3R7EA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-67
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r7eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r7eA01
1OBGA 4BCGA 4EC9A 4FK3A 5DGZA 5AX9A 3IOPA 4DH1A 4TT7A 5B0XA 1OUKA 3VW6A 5KKRC 4D9TA 2FSOX 5CSHA 4C3FA 3SKCA 3VNTA 4MCVA 5CEIA 2R3JA 4E5AX 4M84A 5DT0A 3FLSA 4IZ5A 5T3QA 1GAGA 3C4EA 3WF7A 4S32A 4C36A 5EFQA 4ZJVA 4GU6A 3I6WA 2ERZE 5IISA 3LQ3A 3LCSA 4IBMA 4O7SA 2X8DA 3DBFA 3UBDA 4A9UA 3QRTA 1VYZA 5IA0A 2OZAB 4DBXA 3C4WA 2RGPA 1FVTA 3BQRA 4BDFA 3E7VA 1JKTA 3KXZA 5JGAA 3W8QA 4I41A 2GPHA 4XV2A 4ONAA 4QRCA 5FTOA 3KREA 5I5ZA 2Y4IC 5M56A 2ITVA 5CWZA 4FL3A 4HCTA 3R63A 4M0YA 4XG7A 4BBMA 3EFLA 4RT7A 4NCTC 2WAJA 3ALOA 4C0TA 3T8OA 3FHRA 2GMXA 3E88A 5HO6A 3U8WA 2VV9A 3E93A 3F69A 5BVDA 1SZMA 2QURA 3C5IA 2KULA 1APME 2XNEA 3U6JA 3UGCA 3GFEA 4FT9A 1H26A 4D5KA 4IAFA 4BY9E 3FPQA 3H0ZA 4RWKA 5DMZA 5JFXA 5TF9A 1YQJA 5CXHA 5HQ0A 5K4JA 4YJNA 4A06A 1HOWA 4OTRA 4L46A 3LJ0A 4J1RA 5AAFA 2LGCA 2ETKA 1OPJA 4IACA 4O0YA 4YU2A 4MTAA 4B0GA 5BNJA 3ATSA 4TWCA 4C37A 5HNIX 1DAYA 4O96A 4UMRA 1F0QA 2OF2A 1PKDA 4ZSJA 2VD5A 3VWAA 3EN7A 4FI1A 4LRJA 4QMUA 3FZPA 3R7UA 3ET7A 3DBQA 3ENHA 3UNZA 3CP9A 3D0EA 4CG9A 2YA9A 3LQ8A 4O7RA 2HZIA 4EH5A 1ZY5A 4O22A 5GJFA 4TYJA 4ANOA 4FSMA 2DWBA 3E63A 4J8NA 4TWNA 1REJA 5DWRA 3OFMA 5HBHA 4PPCA 2QCSA 3LCKA 3Q6UA 4LMNA 4UALA 4ZSEA 3F66A 5I4NA 4FOCA 3RHKA 3TL8A 2C1AA 1CMKE 2X8IA 4IM0A 3QD4A 2OWBA 2O5KA 4C7TA 5EW3A 4JLCA 5IPJA 3TNQB 1JKLA 4ZTQA 3JY9A 2UZVA 4DEGA 4KIKA 3PJ3A 1CKJA 3TCPA 1Q5KA 3KMWA 1AD5A 2E9NA 4LG4A 4AZFA 4I21A 4KBCA 4WBBB 4FVRA 2J51A 3UPXA 4A4XA 2QOKA 3OXZA 4I5HA 4U5JA 4LFIA 4KIKB 4TYGA 4CD0A 3HL7A 2JGZA 3ZLWA 3EQDA 4HGSA 4KB8A 5GZ8A 3VS4A 5EW9A 2E9OA 3PE1A 4BTFA 1CDKA 3F2NA 3Q9ZA 3TV6A 3F7WA 2QG7A 4O0XA 4XH6A 5EYMA 4WIHA 1OPKA 1PXKA 3Q4TA 4BHNA 4QMNA 4CFMA 4LV5A 5CF5A 5AUZA 1Q61A 1XH6A 2HY0A 5D7VA 2C0IA 2JFLA 4HPTE 5FTQA 3H10A 2W1FA 3PG1A 3GC8A 1GZNA 1W84A 2R64A 5A14A 2XA4A 3AD6A 5ANOA 5FG8A 3GC9A 4X2KA 3ZBXA 4FMQA 1P4FA 3RGFA 3NNWA 2EU9A 4L44A 2Y8OA 2YJSA 3VS3A 3GU7A 3W55A 2CSNA 3PVWA 3QX2A 4OTIA 1IR3A 1JKSA 4NJDA 1ZYSA 3OTUA 1YDRE 3ZC5A 4DFLA 3BRBA 4NYEA 3IONA 2PL0A 2ITPA 2WIHA 3KN5A 4G5JA 4XG4A 2R3MA 3DA6A 3F3WA 3QTRA 3QZIA 3WZEA 3QD0A 1WVWA 3QTIA 3OROA 3T9IA 3R01A 3EFWA 2X2LA 2J5FA 1J91A 2QR8A 3ATTA 4QQ5A 2BFXA 4DFUA 2HW7A 2YFXA 3VS0A 4M3QA 4C4EA 3PE2A 1F5QA 4O0SA 5C27A 5CAVA 4BDJA 1Y6BA 2V22A 3FBVA 4F7LA 2I40A 3GU4A 2W1HA 3MJ1A 1A9UA 4G9RA 4C57A 1R0EA 3FC2A 4GIHA 3MA6A 3FMEA 3KGAA 4J8MA 4WG4A 3KULA 5ICPA 4OT5A 2XEZA 3OEFX 4I5CA 3TM0A 3E8EA 1SVGA 4JL9A 5AV0A 3TKIA 4DT8A 5IUHA 3BLHA 5E90A 3QX4A 4I4EA 2R7BA 3NNXA 4RJ3A 1WVXA 3FHIA 4P7EA 3ALNA 4U6RA 5J87A 4RVLA 4RA5A 5D11A 4RWJA 3LE6A 3BYSA 5D10A 2H6DA 3H9OA 1H1SA 1RW8A 4XG8A 4EZ5A 2J0KA 1J1BA 4EOKA 2R3IA 1KE9A 2VTIA 3DKGA 4MVFA 3PZEA 3P4KA 3W2SA 3WIKA 4BRXA 4AE9A 2XK7A 5EM5A 4R7BA 1JVPP 2UZLA 1ZY4A 1DM2A 3JUHA 3V5TA 3MY0A 1ZMWA 4FVPA 3CGOA 2VTJA 4QNAA 5LQFA 3UPZA 3LCOA 4PRJA 4FIFA 3CJGA 3FZSA 2IVUA 5DT3A 4DEAA 3LMGA 5A9UA 5H2UA 3MI9A 3NVMB 2WTWA 4YJQA 3RI1A 4UXLA 4U8ZA 4ORKA 5GHVA 5HIBA 4PNKA 2I0HA 5EOBA 3MGYA 3BE9A 3OW3A 3HRCA 5AJQA 4DH8A 4AX8A 3GI3A 5EG3A 2PYWA 5D12A 4QMMA 2JLDA 3E5AA 4QPSA 1MRUA 1UV5A 3LW0A 3LCTA 4BWPA 5LVNA 5CXZA 4FSWA 4W4VA 4ZY4A 2QOCA 4MXAA 4NKSA 5G6VA 2VTNA 4MBJA 3EKKA 4AGUA 5CZIA 4BZNA 3EQPA 3VQUA 2P2HA 2XBAA 2JFMA 1W82A 5EW8A 4I0TA 3OP5A 4UMQA 3IW8A 1OKWA 4E5WA 1PXOA 1FPUA 4I5MA 2WMTA 4QQCA 2WTIA 3NAXA 4I24A 4WG3A 3ZUTA 3DK3A 1Z5MA 2G1TA 4FTAA 1EH4A 5A6NA 3ZFYA 2PE1A 5HZNA 3R22A 4D2RA 1OGUA 4NK9A 1RQQA 3OTVA 3VHEA 4J96A 3PP0A 3CY2A 4CT2A 1YXSA 4FV5A 3ZSGA 3IGGA 3A8WA 3KK8A 3OCSA 1KSWA 1Y8YA 4EOSA 1PXPA 2C5VA 3R04A 4YP8A 2IVVA 4DT9A 1PMUA 2ZDTA 4PTGA 3AC2A 3BHUA 3UOJA 1YOMA 4M13A 5CF6A 5LVPA 5E8YA 2C3JA 1OPLA 1MRVA 1G8AA 4U44A 5EI2A 2PVJA 3K3JA 3MH1A 4U0IA 4EORA 5TO8A 4DF3A 3KRLA 2Y6MA 4JOAA 1MUOA 3D83A 1PXNA 3RPSA 4C61A 5AAGA 2B9JA 4UY9A 1JWHA 3FQHA 3MFUA 3TG1A 2I0EA 4QP7A 4BWXA 3VUMA 4EZ3A 4LQMA 5KBQA 3Q3BA 4QMOA 4TYIA 1KUTA 3E3BX 4MQ2A 1GOLA 4Y83A 2A4LA 2VGOA 2PMNX 4L8MA 3AQVA 3DFAA 3OUKA 3NUYA 3KMUA 4FSQA 4IAYA 3SDJA 4DTAA 2ZJWA 4FTIA 5IEXA 2PVYA 2YCRA 4EH7A 5CEPA 1OI9A 5CVGA 4BI0A 4A9TA 1XH7A 4ZTMA 4Z9LA 2PVLA 3BKBA 3Q53A 3RWPA 5KMKA 4G17A 3MS9A 4N6YA 5M07A 3G2FA 2H96A 4XNEA 3UYSA 4V04A 4K2RA 4GK3A 4KBAA 4EYMA 4X7QA 1KOAA 4RIOA 4TPTA 3EL8A 5KBRA 3W10A 2QLUA 5I9UA 3AG9A 4FZ6A 2C3IB 5HD4A 1PKGA 1NY3A 4D5HA 4CYJA 4PUZA 3FZTA 4M14A 3MVHA 3IPHA 3PYYA 1VZOA 5A3XA 4ITHA 4KIOA 4YJRA 4IVBA 5LMKA 2I6LA 3IECA 4FKPA 3BGPA 2YWPA 1PYXA 1Q4LA 3PXFA 4FUYA 5CSVA 4OTPA 5BUJA 3AMBA 3MSSA 2CN8A 1FQ1B 5CVFA 3SLSA 1BL6A 3D7TA 4B6LA 1WFCA 2HXLA 2QKRA 2EXEA 2PUNA 3PDTA 4BDAA 3SG8A 3C1XA 3COKA 3NUSA 3ZH8A 5L2IA 1Q3DA 2UW7A 3DNEA 2UW8A 4F0GA 3F88A 5T68A 3D7TB 3H30A 3CTHA 3I60A 3WYYA 2RF9A 4QP8A 4NTSA 4JI9A 4ZZNA 2QU6A 4DYMA 2XM8A 4UN0C 5A4LA 2GQSA 3EFKA 4O82A 5CVHA 3LKMA 2BZKB 3R9RA 2EB2A 3O71A 2XB7A 3FE3A 3UE4A 4AT5A 5HCXA 1ERKA 3ORKA 5JFSA 4RGJA 3LIJA 3NZ0A 4FG8A 2GSFA 3NRMA 4MD8E 1QPDA 4JQEA 4QO9A 3VUKA 2HWOA 5FBNC 3LOKA 5AUTA 1H1RA 2GNGA 5HHWA 2QHNA 3I5NA 4FZDB 2WTCA 3LFEA 1ZMVA 1B39A 4XP0A 1XR1A 2ZVAA 4QMPA 4EH9A 2VUWA 4AZSA 5CEKA 3R00A 4IH8A 3CD8A 4XOYA 3FKNA 3HRFA 3SOCA 2B52A 2VGPA 1IRKA 2WQNA 4GW8A 2OH0E 4YC8A 1WBSA 2BILB 2GFSA 4FT5A 4BGQA 3SRVA 5L2QA 2XJ0A 3C4CA 4KIQA 4WNMA 5AP6A 4LMUA 2PVHA 3R7OA 3WF9A 5EQPA 4U79A 2REIA 5C8KA 2C0OA 3DJ5A 3PWDA 4AS0A 2X9EA 3FLNC 4Q5EA 4QMYA 5HE2A 1VYWA 5DIAA 3R7VA 2Z02A 4BCIA 2BVAA 5J7HA 2V7OA 4JT3A 4JRNA 4F6WA 1B38A 3LXNA 3NYXA 4J52A 4O7VA 1YXXA 2O2UA 3BWFA 5IA3A 2NRUA 4HJOA 2QO2A 3DDQA 4CYIA 5AP2A 3MB7A 3KA0A 2BDWA 4AN2A 3PIZA 4QMTA 2XEYA 4F09A 2YCQA 1ND4A 3GP0A 3FMLA 2XJ2A 2JD5A 3BYOA 4YJOA 4FNZA 3KMMA 3PUPA 5KNJA 3HMOA 1OL1A 4JG6A 4BCOA 4D28A 2VZ6A 2VTPA 5ANKA 2FSLX 5KX8A 3MA3A 3PSBA 5EI8A 1TQPA 2YM4A 2JBOA 4CMTA 2J0IA 4LOQA 2J7TA 4TRLA 5J8IA 4EH6A 2PVFA 4X0MA 3TUBA 4G3DA 4O1PA 2GDOA 4YJTA 1Z57A 1XWSA 4CSVA 3QTXA 1JPAA 1ZARA 1OIYA 2H8HA 2X4ZA 3ITZA 3L9PA 3VJNA 3RPYA 3BI6A 2HXQA 5L2WA 3LZBA 4K11A 4UMTA 1XBCA 3QQFA 5GINE 3G90X 4G16A 4BWKA 1ZRZA 2QOLA 3UVPA 2XRWA 2Y9QA 3C4XA 1YI3A 3Q4CA 3Q9WA 3R2BA 3N4TA 3PG3A 4ZLOA 4EWHA 4AAAA 2XRUA 3E7OA 5AUWA 1J7UA 2RFSA 3NX8A 4E6CA 3DBDA 4L7FA 4RWIA 1PW2A 4H3BA 1GIIA 2G9XA 3Q4ZA 1ZOEA 2CLQA 5A4QA 3AD4A 4O2PA 1F3MC 2X7OA 5L6WL 2NRYA 4RLLA 4CKRA 3MFTA 3MFRA 3WZUA 2ZV9A 3G0FA 3K5UA 5DHJA 4ZIMA 2WMBA 3RVGA 4FGRA 3WYXA 4EH2A 3AGLA 5C26A 4BDGA 4BR3A 2Y4PA 1YHWA 3CTJA 3QTSA 4U42A 4QYFA 5ANEA 5I9WA 3NUUA 1J7LA 5H8EA 3RP9A 2W96B 3PXZA 3S2PA 4XG2A 5BQ0A 3ZZWA 2GS6A 4ITJA 3OBJA 3QUDA 3ANQA 4LRMA 2X6DA 5ACKA 5HX8A 2PUIA 4NWMA 5DI1A 4ZMFA 1A48A 4C4GA 3HDMA 3U4WA 2VWWA 4ANQA 2UZEA 4NH1A 4QP2A 1H08A 3EQBA 5BVOA 4ZS0A 4NTTA 5C8MA 2XKDA 4S33A 4HZSA 3V6SA 4NKAA 4JDJA 3E8CA 4HVIA 4YZMA 3BBTB 4FL2A 4MKCA 5BVEA 2OFUA 2WB8A 4FKRA 2UV2A 3LVPA 2YIQA 3TNPC 3RAKA 3R7EA 4IM3A 4IC8A 1ATPE 4RZVA 5EKNA 3UVRA 5ETIA 4CKJA 4O7LA 1SM2A 3OZ6A 1OIUA 3TZ8A 2X1NA 3JPVA 4KKHA 3QYWA 4DA5A 4BIEA 4EC8A 1XBBA 4S34A 2HZ4A 1REKA 2C6DA 3UVQA 4AT4A 1LEWA 3KY2A 5AMNA 5K5NA 2YDIA 4RIWA 5K5XA 3SXRA 4A07A 5L6PA 1JSUA 3QTQA 3B8RA 2JDOA 4UEUA 5HEZA 5JT2A 3EH9A 2ZAZA 3VBWA 2J0LA 4NFMA 4QT1A 4RIWB 2Q83A 5BVNA 2XYNA 2W4KA 3C4ZA 3UIMA 3EIDA 4A9RA 5HU3A 5D7AA 3TNHA 4QP9A 3RPRA 4C4HA 3GC0A 4LGGA 4XV1A 4FA2A 3PY0A 5FM2A 5HG9A 4C02A 4EK4A 1U54A 5TT7A 4G6NA 1AGWA 4WSQA 4EK5A 2PSQA 5K0KA 2PZ5A 4GCJA 5CU2A 3CPCA 1H8FA 3U55A 4ZTSA 3LFFA 3N51A 4RQKA 3A7JA 3CEKA 2W1CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OBG A;  4BCG A;  4EC9 A;  4FK3 A;  5DGZ A;  5AX9 A;  3IOP A;  4DH1 A;  4TT7 A;  5B0X A;  1OUK A;  3VW6 A;  5KKR C;  4D9T A;  2FSO X;  5CSH A;  4C3F A;  3SKC A;  2XAM A;  1G8J A;  3VNT A;  4MCV A;  5CEI A;  2R3J A;  4E5A X;  4M84 A;  5DT0 A;  3FLS A;  4IZ5 A;  5T3Q A;  1GAG A;  3C4E A;  3WF7 A;  4S32 A;  4C36 A;  5EFQ A;  4ZJV A;  4GU6 A;  3I6W A;  2ERZ E;  5IIS A;  3LQ3 A;  3LCS A;  4IBM A;  4O7S A;  2X8D A;  3DBF A;  3UBD A;  4A9U A;  3QRT A;  1VYZ A;  5IA0 A;  2OZA B;  4DBX A;  3C4W A;  2RGP A;  1FVT A;  3BQR A;  4BDF A;  3E7V A;  1JKT A;  3KXZ A;  5JGA A;  3O5A A;  3W8Q A;  4I41 A;  2GPH A;  4XV2 A;  4ONA A;  4QRC A;  5FTO A;  3KRE A;  5I5Z A;  2Y4I C;  5M56 A;  2ITV A;  5CWZ A;  4FL3 A;  4HCT A;  3R63 A;  4M0Y A;  4XG7 A;  4BBM A;  3EFL A;  4RT7 A;  4NCT C;  2WAJ A;  3ALO A;  4C0T A;  3T8O A;  3FHR A;  2GMX A;  3E88 A;  5HO6 A;  3U8W A;  2VV9 A;  3E93 A;  3F69 A;  5BVD A;  1SZM A;  2QUR A;  3C5I A;  2KUL A;  1APM E;  2XNE A;  3U6J A;  3UGC A;  3GFE A;  4FT9 A;  1H26 A;  4D5K A;  4IAF A; 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