3R7VA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-9
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r7vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r7vA01
5HTCA 4DC2A 5IA0A 3OWPA 1YW2A 3VAPA 2BALA 2GFCA 4U43A 4C36A 1CM8A 4I5MA 3BGZA 3GOPA 5IQGA 2VWXA 3RHXA 2BDJA 4EOQA 1PYXA 1H1SA 4BDDA 4FT5A 3MTFA 2WAJA 3PSCA 4C8BA 4RLKA 4O81A 1AQ1A 1K9AA 2OZAB 5KBQA 4HGLA 4JXFA 4LL0A 4M84A 2CKOA 5AP2A 2XCHA 5F94A 2W1GA 2WMXA 5HO8A 5AADA 4X2GA 3TUBA 5HESA 4IZYA 2W99B 5KKRB 3I7BA 5FM3A 5KMLA 4QMQA 2P3GX 3R8LA 2E9OA 5CXZA 4M97A 1IR3A 2YITA 3KXHA 2F4JA 5J87A 3QUPA 5J7HA 1VR2A 5KHWA 5E8ZA 1P4OA 4A9TA 4K2RA 2PVRA 2XKCA 3ELJA 4D58A 2QOKA 1XHAA 5LXMA 3C0HA 2VTOA 3HV7A 4EYJA 5IU2A 5AM6A 3Q32A 4K11A 4GT5A 5HICA 4YTHA 1CKPA 3LM0A 3FZPA 4E6AA 4FIFA 2JKMA 3QWJA 2R3OA 3Q2JA 4BDIA 3SC1A 3TUCA 3SG8A 2HK5A 3PFQA 1QPDA 4RT7A 4DG3E 2VGPA 4JX3A 4DGLC 3PE2A 3DK7A 3TZ9A 3QYZA 1M14A 3FMKA 4AZWA 4WNPA 4NTTA 5BYLA 4GH2A 1R78A 3D4QA 3I7CA 2WIPA 4X21A 3ZLYA 4AN3A 2BUJA 2P4IA 3DZQA 4ZZOA 4FV8A 2UZOA 5EH0A 3AD4A 3GCVA 2W1CA 3F2RA 4ZJJA 2A2AA 5EW3A 1WVWA 3QCQA 3TNPC 3KN6A 2GS7A 4UY9A 2IWIA 5C8NA 2AUHA 2BAJA 2JAMA 3RPSA 3WF7A 2A27A 3THBA 4BCMA 4U0IA 2QOQA 2JDVA 1APME 3IOKA 4AP7A 3BE9A 4H3BA 3U55A 3TACA 3QALE 3COHA 3QD4A 4DH1A 5IQIA 1STCE 1ZLTA 3VQHA 3JR1A 1DAWA 4GJ2A 4DEAA 2UW0A 3WZJA 4CZTA 4FZFB 4ANLA 3FI8A 2WTCA 2GNJA 2XJ0A 4AN2A 2BFXA 2QOOA 4FSYA 4FT7A 5C26A 5E8XA 2XRUA 2WU7A 5A46A 4FGRA 5HO7A 2J4ZA 3FHIA 3PPKA 2P0CA 4FV4A 3JY0A 5HNBA 5FTQA 4FTMA 4BWPA 4YPDA 3RWQA 4EH8A 4BBMA 2YCFA 4HVGA 3JUHA 2ONLC 5HVKA 4OTDA 4BC6A 2OWBA 3ZSHA 4IVDA 4BZNA 4U9AA 2WO6A 2YCRA 5JRSA 2P33A 1UV5A 1PY5A 1I44A 2OF4A 1PKDA 4MWHA 4CRSA 3R9DA 3BELA 1Q62A 3C9WA 3AT2A 3DBQA 4FVPA 4TWOA 2WTWA 4RJ3A 4C35A 2GHGA 4CV9A 4RJ8A 5CALA 2QOCA 4N70A 5F9EA 3LIJA 3PPJA 2ETKA 2JC6A 2XBAA 5DGZA 5LMBA 2WB8A 3T3UA 2ITXA 1J1CA 4TYGA 4BFMA 2XK8A 3U8WA 3ZUUA 4C58A 1OPKA 3T8OA 1WVYA 5BVDA 2CHLA 2ESMA 3AC2A 4XG2A 3S2PA 5C4KA 4GUEA 3D5XA 3F2NA 5EQEA 3DCVA 1QPEA 2QU6A 5C8KA 4BCOA 4PX6A 5C4LA 3TIZA 4LV8A 3NUPA 4ENYA 3F5UA 3KRJA 3W2PA 3EKKA 1VYZA 2B9IA 3I6UA 1LPUA 4W9WA 3UBDA 5M51A 4LM5A 5DOSA 5J9YA 5J1VA 3UQCA 4J71A 4MNFA 3SDJA 3EWHA 3DS6A 3P08A 3ZC6A 4QNAA 1MP8A 4F65A 3F66A 4QNYA 2B7AA 2UUEA 4OTIA 3UMXA 5A4LA 4L43A 2JDOA 4AN9A 4ZS4A 4NUSA 4O2ZA 1FMKA 3WZKA 5B0XA 4F64A 4OTQA 3ZYAA 3E92A 5AFVA 2IVSA 4JBVA 3G5DA 5AR2A 3FKNA 4K6ZA 3BGQA 4XEYA 4C7TA 2UZVA 5FDPA 3UZTA 3ZLSA 4W8DA 3MH1A 4HCTA 4M8TA 3TKHA 4D9UA 4EOJA 3UIBA 1Q41A 5ETFA 4LGHA 2C69A 4Z7HA 5M08A 1PXLA 4IZ7A 2VO7A 1DI8A 4XV3A 4ZLYA 2OIDA 4IAIA 5E4HA 2RFEA 3NUAA 3AOXA 3EQCA 5AV1A 2G9XA 3ZSIA 2F2CB 3LFEA 4XS2A 1PW2A 5KHXA 2R9SA 5LVOA 4BIBA 3L9LA 2GNIA 3NW5A 3V8TA 5ETAA 5GJGA 4L68A 3VBXA 4H1JA 4OTHA 5I3OA 3BYMA 1LEZA 4J98A 1J7IA 3UVRA 4YHFA 2PMIA 3SXFA 5E9EA 1Q61A 4Y72A 2XIYA 4ZIMA 4WSQA 2OXYA 1OVEA 1YDTE 2XUUA 4FKTA 3C4WA 5BMSA 3ACKA 3A4PA 4RVMA 4UMQA 2YCQA 3QRIA 2GTMA 2YZAA 5HVYA 2PVNA 4PMMA 4F6SA 2F9GA 4A9YA 4O86A 5BUEA 4RSSA 4LFIA 5M4IA 3LPBA 3R1QA 4XUFA 1G8AA 4ZY4A 1E1VA 2X2LA 3AT3A 2UZTA 5CZIA 4Y85A 3EQBA 3BHUA 3PJCA 1REJA 4QTCA 3DNDA 4WD5A 3TI1A 2VNWA 3DXNA 5IDNA 4U80A 2IVTA 5DEYA 3FZTA 4D2RA 3G9LX 4ACDA 5EG3A 5L2SA 4JDHA 3H30A 3GUBA 2YDIA 5L6OA 1ZMVA 2LGCA 3ENHA 5JN2A 3DXQA 2RSVA 3HUCA 2VWVA 2VZ6A 3NIEA 1DI9A 2QOLA 1KV1A 4ASDA 4GKIA 1J7LA 3V8WA 4CVAA 1WMKA 4NW6A 4APCA 2C3KA 5E92A 3UTOA 1WAKA 1XO2B 2R3NA 5EM8A 3NIZA 2RIOA 2Y8OA 3PXKA 3QCXA 4QYGA 4FZAB 4HGTA 2H9VA 3LCKA 2JKOA 5FP6A 3BQRA 3ORXA 3VUMA 1OB3A 1H00A 2H34A 3Q52A 4EKKA 4QMTA 3TNQB 5HX6A 3LQ3A 3MESA 2OK1A 2GNGA 3RNYA 3QWKA 3A99A 2A1AB 4FSZA 3EQRA 3JPVA 3V5LA 2JKKA 4RA5A 5IG1A 3CXWA 4BHNA 4F7LA 4BKZA 4BDAA 1W82A 2NO3A 4OT5A 1V0OA 3QQHA 3H9FA 3LJ1A 3GFEA 3IDCA 1RDQE 3TJDA 4B8LA 2VTIA 3IO7A 4JS8A 3FAAA 3NW7A 5K5XA 3RPRA 4F0IA 5FEDA 4WG5A 4IB5A 4QP7A 3BQCA 1VZOA 3BLHA 3ORZA 4D4VA 4FZDB 4XH6A 4FBXA 1NXKA 3VS4A 2KULA 3E8NA 3CPCA 3QLFA 4BZDA 3ANQA 2YAKA 2HWPA 4CEGA 2JBPA 2PUUA 3PSDA 3VBQA 2G15A 3U54A 5AP3A 5B2KA 1PHKA 3RAKA 2WTKC 3DAEA 5E7RA 5HQ0A 3DLSA 1J91A 3PLSA 4Q2AA 4RWIA 4TYIA 3VBWA 4O7RA 4DINA 3R83A 4CKJA 1F3MC 4JBOA 2W9ZB 2BZJA 3ZS5A 4GMYA 2W1ZA 3G51A 4IM2A 5JQ8A 4BWKA 3SXRA 3RP9A 3OT3A 4FTJA 1URWA 3JVSA 1PJKA 2IZTA 3LCDA 4CFXA 4U3YA 4L3PA 4DFUA 4X3FB 2E9UA 2WZJA 2QOHA 2JBOA 4UYNA 3CSVA 2YIRA 4KRCA 3QTZA 4O7TA 3FQEA 5KMIA 4AW2A 2G01A 2DWBA 5DT0A 5E8TA 3WOWA 4FEWA 3MPTA 2JIUA 2PZIA 2PZYA 4FICA 2GDOA 2R4BA 1GIHA 2OG8A 3COIA 3OWKA 4UWBA 2YM3A 5FXQA 3VUIA 3FSKA 4M3QA 3P5KA 5M53A 3DB6A 3D5UA 3F6XA 4IWDA 4RJ6A 5HEZA 4R78A 2CKEA 3AG9A 5HNIX 3R21A 3R7UA 3TZMA 2WMQA 3GBZA 4CZUA 4JBQA 3KGAA 4W4WA 5IPJA 5GZ9A 4AACA 5AR7A 3BWJA 2Y4IB 3QGWA 4FOBA 5J95A 4WG4A 2WMVA 3Q4UA 5T68A 1M2RA 3MFSA 3NUXA 3QRUA 3PY0A 5K3YA 5H8GA 4G3GA 3QTSA 5CAPA 2E9NA 4AXAA 1HOWA 2XK4A 4L6QA 5CQWA 2WTIA 4FG8A 4UALA 4QQTA 5KNJA 3CS9A 2PMOX 4O83A 5CU4A 2CGWA 3CTQA 4FTOA 5CU6A 4GVAA 3V5PA 2PHKA 3VBYA 2ZDUA 4ZEGA 1CDKA 1U46A 5EKNA 4IAYA 4MX9A 4AAAA 4QMWA 2C5VA 3DLZA 5JGBA 3N4TA 5ANEA 1Z5MA 1JKSA 3CE3A 3FLNC 3QC9A 2WU6A 3G9NA 3NDMA 3SXSA 5EM6A 3BYVA 2O3PA 3GNIB 4RJ4A 2ZYBA 1P5EA 4YGAA 4H36A 1TQMA 3AC3A 1OKWA 3WE8A 3ALNA 5CEIA 4BICA 3OOGA 2QQ7A 3V3VA 2RG6A 4I20A 3VUHA 2I0HA 4IWPA 3MY1A 3K3JA 3Q4TA 3TNHA 3CTJA 3UPXA 3GFWA 4V05A 3PVWA 2XNMA 3LKMA 1OPJA 3GQIA 3HUBA 3R63A 4FSQA 3OG7A 3R8MA 3VJOA 4C4IA 4E4NA 4P7EA 4D28A 5E90A 2H8HA 3IW5A 2QD9A 2WOUA 3E5AA 4EK6A 4D0XA 5M4CA 4O0SA 4OLIA 4RIYB 2FSMX 5AP1A 4MBJA 4DLIA 1BUHA 4MQ1A 4O38A 4YP8A 1VYWA 4GYGA 3DNEA 4ZP5A 2QLQA 3PTGA 1Y57A 4DITA 4Z55A 4YLJA 3NYXA 3I60A 5JRQA 3VN9A 4YHJA 5HU3A 4G3EA 5D7AA 3E3PA 3ENMA 3ORLA 4X3JA 4MWIA 2PZ5A 4XG9A 3I5ZA 4MNEA 3HECA 4YURA 3PP0A 2HY0A 2WGJA 3PDTA 1ZOEA 2PUIA 4OT6A 3ALOA 4G9CA 3QZHA 4RA4A 5EDQA 5H2UA 3VF9A 3VUGA 5BUJA 3ETAA 4DFYA 4K18A 4MK0A 3HA6A 4XV2A 4ALVA 4EQUA 1OPLA 5HCZA 4XX9A 1IEPA 4C0TA 5DH3A 2ZB0A 3KVXA 4IBMA 4B99A 2ITNA 4EBWA 4FKIA 5L2QA 4FVRA 3EJ1A 3WIGA 5CYIA 3DDPA 2IW8A 2YJSA 4I41A 1ZAOA 3I1AA 4RZWA 5I3RA 3C7QA 4FF8A 4ITHA 4EJNA 2BAQA 3IGOA 4FV3A 3H9RA 3O71A 2Z7SA 1PMNA 3FMNA 3DAKA 3F88A 3KXNA 3U9CA 4WKQA 3CLYA 3ZC5A 5AR8A 3LOKA 1IASA 3PSBA 5TT7A 4L52A 4FKGA 3LFQA 3W1FA 5L2TA 2PVJA 4EORA 1QCFA 5CU2A 3MIAA 1QL6A 2JD5A 5CASA 1F0QA 4BYIA 2EXEA 3V01A 3B8QA 4CNHA 3A8WA 3BIZA 3EH9A 2R3KA 3UOLA 1JKLA 3UG2A 3VC4A 2R3QA 4FV2A 4ANBA 4MF1A 1Q8WA 3D0EA 3LQ5A 4OGRA 3PXYA 2VTHA 5IQBA 3ZM9A 4DGOA 1JAMA 4QP3A 4L45A 4X7QA 2QODA 3NLBA 4FSUA 4CG8A 2QKWB 3V5JA 4A4OA 1H8FA 5IH5A 1W83A 1I09A 3PXFA 2VTNA 4E5AX 2HOGA 2CPKE 2Q0BA 2F7ZE 1M7QA 2I0VA 5K0XA 3L8XA 4TPTA 2CGUA 5BVWA 3ZXTA 3SW7A 2ZJWA 3BWFA 4YUQA 3GQLA 3SX9A 3I0QA 4Z3VA 4FNXA 4I1ZA 3KRRA 1Q4LA 4B6LA 4IWOA 4YZMA 2QHNA 3PVBA 2W05A 4RWKA 2BRNA 2W1DA 5L6PA 3UPZA 4FEXA 3ZFXA 5AA9A 2CNVA 3MVMA 3LLAA 3VHEA 3KRXA 4AZSA 2CKQA 4GT4A 4KAOA 5IEVA 1JPAA 3Q60A 4FSTA 4JI9A 3F7ZA 3GI3A 3DPKA 2VTMA 2VNYA 3ZM4A 4X2JA 2B54A 3DOGA 3ZDUA 4EZ7A 4QMSA 4IXPA 2ITZA 3AMAA 1BLXA 3NUSA 2PWLA 4ANOA 3DGKA 2QC6A 5GJFA 3AC5A 4FKWA 4P5QA 3SOAA 2GTNA 2ZM1A 3QL8A 4FG9A 4IIRA 3FJQE 4MCVA 5AIKA 4JG6A 3LAUA 5M55A 4QMYA 1XWSA 2WFYA 4M68A 2C5NA 3WARA 5KBRA 4YZNA 3IW4A 4ACHA 5ITAA 2W4OA 3ITZA 4QMPA 3QCYA 4LGDA 5CT0A 3KF7A 4L53A 3Q3BA 3AC8A 2X8IA 3NCGA 3KU2A 4LGGA 5CU3A 5DT4A 3OC1A 3NUYA 4IHPA 4BGHA 2YIQA 2XBJA 3R30A 4DF3A 3GXLA 2QO9A 3NAYA 3TUDA 2C0IA 4D9TA 3SKCA 4CCUA 4WSYA 5JH6A 2B1PA 5FM2A 3F3WA 3QRTA 1OI9A 3TKIA 2HCKA 2OU7A 4L9IA 2C6TA 3ZUTA 4R1YA 4IB3A 3I6WA 2X9FA 4EH3A 2BTSA 4C57A 1FGKA 3E62A 2WPAA 3LZBA 4D4YA 2HWOA 2IVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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