3RK9A

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-74
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rk9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rk9A01
3GOPA 4C7TA 1R0PA 4RIOA 2PY3A 1RE8A 5DBXA 4IAIA 3VUKA 4HVSA 3FKOA 3QWJA 4TYHB 3UPZA 2YM8A 3WE8A 3OF0A 1FGKA 2YERA 4YBKA 3OMVA 2HCKA 4F0FA 5JMSA 3IECA 5AUTA 3E87A 4K33A 3ZSHA 4JX3A 1MUOA 3CJGA 5AA8A 5A9UA 5AR3A 2XNNA 2W1FA 4FTCA 1SMHA 3GEQA 3DB6A 3PVUA 2W0JA 4D9TA 5FP6A 4FA2A 3KXZA 1OBGA 3LJ2A 2JAMA 2GU8A 3QZHA 3VO3A 4GK3A 4ZLZA 2FSOX 4JBVA 4W9XA 4ZTRA 1YXSA 1JKSA 3QYWA 4S30A 3O8TA 2VWYA 4AE6A 4PP7A 1FOTA 2GNGA 4CXAA 3LKMA 2X9EA 1SZMA 3OY3A 3PP0A 3Q04A 3Q60A 4PF4A 4U80A 4W8DA 3V5QA 2JFMA 1ZWSA 4J97A 3UDBA 4EOLA 3RPVA 3DLSA 1JSTA 4GL9A 3QAME 4GW8A 1QPDA 4X7QA 2ITWA 3UVQA 2PZYA 4P5QA 4ZK5A 5BMSA 1UWHA 1V0PA 5IEXA 2QO2A 3L8PA 4QMQA 2G01A 5IQDA 2F2UA 2R3NA 2IVVA 2OFVA 4TYHA 4DEIA 4JQ8A 3P86A 1I09A 2EB2A 3ALOA 3ACJA 4U3YA 4PUZA 2VWBA 2I7QA 3AC3A 4FV8A 2VTQA 3LCTA 5L2QA 3WIKA 4C02A 5BUJA 2CKPA 4K8AA 4IQ6A 4IM3A 4LV5A 3PVGA 4X2NA 4FKUA 5CSWA 2C6KA 2JKKA 3MI9A 3VWAA 2C30A 4FTTA 2X9FA 4PDOA 4C38A 5HQ0A 3RGFA 4B4LA 2R3MA 2UZBA 4ITIA 3PJCA 4BBEA 3MH2A 3Q9XA 4H39A 5IDNA 4MNFA 2F2CB 3BBTB 4I23A 3HZTA 4I41A 5KKRB 1WBOA 4F08A 2RFSA 5LVPA 3OTUA 3OP5A 4FV5A 3VF9A 3ZOSA 3Q4ZA 4ZEGA 5M56A 3NUYA 3NDMA 5LWMA 3IK3A 3FMDA 5AP6A 1U4DA 3Q53A 4IDTA 3GCUA 2QI8A 2G2HA 3LFNA 2I0EA 3E8CA 5M4FA 3G0FA 5CVGA 4R7BA 2ZDTA 2F7EE 4D4SA 2GHMA 3PWYA 4QP2A 3A7HA 4BI1A 4E4XA 4G3DA 4ZZOA 5C1QB 4FKPA 4W8EA 1PHKA 3FC1X 4U9AA 3WZJA 5JQ5A 2WMVA 5AV4A 1ZYJA 3C4FA 5HO7A 3GU8A 3QQLA 4WUNA 2PMNX 3FSFA 4X6RA 1OL5A 1FMKA 2J0LA 3D7ZA 4RT7A 3M1SA 5F95A 3ULZA 5IH6A 3QA8A 4ASEA 4YTCA 4RVLA 3QTWA 3WE4A 4FZDB 4IWPA 4AW2A 4UB7A 5JGAA 3C4WA 3PDTA 3HUCA 3QBNA 1FPUA 1W98A 5EKNA 3OCSA 5KE0A 3BYSA 4EZ7A 3EB0A 4DYMA 1M2QA 3F7ZA 2R3FA 5BYZA 3GVUA 2BIKB 3IW6A 3OY1A 5HG8A 1QL6A 4KWPA 4HGEA 5HO6A 4C0TA 4IFGA 4G3GA 4D1SA 3B2WA 4RLKA 5CU3A 2BZHB 2XNEA 4JVGA 3IDCA 3OCBA 1ZLTA 2UZUE 5IDPA 5E8XA 4I4FA 5ANJA 5T6KA 3R8LA 3KMMA 3QUDA 4TPTA 3SOCA 5B2LA 2YCFA 1OZ1A 3HRBA 3R73A 1STCE 3C50A 2C5NA 4FKOA 5IQCA 2WFYA 3IKAA 3V5PA 2F4JA 4APPA 4BDHA 3EYHA 2ZM4A 5M06A 4JDHA 3HRFA 4YJRA 3D9VA 3NNVA 4F0GA 1QPCA 4R3PA 5C8MA 3TUBA 3U55A 5CU6A 3EZVA 4FTNA 1UVRA 4K9YA 3TTIA 4EK4A 4FTLA 4FMQA 3HV4A 3ZSIA 3CGOA 4F4PA 2WEIA 3MFSA 4MQ2A 3IS5A 3AT2A 2XNMA 4FIGA 4YJTA 5DN3A 3TV4A 4YSJA 3P08A 5IEYA 4S32A 2B4SB 4LGDA 4XP3A 4DBXA 1UKIA 4EC9A 1SNXA 3GQLA 3PJ3A 4C62A 5K5XA 4FV6A 2WEVA 3ENMA 3OD6X 3HKOA 4ENYA 3U6HA 2WTKC 3I5ZA 3UPXA 4UX9A 2VNYA 2PVNA 2B0QA 2W1ZA 3DGKA 4NM3A 3ULIA 5AR7A 3MA3A 3R2BA 4O0XA 4N70A 4QP7A 3V5WA 4WT6A 2QOQA 4RPVA 3POZA 4B8MA 4FC0A 3PA5A 3CBLA 4QPSA 3VRZA 4DEEA 4N0SA 5CAOA 1LEWA 3RPYA 2JAVA 4J53A 4L68A 1U54A 2UZTA 3FHIA 1Z9XA 2JITA 3ZLYA 3ORIA 4APCA 5H9BA 5J1WA 2UZLA 2OXYA 4HYIA 2JGZA 4C33A 2ZDUA 3CTHA 4EQCA 3TZMA 4EYJA 5FXSA 2C3KA 5BVNA 1O6KA 4NM7A 4K77A 5D41A 4CKRA 2C5XA 1FVTA 4QQJA 4Y85A 3T9IA 4O38A 3I79A 1GNGA 4WA9A 3HX4A 3EWHA 3KC3A 3Q9ZA 4RBLA 3C5UA 2QKRA 2P3GX 4L3LA 1G8SA 4YZ9A 3P23A 4I6HA 1KV1A 4I5MA 4J8NA 5JZJA 3PA4A 5HCYA 3QKLA 4AXAA 4ZZNA 3C4XA 1IRKA 4GFMA 4RJ5A 2G15A 4YPDA 1XO2B 2YFXA 5HVJA 2QOCA 3FYKX 4ANLA 2DUVA 4HYHA 2BUJA 2GS2A 2GQRA 5DGZA 2CMWA 4Y83A 4YJUA 2RFNA 4AN9A 1DAWA 4PTCA 4ANSA 2LGCA 2QOHA 3QX4A 3NW6A 4UMTA 5FGKA 3P4KA 5HBJA 3ET7A 3IGGA 5DR2A 1DS5A 4RJ4A 2IZTA 1FMOE 3MH3A 4R7IA 4F63A 4HVIA 4O7RA 4C4HA 3IW4A 3P7CA 4UBAA 4LQMA 2CGVA 3F82A 3PE2A 2OG8A 4C4FA 3PIZA 4TWPA 2QHMA 2OKRA 3MB6A 4NK9A 1CKJA 4Y5HA 3QRKA 2W4KA 2WZJA 4EK5A 5A14A 3D7TB 3PSCA 3ATTA 2BRGA 2R7IA 3K5UA 4KIOA 5CLPA 3I60A 3SW4A 4EL9A 5AAGA 3NUXA 4KIQA 4CRSA 5CI7A 1J7LA 2R3GA 3DNEA 3HGKA 3KK8A 2Z60A 1TQIA 4MBJA 4U41A 4K0YA 3JYAA 3MDYA 5DPVA 4C35A 4RIYA 4AZVA 3R1NA 3FC2A 4FSNA 2VWXA 3FXXA 3IOPA 3LXLA 1UNLA 4EQMA 4KSQA 4AOIA 3TNPC 3AC8A 3ANRA 5H3QA 5TR6A 5EK7A 2HXQA 4YLKA 5HGIA 1BX6A 3BQCA 4OTWA 3GGFA 3KULB 4UALA 5CXHA 5L6WL 3CKXA 3VULA 4RJ7A 4YGAA 4C2VA 1OL2A 3E8NA 4HOKA 3A60A 2UVXA 2DS1A 1UV5A 3PPZA 4H3PA 4R6VA 4DH3A 4E5BA 4EONA 5I3RA 3N9XA 4CMUA 3I0OA 4O21A 4C61A 4FKRA 3CR0A 2XJ0A 3LLTA 1KE9A 4L3JA 1IA9A 2C1AA 2GDOA 2WMQA 3JXWA 1WAKA 2VZ6A 3BHVA 3T3UA 4IWQA 4BCGA 2WOUA 2W1HA 1O6YA 4LG4A 5AP0A 3GU6A 1F3MC 1R78A 5CF6A 4F1MA 3SG8A 3NMUF 5LARA 2WU7A 1XH4A 3F3VA 4E93A 4FV4A 5C4KA 4IBMA 2B53A 3LFAA 2BHEA 3ZFMA 4QP6A 5GZAA 3OBGA 3RWPA 2GPHA 2YHVA 4BZNA 4F9YA 3LE6A 3RAKA 3ZH8A 2FYSA 4O0RA 3E93A 3KXNA 4RIWB 3DZOA 3TN8A 3TKHA 4FV2A 2GHGA 3K2LA 4U43A 4F7JA 1J7UA 3IPHA 3R04A 4O0SA 4W4WA 3D14A 2HYYA 2QOFA 4GMYA 5EI6A 4DCEA 4F9BA 3EL8A 1W0XC 3ODYX 5EI2A 4QYEA 1PXIA 2W17A 4DGOA 1P14A 3V5TA 5IQGA 3ZDUA 3PLSA 4DGMA 1ZY5A 3A8XA 3CPBA 5FD2A 4C2WA 3LCKA 4RFYA 4YJQA 2O0UA 4I4EA 4L00A 4QOXA 4X3FC 2B9IA 5C01A 3I6UA 4OTHA 5A46A 2C5OA 4O7LA 4QQ5A 2R64A 5FG8A 4EUUA 2CGUA 2Z8CA 5CYIA 4FIEA 3FMMA 2YITA 2CNUA 2X8EA 4S2ZA 4L9IA 1JVPP 5IPJA 4GIIA 2XK3A 3AC5A 3OWLA 4DT9A 2OW3A 3BU5A 3H30A 2QO7A 2JDSA 3FHRA 3UIBA 3VUIA 5HE3A 5HZNA 3II5A 3LZBA 4PQNA 3MTLA 4Z9LA 4HVDA 3OEZA 2E9PA 2Y4PA 2YEXA 4IAYA 3BIZA 4AN3A 1IA8A 2VTOA 3C0HA 3NAYA 4WBOA 5K9IA 1GZ8A 1PYEA 1TQMA 3EN9A 4KIPA 3UP2A 2WXVA 5ANEA 3R9DA 2BROA 3EL7A 4HGSA 3V8TA 2NRUA 4DH8A 2FO0A 2XRWA 2YACA 3WF7A 4E20A 4ZLOA 1OI9A 3DAJA 4NU1A 2IZUA 4X2FA 3W55A 4BCKA 3NNXA 4CNHA 3F3WA 5C4LA 3OTVA 4O7SA 5E8YA 3ZEWA 1PF8A 5FRIA 3DXNA 3D5UA 3FZRA 1Q8TA 2QU6A 5KMOA 2JDTA 4FNWA 2P33A 5CAPA 2GNFA 1Q99A 3KRJA 3OBJA 3PG1A 3WI6A 4QQCA 2W5AA 2QOBA 1RW8A 3O7LD 1XH7A 4AS0A 3LQ3A 1GIHA 4EORA 4F9CA 2VX0A 2QNJA 5CEMA 2BFXA 4ZTQA 4QMUA 3TUCA 4D2RA 4BWXA 3BE2A 3CXWA 4BIEA 3F6XA 3M11A 1H00A 4FICA 4ZTLA 4G6NA 4BTKA 5IMXA 3EH9A 3MY5A 4E5WA 3R8ZA 4II5A 3NAXA 4MF1A 5FTOA 4E6AA 4X0MA 1YXVA 4F6SA 4IAKA 5JQ8A 3T9TA 4CFFA 4MD8E 4LL0A 4DEDA 4I3ZA 4UV0A 5HE2A 2Z7RA 3L1SA 4CRLA 5A6NA 2XEZA 4EEVA 2Q0NA 5LJJA 5AR8A 5FLFA 1J1BA 5EKOA 3C4CA 4LFIA 2GQSA 5ANGA 5EM8A 4PNKA 4IX5A 3BX5A 3BRBA 2IPXA 2OXDA 3QTXA 5D1JA 4W4VA 1Z5MA 4QPAA 4CMTA 4FTJA 3PRFA 3QUEA 4FV9A 4CSVA 5CEKA 2VNWA 4QTDA 4OTPA 4QP9A 4HGTA 2J5FA 5D10A 5J5TA 5GNKA 4M8TA 1OUKA 2OJIA 3MB7A 4ZMFA 4QMVA 4FL1A 3BPRA 4P5ZA 2VTAA 2XS0A 5I9UA 5CXZA 4LUDA 3DXPA 4I0TA 4FSRA 4QYHA 4JI9A 4DHFA 4O84A 2JLDA 4NH1A 5CS6A 2RSVA 3E7VA 5FM2A 4TWCA 3UGCA 4TL0A 1RJBA 4IZ5A 3QFVA 3HECA 4ZXTA 3OROA 2JIIA 1E1XA 1H26A 2YN8A 4OW8A 1CM8A 2F7XE 3CQUA 4D4VA 3DFCB 4ZY4A 4PL4A 4DEAA 2OZAA 1XQZA 2PMOX 3KA0A 4MKCA 4B6LA 5JRQA 3GC9A 4ZY5A 1OM1A 3R9NA 3W33A 3VS5A 3W1FA 4E4NA 3NUUA 4JIAA 3KN5A 2BZJA 4FZAB 4ZY6A 4BCOA 4YO4A 4QP4A 1JAMA 3AMBA 1YXUA 4IM2A 4NZWB 4QQTA 2BVAA 3O8PA 3ORMA 1BUHA 4NFMA 3G6GA 3RP9A 1B6CB 2CCHA 4YTHA 2B52A 2QCSA 2W9FB 4O22A 5HE0A 1Q8YA 2YWPA 2X6DA 4FL3A 4U40A 2VTPA 4BCMA 3Q6UA 2YIRA 3CCNA 2XP2A 2BRNA 4FG9A 3GENA 4O6LA 3MW1A 4AACA 2X4ZA 3BBWA 4OR5A 4XCUA 4BKYA 4F0IA 4FK3A 4R7HA 4H36A 2PU8A 2UW6A 2NPQA 4I21A 1KE6A 3KL8A 3NYNA 3UVRA 3H0ZA 1JQHA 3AC1A 4PL5A 3V51A 3GI3A 1GZNA 5CVFA 5M08A 1VYZA 2FSTX 4AGUA 3HA6A 4KNBA 2XNGA 4UXQA 4KUJA 4I94A 2WMSA 5A4CA 3UZRA 3OFMA 2HZ4A 2UUEA 5B2KA 3EFKA 5AM7A 2YDIA 4DFBA 1JSUA 5HD4A 3ZBFA 2E9OA 4ID7A 2VAGA 1HOWA 3WYXA 3IONA 3R7VA 3UIUA 3OS3A 5BVDA 2I0HA 3TWJA 1Q62A 3ORLA 5CZHA 4JDKA 2UZNA 2PE0A 3BELA 4BCNA 2CKOA 3IW7A 3DBEA 3R30A 4XEYA 4CD0A 5M51A 3KF4A 2AUHA 3GCQA 5D9HA 1Q8WA 3KRRA 5BVFA 5CEPA 3ORNA 2QG7A 2GFSA 3HP2A 3D5XA 4RQKA 5HCXA 3A4PA 3CIKA 2KULA 4Q9SA 4XBRA 3TDWA 1MRVA 2UW7A 2NO3A 4P7EA 2CCIA 1K3AA 1JKTA 2YM7A 1IR3A 5DR6A 5L6OA 2ITNA 3R71A 1PKGA 1M14A 4JAIA 4WBBB 2HWPA 2XIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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