3QQGA

Cdk2 in complex with inhibitor l2-5
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 83
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qqgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qqgA01
4BCKA 4F63A 4J7BA 4L44A 4FODA 4LGHA 4QRCA 3R6XA 4DH3A 1PMNA 3EHAA 4BF2A 4C62A 3FL4A 4D4YA 2QLUA 3AD5A 2BDFA 3NUPA 1KE7A 1OL7A 4J98A 2LAVA 5HLWA 4DFUA 4KBKA 3QGWA 2UZOA 5LVPA 4LGDA 4FT3A 3G6GA 5D1JA 3W8LA 5HU9A 5EG3A 2JGZA 2Z7QA 3UO5A 1OIUA 3O17A 4LM5A 1H00A 2OH0E 3V5PA 2YISA 4XG9A 1JPAA 2XEZA 1MQ4A 3KN6A 4AU8A 3ZUUA 2X39A 3NCGA 5HU3A 2QOLA 2R3FA 2B52A 4I5PA 5ETFA 2ERKA 3DPKA 3FXXA 1ZOGA 2FSTX 3NUAA 4BN1A 2IW8A 4F7SA 4G3DA 4S32A 4ZTHA 2BRGA 1IG1A 4PRJA 3QC9A 3FMDA 4MQ2A 5FLFA 5C9CA 1W0XC 1NA7A 4IZYA 4K6ZA 3UNKA 2I7QA 2CCHA 4O0XA 2HAKA 2YAKA 5CEQA 3N9XA 5AADA 5JQ8A 4OTHA 4UALA 3PVUA 3E3BX 3RVGA 4AT5A 1JNKA 5KMLA 5M06A 4O7LA 3PIZA 2BZJA 4E5AX 4NH1A 3NW6A 4AW5A 5DGZA 3W2SA 2J50A 2WD1A 3L8VA 3LCOA 3UQCA 3CR0A 3BGZA 1PY5A 4ZLOA 3UZPA 4TWCA 4DEIA 4XLIA 3PVBA 3ZU7A 4O7RA 4FTJA 2W0JA 4CMTA 4BWKA 4EBVA 4CYJA 2QCSA 3E3PA 3DK7A 4BCFA 4IX4A 3F88A 4OTFA 4I1ZA 2YZLA 4FG8A 5DRBA 5BVWA 5AP4A 3D2KA 3SOAA 3P7CA 3QTSA 1WCCA 5KZ0A 3PUPA 4M7IA 1KV2A 5DT4A 4DTKA 4GG5A 3C50A 5J87A 1M7NA 5CAVA 3KRRA 5CI6A 3BEAA 3HL7A 3OC1A 3EN7A 1ZYSA 4J71A 3GFWA 4FKOA 4AN9A 3QHRA 2RSVA 3LFEA 3BHUA 4IXPA 4CT1A 3SXFA 3OG7A 4IX3A 2Z7LA 2A27A 4Y73A 2UZDA 2G9XA 3D7ZA 3BZ3A 1MRUA 3E92A 4X2FA 4YTIA 5AP6A 3SC1A 1U54A 4JQEA 4FKLA 4K18A 2Z2WA 3QUPA 3COHA 3A7IA 4G6NA 4BI1A 2HZIA 3UIXA 4QMXA 3NZ0A 5CAQA 4ZTMA 2XBJA 4DH8A 2UZTA 4E73A 2W5BA 3QD3A 4MXZA 5IISA 1YHWA 2IPXA 3DU8A 4IFCA 4QD6A 4ZMEA 5EM8A 5JFXA 4I5CA 5EW8A 3OS3A 3TIYA 2JKQA 5DPVA 4O7NA 2CNUA 2WTKB 4CCBA 2XF0A 4QMVA 5CU2A 2W17A 3FZTA 4CTCA 1NVRA 4XBRA 2ITWA 5HBJA 3NEWA 5M4IA 1BKXA 3OWJA 3KKVA 5L6OA 3TM0A 4IVBA 4ANBA 2QOFA 5HQ0A 2WQOA 3FKNA 3I5ZA 3NVKI 3MA6A 3VO3A 3F3TA 4FTOA 2CMWA 4HGEA 4EK4A 3GEQA 3AMBA 2CN8A 4GFOA 4J95A 4PL4A 3UZTA 5FTGA 3KN5A 3OOGA 3I6WA 3U4WA 1ZAOA 3CBLA 3HP5A 4MAOA 4NKAA 1OB3A 3DLSA 4W9XA 2ZM3A 3HZTA 3RJCA 5FUTA 2BHEA 4BDDA 2JDTA 2X7OA 4NW6A 4G1WA 4YC3A 3PPZA 4HVGA 5IZFA 1PXOA 3UQGA 2KTYA 3ROYA 2WO6A 5GHVA 1NT2A 5DT0A 4KRCA 4OTGA 5G6VA 1Q62A 2QVSE 2WMUA 3R7EA 3Q4TA 3C4ZA 4QMUA 4MXOA 5L8LA 2E9VA 2C1AA 4BDJA 4LFIA 3HV3A 2JDSA 2XYNA 3GU6A 5CF8A 4XNEA 1KWPA 2BZIB 3O71A 2YDKA 4L43A 3AC4A 3Q52A 4HYSA 3RTPA 4BTKA 4EQCA 3IK3A 1WBOA 4ASEA 5DT3A 4ZZMA 3ZZEA 4G3CA 3EQPA 3FI2A 3EN5A 3P9JA 1YDSE 4N70A 3K2LA 2XK3A 3BV3A 4C58A 4DF3A 2PMNX 5A3XA 4E5BA 3IOKA 3QRUA 4RIWA 5I5ZA 5KKRC 5DWRA 4F08A 3F2NA 4DEGA 3NS9A 3PLAE 4IHPA 4EHVA 1OI9A 2WOUA 2ZV7A 4AZFA 2XK8A 3UC4A 1H01A 1H08A 1UWHA 4FTIA 4FTCA 3FL5A 4BTMA 5EH0A 2R64A 3FYJX 4YJVA 5EHOA 4BDGA 4XS2A 1SVHA 4EOMA 1TQMA 3NWWA 4BWPA 5EM5A 2XNMA 2XZSA 3KQ7A 1NW1A 4FTTA 1OKVA 3GC8A 4WG5A 5IQIA 1M2QA 4CYIA 1JKLA 4PDOA 3EQHA 3HVCA 4EUUA 5AUUA 3TJDA 3V8WA 5BYYA 5M08A 2BAKA 4AZVA 3GXLA 3QUEA 4BI0A 1UNHA 4HVDA 5I9ZA 2YJRA 4C4IA 4OT5A 2VTTA 5KBQA 4FEWA 3QXOA 4FSUA 5E92A 3RPVA 5LOHA 3ZONA 2ZMCA 2GNGA 4BIDA 3A62A 5AR7A 2B9JA 1MUOA 2BFXA 4CG8A 5HVYA 1IEPA 4KKEA 4AZWA 4GMYA 2QOOA 5AUZA 3GBZA 3L1SA 3VS3A 4QMTA 4FE2A 4IEBA 2C3JA 3DCVA 4NIFA 2HCKA 4I6QA 4F09A 4QYYA 1UWJA 4O21A 4XRLA 3SW7A 1KOAA 1VR2A 2QNJA 4TYJA 3MH0A 5BUIA 4CLIA 2X4ZA 5KZIA 4RVMA 4ZAUA 4G6LA 5DVRA 4CMUA 2IVTA 4FNZA 4G6OA 1OUKA 3V5TA 4U7ZA 3P5KA 4F9CA 2Q83A 3ZFXA 1QPCA 4UXQA 5EOLA 3WZEA 2PUNA 4J1RA 4DFBA 2YN8A 4FT7A 4IM0A 3VW6A 5DA3A 3TCPA 4NM7A 4ASDA 4JQ8A 5HEZA 1J1CA 2R3NA 3EFLA 4PTEA 3P08A 5I9UA 4ZY4A 2PMOX 3AC2A 4JL9A 4RG0A 3M2WA 4IB1A 4MK0A 4UMUA 5AA8A 4DE4A 3D14A 2W99B 4W9WA 4RVLA 4U5JA 3LM0A 3V5JA 4A9UA 4FKJA 3PP0A 3OD6X 3ZDUA 5IH6A 3ATSA 2OIBA 3RWPA 3ZH8A 3PYYA 3R7OA 4EK6A 2XKEA 2V5QA 2UW3A 2RFDA 3BHVA 3D2IA 3U8WA 3V04A 4ITJA 5L2IA 3I7BA 5IA0A 3IS5A 4ZZNA 5JGAA 3NYVA 2PHKA 3V5WA 5ETIA 3N4VA 3QA0A 3LXKA 5KMJA 4F1OA 5IQDA 3QL8A 4ZTSA 3FMKA 2W1EA 3TNWA 4BDIA 2HELA 5BUEA 2R3OA 3POZA 2C6IA 3QQJA 2VWXA 3GNIB 3T3UA 2ZV9A 2YIXA 5D11A 4RT7A 4XYFA 5HVJA 4TY1A 3U51A 3MTFA 2YIYA 5IQCA 3DJ5A 3I1AA 5FGKA 3E87A 3Q6WA 4DYMA 3W2OA 4FVQA 3WARA 2JDOA 4LUDA 4CV9A 5AP1A 2O3PA 3AC3A 4W4WA 4I21A 5AX3A 2NNWB 4ZZOA 2W9ZB 3R00A 4FYNA 5FD2A 3C0IA 4KSQA 1XH5A 2R3RA 3I5NA 4F9AA 1NY3A 5CEKA 5FXQA 4YZCA 1JKSA 2QU5A 4BL1A 3R8LA 2WEVA 4FUXA 4GEOA 2XNPA 5F1ZA 2ITUA 3UJGA 4FTAA 3NSZA 4ZOGA 5KHWA 4AZSA 3F2AA 1F3MC 3MFTA 4TPTA 4RJ7A 3FLZA 3VC4A 5CZHA 3QXPA 4N6YA 4USEA 1JWHA 3EL7A 5DOSA 3HP2A 2Y4IB 1FVRA 4D1SA 5IA4A 5AR8A 4J8NA 4X2NA 1PJKA 2GMXA 1HCLA 2R3HA 4GH2A 3W16A 3EMGA 2WQNA 3PA5A 3OEFX 3BWJA 3LKMA 2BILB 1OECA 5JGDA 3VUKA 2J0MB 5LVNA 3S0OA 1ERKA 3EB0A 1OVEA 2A4LA 2C5VA 2FA2A 5E8TA 4APCA 4E20A 1PKGA 2BKKA 4TYHA 3RPOA 2BIYA 1VEBA 2E9UA 4BCJA 4GCJA 4IWQA 4MXYA 2V62A 4XCUA 3NX8A 2WMTA 3CP9A 3PA4A 3R1NA 3AOXA 4AT4A 4DFNA 1X8BA 4XRJA 1PXMA 2RFEA 3E7VA 1Z9XA 1M2RA 3LXLA 2XM8A 3OZ6A 4OTIA 5EI8A 3E62A 4GVAA 4D58A 2QKWB 3UODA 3FV8A 1ZY4A 3CY3A 4FKWA 2CGXA 4MTAA 4EOIA 2JD5A 2WQBA 4D4SA 3DTWA 4DEAA 4R78A 2ZYBA 1V0PA 2BCJA 4LUEA 4M84A 2ITTA 5BMMA 5M4FA 3AD4A 2B9IA 3HRCA 4NM5A 4YJTA 3RBWA 3ZTXA 1OIYA 3OCGA 1W84A 4IZ7A 3PIXA 4DGMA 4E4LA 2SRCA 3OBGA 4GK4A 2WMWA 4M14A 3GOKA 3TV6A 3ZXTA 4YU2A 4OTWA 3MJ1A 4DT8A 4FV1A 5BVOA 4FR4A 1PF8A 4KWPA 4AACA 5HKMA 3BWFA 2BRNA 2IO6A 5FM2A 3DAKA 4QMSA 2YJSA 4IVAA 2FO0A 2GSFA 4JIAA 4BDHA 2XJ1A 1KE6A 3BYUA 4CXAA 1E1XA 3ITZA 4ZJIA 2GU8A 3CD3A 3MFUA 2JC6A 4FTMA 2YEXA 4TYHB 2XJ2A 1YI3A 2X6EA 2WGJA 3IW4A 4I0SA 5B2LA 5AM7A 5HX8A 3BV2A 3WF9A 5CEMA 4IQ6A 1Y57A 2F2CB 2VTQA 4A4OA 2Q0NA 4JS8A 4FKPA 5EQEA 2XJ0A 4U6RA 5AWMA 4YGAA 4QTAA 5EI2A 2CGWA 4O86A 3P4KA 3UGCA 2QONA 4KA3A 3TUCA 4FV3A 4ACHA 4BCPA 4EQMA 4ALUA 2ITXA 2QG5A 2PMLX 4TTHB 4ZS0A 4D55A 2HZ4A 4XH6A 3V6SA 4DH1A 5L2SA 4UV0A 2UW6A 2BAQA 5EYKA 5CALA 3L9PA 1MRVA 4XHKB 2XP2A 2XRWA 1QPJA 4GU9A 5C8MA 4O82A 5CQWA 5A4CA 4WOVA 2WIPA 3DLZA 4FOCA 2PUUA 4FTLA 5HIBA 5CSHA 2JBOA 3U6HA 3FKOA 3OXIA 4ZEGA 3WIGA 3E8EA 5HG8A 3V8TA 4RX9A 2B1PA 3A61A 4RVKA 3TV7A 4HVIA 3BEGA 3QQKA 3SD0A 3DKCA 4K9YA 5J9YA 3AG9A 4FSNA 4DH7A 5KCVA 2OH4A 1Q41A 5JH6A 3EN6A 3D7TB 5A6NA 1UKIA 3NNUA 4IB3A 2OFUA 2C4GA 4EZ7A 4DCAA 4MWHA 4IWOA 4ACGA 1WVXA 3KA0A 3RWQA 4RIYA 5BUJA 4UYAA 3E64A 3IDBA 4PDPA 2YIWA 5JZJA 1Z5MA 5FP5A 4BKZA 4FEXA 5EDRA 2UZLA 4YURA 4ZTRA 5JGBA 2Y0AA 5HZNA 5IQBA 2C1BA 2VTOA 3F82A 2J5EA 3VS5A 4BBEA 4OBPA 3QZFA 4RWLA 5HICA 3VUDA 3DXPA 5KNJA 4IH8A 4YJSA 4EJNA 4ZY5A 5CZIA 3PG3A 4JT3A 4Q2AA 5CEPA 2IVVA 5AV3A 4FKGA 3MFSA 1IASA 3UP2A 2Y6MA 4QPAA 4ZSJA 2IW6A 1GZOA 4H36A 1NXKA 3LQ8A 2UW7A 1RW8A 5HNBA 2HZNA 2XIRA 4IE9A 2OLCA 2Y9QA 4O0UA 3DKGA 4GG7A 4IAAA 3UIMA 1M7QA 4C7TA 4OTDA 3L8SA 4LOPA 2QQ7A 3C13A 5AUXA 5KE0A 2X7FA 4IADA 3HMMA 5EHLA 2X2MA 5E90A 3UOJA 5J5TA 2PVHA 4RJ3A 3RAIA 3W55A 4TWPA 4EWQA 2CPKE 3BU6A 3DBFA 5J9LA 3GU7A 5M55A 4RIYB 3FZ1A 1AQ1A 4LQMA 4O2PA 2ZOQA 3DB8A 3PJ2A 5FM3A 3AMYA 3WZJA 1YXVA 5LMBA 4QP8A 3VQHA 3JUHA 3FE3A 3U6IA 4ANLA 4BDEA 1A9UA 3W2QA 3F5GA 3NR9A 2ETRA 4JAJA 4E26A 1BI7A 4R77A 3ZZWA 2Y4PA 3EZRA 3NW5A 5HCZA 5C03A 3A99A 4W8EA 4QMPA 4TXCA 3WYYA 5HNIX 2CKQA 4FX3A 2JDVA 4H1MA 5HE0A 1PMVA 5EKOA 3UMWA 1JOWB 3COMA 3EWHA 5KMOA 3PY1A 1PXLA 4UBAA 1UU9A 2REIA 3V3VA 2EB2A 3ZUVA 3ORNA 4F70A 1K3AA 3HMIA 3KVWA 5E1SA 3ULIA 3OTVA 4WUNA 5A6OA 5ICPA 4FGRA 4MYGA 3VBTA 3PXRA 2VTIA 4BGGA 2YZAA 4D28A 5GZ8A 2PVFA 4L46A 3CD8A 3DTCA 3GU5A 3MI9A 4F1TA 2OZOA 4IJPA 2X81A 3REPA 4D4VA 5CS6A 2ETMA 4G3GA 1V0BA 1E1VA 2C3LA 3ZMMA 2C6EA 4FKTA 4CT2A 3Q5IA 3EQIA 1WFCA 3VBYA 4RLLA 1RDQE 3OUKA 3TZ9A 2GS2A 4ANSA 5DYJA 3R7YA 5FDXA 1XWSA 3P78A 3TUBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4AW5 A;  5DGZ A;  3W2S A;  2J50 A;  2WD1 A;  3L8V A;  3LCO A;  3UQC A;  3CR0 A;  3BGZ A;  1PY5 A;  4ZLO A;  3UZP A;  4TWC A;  4DEI A;  4XLI A;  3PVB A;  3ZU7 A;  4O7R A;  4FTJ A;  2W0J A;  4CMT A;  4BWK A;  4EBV A;  4CYJ A;  2QCS A;  3E3P A;  3DK7 A;  4BCF A;  4IX4 A;  3F88 A;  4OTF A;  4I1Z A;  2YZL A;  4FG8 A;  5DRB A;  5BVW A;  5AP4 A;  3D2K A;  3SOA A;  3P7C A;  3QTS A;  1WCC A;  5KZ0 A;  3PUP A;  4M7I A;  1KV2 A;  5DT4 A;  4DTK A;  4GG5 A;  3C50 A;  5J87 A;  1M7N A;  5CAV A;  3KRR A;  5CI6 A;  3BEA A;  3HL7 A;  3OC1 A;  3EN7 A;  1ZYS A;  4J71 A;  3GFW A;  4FKO A;  4AN9 A;  3QHR A;  2RSV A;  3LFE A;  3BHU A;  4IXP A;  4CT1 A;  3SXF A;  3OG7 A;  4IX3 A;  2Z7L A;  2A27 A;  4Y73 A;  2UZD A;  2G9X A;  3D7Z A;  2XAO A;  3BZ3 A;  1MRU A;  3E92 A;  4X2F A;  4YTI A;  5AP6 A;  3SC1 A;  1U54 A;  4JQE A;  4FKL A;  4K18 A;  2Z2W A;  3QUP A;  3COH A;  3A7I A;  4G6N A;  4BI1 A;  2HZI A;  3UIX A;  4QMX A;  3NZ0 A;  5CAQ A;  4ZTM A;  3PFY A;  2XBJ A;  4DH8 A;  2UZT A;  4E73 A;  2W5B A;  3QD3 A;  4MXZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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