3RK5A

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-72
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rk5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rk5A01
4RJ5A 2XK7A 3OBJA 2IW8A 2XCHA 5HHWA 4OT6A 2QR7A 4DGMA 2VTQA 4RZWA 4APPA 4NZWB 4R1VA 2GNGA 3HMIA 4LGDA 4MNEB 5CT0A 3PVUA 3CGOA 5DT4A 2JDTA 3L8SA 4FKLA 4I94A 2BRGA 3TTJA 5GZ9A 4CFWA 1REKA 2G01A 2I0HA 3IG7A 4I0RA 3F7ZA 3R1YA 4IE9A 2WTIA 4E5AX 2ITXA 4J7BA 2V22A 3A8WA 4LFIA 5HCYA 3I6WA 5L6WL 2F7EE 3LQ3A 3FXWA 3RNYA 5EDRA 4G9RA 3R22A 2OI4X 2R3JA 3EHAA 4NH1A 4WSQA 5I5ZA 2C30A 2VTJA 3FL5A 2C5VA 5J9LA 3R04A 4LG4A 4H39A 3IDPA 3ZO2A 3UO4A 3DXQA 4E20A 1V0OA 4L9IA 1HOWA 2C68A 3GFEA 4MXAA 4LL5A 1SVGA 5BMMA 3C50A 3OZ6A 3SC1A 4DLIA 3EQPA 4O0WA 4RIYB 2WMQA 3C0HA 3VUTA 5CAOA 4YUQA 4B99A 1YOLA 1ATPE 4O91A 3QD2B 3TUDA 5IEYA 4IAAA 4RIOA 3KXHA 1OBGA 2UW3A 4D58A 4L8MA 4HNFA 3TN8A 5KZ0A 5JFVA 3B2TA 2YZLA 2WXVA 4HOKA 3WBLA 3VS4A 4R1YA 3SX9A 3LOKA 1PXOA 4XG4A 3P08A 4WOVA 3VS7A 3MV5A 3R7UA 1Q8WA 4QMMA 1OVEA 2FSOX 4QT1A 4RT7A 2I6LA 5JEBA 2JD5A 2HENA 4H1MA 4I4EA 2X2KA 3Q6WA 3R2BA 1KE7A 3LQ8A 4HPUE 3VQHA 5K5XA 3S95A 5ITAA 4PMSA 3HUBA 3L9NA 2PULA 5KZIA 5AUVA 4EOJA 4K18A 3QUDA 3VHEA 1EH4A 2GNIA 3GC7A 5EFQA 1NY3A 3AMAA 5FXQA 1PKDA 1PXPA 1WZYA 4JOAA 4C8BA 5K4IA 3LFNA 2WZJA 5AUTA 1M17A 3D7TA 2JKMA 3CJGA 3MTLA 4EK8A 4YJTA 3HMPA 3OXTA 1SNUA 3VW8A 2CHLA 2YN8A 3GXLA 1E1XA 1JBPE 4KIPA 2GS7A 3LQ5A 3LFAA 4LOPA 4EONA 3NNVA 4D4SA 3SHEA 2AYPA 3DKGA 2OWBA 4FK3A 4KAOA 2WELA 4LV5A 3R63A 1H24A 4IB5A 2JEDA 1MP8A 2W4KA 5HTBA 4YZNA 4PDPA 1CKPA 2C6KA 4YC6A 4BCJA 2QOQA 2Y8OA 2B53A 4BFMA 4U79A 5AIRA 4JRVA 3S2PA 2O3PA 3ZZEA 3HKOA 3ZO4A 3MPTA 2J90A 4O2PA 5F1ZA 2I0EA 1WFCA 1ZOHA 2PYWA 4MNEA 2VTIA 5A3XA 4NM7A 3NW7A 4NTTA 5EM6A 4AZSA 3FMDA 5K3YA 4Y72A 3FL4A 3C4XA 4QOXA 3RVGA 4DEDA 3NMUF 3A4PA 1OIYA 4A9YA 4FNWA 2G2IA 3QGWA 4M68A 3U6JA 3IPHA 4WSYA 2PPQA 3TXOA 3QL8A 3GU4A 2XIRA 3NPCA 5HIDA 5CEIA 4FV2A 4QQ5A 4HGEA 4E8AA 2DUVA 2VV9A 4MNFA 5E8VA 4JAJA 4F7JA 4FKIA 1J91A 2WTKC 3EFKA 4I5PA 4GMYA 5AR4A 4WUAA 1CDKA 4XV2A 4KB8A 1PYEA 3KREA 2PE0A 3PY1A 3VJOA 1PXNA 4G16A 2PVNA 3BYOA 2VTNA 4FOCA 5LARA 2C6LA 4BYJA 2W1ZA 1ZY5A 5I9YA 2GHLA 2I1MA 3S3IA 4AACA 4FL1A 3CE3A 5FP5A 3UNZA 3I0OA 2J5FA 3OWPA 5CENA 4AU8A 3Q2JA 4PRJA 3OEFX 2EB3A 1Q99A 3IW7A 3KU2A 5CASA 3W8QA 3N4TA 5EKNA 4CT1A 3PY3A 5H3QA 1ZAOA 2UZWE 3PJ1A 3PXYA 3FC2A 4E4LA 3KCKA 4GFOA 3P5KA 5M07A 5DYJA 4IX5A 4FVQA 4AG8A 4G34A 2VX1A 4FTAA 1CTPE 5HNIX 4FV4A 4BKJA 5D11A 3LZBA 4RMZA 4AP7A 1NA7A 2G15A 1F0QA 5EHYA 4FSRA 5HGIA 3ZLSA 3KRXA 3Q9YA 4HCUA 4HGSA 4OBPA 4RWJA 2V62A 2IVVA 2ITTA 2ZJWA 1OKZA 2W5BA 5J1WA 2G9XA 4HVIA 3G2FA 4EYJA 2HXLA 4OT5A 1JKTA 5HNBA 3ZM9A 3LHJA 3UOKA 4V04A 5CSPA 3ZYAA 1J1BA 4BDBA 4EQUA 4C4FA 3PJ3A 2OBJA 4ACMA 2WEVA 3LXLA 4FKOA 4JBPA 4C59A 4BI0A 3CTHA 3AGMA 1UU7A 3BRBA 4IWOA 4E3CA 3P7BA 5IQDA 2XNOA 4JR7A 2GPHA 3DTCA 4KKEA 3Q6UA 1F3MC 4PL4A 3KXNA 3K3IA 4ITHA 2GSFA 2I0YA 3LFQA 2ETRA 4UV0A 1BL7A 4DG0E 3N4UA 4JBQA 5E92A 1ZZLA 2WQOA 2C3KA 1OUYA 2E9PA 3VBQA 4CFNA 1VEBA 3CIKA 3HV7A 3NGAA 2PU8A 2C6MA 3ZSIA 2X9FA 4G5PA 4O0YA 4BIDA 2QCSA 1SVHA 5FEQA 4ACGA 4D9UA 5HBJA 3OCSA 5TF9A 4FKUA 1ZY4A 4O22A 5AUZA 3I81A 1FINA 3QF9A 4IANA 4IDVA 4JRNA 2ZM4A 2HY0A 4OLIA 2KULA 1UA2A 1BKXA 2JITA 4QP7A 1W83A 4QP3A 4LUDA 4I21A 1STCE 4RFMA 3TNWA 3UBDA 4IM0A 2QODA 4G3EA 3HMNA 3TZ7A 4IVAA 4PL3A 5KMNA 2YFXA 3HL7A 2VTAA 4RA5A 4L67A 3QHWA 2FGIA 5IPJA 3A7FA 3O7LB 3NYVA 3AC8A 4QQJA 5M4CA 4NUSA 1Q97A 3COHA 3V04A 3F5PA 2X2MA 4FTCA 3RI1A 3N9XA 2QONA 3A7HA 3CEKA 5GJDA 4BCGA 5HVKA 4JQEA 2W1EA 3UIMA 1LEZA 4RX5A 4KA3A 4C38A 2NP8A 4IDTA 3RAHA 3KK9A 2RIOA 3AMBA 3F61A 3HV4A 5E8WA 2XIXA 5EG3A 1I09A 1U54B 1NW1A 3OXIA 3SW4A 4DITA 1Q61A 2QD9A 3GFWA 3L1SA 3MY5A 4FYNA 4A9UA 4X7QA 4YO6A 2HZ0A 1X8BA 3PP0A 2Z7QA 2VU3A 4MXXA 4B8LA 2A0CX 2A27A 3W2QA 3KFAA 1OPKA 3Q5ZA 4I6HA 1WVYA 4M84A 1GIHA 3RMFA 2W1IA 4IACA 2J0MB 4J97A 4NJDA 5AX9A 4EH7A 3GNIB 1SM2A 3ET7A 3R28A 4K33A 3KK8A 3RBWA 4DLJA 4F7NA 1U5QA 4DFZE 1GZNA 1UU9A 3TG1A 2IW6A 2WTCA 4FG9A 3UVPA 3ZONA 3UNKA 4EORA 3NUXA 4EKLA 4TWPA 4BZOA 2QLUA 4R77A 5IQIA 4X2FA 1Z57A 3O8TA 4FV6A 2HW7A 3QX2A 2GCDA 3WIGA 4CQEA 3GU6A 1QL6A 4OTGA 1E1VA 2BKZA 4ANSA 4QO9A 3EN7A 5HQ0A 5GINE 1M14A 2OJ9A 3CPBA 4G3GA 1Q62A 4I93A 3LPBA 4L68A 4QQCA 4EWHA 5AEPA 1J7LA 3TKUA 3VC4A 3HDMA 4MYGA 4DEHA 3ORLA 4QPSA 5L8KA 4DBXA 1UNGA 2HELA 4BTMA 2F49A 4EH9A 3FLSA 2OFUA 3CP9A 4FT5A 1H1WA 4LV8A 4FODA 3W2RA 4ZY4A 4EZ3A 5KMJA 3ORPA 5FM3A 3ENHA 3I6UA 5EM8A 4BDGA 4C34A 3D2IA 4L53A 5HESA 4XBRA 5CZHA 1RE8A 3O23A 5DNRA 5AP7A 3WARA 4USFA 5IA0A 5JGBA 1Y8YA 1KE6A 4QD6A 5BVNA 3EJ1A 5DFPA 4ZLYA 2ITOA 1A9UA 4N6YA 5BUEA 1REJA 4I6QA 4FTKA 3ZUVA 3FPMA 3GCQA 5LWMA 3W1FA 4XNEA 3PXZA 4GK2A 3A61A 2W96B 4IVDA 5FD2A 3E87A 2QKRA 3IKAA 1QPDA 3WE8A 2XB7A 2BDWA 3BU6A 4I5CA 4LRKA 2UZDA 4U44A 2XIYA 3V5PA 5HLNA 3ALNA 2YIQA 4GKHA 4E1ZA 3MBLA 2WTDA 5CSHA 5AV0A 4A9TA 5IA1A 4X3FB 4NKSA 1PRYA 3L8VA 1WVWA 5EW3A 3SW7A 3C9WA 1ZMUA 2X8DA 3F69A 3I60A 3E62A 4WG5A 4CRLA 5CAQA 4O0UA 4RRVA 4GT5A 3QQFA 3U54A 4YZMA 3R1QA 1PXMA 4N0SA 5IQEA 3NWWA 1OB3A 4AOIA 1UKIA 2CGVA 2QO9A 2PZIA 3R02A 4USEA 5IQAA 3DZQA 1M2PA 3PVGA 1VYWA 4C57A 2BTRA 3D9VA 3VF8A 4C62A 2IZSA 4EOKA 4RGJA 1MQBA 4UZHA 4RC2A 4I24A 1NXKA 4IC7A 4DFNA 3EQIA 4BTJA 3D5XA 3ZXZA 2QOHA 1Q8ZA 4HCVA 4ZTLA 3MTFA 3TM0A 4BYIA 3NW5A 4MX9A 3HP5A 4L3PA 2JIIA 2ZAZA 3GB2A 3LM5A 3QWJA 4KABA 3T3VA 4BBEA 2PUIA 4JAIA 3UGCA 3CY2A 2C0OA 2Y7JA 2JKQA 5CVGA 3KMUA 1YDRE 3K5UA 4FGRA 4QTDA 5FTGA 5L6PA 1WBVA 2CNQA 3QTSA 3SQQA 2YDIA 2KTYA 3D7ZA 3Q5IA 3H10A 4CGAA 3CQUA 2VTSA 4X21A 1YXXA 2JAMA 2R64A 1H00A 4FT3A 5CANA 3MA3A 2W06A 2J6MA 3Q3BA 4BR3A 3NCZA 1PXLA 4QPMA 2EB2A 4YJSA 4IBMA 4A7CA 2DQ7X 1XH5A 1J1CA 1ZYLA 5IISA 3I7CA 2F7ZE 2YABA 4EQCA 2VNWA 3PXKA 2WTKB 1FPUA 3R7OA 4N57A 2HYYA 2JKKA 2IN6A 5JFSA 3EQRA 3THBA 4BDAA 5LWNA 3IGGA 5IU2A 4J98A 4O0XA 4YJVA 4ASXA 4ZMEA 3A8XA 4IX3A 3RAWA 5KBRA 4NT4A 4DGLC 2YIXA 4QYGA 2YM6A 5HVYA 2PVFA 1R1WA 3BHTA 3DBFA 4ITIA 4JDKA 4YZDA 4J96A 4PL5A 2HZ4A 2OW3A 2YM3A 5CVFA 4AXAA 4BCFA 3QZGA 2R9SA 3BQRA 5IUGA 2PMLX 5CU6A 3KVXA 5FXSA 1H0WA 2ZM3A 4O6EA 4WT6A 3T9IA 1ZWSA 4QMNA 2J0IA 5HG8A 5CU0A 3FXXA 3NCGA 3HMMA 4QMWA 2VGPA 4NJ3A 1A06A 2QOCA 4J53A 5AM6A 2YM4A 4BDEA 4CFUA 4DHFA 2HOGA 3O17A 4YPSA 3R8UA 5CAUA 4O82A 3D14A 5KBQA 5LQFA 3OXZA 3NAYA 4C3PA 3HAMA 2ZVAA 4GK3A 4Q5HA 4FTJA 1G8SA 2B55A 3BEAA 3ZEPA 5CY3A 2P4IA 4GG5A 4DFBA 4QMVA 5JQ8A 3FC1X 3RPOA 3SA0A 3KCFA 1JSUA 4X3FA 4W8DA 4YZ9A 4F7LA 2Y4IB 4UEUA 3KRJA 3OW3A 4D28A 1YRPA 3CD3A 1BMKA 2C6TA 2IJMA 4Q9SA 1PF8A 5HX8A 5J5SA 2GFSA 2YHVA 3VRZA 3B2WA 1K2PA 4ZJJA 1ZMWA 3ZTXA 5EYMA 3OROA 2I7QA 3QTRA 2R3OA 4OBQA 4PP9A 4ASZA 4U5JA 3MPAA 4XG3A 3GC8A 1OPJA 3AT3A 2X7FA 2PVKA 3F3UA 4FZ6A 4ERKA 3KF4A 3G33A 1UU8A 5CTPA 1WCCA 2GDOA 4ZS0A 3UZPA 4CKRA 5J5TA 3ZSHA 4RG0A 3JYAA 3D15A 4GJ2A 4PV0A 2YEXA 5TE0A 5AM7A 4O83A 4FTMA 4DEGA 4GUEA 4QTAA 5AP4A 4IAFA 1A48A 3U51A 4ZY6A 4M0YA 3MVLA 1Z5MA 1W98A 4IB1A 5TT7A 5I9WA 3QQKA 4S31A 4QMQA 4C0TA 4A4XA 1DS5A 4AW0A 4P5QA 4R7BA 3PIZA 3O50A 3DT1A 2P0CA 2B9JA 4GUBA 4EBVA 3FE3A 2JDVA 2F9GA 5EDQA 2XRWA 3IOPA 4BCMA 3PP1A 4F99A 2NNWB 4CCUA 2XK3A 2BRBA 4WA9A 2VTPA 3P4KA 4MHAA 5L8LA 4BWXA 4O7NA 1ZOEA 2R3LA 2QOIA 3AC3A 2GQGA 3TWJA 1FMOE 3DJ6A 3QX4A 5HG5A 3RCDA 4GYIA 1QPJA 3ELJA 1SZMA 3BHYA 3FQSA 4FTUA 2X7OA 2XNPA 3QRKA 3KULB 2WEIA 2X1NA 1KOAA 3A4OX 3ZO3A 2X9EA 2X4FA 4I0TA 2RL5A 3E8DA 4MBIA 4UYAA 3UC4A 4ALVA 3O2MA 3E8CA 4CEGA 2BZIB 5L3AA 3M11A 4V0GA 3DQXA 5JN2A 4BCHA 3QQJA 4UMRA 4DGGA 4FIEA 1Q8TA 4D1ZA 4YTFA 3VNTA 3OCTA 4FV1A 4FR4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RJ5 A;  2XK7 A;  3OBJ A;  2IW8 A;  2XCH A;  5HHW A;  4OT6 A;  2QR7 A;  4DGM A;  2VTQ A;  4RZW A;  4APP A;  4NZW B;  4R1V A;  2GNG A;  3HMI A;  4LGD A;  4MNE B;  5CT0 A;  3PVU A;  3CGO A;  5DT4 A;  2JDT A;  3L8S A;  4FKL A;  4I94 A;  2BRG A;  3TTJ A;  5GZ9 A;  4CFW A;  1REK A;  2G01 A;  2I0H A;  3IG7 A;  4I0R A;  3F7Z A;  3R1Y A;  4IE9 A;  2WTI A;  4E5A X;  2ITX A;  4J7B A;  2V22 A;  3A8W A;  4LFI A;  5HCY A;  3I6W A;  5L6W L;  2F7E E;  4O4D A;  3LQ3 A;  2X0O A;  3FXW A;  3RNY A;  5EDR A;  4G9R A;  3R22 A;  2OI4 X;  3BLA A;  2R3J A;  3EHA A;  4NH1 A;  4WSQ A;  5I5Z A;  2C30 A;  2VTJ A;  3FL5 A;  2C5V A;  5J9L A;  3R04 A;  4LG4 A;  4H39 A;  3IDP A;  3ZO2 A;  3UO4 A;  3DXQ A;  4E20 A;  1V0O A;  4L9I A;  1HOW A;  2C68 A;  3GFE A;  4MXA A;  4LL5 A;  1SVG A;  5BMM A;  3C50 A;  3OZ6 A;  3SC1 A;  4DLI A;  3EQP A;  4O0W A;  4RIY B;  2WMQ A;  3C0H A;  3VUT A;  5CAO A;  4QDE A;  4YUQ A;  4B99 A;  1YOL A;  1ATP E;  4O91 A;  3QD2 B;  3TUD A;  5IEY A;  4IAA A;  4RIO A;  3KXH A;  1OBG A;  2UW3 A;  4D58 A; 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