3R7UA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-75
Total Genus 79

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
282
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TI1 (1-4)TIV1 (23-26)EMPTYTI2 (13-16)S3 (29-35)S2 (18-23)TI3 (24-27)AH1 (46-56)O1 (57-59)AH3 (101-121)TIV2 (71-74)S4 (66-72)S7 (133-135)S5 (75-81)S6 (85-86)AH2 (87-94)AH6 (182-198)TI6 (95-98)TI5 (94-97)3H4 (271-273)3H1 (130-132)TI7 (136-139)TIV4 (125-128)S8 (141-143)TIV5 (143-146)AH4 (148-151)TI8 (166-169)AH8 (257-267)AH5 (171-175)3H2 (230-232)TVIII1 (201-204)TII2 (227-230)TIV7 (250-253)TI9 (224-227)AH7 (208-219)TI10 (233-236)TI11 (237-240)3H3 (248-250)TVIa1 (252-255)AH9 (277-282)TI4 (60-63)TIV6 (223-226)S1 (4-11)Updating...
connected with : NaN
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 282
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r7uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r7uA01
2JLDA 4GU9A 3RM6A 5KMMA 4WA9A 5AUXA 2EB3A 5M55A 3FMJA 5EYDA 3A8XA 1SMHA 3NVKI 4KBAA 3ANRA 2QODA 4FSZA 2OLCA 1OPLA 4GH2A 3IQ7A 1NW1A 1H00A 4OTGA 1FMKA 3DK6A 4D0WA 5K4JA 2IW9A 3R28A 1ZMWA 4JI9A 3GEQA 4JT3A 2FO0A 3ZMMA 2PUIA 3Q32A 1HCLA 4NL0A 2XEYA 3LLTA 5HG9A 2PVFA 3OT3A 4O0RA 2QOCA 2YZLA 2XS0A 4HGLA 4MXZA 5IUIA 2Z7QA 4JQEA 2VZ6A 3BIZA 3R21A 1V1KA 2R3LA 3AD5A 4GYGA 3BEGA 5DR2A 5H2UA 4PDOA 3HA8A 2NO3A 3MIYA 2VWVA 1G8AA 4YJTA 5AAEA 2IZSA 3GC0A 4UXQA 4C58A 1JKKA 3OUNB 3QWJA 4Y73A 4FVPA 4ZS0A 5LMKA 1UU9A 3PE1A 4I41A 4O0VA 1KE6A 4AXAA 3QA0A 5I0BA 2HIWA 1LEZA 3FZOA 4OTFA 4Y8DA 5A3XA 1J7UA 1CM8A 3CEKA 2BRHA 5A4EA 4MD9E 2WMTA 1GIHA 3GCVA 3EIDA 3HEGA 3LM0A 5A9UA 4GJ2A 4GRBA 3H10A 4ANBA 2VV9A 2VTNA 5E8SA 3BV2A 5EW3A 2OF2A 2R7BA 1I44A 4DLJA 5CEKA 3UYTA 1OZ1A 3D4QA 3D7TA 5FM3A 5K4IA 4Q5HA 2WGJA 4TZRA 1MQBA 4LGDA 4UMTA 4D55A 3VIDA 5IG1A 5ACKA 3BBWA 3NPCA 5IQAA 1PXOA 4IAFA 1M7NA 3WZKA 1SVGA 2OU7A 5KMJA 2XBJA 5E90A 3VHEA 4ZTNA 4I94A 3R7YA 5A4QA 2YWVA 4YNEA 3A7FA 4M7IA 4PL5A 3RNIA 1P4FA 4O7SA 2PK9A 3BCEA 4DYMA 4AOIA 3P7AA 4IFGA 3ELJA 4EQMA 4YLLA 4RFZA 3QRIA 3R7IA 4H3QA 3VS3A 4GK2A 2W4KA 4HJOA 4HCTA 2DS1A 2OZAB 1ZAOA 4NKSA 2VTIA 3EN9A 4DEBA 4HNIA 1M2PA 5DGZA 4CXAA 3VNTA 3D5VA 5FQDC 4HYUA 2AUHA 3ORNA 1WBTA 1ZOEA 2WU6A 3W8QA 3NVMB 3DK7A 4GFOA 2W1IA 3PIYA 4RG0A 4EOJA 1YRPA 2XNMA 3R73A 4AUAA 1H08A 2R4BA 4EH8A 5IQCA 3PY0A 4ZY6A 5M07A 4APPA 4FV9A 3RAKA 4DT9A 4DA5A 5CY3A 2NPQA 2PVLA 4FG9A 2VGPA 4QYGA 3HECA 2C47A 1YW2A 4AZFA 4D2TA 2C5XA 3L8SA 1VZOA 4C4JA 3QZGA 5AP7A 4K11A 1VR2A 2WMVA 3EJ1A 5IA3A 2W5AA 3KXNA 3FZTA 4EH7A 3KY2A 2QCSA 4ALWA 3P78A 3R04A 5KUPA 2J0MB 3NUSA 2WTKC 4JRNA 4FKQA 3ZSIA 1RE8A 5IQBA 4JIKA 4AZSA 4PPCA 4QMSA 3E8NA 5LXMA 4FTQA 5AA9A 3C9WA 5GJFA 2WOUA 4L6QA 2ZB0A 3UNJA 1B38A 2UW5A 4O96A 4XP3A 5J5SA 4BN1A 4IM3A 3TDVA 3GU5A 4IE9A 3FPQA 3PXFA 4IAKA 2E9NA 2J0KA 3FKLA 5CSXA 5J95A 3LXPA 3LAUA 3FI2A 4TNBA 3KVWA 3VAPA 3W1FA 2CKEA 3D15A 3LMIA 1UU7A 5EDQA 4HVGA 2C6DA 4FUYA 4ACDA 3U9NA 4QMNA 2P55A 2B7AA 1Q97A 3KXMA 4IVCA 3OROA 4J1RA 4Y83A 4W4YA 2F7EE 5GHVA 5L8KA 3TIYA 1XWSA 3MVLA 3C5IA 5HI2A 4XV2A 2XNEA 4M14A 5FTGA 2BRGA 2QOOA 5KKRC 2PUPA 1OL1A 5FP6A 1LEWA 1PMEA 2RSVA 1JKLA 3PWYA 2RGPA 2X9FA 4BDJA 3LMGA 2V55A 2PMIA 3TXOA 4H58A 3DXPA 3O7LB 5HO6A 3SKCA 1MP8A 5BVWA 3RP9A 5JGDA 3EZVA 5IPJA 4IDTA 1XR1A 5HO7A 2WQOA 3EHAA 4K0YA 3EFLA 2CN5A 1Y57A 3WF5A 4FZFB 2G01A 4YP8A 3T9IA 4DG0E 4QP6A 3RZFA 2QU5A 2C3JA 4CYJA 4ERWA 1XBCA 1YXVA 4AZEA 4KSQA 4AF3A 3LFDA 2QR8A 4YU2A 4FSTA 2H96A 5L2SA 5DPVA 4B4LA 3PXZA 4FKTA 5EH0A 4CZYB 4HYIA 4O0UA 4WRGA 3WZJA 2XRWA 4O1OA 3HV4A 4AT5A 5K9IA 3EQBA 2EXEA 3PJCA 5KHWA 4GUEA 4BDEA 3IW5A 5D7VA 4I22A 2E9UA 3FKOA 5AAFA 5AADA 3HA6A 3UO4A 4C2WA 3MBLA 3KXGA 3POZA 4U40A 3LJ1A 3MFRA 4R77A 3OHTA 5IDPA 4AWIA 5KMKA 2Q83A 3CCNA 2DQ7X 2YLEA 3EL8A 4BGGA 4LMNA 4ENXA 5J87A 3PZHA 3R2BA 1GJOA 4X3JA 3R1NA 3VJNA 4J97A 3FEGA 5EQYA 4C62A 4FTUA 3H30A 5IQFA 1O6YA 2ZM4A 3D94A 3LCDA 4FNZA 4YJPA 2JDTA 3SXRA 3ATSA 4TNDA 5DMZA 3CSVA 5EYMA 3ZDUA 5IA1A 3LFNA 2UZWE 3EB0A 3CQWA 3ZFXA 1TQMA 4FF8A 1UA2A 2OF4A 3TV6A 4JDHA 3FMNA 4FVQA 4BDCA 2OFUA 2BCJA 3I81A 5E8TA 3P1AA 4FNXA 4YURA 1H25A 4MVFA 4WUAA 3TZ9A 3R63A 3Q4UA 4FV3A 2PZRA 3QXPA 4L43A 4EHZA 1ZWSA 4Y85A 1YWNA 1I09A 4FGBA 3F7WA 1QL6A 4FV0A 2Y8OA 3REPA 3I60A 3PLSA 4ZK5A 4NWMA 4D2RA 4DEGA 5A46A 4CZTA 5AP6A 5D41A 1GNGA 2JDVA 2XKEA 5ICPA 1W0XC 3V01A 3ZM9A 3N51A 4BI0A 2ETKA 3QZIA 4CTBA 4XG8A 2JDSA 2XNGA 2YM3A 3ZO2A 2WEVA 2UW3A 3V8SA 4MF0A 4U3ZA 3UOHA 1FGKA 4D1SA 4RIYA 4BCKA 4CVAA 3CKWA 5JEBA 1LPUA 2E9OA 3B8QA 4F0IA 3G15A 2W1HA 4QQTA 1URWA 4G6OA 2G15A 5IH4A 2C68A 4DH3A 4EBVA 1NA7A 3MY1A 4AA0A 5JN2A 2J0LA 3ITZA 4ZJIA 4D2SA 5LOHA 3DAJA 2J90A 2RKUA 4BDIA 4W9WA 1XH5A 3AG9A 2CN8A 2R3PA 4YZDA 3EYGA 4RJ4A 1JNKA 2RFEA 4YJUA 1XBAA 4Q5EA 4QTCA 4Y5QA 3UZPA 3IGGA 2J5EA 5E7RA 4L44A 4F9BA 2PZPA 3QQHA 3A8WA 2VUWA 3E3BX 4B9DA 4R78A 1PXPA 3AC1A 4DTBA 5M53A 2QOKA 5F94A 1PMNA 2PE1A 5TKDA 4FEQA 4BKZA 3PJ8A 2EB2A 3GXLA 4FK3A 4NIFB 2CKQA 1OECA 2WQNA 1UVRA 3QC4A 1CMKE 4FYNA 4JR3A 4EZ3A 5C26A 5CI7A 3NDMA 3CGFA 4MQ1A 4Y5HA 4RIWB 4KRCA 1JAMA 4J53A 3H3CA 5J5TA 4HGEA 2P33A 5GINE 3DB6A 4AAAA 2IPXA 2B9IA 5IQDA 3GCPA 5K5NA 5L2TA 5ANJA 3ZU7A 3LJ0A 3OXTA 4U43A 3TNWA 4BGHA 2YWPA 2OZAA 1YWVA 3R0TA 4DEEA 1OKWA 3MDYA 1Q8YA 5GNKA 2VWZA 3GCSA 4R1VA 5DT3A 3RZBA 1IAHA 3FDNA 3DQXA 4P2KA 1CKPA 3QTRA 4JJRA 2CGXA 4RBLA 4RGJA 5CSHA 4AX8A 3DJ7A 3HUBA 3S95A 4FT7A 5DBXA 4RWLA 4LQMA 3BI6A 1WBSA 4QMWA 2PVKA 3VS2A 4FEXA 5M51A 3EN4A 4L00A 1LUFA 1R39A 4G17A 4GL9A 3QRUA 2WTIA 4DEDA 4D2VA 5CF5A 3COMA 4I6HA 2QOQA 4XV1A 3W2RA 4CQEA 4E73A 2ACXA 1H1QA 4ACHA 3VBXA 5BMSA 4FE2A 2BAQA 3K2LA 4QMQA 4QP7A 3FI8A 5EDPA 2UVZA 4FK6A 1P2AA 3IOPA 3B2TA 1ZOHA 3P86A 3ZC6A 2R3MA 4UEUA 3HRCA 4RX7A 1NY3A 2WMAA 1YI3A 2QG7A 4KIQA 1GAGA 3N4VA 1REKA 2XK8A 3MPMA 1MRUA 4Y95A 3KEXA 1L8TA 4L3PA 5HE2A 5KKRB 1XJDA 5AR5A 1YI4A 4EKKA 5T68A 3IDBA 5HIDA 4HOKA 4ASDA 2PSQA 3C4FA 2WELA 3NR9A 4IZ5A 4JG7A 3TNPC 1Q61A 4FI1A 4V01A 3ZHPC 2Q0NA 4DN5A 3C0GA 1H1RA 2B54A 3NWWA 3ATTA 3MY0A 2BHEA 3PVWA 3FY0A 1KV1A 3AQVA 3NUUA 5CNNA 1OB3A 4CSVA 4OLIA 3UP7A 4WNMA 4BTFA 1QPEA 3RCDA 5FUTA 4DC2A 4RRVA 4YZ9A 1U4DA 4UWYA 5AFVA 3DGKA 4BICA 4ZY5A 3RCJA 4CLIA 1U46A 1FQ1B 4MNFA 3GC8A 1Q8ZA 2PTKA 4RC4A 5AUUA 1PMVA 4V0GB 3TG1A 4F6WA 3UOJA 2ZVAA 2FSMX 3V04A 3MTFA 1Q8TA 3BHTA 4FV7A 3TUBA 2UW9A 3BYSA 2WEIA 1NVQA 1OPJA 3RAWA 2JGZA 1WMKA 1ZMUA 2A27A 4YHTA 2XNPA 4V05A 5L2QA 5CSPA 5L2IA 3UZRA 4C33A 3KXHA 2GPHA 4S33A 2UZNA 3P7CA 4ENYA 5I9VA 2X0GA 4F6SA 5A54A 4R7BA 4U41A 3FLYA 2PUUA 3R8VA 4BR3A 1Q62A 1YXUA 2OJGA 4RJ8A 4BCHA 4FT3A 4E5WA 3I5NA 2Y4IC 5HVYA 3ZRMA 2ITNA 3UPZA 3FV8A 4QPMA 1BL6A 3NW6A 4GKHA 3C4XA 3VWAA 4IQ6A 5CI6A 2CKPA 3HRBA 3PXQA 3II5A 3RKBA 3QGYA 4QTDA 3EL7A 4LG4A 4FTRA 3VO3A 3DNEA 4HVDA 4OAUC 3WARA 4IWQA 3M2WA 1YDTE 3COKA 4L01A 3QRKA 5LVNA 4FEWA 4F0GA 5CEMA 3NNXA 3S3IA 4H1JA 3VRYA 3QQGA 4DTAA 2PVMA 3DKGA 3E62A 3GVUA 4KD1A 4ASEA 4CV9A 3GP0A 3EFJA 5KMNA 4AE9A 4EQCA 3ANQA 2XIXA 1ZARA 3PJ2A 3PSDA 4OGRA 5GIPE 2HYYA 4G31A 4LOPA 4KWPA 3VF8A 2RG5A 3OW3A 1E9HA 1XKKA 5AUYA 4XRLA 1KE7A 2B4SB 4FKVA 4ZEGA 4F4PA 4FA2A 4QP4A 4PNKA 2BDFA 3KGAA 3UODA 4EK4A 4YZMA 3BGPA 5FEDA 5AWMA 4TWCA 3RNYA 3TKUA 1R78A 4CD0A 3OWJA 3Q9WA 4RJ3A 3NUYA 3QTUA 4D1ZA 3MS9A 4XV9A 1R0EA 4AACA 4RVLA 5CF8A 2GSFA 4FKLA 5F9EA 1H01A 2YDKA 4M97A 5HX8A 4GVAA 3WE4A 4AG8A 3UC3A 4OTQA 1KOAA 4OW8A 4ZLZA 5AEPA 4CRLA 3ORZA 4BDAA 3COIA 3DJ5A 4FSWA 4PTGA 5HX6A 2ZDUA 2VO6A 2RFDA 4G3DA 4TN6A 3UVPA 2V22A 4DINA 2VN9A 4PPBA 5M4CA 5E8ZA 4AT4A 3AC5A 4O0SA 3VS5A 4GG7A 4JDKA 2W1EA 3D7ZA 3QWKA 2UZBA 3VRZA 5FTQA 4LL0A 4DFUA 3BLRA 1H4LA 5T6KA 4BCQA 3GNIB 4HW7A 1W82A 5D9HA 5EW8A 4LUEA 3ZC5A 2OIQA 1A9UA 3G0FA 3C4ZA 4KA3A 4U8ZA 2I0YA 4EOOA 3EQGA 3T9TA 4F65A 4I23A 3U4UA 2PVRA 4UMPA 3QD2B 2QOLA 4CNHA 5IMXA 2CDZA 2I1MA 2P4IA 3R8MA 1BI8A 5LVPA 4GIIA 4YHJA 5KCVA 3R2YA 3K3JA 3MESA 4C61A 1UV5A 3NYNA 4YGAA 4EWHA 5B2MA 3FMMA 5HEZA 5I3OA 5FDPA 5EW9A 2J2IB 4TL0A 3CJFA 5I3RA 4QMYA 5CENA 3R7UA 3U9CA 4D2PA 4AQCA 3RMFA 1XH7A 4W8EA 3PTGA 4FSNA 4JQ8A 4AN3A 3MTLA 1G8SA 1KUTA 4EH9A 4A9RA 2F49A 3A2CA 3QZHA 4I6QA 1OKYA 2GNHA 2JIUA 2YCSA 4BL1A 3FKNA 1Q3WA 5EOLA 3V8TA 1JKSA 3KU2A 2PL0A 4YMJA 3NAXA 5AMNA 4ZTMA 5HTCA 3SXSA 4EQUA 2NNWB 2PPQA 3UG2A 4BI1A 3E87A 1VJYA 2GNJA 4EOKA 3RHKA 1UWJA 4J7BA 2XKCA 1H07A 4RIWA 5G6VA 4U3YA 4YR8A 3MH2A 3R01A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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