3QWJA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-142
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 78
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qwjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qwjA01
2QR8A 2PPQA 3L8VA 4ZTHA 3V8SA 3P5KA 1ZYJA 5IF1A 4OAVB 4D1XA 5TT7A 2PYWA 4C34A 3ZRMA 4XRJA 2WMRA 4NH1A 5BVNA 4K0YA 5CI7A 1WAKA 3OP5A 3P9JA 2I0EA 3HV3A 5HE2A 2FO0A 3B8RA 3DTWA 3CBLA 4WNOA 3LE6A 3C5IA 1QMZA 4O2PA 5DLSA 1VEBA 4BN1A 5J5TA 2GQGA 1JSUA 4C4IA 4FV9A 3AC4A 5AUVA 3NCZA 3TG1A 4CFWA 3EFJA 5LVOA 3BLRA 4EHZA 4KKHA 1H1PA 4PL5A 3AOXA 4MEDA 5HI2A 2PUIA 3N4VA 4FKJA 4EH3A 5IH4A 1YXVA 2OFUA 3OF0A 4ZIMA 3ZMMA 5FTGA 2GS2A 2YWPA 2JIVA 3C7QA 3P4KA 4CRSA 4FSNA 4TWCA 3ZONA 4EOIA 3GBZA 3T3VA 4K1BA 3OW3A 4RFMA 1BKXA 3BBTB 2R3KA 3R9OA 3KC3A 5KMNA 1NXKA 1UV5A 3FZPA 1WFCA 3E3PA 4JI9A 4ONAA 4ZTNA 3R01A 2X7GA 3TWJA 3U4WA 2FUMA 3DJ7A 2QOKA 4FKVA 3FLYA 3QC4A 4MHAA 3HMNA 4Z9LA 4ANOA 3FV8A 4QP3A 3DAJA 5CNOA 3RK5A 1DS5A 5AP4A 4U44A 3KCFA 3T9TA 2AC3A 4FKLA 1J1CA 3HKOA 3D7TB 3LFCA 3PIZA 4AN9A 3UG2A 4UMUA 1Y6BA 5EQEA 4EK4A 3EQRA 3KVWA 3NUSA 4HVHA 3GC8A 3UVRA 4BWPA 5CEMA 3DBFA 4I5HA 4KS7A 1YKRA 4JBOA 4ITIA 3FC2A 5GJFA 4XUFA 5KNJA 4P5QA 5HICA 1IAHA 2EU9A 4R1YA 1QPDA 2B9FA 2I40A 2VO0A 2HY81 1H1SA 3E63A 3ZCLA 5EM8A 3DKOA 3FSFA 5L2QA 4ZY4A 1WBTA 3LM5A 3DV3A 3O17A 4G2FA 3ZYAA 4LV8A 3OCBA 1H1WA 4ALVA 1H0VA 3KXGA 4CT1A 1UNGA 3QZGA 5C27A 1DAWA 5IQCA 3F7WA 2CPKE 5H8GA 5KZIA 3IDCA 4PDPA 2WKMA 2XJ1A 4OTHA 1NVRA 4TKSA 2J0JA 4AA5A 4FVRA 1Z5MA 2Q83A 1H1RA 1H26A 4MQ2A 4QMVA 2GHLA 4IW0A 4EH4A 5CEKA 5BMMA 3UO4A 3DB8A 1UU7A 3P86A 4DFYA 1AQ1A 4OTPA 3LXKA 3Q6WA 4CKRA 2OIQA 3QX2A 2BDWA 3S0OA 4FSQA 2CN8A 3LZBA 2C5XA 1OUKA 3W55A 4AA0A 3K5VA 3KXHA 4EQCA 2ONLA 4LRKA 3UNZA 2ERKA 3MSSA 5BUJA 5KMMA 4TYJA 3VBQA 2YIRA 4R8QA 3DKGA 3BWJA 4LUDA 4PX6A 4CFFA 2ZJWA 2W17A 2PVFA 2B52A 2R9SA 3R2BA 4GH2A 3CLYA 2IVUA 4JBVA 4KIKA 3BGPA 3R9DA 5M06A 3A7JA 4RVTA 3OXIA 3QTSA 3UPXA 3HUBA 5E8UA 4YP8A 2WU7A 2UZBA 1KOBA 3LFQA 4L45A 1DAYA 3PIYA 2JDTA 4FTTA 2RFNA 3ZHPC 2BRNA 3FLZA 5DT3A 4EOQA 4AZTA 4EL9A 3SHEA 2O3PA 4FTMA 5ITAA 3A62A 2VWWA 3NCGA 2ZM3A 4XG2A 2JKOA 1LUFA 4NKAA 1XKKA 3VS7A 3FBVA 4B4LA 5EOBA 4X3FA 1WBPA 4J8NA 4BIDA 5E90A 4R1VA 3QZIA 5KHXA 4O7YA 4JG6A 4O7RA 4DTAA 2J51A 3Q4TA 3D7ZA 3QYWA 3D94A 3WF6A 2VUWA 2ITYA 3VS5A 4BCFA 2Y4IC 3AXWA 4LYNA 3NYVA 2W06A 3G6GA 4BYIA 3UZTA 2C68A 3DK7A 3QRIA 3HV4A 4FKPA 4DTKA 2FH9A 3OBGA 2GQRA 2F7ZE 3QCYA 4D9UA 2A27A 2XIKA 2UZVA 5CU2A 3ZH8A 2EB3A 2W99B 2WTKC 3UOLA 3CC6A 2ZYBA 4RFZA 5IKWA 3CJGA 5CALA 1OPKA 1W83A 2XIRA 1OPLA 1QPJA 2GU8A 5AV3A 5AV1A 3PLSA 2VGPA 2HXLA 2X7OA 4W4XA 3TNPC 4D4RA 3S00A 2BRHA 4IB5A 4A07A 3LFDA 4O83A 4EH6A 4AUAA 4R77A 4B7TA 3VQUA 5BNJA 2W1HA 4O0WA 4FUXA 4AG8A 4APCA 2UVXA 5CU3A 3F3UA 3RAHA 3JXWA 3UP2A 3RKBA 3CGOA 3BPRA 1WVXA 1YDSE 4WKQA 5HHWA 4E26A 1OKYA 2OIDA 5CZIA 3RPOA 3HP2A 4FIJA 3IW8A 1JPAA 1A9UA 1YW2A 2ZAZA 3EWHA 3O2MA 3AC8A 5KMOA 5KMIA 4RX5A 4AA4A 1FINA 3LM0A 2EWAA 4FTKA 2ACXA 4K8AA 2PMIA 2PY3A 4RQVA 4MBLA 2XKDA 3DK3A 4MNFA 1VYWA 5FQDC 3WZDA 1YOMA 2CLXA 1XR1A 4I20A 2PVMA 4JDJA 1KUTA 4EBWA 3O7LB 3W2SA 2WOTA 1IA9A 5I5ZA 4IDVA 3MY1A 4E4XA 3UQFA 2AYPA 1W84A 2RSVA 2B53A 2Z60A 4IWPA 5E8SA 5AUUA 5LVPA 2J50A 1PYXA 3ID6C 4Y5QA 2WHBA 4Y5HA 3S95A 4CZYB 1KV1A 1XH7A 2X81A 5FLFA 4DTBA 4C8BA 5IA2A 3KN5A 4QP2A 2J5EA 5HBEA 3UGCA 4FEWA 1U4DA 5EK7A 5FDXA 4C35A 1GIIA 5HO6A 3OY3A 4UWBA 5BYYA 5AR7A 2GNHA 5A3XA 4C59A 3W2CA 5ANOA 4UALA 4NW5A 1G5SA 2IO6A 4ZTLA 3FYJX 4IB3A 4XYFA 3W32A 3QQLA 4EUUA 4IFCA 4L68A 5IA3A 4NU1A 5I9XA 4RWIA 4RC2A 2VX3A 3PY3A 1ZYCA 1Y8GA 5DE2A 4QPAA 2ITNA 3WIKA 4FGRA 1T45A 5I0BA 5KMJA 2X2MA 3NUAA 5IQHA 4E93A 1Q99A 4MK0A 3LKMA 1I44A 2VWIA 3ROCA 3D7TA 3SW7A 3RTPA 4MCVA 2PL0A 3AT2A 3D2KA 3FQEA 4S31A 3RPRA 4NTTA 2R3NA 5IEYA 2OXDA 4YNEA 3Q96A 4C02A 5JKGA 3M2WA 4Z7GA 1OBDA 2DWBA 3OROA 3WOWA 4KKEA 1M7NA 3UPZA 1MRVA 3MS9A 3QU0A 2R3OA 4FKUA 4EH8A 4PNKA 3WYYA 1YRPA 3C4FA 2HCKA 4AT4A 3I4BA 4BI2A 4JG7A 3R9NA 3RNIA 4RT7A 3QALE 1PXKA 4TWOA 2UW7A 4IHPA 5CEPA 4UZHA 2I0HA 4R6VA 3I60A 2XNOA 4NCTA 3IO7A 4D2WA 4YSJA 2X8IA 4O84A 4EH7A 3NGAA 2C5OA 3NYNA 4IE9A 1UWHA 4OUCA 4YUQA 4H39A 3RJCA 2EXMA 3PJ8A 3MYGA 3FMKA 4KRCA 4OTGA 4XLVA 3FXWA 4IWDA 4C62A 4DLJA 3KMWA 2OBJA 2H34A 5CAUA 1SVGA 5E7RA 1CKIA 4XOZA 3HUCA 4RBLA 4MXOA 4DH3A 4XH6A 4DINA 2PZRA 3DNEA 2VTQA 5CYIA 5AR8A 1IR3A 1OKWA 3T9IA 3R7YA 1MQBA 4QNAA 4UMPA 4QMOA 4ZP5A 4APPA 3EZVA 5CF4A 4FVPA 2QO7A 2XCKA 4FC0A 5CQWA 4QMNA 4N70A 4U81A 5K0XA 4U9AA 3EB0A 1J7UA 2CGWA 3AC1A 5J79A 1JKTA 5DOSA 3PJ2A 5TO8A 4UXQA 3GOPA 4O0TA 2YITA 4G5JA 3DXNA 5HE0A 4QT1A 1YXUA 5EG3A 2QLQA 2Y6MA 4I4EA 5CSXA 2BRBA 4YJOA 4XP0A 4HVDA 4A9YA 4EC9A 1LEWA 3K5UA 2YN8A 3O96A 5FM3A 4GFGA 5HCZA 2R3RA 2Y0AA 3KXMA 5JFSA 3PSCA 4FK3A 2C5NA 4IC8A 3ZDIA 2XEZA 4FGBA 3UVPA 3DPKA 1G3NA 1FMKA 2J5FA 3GC0A 2ONLC 4XOYA 2YERA 3QTRA 4MWHA 2QOBA 3FMLA 2Y4PA 4U6RA 3SV0A 3V5PA 2OH0E 1QCFA 3QCQA 3VUIA 3VBTA 1IAJA 2CNUA 1H00A 3EOCA 2PVLA 3FE3A 2ITTA 4RGJA 3MB6A 5A4LA 2Y4IB 3CSVA 4MH7A 2WIHA 4V01A 4ERKA 5D11A 3EYGA 4YZ9A 3GFWA 2WMQA 4CYJA 4IEBA 3V5LA 4FTAA 4ZOGA 4RFYA 3HECA 2GDOA 3ORMA 2WTKB 3R7IA 5CVFA 4D4SA 4FEUA 2JBPA 1QL6A 2X0GA 4QMXA 4X3FC 1OIQA 4O27B 2RF9A 4RG0A 3BEGA 4F7JA 4WG5A 1OMWA 5DR2A 3EQGA 4JIAA 3M42A 4Y72A 2YM4A 5CLPA 3ZUVA 5L3AA 4V04A 2ITPA 5HEZA 4BCGA 3KRJA 4L3LA 4YLJA 3PZEA 4XHKB 4MD8E 2CHLA 3NYXA 2IVVA 3C0HA 3BEAA 4QQJA 4OR5A 4D2TA 2JBOA 3H0YA 3TV4A 4ZS0A 3VS0A 3FL4A 4CV9A 4PUZA 4DT9A 2JC6A 1BYGA 2X2KA 4W4VA 2QHNA 3IECA 4RA4A 3ZRLA 2XVDA 1OBGA 2WQMA 1V0PA 3F82A 4AFJA 4BIBA 4EJNA 5K5XA 2BALA 2W9ZB 4JG8A 5M53A 1BL7A 4O7WA 4F64A 3SG9A 5DMZA 5HO8A 1M2QA 1YHWA 4WIHA 1APME 4G1WA 1GZOA 3DLSA 4IVAA 4WRSA 5H8EA 1ZYSA 4OTDA 2WMTA 3FMNA 2YCRA 2IG7A 3ETAA 3ORLA 5IEXA 4HYIA 1KE7A 1XQZA 2JIIA 4ZY6A 2IW8A 2BPMA 5CXZA 3PVWA 3SQQA 4DG2E 3UIBA 2W5AA 2UW8A 2E9PA 3OUKA 4QO9A 2UV2A 1MUOA 2QOFA 1PKGA 2XM8A 5LMKA 3FI4A 4J1RA 4FOBA 3AC3A 3Q9ZA 1VYZA 2ZMCA 4FG9A 4WNPA 5EDQA 4BRXA 2VTPA 3FSKA 4DEEA 5CAPA 1JWHA 3FJQE 1STCE 4G31A 3FXZA 5IQEA 1ZY5A 4TWPA 3WARA 1UKIA 3CD3A 3SXSA 2GS7A 4GU9A 4ZY5A 2XF0A 4GCJA 4IBMA 3N4UA 2Y7JA 3HRCA 4FTQA 3ALNA 3R1NA 2RG5A 5AADA 3JS2A 3R04A 5JT2A 3NS9A 4YC8A 1SMHA 4KBAA 2W5HA 2WPAA 3GU7A 4RVLA 3GC7A 3Q4UA 3Q5IA 4O2ZA 1YXXA 4TW9A 2R3IA 3PA3A 3QD0A 2J0LA 3RAKA 2XK9A 4KIQA 3R8VA 5AV4A 5EI2A 3NRMA 3JVSA 2WQOA 3QXPA 4YHFA 4JR7A 3W2RA 2B9IA 4AACA 3LXPA 5C8NA 4H3BA 4IB1A 5EDPA 5EHOA 1YOLA 3VNTA 4FKOA 4GSBA 4PV0A 4D2PA 2B55A 4IX6A 3R1QA 2BROA 5HLWA 4MKCA 3EFLA 4C33A 3HAVA 5FEQA 5CWZA 5HU9A 2WQBA 5HKMA 2GMXA 3EQIA 3QGYA 1Y6AA 5TF9A 2C5VA 5CZHA 3VUKA 3F5GA 3HLLA 1UWJA 4NM3A 5AP6A 3WF5A 3S3IA 4WG3A 2BRGA 3G5DA 2G1TA 3M11A 4FIHA 3FWQA 3QTIA 4GV1A 4YJTA 3FHIA 4EOSA 5A4TA 4JRNA 3DDPA 1ZOEA 4E73A 2XNNA 1UU8A 2BDJA 5CVGA 5HTIA 1T46A 2EXCX 1B6CB 3I0QA 5ETIA 5EYCA 4KWPA 2X8EA 3BWFA 3KEXA 3AMBA 3H3CA 4DCEA 1E9HA 4ACHA 3A7IA 5ANKA 3PE1A 4A4OA 1PXMA 3UQGA 3C4EA 3RI1A 2CNVA 4BDJA 2HK5A 2C6OA 4E8AA 3FI8A 4BGQA 2C47A 5FTQA 4IWOA 1Q3DA 4FT7A 3LW0A 2KULA 4ZEGA 4DFBA 5DEWA 3UNKA 2BZJA 4JQ7A 1MP8A 3O8TA 5F94A 3QXOA 4GFMA 5K4JA 3Q4ZA 5GINE 4UMRA 2QLUA 3CQEA 3V04A 4BTJA 5J9LA 5L6OA 4GU6A 2XKEA 5IEVA 5CF5A 4NEUA 3BHTA 4MBIA 2O63A 1Q62A 3G33A 1U59A 3A7GA 4P4CA 3V6SA 4U45A 2C6EA 5A14A 3FI3A 4GMYA 3MIAA 3PIXA 3R73A 4BBMA 4CLIA 5M4UA 1QPEA 3IPHA 5HGIA 3W8QA 3HYHA 3R8MA 1XO2B 3NPCA 4FSMA 4M14A 1F3MC 4IAAA 1UVRA 3VS4A 1U54B 4GVAA 4ORKA 5LVMA 4CG9A 4FEQA 4TXCA 3HRBA 4C3FA 4K6ZA 4C3PA 3JUHA 5JSMA 5EW9A 3B8QA 4G17A 1R1WA 3PA4A 3FUPA 3RAWA 4JDKA 5H2UA 3K2LA 5HVJA 5AA9A 3V3VA 4EOMA 5JN2A 4MXAA 4ASEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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