3R2YA

Mk2 kinase bound to compound 1
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
300
structure length
259
Chain Sequence
FHVKSGLQIKKNAIIDDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-based lead identification of ATP-competitive MK2 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MAP kinase-activated protein kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 259
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r2yA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r2yA01
1M2QA 2BVAA 3PP0A 3QTSA 5HVJA 3CIKA 4TXCA 4EYJA 3LPBA 2GHGA 4GK4A 3HEGA 2C6KA 3DQWA 3M2WA 3MFTA 2PTKA 4E4MA 2AC3A 3VBYA 5JFSA 5K3YA 3RWQA 2XK6A 1PXNA 1Q8UA 2XJ0A 1F5QA 3DBDA 4UXQA 5M07A 3B2TA 2F9GA 3P9JA 4MHAA 4G5PA 2R3LA 1UA2A 3DNEA 4OW8A 4WHZA 5EQPA 4Y72A 5CF8A 5CSHA 4UMQA 3FPQA 4MBLA 4L52A 4ZTQA 5L6PA 2GHMA 2BR1A 2VWXA 2CGXA 4KSQA 2Y9QA 4FTLA 4MD7E 5EYDA 4BIDA 2QOIA 3O50A 4M84A 5IQAA 4BCMA 4RLKA 1SVEA 3SXRA 3UNKA 1RW8A 3BYVA 2WTDA 4W8EA 4LL5A 4M68A 4KIKB 4PDSA 3BEGA 5LARA 1ZOEA 2HZ4A 4I20A 4Y5HA 1YW2A 2OF4A 4H58A 1H8FA 2JGZA 4WG4A 4AZWA 1KV2A 2PZRA 1S9JA 2W0JA 3GB2A 2OJJA 4G3CA 3G0EA 4QMXA 4ZEGA 1E1VA 2PL0A 2E9NA 2QOOA 3Q4UA 4C4IA 4XRJA 1NA7A 4I6FA 4MKCA 4KNBA 4FKLA 4YTCA 3BIZA 2QU6A 2PYWA 3Q52A 3O51A 4TTHB 3PVWA 3MSSA 3U8WA 3FZTA 3EWHA 4AACA 4EC9A 3PXZA 4NM3A 5HQ0A 3E5AA 3LFDA 4L43A 3RWPA 3AGMA 2HWPA 3V5JA 5AADA 3RAHA 4WG5A 4L42A 4O7VA 5IH4A 4IFCA 3A8XA 2VWVA 2XEZA 4YZ9A 5EM7A 4BWKA 3P86A 4FL3A 3E64A 2PPQA 4IEBA 1OGUA 3PSBA 3EZRA 2KULA 1PXJA 4I94A 5D1JA 3GOKA 5HG8A 4DBNA 4C4JA 4CZTA 3DFCB 1UNGA 3DV3A 3O8UA 1LEWA 2OU7A 2QOFA 5DR9A 2Z60A 2BKZA 3UOLA 2CDZA 4QMYA 4W4WA 4BYIA 4R1YA 3PIYA 3R0TA 3R04A 2UW4A 5L2TA 5A4CA 4PMMA 5E8VA 4BFMA 3DXQA 4CLJA 2I0VA 3CY2A 3CCNA 1OL5A 2UUEA 2WZJA 5A3XA 4DFUA 4FNXA 1VJYA 3F3VA 4K8AA 4V0GB 2JBPA 3UDBA 4BWXA 3TUDA 2RFEA 4GUEA 3R63A 2X9EA 2WU7A 5KKRB 5M4CA 5HNGA 3VUIA 4XV9A 4E26A 2WMVA 3WI6A 3WYXA 2VTSA 2XK9A 3A7JA 1JOWB 3TEIA 2R3NA 4EJNA 5I9VA 2UW9A 1DI8A 3W1FA 3DBEA 2G9XA 4OGRA 3C7QA 3EL8A 4ZTNA 5AAFA 3Q53A 4FV6A 2I7QA 1RE8A 5KHWA 3IGOA 5L2IA 1GOLA 4RLLA 4IB5A 1Z9XA 1FOTA 2C6OA 4Q2AA 1LR4A 4A9RA 4ASZA 4IACA 1NT2A 5KMKA 2QHNA 1WBPA 5HLWA 3Q96A 3MI9A 2WTWA 2B9HA 2HY0A 4FKIA 4GT5A 4H36A 2WTKB 3FLYA 3QA8A 5EM5A 5IH5A 2VNYA 4J7BA 3WZKA 4F9WA 1OM1A 3QXPA 2YJSA 3KRJA 3LQ8A 5CLPA 5F20A 4L44A 5CALA 3A99A 3QALE 3L8SA 5HKMA 4ZIMA 2O64A 4DTKA 2A19B 3KK8A 3R22A 2HY81 4FV5A 2C6LA 4JIAA 3EQPA 5EW9A 4D2PA 1WBVA 3TL8A 4C34A 2V5QA 4FTTA 1H1QA 3QX2A 1YWNA 3K54A 2P55A 1XH9A 1XWSA 2W1CA 3VJOA 1K9AA 2VTJA 3UIBA 4BC6A 3E63A 3TZ8A 5LCJA 3A61A 4WNKA 4ZTRA 4ZTSA 3MVMA 2AC5A 4RG0A 3KC3A 4JJRA 3QA0A 3PG1A 2FSLX 2CCIA 4XOYA 4AZVA 1SZMA 5HHWA 4ANLA 4AS0A 3R6XA 1OUYA 3UYTA 3KFAA 5CU2A 3VS0A 3KF7A 4NZWB 2C5NA 2CNQA 5HD7A 4E73A 3DKFA 2FA2A 5E8XA 3I0OA 4UMTA 4FIFA 3SX9A 3IDCA 2BFYA 5HU3A 1UV5A 3EZVA 1CDKA 3PZEA 5DVRA 5HVYA 4BIBA 4O7WA 1KWPA 1P5EA 4L7FA 2UZEA 2HAKA 2OO8X 4WUAA 4TYIA 5E9EA 3K5UA 4NIFB 4U3ZA 2HWOA 3F3TA 3QQLA 4DCEA 4YO6A 4ZLZA 4LV5A 4U97A 5TOZA 4A4LA 4BDEA 4ZLYA 4EWHA 3DT1A 3ORPA 2HZ0A 4JBVA 2YA9A 3ZUVA 4KABA 4M69A 2JAVA 2XKFA 3WIKA 2J0MB 5AP1A 3TV7A 3SQQA 2XIXA 3KCFA 4ZTLA 5C01A 5TE0A 4XP3A 2PVFA 4X2NA 2I0EA 4C0TA 4DLIA 4AOIA 1QCFA 4DGMA 4IJPA 3MFRA 3ZC5A 4ZJVA 2W05A 1Q61A 4D4YA 3L9MA 2C3KA 2XBAA 3FSKA 3V8SA 5CQUA 4LOQA 5CU6A 4LUEA 4PUZA 2I0YA 4EQUA 4JG6A 2JIUA 1ZY5A 3G0FA 5HCYA 2WMSA 5DEYA 5A4EA 5IEVA 3OCSA 4KKEA 5E7RA 3FQEA 3UVRA 3B8RA 1PKGA 4J8MA 3U55A 3DDPA 3TZ9A 4ZSGA 3OOMA 3QRIA 4S33A 3RCDA 4KKHA 4EKLA 2GSFA 5KMIA 5DR6A 3I1AA 2PVRA 3VW6A 1PHKA 4L6QA 5CYIA 4ALWA 3DB6A 4CEGA 4EBWA 1B39A 2G01A 2Y4IC 2PUNA 4YNOA 3UPXA 2XCHA 3BBTB 3OHTA 1LPUA 3DAEA 3TV4A 1V0BA 3O7LD 5DMZA 3UG1A 5IQCA 4HZSA 4YJUA 5CEOA 3HMPA 3F7WA 3HMOA 4QMVA 3RNIA 5LVPA 4AGCA 4NT4A 4ACDA 3TKHA 3HP2A 1T46A 4G6OA 4GK3A 2EXMA 4X2JA 5HORA 4IW0A 5GNKA 5M53A 1OL2A 3WIGA 2EVAA 3W33A 3JVSA 3SKCA 3R7IA 2XKDA 1WCCA 1QPCA 3KKVA 1CKPA 1OIYA 5FP5A 1OITA 2IZTA 4YBKA 3ERKA 5HICA 2HOGA 3F7ZA 2QODA 5DPVA 4BGQA 1ZZLA 5CS6A 4NFMA 4HPUE 2CLQA 3N51A 2X8EA 2ITNA 3ZOSA 4U42A 3R7GA 3COKA 3NIEA 5CSWA 5LMAA 3NVKI 3P7BA 3U4WA 5KO1A 4QMWA 3VUMA 3QAME 2BDWA 4RX8A 5K9IA 3OWPA 4M97A 4IAYA 5IISA 4F7SA 2QR7A 4DF3A 2X4ZA 5E92A 2GCDA 1PXPA 2DS1A 4V04A 1NXKA 5BPYA 4IVCA 3A8WA 4M66A 3HRBA 4HGLA 4RC4A 3QWKA 1OKVA 3FQSA 1H26A 3C4WA 4X7QA 4FVRA 4CYJA 2X39A 2Y7JA 3F3UA 2VTNA 4B9DA 4TWNA 3OTUA 5M44A 4RIXA 4X6QC 3U51A 2W1ZA 3QQUA 3DQXA 4DGGA 3ZO2A 1OPKA 4ZSLA 4JBOA 4USEA 4XLIA 4I41A 4J52A 3NIZA 3BYSA 4DTAA 3PSDA 2YIYA 4IM3A 3SRVA 3OG7A 4CGAA 1TQMA 4IFGA 2R3OA 5DGZA 2JKMA 3G9NA 2YM7A 2UW5A 4NTSA 5IA5A 3BLHA 3CLYA 3IK3A 3VS5A 3PIZA 3FHIA 4IDTA 4YJTA 3ZSHA 5AAEA 2XUUA 4HYHA 3FMNA 4FGBA 2ZM1A 1P4FA 3ETAA 2BROA 5IQFA 5EK7A 3OW4A 4FKRA 4WA9A 2OZAB 4FKJA 1WBTA 1KOAA 3Q9WA 5FM3A 3TN8A 4FNZA 3R1NA 2VWYA 2VTAA 1F3MC 3D14A 1Q8TA 4F4PA 3P0MA 2PSQA 3OP5A 3F66A 5H8EA 3Q60A 3S4QA 4L45A 5H9BA 2WXVA 3Q2MA 2R3JA 2F7EE 1TKIA 2GDOA 1H25A 2J6MA 2VUWA 1URWA 3EJ1A 4GRBA 2WOTA 4NFNA 2E2BA 1M52A 2CN8A 5AR3A 1Y8YA 1ZARA 4F9CA 2AUHA 3TG1A 1AGWA 3BV3A 4ANQA 3DK7A 4ID7A 3ZLSA 5I0BA 3ZM9A 3CQWA 3Q6WA 3SD0A 4AAAA 3OF0A 4EONA 3QKKA 4H05A 2VNWA 4IVBA 3KL8A 1OUKA 5JH6A 3PLSA 5CAVA 3ZTXA 4QNAA 3R01A 3OUKA 3HNGA 3KA0A 2F4JA 4I6HA 4RX9A 3HMIA 3TV6A 2VGOA 2DQ7X 3GT8A 4DFNA 4DFXE 4DYMA 4KRDA 4YJRA 2OICA 4ACCA 2E9UA 4JVGA 5K0XA 1H1PA 4IDVA 2R2PA 3LE6A 4UY9A 1FVRA 2W1HA 3DS6A 3IO7A 4FZ7A 4GKHA 3KRXA 5HOAA 1YXSA 4K0YA 3PTGA 4QMQA 3EMGA 1YOMA 3GU5A 4LQMA 4DA5A 4J99A 5CEKA 4BBMA 4M8TA 2JBOA 2OJ9A 3NUPA 4DG2E 2G2IA 4O7SA 2R7IA 2UZUE 4TWCA 4S30A 1XJDA 4AE9A 5D7VA 5CNNA 4DGLC 3V3VA 3P7AA 3GCPA 2OH4A 5CF5A 4JR3A 3FY0A 5IA3A 5F95A 2PZPA 1W83A 3VN9A 4G16A 2CKPA 4FICA 3GBZA 3QQHA 4HNFA 4CRLA 4E4XA 4FF8A 5CU0A 4ORKA 4O38A 3BBWA 1PMEA 3LZBA 3FC2A 3T3UA 4CTCA 3I7BA 3NUSA 4PNKA 5FUTA 4YHTA 5CVHA 4EH6A 2YZAA 3HV6A 2PK9A 3QTWA 2VTLA 2PVNA 4FKUA 4WKQA 2YERA 4YSMA 4AW5A 3UMWA 4D2WA 4JX3A 4MAOA 2PMNX 3ZXZA 3OEZA 3OTVA 3RKBA 3UGCA 1APME 3PY1A 2BUJA 4NM0A 3W2SA 2JDOA 5IZFA 4P90A 3PYYA 5M4IA 1XBBA 2C0OA 4IQ6A 2XIKA 3NLBA 3ZLYA 3E8DA 1X8BA 3WZJA 2OIBA 4BDKA 3DBQA 3NPCA 4YLLA 4E7WA 1CSNA 2F57A 3FEGA 3HAVA 2X0GA 4E5AX 1OL6A 1J7UA 5IU2A 5DT3A 5CEIA 3ZO1A 5KNJA 5J95A 2ZV2A 4XP0A 2OJIA 4FV2A 4I1ZA 4ITHA 4DITA 5CTPA 2R4BA 5ANKA 5F94A 5HI2A 3CE3A 1FPUA 1PYEA 2YJRA 3CY3A 3LLTA 2F2CB 2IVSA 4QD6A 5DWRA 3TIYA 3VIDA 3WF9A 2QURA 4BHNA 4D28A 5CANA 4IAAA 4S31A 5HG9A 5C8MA 3SAYA 4E4LA 4XG7A 3ZRLA 3UZTA 5DLSA 4RIOA 2O63A 3F2AA 3TXOA 4AE6A 2V7OA 4ENYA 4X0MA 1E1XA 3ANQA 1U5QA 4CTBA 3VBXA 4GVAA 4I5PA 4PRJA 1H1WA 5D12A 5TR6A 3UQCA 4EJ7A 3C50A 4UWBA 5JRSA 3GU6A 5T68A 4AX8A 5HBJA 2UW3A 4X21A 2VGPA 3NUUA 3ACKA 4GIIA 4BI2A 3NR9A 1PXOA 1YHSA 3H9OA 3R7YA 1A9UA 3BE2A 2VD5A 3ZEWA 4P2KA 3PUPA 4QPAA 5AR8A 4BDIA 2O8YA 5EFQA 2YABA 2P2IA 3WF5A 3NWWA 2NPQA 4IC7A 3EQRA 4O7ZA 1ZOHA 3VBQA 4TYHB 2V0DA 4NYEA 4ZLOA 5LXMA 2RSVA 5EHYA 3D83A 4DEAA 3TNPC 2W4JA 1SYKA 3KXNA 2I40A 5AP2A 4M14A 3BQCA 3NNXA 4U79A 5B0XA 5HCXA 3ZZWA 1XO2B 4OTIA 5JKGA 3AD5A 5ACBC 3OUNB 5A4LA 2XRUA 3VHEA 1FMKA 1O6KA 4MYGA 4QYEA 4D4RA 5JN2A 1REKA 1ZYJA 2GMXA 3R73A 1AQ1A 1GY3A 2GNJA 3C5UA 4LGHA 3D94A 3FUPA 3LFSA 2Y4PA 4NM7A 5L3AA 3VS1A 1Q8YA 3KMUA 3BELA 4O27B 3VUGA 3QD3A 5CWZA 1GNGA 4DN5A 5IQEA 1DM2A 4BL1A 3MFSA 2WTIA 4QTBA 3SW4A 3QTQA 3QTUA 4MXCA 5DBXA 2VO0A 3UO4A 4W9XA 5AR4A 3VRZA 5M4UA 3K3JA 2CPKE 3QX4A 4HYIA 4FYNA 4IVAA 4YUQA 2ZMCA 3QHRA 4O7NA 4XH6A 4TYGA 4HVGA 3UYSA 3GNIB 2EXEA 1RQQA 4N6ZA 3SXFA 4R7IA 4BWPA 2RF9A 4D9UA 5FBNC 4EWQA 2J50A 4UALA 5IDPA 1CM8A 3MWUA 3QL8A 2CNUA 4XLVA 1NW1A 2GTNA 1WMKA 2J0KA 1M7NA 4S2ZA 4X3FC 3FLWA 4C2VA 4PTEA 3ACJA 1Y91A 2JDVA 4RWJA 4I6BA 3WF7A 2YIRA 2BZJA 5HE0A 2FSTX 2RFDA 1KE5A 3W8LA 5J9YA 3NVMB 3V5LA 4YC6A 3BHVA 4Y8DA 2QG5A 3FL4A 3MA3A 2C6IA 4M3QA 4X3FA 5DE2A 5K5XA 2WMTA 3KRLA 4QTEA 5BUJA 2Q83A 1JVPP 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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