A 3IPHA 3QX4A 1BLXA 3HDMA 4U6RA 3OTVA 3TM0A 4QNYA 2X39A 4C62A 3NUAA 4E6CA 4L7FA 3HP2A 3DZQA 4FTAA 4B9DA 5IPJA 5EI2A 5EW8A 5L6PA 4NUSA 2JKOA 5C4KA 5AP7A 2DQ7X 4QQJA 4RIOA 3P79A 4BZOA 4N4SA 3R8PA 1NVSA 3PXRA 5HIDA 5C26A 4FEUA 4AA4A 4BCFA 5GHVA 2JGZA 2FSLX 3DLSA 3GENA 4OLIA 4KKGA 5F94A 5M53A 2BKKA 3R22A 4GU6A 3PIYA 4H3BA 5CZHA 1H08A 3ZTXA 3F7ZA 4O91A 5EI8A 1U54A 2W5HA 2OGVA 3AXWA 3DKOA 4OR5A 4F9CA 5HZNA 2WOUA 2CN5A 4M15A 4EC8A 1FQ1B 4HYIA 4G1WA 3RBWA 2C6OA 5GNKA 3GFWA 2ESMA 2ZM4A 1ZMVA 3C13A 5JH6A 3VUTA 3S00A 1Q8YA 4I24A 2CSNA 3FLYA 2HYYA 4XLVA 4EH6A 4FEVA 5M07A 3DV3A 2ERKA 1W7HA 3RTPA 3BLQA 4EBWA 4DTBA 2HY0A 4ZLYA 5BQ0A 5IMXA 2YDKA 3D7TA 4RT7A 4QMXA 3DJ7A 5FXRA 4IZ5A 4D9TA 1J3HA 1YOLA 1G3NA 4O6LA 3BV2A 5C8NA 3P4KA 2PULA 5HIEA 2WU6A 3QTXA 3NYXA 5HO6A 1OL5A 4TYEA 2R3RA 3KXGA 4R5YA 3EFJA 4E4XA 1T46A 3PYYA 2WU7A 4IACA 1KE9A 5CTPA 5TF9A 5B2LA 2X7GA 2PE0A 4QP9A 4FKTA 3UO6A 3DBQA 3E88A 2JBPA 4O0TA 3I7CA 1F3MC 3R7EA 3WIGA 3LQ8A 4AX8A 5IF1A 2G01A 3LXKA 3NCZA 5CY3A 2P4IA 3FQHA 4YU2A 4YZBA 2CKEA 2O5KA 2QOHA 2VTJA 3PPZA 4IIRA 3ZLYA 4CKIA 4NCTA 1YI6A 3Q4TA 3TKIA 5I9WA 2QOKA 2XNGA 5K5NA 2R64A 5EDRA 1LEWA 5LWMA 3A7GA 2VAGA 3LJ2A 3MH3A 2P2IA 3G0FA 3GC9A 4G31A 4YJQA 2ONLC 4C33A 4PP7A 5CASA 3ZLSA 4C4JA 4UWYA 4XOZA 5AA9A 3OOMA 5IEVA 1PY5A 4NKSA 4ACHA 3ZUTA 4ASXA 4BWPA 5AEPA 3AMYA 2YEXA 3VBVA 2X2KA 5D1JA 3GC0A 3BU5A 3OFMA 4ENXA 3RNIA 4FG9A 1BL6A 2YHVA 3OTUA 3VJOA 4CVAA 3BYUA 2YM3A 1JOWB 4FTKA 3CKWA 3LIJA 4FV6A 3UP7A 4YMJA 4O86A 2V22A 5IEXA 3FHRA 4O7LA 3W2OA 3HA6A 2Z7RA 4DYMA 2ZMDA 1EH4A 3ZS5A 1YVJA 1H24A 3TDWA 1O6LA 4C02A 3BKBA 3QC9A 4IVDA 2ITXA 4D2VA 2NRYA 3KVWA 4BCOA 2Y4IC 2PVHA 4RSSA 5BYZA 4W4VA 2PTKA 3VRYA 5I9XA 3DK3A 2B4SB 3CKXA 3FKNA 4RZWA 4B99A 2VTPA 5E7RA 5AAGA 1JBPE 3DTWA 3KN5A 5J9ZA 4CZYB 5EYMA 4ACDA 4HVHA 4JG6A 4YO6A 3LOKA 5E8ZA 1OPLA 4K2RA 3RI1A 2VTNA 3ALNA 5EQYA 3QZIA 4GEOA 2CNVA 3OP5A 1H8FA 4GW8A 4ONAA 4OTQA 3FZTA 1YHVA 4L53A 4D4RA 3GCPA 2BFXA 3UYTA 3QD0A 2ZV9A 3BYVA 1PMEA 3FZ1A 2WQMA 4FKLA 2ITTA 2H8HA 3DB6A 4FTUA 3HUCA 3OHTA 4FT5A 3UBDA 4UALA 4XCUA 4GH2A 3L1SA 2XK7A 3KXZA 2W1CA 2YERA 3TJDA 5HO7A 2AYPA 3JVRA 3W2CA 1H4LA 2XM8A 3PY3A 4WBBB 5CVHA 5JFVA 5I5ZA 3PXFA 1XBBA 2R2PA 4WSQA 2ZM3A 4YZDA 4F65A 3EN9A 3FDNA 3G9NA 3G15A 4DH8A 3VULA 4FV5A 4C0TA 3GQLA 5T6KA 1G8AA 1M17A 4GFOA 5FP5A 4CMUA 4ZZOA 5A3XA 5KE0A 5JGAA 2P0CA 4E5AX 3NPCA 4HYHA 2OU7A 3D5VA 1DAWA 2VN9A 5I9VA 2YCQA 4WUNA 3LFSA 2HOGA 3R8MA 3R2YA 3QZGA 4O0VA 4ALWA 4MAOA 3D7TB 3MWUA 3BLHA 5H8GA 4O81A 3HLLA 5FDPA 5IQIA 2FO0A 2W1ZA 4ACGA 4GKHA 3QUDA 2NRUA 3UZTA 2J2IB 4ZTQA 1CTPE 4K9YA 4MTAA 2QCSA 5HBJA 2WB8A 5KO1A 5GIOE 5AP2A 2C0IA 4MXXA 3ZLXA 1ZOGA 4GJ2A 4O0UA 5M55A 4D2RA 4EUTA 3BZ3A 4FTIA 4AW1A 1WVXA 2XK4A 3EKKA 5J87A 4BTKA 5CAOA 3KREA 3FL5A 2WMVA 5LJJA 4R1VA 2IJMA 2PVYA 4U3ZA 3IDBA 2JC6A 4FTJA 4QP6A 1PYEA 4L8MA 4DG3E 1FMKA 1SNUA 2R3NA 5M4CA 1OBDA 2VO3A 1YI4A 4BDJA 2YACA 3HV3A 5CQUA 5AR7A 4ZEGA 4O84A 5A4TA 4JDIA 3DXNA 2A0CX 3QGYA 5HD7A 4DBXA 5HX8A 2YN8A 2DUVA 2OH0E 2OFVA 2XIZA 5CXHA 1H25A 2XNMA 3KVXA 4E20A 3BYSA 3VUGA 2FB8A 3SG8A 4NU1A 5IKWA 5E1EA 1A48A 4I1ZA 4IWQA 4BDGA 1JQHA 3BGPA 4TYIA 1ZZ2A 5EM7A 3NRMA 3A4OX 3QQKA 3OCGA 1Q97A 1BX6A 1R39A 4IB0A 3VS1A 2CGWA 1U46A 2YA9A 1H1QA 3VO3A 4RJ6A 5LARA 2XCKA 4D5KA 2OG8A 2OZOA 3OVVA 1H0VA 4FTCA 5ANIA 3R8UA 4CQGA 4EH2A 4P5QA 5KBQA 4JVGA 4PMTA 4MH7A 4AXAA 4O83A 1YQJA 5AMNA 2PE1A 2BILB 2B55A 4X2GA 1KE7A 2ETMA 3R73A 4Q9SA 4RG0A 4ZIMA 3TV6A 1OZ1A 3TZ9A 5CT0A 3VS0A 4LGHA 4EH4A 4UMUA 4FUYA 5CU4A 3R9OA 4QP7A 2YIYA 2QU5A 1JNKA 4AN3A 3EHAA 4EK5A 2ITQA 3P1AA 4OBOA 2IG7A 3FUPA 3S2PA 4L00A 4BHZA 1CDKA 2JEDA 4M67A 3ROCA 5IA3A 4WG4A 3PVWA 1GZOA 4IAKA 4DGLC 1VYWA 2ZB1A 2XVDA 3JVSA 1YWVA 4USDA 4TNDA 4W9WA 3ZZWA 3QAME 4KSQA 3UMWA 1XH9A 2XKFA 1K3AA 2BAQA 3UIUA 4DH7A 4HVSA 2O3PA 2WO6A 3JPVA 2HXLA 2F7ZE 4ZTLA 5HTIA 4H36A 3OG7A 4BTJA 1AQ1A 2E9NA 5C9CA 3RZFA 4JQ7A 1QCFA 3BIZA 3WF8A 1L8TA 3RWQA 1TQIA 5BYLA 3BWFA 5D12A 5GZAA 2OXXA 4YTCA 5HGIA 2P55A 4EUUA 2XNEA 4U80A 5AX9A 2BZKB 3ENHA 5IISA 3OBJA 5KMMA 5A46A 3PY1A 3G0EA 3T3UA 3CTQA 3ZHPC 3IG7A 5L6OA 2QONA 4AT4A 2WPAA 2XKEA 3TEIA 1GZKA 4GYGA 4DG2E 4EWHA 4OBQA 2R3HA 3EL7A 3PJ8A 3EOCA 4N6YA 3ZONA 2BRBA 3OUNB 4XLIA 4QO9A 4CQEA 4FZFB 2ZVAA 1KSWA 2XMYA 2BDJA 5H9BA 4D1ZA 5IH4A 5AUYA 1W8CA 4QP8A 5EHYA 4AA5A 3QTUA 1Q41A 2W4JA 4DFYA 1NVRA 1Q4LA 3C51A 3FXZA 3V5WA 3Q4ZA 4CFMA 2CKQA 3T3VA 4RWIA 4IX5A 1JSTA 4HCUA 4E6DA 4UX9A 3R7IA 3QL8A 3FMJA 5ITAA 2VTSA 3U87A 4EH9A 2UZOA 3CC6A 4QP2A 3UVRA 4A9TA 4AFEA 4IAYA 3KK8A 2X7FA 4ZTRA 4L01A 3DBFA 4D4SA 3BHTA 2PVMA 4DEAA 1LUFA 3ZMMA 4EORA 2PUIA 3SXFA 3Q04A 1QPDA 2JKKA 3QGWA 4APCA 3TUBA 4EOJA 4L45A 4AGWA 4C7TA 1WBNA 2W17A 5J9LA 2BPMA 4YZNA 5LVMA 3EQGA 1UVRA 4R8QA 5FXSA 1PJKA 1J7IA 2WNTA 3QTSA 3G90X 5B2KA 2G2IA 3C0HA 3LFDA 4F08A 3ODZX 3WYYA 3C50A 3MPTA 4X6RA 5EOBA 3LM5A 4C59A 4G3GA 4FBXA 3PXZA 4ANOA 3EYGA 4FG8A 3R8LA 4IM2A 4D1XA 2PSQA 4LMNA 2C30A 3LMGA 4DH1A 2XB7A 3EZVA 4MX9A 4AA0A 4EOKA 3MVHA 1M7NA 3R6XA 3RALA 3IW5A 2LGCA 3CTHA 5AV3A 5AR8A 5HE2A 4L6QA 3GCSA 5E8TA 4FA2A 4FIEA 2IWIA 3R1NA 4Y5QA 4RVMA 3V6SA 3W55A 5FLFA 3DKCA 4CRSA 2EU9A 4FKPA 4MCVA 3I7BA 4EQMA 4CG8A 2R0IA 2VTOA 4I4EA 3NNUA 5FBNC 2GS7A 4GT4A 3QU0A 3R7GA 2ITUA 4NIFA 5LQFA 2VWXA 1IG1A 2HZ0A 5E90A 3M1SA 4F1MA 2UZDA 3C4WA 3TXOA 2YCFA 3LCTA 3R0TA 4XS2A 2JITA 5EYDA 2ZJWA 4UN0C 2WD1A 4YP8A 3UE4A 1WZYA 3U9NA 3EN4A 4BI2A 3H3CA 5ANGA 1MRUA 3JY0A 1WCCA 1M14A 3HUBA 1URCA 4ARKA 2YLEA 4FV8A 2WTJA 4JRNA 3QF9A 4PF4A 4BICA 4EK4A 2XM9A 4DFBA 1M7QA 2R3GA 3L9NA 2BMCA 1STCE 4F4PA 4JX3A 1TQMA 4F09A 2QOOA 3D0EA 4IQ6A 3A2CA 3CD3A 3HX4A 5E8WA 3KXNA 5DI1A 3QRTA 5K4JA 1JKKA 2A1AB 3EQBA 3PJ2A 3R8ZA 2ITNA 1PXNA 3VUIA 4LFIA 4IW0A 2VU3A 5J7HA 2W4OA 2W1IA 2XRUA 3QQFA 3F6XA 4RA5A 4FV3A 1O6YA 3DKFA 2OH4A 3DT1A 4FV2A 4F1OA 3R21A 4FKJA 5HD4A 4YZCA 4A9YA 3NYNA 3UIMA 4HOKA 2QO2A 3RAWA 2I7QA 4BRXA 3KGAA 3UIBA 4P90A 3FEGA 5L8KA 1Y6AA 2C5NA 4QYEA 5IH6A 2QO9A 4KUJA 1XWSA 4EHEA 3A60A 4XG4A 2WFYA 3HMIA 4QMVA 5AAFA 3ZDIA 5M06A 3ZRKA 1JSUA 2NP8A 5HX6A 3QYZA 4FR4A 2E9VA 4RX8A 4X0MA 5EW9A 4WNOA 3N51A 4FSMA 4E8AA 1Q3WA 4F6UA 4A9RA 2NNWB 5E8SA 3HECA 4PNKA 4YJVA 1ZRZA 3F2NA 1SVGA 3NAYA 5E8XA 4CCUA 3EJ1A 3VRZA 3I79A 4FKUA 3SX9A 2HWOA 4I6BA 1YHSA 3LLTA 3LPBA 4B0GA 2CKOA 3NUNA 3UP2A 1PW2A 2BALA 2WMUA 3BX5A 4JBPA 4JG8A 4KINA 3R9HA 4ANSA 4C4EA 5C27A 2X4FA 3TNHA 3DNEA 3MTFA 2QO7A 2X4ZA 3UVPA 1U5QA 5HTBA 1UNHA 2QD9A 3UMXA 4I5MA 4FC0A 4MXCA 5L6WL 1XBCA 3HKOA 2XJ2A 2J0JA 3IOPA 5DA3A 3U4WA 4FNXA 4S31A 3BLRA 5CT7A 4CFWA 2DS1A 5BNJA 4FKGA 4X2JA 3MV5A 4RMZA 2C6TA 1IAHA 3TNWA 4EOMA 1B6CB 3D9VA 3EB0A 3GP0A 3U51A 3ORXA 2JKMA 5JT2A 3D7ZA 2WIPA 2X2LA 1JSVA 2JIUA 4ID7A 4JDHA 1BKXA 2C3LA 2ZDTA 3MY1A 4CMTA 4WBOA 5C4LA 4F7SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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